Avogadro/C2/Build-molecules/Marathi
From Script | Spoken-Tutorial
Time | Narration |
00:01 | Build Molecules वरील स्पोकन ट्युटोरिअलमध्ये आपले स्वागत आहे. |
00:07 | या ट्युटोरियलमध्ये आपण डेटाबेस मधून रेणूंना आयात करणे शिकू. |
00:11 | रोटेट, ज़ूम इन आणि ज़ूम आऊट करणे. |
00:15 | पॅनलवर रेणूंना बनवणे. |
00:17 | फोर्स फील्ड सेट अप करणे आणि जोमिट्री ऑप्टीमाइज करणे. |
00:21 | बॉन्ड लेंग्थस, बॉन्ड अँगल्स, डायहेड्रल अँगल्स मोजा. |
00:25 | फ्रॅगमेंट लायब्ररी दाखवणे. |
00:27 | DNA molecules आणि Peptides बनवणे. |
00:31 | येथे मी वापरत आहे Ubuntu Linux OS व्हर्जन 14.04 Avogadro व्हर्जन 1.1.1 आणि चालू स्तिथितील इंटरनेट कनेक्शन. |
00:44 | या ट्युटोरियलचे अनुसरण करण्यास तुम्हाला रसायनशास्त्राची मूलभूत माहिती असणे आवश्यक आहे.
Avogadro डाउनलोड करण्यास कृपया दर्शविलेल्या लिंकचा वापर करा. sourceforge.net/projects/avogadro |
00:53 | मी आधीच Avogadro डाउनलोड केले आहे. |
00:56 | Avogadro उघडण्यासाठी, Dash home वर क्लीक करा. |
01:00 | सर्च बार मध्ये, avogadro टाइप करा. |
01:02 | अँप्लिकेशन उडण्यासाठी Avogadro आयकॉन वर क्लीक करा. |
01:08 | आता chemical structure database मधून xylene रेणू आयात करून सुरुवात करूया. |
01:15 | रेणू आयात करण्यास आपल्याला चालू स्तिथितील इंटरनेट कनेक्शनची गरज लागेल. |
01:19 | File मेनू वर क्लीक करून Import वर जा. |
01:23 | सब-मेनू उघडेल. |
01:25 | Fetch by chemical name निवडा. |
01:28 | Chemical name डायलॉग बॉक्स दिसेल. |
01:30 | प्रात्यक्षिकांसाठी मी सर्च बॉक्स मध्ये xylene टाईप करेल. |
01:36 | OK बटण वर क्लीक करा. |
01:38 | आपल्याकडे आता पॅनल वर xylene रेणू आहे. |
01:42 | पॅनलवरील रेणूला फिरुया. |
01:45 | टूल बार वरील Navigation tool वर क्लीक करा. |
01:49 | रेणू वर कर्सर ठेवा. |
01:52 | माउसचे डावे बटण दाबून ड्रॅग करा. |
01:56 | लक्षात घ्या डायरेक्शन एरोज ड्रॅगला संकेत करतो. |
02:00 | रेणूला हलवण्यासाठी, माऊसचा उजवा बटण वापरून ड्रॅग करा. |
02:06 | स्ट्रक्चर जुम इन आणि जुम आऊट करण्यास माऊस व्हीलला स्क्रोल करा. |
02:10 | आता रेणूला कसे बनवायचे ते शिकू. |
02:14 | रेणूला बनवण्यास, टूल बार वरील Draw Tool आयकॉन वर क्लीक करा. |
02:19 | Draw Settings मेनू मध्ये आपण निम्न पाहू शकतो,
Element ड्रॉप डाउन बटण Bond Order ड्रॉप डाउन बटण Adjust Hydrogens चेक बॉक्स. |
02:30 | जर तुम्हाला स्ट्रक्चर वर हायड्रोजन्स नको असल्यास, Adjust Hydrogens चेक बॉक्स अन-चेक करा. |
02:37 | Element ड्रॉप डाउन लिस्ट, एलेमेंट्सची सूची दाखवते. |
02:42 | एका वेगळ्या विंडो मध्ये संपूर्ण Periodic table पाहण्यासाठी Other वर क्लीक करा. |
02:48 | विंडो बंद करण्यास, Close (X) वर क्लीक करा. |
02:51 | आता पॅनल वर Aniline चे स्ट्रक्चर काढू या. |
02:55 | Element ड्रॉप डाउन लिस्ट मधून Carbon निवडा. |
02:59 | Bond Order ड्रॉप डाउन मधून Single निवडा. |
03:03 | पॅनल वर क्लीक करा. |
03:05 | 6 कार्बन अणूंच्या बंद साकळी बनविण्यासाठी ड्रॅग आणि ड्रॉप करा. |
03:10 | डबल बॉण्ड्स दाखवण्यास, Bond Order ड्रॉप डाउन मधून Double निवडा. |
03:16 | Benzene स्ट्रक्चर मिळवण्यासाठी alternate bonds वर क्लीक करा. |
03:21 | आता Aniline चे स्ट्रक्चर पूर्ण झाले आहे. |
03:24 | Element ड्रॉप डाउन लिस्ट मधून Nitrogen निवडा. |
03:29 | Bond Order ड्रॉप डाउन मधून Single निवडा. |
03:33 | स्ट्रक्चर वर कोणत्याही एका कार्बन अणू वर क्लीक करून ड्रग करा. |
03:39 | Build मेनू वर जा आणि Add Hydrogens निवडा. |
03:45 | आपल्या पॅनल वर Aniline चे स्ट्रक्चर आहे. |
03:49 | स्थिर आकार मिळवण्यासाठी, पॅनल वरील Aniline स्ट्रक्चर ऑप्टिमाइज्ड करणे आवश्यक आहे. |
03:56 | ऑप्टिमाइज करण्यास, टूल बार वरील Auto Optimization Tool वर क्लीक करा. |
04:02 | AutoOptimization Settings मेनू डावीकडे दिसत आहे. |
04:06 | Force Field ड्रॉप डाउन लिस्ट वर क्लीक करा, MMFF94 निवडा. |
04:13 | लहान सेंद्रीय रेणूंना ऑप्टिमाइज करण्यासाठी सामान्यतः MMFF94 वापरले जाते. |
04:20 | Start बटण वर क्लीक करा. |
04:23 | ऑप्टिमायझेशन पूर्ण करण्यासाठी काही सेकंद लागतील. |
04:28 | Optimization Settings बंद करण्यासाठी Stop वर क्लीक करा. |
04:33 | आता Aniline चे bond lengths, bond angles आणि dihedral angles मोजुया. |
04:40 | टूल बार मधील Click to Measure आयकॉन निवडा. |
04:44 | अंतर मोजण्यासाठी, कोणत्याही दोन सलग कार्बन अणूंवर क्लिक करा. |
04:49 | अँगल्स मोजण्यासाठी, कोणत्याही 3 सलग अणूंवर क्लिक करा. |
04:55 | dihedral angles मोजण्यासाठी, कोणत्याही 4 सलग अणूंवर क्लिक करा. |
05:02 | मोजलेले वेल्यूज Panel च्या खाली दिसतील. |
05:07 | फाइल सेव्ह करण्यास, File आणि Save As वर क्लीक करा. |
05:13 | Save Molecule As डायलॉग बॉक्स दिसेल. |
05:17 | Aniline.cml म्हणून फाइलचे नाव टाईप करा . |
05:21 | स्थान Desktop म्हणून निवडा आणि Save बटण वर क्लिक करा. |
05:28 | नवीन विंडो उडण्यास, New आयकॉन वर क्लीक करा. |
05:32 | Avogadro सॉफ्टवेअरमध्ये fragment लायब्ररी वापरून जटिल रेणूंना तयार करण्याची सुविधा आहे. |
05:38 | Build मेनू वर जाऊ. |
05:40 | Insert वर जा आणि Fragment पर्याय निवडा. |
05:45 | Insert Fragment डायलॉग बॉक्स उघडेल. |
05:49 | आपण विविध केमिकल स्ट्रक्चर्सची cml फाइल्स असलेल्या फोल्डर्सची यादी पाहू शकतो. |
05:55 | उदाहरणार्थ alkenes फोल्डर उघडूया. |
06:00 | फोल्डरचे कन्टेन्ट पाहण्यासाठी फोल्डर वर डबल क्लीक करा. |
06:04 | 2-methyl-buta-1,3-diene.cml निवडा. |
06:10 | Insert बटण वर क्लीक करा. |
06:13 | डायलॉग बॉक्स बंद करण्यास Close वर क्लीक करा. |
06:17 | पॅनल वर 2-methyl-1,3-butadiene चे स्ट्रक्चर प्रदर्शित आहेत. |
06:22 | हे सामान्यतः Isoprene असे म्हटले जाते. |
06:26 | आपण Isoprene वापरून अनेक नैसर्गिक उत्पादने तयार करू शकतो. |
06:30 | रेणू निवडण्याच्या मोड मध्ये आहे. |
06:33 | डी-सिलेक्ट करण्यासाठी, CTRL, SHIFT आणि A कीज एकत्रपणे दाबा. |
06:39 | उदाहरणार्थ: मी Vitamin A आणि natural rubber दाखवेल जे Isoprene वापरून तयार करण्यात आले होते . |
06:47 | Vitamin A आणि natural rubber. |
06:51 | मी Isoprene एका कोपर्यात हलवेल. |
06:56 | Build मेनू वर क्लीक करा, Insert वर जा आणि Fragment निवडा. |
07:02 | macrocycles फोल्डर खाली स्क्रोल करा, उघडण्यास डबल क्लीक करा. |
07:08 | porphin फ्रॅगमेंट निवडा आणि Insert वर क्लीक करा. |
07:14 | डायलॉग बॉक्स बंद करा. |
07:16 | porphin फ्रॅगमेंट वापरून, आपण जटिल केमिकल स्ट्रक्चर्स तयार करू शकतो: जसे कि Chlorophyll आणि Vitamin B12 . |
07:25 | Chlorophyll |
07:27 | Vitamin B12 |
07:30 | DNA आणि peptides सारख्या जटिल रेणूंना सहजपणे Avogadro वापरून तयार केल्या जाऊ शकतात. |
07:37 | New आयकॉन वापरून एक नवीन विंडो उघडा. |
07:41 | DNA रेणू समाविष्ट करण्यास, Build मेनू वर जाऊन Insert वर जा आणि सब मेनू मधून DNA/RNA वर क्लीक करा. |
07:51 | Insert Nucleic Acids डायलॉग बॉक्स दिसेल. |
07:55 | DNA/RNA Builder ड्रॉप डाउन मधून DNA निवडा. |
08:00 | चार nucleic acid bases बटण म्हणून दर्शविले आहेत. |
08:05 | nucleic acid क्रम निवडण्यासाठी बटनांवर क्लिक करा. |
08:10 | तुम्ही acids ची क्रम तुमच्या आवडीने निवडू शकता. |
08:14 | प्रदर्शनासाठी मी A T G C A T G C निवडणार आहे. |
08:26 | nucleic acids चे निवडण्याचे क्रम Sequence टेक्स्ट बॉक्स मध्ये दिसते. |
08:32 | Bases Per Turn ड्रॉप डाउन मध्ये, A निवडा, "5" निवडा : जे प्रति Helix मूळ जोड्यांची संख्या आहे. |
08:41 | Strands मध्ये Single निवडा आणि Insert बटण वर क्लीक करा. |
08:47 | डायलॉग बॉक्स बंद करण्यास close (X) वर क्लीक करा. |
08:51 | आता आपल्याकडे Panel वर एकच स्ट्रेंडेड DNA रेणू आहे. |
08:56 | स्ट्रक्चर झूम करा आणि पॅनलच्या मध्यभागी ड्रॅग करा. |
09:01 | Panel वर DNA रेणू न निवडण्यास, CTRL, Shift आणि A कीज एकत्रित दाबा. |
09:09 | आपण Insert मेनू मधील Peptide पर्याय वापरून Peptide क्रम देखील तयार करू शकतो. |
09:16 | पुन्हा एक नवीन विंडो उघडण्यास New आयकॉन वर क्लीक करा. |
09:21 | Build मेनू वर जाऊन Insert आणि Peptide पर्यंत खाली स्क्रोल करा. |
09:26 | Insert Peptide डायलॉग बॉक्स दिसेल. |
09:29 | amino acids बटणावर क्लीक करून Peptide क्रमसाठी amino acids निवडा. |
09:36 | निदर्शनासाठी मी Glycine(Gly) -Valine(Val) -Proline(Pro) आणि Cystine(Cys) . म्हणून क्रम निवडेल. |
09:45 | Sequence टेक्स्ट बॉक्स मध्ये निवडीचा क्रम दिसतो. |
09:50 | Insert Peptide बटण वर क्लीक करा. |
09:53 | Insert Peptide डायलॉग बॉक्स बंद करा. |
09:57 | Panel वर Peptide शृंखला दिसते. |
10:00 | Panel वर Peptide डि - सिलेक्ट करण्यास, CTRL, Shift आणि A कीज एकत्रित दाबा. |
10:07 | तुम्ही तुमच्या पसंतीचा amino acids निवडू शकता आणि Peptide क्रम तयार करू शकता. |
10:13 | थोडक्यात |
10:15 | या ट्युटोरिअल मध्ये आपण शिकलो : |
10:18 | डेटाबेस मधून रेणूंना आयात करणे. |
10:21 | रोटेट, ज़ूम इन आणि ज़ूम आऊट करणे. |
10:24 | पॅनल वर रेणूंना तयार करणे. |
10:26 | फोर्स फील्ड सेट अप करणे आणि जोमेट्री ऑप्टिमाइज करणे |
10:30 | बॉन्ड लेंग्थस, बॉन्ड अँगल्स, डायहेडरल अँगल्स मापणे. |
10:35 | फ्रॅगमेंट लायब्ररी दाखवणे. |
10:37 | DNA रेणू आणि Peptides तयार करणे. |
10:41 | असाईनमेन्ट म्हणून - खालील अमिनो ऍसिड रेसिडूएस (अवशेष) वापरून एक प्रोटीन क्रम तयार करा: |
10:49 | UFF फोर्स फील्ड वापरून जोमेट्री ऑप्टिमाइज करा. |
10:53 | इमेज .cml फाइल म्हणून सेव्ह करा. |
10:58 | Nucleic acids: AUGC वापरून RNA क्रम तयार करा. |
11:04 | MMFF94 फोर्स फील्ड वापरून जोमेट्री ऑप्टिमाइज करा. |
11:10 | इमेज .cml फाइल म्हणून सेव्ह करा. |
11:14 | या व्हिडिओमधे स्पोकन ट्युटोरियल प्रॉजेक्टचा सारांश मिळेल. |
11:18 | जर तुमच्या कडे चांगली बॅण्डविड्थ नसेल तर विडिओ डाउनलोड करूनही पाहू शकता. |
11:23 | स्पोकन ट्युटोरियल च्या सहाय्याने कार्यशाळा चालविते आणि प्रमाणपत्रही दिले जाते. अधिक माहितीसाठी कृपया आम्हाला लिहा. |
11:30 | स्पोकन ट्युटोरियल प्रॉजेक्टसाठी अर्थसहाय्य NMEICT, MHRD आणि Government of India यांच्याकडून मिळालेले आहे. |
11:36 | मी रंजना उके आपला निरोप घेते. सहभागासाठी धन्यवाद. |