Jmol-Application/C3/Crystal-Structure-and-Unit-Cell/Gujarati

From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 16:11, 8 February 2016 by Jyotisolanki (Talk | contribs)

Jump to: navigation, search
Time
Narration
00:01 Jmol. માં Crystal Structure and unit cell પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છે.
00:07 આ ટ્યુટોરીયલ માં, આપણે Crystallography Open Database. થી CIF એટલેકે Crystallographic Information file ને ડાઉનલોડ કરતા.
00:17 જેમોલમાં CIF ખોલતા.
00:20 જેમોલ પેનલ પર unit cell અને unit cell parameters ને દર્શાવતા.
00:25 અને વિવિધ ક્રિસ્ટલ સીસ્ટમના ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરને દર્શાવતા. ઉદાહરણ તરીકે Cubic, Hexagonal અને Rhombohedral.. (ક્યુબીક, હેક્સાગોનલ અને રોમ્બોહેડ્રલ )
00:34 આ ટ્યુટોરીયલના સંદર્ભમાટે તમને હાઇ સ્કૂલ કેમિસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જોઈએ.
00:39 અને જેમોલ વિન્ડો ઓપરેશન સાથે પરિચિત હોવા જોઈએ.


00:42 જો નથી તો વેબ સાઈટ પર ઉપલબ્ધ સંબંધિત ટ્યુટોરિયલ જુઓ.
00:48 આ ટ્યુટોરીયલ રિકોર્ડ કરવા માટે હું ઉપયોગ કરી રહી છું Ubuntu OS version. 14.04
00:54 Jmol version 12.2.32
00:57 Java version 7 અને
01:01 Mozilla Firefox browser 35.0
01:04 ક્રિસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર સાત ક્રિસ્ટલ સીસ્ટમ ના અંતર્ગત ગ્રુપ કરવામાં આવે છે.
01:08 આ ટેબલ ક્રિસ્ટલ સીસ્ટમ અને તેથી સમ્બન્ધિત લેટીસ પેરામીટરસની યાદી દેખાડે છે.
01:14 કંપાઉન્ડસ અને મિનરલસ ના ક્રીસ્ટલસ ના માટે ઉદાહરણ અહી યાદીબદ્ધ છે.
01:20 આપણે જેમોલ પેનલ પર Sodium chloride, Graphite and Calcite (સોડીયમ ક્લોરાઈડ, ગ્રેફાઈટ, અને કેલ્સાઈટ,) ના ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરસ દેખાડીશું.
01:27 ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરસ ને જેમોલ પર દેખાડવા માટે:
01:31 આપણને એક વિશેષ ક્રીસ્ટલના માટે Crystallographic Information File ડાઉનલોડ કરવાની જુરીયાત છે .
01:37 CIF ક્રીસ્ટલોગ્રાફિક ઇન્ફ્રોર્મશન ને જોવા માટે એક સ્ટેન્ડડ ટેક્સ્ટ ફાઈલ ફોરમેટ છે.
01:43 CIF ફોરમેટ .cif. એક્સ્ટેંશન ધરાવે છે.
01:48 Crystallography Open Database એ ઓપન એક્સેસ ડેટાબેસ છે.
01:53 ડાઉનલોડ થવા વાળું CIF COD વેબસાઈટ પર ઉપલભ્ધ છે.
01:58 વેબસાઈટ આપેલ લીંક થી એક્સેસ કરી શકાય છે.
02:03 હવે COD' ડેટાબેસ ખોલીએ અને અમુક CIF ફાઈલસ ડાઉનલોડ કરીએ.
02:10 અહી મેં COD વેબસાઈટ ખોલી છે.
02:13 પેજના ડાબી બાજુ એ જાણકારી અનેક શીર્ષકોમાં વિભાજીત કરાવાય છે.
02:19 Under the heading Accessing COD Data, શીર્ષકમાં ઉપશીર્ષક જેમકે Browse, Search વગરે.
02:27 Search વિકલ્પ પર ક્લિક કરો એક નવું પેજ ખુલશે.
02:31 Search પેજ પર આપણેને CIF ફાઈલ ના માટે અનેક વિકલ્પ શોધવાના છે.
02:36 Hints and Tips લીંક પર ક્લિક કરો .

સર્ચ વિકલ્પને અસરકારક રૂપે કેસે ઉપયોગ થાય તેને આ જાણકારી સાથે એક પેજ ખુલે છે.

02:46 સર્ચ પેજ પર પાછા જાવ.
02:59 COD ID નો ઉપયોગ કરીને આપણે આપેલ પ્રકારથી ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરને શોધી શકીએ છીએ.
02:54 OpenBabel Fastsearch ટેક્સ્ટ બોક્સમાં કેમિકલ અથવા મિનરલનું નામ ટાઈપ કરીને.
03:01 ઉદાહરણ તરીકે સોડીયમ ક્લોરાઈડની CIF ફાઈલ ને શોધવા માટે
03:06 ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો “Halite” je સોડીયમ ક્લોરાઈડ નું મિનરલ નામ છે
03:12 elements બોક્સ માટે નીચે સ્ક્રોલ કરો .
03:15 ટાઇપ કરો Na સોડીયમ માટે અને Cl ક્લોરાઈડ માટે
03:20 Number of distinct elements બોક્સ માટે નીચે સ્ક્રોલ કરો.
03:24 અહી આપણી પાસે મીનીમમ અને મેક્ઝીમમ એલિમેન્ટસ ટાઈપ કરવાનો વિકલ્પ છે.
03:29 મીનીમમ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 2 જો તમે ફક્ત બે એલિમેન્ટસ ના સાથે ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર ઈચ્છો છો. જે Sodium અને Chloride છે.


03:37 Send બટન પર ક્લિક કરો.
03:40 સોડીયમ ક્લોરાઈડના માટે ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર એટ ફાઈલસ નાસાથે એક પેજ ખુલે છે.
03:45 COD ID પર જમણું ક્લિક કરો અને “open the link in a new tab” પર ક્લિક કરો.
03:51 આ પેજ તે વિશેષ ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચર થી સમ્બન્ધિત વિસ્તૃત જાણકારી ધારાવે છે.
03:57 ડેટાબેસ વેબપેજ પર પાછા જાવ.
04:00 archive of CIF files” લીંક પર ક્લિક કરો જે પેજ ના જમણી બાજુએ છે.
04:08 સ્ક્રીન પર ડાઈલોગ બોક્સ ખુલે છે Open with વિકલ્પ પસંદ કરો. OK બટન પર ક્લિક કરો.
04:17 સ્ક્રીન પર સોડીયમ ક્લોરાઈડ ક્રીસ્ટલ ના માટે અનેક CIF ફાઈલના સાથે એક ફોલ્ડર ખુલે છે.
04:23 જ ફાઈલસ તમે ડાઉનલોડ કરવા ઈચ્છો છો તે પર ક્લિક કરીને તેને પસંદ કરો.
04:28 ટૂલ બાર પર “Extract” બટન ને ક્લિક કરો.
04:32 પોતાના સીસ્ટમ પર અનુકૂળ સ્થાન પર ફાઈલોને સેવ કરો.
04:37 Extract. પર ક્લિક કરો. વિન્ડો ને બંદ કરો.
04:41 સર્ચ પેજ પર પાછા જાવ.
04:43 હવે પહેલાની જેમ જ સમાન પ્રક્રિયાનો ઉપયોગ કરીને graphite અને calcite નું CIF ફાઈલ ડાઉનલોડ કરો.
04:51 હવે આપણે જેમોલમાં sodium chloride ની CIF ફાઈલ ખોલીશ.
04:55 અહી મેં જેમોલ વિન્ડો ખોલી છે.
04:59 ટૂલ બારમાં '“Open a file”' આઇકન પર ક્લિક કરો.
05:03 sodium chloride. ની CIF ફાઈલના લોકેશન પર જાવ જે આપણે COD ડેટાબેસ થી ડાઉનલોડ કર્યું છે.
05:12 Open પર ક્લિક કરો.
05:14 સ્ક્રીન પર સોડીયમ ક્લોરાઈડ ક્રીસ્ટલનું Unit cell ખુલે છે.
05:19 Unit cell ક્રીસ્ટલમાં બધાથી નાની પુનરાવર્તન થવા વાડી યુનિટ છે.
05:23 આ યુનિટ સેલનું 3 ડાઈમેન્શન માં સ્ટેક કરવું ક્રીસ્ટલ સ્ટ્રક્ચરનું આધાર બનાવશે.
05:29 જેમોલ પેનલ પર પાછા જાવ.
05:32 યુનિટ સેલથી સમ્બન્ધિત ડેટા પેનલ ના ડાબી બાજુએ પ્રદશિત થાય છે.
05:37 space group વર્ગીકરણ ના સાથે શરુ થાય છે.
05:41 સોડીયમ ક્લોરાઈડ, ક્યુબીક લેટીક્સ સીસ્ટમથી અનુસરે છે. તે માટે a, b અને c સમાન હોય છે.
05:50 એન્ગલ્સ alpha, beta અને gamma 90 degrees. હોય છે.
05:55 Right click to open the pop-up menu.
05:59 Scroll down to Symmetry option.
06:01 In the sub-menu we have options to display symmetry elements.
06:05 We can also display blocks of unit cells using the options in the sub-menu.
06:10 For example click on Reload {1 1 1} option.
06:15 On the panel we have a unit cell block, showing face center cubic lattice.
06:21 To change the display; Open the pop-up menu, scroll down to style then scheme and click on CPK Spacefill.
06:29 Here on the panel we have the crystal structure in CPK display.
06:34 Open the pop-up menu again scroll down to symmetry and click on Reload {4 4 4 6 6 6 1}option.
06:44 This option loads the 27 cell block on Jmol panel.
06:49 Open the pop-up menu go to symmetry go back to Reload {1 1 1} option.
06:56 To display the symmetry elements, open the pop-up menu again.
07:00 Scroll down to symmetry in the sub-menu and click on mirrorplane (x z y) option .
07:08 On the panel we have a cubic lattice with mirrorplane (x z y) displayed.
07:16 Let us now load the CIF file for graphite ,which belongs to hexagonal crystal system.
07:22 As shown earlier use Open a file option to load the CIF file for graphite on the panel.
07:29 Unit cell for graphite opens on the panel.
07:33 Observe the unit cell parameters,
07:35 The vectors a equal to b but not equal to c.
07:40 Angles, alpha and beta equal to 90 degrees and gamma equal to 120 degrees.
07:47 Open the pop-up menu scroll down to Symmetry and click on Reload {444 666 1} option.
07:56 Hexagonal lattice arrangement of atoms is shown on the screen.
08:01 To change the display , open the pop-up menu go to style, go to scheme click on wireframe option.
08:10 Similarly I have opened a CIF file of mineral calcite on the panel.
08:16 Calcite belongs to the rhombohedral crystal system.
08:20 You can open the CIF of any crystal system and explore the structure and symmetry options.
08:27 Let's summarize, In this tutorial we have learnt to Download CIF from Crystallography Open Database.
08:35 Open CIF in Jmol.
08:38 Display unit cell and unit cell parameters.
08:41 And display crystal structures of sodium chloride, graphite and calcite.
08:47 For assignment

Download CIF for quartz crystal from COD database.

08:53 Display unit cell on Jmol panel and explore the symmetry options.
08:59 This video summarizes the Spoken Tutorial project
09:02 If you do not have good bandwidth, you can download and watch it.
09:06 We Conducts workshops using spoken tutorials and Give certificates.

Please contact us.

09:12 The spoken tutorial project is funded by NMEICT-MHRD govt of India.
09:18 This is Snehalatha from IIT Bombay signing off. Thank you for joining.

Contributors and Content Editors

Jyotisolanki