Difference between revisions of "Biopython/C2/Writing-Sequence-Files/Malayalam"
From Script | Spoken-Tutorial
(Created page with "{|Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 | ഹലോ എല്ലാവരും '''Writing Sequence Files'''.ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക...") |
|||
| Line 10: | Line 10: | ||
|- | |- | ||
| 00:07 | | 00:07 | ||
| − | | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും: '''Sequence Record Objects'''എങ്ങിനെ സൃഷ്ടിക്കാം | + | | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും:'''Sequence Record Objects'''എങ്ങിനെ സൃഷ്ടിക്കാം? |
|- | |- | ||
| Line 42: | Line 42: | ||
|- | |- | ||
| 00:38 | | 00:38 | ||
| − | | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ രേഖപ്പെടുത്താൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു: * '' 'ഉബുണ്ടു ഓസ്' 'പതിപ്പ് 14.10 | + | | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ രേഖപ്പെടുത്താൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു:* '' 'ഉബുണ്ടു ഓസ്' 'പതിപ്പ് 14.10 |
|- | |- | ||
| Line 57: | Line 57: | ||
|- | |- | ||
| − | | 01: 03 | + | | 01:03 |
| ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഒരു ഫയലിലേക്ക് സീക്വൻസുകൾ എഴുതാൻ '''write''' ഫങ്ഷൻ' 'എങ്ങനെ ഉപയോഗിക്കണമെന്ന് പഠിക്കും. | | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഒരു ഫയലിലേക്ക് സീക്വൻസുകൾ എഴുതാൻ '''write''' ഫങ്ഷൻ' 'എങ്ങനെ ഉപയോഗിക്കണമെന്ന് പഠിക്കും. | ||
| Line 73: | Line 73: | ||
|- | |- | ||
| − | | 01: 24 | + | | 01:24 |
| ഇൻസുലിൻ പ്രോട്ടീൻ ഇവിടെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. | | ഇൻസുലിൻ പ്രോട്ടീൻ ഇവിടെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 01: 28 | + | | 01:28 |
| − | | '''GI accession number'''കൂടാതെ | + | | '''GI accession number'''കൂടാതെ description.തുടങ്ങിയ വിവരങ്ങളും ഇതിനുണ്ട്. |
|- | |- | ||
| − | | 01: 36 | + | | 01:36 |
| 'FASTA' 'ഫോര്മാറ്റില് ഈ സീക്വന്സിനായി നമ്മള് ഒരു ഫയല് സൃഷ്ടിക്കും. | | 'FASTA' 'ഫോര്മാറ്റില് ഈ സീക്വന്സിനായി നമ്മള് ഒരു ഫയല് സൃഷ്ടിക്കും. | ||
|- | |- | ||
| − | | 01: 41 | + | | 01:41 |
| '''sequence record object'''.സൃഷ്ടിക്കുന്നതിനാണ് ആദ്യത്തെ ഘട്ടം' '. | | '''sequence record object'''.സൃഷ്ടിക്കുന്നതിനാണ് ആദ്യത്തെ ഘട്ടം' '. | ||
| Line 93: | Line 93: | ||
|- | |- | ||
| − | | 01: 49 | + | | 01:49 |
| '''sequence input/output interface'''.എന്ന അടിസ്ഥാന ഡേറ്റാ ടൈപ്പ് ആണ് ഇത്. | | '''sequence input/output interface'''.എന്ന അടിസ്ഥാന ഡേറ്റാ ടൈപ്പ് ആണ് ഇത്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 01: 55 | + | | 01:55 |
| സീക്വൻസസ് റെക്കോഡ് ഒബ്ജക്റ്റിൽ, ഐഡന്റിഫയർ '', ഡിസ്ക്രിപ്ഷൻസ് .എന്നീ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള സവിശേഷതകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. | | സീക്വൻസസ് റെക്കോഡ് ഒബ്ജക്റ്റിൽ, ഐഡന്റിഫയർ '', ഡിസ്ക്രിപ്ഷൻസ് .എന്നീ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള സവിശേഷതകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 02: 04 | + | | 02:04 |
| '' 'Ctrl, Alt' '', '' 't' '' കീകളിലൊന്ന് അമർത്തി ടെർമിനൽ തുറക്കുക. | | '' 'Ctrl, Alt' '', '' 't' '' കീകളിലൊന്ന് അമർത്തി ടെർമിനൽ തുറക്കുക. | ||
|- | |- | ||
| 02:10 | | 02:10 | ||
| − | | പ്രോംപ്റ്റിൽ, ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: '' 'ipython' '' '' 'Enter' '' അമർത്തുക. | + | | പ്രോംപ്റ്റിൽ, ടൈപ്പ് ചെയ്യുക:'' 'ipython' '' '' 'Enter' '' അമർത്തുക. |
|- | |- | ||
| − | | 02: 15 | + | | 02:15 |
| പ്രോംപ്റ്റില്, താഴെ പറയുന്ന വരികള് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: | | പ്രോംപ്റ്റില്, താഴെ പറയുന്ന വരികള് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: | ||
| Line 124: | Line 124: | ||
| അടുത്തതു , '''from Bio dot Alphabet module import generic protein class'''. | | അടുത്തതു , '''from Bio dot Alphabet module import generic protein class'''. | ||
|- | |- | ||
| − | | 02: 38 | + | | 02:38 |
| അടുത്തതായി, റിക്കോർഡ് 1 എന്ന വേരിയബിളിൽ സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് ഞാൻ സംരക്ഷിക്കും. | | അടുത്തതായി, റിക്കോർഡ് 1 എന്ന വേരിയബിളിൽ സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് ഞാൻ സംരക്ഷിക്കും. | ||
|- | |- | ||
| − | | 02: 45 | + | | 02:45 |
| '''sequence, id''' '''description''' എന്നിവ ടെക്സ്റ്റ് ഫയൽ ൽ നിന്ന് ടെർമിനലിൽ പേസ്റ്റ് ചെയുക | | '''sequence, id''' '''description''' എന്നിവ ടെക്സ്റ്റ് ഫയൽ ൽ നിന്ന് ടെർമിനലിൽ പേസ്റ്റ് ചെയുക | ||
|- | |- | ||
| − | | 02: 56 | + | | 02:56 |
| അമർത്തുക '' 'Enter.' '' | | അമർത്തുക '' 'Enter.' '' | ||
|- | |- | ||
| 02:58 | | 02:58 | ||
| − | | ഔട്ട്പുട്ട് കാണുന്നതിന്: '' 'record1' '' എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | + | | ഔട്ട്പുട്ട് കാണുന്നതിന്:'' 'record1' '' എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
|- | |- | ||
| − | | 03: 02 | + | | 03:02 |
| അമർത്തുക '' 'Enter.' '' | | അമർത്തുക '' 'Enter.' '' | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 04 | + | | 03:04 |
| '''insulin protein''' സീക്വൻസ്''''sequence record '''ഒബ്ജക്ട് കാണിക്കുന്നു. | | '''insulin protein''' സീക്വൻസ്''''sequence record '''ഒബ്ജക്ട് കാണിക്കുന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 10 | + | | 03:10 |
| '''id''' '''description'''.എന്നിവയുമായുള്ള സീക്വൻസ് കാണിക്കുന്നു. | | '''id''' '''description'''.എന്നിവയുമായുള്ള സീക്വൻസ് കാണിക്കുന്നു. | ||
| Line 156: | Line 156: | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 21 | + | | 03:21 |
| ''Bio package.'''ൽ നിന്നും'''Import SeqIO module''' | | ''Bio package.'''ൽ നിന്നും'''Import SeqIO module''' | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 26 | + | | 03:26 |
| അടുത്തതായി, കമാസ്ഡ് ലൈന്' ഒരു'''write''' എന്ന ഫംഗ്ഷന് ഉപയോഗിച്ച് '' 'FASTA' '' ഫയലിലേക്ക് പ്രദര്ശിപ്പിക്കുക. | | അടുത്തതായി, കമാസ്ഡ് ലൈന്' ഒരു'''write''' എന്ന ഫംഗ്ഷന് ഉപയോഗിച്ച് '' 'FASTA' '' ഫയലിലേക്ക് പ്രദര്ശിപ്പിക്കുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 40 | + | | 03:40 |
| '' 'Write' '' ഫംഗ്ഷൻ 3 '' 'ആർഗ്യുമെന്റ്' എടുക്കുന്നു | | '' 'Write' '' ഫംഗ്ഷൻ 3 '' 'ആർഗ്യുമെന്റ്' എടുക്കുന്നു | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 44 | + | | 03:44 |
| ആദ്യത്തേത് '''sequence record object'''.സൂക്ഷിക്കുന്ന വേരിയബിൾ ആണ്. | | ആദ്യത്തേത് '''sequence record object'''.സൂക്ഷിക്കുന്ന വേരിയബിൾ ആണ്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 49 | + | | 03:49 |
| രണ്ടാമത്തേത് '' 'FASTA' '' ഫയല് എഴുതാനുള്ള ഫയലിന്റെ പേരു്. | | രണ്ടാമത്തേത് '' 'FASTA' '' ഫയല് എഴുതാനുള്ള ഫയലിന്റെ പേരു്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: 54 | + | | 03:54 |
| മൂന്നാമത്തേത് എഴുതാനുള്ള ഫയൽ ഫോർമാറ്റാണ്. എന്റർ അമർത്തുക'''. | | മൂന്നാമത്തേത് എഴുതാനുള്ള ഫയൽ ഫോർമാറ്റാണ്. എന്റർ അമർത്തുക'''. | ||
|- | |- | ||
| 03:58 | | 03:58 | ||
| − | | ഔട്ട്പുട്ട് ഒന്ന് കാണിക്കുന്നു, അതായത്, ഒരു | + | | ഔട്ട്പുട്ട് ഒന്ന് കാണിക്കുന്നു, അതായത്, ഒരു sequence record object ഒരു '' 'FASTA' '' ഫയലിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്തു. |
|- | |- | ||
| − | | 04: 07 | + | | 04:07 |
| ഫയൽ '''FASTA''' ഫോർമാറ്റ്'ൽ ഹോം ഫോൾഡറിൽ "example.fasta" ആയി സേവ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. | | ഫയൽ '''FASTA''' ഫോർമാറ്റ്'ൽ ഹോം ഫോൾഡറിൽ "example.fasta" ആയി സേവ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 13 | + | | 04:13 |
| ഞാൻ നിങ്ങൾക്ക് മുന്നറിയിപ്പ് നൽകട്ടെ, ഔട്ട്പുട്ട് ഇതേ പേരിലുള്ള ഏത് മുൻപ് നിലവിലുണ്ടെന്നതും ഓവർ-റൈറ്റ് ചെയ്യും. | | ഞാൻ നിങ്ങൾക്ക് മുന്നറിയിപ്പ് നൽകട്ടെ, ഔട്ട്പുട്ട് ഇതേ പേരിലുള്ള ഏത് മുൻപ് നിലവിലുണ്ടെന്നതും ഓവർ-റൈറ്റ് ചെയ്യും. | ||
| Line 196: | Line 196: | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 24 | + | | 04:24 |
| '''text editor.'''ൽ ഈ ഫയൽ തുറക്കുക.' '' | | '''text editor.'''ൽ ഈ ഫയൽ തുറക്കുക.' '' | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 27 | + | | 04:27 |
| പ്രോട്ടീൻ ശ്രേണി ഇപ്പോൾ '' 'FASTA' '' ഫോർമാറ്റിലാണ്. | | പ്രോട്ടീൻ ശ്രേണി ഇപ്പോൾ '' 'FASTA' '' ഫോർമാറ്റിലാണ്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 31 | + | | 04:31 |
| ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. | | ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. | ||
| Line 212: | Line 212: | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 38 | + | | 04:38 |
| അതിനാൽ, ചിലപ്പോൾ ക്രമം ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾക്കിടയിൽ ഇന്റർ-കൺവർ ചെയ്യേണ്ട ആവശ്യമുണ്ട്. | | അതിനാൽ, ചിലപ്പോൾ ക്രമം ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾക്കിടയിൽ ഇന്റർ-കൺവർ ചെയ്യേണ്ട ആവശ്യമുണ്ട്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 44 | + | | 04:44 |
| '''SeqIO module.''' ലെ '' convert '''ഫങ്ക്ഷന് ഉപയോഗിച്ച് ഫയൽ കണ്വേര്ഷന് ചെയാം | | '''SeqIO module.''' ലെ '' convert '''ഫങ്ക്ഷന് ഉപയോഗിച്ച് ഫയൽ കണ്വേര്ഷന് ചെയാം | ||
| Line 224: | Line 224: | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 55 | + | | 04:55 |
| എന്റെ '''home'''ഫോൾഡറിൽ ഒരു '' 'Genbank' '' ഫയൽ ഉണ്ടോ? | | എന്റെ '''home'''ഫോൾഡറിൽ ഒരു '' 'Genbank' '' ഫയൽ ഉണ്ടോ? | ||
|- | |- | ||
| − | | 04: 59 | + | | 04:59 |
| ഞാൻ ഇത് ഒരു ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്ററിൽ തുറക്കാം. | | ഞാൻ ഇത് ഒരു ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്ററിൽ തുറക്കാം. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 02 | + | | 05:02 |
| '''HIV genome'''' '' '' 'GenBank' '' ഫോർമാറ്റിലുണ്ട്. | | '''HIV genome'''' '' '' 'GenBank' '' ഫോർമാറ്റിലുണ്ട്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 07 | + | | 05:07 |
| ഈ '' 'GenBank' '' ഫയലിൽ ആദ്യ ഭാഗത്ത് '''genome'''ലെ' '''genes''' ന്റെ വിവരണം ഉണ്ട്. | | ഈ '' 'GenBank' '' ഫയലിൽ ആദ്യ ഭാഗത്ത് '''genome'''ലെ' '''genes''' ന്റെ വിവരണം ഉണ്ട്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 14 | + | | 05:14 |
| തുടർന്ന് ഒരു പൂർണ്ണമായ '''genome''' സെക്യുഎൻസ് | | തുടർന്ന് ഒരു പൂർണ്ണമായ '''genome''' സെക്യുഎൻസ് | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 18 | + | | 05:18 |
| ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. ടെർമിനലിൽ ഈ വരികൾ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | | ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. ടെർമിനലിൽ ഈ വരികൾ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 23 | + | | 05:23 |
| '''convert''' ഫംഗ്ഷൻ '' 'GenBank' '' ഫയൽ '' 'FASTA' '' ഫയലിൽ നിലവിൽ വരുന്ന '''genome''' സീക്വൻസ് കന്വേര്റ്റ് ചെയ്യുന്നു. എന്റർ അമർത്തുക. | | '''convert''' ഫംഗ്ഷൻ '' 'GenBank' '' ഫയൽ '' 'FASTA' '' ഫയലിൽ നിലവിൽ വരുന്ന '''genome''' സീക്വൻസ് കന്വേര്റ്റ് ചെയ്യുന്നു. എന്റർ അമർത്തുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 33 | + | | 05:33 |
| '' 'FASTA' '' ഫോർമാറ്റിലുള്ള പുതിയ ഫയൽ ഇപ്പോൾ '''home''' ഫോൾഡറിൽ HIV.fasta '' 'ആയി സേവ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. | | '' 'FASTA' '' ഫോർമാറ്റിലുള്ള പുതിയ ഫയൽ ഇപ്പോൾ '''home''' ഫോൾഡറിൽ HIV.fasta '' 'ആയി സേവ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. | ||
| Line 259: | Line 259: | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 46 | + | | 05:46 |
| ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. | | ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 49 | + | | 05:49 |
| '' 'Convert' 'ഫങ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് നമുക്ക് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ എളുപ്പത്തിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യാമെങ്കിലും അതിന് പരിമിതികളുണ്ട്. | | '' 'Convert' 'ഫങ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് നമുക്ക് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ എളുപ്പത്തിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യാമെങ്കിലും അതിന് പരിമിതികളുണ്ട്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 05: 56 | + | | 05:56 |
| ചില ഫോർമാറ്റുകൾ എഴുതുന്നത് മറ്റ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകളിൽ അടങ്ങിയിട്ടില്ലാത്ത വിവരങ്ങൾ ആവശ്യമാണ്. | | ചില ഫോർമാറ്റുകൾ എഴുതുന്നത് മറ്റ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകളിൽ അടങ്ങിയിട്ടില്ലാത്ത വിവരങ്ങൾ ആവശ്യമാണ്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 02 | + | | 06:02 |
| − | | ഉദാഹരണത്തിന്: നമുക്ക് '' 'GenBank' '' ഫയൽ ഒരു '' 'FASTA' '' ഫയലായി പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ കഴിയും, ഞങ്ങൾക്ക് റിവേഴ്സ് ചെയ്യാൻ കഴിയില്ല. | + | | ഉദാഹരണത്തിന്:നമുക്ക് '' 'GenBank' '' ഫയൽ ഒരു '' 'FASTA' '' ഫയലായി പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ കഴിയും, ഞങ്ങൾക്ക് റിവേഴ്സ് ചെയ്യാൻ കഴിയില്ല. |
|- | |- | ||
| − | | 06: 09 | + | | 06:09 |
| അതുപോലെ തന്നെ FASTQ '' 'ഫയൽ ഒരു' '' FASTA '' 'ഫയലാക്കി മാറ്റാൻ കഴിയും, പക്ഷേ റിവേഴ്സ് ചെയ്യാൻ കഴിയില്ല. | | അതുപോലെ തന്നെ FASTQ '' 'ഫയൽ ഒരു' '' FASTA '' 'ഫയലാക്കി മാറ്റാൻ കഴിയും, പക്ഷേ റിവേഴ്സ് ചെയ്യാൻ കഴിയില്ല. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 15 | + | | 06:15 |
| '''convert''' ഫംഗ്ഷനെ സംബന്ധിച്ച കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, '' 'help' '' കമാൻഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | | '''convert''' ഫംഗ്ഷനെ സംബന്ധിച്ച കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, '' 'help' '' കമാൻഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 21 | + | | 06:21 |
| അമർത്തുക '' 'Enter' ''. | | അമർത്തുക '' 'Enter' ''. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 24 | + | | 06:24 |
| പ്രോംപ്റ്റിൽ ലഭ്യമാകുന്നതിനായി കീ ബോർഡിൽ 'q' അമർത്തുക. | | പ്രോംപ്റ്റിൽ ലഭ്യമാകുന്നതിനായി കീ ബോർഡിൽ 'q' അമർത്തുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 28 | + | | 06:28 |
| '' '' GenBank '' 'ഫോർമാറ്റിൽ'''HIV genome''' യില് നിന്നും ഇന്ടവിജെൽ '' 'ജീനുകള് നമുക്കും ലഭ്യമാക്കാം. | | '' '' GenBank '' 'ഫോർമാറ്റിൽ'''HIV genome''' യില് നിന്നും ഇന്ടവിജെൽ '' 'ജീനുകള് നമുക്കും ലഭ്യമാക്കാം. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 35 | + | | 06:35 |
| ഈ ഇന്ടവിജെൽ '' 'ജീനുകള് '' FASTA '' അല്ലെങ്കിൽ മറ്റേതെങ്കിലും ഫോർമാറ്റുകളിൽ സംരക്ഷിക്കാവുന്നതാണ്. | | ഈ ഇന്ടവിജെൽ '' 'ജീനുകള് '' FASTA '' അല്ലെങ്കിൽ മറ്റേതെങ്കിലും ഫോർമാറ്റുകളിൽ സംരക്ഷിക്കാവുന്നതാണ്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 41 | + | | 06:41 |
| ഇതിനായി, '' 'പ്രോംപ്റ്റിൽ' '' ഇനിപ്പറയുന്ന കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | | ഇതിനായി, '' 'പ്രോംപ്റ്റിൽ' '' ഇനിപ്പറയുന്ന കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 47 | + | | 06:47 |
| ഈ കോഡ് എല്ലാ സിഡ്പ്ട് '''CDS''' ജീനുകൾ, അവരുടെ ഐഡികളും ഒരു ഫയലിലെ '' 'ജീൻ' '' ഉം എഴുതുന്നു. | | ഈ കോഡ് എല്ലാ സിഡ്പ്ട് '''CDS''' ജീനുകൾ, അവരുടെ ഐഡികളും ഒരു ഫയലിലെ '' 'ജീൻ' '' ഉം എഴുതുന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 06: 56 | + | | 06:56 |
| ഫയൽ നിങ്ങളുടെ '' 'ഹോം' '' ഫോൾഡറിൽ "HIV_geneseq.fasta" ആയി സംരക്ഷിക്കുന്നു. എന്റർ അമർത്തുക'''. | | ഫയൽ നിങ്ങളുടെ '' 'ഹോം' '' ഫോൾഡറിൽ "HIV_geneseq.fasta" ആയി സംരക്ഷിക്കുന്നു. എന്റർ അമർത്തുക'''. | ||
| Line 315: | Line 315: | ||
|- | |- | ||
| − | | 07: 12 | + | | 07:12 |
| ആറ് റെക്കോർഡുകളുള്ള ഒരു FASTA ഫയൽ "hemoglobin.fasta" ഞാൻ തുറന്നു. | | ആറ് റെക്കോർഡുകളുള്ള ഒരു FASTA ഫയൽ "hemoglobin.fasta" ഞാൻ തുറന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 07: 19 | + | | 07:19 |
| − | | ഓരോ | + | | ഓരോ റെക്കോർഡ് വിവിധ ലെങ്ത് ഉള്ളതാണ് |
|- | |- | ||
| 07:23 | | 07:23 | ||
| Line 325: | Line 325: | ||
|- | |- | ||
| − | | 07: 27 | + | | 07:27 |
| ക്രമപ്പെടുത്തിയ സീക്വൻസുകളുള്ള പുതിയ ഫയൽ നിങ്ങളുടെ '' 'ഹോം' '' ഫോൾഡറിൽ "sorted_hemoglobin.fasta" ആയി സംഭരിക്കും | | ക്രമപ്പെടുത്തിയ സീക്വൻസുകളുള്ള പുതിയ ഫയൽ നിങ്ങളുടെ '' 'ഹോം' '' ഫോൾഡറിൽ "sorted_hemoglobin.fasta" ആയി സംഭരിക്കും | ||
|- | |- | ||
| − | | 07: 38 | + | | 07:38 |
| ചുരുക്കത്തിൽ ചുരുക്കത്തിൽ, '' 'records.sort' '' കമാൻഡ് ലൈനിൽ ആർഗ്യുമെന്റുകൾ റിവേഴ്സ് ചെയ്യുക. | | ചുരുക്കത്തിൽ ചുരുക്കത്തിൽ, '' 'records.sort' '' കമാൻഡ് ലൈനിൽ ആർഗ്യുമെന്റുകൾ റിവേഴ്സ് ചെയ്യുക. | ||
|- | |- | ||
| 07:45 | | 07:45 | ||
| − | | സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഞങ്ങൾ മനസ്സിലാക്കിയത്: * സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് സൃഷ്ടിക്കാൻ | + | | സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഞങ്ങൾ മനസ്സിലാക്കിയത്:* സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് സൃഷ്ടിക്കാൻ |
|- | |- | ||
| − | | 07: 51 | + | | 07:51 |
| '' 'sequence input /output ' മൊഡ്യൂൾ എന്ന ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് സീക്വൻസ് ഫയലുകൾ എഴുതുക. | | '' 'sequence input /output ' മൊഡ്യൂൾ എന്ന ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് സീക്വൻസ് ഫയലുകൾ എഴുതുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 07: 58 | + | | 07:58 |
| '' 'കൺവേർഷൻ' '' ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് '' 'സീക്വൻസ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിനുമിടയിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക. | | '' 'കൺവേർഷൻ' '' ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് '' 'സീക്വൻസ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിനുമിടയിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 08: 03 | + | | 08:03 |
| കൂടാതെ, ഒരു ഫയൽ ദൈർഘ്യത്തിൽ നീളം വെയ്ക്കുക. | | കൂടാതെ, ഒരു ഫയൽ ദൈർഘ്യത്തിൽ നീളം വെയ്ക്കുക. | ||
| Line 353: | Line 353: | ||
|- | |- | ||
| − | | 08: 09 | + | | 08:09 |
| − | | എച്ച്.ഐ.വി.യുടെ ജീനോമിക് ശ്രേണിയിൽ നിന്ന് 4587 മുതൽ 5165 വരെയുള്ള സ്ഥാനങ്ങൾ | + | | എച്ച്.ഐ.വി.യുടെ ജീനോമിക് ശ്രേണിയിൽ നിന്ന് "HIV1gp3" യുടെ 4587 മുതൽ 5165 വരെയുള്ള സ്ഥാനങ്ങൾ എക്സ്ട്രാക്റ്റ്" ചെയുക |
|- | |- | ||
| − | | 08: 21 | + | | 08:21 |
| "HIV.gb" എന്ന ഫയൽ ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിന്റെ കോഡ് ഫയലുകളിൽ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്. | | "HIV.gb" എന്ന ഫയൽ ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിന്റെ കോഡ് ഫയലുകളിൽ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്. | ||
|- | |- | ||
| − | | 08: 28 | + | | 08:28 |
| നിങ്ങളുടെ പൂർത്തിയാക്കിയ അസ്സൈൻഡിന് ഇനിപ്പറയുന്ന കോഡ് ഉണ്ടായിരിക്കും. | | നിങ്ങളുടെ പൂർത്തിയാക്കിയ അസ്സൈൻഡിന് ഇനിപ്പറയുന്ന കോഡ് ഉണ്ടായിരിക്കും. | ||
| Line 369: | Line 369: | ||
|- | |- | ||
| − | | 08: 48 | + | | 08:48 |
| ഇത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക. സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു. | | ഇത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക. സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു. | ||
|- | |- | ||
| − | | 08: 57 | + | | 08:57 |
| കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി ഞങ്ങൾക്ക് എഴുതുക. | | കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി ഞങ്ങൾക്ക് എഴുതുക. | ||
|- | |- | ||
| − | | 09: 00 | + | | 09:00 |
| − | | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ്, | + | | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ് NMEICT , MHRD ഗവർൺമെൻറ് ഓഫ് ഇന്ത്യ എന്നിവയുടെ പിന്തുണയോട് കൂടിനടത്തുന്നു |
|- | |- | ||
| − | | 09: 06 | + | | 09:06 |
| ഈ ദൗത്യത്തെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്. | | ഈ ദൗത്യത്തെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്. | ||
Revision as of 15:24, 19 January 2018
| Time | Narration
|
| 00:01 | ഹലോ എല്ലാവരും Writing Sequence Files.ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം. |
| 00:07 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും:Sequence Record Objectsഎങ്ങിനെ സൃഷ്ടിക്കാം? |
| 00:13 | സീക്വൻസുകളുടെ ഫയലുകൾ എഴുതുക |
| 00:15 | 'ഫയൽ ഫോർമാറ്റിനുമിടയിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക |
| 00:19 | കൂടാതെ, ഒരു ഫയലിൽ ലെങ്ത് അനുസരിച്ച record ക്രമീകരിക്കുക |
| 00:23 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, നിങ്ങൾ പരിചയത്തിലായിരിക്കണം |
| 00:27 | ബിരുദാനന്തര ബയോകെമിസ്ട്രി അല്ലെങ്കിൽ ബയോ ഇൻഫർമാറ്റിക്സ് |
| 00:31 | ബേസിക് പൈത്തൺ പ്രോഗ്രാമിങ്. |
| 00:34 | തന്നിരിക്കുന്ന ലിങ്ക് Python ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ കാണുക. |
| 00:38 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ രേഖപ്പെടുത്താൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു:* 'ഉബുണ്ടു ഓസ്' 'പതിപ്പ് 14.10 |
| 00:45 | Python പതിപ്പ് 2.7.8 |
| 00:48 | Ipython interpretor പതിപ്പ് 2.3.0 ഉംBiopython' പതിപ്പ് 1.64. |
| 00:55 | ഒരു ഫയലിന്റെ ഉള്ളടക്കം വായിക്കാൻ parse read function' |
| 01:03 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഒരു ഫയലിലേക്ക് സീക്വൻസുകൾ എഴുതാൻ write ഫങ്ഷൻ' 'എങ്ങനെ ഉപയോഗിക്കണമെന്ന് പഠിക്കും. |
| 01:09 | കൂടാതെ, വിവിധ 'ഫയൽ ഫോർമാറ്റ്' കൾ തമ്മിലുള്ള ഇന്റർ-കൺവേർഷൻ വേണ്ടിConvertഫങ്ഷൻ ഉപയോഗിക്കുക. |
| 01:16 | 'Write' ഫങ്ഷൻ എങ്ങനെയാണ് ഉപയോഗിക്കേണ്ടതെന്ന് ഇപ്പോൾ എനിക്ക് കാണിച്ചു തരാം. |
| 01:20 | പ്രോട്ടീൻസീക്വൻസ് ഉള്ള ഒരു ടെക്സ്റ്റ് ഫയൽ ഇവിടെയുണ്ട്. |
| 01:24 | ഇൻസുലിൻ പ്രോട്ടീൻ ഇവിടെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. |
| 01:28 | GI accession numberകൂടാതെ description.തുടങ്ങിയ വിവരങ്ങളും ഇതിനുണ്ട്. |
| 01:36 | 'FASTA' 'ഫോര്മാറ്റില് ഈ സീക്വന്സിനായി നമ്മള് ഒരു ഫയല് സൃഷ്ടിക്കും. |
| 01:41 | sequence record object.സൃഷ്ടിക്കുന്നതിനാണ് ആദ്യത്തെ ഘട്ടം' '. |
| 01:45 | സീക്വൻ റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് സംബന്ധിച്ച കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ: |
| 01:49 | sequence input/output interface.എന്ന അടിസ്ഥാന ഡേറ്റാ ടൈപ്പ് ആണ് ഇത്. |
| 01:55 | സീക്വൻസസ് റെക്കോഡ് ഒബ്ജക്റ്റിൽ, ഐഡന്റിഫയർ , ഡിസ്ക്രിപ്ഷൻസ് .എന്നീ ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള സവിശേഷതകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. |
| 02:04 | 'Ctrl, Alt' , 't' കീകളിലൊന്ന് അമർത്തി ടെർമിനൽ തുറക്കുക. |
| 02:10 | പ്രോംപ്റ്റിൽ, ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: 'ipython' 'Enter' അമർത്തുക. |
| 02:15 | പ്രോംപ്റ്റില്, താഴെ പറയുന്ന വരികള് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: |
| 02:18 | from Bio dot Seq module import Seq class. |
| 02:24 | from Bio dot SeqRecord module import Sequence Record class |
| 02:31 | അടുത്തതു , from Bio dot Alphabet module import generic protein class. |
| 02:38 | അടുത്തതായി, റിക്കോർഡ് 1 എന്ന വേരിയബിളിൽ സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് ഞാൻ സംരക്ഷിക്കും. |
| 02:45 | sequence, id description എന്നിവ ടെക്സ്റ്റ് ഫയൽ ൽ നിന്ന് ടെർമിനലിൽ പേസ്റ്റ് ചെയുക |
| 02:56 | അമർത്തുക 'Enter.' |
| 02:58 | ഔട്ട്പുട്ട് കാണുന്നതിന്: 'record1' എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
| 03:02 | അമർത്തുക 'Enter.' |
| 03:04 | insulin protein സീക്വൻസ്'sequence record ഒബ്ജക്ട് കാണിക്കുന്നു. |
| 03:10 | id description.എന്നിവയുമായുള്ള സീക്വൻസ് കാണിക്കുന്നു. |
| 03:13 | 'FASTA' എന്ന ഫയലിലേക്ക് മുകളിലുള്ള സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നതിന് 'write' ഫങ്ഷൻ ഉപയോഗിക്കും. |
| 03:21 | Bio package.'ൽ നിന്നുംImport SeqIO module |
| 03:26 | അടുത്തതായി, കമാസ്ഡ് ലൈന്' ഒരുwrite എന്ന ഫംഗ്ഷന് ഉപയോഗിച്ച് 'FASTA' ഫയലിലേക്ക് പ്രദര്ശിപ്പിക്കുക. |
| 03:40 | 'Write' ഫംഗ്ഷൻ 3 'ആർഗ്യുമെന്റ്' എടുക്കുന്നു |
| 03:44 | ആദ്യത്തേത് sequence record object.സൂക്ഷിക്കുന്ന വേരിയബിൾ ആണ്. |
| 03:49 | രണ്ടാമത്തേത് 'FASTA' ഫയല് എഴുതാനുള്ള ഫയലിന്റെ പേരു്. |
| 03:54 | മൂന്നാമത്തേത് എഴുതാനുള്ള ഫയൽ ഫോർമാറ്റാണ്. എന്റർ അമർത്തുക. |
| 03:58 | ഔട്ട്പുട്ട് ഒന്ന് കാണിക്കുന്നു, അതായത്, ഒരു sequence record object ഒരു 'FASTA' ഫയലിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്തു. |
| 04:07 | ഫയൽ FASTA ഫോർമാറ്റ്'ൽ ഹോം ഫോൾഡറിൽ "example.fasta" ആയി സേവ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. |
| 04:13 | ഞാൻ നിങ്ങൾക്ക് മുന്നറിയിപ്പ് നൽകട്ടെ, ഔട്ട്പുട്ട് ഇതേ പേരിലുള്ള ഏത് മുൻപ് നിലവിലുണ്ടെന്നതും ഓവർ-റൈറ്റ് ചെയ്യും. |
| 04:18 | ഫയൽ കാണുന്നതിന്, home ഫോൾഡറിൽ ഫയൽ നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക. |
| 04:24 | text editor.ൽ ഈ ഫയൽ തുറക്കുക.' |
| 04:27 | പ്രോട്ടീൻ ശ്രേണി ഇപ്പോൾ 'FASTA' ഫോർമാറ്റിലാണ്. |
| 04:31 | ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. |
| 04:33 | പലതരം bioinformatics ടൂളുകൾ വിവിധ ഇൻപുട്ട് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ എടുക്കുന്നു. |
| 04:38 | അതിനാൽ, ചിലപ്പോൾ ക്രമം ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾക്കിടയിൽ ഇന്റർ-കൺവർ ചെയ്യേണ്ട ആവശ്യമുണ്ട്. |
| 04:44 | SeqIO module.' ലെ convert ഫങ്ക്ഷന് ഉപയോഗിച്ച് ഫയൽ കണ്വേര്ഷന് ചെയാം |
| 04:50 | പ്രകടനത്തിനായി, ഒരു 'GenBank' ഫയൽ ഒരു 'FASTA' ഫയലാക്കി മാറ്റും. |
| 04:55 | എന്റെ homeഫോൾഡറിൽ ഒരു 'Genbank' ഫയൽ ഉണ്ടോ? |
| 04:59 | ഞാൻ ഇത് ഒരു ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്ററിൽ തുറക്കാം. |
| 05:02 | HIV genome' 'GenBank' ഫോർമാറ്റിലുണ്ട്. |
| 05:07 | ഈ 'GenBank' ഫയലിൽ ആദ്യ ഭാഗത്ത് genomeലെ' genes ന്റെ വിവരണം ഉണ്ട്. |
| 05:14 | തുടർന്ന് ഒരു പൂർണ്ണമായ genome സെക്യുഎൻസ് |
| 05:18 | ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. ടെർമിനലിൽ ഈ വരികൾ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
| 05:23 | convert ഫംഗ്ഷൻ 'GenBank' ഫയൽ 'FASTA' ഫയലിൽ നിലവിൽ വരുന്ന genome സീക്വൻസ് കന്വേര്റ്റ് ചെയ്യുന്നു. എന്റർ അമർത്തുക. |
| 05:33 | 'FASTA' ഫോർമാറ്റിലുള്ള പുതിയ ഫയൽ ഇപ്പോൾ home ഫോൾഡറിൽ HIV.fasta 'ആയി സേവ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. |
| 05:39 | ഫയലിൽ നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക, ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്ററിൽ തുറക്കുക. |
| 05:46 | ടെക്സ്റ്റ് എഡിറ്റർ അടയ്ക്കുക. |
| 05:49 | 'Convert' 'ഫങ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് നമുക്ക് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ എളുപ്പത്തിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യാമെങ്കിലും അതിന് പരിമിതികളുണ്ട്. |
| 05:56 | ചില ഫോർമാറ്റുകൾ എഴുതുന്നത് മറ്റ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകളിൽ അടങ്ങിയിട്ടില്ലാത്ത വിവരങ്ങൾ ആവശ്യമാണ്. |
| 06:02 | ഉദാഹരണത്തിന്:നമുക്ക് 'GenBank' ഫയൽ ഒരു 'FASTA' ഫയലായി പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ കഴിയും, ഞങ്ങൾക്ക് റിവേഴ്സ് ചെയ്യാൻ കഴിയില്ല. |
| 06:09 | അതുപോലെ തന്നെ FASTQ 'ഫയൽ ഒരു' FASTA 'ഫയലാക്കി മാറ്റാൻ കഴിയും, പക്ഷേ റിവേഴ്സ് ചെയ്യാൻ കഴിയില്ല. |
| 06:15 | convert ഫംഗ്ഷനെ സംബന്ധിച്ച കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, 'help' കമാൻഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
| 06:21 | അമർത്തുക 'Enter' . |
| 06:24 | പ്രോംപ്റ്റിൽ ലഭ്യമാകുന്നതിനായി കീ ബോർഡിൽ 'q' അമർത്തുക. |
| 06:28 | GenBank 'ഫോർമാറ്റിൽHIV genome യില് നിന്നും ഇന്ടവിജെൽ 'ജീനുകള് നമുക്കും ലഭ്യമാക്കാം. |
| 06:35 | ഈ ഇന്ടവിജെൽ 'ജീനുകള് FASTA അല്ലെങ്കിൽ മറ്റേതെങ്കിലും ഫോർമാറ്റുകളിൽ സംരക്ഷിക്കാവുന്നതാണ്. |
| 06:41 | ഇതിനായി, 'പ്രോംപ്റ്റിൽ' ഇനിപ്പറയുന്ന കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
| 06:47 | ഈ കോഡ് എല്ലാ സിഡ്പ്ട് CDS ജീനുകൾ, അവരുടെ ഐഡികളും ഒരു ഫയലിലെ 'ജീൻ' ഉം എഴുതുന്നു. |
| 06:56 | ഫയൽ നിങ്ങളുടെ 'ഹോം' ഫോൾഡറിൽ "HIV_geneseq.fasta" ആയി സംരക്ഷിക്കുന്നു. എന്റർ അമർത്തുക. |
| 07:07 | Biopythonടൂളുകൾ ഉപയോഗിച്ചു നമുക്ക് ഒരു ഫയൽ റെക്കോർഡുകൾ നീളം കൊണ്ട് അടുക്കാൻ കഴിയും. |
| 07:12 | ആറ് റെക്കോർഡുകളുള്ള ഒരു FASTA ഫയൽ "hemoglobin.fasta" ഞാൻ തുറന്നു. |
| 07:19 | ഓരോ റെക്കോർഡ് വിവിധ ലെങ്ത് ഉള്ളതാണ് |
| 07:23 | ഏറ്റവും ദൈർഘ്യമേറിയ റെക്കോർഡ് ആദ്യം ക്രമീകരിക്കാൻ ഇനിപ്പറയുന്ന വരികൾ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
| 07:27 | ക്രമപ്പെടുത്തിയ സീക്വൻസുകളുള്ള പുതിയ ഫയൽ നിങ്ങളുടെ 'ഹോം' ഫോൾഡറിൽ "sorted_hemoglobin.fasta" ആയി സംഭരിക്കും |
| 07:38 | ചുരുക്കത്തിൽ ചുരുക്കത്തിൽ, 'records.sort' കമാൻഡ് ലൈനിൽ ആർഗ്യുമെന്റുകൾ റിവേഴ്സ് ചെയ്യുക. |
| 07:45 | സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഞങ്ങൾ മനസ്സിലാക്കിയത്:* സീക്വൻസി റിക്കോർഡ് ഒബ്ജക്റ്റ് സൃഷ്ടിക്കാൻ |
| 07:51 | 'sequence input /output ' മൊഡ്യൂൾ എന്ന ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് സീക്വൻസ് ഫയലുകൾ എഴുതുക. |
| 07:58 | 'കൺവേർഷൻ' ഫംഗ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് 'സീക്വൻസ് ഫയൽ ഫോർമാറ്റിനുമിടയിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക. |
| 08:03 | കൂടാതെ, ഒരു ഫയൽ ദൈർഘ്യത്തിൽ നീളം വെയ്ക്കുക. |
| 08:07 | അസൈൻമെന്റിനായി: |
| 08:09 | എച്ച്.ഐ.വി.യുടെ ജീനോമിക് ശ്രേണിയിൽ നിന്ന് "HIV1gp3" യുടെ 4587 മുതൽ 5165 വരെയുള്ള സ്ഥാനങ്ങൾ എക്സ്ട്രാക്റ്റ്" ചെയുക |
| 08:21 | "HIV.gb" എന്ന ഫയൽ ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിന്റെ കോഡ് ഫയലുകളിൽ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്. |
| 08:28 | നിങ്ങളുടെ പൂർത്തിയാക്കിയ അസ്സൈൻഡിന് ഇനിപ്പറയുന്ന കോഡ് ഉണ്ടായിരിക്കും. |
| 08:43 | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ താഴെയുള്ള ലിങ്കിലുളള വീഡിയോ സംഗ്രഹിക്കുന്നു. |
| 08:48 | ഇത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക. സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു. |
| 08:57 | കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി ഞങ്ങൾക്ക് എഴുതുക. |
| 09:00 | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ് NMEICT , MHRD ഗവർൺമെൻറ് ഓഫ് ഇന്ത്യ എന്നിവയുടെ പിന്തുണയോട് കൂടിനടത്തുന്നു |
| 09:06 | ഈ ദൗത്യത്തെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ കാണിച്ചിരിക്കുന്ന ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്. |
| 09:10 | ഇത് 'ഐഐടി ബോംബെ'യിൽ നിന്ന് വിജി നായർ ആണ്. പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി. |
