CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Bengali
From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 16:39, 6 December 2017 by Satarupadutta (Talk | contribs)
Time | Narration |
00:01 | CellDesigner এ Create and Edit Components এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত। |
00:08 | এখানে আমরা শিখব: ড্র এরিয়াতে ইতিমধ্যে সংরক্ষিত .xml ফাইল খোলা। |
00:15 | কম্পার্টমেন্টে বর্ডারের আকৃতি, আকার, রঙ এবং বেধ বদলানো। |
00:22 | CellDesigner এ একাধিক ফাইল বানানো, Species এর পরিচয় বদলানো। |
00:28 | এছাড়াও শিখব: Species কাট, কপি এবং পেস্ট করা, Species এর Start-point এবং End-point সম্পর্কে। |
00:37 | Species কিভাবে সক্রিয় করে এবং রঙ বদলায়, একটি Reaction এর বৈশিষ্ট্য বদলানো, File বন্ধ করা। |
00:47 | এখানে উবুন্টু লিনাক্স OS সংস্করণ 14.04, CellDesigner সংস্করণ 4.3, Java সংস্করণ 1.7 ব্যবহার করছি। |
00:57 | টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে, শিক্ষার্থীদের স্নাতক স্তরের Biochemistry এবং CellDesigner ইন্টারফেস সম্পর্কে জানা উচিত। |
01:05 | না হলে, প্রাসঙ্গিক CellDesigner টিউটোরিয়ালের জন্য, www.spoken-tutorial.org ওয়েবসাইটে যান। |
01:16 | শিক্ষার্থীরা লক্ষ্য করুন: এই শৃঙ্খলার পূর্ববর্তী টিউটোরিয়াল Windows OS এ বানানো হয়েছিল। |
01:24 | যদিও এখানে থেকে এই শৃঙ্খলা Ubuntu Linux OS এ সম্পন্ন হবে। |
01:30 | CellDesigner এ create and edit components এ আগে দেখি। |
01:35 | Ctrl + Alt + T কী একসাথে টিপে টার্মিনাল খুলুন। |
01:41 | এখন ./runCellDesigner4.3 লিখুন এবং এন্টার টিপুন। |
01:52 | CellDesigner উইন্ডোটি আপনার স্ক্রীনে খোলে। |
01:56 | এখন আমাদের ইতিমধ্যে বানানো Create and Edit ফাইলটি খুলুন। |
02:02 | তাই File এ এবং তারপর Open এ ক্লিক করুন। |
02:07 | স্ক্রীনে Open নামের একটি ডায়লগ বাক্স দেখায়। |
02:11 | এখানে, Folders লেবেলের ভিতরের ফোল্ডার চয়ন করতে হবে। |
02:15 | File লেবেলে Create_and_Edit.xml ফাইলে ক্লিক করুন এবং তারপর Ok তে ডবল ক্লিক করুন। |
02:27 | আমাদের ফাইল Create_and_Edit.xml এখন ড্র এরিয়াতে খুলে গেছে। |
02:35 | কম্পার্টমেন্ট চয়ন করুন। মেন মেনুবারে Component এ যান। |
02:43 | নীচে স্ক্রোল করুন এবং Change to OVAL চয়ন করুন। |
02:48 | ড্র এরিয়াতে, এখন একটি ওভাল কম্পার্টমেন্ট রয়েছে। |
02:54 | রঙ বা বেধ বদলাতে, মেন মেনু বারে Component এ যান। |
03:00 | Change color & shape বিকল্পে ক্লিক করুন। |
03:05 | অন্যদিকে, কম্পার্টমেন্টের বাউন্ডারীতে ডান ক্লিক করুন এবং Change color & shape বিকল্প চয়ন করুন। |
03:14 | স্ক্রীনে Change color & shape নামে একটি ডায়ালগ বাক্স খোলে। |
03:20 | একটি অপেক্ষাকৃত পাতলা বাউন্ডারী লাইন বানাতে, Membrane Thickness কে 12 থেকে কমিয়ে 8 বা তার কম করুন। |
03:29 | রঙ বদলাতে, Color panel এ যান। |
03:34 | Color panel এ একটি হ্যান্ডেল, যেখানে পয়েন্টারের সাথে কলর wheel রয়েছে। |
03:39 | পয়েন্টার ক্লিক এবং হোল্ড করুন এবং পছন্দসই রঙ চয়ন করতে ঘোরান। |
03:46 | সকল পরিবর্তন করার পর Apply তে ক্লিক করুন এবং তারপর Ok তে ক্লিক করুন। |
03:53 | রিঅ্যাকশন টুলবারে বিভিন্ন কম্পার্টমেন্ট আঁকতে অন্যান্য বিকল্প সন্ধান করুন। |
04:00 | এখন Species এর পরিচয় বদলানোর উপায় শিখব। |
04:05 | প্রথমে আমরা CTRL + N টিপে একটি নতুন উইন্ডো খুলবো। |
04:11 | ফাইলটিকে একটি নাম ধরুন Change Species দেই। |
04:16 | আমরা প্রস্থ এবং উচ্চতা ডিফল্ট রাখব। Ok বোতামে ক্লিক করুন। |
04:22 | এখন, টুলবার থেকে Generic protein এর আইকনে ক্লিক করুন। ড্র এরিয়াতে ক্লিক করুন। |
04:30 | ডায়ালগ বাক্সে, Pectin লিখুন এবং Ok বোতামে ক্লিক করুন। |
04:37 | এখন Generic protein Pectin এ ডান ক্লিক করুন। |
04:41 | Change Identity বিকল্পে ক্লিক করুন। |
04:46 | স্ক্রীনে Change identity of the species নামে একটি ডায়লগ বাক্স খোলে। |
04:53 | Class বাক্সে down arrow তে ক্লিক করুন। |
04:58 | ড্রপ ডাউন মেনু থেকে একটি বিকল্প, উদাহরণস্বরূপ simple molecule চয়ন করুন। |
05:05 | এখন, Name বাক্সে এই simple molecule কে নাম দিন। |
05:10 | এটিকে Fructose বলে। Apply বোতামে ক্লিক করুন। |
05:17 | লক্ষ্য করুন Protein Pectin এখন Fructose নামে simple molecule এ বদলে গেছে। |
05:25 | এখন Cut, Copy এবং Paste করা শিখি। |
05:29 | আমি একই Fructose ব্যবহার করব যা ইতিমধ্যে ড্র এরিয়াতে বিদ্যমান। |
05:34 | Species কাট করতে, প্রথমে Species Fructose এ ক্লিক করুন। |
05:40 | Edit মেনুতে যান, নীচে স্ক্রোল করুন এবং Cut এ ক্লিক করুন। |
05:47 | লক্ষ্য করুন, Cut এর জন্য শর্টকাট কী হল Ctrl + X. |
05:53 | Species Fructose কাট করা হয়েছে। |
05:56 | স্পিসিস পেস্ট করতে, Edit মেনুতে ফিরে যান, নীচে স্ক্রোল করে Paste এ ক্লিক করুন। |
06:03 | লক্ষ্য করুন Paste এর জন্য শর্টকাট কী হল Ctrl + V. |
06:08 | Species Fructose ড্র এরিয়াতে পুনরায় দেখায়। |
06:12 | Species এর কপি বানাতে, মেন মেনু বারে Edit এ যান। |
06:18 | Copy তে ক্লিক করুন। |
06:21 | কপির জন্য শর্টকাট কী হল Ctrl + C. Copy তে ক্লিক করুন। ড্র এরিয়াতে ক্লিক করুন। |
06:31 | এখন, পেস্ট করতে Ctrl + V টিপি। |
06:36 | এখন Fructose এর একটি কপি ড্র এরিয়াতে পেস্ট করেছি। |
06:40 | কোনো ধাপ পূর্বাবস্থায় নিয়ে যেতে Ctrl + Z টিপুন এবং পুনরায় ফিরে আসতে Ctrl + Y টিপুন। |
06:51 | যদিও এগুলি ব্যবহারের কিছু সীমা রয়েছে। |
06:55 | Fructose molecules ড্রেগ করে ড্র এরিয়াতে একপাশে সরাই। |
07:00 | এটি করতে, Fructose এ ক্লিক করুন এবং এটি বাঞ্চিত স্থানে নিয়ে যান। |
07:07 | এরপর শিখব: start-point এবং end-point species কি এবং Species কিভাবে সক্রিয় করে? |
07:13 | তাই আমি ইতিমধ্যে 2 generic proteins এর মাঝে একটি state transition reaction এঁকেছি। |
07:21 | আমি তাদের Protein 1 এবং Protein 2 নাম দিয়েছি। |
07:25 | মনে রাখবেন, আমরা ইতিমধ্যে reaction আঁকা শিখেছি। |
07:29 | আপনি না জানলে এই শৃঙ্খলার পূর্ববর্তী টিউটোরিয়াল দেখুন। এখন এগোই। |
07:35 | এই রিঅ্যাকশনে, start point হল Protein 1 এবং end point হল Protein 2. |
07:43 | species সক্রিয় করতে, একটি Species এ ক্লিক করুন যা Reaction এর end-point. |
07:50 | আমাদের ক্ষেত্রে, এটি Protein 2. |
07:53 | তাই Protein 2 এ ক্লিক করুন এবং কীবোর্ডে A টিপুন। |
07:59 | এখন Ctrl + Z কী টিপে এই পরিবর্তন পূর্বাবস্থায় নিয়ে যান। |
08:05 | বিকল্পরূপে, Protein 2 এ ক্লিক করুন। |
08:09 | তারপর, মেন মেনু বারে, Component এ যান। |
08:13 | নীচে স্ক্রোল করুন এবং Set Active এ ক্লিক করুন। |
08:18 | লক্ষ্য করুন activated species একটি ড্যাশ লাইন দ্বারা আবৃত। |
08:24 | এখন species, Protein 2 এর রঙ বদলাই। |
08:29 | এতে ডান ক্লিক করুন এবং তারপর Change color and shape এ ক্লিক করুন। |
08:35 | যেমনকি আগে দেখেছি, Color প্যানেলে একটি কলর wheel রয়েছে। |
08:40 | পছন্দের রঙ চয়ন করতে পয়েন্টারে ক্লিক করুন এবং ঘোরান। |
08:44 | তারপর Apply এবং Ok তে ক্লিক করুন। |
08:49 | species এ রঙের পরিবর্তন লক্ষ্য করুন। |
08:53 | আমরা এখন Reaction এর বৈশিষ্ট্য বদলানো শিখব। |
08:57 | ড্র এরিয়াতে থাকা state transition reaction এ ফিরে আসি। |
09:03 | দুটি species এর মাঝে reaction arrow তে ডান ক্লিক করুন। |
09:08 | এখন Change Identity বিকল্প চয়ন করুন। |
09:13 | Change Properties of the Reaction নামে একটি ডায়ালগ বাক্স খোলে। |
09:18 | Name বাক্সে রিঅ্যাকশনের নাম, ধরুন Reaction1 লিখুন। |
09:26 | Type বাক্সের ড্রপ-ডাউনে আবশ্যক রিঅ্যাকশন ধরুন Transcription চয়ন করুন। Ok তে ক্লিক করুন। |
09:38 | লক্ষ্য করুন ড্র এরিয়াতে reaction বদলে গেছে। |
09:42 | আমরা সেই নাম দেখি না যা ড্র এরিয়াতে রিঅ্যাকশন অ্যারোতে দিয়ে ছিলাম। |
09:47 | চিন্তা করবেন না, আসন্ন টিউটোরিয়ালে এটি সম্পর্কে শিখব। |
09:53 | একবার আবার reaction arrow তে ডান ক্লিক করুন এবং Change Identity বিকল্পে ক্লিক করুন। |
10:00 | এটি একটি Reversible রিঅ্যাকশন হলে, TRUE বিকল্প চয়ন করুন এবং Ok তে ক্লিক করুন। |
10:09 | এখন আপনি দেখবেন যে রিঅ্যাকশন রিভার্স হয়েছে। |
10:14 | CellDesigner থেকে প্রস্থান করতে, File এ ক্লিক করে Exit বিকল্প চয়ন করুন। |
10:20 | বিকল্পরূপে, আপনি Ctrl Q টিপতে পারেন। |
10:25 | স্ক্রীনে Confirmation নামে একটি ডায়ালগ বাক্স বলে যে আমরা কি পরিবর্তনগুলি সংরক্ষণ করতে চাই। |
10:32 | Yes এ ক্লিক করুন এবং OK বোতামে ডবল ক্লিক করুন। |
10:38 | এটি বলে যে ফাইল সংশোধন করা হয়েছে। |
10:41 | Save the changes? Yes এ ক্লিক করুন। |
10:45 | সংক্ষিপ্তকরণ করি। এখানে আমরা শিখেছি: |
10:50 | ড্র এরিয়াতে ইতিমধ্যে সংরক্ষিত .xml ফাইল খোলা। |
10:55 | Compartment এর আকার, আকার, রঙ এবং বেধ বদলানো। |
11:01 | CellDesigner এ একাধিক ফাইল বানানো এবং পরিচয় বদলানো। |
11:07 | Species কাট, কপি এবং পেস্ট করা। |
11:10 | আমরা এও শিখেছি: Species এর Start-point এবং End-point সম্পর্কে। |
11:15 | Species সক্রিয় করা, Species এর রঙ বদলানো, Reaction এর properties বদলানো এবং File বন্ধ করা। |
11:25 | অনুশীলনী হিসাবে: একটি complex বানান এবং Complex এ একটি Species রাখুন। |
11:32 | অনুশীলনী 2: টুলবার সম্পর্কে শিখুন এবং দেখুন একটি রিঅ্যাকশনে reactant এবং product কিভাবে জোড়ে। |
11:41 | আপনার সম্পন্ন কাজ এইরকম হওয়া উচিত। |
11:45 | আপনার প্রথম অনুশীলনী এইরকম হতে হবে: একটি complex এবং complex এর ভিতরে থাকা complex. |
11:55 | অনুশীলনী 2 এইরকম দেখানো উচিত: একটি reactant এবং একটি product সহ state-transition reaction. |
12:00 | স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প সম্পর্কে- |
12:05 | এই লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়। এটি ডাউনলোড করে দেখুন। |
12:13 | স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল কর্মশালার আয়োজন করে। অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়। অধিক জানতে আমাদের লিখুন। |
12:23 | স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা সমর্থিত। এই মিশন সম্পর্কে আরো তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য। |
12:35 | আই আই টী বোম্বে থেকে আমি বিদায় নিচ্ছি। অংশগ্রহনের জন্যে ধন্যবাদ। |