Biopython/C2/Introduction-to-Biopython/Assamese

Time	Narration
00:01	Introduction to Biopython এৰ টিউটোৰিয়েলত আপোনাক স্বাগতমম।
00:05	ইয়াতে মই শিকিম, Biopython এৰ গুৰুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য সম্পর্কে,
00:10	লিনাক্স অপাৰেটিং সিস্টেমত ডাউনলোড আৰু সংস্থাপনৰ তথ্য
00:15	আৰু Biopython টুলস ব্যবহাৰ কৰি প্ৰোটিন ক্ৰমত DNA ক্ৰমৰ ট্রান্সলেশন।
00:22	টিউটোৰিয়েলটো অনুসৰণ কৰিবলৈ নিম্ন সম্পর্কে জানিব লাগিব-
00:25	অস্নাতকৰ বায়োকেমিস্ট্ৰি বা বায়োইনফৰমেটিক্স।
00:29	আৰু মৌলিক Python প্ৰোগ্ৰামিং।
00:31	প্ৰদত্ত লিঙ্কত Python টিউটোৰিয়েল চাওক।
00:35	টিউটোৰিয়েলটো ৰেকর্ড কৰিবলৈ ব্যবহাৰ কৰিছো: উবুন্টু OS সংস্কৰণ 12.04
00:41	Python সংস্কৰণ 2.7.3
00:44	Ipython সংস্কৰণ 0.12.1 আৰু
00:48	Biopython সংস্কৰণ 1.58.
00:51	Biopython হৈছে কম্পিউটেশনেল বায়োলজিৰ বাবে মডিউলৰ সংগ্ৰহ।
00:57	এইটোৱে বায়োইনফৰম্যাটিক্সৰ বাবে প্ৰয়োজনীয় সবতচে মৌলিক কামবোৰ কৰিবলৈ পাৰে।
01:03	Biopython টুল্স নিম্ন কামত ব্যবহৃত হয়:
01:05	Parsing অর্থাৎ বিভিন্ন ফাইল ফৰম্যাট যেনে FASTA, Genbank ইত্যাদি পৰা তথ্য এক্সট্র্যাক্ট কৰা।
01:14	ডাটাবেস ওয়েবসাইট যেনে NCBI, ExPASY ইত্যাদি পৰা তথ্য ডাউনলোড কৰা।
01:22	বায়োইন ফৰম্যাটিক এলগৰিদম যেনে BLAST ৰান কৰা।
01:26	ইয়াত সাধাৰণ অপাৰেশনবোৰ ক্ৰমত কৰাৰ টুল্স আছে।
01:31	উদাহৰণস্বৰুপে - কমপ্লিমেন্টস, ট্রান্সক্ৰিপশন, ট্রান্সলেশন ইত্যাদি পাবলৈ।
01:38	এলাইনমেন্টৰ সৈতে ডিলিং কৰিবলৈ কোড।
01:40	আৰু কামবোৰ বেলেগ বেলেগ প্ৰক্ৰিয়াত ভাগ কৰাৰ কোড।
01:46	ডাউনলোড সম্পর্কিত তথ্য:
01:48	Biopython প্যাকেজ, Python বিতৰণৰ অংশ নহয়; এইটোক বেলেগভাবে ডাউনলোড কৰা প্ৰয়োজন।
01:54	বিস্তাৰিত তথ্যৰ বাবে নিম্নলিখিত লিঙ্কত যাওক।
01:59	Linux সিস্টেমত সংস্থাপনৰ বাবে:
02:02	Synaptic Package Manager দ্বাৰা Python, Ipython আৰু Biopython সংস্থাপন কৰক।
02:08	পূর্বে দৰকাৰী সফ্টওয়্যাৰ নিজেই সংস্থাপিত হব।
02:13	গ্রাফিক আউটপুট আৰু প্লটৰ বাবে অতিৰিক্ত প্যাকেজ সংস্থাপন কৰা আবশ্যক।
02:18	Ctrl, Alt আৰু T কী একসৈতে টিপি টার্মিনেল খুলক।
02:24	মই সিস্টেমত Python, Ipython আৰু Biopython আগেই সংস্থাপিত কৰিছো।
02:30	Ipython ইন্টাৰপ্ৰেটাৰ আৰম্ভ কৰিবলৈ লিখক ipython আৰু এন্টাৰ টিপক।
02:35	স্ক্ৰীনত IPython প্ৰম্পট দেখায়।
02:38	Biopython এৰ সংস্থাপন ছেক কৰিবলৈ প্ৰম্পটত লিখক: import Bio, এন্টাৰ টিপক।
02:48	আপোনি কোনো এৰৰ ম্যাসেজ নাপালে তাৰ মানে Biopython সংস্থাপিত হৈ গৈছে।
02:54	মই মনত কৰাই দিয়ো, Python ল্যাঙ্গুয়েজ কেস সেন্সিটিভ হয়।
02:59	কীওয়ার্ড, ভ্যাৰিয়েবল বা ফাংশন লেখাৰ সময়ত সতর্ক থাকিব।
03:04	উদাহৰণস্বৰুপে, উপৰোক্ত লাইনত import তাৰ i সৰু হাতৰ অাখৰত আৰু Bio তাৰ B ডাঙৰ হাতৰ অাখৰত আছে।
03:12	ইয়াতে মই DNA ক্ৰমক ট্রান্সলেশন কৰিবলৈ Biopython মডিউল ব্যবহাৰ কৰিম।
03:19	ইয়াতে নিম্ন ধাপবোৰ জড়িত থাকে।
03:22	প্ৰথমে, কোডিং DNA strand এৰ বাবে sequence object বনাও।
03:27	ইয়াৰ পিছত কোডিং DNA স্ট্রান্ডক mRNA লৈ  ট্রান্সক্ৰিপশন কৰা।
03:32	শেষত, mRNA ইয়াক প্ৰোটিন ক্ৰমত ট্রান্সলেশন।
03:37	উদাহৰণস্বৰুপে মই এই স্লাইডত দেখোৱা কোডিং DNA স্ট্র্যান্ড ব্যবহাৰ কৰিম।
03:42	এইটোৱে সৰু প্ৰোটিন ক্ৰমৰ বাবে কোড বনায়।
03:46	প্ৰথমে উপৰোক্ত কোডিং DNA স্ট্র্যান্ডৰ বাবে এটা sequence object বনাব লাগিব।
03:52	টার্মিনেলত উভতি আহক।
03:55	এটা sequence object বনাবলৈ, Bio প্যাকেজৰ পৰা Seq মডিউল ইম্পোর্ট কৰক।
04:02	Seq মডিউলে sequence objectক সংৰক্ষণ আৰু প্ৰক্ৰিয়াৰ পদ্ধতি দিয়ে।
04:08	প্ৰম্পটত লিখক: from Bio dot Seq import Seq আৰু Enter টিপক।
04:17	ইয়াৰ পিছত, sequence object বনোৱাৰ সময়ত অাখৰবোৰ স্ট্র্যান্ডত স্পষ্টৰুপে উল্লেখ কৰক
04:24	অর্থাৎ উল্লিখিত কৰিব লাগিব যে, অাখৰৰ ক্ৰম নিউক্লিয়টাইড বা এমিনো এসিডৰ বাবে কোড কৰে কি নকৰে।
04:32	এইটো কৰিবলৈ, Alphabet প্যাকেজৰ পৰা IUPAC মডিউল ব্যবহাৰ কৰিম।
04:38	প্ৰম্পটত লিখক: from Bio dot Alphabet import IUPAC, এন্টাৰ টিপক।
04:48	মই Seq আৰু IUPAC মডিউল লোড কৰিবলৈ import আৰু from স্টেটমেন্ট ব্যবহাৰ কৰিছো।
04:56	sequence object ক cdna নামৰ ভ্যাৰিয়েবলত সংৰক্ষণ কৰক।
05:01	সাধাৰণ স্ট্ৰি্ং এৰ মতে প্ৰম্পটত লিখক: cdna equal to Seq.
05:08	ক্ৰমক ডাবল উদ্ধৃতি আৰু বন্ধনীত ৰাখক।
05:13	আমি আমাৰ DNA ফ্ৰাগমেন্টৰ ক্ৰম জানো। সেয়ে আর্গুমেন্ট হিসাবে unambiguous DNA এলফাবেট অবজেক্ট লিখক।
05:21	আউটপুটৰ বাবে লিখক: cdna এন্টাৰ টিপক।
05:26	আউটপুটতো sequence object এৰ মতে DNA sequence দেখায়।
05:30	এতিয়া কোডিং DNA স্ট্র্যান্ডক সম্পর্কিত mRNA ইয়াত ট্রান্সক্ৰাইব কৰো।
05:35	মই Seq মডিউলৰ বিল্ট-ইন transcribe পদ্ধতি ব্যবহাৰ কৰিম।
05:39	নিম্নলিখিত কোড লিখক।
05:41	আউটপুটক ভ্যাৰিয়েবল mrna ত সংৰক্ষণ কৰক।
05:45	প্ৰম্পটত লিখক: mrna equal to cdna dot transcribe বন্ধনী খুলক আৰু বন্ধ কৰক, এন্টাৰ টিপক।
05:55	আউটপুটৰ বাবে লিখক: mrna এন্টাৰ টিপক।
06:01	আউটপুট চাওক। transcribe মেথডে DNA ক্ৰমত Thiamin ক Uracil দ্বাৰা সলায়।
06:09	ইয়াৰ পিছত এই mRNAক সংশ্লিষ্ট প্ৰোটিন ক্ৰমত ট্রান্সলেশন কৰিবলৈ, translate মেথড ব্যবহাৰ কৰক।
06:16	নিম্ন কোড লিখক: protein equal to mrna dot translate বন্ধনী খুলক আৰু বন্ধ কৰক। এন্টাৰ টিপক।
06:27	উল্লিখিত নহলে, translate মেথডে স্ট্যান্ডার্ড জেনেটিক কোড ব্যবহাৰ কৰি RNA বা DNA ক্ৰমক ট্রান্সলেট কৰে।
06:36	আউটপুটত এটা এমাইনো এসিড ক্ৰম দেখায়।
06:40	আউটপুটে ট্রান্সলেট কৰা ক্ৰমত stop codons এৰ উপস্থিতি সংক্ৰান্তৰ তথ্যও দেখায়।
06:47	প্ৰোটিন ক্ৰমৰ শেষত এস্টেৰিস্ক চাওক। এইটোৱে stop codon নির্দেশ কৰে.
06:53	উপৰৰ কোডত transcription এৰ বাবে কোডিং DNA স্ট্র্যান্ড ব্যবহাৰ কৰিছো।
06:59	Biopythonত, transcribe মেথডে কেবল কোডিং DNA স্ট্র্যান্ডত কাম কৰে।
07:04	যদিও, বাস্তবিক বায়োলজিক্যেল সিস্টেমত, ট্রান্সক্ৰিপশন প্ৰক্ৰিয়া টেমপ্লেট স্ট্র্যান্ড সহ আৰম্ভ হয়।
07:11	টেমপ্লেট স্ট্রান্ড দি আৰম্ভ কৰিলে, টার্মিনেলত দেখোৱা দৰে reverse complement মেথড ব্যবহাৰ কৰি এইটোক কোডিং স্ট্র্যান্ডত সলাওক।
07:20	কোডিং স্ট্র্যান্ডৰ বাবে উপৰৰ বাকি কোডবোৰ অনুসৰণ কৰক।
07:24	Biopython ত মেথড ব্যবহাৰ কৰি DNA ক্ৰমক প্ৰোটিন ক্ৰমত ট্রান্সলেট কৰিছো।
07:31	এই কোড দ্বাৰা যি কোনো আকাৰৰ DNA ক্ৰম প্ৰোটিন ক্ৰমত ট্রান্সলেট কৰা যাব পাৰে।
07:37	সংক্ষেপে, ইয়াতে মই শিকিছো :
07:41	Biopython এৰ গুৰুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য।
07:43	Linux OS ত ডাউনলোড আৰু সংস্থাপনৰ তথ্য।
07:48	দিয়া DNA স্ট্র্যান্ডৰ বাবে sequence object বনোৱা।
07:52	DNA ক্ৰমক mRNA ত Transcription কৰা
07:56	mRNA ইয়াক প্ৰোটিন ক্ৰমত Translation কৰা
08:00	এতিয়া, অনুশীলনী-
08:02	দিয়া DNA ক্ৰমক প্ৰোটিন ক্ৰমলৈ ট্রান্সলেট কৰক।
08:06	আউটপুট চাওক।
08:08	প্ৰোটিন ক্ৰমত অভ্যন্তৰীণ stop codon আছে।
08:11	stop codon ফ্ৰেমত DNA প্ৰথম পর্যন্ত ট্রান্সলেট কৰক।
08:17	আপোনাৰ সম্পন্ন কামটোৰ নিম্ন কোড থকা উচিত।
08:20	মই translate() মেথডত to underscore stop আর্গুমেন্ট ব্যবহাৰ কৰিছো। আউটপুট লক্ষ্য কৰক।
08:27	stop codon নিজেই ট্রান্সলেট কৰা হোৱা নাই
08:31	stop চিহ্ন আপোনাৰ প্ৰোটিন ক্ৰমৰ শেষত অন্তর্ভুক্ত কৰা হোৱা নাই।
08:36	এই ভিডিওটোৱে প্ৰকল্পক সাৰসংক্ষেপে বোঝায়।
08:39	আপোনাৰ উচৰত ভাল ব্যান্ডউইডথ নাথাকিলে এইটোক ডাউনলোড কৰি চাওক।
08:43	স্পোকেন টিউটোৰিয়েল প্ৰকল্প দলে কর্মশালা আয়োজন কৰে আৰু অনলাইন পৰীক্ষা পাস কৰিলে প্ৰশংসাপত্ৰ দিয়ে।
08:50	অধিক জানিবলৈ আমাক যোগাযোগ কৰক।
08:53	স্পোকেন টিউটোৰিয়েল প্ৰকল্প ভাৰত সৰকাৰৰ NMEICT, MHRD দ্বাৰা সমর্থিত।
08:59	এই বিষয়ত বিস্তাৰিত তথ্য এই লিঙ্কত প্ৰাপ্তিসাধ্য।
09:03	আইআইটি বোম্বেৰ পৰা মই বিদায় লৈছো। অংশগ্ৰহণৰ বাবে ধন্যবাদ।

Contributors and Content Editors

Mousumi