Jmol-Application/C3/Surfaces-and-Orbitals/Kannada

Time	Narration
00:01	Jmol Application (ಜೆ-ಮೊಲ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್) ನಲ್ಲಿ, Surfaces and Orbitals (ಸರ್ಫೇಸಸ್ ಆಂಡ್ ಆರ್ಬಿಟಾಲ್ಸ್) ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗೆ ನಿಮಗೆ ಸ್ವಾಗತ.
00:07	ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ನಾವು:
00:10	* 'Alicyclic'(ಅಲಿಸೈಕ್ಲಿಕ್) ಹಾಗೂ 'Aromatic'(ಆರೋಮ್ಯಾಟಿಕ್) ಅಣುಗಳ ಮಾಡೆಲ್ ಗಳನ್ನು ರಚಿಸುವುದು
00:14	* ಅಣುಗಳ ವಿವಿಧ ಮೇಲ್ಮೈಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವುದು
00:18	* ಅಟೋಮಿಕ್ ಮತ್ತು ಮೊಲೆಕ್ಯೂಲರ್ ಆರ್ಬಿಟಲ್ ಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವುದು ಇತ್ಯಾದಿಗಳನ್ನು ಕಲಿಯುವೆವು.
00:22	ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ಅನುಸರಿಸಲು, ನೀವು ಜೆ-ಮೊಲ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್ ನಲ್ಲಿ, ಮೊಲೆಕ್ಯುಲರ್ ಮಾಡೆಲ್ ಗಳನ್ನು ರಚಿಸುವುದನ್ನು ಮತ್ತು ಎಡಿಟ್ ಮಾಡುವುದನ್ನು ತಿಳಿದಿರಬೇಕು.
00:29	ಇಲ್ಲದಿದ್ದರೆ, ಸಂಬಂಧಪಟ್ಟ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗಳನ್ನು ನಮ್ಮ ವೆಬ್ಸೈಟ್ ನಲ್ಲಿ ನೋಡಿ.
00:35	ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಮಾಡಲು, ನಾನು:
00:38	Ubuntu OS ಆವೃತ್ತಿ 12.04
00:42	Jmol ಆವೃತ್ತಿ 12.2.2 ಹಾಗೂ
00:45	Java (JRE) ಆವೃತ್ತಿ 7 ಇವುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ.
00:48	ನಾನು ಒಂದು ಹೊಸ ‘ಜೆ-ಮೊಲ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್’ ವಿಂಡೋಅನ್ನು ತೆರೆದಿದ್ದೇನೆ.
00:52	ಮೊದಲು, ‘ಸೈಕ್ಲೋಹೆಕ್ಸೇನ್’ನ ಒಂದು ಮಾಡೆಲ್ ಅನ್ನು (cyclohexane) ನಾವು ರಚಿಸೋಣ.
00:56	ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯುದ ಮೇಲೆ (modelkit menu) ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ.
00:59	ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ ಮೀಥೇನ್ ನ ಒಂದು ಮಾಡೆಲ್ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.
01:03	To create cyclohexane, we have to make a ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್ chain of six ಕಾರ್ಬನ್ atoms.
01:09	We will substitute the ಹೈಡ್ರೋಜನ್ in the model with a methyl group.
01:13	To do so, we will place the cursor on the ಹೈಡ್ರೋಜನ್ and click on it.
01:18	This is a model of ethane on screen.
01:21	Repeat this step another 2 times and replace one ಹೈಡ್ರೋಜನ್ at a time with a methyl group.
01:28	Click on the ಹೈಡ್ರೋಜನ್s in such a way that the structure forms a circle.
01:33	Now, rotate the structure on screen using the Rotate molecule tool.
01:38	This is the structure of butane on the panel.
01:41	ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯುದ ಮೇಲೆ ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ.
01:45	Click on ಹೈಡ್ರೋಜನ್ on any of the carbon atoms present at the end of the chain.
01:52	Here is a model of pentane ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ
01:55	Click on one of the ಹೈಡ್ರೋಜನ್s, that is close to the end of the carbon chain.
02:00	A model of cyclohexane is created ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ
02:04	Use minimize option in the ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯು to optimize the structure.
02:09	The model of Cyclohexane is now, in its most stable “chair” conformation.
02:15	Alternately, we can also use Drag to bond option in ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯು to create cyclic structures.
02:24	I will use a model of pentane to demonstrate this feature.
02:29	This is a model of pentane ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ
02:32	To convert this into cyclopentane, select Drag to bond option from the ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯು
02:40	Place the cursor on the ಕಾರ್ಬನ್ present at one end of the chain.
02:45	Hold down the mouse button.
02:47	Without releasing the mouse button, bring the cursor to the ಕಾರ್ಬನ್ present at the other end of the chain.
02:54	Now release the mouse button.
02:57	We have a model of cyclopentane ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ
03:01	Now Let us go back to the Jmol panel with the model of cyclohexane.
03:06	Let us now convert cyclohexane to a benzene ring.
03:10	We have to introduce double bonds at alternate positions in the cyclohexane ring.
03:16	Open the ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯು
03:19	Place the cursor on the bond between any two carbon atoms and click on it.
03:25	We now have cyclohexene ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ.
03:29	Next, we need to introduce two more double bonds in the structure, to convert it to benzene.
03:36	Click on the bond between the next two alternate carbon atoms.
03:41	We have a model of benzene ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ.
03:44	Do the energy minimization to get a stable conformation.
03:49	Surface topology of the molecules can be displayed by using Jmol Application.
03:56	To view different surfaces, open the pop-up menu.
04:01	Ensure that the ಮಾಡೆಲ್-ಕಿಟ್ ಮೆನ್ಯು is closed, if it is open.
04:06	Now, right-click ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ, to open the Pop-up menu.
04:10	Scroll down and select "Surfaces".
04:14	A sub-menu opens with many options.
04:18	Dot Surface
04:20	van der Waal's
04:21	and some others.
04:23	For demonstration purpose, I will select Molecular surface.
04:28	The model of Benzene is displayed with a molecular surface.
04:33	Let us change it to another surface, say, Dot Surface.
04:38	So, open the Pop-up menu again, and choose Dot Surface.
04:44	We can also make the surfaces opaque or translucent.
04:48	To do so, open the Pop-up menu,
04:52	Scroll down to Surfaces and select Make Opaque options.
04:59	Observe that the benzene model has become opaque.
05:03	To turn off the surface option, open the Pop-up menu, choose Surfaces.
05:10	scroll down to Off and click on it.
05:15	Now, we have a model of benzene without any surfaces.
05:20	Jmol can display atomic and molecular orbitals of molecules.
05:25	Atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s can be displayed on screen by writing commands on the console.
05:32	Open a new Jmol window by clicking on File and New.
05:37	Now open the console window by clicking on File and then on Console.
05:43	The console window opens on the screen.
05:47	I am using KMag Screen magnifier to magnify the console window.
05:53	The command line for atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s starts with isosurface phase atomicorbital.
06:00	At the ($) dollar prompt type: isosurface phase atomicorbital.
06:06	This is followed by quantum numbers n. l and m that are specific for each atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್.
06:14	To display 's' ಆರ್ಬಿಟಲ್. type 2 0 0
06:20	The Numbers 2, 0, 0 represent n, l and m quantum numbers respectively.
06:27	'Enter' ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ. to execute the command.
06:31	We have s ಆರ್ಬಿಟಲ್ displayed ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ.
06:35	Here are few more examples of atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s and the corresponding script commands.
06:41	The command line is same for all atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
06:45	To display the previous command on the console, press up arrow key on the keyboard.
06:51	Edit n, l and m quantum numbers to 2 1 1.
06:58	'Enter' ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ. and see the 'px' ಆರ್ಬಿಟಲ್ on the Jmol panel.
07:05	Press up arrow key again and edit n, l and m to 3 2 and -1.
07:13	Press Enter key and see the 'dxy' ಆರ್ಬಿಟಲ್ on the Jmol panel.
07:19	We can also save these images in different file formats like jpg, png ಅಥವಾ pdf.
07:27	Here is a list of commands for all atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s (s, p, d, and f).
07:35	Shown on this slide are models of atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
07:40	They were created with the help of script commands written on the console.
07:45	Here I have opened a new Jmol panel and console to show how to display molecular ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
07:53	Hybridized molecular orbitals such as sp3, sp2 and sp can be displayed using Jmol.
08:02	We have a model of methane ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ.
08:06	Methane has molecular orbitals of the type: sp3.
08:11	Linear Combination of Atomic Orbitals i.e. LCAO method is used to create molecular ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
08:21	So, the command line starts with 'lcaocartoon', followed by create and the name of the ಆರ್ಬಿಟಲ್.
08:30	At the dollar prompt type: lcaocartoon create sp3
08:36	'Enter' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
08:38	Observe the model of methane with sp3 hybridized molecular orbitals.
08:45	To display sp2 hybridized molecular orbitals, we will take ethene as an example.
08:52	This is a molecule of ethene ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ
08:56	Ethene molecule has three sp2 hybridized molecular orbitals. They are named sp2a, sp2b and sp2c.
09:08	At the dollar prompt, type: lcaocartoon create sp2a , 'Enter' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
09:17	Observe the sp2 orbital on the ethene model ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ
09:22	Press up arrow key and change sp2a to sp2b, 'Enter' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
09:31	Again, press up arrow key and change sp2b to sp2c, 'Enter' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
09:41	Finally for the pi bond, edit the name of the orbital as pz.
09:48	ಪ್ಯಾನೆಲ್ ನ ಮೇಲೆ, we have ethene molecule with all the molecular ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
09:55	This slide shows examples of few other molecules with molecular ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
10:01	Explore the website for Jmol Script documentation for more information.
10:08	Let's summarize.
10:10	In this tutorial we have learnt to
10:12	Create a model of cyclohexane and cyclopentane
10:17	Create a model of benzene
10:19	Display surface topology of molecules.
10:23	We also learnt to
10:24	Display Atomic ಆರ್ಬಿಟಲ್s (s, p, d, f)
10:29	Display Molecular orbitals (sp3, sp2 and sp) by writing script commands on the console.
10:38	ಇಲ್ಲಿ ಒಂದು ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ ಇದೆ.
10:40	Create a model of 2-Butene and display molecular orbitals.
10:45	Explore lcaocartoon command to change the color and size of molecular ಆರ್ಬಿಟಲ್s.
10:52	ಕಮಾಂಡ್ ಗಳ ಲಿಸ್ಟ್ ಗಾಗಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಲಿಂಕ್ ಅನ್ನು ನೋಡಿ.
10:57	ಈ ಕೆಳಗಿನ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ವಿಡಿಯೋಅನ್ನು ನೋಡಿ. http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial
11:01	ಇದು ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೋಜೆಕ್ಟ್ ನ ಸಾರಾಂಶವಾಗಿದೆ.
11:04	ನಿಮ್ಮಲ್ಲಿ ಸರಿಯಾದ ಬ್ಯಾಂಡ್ವಿಡ್ತ್ ಇಲ್ಲದಿದ್ದಲ್ಲಿ, ನೀವು ಇದನ್ನು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ ನೋಡಬಹುದು.
11:09	‘ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್’ ತಂಡವು:
11:11	* ‘ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್’ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ಕಾರ್ಯಶಾಲೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸುತ್ತದೆ.
11:15	* ‘ಆನ್ ಲೈನ್ ಟೆಸ್ಟ್’ ನಲ್ಲಿ ಉತ್ತೀರ್ಣರಾದವರಿಗೆ ಪ್ರಮಾಣಪತ್ರವನ್ನು ಕೊಡಲಾಗುತ್ತದೆ.
11:19	ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, ದಯವಿಟ್ಟು ಇಲ್ಲಿಗೆ ಬರೆಯಿರಿ: contact@spoken-tutorial.org
11:26	‘ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್’, ‘ಟಾಕ್ ಟು ಎ ಟೀಚರ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್’ ನ ಭಾಗವಾಗಿದೆ.
11:30	ಇದು ICT, MHRD ಮೂಲಕ ರಾಷ್ಟ್ರೀಯ ಸಾಕ್ಷರತಾ ಮಿಷನ್, ಭಾರತ ಸರ್ಕಾರದಿಂದ ಬೆಂಬಲಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ.
11:37	ಈ ಮಿಷನ್ನಿನ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯು ಕೆಳಗಿನ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ: [1]
11:42	IIT Bombay ಯಿಂದ, ‘ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್’ನ ಅನುವಾದಕಿ ಸಂಧ್ಯಾ ಪುಣೇಕರ್ ಹಾಗೂ ಪ್ರವಾಚಕ….. ವಂದನೆಗಳು.

Contributors and Content Editors

Sandhya.np14