Jmol-Application/C3/Crystal-Structure-and-Unit-Cell/Gujarati
From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 15:51, 8 February 2016 by Jyotisolanki (Talk | contribs)
| |
|
|---|---|
| 00:01 | Jmol. માં Crystal Structure and unit cell પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છે. |
| 00:07 | આ ટ્યુટોરીયલ માં, આપણે Crystallography Open Database. થી CIF એટલેકે Crystallographic Information file ને ડાઉનલોડ કરતા. |
| 00:17 | જેમોલમાં CIF ખોલતા. |
| 00:20 | જેમોલ પેનલ પર unit cell અને unit cell parameters ને દર્શાવતા. |
| 00:25 | અને વિવિધ ક્રિસ્ટલ સીસ્ટમના ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરને દર્શાવતા. ઉદાહરણ તરીકે Cubic, Hexagonal અને Rhombohedral.. (ક્યુબીક, હેક્સાગોનલ અને રોમ્બોહેડ્રલ ) |
| 00:34 | આ ટ્યુટોરીયલના સંદર્ભમાટે તમને હાઇ સ્કૂલ કેમિસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જોઈએ. |
| 00:39 | અને જેમોલ વિન્ડો ઓપરેશન સાથે પરિચિત હોવા જોઈએ.
|
| 00:42 | જો નથી તો વેબ સાઈટ પર ઉપલબ્ધ સંબંધિત ટ્યુટોરિયલ જુઓ. |
| 00:48 | આ ટ્યુટોરીયલ રિકોર્ડ કરવા માટે હું ઉપયોગ કરી રહી છું Ubuntu OS version. 14.04 |
| 00:54 | Jmol version 12.2.32 |
| 00:57 | Java version 7 અને |
| 01:01 | Mozilla Firefox browser 35.0 |
| 01:04 | ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર સાત ક્રિસ્ટલ સીસ્ટમ ના અંતર્ગત ગ્રુપ કરવામાં આવે છે. |
| 01:08 | આ ટેબલ ક્રિસ્ટલ સીસ્ટમ અને તેથી સમ્બન્ધિત લેટીસ પેરામીટરસની યાદી દેખાડે છે. |
| 01:14 | કંપાઉન્ડસ અને મિનરલસ ના ક્રીસ્ટલસ ના માટે ઉદાહરણ અહી યાદીબદ્ધ છે. |
| 01:20 | આપણે જેમોલ પેનલ પર Sodium chloride, Graphite and Calcite (સોડીયમ ક્લોરાઈડ, ગ્રેફાઈટ, અને કેલ્સાઈટ,) ના ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરસ દેખાડીશું. |
| 01:27 | ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરસ ને જેમોલ પર દેખાડવા માટે: |
| 01:31 | આપણને એક વિશેષ ક્રીસ્ટલના માટે Crystallographic Information File ડાઉનલોડ કરવાની જુરીયાત છે . |
| 01:37 | CIF ક્રીસ્ટલોગ્રાફિક ઇન્ફ્રોર્મશન ને જોવા માટે એક સ્ટેન્ડડ ટેક્સ્ટ ફાઈલ ફોરમેટ છે. |
| 01:43 | CIF ફોરમેટ .cif. એક્સ્ટેંશન ધરાવે છે. |
| 01:48 | Crystallography Open Database એ ઓપન એક્સેસ ડેટાબેસ છે. |
| 01:53 | ડાઉનલોડ થવા વાળું CIF COD વેબસાઈટ પર ઉપલભ્ધ છે. |
| 01:58 | વેબસાઈટ આપેલ લીંક થી એક્સેસ કરી શકાય છે. |
| 02:03 | હવે COD' ડેટાબેસ ખોલીએ અને અમુક CIF ફાઈલસ ડાઉનલોડ કરીએ. |
| 02:10 | અહી મેં COD વેબસાઈટ ખોલી છે. |
| 02:13 | પેજના ડાબી બાજુ એ જાણકારી અનેક શીર્ષકોમાં વિભાજીત કરાવાય છે. |
| 02:19 | Under the heading Accessing COD Data, શીર્ષકમાં ઉપશીર્ષક જેમકે Browse, Search વગરે. |
| 02:27 | Search વિકલ્પ પર ક્લિક કરો એક નવું પેજ ખુલશે. |
| 02:31 | Search પેજ પર આપણેને CIF ફાઈલ ના માટે અનેક વિકલ્પ શોધવાના છે. |
| 02:36 | Hints and Tips લીંક પર ક્લિક કરો .
સર્ચ વિકલ્પને અસરકારક રૂપે કેસે ઉપયોગ થાય તેને આ જાણકારી સાથે એક પેજ ખુલે છે. |
| 02:46 | સર્ચ પેજ પર પાછા જાવ. |
| 02:59 | COD ID નો ઉપયોગ કરીને આપણે આપેલ પ્રકારથી ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરને શોધી શકીએ છીએ. |
| 02:54 | OpenBabel Fastsearch ટેક્સ્ટ બોક્સમાં કેમિકલ અથવા મિનરલનું નામ ટાઈપ કરીને. |
| 03:01 | ઉદાહરણ તરીકે સોડીયમ ક્લોરાઈડની CIF ફાઈલ ને શોધવા માટે |
| 03:06 | ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “Halite” je સોડીયમ ક્લોરાઈડ નું મિનરલ નામ છે |
| 03:12 | elements બોક્સ માટે નીચે સ્ક્રોલ કરો . |
| 03:15 | ટાઇપ કરો Na સોડીયમ માટે અને Cl ક્લોરાઈડ માટે |
| 03:20 | Number of distinct elements બોક્સ માટે નીચે સ્ક્રોલ કરો. |
| 03:24 | અહી આપણી પાસે મીનીમમ અને મેક્ઝીમમ એલિમેન્ટસ ટાઈપ કરવાનો વિકલ્પ છે. |
| 03:29 | મીનીમમ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 2 જો તમે ફક્ત બે એલિમેન્ટસ ના સાથે ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર ઈચ્છો છો. જે Sodium અને Chloride છે.
|
| 03:37 | Send બટન પર ક્લિક કરો. |
| 03:40 | સોડીયમ ક્લોરાઈડના માટે ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર એટ ફાઈલસ નાસાથે એક પેજ ખુલે છે. |
| 03:45 | COD ID પર જમણું ક્લિક કરો અને “open the link in a new tab” પર ક્લિક કરો. |
| 03:51 | આ પેજ તે વિશેષ ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર થી સમ્બન્ધિત વિસ્તૃત જાણકારી ધારાવે છે. |
| 03:57 | ડેટાબેસ વેબપેજ પર પાછા જાવ. |
| 04:00 | “archive of CIF files” લીંક પર ક્લિક કરો જે પેજ ના જમણી બાજુએ છે. |
| 04:08 | સ્ક્રીન પર ડાઈલોગ બોક્સ ખુલે છે Open with વિકલ્પ પસંદ કરો. OK બટન પર ક્લિક કરો. |
| 04:17 | સ્ક્રીન પર સોડીયમ ક્લોરાઈડ ક્રીસ્ટલ ના માટે અનેક CIF ફાઈલના સાથે એક ફોલ્ડર ખુલે છે. |
| 04:23 | જ ફાઈલસ તમે ડાઉનલોડ કરવા ઈચ્છો છો તે પર ક્લિક કરીને તેને પસંદ કરો. |
| 04:28 | ટૂલ બાર પર “Extract” બટન ને ક્લિક કરો. |
| 04:32 | પોતાના સીસ્ટમ પર અનુકૂળ સ્થાન પર ફાઈલોને સેવ કરો. |
| 04:37 | Extract. પર ક્લિક કરો. વિન્ડો ને બંદ કરો. |
| 04:41 | સર્ચ પેજ પર પાછા જાવ. |
| 04:43 | હવે પહેલાની જેમ જ સમાન પ્રક્રિયાનો ઉપયોગ કરીને graphite અને calcite નું CIF ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો. |
| 04:51 | હવે આપણે જેમોલમાં sodium chloride ની CIF ફાઈલ ખોલીશ. |
| 04:55 | અહી મેં જેમોલ વિન્ડો ખોલી છે. |
| 04:59 | Click on “Open a file” icon in the tool bar. |
| 05:03 | Navigate to the location of the CIF file of sodium chloride. which we have downloaded from the COD database. |
| 05:12 | Click on Open. |
| 05:14 | Unit cell of sodium chloride crystal opens on the screen. |
| 05:19 | Unit cell is the smallest repeating unit in a crystal. |
| 05:23 | Stacking of these unit cells in 3 dimensions will form the basis of the crystal structure. |
| 05:29 | Back to the Jmol Panel. |
| 05:32 | Relevant data for unit cell is displayed on the left-hand side of the panel. |
| 05:37 | It begins with the space group classification. |
| 05:41 | Sodium Chloride belongs to the cubic lattice system. Hence the vectors a, b and c are equal. |
| 05:50 | The angles alpha, beta and gamma are 90 degrees. |
| 05:55 | Right click to open the pop-up menu. |
| 05:59 | Scroll down to Symmetry option. |
| 06:01 | In the sub-menu we have options to display symmetry elements. |
| 06:05 | We can also display blocks of unit cells using the options in the sub-menu. |
| 06:10 | For example click on Reload {1 1 1} option. |
| 06:15 | On the panel we have a unit cell block, showing face center cubic lattice. |
| 06:21 | To change the display; Open the pop-up menu, scroll down to style then scheme and click on CPK Spacefill. |
| 06:29 | Here on the panel we have the crystal structure in CPK display. |
| 06:34 | Open the pop-up menu again scroll down to symmetry and click on Reload {4 4 4 6 6 6 1}option. |
| 06:44 | This option loads the 27 cell block on Jmol panel. |
| 06:49 | Open the pop-up menu go to symmetry go back to Reload {1 1 1} option. |
| 06:56 | To display the symmetry elements, open the pop-up menu again. |
| 07:00 | Scroll down to symmetry in the sub-menu and click on mirrorplane (x z y) option . |
| 07:08 | On the panel we have a cubic lattice with mirrorplane (x z y) displayed. |
| 07:16 | Let us now load the CIF file for graphite ,which belongs to hexagonal crystal system. |
| 07:22 | As shown earlier use Open a file option to load the CIF file for graphite on the panel. |
| 07:29 | Unit cell for graphite opens on the panel. |
| 07:33 | Observe the unit cell parameters, |
| 07:35 | The vectors a equal to b but not equal to c. |
| 07:40 | Angles, alpha and beta equal to 90 degrees and gamma equal to 120 degrees. |
| 07:47 | Open the pop-up menu scroll down to Symmetry and click on Reload {444 666 1} option. |
| 07:56 | Hexagonal lattice arrangement of atoms is shown on the screen. |
| 08:01 | To change the display , open the pop-up menu go to style, go to scheme click on wireframe option. |
| 08:10 | Similarly I have opened a CIF file of mineral calcite on the panel. |
| 08:16 | Calcite belongs to the rhombohedral crystal system. |
| 08:20 | You can open the CIF of any crystal system and explore the structure and symmetry options. |
| 08:27 | Let's summarize, In this tutorial we have learnt to Download CIF from Crystallography Open Database. |
| 08:35 | Open CIF in Jmol. |
| 08:38 | Display unit cell and unit cell parameters. |
| 08:41 | And display crystal structures of sodium chloride, graphite and calcite. |
| 08:47 | For assignment
Download CIF for quartz crystal from COD database. |
| 08:53 | Display unit cell on Jmol panel and explore the symmetry options. |
| 08:59 | This video summarizes the Spoken Tutorial project |
| 09:02 | If you do not have good bandwidth, you can download and watch it. |
| 09:06 | We Conducts workshops using spoken tutorials and Give certificates.
Please contact us. |
| 09:12 | The spoken tutorial project is funded by NMEICT-MHRD govt of India. |
| 09:18 | This is Snehalatha from IIT Bombay signing off. Thank you for joining. |
