Jmol-Application/C3/Structures-from-Database/Telugu

From Script | Spoken-Tutorial
Jump to: navigation, search
Time Narration
00:01 Jmol లో Structures from Database పై ఈ ట్యుటోరియల్ కు స్వాగతం.
00:07 ఈ ట్యుటోరియల్ లో మనము,
00:10 PubChem డేటాబేస్ నుండి రసాయన నిర్మాణాలు Load చేయడం మరియు
00:14 Jmol లో GChemPaint లో డ్రా అయిన 2D నిర్మాణాలను 3D నమూనాలు గా మార్చడం నేర్చుకుంటాము.
00:21 ఈ ట్యుటోరియల్ ను అనుసరించడానికి, మీకు Jmol Application window గురించి తెలిసి ఉండాలి.
00:27 లేకపోతే, మా వెబ్సైట్ లో అందుబాటులో ఉన్న ట్యుటోరియల్స్ చూడండి.
00:33 ఈ ట్యుటోరియల్ ను రికార్డ్ చేసేందుకు, నేను
00:35 ఉబుంటు OS వర్షన్ 12.04
00:40 Jmol వర్షన్ 12.2.2
00:44 Java వర్షన్ 7
00:46 GChemPaint వర్షన్ 0.12.10
00:51 Mozilla Firefox browser 22.0 ను ఉపయోగిస్తున్నాను.
00:56 నేను ఒక క్రొత్త Jmol Application విండోని తెరిచాను.
01:00 Jmol, ఒక డేటాబేస్ లో జాబితా చేయబడిన కంపోనెంట్స్ యొక్క structures లను load చేయగల ఒక లక్షణాన్ని కలిగి ఉంది.
01:07 మెనూ బార్లో File మెను, Get MOL అనే ఒక ఎంపికను కలిగి ఉంది.
01:12 ఇది రసాయన నిర్మాణం డేటాబేస్ అయిన PubChem నుండి అణువులను లోడ్ చేస్తుంది.
01:17 ఇది Protein Data Bank నుండి protein నిర్మాణాలను లోడ్ చేయడానికి మరొక ఎంపిక Get PDB ను కలిగి ఉన్నది.
01:26 ఈ ఫీచర్ మరొక ట్యుటోరియల్ లో వివరంగా వివరించబడుతుంది.
01:31 ప్యానెల్ పై ఒక రసాయన నిర్మాణం, load చేయుటకు Get Mol పై క్లిక్ చేయండి.
01:36 screen పై Input డైలాగ్-బాక్స్ తెరుచుకుంటుంది.
01:40 డేటాబేస్లో జాబితా చేయబడిన ఏదైనా అణువును, టెక్స్ట్ బాక్స్లో కింది విధంగా టైప్ చేయడం ద్వారా లోడ్ చేయవచ్చు:
01:48 సాధారణ పేరు లేదా IUPAC name,
01:51 CAS number,
01:54 CID number,
01:56 InChi identifier లేదా
01:58 SMILES identifier.
02:01 దయచేసి ఒక ప్రత్యేక రసాయనం యొక్క గుర్తింపు సంఖ్యలపై సమాచారం కోసం Pubchem డేటాబేస్ వెబ్సైట్ ను సందర్శించండి.
02:09 స్క్రీన్ పై phenol ను ప్రదర్శిద్దాం.
02:13 కాబట్టి, Input టెక్స్ట్-బాక్స్ లో phenol అని టైప్ చేయండి.
02:16 OK బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
02:20 ఫినాల్ యొక్క నమూనా ప్యానెల్లో ప్రదర్శించబడుతుంది.
02:24 వివిధ రకాల రెండరింగ్ ఎంపికలు ఉపయోగించి, phenol యొక్క ప్రదర్శనను మనము మార్చవచ్చు.
02:30 ఈ ఎంపికలు మెనూ బార్ మరియు పాప్-అప్ మెనులో ఇవ్వబడ్డాయి.
02:36 మనము ఫినాల్ యొక్క benzene ring కు ప్రత్యామ్నాయాలను జోడించవచ్చు.
02:41 ముందుగా, మనము model లోని అణువులకు లేబుల్ ఇద్దాం.
02:45 Display మెనుపై క్లిక్ చేసి, Label ఎంచుకోండి. Number ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
02:52 ఇప్పుడు నెంబర్ 4 వద్ద ఉన్న carbon కు జోడించబడి ఉన్న నెంబర్ 10 వద్ద hydrogen ను amino group తో బదలీ చేద్దాం.
03:00 modelkit మెనుని తెరచి, ఎంపికల జాబితా నుండి nitrogen ను ఎంచుకోండి.
03:06 నెంబర్ 10 hydrogen పై క్లిక్ చేయండి.
03:09 ఇది panel పై Para-Amino Phenol యొక్క మరొక అణువు.
03:14 మనం డిస్ప్లేను Sticks display గా మారుస్తాము.
03:18 modelkit మెనూ నుండి నిష్క్రమించండి.
03:21 పాప్-అప్ మెనుని తెరిచి, Style వరకు స్క్రోల్ చేసి, Scheme ఎంచుకుని Sticks ఎంపికల పై క్లిక్ చేయండి.
03:30 ప్యానెల్ పై, మనం sticks display లో Para-Amino-phenol యొక్క నమూనాను కలిగి ఉన్నాము.
03:36 సృష్టించడానికి కష్టం అయిన సంక్లిష్ట నిర్మాణాలు, ప్యానెల్ లో సులభంగా లోడ్ చేయవచ్చు.
03:42 ఉదాహరణకు: cholesterol.
03:45 File మెనూ పై క్లిక్ చేయండి.
03:47 Get Mol ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి. టెక్స్ట్ బాక్స్లో, Cholesterol అని టైప్ చేయండి.
03:54 OK బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
03:57 Cholesterol యొక్క అణువు ప్యానెల్లో ప్రదర్శించబడుతుంది.
04:02 మనం మొలిక్యూల్ లో double-bond మరియు side-chain వంటి లక్షణాలను హైలైట్ చేయవచ్చు.
04:08 ద్వి-బంధాన్ని హైలైట్ చేయడానికి, మనం మొదట ద్వి-బంధం యొక్క carbon అణువుల రంగును మార్చుదాం.
04:15 సాధన పట్టీలో Select atoms ఐకాన్ పై క్లిక్ చేయండి.
04:19 తరువాత ద్వి-బంధం లో ఉన్న carbon అణువులపై క్లిక్ చేయండి.
04:24 అణువుల చుట్టూ ఒక పసుపు వలయం కనిపిస్తుంది.
04:28 పాప్-అప్-మెనుని తెరవండి.
04:30 Color వద్దకు స్క్రోల్ చేసి, Atoms ఎంచుకుని, Orange ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
04:37 ఇప్పుడు టూల్బార్ లోని Rotate molecule ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి.
04:42 Cholesterol నమూనా లోని ద్వి-బంధం నారింజ రంగులో ఉంది.
04:49 అదేవిధంగా, మనము సైడ్-చైన్ లో గల carbons ను హైలైట్ చేయవచ్చు.
04:54 పాప్-అప్ మెనుని ఉపయోగించి, రంగును ఉదారంగుగా మార్చండి.
04:59 ప్యానెల్ పై, Cholesterol యొక్క మోడల్ ముఖ్యమైన లక్షణాలతో హైలైట్ చేయబడింది.
05:06 ఒక అసైన్మెంట్ గా,
05:08 Pubchem డేటాబేస్ నుండి caffeine నిర్మాణంను Load చేయండి.
05:11 అణువులోని ముఖ్య లక్షణాలను హైలైట్ చేయండి.
05:15 ప్రదర్శనను wireframe గా మార్చండి.
05:19 ఇప్పుడు నేను Jmol యొక్క మరొక ముఖ్యమైన లక్షణం గురించి చర్చిస్తాను.
05:24 మనము ఏదైనా సాఫ్ట్వేర్ లో డ్రా అయిన, 2D structures అణువులను, 3D models గా మార్చగలము.
05:31 నా వద్ద ఇక్కడ, ప్యానెల్లో amino acid Alanine యొక్క నమూనా ఉంది.
05:36 ఈ అణువు యొక్క 2D structure GChemPaint అని పిలువబడే ఒక software లో చిత్రీకరించబడింది.
05:42 నిర్మాణం .mol ఫైల్ గా సేవ్ చేయబడింది.
05:46 GchemPaint అనేది 2D రసాయన నిర్మాణాలను గీయడానికి ఉపయోగపడు ఒక Open source software.
05:51 GChemPaint పై ట్యుటోరియల్స్ ఈ క్రింది లింక్ లో అందుబాటులో ఉన్నాయి.
05:56 స్ట్రక్చర్లను చిత్రీకరించి, మరియు .mol ఫార్మాట్ లో సేవ్ చేయడానికి Analysis of Compounds ట్యుటోరియల్ ను చూడండి.
06:05 ఈ Gchempaint ప్రదర్శన ప్రదేశంలో చూపబడినది,
06:10 Amino acid -Alanine
06:12 Nuclioside -Adenosine మరియు
06:14 Saccharide -Alpha-D glucopyranose యొక్క 2D చిత్రాలు.
06:19 నేను వాటిని నా Desktop. లో .mol ఫార్మాట్ లో సేవ్ చేసాను.
06:24 ముందుగా Alanine యొక్క 2D ఆకృతిని Jmol అప్లికేషన్ లో, 3D నమూనాగా చూద్దాం.
06:32 కాబట్టి, నేను ఒక క్రొత్త Jmol విండోని తెరుస్తాను.
06:36 టూల్బార్లో Open a file ఐకాన్ పై క్లిక్ చేయండి.
06:40 నేను Desktop ఫోల్డర్ ను ఎంచుకుని, Open పై క్లిక్ చేస్తా. Alanine.mol ఫైల్ ను ఎంచుకొని, Open బటన్ పై క్లిక్ చేయండి.
06:51 తెరపై, Alanine యొక్క 3D model తెరుచుకుంటుంది.
06:55 modelkit మెనూని తెరచి, fix hydrogens and minimize ఐచ్ఛికం పై క్లిక్ చేయండి.
07:03 Hydrogens నిర్మాణంకు జోడించబడతాయి మరియు శక్తి తగ్గిపోతుంది.
07:08 ఏదైనా .mol ఫైల్ తో, మనము మెనూ బార్ ను మరియు పాప్-అప్ మెనూ ను కూడా ఉపయోగించి ప్రదర్శనను మార్చవచ్చు.
07:15 ఇది Jmol. లో Adenosine.mol యొక్క 3D నమూనా మరియు
07:19 ఇది Jmol. లో Alpha-D-glucopyranose.mol యొక్క 3D నమూనా.
07:25 సారాంశం చూద్దాం.
07:27 ఈ ట్యుటోరియల్ లో మనము
07:32 PubChem డేటాబేస్ నుండి రసాయన నిర్మాణాలు Load చేయడం,
07:34 Phenol మరియు Cholesterol ల యొక్క ప్రదర్శనను సవరించడం,
07:38 Jmol లో GChemPaint లో డ్రా అయిన 2D నిర్మాణాలను 3D నమూనాలు గా మార్చడం
07:44 Alanine, Adenosine మరియు Alpha-D-glucopyranose ల యొక్ 2-D నిర్మాణాలను 3-D నమూనాలకు మార్చడం నేర్చుకున్నాము:
07:53 ఇక్కడ మీ కోసం ఒక అసైన్మెంట్,
07:56 GChemPaint లో ఈ క్రింది Amino acids యొక్క 2D నిర్మాణాలు గీయండి.
08:01 Cysteine
08:03 Histidine Phenylalanine
08:06 .mol గా ఫైళ్ళన సేవ్ చేయండి.
08:09 Jmol లో ఫైళ్ళను తెరచి ప్రదర్శనని మార్చండి.
08:12 ఈ URL లో అందుబాటులో ఉన్న వీడియోను చూడండి. http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial
08:16 ఈ వీడియో Spoken Tutorial ప్రాజెక్ట్ సారాంశాన్ని ఇస్తుంది.
08:19 మీకు మంచి బ్యాండ్విడ్త్ లేకపోతే, మీరు దీన్ని డౌన్లోడ్ చేసి చూడవచ్చు.
08:23 స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్ ప్రాజెక్ట్ టీమ్:
08:26 స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్స్ ఉపయోగించి వర్క్ షాప్స్ నిర్వహిస్తుంది.
08:29 ఆన్ లైన్ పరీక్షలో ఉత్తీర్ణులైనవారికి సర్టిఫికేట్లను ఇస్తుంది.
08:33 దయచేసి మమ్మల్ని సంప్రదించండి. contact@spoken-tutorial.org
08:40 స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్ ప్రాజెక్ట్ టాక్ టు ఎ టీచర్ ప్రాజెక్ట్ లో ఒక భాగం.
08:45 స్పోకెన్ ట్యుటోరియల్ ప్రాజెక్ట్ కు భారతదేశం ప్రభుత్వం యొక్క NMEICT-MHRD నిధులు సమకూరుస్తుంది.
08:52 ఈ మిషన్ పై మరింత సమాచారం ఈ లింక్ వద్ద అందుబాటులో ఉంది. http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro.
08:57 ఈ ట్యుటోరియల్ ని తెలుగు లోకి అనువదించినది స్వామి, మరియు నేను ఉదయలక్ష్మి. మాతో చేరినందుకు ధన్యవాదములు.

Contributors and Content Editors

Madhurig, Simhadriudaya