View source for CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Bengali

{| border=1
|| '''Time'''
|| '''Narration'''

|-
| 00:01
|  নমস্কার। Customizing Diagram Layout এর এই টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত।

|-
|  00:08
|  এখানে আমরা শিখব: Reaction লাইনের রঙ, আকৃতি এবং প্রস্থ বদলানো।

|-
|  00:19
|Anchor points কে Reaction লাইনের সাথে জোড়া, Components সারিবদ্ধ করা, Reaction ids দেখানো / লুকানো।

|-
| 00:30  
|  আমরা এও শিখব: Components এ নোট যোগ করা, প্রোটিন এডিট করা, তথ্য এডিট করা এবং

|-
|00:39
| ডায়াগ্রামের একটি bird’s eye view পাওয়া।

|-
| 00:44
|  টিউটোরিয়ালটি রেকর্ড করতে ব্যবহার করছি, উবুন্টু লিনাক্স অপারেটিং সিস্টেম 14.04, CellDesigner সংস্করণ 4.3, Java সংস্করণ 1.7.

|-
|  01:01
| টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে, শিক্ষার্থীদের স্নাতক স্তরের Biochemistry এবং CellDesigner ইন্টারফেস সম্পর্কে জানা উচিত।

|-
|  01:12
|না হলে, প্রাসঙ্গিক CellDesigner টিউটোরিয়ালের জন্য, Spoken Tutorial ওয়েবসাইটে যান।

|-
| 01:20
| এখন শুরু করি।

|-
| 01:22
|  পূর্ববর্তী টিউটোরিয়ালের একটি অনুশীলনী ছিল- Methionine Biosynthesis এর জন্য প্রসেস ডায়াগ্রাম বানানো।

|-
|  01:32
| আমি এই টিউটোরিয়ালের উদাহরণ হিসাবে একই ডায়াগ্রাম ব্যবহার করছি। আমি এটি কাস্টমাইজ করা দেখাবো।

|-
|  01:43
|  CellDesigner ইন্টারফেসে যাই।

|-
|  01:47
|  আপনি এখানে Methionine Biosynthesis এর প্রসেস ডায়াগ্রাম দেখছেন।

|-
|  01:53
| টিউটোরিয়ালটি এখানে থামান এবং আপনার বানানো Methionine Biosynthesis প্রসেস ডায়াগ্রাম খুলুন।

|-
|  02:01
| আপনার কোনো সংরক্ষিত ফাইল না থাকলে আপনাকে দেওয়া কোড ফাইল থেকে খুলতে পারেন।

|-
|  02:08
|  এখন ডায়াগ্রামটি কাস্টমাইজ করা শুরু করি।

|-
|  02:12
| CellDesigner ইন্টারফেসে ফিরে যাই।

|-
| 02:16
|  শুরু করতে, আমি Reaction লাইনের প্রস্থ এবং রঙ বদলাবো।

|-
| 02:22
| এটি করতে, Homoserine এবং Succinylhomoserine এর মাঝে State Transition চয়ন করছি।

|-
|  02:30
|  এখন, মেন মেনুবারে Component এ যান।

|-
| 02:35
|  Change color & shape বিকল্পে ক্লিক করুন।

|-
|  02:39
| বিকল্পরূপে, আপনি Reaction লাইনে ডান ক্লিক করে Change color & shape বিকল্প চয়ন করতে পারেন।

|-
| 02:47
|Change color & shape নামে ডায়ালগ বাক্স দেখায়।

|-
| 02:53
| একটি পুরু Reaction লাইনের জন্য, Line Width কে 1.0 এর থেকে উচ্চতর মানে বদলান।

|-
|  03:02
|আমি এটি বদলে 3.0 করব।

|-
|  03:06
| Reaction লাইনের রঙ বদলাতে, Color panel এ যান।

|-
|  03:12
|  Color panel এ হ্যান্ডেল যেমন একটি পয়েন্টার যুক্ত কলর wheel দেখতে পারি।

|-
|  03:19
| পয়েন্টারে ক্লিক করে ধরে রাখুন এবং পছন্দসই রঙ চয়ন করতে এটি ঘোরান।

|-
|  03:25
| আমি নীল রঙের ছায়াছবি চয়ন করব।

|-
|  03:28
| এরপর, রঙিন ত্রিভুজের যে কোনো জায়গায় ক্লিক করুন।

|-
|  03:34
| এখন, পয়েন্টারে ছোট বৃত্তে ক্লিক করুন এবং ছেড়ে দিন।

|-
| 03:40
| সকল পরিবর্তন করার পর Apply এবং তারপর Ok তে ক্লিক করুন।

|-
| 03:48
| লক্ষ্য করুন Reaction লাইন এখন পুরু এবং নীল রঙের দেখায়।

|-
| 03:55
|  এরপর আমরা শিখব Reaction লাইনে Anchor points যোগ করা

|-
|  04:01
|  এবং Anchor points, Reaction lines এর চারপাশে ঘোরাতে কেন উপযোগী।

|-
|  04:09
|এদের উপযুক্ত আকৃতি দিন এবং তাদের draw area তে সঠিক স্থানে রাখুন।

|-
|  04:16
|  CellDesigner ইন্টারফেসে ফিরে আসি।

|-
| 04:20
|  যে কোনো Reaction লাইন চয়ন করুন।

|-
|   04:23
| আমি Homoserine এবং SuccinylHomoserine এর মাঝে একই State Transition reaction line চয়ন করব।

|-
|  04:31 
|  এই লাইনে, কার্সার দ্বারা সঠিক স্থান চয়ন করুন যেখানে Anchor point রাখতে হবে।

|-
|   04:39
| একবার সঠিক বিন্দু চয়নের পর, ডান ক্লিক করুন এবং Add Anchor Point চয়ন করুন।

|-
|   04:47
|  আপনি Reaction লাইনে চয়নিত সঠিক স্থানে নতুন যোগ করা Anchor point দেখবেন।

|-
|  04:55
|  আমি দেখাবো যে Anchor Points একটি Reaction লাইন সংশোধন করতে কিভাবে সাহায্য করে।

|-
|   05:03
| একটি নতুন উইন্ডো খুলুন এবং এটিকে Anchor নাম দিন। Ok তে ক্লিক করুন।

|-
|   05:11
| এখন GTP / GDP এর আইকনে ক্লিক করুন।

|-
|  05:18
| ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন।

|-
|  05:22
|Reaction line এ ডান ক্লিক করুন এবং Add Anchor Point এ ক্লিক করুন।

|-
|  05:29
| Reaction line ড্রেগ করুন এবং ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ড্রপ করুন।

|-
|  05:37
|  এরপর আমরা শিখব draw area তে কম্পোনেন্ট সারিবদ্ধ করা।

|-
|  05:44
| Methionine biosynthesis প্রসেস ডায়াগ্রাম উইন্ডোতে ফিরে আসি।

|-
|  05:50
|লক্ষণীয় Reaction লাইন আনচেক করতে ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন।

|-
| 05:56
| এখন, Shift কী টিপে রাখুন এবং ড্র এরিয়াতে একাধিক Species এ ক্লিক করুন।

|-
| 06:04
|  Edit মেনুতে যান, নীচে স্ক্রোল করুন, Alignment চয়ন করুন এবং Alignment type এ ক্লিক করুন।

|-
|  06:15
| বিকল্পরূপে, টুলবারে Alignment এর জন্য আইকনে ক্লিক করুন।

|-
|  06:21
|  স্বয়ংক্রিয়ভাবে টুলবারে অন্যান্য Alignment বিকল্প সন্ধান করুন।

|-
|  06:27
| Alignment আন্ডু করুন এবং এগিয়ে যান।

|-
| 06:31
|  Reaction এ কাজ করার সময়, আমরা প্রসেস ডায়াগ্রামে Reaction ids দেখাতে বা লুকোতে পারি?

|-
|  06:39
| এখন সেটি শিখি।

|-
| 06:41
| View তে যান, নীচে স্ক্রোল করুন এবং Show Reaction Id আনচেক করুন।

|-
|  06:48
| draw area তে সংশ্লিষ্ট রিঅ্যাকশনে Reaction ids আর দেখায় না।

|-
|  06:55
|  আপনি Reaction Id দেখতে চাইলে নিম্ন করুন।

|-
|  07:01
| View তে যান, নীচে স্ক্রোল করুন এবং Show Reaction Id তে ক্লিক করুন।

|-
|   07:08
| Reaction ids, draw area তে সম্পর্কিত reactions এ দেখাবে।

|-
|   07:15
|  আমরা draw area তে সকল কম্পোনেন্টে (Compartment, Species বা Reaction) নোট জুড়তে পারি।

|-
|   07:21
| এটি করা শিখি।

|-
|  07:24
|  draw area তে একটি Species এ ডান ক্লিক করুন।

|-
|   07:28
| আমি CoA তে ক্লিক করব।

|-
|  07:32
|  নীচে স্ক্রোল করুন এবং Species Notes এ ক্লিক করুন।
|-
|  07:35
| একটি পপ আপ মেনু দেখায়।

|-
|   07:38
|  Species Notes নামে ডায়লগ বাক্স খোলে। Species এর সম্পর্কিত টেক্সট লিখুন।

|-
|   07:46
|  আমি নিম্ন লিখব।

|-
|  07:49
|  Ok তে ক্লিক করুন।

|-
|  07:51
|  লক্ষ্য করুন নোটস সম্পর্কিত তথ্য Notes Area তে দেখানো হয়েছে।

|-
|  07:58
|  বিকল্পরূপে, Species এ নোট জুড়তে, draw area তে Species এ ক্লিক করুন।

|-
|  08:06
| আমি Succinate এ ক্লিক করব।

|-
|  08:09
| এরপর, CellDesigner উইন্ডোর নীচে ডানদিকে স্থিত Edit Notes ট্যাবে ক্লিক করুন।

|-
| 08:18
| একটি পপ আপ উইন্ডো দেখাবে।

|-
|  08:21
| Species এর সম্পর্কিত টেক্সট লিখুন-

|-
|  08:25
| আমি লিখব এবং Ok তে ক্লিক করব।

|-
|  08:30
|  একইভাবে আমরা একটি Protein এডিট করতে পারি।

|-
|  08:35
|  এটি করতে, draw area তে কম্পোনেন্টে ডান ক্লিক করুন।

|-
|  08:40
| আমি Homoserine succinyl transferase এ ক্লিক করব।

|-
|  08:46
|  নীচে স্ক্রোল করুন এবং Edit Protein এ ক্লিক করুন।

|-
|  08:51
|  স্ক্রিনে Protein নামে একটি ডায়লগ বাক্স দেখায়।

|-
|  08:55
| name বাক্সে Protein এর নাম লিখুন।

|-
|  09:00
| আমি name বাক্সে O-succinyltransferase লিখব।

|-
| 09:06
|  Update এ ক্লিক করুন এবং ডায়লগ বাক্স বন্ধ করুন।

|-
|  09:11
|আমরা Protein এ ক্ষেত্রও জুড়তে পারি।

|-
|  09:15
|  draw area তে Protein এ ডান ক্লিক করুন।

|-
|  09:19
| আমি O- succinyltransferase এ ডান ক্লিক করব।

|-
|  09:24
|  নীচে স্ক্রোল করুন এবং Edit Protein এ ক্লিক করুন।

|-
|  09:29
| স্ক্রিনে Protein নামে একটি ডায়ালগ বাক্স দেখায়।

|-
|  09:33
|  residues/regions ট্যাবে Add বোতামে ক্লিক করুন।

|-
| 09:40
|  ModificationResidue/Bindingregion ডায়ালগ বাক্সে:

|-
|  09:46
|ড্রপ ডাউন মেনু থেকে Type এ Binding region চয়ন করুন।

|-
|  09:52
| কার্সার আবশ্যক ভ্যালুতে সরিয়ে আকার এবং কোণ বদলান।

|-
|  09:59
|  এই ডেমো জন্য, Size 15 এবং Angle 38 চয়ন করব।
|-
| 10:09
|  তারপর Close এ ক্লিক করুন।

|-
|  10:12
|  Update এ ক্লিক করুন

|-
|  10:14
| এবং বক্স বন্ধ করুন।

|-
|  10:17
| Methionine Biosynthesis এ ক্ষেত্র জোড়ার প্রয়োজন নেই, তাই আমি এই পরিবর্তন আন্ডু করব।

|-
|  10:25
|  তারপর, আমরা তথ্য এডিট করা শিখি।

|-
|  10:30
|  draw area তে component এ ডান ক্লিক করুন।

|-
|  10:33
| আমি Homoserine এ ক্লিক করব।

|-
| 10:37
|  নীচে স্ক্রোল করুন এবং Edit Information এ ক্লিক করুন।

|-
|  10:41
| স্ক্রিনে Edit Information নামে ডায়লগ বাক্স দেখায়।
|-
| 10:46
|  ডায়ালগ বাক্সে নিম্ন করুন - state ট্যাবে Open চয়ন করুন।

|-
|  10:54
| prefix ট্যাবে mt চয়ন করুন।
 
|-
|  10:59
| Label ট্যাবে dna চয়ন করুন।

|-
|  11:04
| Ok তে ক্লিক করুন।

|-
|  11:07
| আপনি ড্র এরিয়াতে প্রদর্শিত তথ্য mt:dna দেখতে পারেন।

|-
|  11:15
|  আমি Edit Information আন্ডু করব, যেহেতু Methionine Biosynthesis এ এর প্রয়োজন নেই।

|-
|  11:23
|  কিছু ক্ষেত্রে, process diagram জটিল হতে পারে।

|-
|  11:28
| এই ধরনের ক্ষেত্রে, Bird's eye view সাহায্য করতে পারে কারণ একটি বড় মডেলে নেভিগেট করা সুবিধাজনক।

|-
|  11:37
|  Bird's eye view আইকনে ক্লিক করুন।

|-
|  11:41
| Bird’s Eye View রেড স্কোয়ার টানুন।

|-
|  11:46
| লক্ষ্য করুন draw area তে দৃশ্য সেই অনুযায়ী চলছে।

|-
|  11:52
|  এই টিউটোরিয়াল এখানেই শেষ হয়।

|-
|  11:56
|  সংক্ষিপ্তকরণ করি। এখানে আমরা শিখেছি: Reaction লাইনের রঙ, আকৃতি এবং প্রস্থ বদলানো।

|-
|  12:07
| Anchor points কে Reaction লাইনে যোগ করা, Components সারিবদ্ধ করা এবং Reaction ids দেখানো / লুকানো

|-
|  12:18
|  আমরা এও শিখেছি- Components এ নোট যোগ করা.
 
|-
|  12:23
| Protein এডিট করা, তথ্য এডিট করা,
 
|-
|  12:27
|এবং ডায়াগ্রামের Bird’s Eye View পাওয়া।

|-
|  12:32
|  অনুশীলনী হিসাবে, CellDesigner এ টুলস দ্বারা একটি গ্লাইকোসিসিস প্রসেস ডায়াগ্রাম বানান।
 
|-
|  12:41
| Reaction লাইনের বিভিন্ন আকৃতি সন্ধান করুন।

|-
|  12:47
| প্রদত্ত লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি দেখুন, এটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়।

|-
|  12:52
| ভালো ব্যান্ডউইডথ না থাকলে ভিডিওটি ডাউনলোড করে দেখুন।

|-
| 12:57
| স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল কর্মশালার আয়োজন করে। অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়।

|-
|  13:06
| অধিক জানতে contact@spoken-tutorial.org তে লিখুন।

|-
|  13:13
|  স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প Talk to a Teacher প্রকল্পের অংশবিশেষ। এটি ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা সমর্থিত। এই মিশন সম্পর্কে আরো তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য।

|-
|  13:29
|  আই আই টী বোম্বে থেকে আমি বিদায় নিচ্ছি। অংশগ্রহনের জন্যে ধন্যবাদ।

|}