Difference between revisions of "CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Hindi"
From Script | Spoken-Tutorial
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Revision as of 00:53, 7 November 2017
Title of the Script: Build and Modify Process Diagram Author: Bella Tony Keywords: Process Diagram, Macros, Alanine Biosythesis, Generic Protein, Aminotransferase
Time | Narration |
00:01 | नमस्कार। सेल डिज़ाइनर में Build and Modify Process Diagram के इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है। |
00:08 | इस ट्यूटोरियल में हम सीखेंगे : Macros का उपयोग करना, कंपोनेंट्स को ड्रा एरिया में मूव करना, रिएक्शन लाइन को स्पीशीज़ के आसपास जोड़ना |
00:18 | रिएक्शन लाइन को अलाइन करना एवं बढ़ाना, एक Product एवं एक Reactant जोड़ना। |
00:23 | इस ट्यूटोरियल के लिए, मैं Ubuntu Linux OS 14.04 CellDesigner वर्जन 4.3 Java वर्जन 1.7 का प्रयोग कर रही हूँ। |
00:35 | इस ट्यूटोरियल पर आगे बढ़ने के लिए, शिक्षार्थियों को स्नातक स्तर की Biochemistry से और CellDesigner इंटरफ़ेस से परिचित होना चाहिए। |
00:43 | यदि ऐसा नहीं है, तो सम्बंधित CellDesigner ट्यूटोरियल्स के लिए कृपया Spoken Tutorial वेबसाइट पर जाएँ। |
00:51 | अब शुरू करते हैं। |
00:53 | आपको यहां Alanine Biosynthesis का एक पारंपरिक डायग्राम दिखाई दे रहा है। |
00:58 | अब, हम इस प्रोसेस डायग्राम को बनाने के लिए CellDesigner का उपयोग करेंगे। |
01:02 | एक साथ Ctrl+Alt+T कीज़ दबा कर terminal खोलें। |
01:09 | अब ./runCellDesigner4.3 टाइप करें तथा एंटर दबाएं। |
01:20 | अब आपके टर्मिनल पर सेल डिज़ाइनर विंडो खुल गई है। |
01:24 | CTRL+N दबाकर एक नई फाइल खोलें तथा इसे Build and Modify Process Diagram नाम दें। |
01:34 | चौड़ाई एवं ऊंचाई को डिफॉल्ट रखें तथा Ok बटन पर क्लिक करें। |
01:39 | अब ‘Macros’ के बारे में जानते हैं। |
01:42 | Macros अक्सर प्रयोग किए जाने वाले Components सेट हैं, जो आसानी से डायग्राम बनाने में मदद करते हैं। |
01:47 | टूलबार पर, Catalysis के लिए Macros आइकन पर क्लिक करें तथा ड्रॉ एरिया पर क्लिक करें। |
01:57 | हमारे पास अब ड्रॉ एरिया में एक Macros-Catalysis reaction है। |
02:02 | सभी कंपोनेंट्स को ड्रा एरिया के दूसरी तरफ मूव करना सीखते हैं। |
02:08 | इसके लिए 'Edit' मेनू पर और फिर 'Select All' पर क्लिक करें। |
02:16 | इसके अलावा आप Ctrl + A कीज़ का प्रयोग कर सकते हैं। |
02:21 | अब सभी Components हाईलाइट हो गए हैं। |
02:24 | अब हाईलाइट हो चुके कंपोनेंट्स पर कहीं भी क्लिक करें और उन्हें वांछित स्थिति तक ड्रैग करें। |
02:30 | अब आगे बढ़ते हैं। |
02:32 | हाइलाइट किए गए कंपोनेंट को अनचेक करने के लिए ड्रा एरिया पर कहीं भी क्लिक करें। |
02:37 | पुनः ड्रा एरिया में, Generic Protein S1 पर राइट क्लिक करें। |
02:43 | फिर 'Change Identity' विकल्प पर क्लिक करें। |
02:47 | 'class' बॉक्स में, Protein को Simple Molecule में बदलें। |
02:53 | Name में: 2-keto-isovalerate टाइप करें। |
02:58 | और फिर ‘Apply’ बटन पर क्लिक करें। |
03:02 | ‘The Same Species Exists’ डायलॉग बॉक्स में ‘No’ पर क्लिक करें। |
03:10 | हालांकि यदि आप स्पिशीज़ के सभी कंपोनेंट्स पर इस परिवर्तन को प्रभावी करना चाहते हैं, तो ‘Yes’ पर क्लिक करें। यहां मैं ‘No’ पर क्लिक करुंगी। |
03:20 | देखें Generic Protein S1, अब 2-keto-isovalerate नामक simple molecule बन गया है। |
03:30 | मैं नाम को समायोजित करने के लिए अणु को ड्रैग करुंगी। |
03:34 | end-point के केंद्र में Generic protein-S1 पर राइट क्लिक करें, जो एक उत्पाद है। |
03:42 | Change identity को Simple Molecule करें और इसे Valine नाम दें। |
03:50 | Apply बटन पर क्लिक करें। |
03:52 | आपके पास ड्रा एरिया में Valine है। |
03:36 | फिर, कैटेलिस्ट (उत्प्रेरक) S2 का नाम बदलें। इस पर राइट क्लिक करें तथा Edit Protein चुनें। |
04:06 | ‘name’ में, Aminotransferase टाइप करें। |
04:11 | Update पर क्लिक करें और डायलॉग बॉक्स बंद करें। |
04:16 | नाम को समायोजित करने के लिए अणु के कोने को ड्रैग करें। |
04:21 | फिर, लिंक की गई रिएक्शन की स्थिति को बदलते हैं। |
04:25 | 'end-point' species यानी Valine के केंद्र पर क्लिक करें तथा ड्रैग करके वांछित स्थान में ड्रॉप करें। |
04:33 | Aminotransferase के साथ इसे दोहराएं। |
04:37 | देखें कि लिंक की गई रिएक्शन ‘end-point’ Species की गति का अनुपालन करती है। |
04:44 | अब हम सीखेंगें कि reaction line को species के आसपास कैसे जोड़ते हैं। |
04:49 | Reaction line को Species के आसपास 16 कनेक्शन बिंदुओं में से किसी के साथ भी जोड़ा जा सकता है। |
04:56 | मैं आपको दिखाउंगी कि ऐसा कैसे करना है। |
04:59 | CTRL+N दबाकर एक नई विंडों खोलें। |
05:04 | इस फाइल को Connection points नाम दें। |
05:08 | चौड़ाई एवं ऊँचाई को डिफॉल्ट रखें तथा Ok बटन पर क्लिक करें। |
05:14 | ड्रा एरिया में, दो generic proteins ड्रा करें तथा उन्हें Protein 1 एवं Protein 2 नाम दें। |
05:23 | मेन मेनू में, State Transition आइकन पर क्लिक करें। |
05:28 | फिर, ड्रा एरिया में, माउस को ‘start-point' Species, Protein 1 पर घुमाएँ। |
05:36 | देखें कि सभी 16 कनेक्शन पॉइंट ग्रे रंग में हाइलाइट हो जाते हैं। |
05:42 | ध्यान दें कि जब कर्सर इनमें से किसी एक कनेक्शन पॉइंट पर जाता है, तो यह नीले रंग का हो जाएगा। |
05:49 | एक कनेक्शन पॉइंट पर क्लिक करें। |
05:53 | उसी तरह, माउस को ‘end-point' Species यानी Protein 2 पर घुमाएँ। |
06:00 | पुनः, उपरोक्त व्याख्या के अनुसार, आवश्यक कनेक्शन पॉइंट पर क्लिक करें। |
06:05 | चयनित कनेक्शन पॉइंट्स के बीच एक State Transition रिएक्शन लाइन बन गई है। |
06:12 | फिर, हम Reaction line को अलाइन करेंगे। |
06:16 | Protein 1 एवं Protein 2 के बीच State transition reaction line पर क्लिक करें। |
06:21 | ध्यान दें कि reaction line पर 2 process nodes हाइलाइट हो जाते हैं। |
06:27 | यदि हम माउस को 2 process nodes में से किसी एक पर घुमाते हैं, तो एक ‘plus’ चिन्ह दिखाई देता है। |
06:34 | process nodes में से एक पर क्लिक करें। |
06:37 | अब पॉइंटर को ड्रैग करें तथा वांछित connection pointपर रखें। |
06:43 | हाइलाइट किए गए कंपोनेंट्स को अनचेक करने के लिए ड्रा एरिया में कहीं भी क्लिक करें। |
06:49 | reaction line को बढ़ाने या फैलाने के लिए, पहले इस पर क्लिक करें। |
06:54 | अब start-point या end-point Species पर स्थित process nodes में से किसी एक पर क्लिक करें। |
07:01 | reaction line को फैलाने के लिए माउस को वांछित कनेक्शन पॉइंट तक ड्रैग करें। |
07:07 | यहां से, हम प्रोसेस डायग्राम के साथ आगे बढ़ेंगे। |
07:12 | Build and Modify Process Diagram विंडो पर वापस आएं। |
07:16 | मौजूदा रिएक्शन में एक Reactant एवं एक Product जोड़ें। |
07:21 | टूल बार से, 2 simple molecules पर क्लिक करके ड्रा एरिया पर लाएं। |
07:27 | उन्हें Glutamate एवं 2-Oxoglutarate नाम दें। |
07:36 | उन्हें ड्रैग करें तथा Simple molecules: 2-keto-isovalerate एवं Valineके नजदीक रखें। |
07:44 | पूर्व में बताए गए अनुसार, कंपोनेंट्स को ड्रा एरिया में अलाइन करें। |
07:49 | पूर्व में बताए गए विवरण से, मैंने अब कंपोनेंट्स को अलाइन कर लिया है। |
07:55 | टूल बार पर, ‘Add Product’ आइकन पर अलाइन करें। |
08:00 | अब माउस को State Transition reaction between 2-keto-isovalerate and Valine पर घुमाएं। |
08:07 | हाईलाइट किये हुए process node पर क्लिक करें। |
08:10 | फिर, माउस को 2-Oxoglutarate पर घुमाएं। |
08:17 | हाइलाइट हुए 16 process nodes में से किसी एक पर क्लिक करें। |
08:21 | देखें, State Transition एवं 2-Oxoglutarate के बीच एक reaction line दिखाई देती है। |
08:29 | इसी तरह, ‘Add Reactant’ आइकन पर क्लिक करें। |
08:34 | माउस को Glutamate पर घुमाएं तथा हाइलाइट हुए 16 process nodesमें से किसी एक पर क्लिक करें। |
08:40 | फिर, मैं उसको State Transition रिएक्शन पर घुमाएं तथा process node पर क्लिक करें। |
08:49 | देखें, State Transition एवं Glutamate के बीच एक reaction line दिखाई देती है। |
08:55 | हमारे पास अब एक Reactant एवं एक Product के साथ एक पूर्ण Catalysis रिएक्शन है। |
09:01 | मैं प्रोसेस डायग्राम में अन्य components को समायोजित करने के लिए reactionको अलाइन करुँगी। |
09:09 | टूल बार से State Transition Simple Molecule Generic Protein एवं Catalysis आइकंस का उपयोग करें |
09:18 | यह एक पूर्ण प्रोसेस डायग्राम है। |
09:22 | इसे सही ढंग से देखने के लिए, मेन मेनू बार में View पर जाएं तथा Zoom Fit पर क्लिक करें |
09:32 | अब आपको पूर्ण Process Diagram दिखाई देता है। |
09:36 | सारांशित करते हैं। इस ट्यूटोरियल में, हमने सीखा Macros का उपयोग करना |
09:42 | कंपोनेंट्स को ड्रा एरिया में मूव करना, रिएक्शन लाइन को स्पिशीज़ के आस पास जोड़ना |
09:48 | रिएक्शन लाइन को अलाइन करना एवं बढ़ाना, एक Product एवं एक Reactant जोड़ना |
09:54 | असाइनमेंट के लिए : CellDesigner में टूल्स का उपयोग करके Methionine Biosynthesis के लिए एक प्रोसेस डायग्राम बनाना # GTP/GD के लिए Macrosके बारे में पता लगाना # पता लगाना कि एक ‘Curve’ रिएक्शन लाइन कैसे बनाते हैं |
10:11 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट के बारे में- |
10:14 | दिए गए लिंक पर जाकर वीडियो देखें
यह वीडियो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है। |
10:19 | अच्छी बैंडविड्थ न मिलने पर आप इसे डाउनलोड करके भी देख सकते हैं। |
09:24 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टीम स्पोकन ट्यूटोरियल्स का उपयोग करके कार्यशालाएं आयोजित करती है। |
09:29 | तथा ऑनलाइन टेस्ट पास करने वालों को प्रमाण पत्र प्रदान करती है। |
10:34 | अधिक जानकारी के लिए, कृपया contact@spoken-tutorial.org पर संपर्क करें। |
10:40 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टॉक टू अ टीचर प्रोजेक्ट का एक भाग है यह NMEICT, MHRD भारत सरकार द्वारा वित्तपोषित है। इस “मिशन” से संबंधित अधिक जानकारी निम्नलिखित लिंक पर उपलब्ध है। |
10:54 | यह ट्यूटोरियल इं. अमित कुमार द्वारा अनुवादित है। आईआईटी बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य आपसे विदा लेती हूँ। हमसे जुड़ने के लिए धन्यवाद। |