CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Bengali

Time	Narration
00:01	নমস্কার। Customizing Diagram Layout এর এই টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত।
00:08	এখানে আমরা শিখব: Reaction লাইনের রঙ, আকৃতি এবং প্রস্থ বদলানো।
00:19	Anchor points কে Reaction লাইনের সাথে জোড়া, Components সারিবদ্ধ করা, Reaction ids দেখানো / লুকানো।
00:30	আমরা এও শিখব: Components এ নোট যোগ করা, প্রোটিন এডিট করা, তথ্য এডিট করা এবং
00:39	ডায়াগ্রামের একটি bird’s eye view পাওয়া।
00:44	টিউটোরিয়ালটি রেকর্ড করতে ব্যবহার করছি, উবুন্টু লিনাক্স অপারেটিং সিস্টেম 14.04, CellDesigner সংস্করণ 4.3, Java সংস্করণ 1.7.
01:01	টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে, শিক্ষার্থীদের স্নাতক স্তরের Biochemistry এবং CellDesigner ইন্টারফেস সম্পর্কে জানা উচিত।
01:12	না হলে, প্রাসঙ্গিক CellDesigner টিউটোরিয়ালের জন্য, Spoken Tutorial ওয়েবসাইটে যান।
01:20	এখন শুরু করি।
01:22	পূর্ববর্তী টিউটোরিয়ালের একটি অনুশীলনী ছিল- Methionine Biosynthesis এর জন্য প্রসেস ডায়াগ্রাম বানানো।
01:32	আমি এই টিউটোরিয়ালের উদাহরণ হিসাবে একই ডায়াগ্রাম ব্যবহার করছি। আমি এটি কাস্টমাইজ করা দেখাবো।
01:43	CellDesigner ইন্টারফেসে যাই।
01:47	আপনি এখানে Methionine Biosynthesis এর প্রসেস ডায়াগ্রাম দেখছেন।
01:53	টিউটোরিয়ালটি এখানে থামান এবং আপনার বানানো Methionine Biosynthesis প্রসেস ডায়াগ্রাম খুলুন।
02:01	আপনার কোনো সংরক্ষিত ফাইল না থাকলে আপনাকে দেওয়া কোড ফাইল থেকে খুলতে পারেন।
02:08	এখন ডায়াগ্রামটি কাস্টমাইজ করা শুরু করি।
02:12	CellDesigner ইন্টারফেসে ফিরে যাই।
02:16	শুরু করতে, আমি Reaction লাইনের প্রস্থ এবং রঙ বদলাবো।
02:22	এটি করতে, Homoserine এবং Succinylhomoserine এর মাঝে State Transition চয়ন করছি।
02:30	এখন, মেন মেনুবারে Component এ যান।
02:35	Change color & shape বিকল্পে ক্লিক করুন।
02:39	বিকল্পরূপে, আপনি Reaction লাইনে ডান ক্লিক করে Change color & shape বিকল্প চয়ন করতে পারেন।
02:47	Change color & shape নামে ডায়ালগ বাক্স দেখায়।
02:53	একটি পুরু Reaction লাইনের জন্য, Line Width কে 1.0 এর থেকে উচ্চতর মানে বদলান।
03:02	আমি এটি বদলে 3.0 করব।
03:06	Reaction লাইনের রঙ বদলাতে, Color panel এ যান।
03:12	Color panel এ হ্যান্ডেল যেমন একটি পয়েন্টার যুক্ত কলর wheel দেখতে পারি।
03:19	পয়েন্টারে ক্লিক করে ধরে রাখুন এবং পছন্দসই রঙ চয়ন করতে এটি ঘোরান।
03:25	আমি নীল রঙের ছায়াছবি চয়ন করব।
03:28	এরপর, রঙিন ত্রিভুজের যে কোনো জায়গায় ক্লিক করুন।
03:34	এখন, পয়েন্টারে ছোট বৃত্তে ক্লিক করুন এবং ছেড়ে দিন।
03:40	সকল পরিবর্তন করার পর Apply এবং তারপর Ok তে ক্লিক করুন।
03:48	লক্ষ্য করুন Reaction লাইন এখন পুরু এবং নীল রঙের দেখায়।
03:55	এরপর আমরা শিখব Reaction লাইনে Anchor points যোগ করা
04:01	এবং Anchor points, Reaction lines এর চারপাশে ঘোরাতে কেন উপযোগী।
04:09	এদের উপযুক্ত আকৃতি দিন এবং তাদের draw area তে সঠিক স্থানে রাখুন।
04:16	CellDesigner ইন্টারফেসে ফিরে আসি।
04:20	যে কোনো Reaction লাইন চয়ন করুন।
04:23	আমি Homoserine এবং SuccinylHomoserine এর মাঝে একই State Transition reaction line চয়ন করব।
04:31	এই লাইনে, কার্সার দ্বারা সঠিক স্থান চয়ন করুন যেখানে Anchor point রাখতে হবে।
04:39	একবার সঠিক বিন্দু চয়নের পর, ডান ক্লিক করুন এবং Add Anchor Point চয়ন করুন।
04:47	আপনি Reaction লাইনে চয়নিত সঠিক স্থানে নতুন যোগ করা Anchor point দেখবেন।
04:55	আমি দেখাবো যে Anchor Points একটি Reaction লাইন সংশোধন করতে কিভাবে সাহায্য করে।
05:03	একটি নতুন উইন্ডো খুলুন এবং এটিকে Anchor নাম দিন। Ok তে ক্লিক করুন।
05:11	এখন GTP / GDP এর আইকনে ক্লিক করুন।
05:18	ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন।
05:22	Reaction line এ ডান ক্লিক করুন এবং Add Anchor Point এ ক্লিক করুন।
05:29	Reaction line ড্রেগ করুন এবং ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ড্রপ করুন।
05:37	এরপর আমরা শিখব draw area তে কম্পোনেন্ট সারিবদ্ধ করা।
05:44	Methionine biosynthesis প্রসেস ডায়াগ্রাম উইন্ডোতে ফিরে আসি।
05:50	লক্ষণীয় Reaction লাইন আনচেক করতে ড্র এরিয়াতে যে কোনো স্থানে ক্লিক করুন।
05:56	এখন, Shift কী টিপে রাখুন এবং ড্র এরিয়াতে একাধিক Species এ ক্লিক করুন।
06:04	Edit মেনুতে যান, নীচে স্ক্রোল করুন, Alignment চয়ন করুন এবং Alignment type এ ক্লিক করুন।
06:15	বিকল্পরূপে, টুলবারে Alignment এর জন্য আইকনে ক্লিক করুন।
06:21	স্বয়ংক্রিয়ভাবে টুলবারে অন্যান্য Alignment বিকল্প সন্ধান করুন।
06:27	Alignment আন্ডু করুন এবং এগিয়ে যান।
06:31	Reaction এ কাজ করার সময়, আমরা প্রসেস ডায়াগ্রামে Reaction ids দেখাতে বা লুকোতে পারি?
06:39	এখন সেটি শিখি।
06:41	View তে যান, নীচে স্ক্রোল করুন এবং Show Reaction Id আনচেক করুন।
06:48	draw area তে সংশ্লিষ্ট রিঅ্যাকশনে Reaction ids আর দেখায় না।
06:55	আপনি Reaction Id দেখতে চাইলে নিম্ন করুন।
07:01	View তে যান, নীচে স্ক্রোল করুন এবং Show Reaction Id তে ক্লিক করুন।
07:08	Reaction ids, draw area তে সম্পর্কিত reactions এ দেখাবে।
07:15	আমরা draw area তে সকল কম্পোনেন্টে (Compartment, Species বা Reaction) নোট জুড়তে পারি।
07:21	এটি করা শিখি।
07:24	draw area তে একটি Species এ ডান ক্লিক করুন।
07:28	আমি CoA তে ক্লিক করব।
07:32	নীচে স্ক্রোল করুন এবং Species Notes এ ক্লিক করুন।
07:35	একটি পপ আপ মেনু দেখায়।
07:38	Species Notes নামে ডায়লগ বাক্স খোলে। Species এর সম্পর্কিত টেক্সট লিখুন।
07:46	আমি নিম্ন লিখব।
07:49	Ok তে ক্লিক করুন।
07:51	লক্ষ্য করুন নোটস সম্পর্কিত তথ্য Notes Area তে দেখানো হয়েছে।
07:58	বিকল্পরূপে, Species এ নোট জুড়তে, draw area তে Species এ ক্লিক করুন।
08:06	আমি Succinate এ ক্লিক করব।
08:09	এরপর, CellDesigner উইন্ডোর নীচে ডানদিকে স্থিত Edit Notes ট্যাবে ক্লিক করুন।
08:18	একটি পপ আপ উইন্ডো দেখাবে।
08:21	Species এর সম্পর্কিত টেক্সট লিখুন-
08:25	আমি লিখব এবং Ok তে ক্লিক করব।
08:30	একইভাবে আমরা একটি Protein এডিট করতে পারি।
08:35	এটি করতে, draw area তে কম্পোনেন্টে ডান ক্লিক করুন।
08:40	আমি Homoserine succinyl transferase এ ক্লিক করব।
08:46	নীচে স্ক্রোল করুন এবং Edit Protein এ ক্লিক করুন।
08:51	স্ক্রিনে Protein নামে একটি ডায়লগ বাক্স দেখায়।
08:55	name বাক্সে Protein এর নাম লিখুন।
09:00	আমি name বাক্সে O-succinyltransferase লিখব।
09:06	Update এ ক্লিক করুন এবং ডায়লগ বাক্স বন্ধ করুন।
09:11	আমরা Protein এ ক্ষেত্রও জুড়তে পারি।
09:15	draw area তে Protein এ ডান ক্লিক করুন।
09:19	আমি O- succinyltransferase এ ডান ক্লিক করব।
09:24	নীচে স্ক্রোল করুন এবং Edit Protein এ ক্লিক করুন।
09:29	স্ক্রিনে Protein নামে একটি ডায়ালগ বাক্স দেখায়।
09:33	residues/regions ট্যাবে Add বোতামে ক্লিক করুন।
09:40	ModificationResidue/Bindingregion ডায়ালগ বাক্সে:
09:46	ড্রপ ডাউন মেনু থেকে Type এ Binding region চয়ন করুন।
09:52	কার্সার আবশ্যক ভ্যালুতে সরিয়ে আকার এবং কোণ বদলান।
09:59	এই ডেমো জন্য, Size 15 এবং Angle 38 চয়ন করব।
10:09	তারপর Close এ ক্লিক করুন।
10:12	Update এ ক্লিক করুন
10:14	এবং বক্স বন্ধ করুন।
10:17	Methionine Biosynthesis এ ক্ষেত্র জোড়ার প্রয়োজন নেই, তাই আমি এই পরিবর্তন আন্ডু করব।
10:25	তারপর, আমরা তথ্য এডিট করা শিখি।
10:30	draw area তে component এ ডান ক্লিক করুন।
10:33	আমি Homoserine এ ক্লিক করব।
10:37	নীচে স্ক্রোল করুন এবং Edit Information এ ক্লিক করুন।
10:41	স্ক্রিনে Edit Information নামে ডায়লগ বাক্স দেখায়।
10:46	ডায়ালগ বাক্সে নিম্ন করুন - state ট্যাবে Open চয়ন করুন।
10:54	prefix ট্যাবে mt চয়ন করুন।
10:59	Label ট্যাবে dna চয়ন করুন।
11:04	Ok তে ক্লিক করুন।
11:07	আপনি ড্র এরিয়াতে প্রদর্শিত তথ্য mt:dna দেখতে পারেন।
11:15	আমি Edit Information আন্ডু করব, যেহেতু Methionine Biosynthesis এ এর প্রয়োজন নেই।
11:23	কিছু ক্ষেত্রে, process diagram জটিল হতে পারে।
11:28	এই ধরনের ক্ষেত্রে, Bird's eye view সাহায্য করতে পারে কারণ একটি বড় মডেলে নেভিগেট করা সুবিধাজনক।
11:37	Bird's eye view আইকনে ক্লিক করুন।
11:41	Bird’s Eye View রেড স্কোয়ার টানুন।
11:46	লক্ষ্য করুন draw area তে দৃশ্য সেই অনুযায়ী চলছে।
11:52	এই টিউটোরিয়াল এখানেই শেষ হয়।
11:56	সংক্ষিপ্তকরণ করি। এখানে আমরা শিখেছি: Reaction লাইনের রঙ, আকৃতি এবং প্রস্থ বদলানো।
12:07	Anchor points কে Reaction লাইনে যোগ করা, Components সারিবদ্ধ করা এবং Reaction ids দেখানো / লুকানো
12:18	আমরা এও শিখেছি- Components এ নোট যোগ করা.
12:23	Protein এডিট করা, তথ্য এডিট করা,
12:27	এবং ডায়াগ্রামের Bird’s Eye View পাওয়া।
12:32	অনুশীলনী হিসাবে, CellDesigner এ টুলস দ্বারা একটি গ্লাইকোসিসিস প্রসেস ডায়াগ্রাম বানান।
12:41	Reaction লাইনের বিভিন্ন আকৃতি সন্ধান করুন।
12:47	প্রদত্ত লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি দেখুন, এটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়।
12:52	ভালো ব্যান্ডউইডথ না থাকলে ভিডিওটি ডাউনলোড করে দেখুন।
12:57	স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল কর্মশালার আয়োজন করে। অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়।
13:06	অধিক জানতে contact@spoken-tutorial.org তে লিখুন।
13:13	স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প Talk to a Teacher প্রকল্পের অংশবিশেষ। এটি ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা সমর্থিত। এই মিশন সম্পর্কে আরো তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য।
13:29	আই আই টী বোম্বে থেকে আমি বিদায় নিচ্ছি। অংশগ্রহনের জন্যে ধন্যবাদ।

Contributors and Content Editors

Satarupadutta