Jmol-Application/C4/3D-Models-of-Enzymes/Assamese

Time	Narration
00:01	Jmol ত 3D Models of Enzymes এৰ এই টিউটৰিয়েলত আপোনাক স্বাগতম।
00:08	এই টিউটৰিয়েলত আমি Jmol প্যানেলত Human Pancreatic Hexokinase এৰ গঠন লোড কৰা সম্পর্কে শিকিম।
00:16	সেকেন্ডাৰি গঠনৰ ডিসপ্লে পৰিবর্তন কৰা।
00:20	সক্রিয় সাইটত অ্যামিনো অ্যাসিডৰ অবশিষ্টক হাইলাইট কৰা।
00:25	এনজাইমৰ স্তৰ(substrate) আৰু সহ উত্পাদকক(cofactors) হাইলাইট কৰা।
00:30	প্রোটিনৰ বাবে Ramachandran প্লট দেখোৱা।
00:35	টিউটৰিয়েলটো অনুসৰণ কৰিবলৈ মৌলিক বায়ো-কেমিস্ট্রি সম্পর্কে জানিব লাগিব।
00:41	Jmol অ্যাপ্লিকেশন উইন্ডোৰ পৰা মৌলিক অপাৰেশনেৰ সৈতে পৰিচিত থাকিব লাগিব।
00:46	Jmol এপ্লিকেশন শৃঙ্খলাত Proteins and Macromolecules টিউটৰিয়েলটো চাওক।
00:53	এইটো নিম্নলিখিত লিঙ্কত উপলব্ধ।
00:57	টিউটৰিয়েলটো ৰেকর্ড কৰিবলৈ ব্যবহাৰ কৰিছো, উবুন্টু অপাৰেটিং সিস্টেম সংস্কৰণ 12.04.
01:05	Jmol সংস্কৰণ 12.2.2.
01:08	জাভা সংস্কৰণ 7 আৰু মোজিলা ফায়াৰফক্স ব্রাউজাৰ 22.0.
01:16	Jmol উইন্ডো খুলক আৰু hexokinase এনজাইমৰ গঠন লোড কৰক।
01:22	মই ইন্টাৰনেটৰ সৈতে সংযুক্ত, সেয়ে মই PDB ওয়েবসাইটৰ পৰা প্রত্যক্ষভাবে গঠন লোড কৰিম।
01:28	এইটো কৰিবলৈ, File মেনু খুলক, তলত স্ক্রোল কৰক আৰু Get PDB বিকল্পত টিপক।
01:37	স্ক্রিনত এটা ইনপুট ডায়ালগ বাক্স দেখায়। hexokinase এৰ বাবে চাৰি অক্ষৰৰ PDB কোড লিখক, যি হল টেক্সট বাক্সত 3IDH.
01:50	এই কোডটো Protein Data Bank ওয়েবসাইটৰ পৰা উপলব্ধ হয়।
01:55	আপোনাৰ কার্যকৰ ইন্টাৰনেট সংযোগ নাথাকিলে টুল বাৰতopen a file আইকন ব্যবহাৰ কৰি বিদ্যমান pdb ফাইলক খুলক।
02:06	OK বোতামত টিপক।
02:09	পর্দাত প্রদর্শিত hexokinase এৰ 3D গঠন, glucokinase হিসাবেও পৰিচিত হয়।
02:16	File মেনুৰ পৰা কনসোল উইন্ডো খুলক।
02:21	কনসোলত দেখোৱাৰ দৰে, প্যানেলৰ গঠন Glucose সাব্সট্রেটৰ সৈতে Human Pancreatic Glucokinase ৰ বাবে।
02:31	কনসোল বন্ধ কৰক।
02:34	প্যানেলত hexokinase এৰ ball and stick মডেল আছে।
02:40	প্যানেলত protein মডেলৰ পৰা পানীৰ অনুক অতৰুৱাই দিয়ক।
02:44	এই প্রক্রিয়াক Jmol এৰ Proteins and macromolecules টিউটৰিয়েলত বিস্তাৰিতভাবে আলোচনা কৰা হৈছে।
02:53	Hexokinase এনজাইম সম্পর্কে।
02:56	Hexokinase হল 465 অ্যামিনো অ্যাসিডৰ এটা মনোমেৰিক প্রোটিন।
03:02	ইয়াৰ দুটা ডোমেন আছে, এটা ডাঙৰ ডোমেন আৰু এটা সৰু ডোমেন।
03:07	এই এনজাইমৰ বাবে সক্রিয় সাইট, দুটা ডোমেনৰ মাজৰ ছিদ্রত স্থিত হয়।
03:14	hexokinase এৰ বাবে সক্রিয় সাইটত 3 টা অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ আছে। 204 ত Aspergine, 231 ত Aspergine আৰু 256 ত Glutamic অ্যাসিড আছে।
03:30	Alpha-D-Glucose এই এনজাইমৰ বাবে সাব্সট্রেটস হয়।
03:34	এতিয়া আমি Jmol প্যানেলত উভতি যাও।
03:38	আমি এইৰকমে এনজাইমৰ কম্পোনেন্টক নির্বাচন আৰু হাইলাইট কৰিব পাৰো: সক্রিয় সাইটত Substrate, Cofactors বা Amino acid ৰেসিডিউ।
03:49	এটা নির্দিষ্ট কম্পোনেন্ট নির্বাচন কৰিবলৈ সো ক্লিক ব্যবহাৰ কৰি পপ-আপ মেনু খুলক।
03:55	Select বিকল্পলৈ স্ক্রোল কৰক।
03:57	সাব-মেনুৰ পৰা Proteins আৰু By Residue name নির্বাচন কৰক।
04:04	আমাৰ উচৰত পৃথক অ্যামিনো অ্যাসিডৰ ৰেসিডিউ তালিকাভুক্ত আছে।
04:10	এইটো নির্বাচন কৰিবলৈ অ্যামিনো অ্যাসিডৰ নামত টিপক।
04:14	লগতে অ্যামাইনো অ্যাসিড এইৰকমে হেডিং এৰ তলত সাৰিবদ্ধ আছে: Polar, Non-polar, Basic, Acidic, Uncharged ইত্যাদি।
04:26	Hetero মেনুত তালিকাভুক্ত আছে মেটাল আয়ন পটাসিয়াম আৰু গ্লুকোজ সাব্সট্রেট।
04:34	সাব্সট্রেট বাইন্ডিং সাইট সহজে সিনাক্ত কৰিবলৈ এনজাইমৰ ডিসপ্লেক পৰিবর্তন কৰিব পাৰি।
04:41	প্রোটিনৰ পৰমাণুৰ ডিসপ্লে আৰু ৰঙ পৰিবর্তন কৰো।
04:46	পপ-আপ মেনু খুলক, Select ত যাওক আৰু Protein বিকল্পত স্ক্রোল কৰক। All ত টিপক।
04:55	আৰু এবাৰ পপ-আপ মেনু খুলক, Styleত স্ক্রোল কৰক আৰু তাৰপিছত Schemeত। Sticks বিকল্পত টিপক।
05:05	এতিয়া আমাৰ উচৰত প্যানেলত, প্রোটিন, sticks ডিসপ্লেত আছে।
05:11	এতিয়া, ৰঙ পৰিবর্তন কৰিবলৈ আকৌ এবাৰ পপ-আপ মেনু খুলক। Color, Atoms ত যাওক, আৰু Blue বিকল্পত টিপক।
05:23	আমাৰ স্ক্রিনত নীলা ৰঙৰ hexokinase এৰ মডেল sticks ডিসপ্লেত আছে।
05:30	ক্লেফ্টেত ball and stick ডিসপ্লেত Alfa-D-Glucose সাব্সট্রেট লক্ষ্য কৰক।
05:38	সাব্সট্রেটক লক্ষনীয় কৰিবলৈ, পপ-আপ মেনু খুলক, Select ত যাওক আৰু তাৰপিছত Hetero আৰু GLC-ALFA-D-GLUCOSE ত টিপক।
05:52	আকৌ এবাৰ পপ-আপ মেনু খুলক, Style আৰু Scheme ত স্ক্রল কৰক আৰু Sticks বিকল্পত টিপক।
06:00	ৰঙ পৰিবর্তন কৰিবলৈ আকৌ এবাৰ পপ-আপ মেনু খুলক, Color আৰু Atomsত যাওক আৰু White বিকল্পত টিপক।
06:12	প্যানেলত এইটো সাব্সট্রেটৰ সৈতে পৰিষ্কাৰভাবে লক্ষনীয় হোৱা hexokinase এৰ মডেল।
06:20	আমি এইবোৰক লক্ষনীয় কৰিবলৈ সক্রিয় সাইটত অ্যামাইনো অ্যাসিডৰ ৰঙ পৰিবর্তন কৰিব পাৰি।
06:26	এইটো কৰিবলৈ, আমি কনসোল উইন্ডোত কমান্ড লিখিব লাগিব।
06:32	আগেই উল্লিখিত সক্রিয় সাইটত জড়িত অ্যামিনো অ্যাসিড Aspergine, 204 ত, Aspergine, 231ত আৰু Glutamic acid, 256 ত আছে।
06:50	File মেনুৰ পৰা কনসোল উইন্ডো খুলক। Consoleত টিপক।
06:57	মই কনসোল উইন্ডো ডাঙৰ কৰিবলৈ Kmag স্ক্রীন ম্যাগনিফায়াৰ ব্যবহাৰ কৰিছো।
07:03	$ প্রম্পটত লিখক: select বর্গাকাৰ বন্ধনীত aspergine এৰ বাবে Asn বন্ধনী বন্ধ কৰক 204 অর্থাৎ স্থান সেমিকোলন color atoms orange.
07:25	এন্টাৰ টিপক।
07:27	লক্ষ্য কৰক যে aspargine ৰেসিডিউয়ৰ পৰমাণু এতিয়া কমলা ৰঙত আছে।
07:33	কী বোর্ডত আপ অ্যাৰো বোতাম টিপক আৰু কমান্ড এডিট কৰক।
07:39	অ্যামাইনো অ্যাসিডৰ স্থান 231ত এডিট কৰক আৰু পৰমাণুৰ ৰঙ ৰঙালৈ সলাওক।
07:48	এন্টাৰ টিপক।
07:51	আকৌ এবাৰ আপ অ্যাৰো কী টিপক আৰু অ্যামাইনো অ্যাসিডৰ নাম GLU ত সলাওক যি হল গ্লুটামিক অ্যাসিড আৰু তাৰ স্থান 256ত।
08:06	পৰমাণুৰ ৰঙ সেউজীয়াত আৰু এন্টাৰ টিপক।
08:13	প্যানেলত লক্ষনীয় সক্রিয় সাইট আৰু সাব্সট্রেটৰ সৈতে hexokinaseৰ এটা 3D মডেল আছে।
08:23	লগতে মডেলত লক্ষ্যনীয় বেগুনীয়া ৰঙত থকা পটাসিয়াম পৰমাণু আছে।
08:30	লগতে আমি jmol ত এটা বিশেষ প্রোটিনৰ বাবে ramachandran প্লট দেখিব পাৰো।
08:36	কনসোলত, $ প্রম্পটত লিখক plot ramachandran
08:45	এন্টাৰ টিপক।
08:47	স্ক্রিনত hexokinase এৰ বাবে ramachandran প্লট আছে।
08:54	ডাটাবেসৰ পৰা পিডিবি ফাইলৰ দ্বাৰা বিভিন্ন এনজাইম লোড কৰাৰ চেষ্টা কৰক।
09:00	সেকেন্ডাৰি স্ট্রাকচাৰৰ ডিসপ্লে পৰিবর্তন কৰক।
09:04	সংক্ষিপ্তকৰণ কৰো। এই টিউটৰিয়েলত শিকিছো পিডিবি কোড ব্যবহাৰ কৰিHuman Pancreatic Hexokinase এৰ স্ট্রাকচাৰ লোড কৰা।
09:14	সেকেন্ডাৰি স্ট্রাকচাৰৰ ডিসপ্লে পৰিবর্তন কৰা।
09:17	সক্রিয় সাইটত অ্যামাইনো অ্যাসিডৰ ৰেসিডিউ লক্ষনীয় কৰা।
09:21	এনজাইমৰ সাব্সট্রেট আৰু কো-ফ্যাক্টৰ লক্ষনীয় কৰা।
09:25	আৰু প্রোটিনৰ বাবে ramachandran plot দেখা।
09:30	নির্দেশিত কাম হিসাবে Jmol প্যানেলত Lysozyme এনজাইমৰ ডট পিডিবি ফাইল লোড কৰক।
09:38	এনজাইমত আবদ্ধ সাব্সট্রেট লক্ষনীয় কৰক।
09:42	সক্রিয় সাইটত অ্যামাইনো অ্যাসিড লক্ষনীয় কৰক।
09:46	ইঙ্গিত: পিডিবি ডাটাবেসৰ পৰা Lysozyme এৰ পিডিবি ফাইল প্রাপ্ত কৰক।
09:52	এই URL এ উপলব্ধ ভিডিওটো চাওক।
09:56	এইটোৱে প্রকল্পক সাৰসংক্ষেপে বোজায়।
10:00	ভাল ব্যান্ডউইডথ নাথাকিলে ভিডিওটি ডাউনলোড কৰি চাওক।
10:04	স্পোকেন টিউটৰিয়েল প্রকল্প দলে
10:07	কর্মশালাৰ আয়োজন কৰে আৰু প্রশংসাপত্র দিয়ে।
10:10	বিস্তাৰিত তথ্যৰ বাবে আমালৈ লিখক।
10:14	স্পোকেন টিউটৰিয়েল প্রকল্প Talk to a Teacher প্রকল্পৰ অংশবিশেষ।
10:19	এইটো ভাৰত সৰকাৰৰ ICT, MHRD এৰ জাতীয় শিক্ষা মিশনৰ দ্বাৰা সমর্থিত।
10:25	এই বিষয়ত বিস্তাৰিত তথ্য এই লিঙ্কত প্রাপ্তিসাধ্য।
10:30	আই আই টি বম্বেৰ পৰা মই মৌচুমী মেধি এতিয়া আপোনাৰ পৰা বিদায় লৈছো। অংশগ্রহনৰ বাবে ধন্যবাদ।

Contributors and Content Editors

Mousumi