CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Tamil

Time	Narration
00:01	வணக்கம், CellDesigner ல் Create மற்றும் Edit Components குறித்த ஸ்போக்கன் டுட்டோரியலுக்கு நல்வரவு.
00:08	இந்த டுட்டோரியலில் நாம் கற்கப்போவது: draw area ல் ஏற்கனவே சேமித்த .xml file ஐ திறப்பது.
00:15	compartment ல் shape, size, color மற்றும் border ன் thicknessஐ மாற்றுதல்.
00:22	CellDesigner ல் multiple file களை உருவாக்குதல், Species ன் அடையாளத்தை மாற்றுதல்.
00:28	மேலும் Species ஐ Cut, Copy மற்றும் Paste செய்வது ,Species ன் Start-point மற்றும் End-point பற்றியும் நாம் கற்கலாம்.
00:37	Species ஐ எவ்வாறு செயல்படுத்துவது மற்றும் அதன் நிறத்தை மாற்றுவது, Reaction னின் அம்சங்களை மாற்றுவது , File ஐ எப்படி மூடுவது.
00:47	இங்கே நான் பயன்படுத்துவது Ubuntu Linux OS version 14.04 CellDesigner version 4.3 Java version 1.7 .
00:57	இந்த டுடோரியலை பின்பற்ற கற்பவருக்கு Undergraduate Biochemistry மற்றும் CellDesigner interface பரீட்சயமாக இருக்க வேண்டும்.
01:05	இல்லையெனில், தொடர்புடைய CellDesigner டுட்டோரியல்களுக்கு www.spoken-tutorial.org ஐ அணுகவும்.
01:16	இந்த series ன் முந்தைய tutorial கள் Windows OS ல் உருவாக்கப்பட்டது என்பதை கவனிக்கவும் .
01:24	எனினும், இனிவரும் tutorial கள் Ubuntu Linux OS ல் உருவாக்கப்படும்.
01:30	நாம் CellDesigner ல் component களை உருவாக்கி edit செய்யலாம்.
01:35	Ctrl+Alt+T key களை ஒன்றாக அழுத்தி terminal ஐ திறக்கவும் .
01:41	இப்போது type செய்க ./runCellDesigner4.3 பிறகு Enter ஐ அழுத்தவும்.
01:52	இப்போது உங்கள் screen ல் CellDesigner window திறக்கும்.
01:56	இப்போது நாம் முன்பே உருவாக்கிய Create and Edit file ஐ திறக்கலாம்.
02:02	ஆகவே File ஐ click செய்து பிறகு Open ஐ click செய்க.
02:07	Open என்று பெயருடைய dialog box திரையில் தோன்றும்.
02:11	இங்கே, ‘Folders’ label ன் கீழ் உள்ள folder ஐ தேர்வு செய்ய வேண்டும்.
02:15	‘File’ label ன் கீழ் உள்ள 'Create_and_Edit.xml' file ஐ click செய்து ‘Ok’ ஐ double-click செய்யவும்.
02:27	இப்போது draw area ல் நமது Create_and_Edit.xml file திறந்துள்ளது.
02:35	Compartment ஐ தேர்வு செய்க. main menu bar ல் Component க்கு செல்லவும் .
02:43	Scroll down செய்து Change to OVAL ஐ தேர்வு செய்யவும்.
02:48	இப்போது draw area ல் , நாம் oval compartment ஐ கொண்டுள்ளோம்.
02:54	Color அல்லது thickness ஐ மாற்ற , main menu bar ல் “Component” க்கு செல்லவும் .
03:00	“Change color & shape” option ஐ click செய்யவும்.
03:05	மாற்றாக , compartment boundary ல் right-click செய்து “Change color & shape” option ஐ தேர்வு செய்யவும்.
03:14	'Change color & shape' என்ற பெயருடைய dialog box திரையில் தோன்றும்.
03:20	மெலிந்த boundary line க்காக ,Membrane Thickness ஐ 12 ல் இருந்து 8 அல்லது அதற்க்கு கீழ் மாற்ற வேண்டும் .
03:29	நிறத்தை மாற்ற Color panel க்கு செல்லவும்.
03:34	Color panel ல் pointer போன்ற handle ஐ உடைய color wheel இருக்கும்.
03:39	தேவையான நிறத்தை தேர்வு செய்ய pointer ஐ click மற்றும் hold செய்து அதனை rotate செய்ய வேண்டும்
03:46	அனைத்து மாற்றங்களும் முடிந்த பிறகு ,Apply ஐ click செய்து பின்பு 'Ok' ஐ click செய்யவும்.
03:53	வெவ்வேறு Compartment களை வரைய reaction toolbar ல் மற்ற option களை நீங்களே ஆராயவும்.
04:00	இப்போது நாம் Species ன் அடையாளத்தை எப்படி மாற்றுவது என கற்கலாம்.
04:05	ஆகவே , CTRL+N ஐ அழுத்தி புதிய window ஐ திறக்கவும்.
04:11	இந்த file லிற்கு Change Species என நாம் பெயரிடுவோம்.
04:16	முன்னிருப்பான width மற்றும் height ஐ நாம் வைத்துக்கொள்ளலாம். பிறகு Ok button ஐ click செய்யவும்.
04:22	இப்போது, toolbar ல் 'Generic protein' க்கான icon ஐ click செய்க. draw area ஐ click செய்க.
04:30	Dialog box ல் , type செய்க Pectin பிறகு Ok button ஐ click செய்யவும்.
04:37	இப்போது Generic protein Pectin ன் மீது right-click செய்யவும்.
04:41	பிறகு Change Identity என்ற option ஐ click செய்யவும்.
04:46	Screen ல் 'Change identity of the species' என்ற பெயருடைய dialog box தோன்றும்.
04:53	Class box ல் down arrow ஐ click செய்யவும்.
04:58	Drop-down menu ல் எந்த option ஐயும் தேர்வு செய்யலாம். உதாரணத்திற்கு simple molecule
05:05	இப்போது , Name box ல் இந்த simple molecule க்கு பெயரிடவும்.
05:10	இப்போது Fructose என வைத்துக்கொள்ளலாம் .பிறகு Apply button ஐ click செய்யவும்.
05:17	இப்போது நமது Protein Pectin, Fructose என்று பெயருடைய simple molecule ஆக மாற்றப்பட்டுள்ளதை கவனிக்கவும்.
05:25	இப்போது நாம் எப்படி Cut, Copy மற்றும் Paste செய்வது என்பதை கற்போம்.
05:29	நான் draw area ல் முன்னரே இருந்த அதே Fructose ஐயே பயன்படுத்துகிறேன் .
05:34	Species ஐ cut செய்ய , Species Fructose ஐ முதலில் click செய்யவும்.
05:40	Edit menu க்கு சென்று , scroll down செய்து Cut ஐ click செய்க.
05:47	Ctrl+X என்பது Cut செய்வதற்கான shortcut key என்பதை குறித்துக்கொள்ளவும்.
05:53	Species Fructose இப்போது cut செய்யபட்டிருக்கும் .
05:56	Species ஐ paste செய்ய 'Edit' menu க்கு திரும்பிச்சென்று , scroll down செய்து Paste ஐ click செய்யவும்.
06:03	Ctrl+V என்பது Paste செய்வதற்கான shortcut key என்பதை குறித்துக்கொள்ளவும்.
06:08	Draw area ல் Species Fructose என்பது மறுமுறை தோன்றும்.
06:12	Species ஐ copy செய்ய main menu bar ல் Edit க்கு செல்லவும்.
06:18	Copy ஐ click செய்யவும்.
06:21	Ctrl+C என்பது copy செய்வதற்கான shortcut key என்பதை குறித்துக்கொள்ளவும்.Copy ஐ click செய்யவும் .draw area ஐ click செய்யவும்.
06:31	இம்முறை, paste செய்ய நாம் Ctrl + V ஐ அழுத்தவும்.
06:36	இப்போது நாம் draw area ல் Fructose ன் copy ஐ கொண்டுள்ளோம்.
06:40	ஏதேனும் ஒரு செயலை undo செய்ய Ctrl+Z ஐ அழுத்தவும். பிறகு ஏதேனும் ஒரு செயலை redo செய்ய Ctrl+Y ஐ அழுத்தவும்.
06:51	எனினும் இவை குறைந்த பயன்பாட்டிலேயே இருக்கின்றன.
06:55	Draw area ல் உள்ள Fructose molecule களை இழுத்து நகர்த்தவும்.
07:00	அதனை செய்ய , Fructose ஐ click செய்து தேவையான இடத்திற்கு இழுக்கவும்.
07:07	அடுத்து நாம் start-point மற்றும் end-point species என்றால் என்ன மற்றும் species ஐ எப்படி activate செய்வது என்பது பற்றியும் கற்கலாம்.
07:13	அதற்கு நான் 2 generic protein களுக்கு நடுவே state transition reaction ஐ முன்னரே வரைந்துவிட்டேன்.
07:21	நான் அவற்றிக்கு Protein 1 மற்றும் Protein 2 என்று பெயரிட்டுள்ளேன்.
07:25	reaction ஐ வரைவது பற்றி முன்னரே கற்றோம் என்பதை நினைவுக்கூரவும்.
07:29	உங்களுக்கு தெரியவில்லையெனில், இந்த series ன் முந்தைய tutorial களை பார்க்கவும் . மேலும் தொடரலாம்.
07:35	இந்த reaction ல் ‘Protein 1’ என்பது ‘start point’ மற்றும் Protein 2 என்பது ‘end point’ .
07:43	species ஐ activate செய்ய Reaction ன் 'end-point' Species ஐ click செய்யவும்.
07:50	இங்கே, அது Protein 2.
07:53	ஆகவே, Protein 2 ஐ click செய்து keyboard ல் A ஐ அழுத்தவும்.
07:59	நான் Ctrl + Z key களை பயன்படுத்தி இந்த மாற்றத்தை undo செய்கிறேன்.
08:05	மாற்றாக , Protein 2 ஐ click செய்யவும்.
08:09	அடுத்து, main menu bar ல் Component க்கு செல்லவும்.
08:13	Scroll down செய்து Set Active ஐ click செய்யவும்.
08:18	activated species , dashed line ஆல் மூடப்பட்டிருப்பதை கவனிக்கவும்.
08:24	இப்பொது நாம், Protein 2 species ன் நிறத்தை மாற்றலாம் .
08:29	ஆகவே, அதை right-click செய்து பிறகு 'Change color and shape' ஐ click செய்யவும்.
08:35	நாம் முன்னரே பார்த்தபடி, Color panel ல் color wheel இருக்கும்.
08:40	தேவையான நிறத்தை தேர்வு செய்ய pointer ஐ click செய்து சுழற்றவும்.
08:44	பிறகு, Apply மற்றும் Ok ஐ click செய்யவும்.
08:49	species ல் நிற மாற்றத்தை கவனிக்கவும்.
08:53	நாம், Reaction ன் அம்சங்களை எப்படி மாற்றுவது என்பதை கற்கலாம்.
08:57	இப்போது, draw area ல் உள்ள state transition reaction க்கு திரும்புவோம்.
09:03	இரண்டு species ன் நடுவில் உள்ள reaction arrow ன் மீது right-click செய்யவும்.
09:08	இப்போது Change Identity option ஐ click செய்யவும்.
09:13	Change Properties of the Reaction என்ற dialog box தோன்றும் .
09:18	Name box ல் reaction ன் பெயரை type செய்யவும். உதாரணத்திற்கு Reaction1 .
09:26	Type box ன் drop-down menu ல் , தேவையான reaction ஐ தேர்வு செய்யவும் உதாரணத்திற்கு Transcription.'Ok' ஐ click செய்யவும்.
09:38	Draw area ல் reaction மாறியிருப்பதை கவனிக்கவும்.
09:42	Draw area ல் reaction arrow க்கு கொடுத்த பெயரை நம்மால் காண முடியாது.
09:47	கவலைப்பட தேவையில்லை, இனிவரும் tutorial களில் நாம் அதை கற்கலாம்.
09:53	reaction arrow ன் மீது மீண்டும் right-click செய்து Change Identity option ஐ click செய்யவும்.
10:00	ஒருவேளை அது Reversible reaction ஆக இருந்தால், TRUE option ஐ click செய்து பிறகு Ok ஐ click செய்யவும்.
10:09	இப்பொது reaction தலைகீழாய் இருப்பதை நீங்கள் காணலாம்.
10:14	CellDesigner ல் இருந்து வெளிவர, File ஐ click செய்து பிறகு Exit option ஐ click செய்யவும்.
10:20	மாற்றாக , Ctrl+ Q ஐயும் click செய்யலாம்.
10:25	மாற்றங்களை நாம் சேமிக்க விரும்புகிறோமா என்று கேட்டு screen ல் Confirmation dialog box தோன்றும்.
10:32	Yes ஐ click செய்து Ok button மீது double-click செய்யவும்.
10:38	அது file திருத்தப்பட்டுவிட்டது என்று கூறுகிறது.
10:41	மாற்றங்களை சேமிக்க வேண்டுமா ? Yes ஐ click செய்யவும்.
10:45	நாம் கற்றதை நினைவுகூருவோம். இந்த டுட்டோரியலில், நாம் கற்றது
10:50	Draw area ல் முன்னரே சேமித்த .xml file ஐ திறப்பது.
10:55	Compartment ன் shape, size, color மற்றும் border ன் thickness ஐ மாற்றுவது.
11:01	CellDesigner ல் multiple file களை உருவாக்குவது identity ஐ மாற்றுவது.
11:07	Species ஐ Cut, Copy மற்றும் Paste செய்வது.
11:10	மேலும் நாம் கற்றது Species ன் Start-point மற்றும் End-point ஐ பற்றி.
11:15	Species ஐ செயல்படுத்துவது, Species ன் நிறத்தை மாற்றுவது , Reaction ன் அம்சங்களை மாற்றுவது, பிறகு File ஐ மூடுவது .
11:25	பயிற்சியாக : complex ஐ உருவாக்கி Species ஐ Complex உள் வைக்கவும்.
11:32	பயிற்சி 2: Toolbar ஐ ஆராந்து ஒரு reactionக்கு reactant மற்றும் product ஐ எப்படி சேர்ப்பது என்பதை கண்டுபிடிக்கவும்.
11:41	உங்களின் முழுமையான பயிற்சி இது போல் காண வேண்டும்.
11:45	உங்கள் முதல் பயிற்சி இது போல் காண வேண்டும்: complex மற்றும் Complex உள் உள்ள Species.
11:55	பயிற்சி 2 இது போல் காண வேண்டும்: reactant மற்றும் product உடன் உள்ள state-transition reaction.
12:00	Spoken Tutorial project ஐ பற்றி காணலாம்-
12:05	கொடுக்கப்பட்டுள்ள இணைப்பில் உள்ள video, Spoken Tutorial project ஐ சுருங்க சொல்கிறது.அதை download செய்து பார்க்கவும்.
12:13	ஸ்போகன் டுடொரியல் திட்டக்குழு, ஸ்போகன் டுடொரியல்களை பயன்படுத்தி செய்முறை வகுப்புகள் நடத்துகிறது. இணையத்தில் பரிட்சை எழுதி தேர்வோருக்கு சான்றிதழ்கள் தருகிறது.மேலும் விவரங்களுக்கு மின்னஞ்சல் எழுதவும்.
12:23	Spoken Tutorial Project க்கு ஆதரவு NMEICT, MHRD, Government of India.மேலதிக விவரங்களுக்கு கொடுக்கப்பட்டுள்ள இணைப்பை பார்க்கவும்.
12:35	இந்த டுட்டோரியலை தமிழாக்கம் செய்து குரல் கொடுத்தது IIT Bombayல் இருந்து சண்முகப் பிரியா. நன்றி

Contributors and Content Editors

Venuspriya