Difference between revisions of "Biopython/C2/Manipulating-Sequences/Assamese"
From Script | Spoken-Tutorial
(Created page with " {| Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 | Manipulating Sequences এৰ টিউটোৰিয়েলত আপোনাক স্বাগতম। |- | 0...") |
|||
Line 201: | Line 201: | ||
|- | |- | ||
| 04:31 | | 04:31 | ||
− | |String1 equal to dna1 ব্ৰেকেটত 0 | + | |String1 equal to dna1 ব্ৰেকেটত 0 colon 6 |
|- | |- | ||
Line 359: | Line 359: | ||
|- | |- | ||
| 08:35 | | 08:35 | ||
− | | Dna3 বন্ধনীত 6 | + | | Dna3 বন্ধনীত 6 কোলন 10 ইকুয়াল টু ডাবল উদ্ধৃতিত ATGC, এন্টাৰ টিপক। |
|- | |- | ||
| 08:45 | | 08:45 |
Latest revision as of 11:51, 20 June 2019
Time | Narration |
00:01 | Manipulating Sequences এৰ টিউটোৰিয়েলত আপোনাক স্বাগতম। |
00:06 | ইয়াতে এটা ৰেন্ডম DNA সিকোয়েন্স বনাবলৈ মই Biopython টুল্স ব্যবহাৰ কৰিম। |
00:13 | নির্দিষ্ট স্থানত DNA সিকোয়েন্স স্লাইস কৰিবলৈ। |
00:17 | নতুন সিকোয়েন্স বনাবলৈ দুটা সিকোয়েন্সক একেসৈতে শ্ৰেণীবদ্ধ কৰা। |
00:22 | সিকোয়েন্সৰ দৈর্ঘ্য নির্ণয় কৰিবলৈ। |
00:26 | পৃথক বেসেস বা স্ট্ৰি্ং এৰ অংশৰ সংখ্যা গণনা কৰিবলৈ। |
00:31 | এটা নির্দিষ্ট বেস বা স্ট্ৰি্ং এৰ অংশ বিছৰা। |
00:35 | এটা সিকোয়েন্স অবজেক্টক পৰিবর্তনযোগ্য সিকোয়েন্স অবজেক্টলৈ সলোৱা। |
00:40 | টিউটোৰিয়েলটো অনুসৰণ কৰিবলৈ অস্নাতকৰ বায়োকেমিস্ট্ৰি বা বায়োইনফৰমেটিক্স |
00:47 | আৰু মৌলিক Python প্ৰোগ্ৰামিং সম্পর্কে জানোব লাগিব। |
00:51 | নহলে প্ৰদত্ত লিঙ্কত Python টিউটোৰিয়েল চাওক। |
00:56 | টিউটোৰিয়েলটো ৰেকর্ড কৰিবলৈ ব্যবহাৰ কৰিছো: উবুন্টু OS সংস্কৰণ 14.10 |
01:03 | Python সংস্কৰণ 2.7.8 |
01:07 | Ipython interpretor সংস্কৰণ 2.3.0 |
01:12 | Biopython সংস্কৰণ 1.64 |
01:16 | এতিয়া টার্মিনেল খুলক আৰু ipython ইন্টাৰপ্ৰেটাৰ আৰম্ভ কৰক। |
01:21 | Ctrl, Alt আৰু T কী একসৈতে টিপক। |
01:26 | প্ৰম্পটত লিখক: ipython আৰু এন্টাৰ টিপক। |
01:31 | Ipython প্ৰম্পট পর্দাত দেখায়। |
01:35 | Biopython দ্বাৰা মই যিকোনো নির্দিষ্ট দৈর্ঘৰ ৰেন্ডম DNA সিকোয়েন্সৰ বাবে সিকোয়েন্স অবজেক্ট বনাব পাৰো। |
01:44 | এতিয়া 20 টা বেসেস থকা DNA সিকোয়েন্সৰ বাবে এটা সিকোয়েন্স অবজেক্ট বনাও। |
01:50 | প্ৰম্পটত লিখক: import random, এন্টাৰ টিপক। |
01:56 | ইয়াৰ পিছত, Bio প্যাকেজৰ পৰা Seq মডিউল ইম্পোর্ট কৰক। |
02:01 | প্ৰায়েই Seq ক seek হিসাবে উচ্চাৰিত কৰা হয়। |
02:06 | প্ৰম্পটত লিখক: From Bio dot Seq import Seq, এন্টাৰ টিপক। |
02:15 | মই DNA সিকোয়েন্সত অাখৰ নির্দিষ্ট কৰিবলৈ Bio.Alphabet মডিউল ব্যবহাৰ কৰিম। |
02:22 | লিখক: from Bio dot Alphabet import generic underscore dna, এন্টাৰ টিপক। |
02:32 | এতিয়া ৰেন্ডম DNA সিকোয়েন্সৰ এটা সিকোয়েন্স অবজেক্ট বনাবলৈ নিম্ন কমান্ড লিখক। |
02:38 | সেই সিকোয়েন্সক dna1 ভ্যাৰিয়েবলত সংৰক্ষণ কৰক। |
02:42 | লক্ষ্য কৰক: এই কমান্ডত এটা ডাবল উদ্ধৃতিৰ সলনি দুটা একক উদ্ধৃতি ব্যবহৃত কৰক। এন্টাৰ টিপক। |
02:50 | আউটপুটৰ বাবে লিখক: dna1 এন্টাৰ টিপক। |
02:55 | আউটপুটত ৰেন্ডম DNA সিকোয়েন্সৰ বাবে সিকোয়েন্স অবজেক্ট দেখায়। |
03:00 | আপোনি এটা নতুন সিকোয়েন্স বিছাৰিলে উপৰৰ নিচিনা একেই কমান্ড পাবলৈ আপ-এৰো কী টিপক। এন্টাৰ টিপক। |
03:11 | আউটপুটৰ বাবে, ভ্যাৰিয়েবল নাম dna1 লিখক। এন্টাৰ টিপক। |
03:17 | আউটপুটত এটা নতুন DNA সিকোয়েন্স দেখায় যি আগৰটোৰ পৰা বেলেগ হয়। |
03:23 | Sequence Objects সম্পর্কে: |
03:25 | সিকোয়েন্স অবজেক্ট সাধাৰণতে স্বাভাবিক Python স্ট্ৰি্ং এৰ মতে কাম কৰে। |
03:30 | সেয়ে স্বাভাবিক নিয়ম অনুসৰণ কৰক যি Python স্ট্ৰি্ং এৰ বাবে কৰে। |
03:35 | Python ত, মই 1 এৰ সলনি 0 দি আৰম্ভ কৰি স্ট্ৰি্ং ত অাখৰ গণনা কৰো। |
03:41 | সিকোয়েন্সত প্ৰথম অাখৰ হল স্থান 0. |
03:45 | টার্মিনেলত উভতি আহক। |
03:47 | প্ৰায়েই আপোনাক সিকোয়েন্সৰ এটা অংশ দিহে কাম কৰাত লাগিব পাৰে। |
03:52 | এতিয়া স্ট্ৰি্ংয়ৰ অংশক এক্সট্র্যাক্ট কৰি তাক সিকোয়েন্স অবজেক্ট হিসাবে সংৰক্ষণ কৰা চাও। |
03:58 | উদাহৰণস্বৰুপে, মই DNA সিকোয়েন্সক দুটা স্থানত স্লাইস কৰিম। |
04:04 | প্ৰথমে 6 আৰু 7 বেসেসৰ মাজত। |
04:08 | এইটোৱে সিকোয়েন্সৰ আৰম্ভৰ পৰা 6 তম বেস পর্যন্ত ফ্ৰাগমেন্ট এক্সটার্ক্ট কৰিব। |
04:15 | দ্বিতীয় স্লাইস 11 আৰু 12 বেসেসৰ মাজত থাকিব। |
04:20 | দ্বিতীয় ফ্রাগমেন্ট সিকোয়েন্সৰ 12 তম বেসৰ পৰা শেষ পর্যন্ত লাগিব। |
04:26 | প্ৰথম ফ্ৰাগমেন্ট এক্সট্রাক্ট কৰিবলৈ প্ৰম্পটত নিম্ন কমান্ড লিখক। |
04:31 | String1 equal to dna1 ব্ৰেকেটত 0 colon 6 |
04:39 | string1 প্ৰথম ফ্ৰাগমেন্টক সংৰক্ষণ কৰাৰ ভ্যাৰিয়েবল। |
04:43 | বাকিবোৰ কমান্ড অনুসৰণ কৰক যেনেকৈ স্বাভাবিক Python ত কৰে। |
04:47 | এই বন্ধনীত কোলন দ্ৱাৰা পৃথক কৰা আৰম্ভ আৰু বন্ধ স্থিতি আছে। |
04:53 | এই স্থিতি আৰম্ভক অন্তর্ভুক্ত কৰে কিন্তু স্টপক নকৰে। এন্টাৰ টিপক। |
05:01 | আউটপুটক চাবলৈ লিখক: string1, এন্টাৰ টিপক। |
05:04 | আউটপুটে সিকোয়েন্স অবজেক্টৰ মতে প্ৰথম ফ্ৰাগমেন্ট দেখায়। |
05:10 | সিকোয়েন্সৰ পৰা দ্বিতীয় স্ট্ৰি্ং এক্সট্র্যাক্ট কৰিবলৈ আপ-এৰো কী টিপি নিম্নৰ মতে কমান্ড এডিট কৰক: |
05:17 | ভ্যাৰিয়েবলৰ নাম string2লৈ সলাই আৰু স্থিতিক 11 আৰু 20লৈ সলাওক। |
05:24 | আউটপুটৰ বাবে লিখক: string2, এন্টাৰ টিপক। |
05:30 | এতিয়া দ্বিতীয় ফ্ৰাগমেন্টও সিকোয়েন্স অবজেক্টেৰ নিচিনা আছে। |
05:34 | এতিয়া শ্ৰেণীবদ্ধ কৰক অর্থাৎ দুটা স্ট্ৰি্ং একেসৈতে জুড়ি নতুন ফ্ৰাগমেন্ট বনাওক। |
05:42 | ভ্যাৰিয়েবল dna2 ত নতুন সিকোয়েন্স সংৰক্ষণ কৰক। |
05:46 | লিখক: dna2 equal to string1 plus string2, এন্টাৰ টিপক। |
05:53 | লক্ষ্য কৰক: মই অসঙ্গত বর্ণমালাৰ সিকোয়েন্স জুড়াব নোৱাৰো। |
05:59 | অর্থাৎ, এটা নতুন সিকোয়েন্স বনাবলৈ DNA সিকোয়েন্সক আৰু এটা প্ৰোটিন সিকোয়েন্সক শ্ৰেণীবদ্ধ কৰিব নোৱাৰে। |
06:07 | দুটা সিকোয়েন্সৰ বর্ণমালাৰ এট্ৰিবিউট একেই থকা আবশ্যক। |
06:12 | আউটপুট চাবলৈ লিখক: dna2, এন্টাৰ টিপক। |
06:17 | আউটপুটে নতুন সিকোয়েন্স দেখায় যি string1 আৰু string2 ৰ সমন্বয় হয়। |
06:23 | নতুন সিকোয়েন্সৰ দৈর্ঘ্য নির্ণয় কৰিবলৈ, মই len ফাংশন ব্যবহাৰ কৰিম। |
06:29 | লিখক: len বন্ধনীত dna2, এন্টাৰ টিপক। |
06:34 | আউটপুটে 15 বেস লম্বা সিকোয়েন্স দেখায়। |
06:39 | মই সিকোয়েন্সত উপস্থিত থকা পৃথক বেসেসৰ সংখ্যা গণনা কৰিব পাৰো। |
06:44 | এইটো কৰিবলৈ মই count() ফাংশন ব্যবহাৰ কৰিম। |
06:47 | উদাহৰণস্বৰুপে- সিকোয়েন্সত উপস্থিত থকা alanines সংখ্যা গণনা কৰিবলৈ, নিম্ন কমান্ড লিখক: dna2 dot count বন্ধনীত ডবল উদ্ধৃতিত অাখৰ A. |
07:02 | এন্টাৰ টিপক। |
07:04 | আউটপুটে সিকোয়েন্স dna2 ত উপস্থিত alanines এৰ সংখ্যা দেখায়। |
07:10 | এটা নির্দিষ্ট বেস বা স্ট্ৰি্ং এৰ অংশ বিছাৰিবলৈ মই find() ফাংশন ব্যবহাৰ কৰিম। |
07:16 | লিখক: dna2 dot find বন্ধনীত ডবল উদ্ধৃতিতে GC, এন্টাৰ টিপক। |
07:26 | আউটপুটে স্ট্ৰি্ং ত GC এৰ উপস্থিতিৰ প্ৰথম ইন্সট্যান্সৰ স্থিতি নির্দেশ কৰে। |
07:32 | সাধাৰণতে সিকোয়েন্স অবজেক্ট এডিট কৰা নাযায়। |
07:35 | সিকোয়েন্স এডিট কৰিবলৈ এইটোক ৰুপান্তৰযোগ্য সিকোয়েন্স অবজেক্টেলৈ সলাব লাগিব। |
07:41 | এইটো কৰিবলৈ লিখক: dna3 equal to dna2 dot to mutable বন্ধনী খুলক আৰু বন্ধ কৰক। এন্টাৰ টিপক। |
07:52 | আউটপুটৰ বাবে লিখক: dna3, এন্টাৰ টিপক। |
07:55 | এতিয়া সিকোয়েন্স অবজেক্ট এডিট কৰা যাব পাৰে। |
07:59 | এতিয়া বেসক সিকোয়েন্স দ্বাৰা সলাও। |
08:01 | উদাহৰণস্বৰুপে- পঞ্চম স্থানত উপস্থিত বেসক alanine দ্বাৰা সলাবলৈ লিখক dna3 বন্ধনীত 5 ইকুয়াল টু ডাবল উদ্ধৃতিত অাখৰ A. এন্টাৰ টিপক। |
08:19 | আউটপুটৰ বাবে লিখক: dna3 এন্টাৰ টিপক। |
08:24 | আউটপুট চাওক। পঞ্চম স্থানত cytosineক, alanine দ্বাৰা সলোৱা গৈছে। |
08:31 | স্ট্ৰি্ং এৰ এটা অংশ সলাবলৈ নিম্ন কমান্ডটো লিখক। |
08:35 | Dna3 বন্ধনীত 6 কোলন 10 ইকুয়াল টু ডাবল উদ্ধৃতিত ATGC, এন্টাৰ টিপক। |
08:45 | আউটপুটৰ বাবে লিখক: dna3 এন্টাৰ টিপক। |
08:52 | আউটপুটে দেখায় যে 6 পৰা 9 পর্যন্ত স্থানৰ 4 টা বেসেস ইয়াক নতুন বেসেস ATGC দ্বাৰা সলোৱা গৈছে। |
09:01 | এবাৰ সিকোয়েন্স অবজেক্টক এডিট কৰাত এইটোক আৰু এবাৰ read only ফর্মত সলাওক। |
09:07 | নিম্ন লিখক: dna4 equal to dna3 dot to seq বন্ধনী খুলক আৰু বন্ধ কৰক। এন্টাৰ টিপক। |
09:19 | আউটপুটৰ বাবে লিখক: dna4 এন্টাৰ টিপক। |
09:25 | সংক্ষিপ্তকৰণ কৰো। |
09:27 | ইয়াতে শিকিছো: এটা ৰেন্ডম DNA সিকোয়েন্স বনোৱা। |
09:32 | নির্দিষ্ট স্থানত DNA সিকোয়েন্স স্লাইস কৰা। |
09:36 | এটা নতুন সিকোয়েন্স বনাবলৈ দুটা সিকোয়েন্স যোগ কৰক অর্থাৎ, শ্ৰেণীবদ্ধ কৰা। |
09:43 | মই এয়াও শিকিছো: len, count আৰু find ফাংশনৰ ব্যবহাৰ। |
09:49 | সিকোয়েন্স অবজেক্টক পৰিবর্তনযোগ্য সিকোয়েন্স অবজেক্টেলৈ সলোৱা আৰু স্ট্ৰি্ং এৰ অংশ বা বেসৰ স্থান সলোৱা। |
09:57 | অনুশীলনী হিসাবে 30 টা বেসেসৰ ৰেন্ডম DNA সিকোয়েন্স বনোৱা। |
10:02 | Biopython টুল্স দ্বাৰা GC পার্সেন্টেজ আৰু সিকোয়েন্সৰ আণবিক ওজন গণনা কৰক। |
10:09 | আপোনাৰ সম্পন্ন কামটো নিম্নৰুপ হব লাগিব। |
10:13 | আউটপুট পার্সেন্টেজ হিসাবে GC কন্টেন্ট দেখায়। |
10:18 | আউটপুটে DNA সিকোয়েন্সৰ আণবিক ওজন দেখায়। |
10:23 | এই ভিডিওটোৱা প্ৰকল্পক সাৰসংক্ষেপে বোঝায়। |
10:26 | এইটোক ডাউনলোড কৰি চাওক। |
10:30 | মই কর্মশালাৰ আয়োজন কৰি আৰু প্ৰশংসাপত্ৰ দিয়ো। |
10:32 | অধিক জানিবলৈ যোগাযোগ কৰক। |
10:35 | স্পোকেন টিউটোৰিয়েল প্ৰকল্প ভাৰত সৰকাৰৰ NMEICT, MHRD দ্বাৰা সমর্থিত। |
10:43 | আইআইটি বোম্বেৰ পৰা মই বিদায় লৈছো। অংশগ্ৰহণৰ বাবে ধন্যবাদ। |