Jmol-Application/C3/Structures-from-Database/Oriya
From Script | Spoken-Tutorial
Time | Narration |
00:01 | ବନ୍ଧୁଗଣ, Jmol ରେ Structures from Database ଉପରେ ଥିବା ସ୍ପୋକନ୍ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲକୁ ସ୍ଵାଗତ |
00:07 | ଏହି ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲରେ, ଆମେ ଶିଖିବା: |
00:10 | PubChem ଡେଟାବେସରୁ କେମିକାଲ୍ ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ Load କରିବା ଏବଂ |
00:14 | GchemPaintରେ ଅଙ୍କିତ ହୋଇଥିବା 2D structureଗୁଡିକୁ Jmolରେ 3D modelକୁ ରୂପାନ୍ତର କରିବା |
00:21 | ଏହି ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲକୁ ଅନୁସରଣ କରିବା ପାଇଁ ଆପଣ Jmol Application ସହିତ ପରିଚିତ ଥିବା ଆବଶ୍ୟକ |
00:27 | ଯଦି ନୁହେଁ ତେବେ ଆମ ୱେବସାଇଟରେ ଉପଲବ୍ଧ ଥିବା ସମ୍ପର୍କୀତ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲଗୁଡିକୁ ଦେଖନ୍ତୁ |
00:33 | ଏହି ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲ୍ ରେକର୍ଡ କରିବା ପାଇଁ ମୁଁ ବ୍ୟବହାର କରୁଛି: |
00:35 | Ubuntu ଅପରେଟିଙ୍ଗ ସିଷ୍ଟମ୍ ଭର୍ସନ୍ 12.04 |
00:40 | Jmol ଭର୍ସନ୍ 12.2.2 ଏବଂ |
00:44 | Java ଭର୍ସନ୍ 7 |
00:46 | GchemPaint ଭର୍ସନ୍ 0.12.10 |
00:51 | Mozilla Firefox ବ୍ରାଉଜର୍ 22.0 |
00:56 | ମୁଁ ଗୋଟିଏ ନୁତନ Jmol Application ୱିଣ୍ଡୋକୁ ଖୋଲିସାରିଛି |
01:00 | ଡେଟାବେସରେ ତାଲିକାଭୁକ୍ତ ଥିବା କମ୍ପାଉଣ୍ଡଗୁଡିକର ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ load କରିବା ପାଇଁ Jmolର ଗୋଟିଏ ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟ ଅଛି |
01:07 | ମେନୁ ବାରରେ ଥିବା File ମେନୁରେ Get MOL ନାମକ ଗୋଟିଏ ବିକଳ୍ପ ଅଛି |
01:12 | ଏହା କେମିକାଲ୍ ଷ୍ଟ୍ରକଚର୍ ଡେଟାବେସ୍, PubChem ରୁ ପରମାଣୁଗୁଡିକୁ ଲୋଡ୍ କରିଥାଏ |
01:17 | Protein Data Bankରୁ protein ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ ଲୋଡ୍ କରିବା ପାଇଁ Get PDB ନାମକ ଅନ୍ୟ ଏକ ବିକଳ୍ପ ମଧ୍ୟ ଅଛି |
01:26 | ଅନ୍ୟ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲରେ ଏହି ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟତାକୁ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଭାବେ ବର୍ଣ୍ଣନା କରାଯିବ |
01:31 | ପ୍ୟାନେଲ୍ ଉପରେ ଗୋଟିଏ କେମିକାଲ୍ ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ load କରିବା ପାଇଁ Get Mol ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
01:36 | screen ଉପରେ ଗୋଟିଏ Input ଡାଇଲଗ୍ ବକ୍ସ ଖୋଲିଯିବ |
01:40 | ଡେଟାବେସରେ ତାଲିକାଭୁକ୍ତ ଥିବା ଯେକୌଣସି ପରମାଣୁକୁ ଟେକ୍ସଟ ବକ୍ସରେ ନିମ୍ନଲିଖିତ ଟାଇପ୍ କରି ଲୋଡ୍ କରାଯାଇପାରିବ: |
01:48 | ସାଧାରଣ ନାମ କିମ୍ବା IUPAC ନେମ୍, |
01:51 | CAS ସଂଖ୍ୟା, |
01:54 | CID ସଂଖ୍ୟା, |
01:56 | InChi identifier କିମ୍ବା |
01:58 | SMILES identifier |
02:01 | ଗୋଟିଏ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ କେମିକାଲକୁ ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ ଥିବା ତଥ୍ୟକୁ ପ୍ରାପ୍ତ କରିବା ସକାଷେ ଦୟାକରି, Pubchem ଡେଟାବେସ୍ ୱେବସାଇଟକୁ ଯା’ନ୍ତୁ |
02:09 | ସ୍କ୍ରୀନ୍ ଉପରେ phenolକୁ ପ୍ରଦର୍ଶନ କରନ୍ତୁ |
02:13 | ତେଣୁ Input ଟେକ୍ସଟ ବକ୍ସରେ phenol ଟାଇପ୍ କରନ୍ତୁ |
02:16 | OK ବଟନ୍ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
02:20 | ପ୍ୟାନେଲ୍ ଉପରେ ଫିନଲର ଗୋଟିଏ ଆକାର ପ୍ରଦର୍ଶିତ ହୋଇଛି |
02:24 | phenolର ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ ବିଭିନ୍ନ ରେଣ୍ଡରିଙ୍ଗ ବିକଳ୍ପଗୁଡିକୁ ବ୍ୟବହାର କରି, ରୂପାନ୍ତର କରିପାରିବେ |
02:30 | ଏହି ବିକଳ୍ପଗୁଡିକ Menu bar ଓ Pop-up ମେନୁରେ ତାଲିକାଭୁକ୍ତ ଅଛନ୍ତି |
02:36 | ଫିନଲ୍ benzene ringର ବିକଳ୍ପଗୁଡିକୁ ସଂଯୁକ୍ତ କରିପାରିବେ |
02:41 | ପ୍ରଥମେ, modelରେ ଥିବା ଅଣୁଗୁଡିକୁ ଲେବଲ୍ କରନ୍ତୁ |
02:45 | Display ମେନୁ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରିବା ସହ Labelକୁ ଚୟନ କରନ୍ତୁ. ବିକଳ୍ପ Numberରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
02:52 | ବର୍ତ୍ତମାନ, 4 ନମ୍ବର୍ carbon ସହିତ ସଂଯୁକ୍ତ ଥିବା ଗୋଟିଏ 10 ନମ୍ବର୍ hydrogenକୁ, ଏକ amino group ସହିତ ପ୍ରତିସ୍ଥାପନ କରନ୍ତୁ |
03:00 | modelkit ମେନୁକୁ ଖୋଲିବା ସହିତ ବିକଳ୍ପଗୁଡିକ ମଧ୍ୟରୁ nitrogenକୁ ଚୟନ କରନ୍ତୁ |
03:06 | 10 ନମ୍ବର୍ hydrogen ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
03:09 | panel ଉପରେ ଥିବା ଏହା Para-Amino Phenolର ଗୋଟିଏ ପରମାଣୁ ଅଟେ |
03:14 | ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ Sticks displayରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ କରନ୍ତୁ |
03:18 | modelkit ମେନୁକୁ ବାହାର କରନ୍ତୁ |
03:21 | ପପ୍-ଅପ୍ ମେନୁକୁ ଖୋଲିବା ସହ Style ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ସ୍କ୍ରୋଲ୍ କରନ୍ତୁ, Schemeକୁ ଚୟନ କରିବା ସହ ବିକଳ୍ପ Sticks ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
03:30 | ପ୍ୟାନେଲ୍ ଉପରେ ଗୋଟିଏ Para-Amino-phenolର ଆକାର sticksରେ ପ୍ରଦର୍ଶିତ ହୋଇଛି |
03:36 | ଜଟିଳ ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକ ଯେଉଁଗୁଡିକୁ ସୃଷ୍ଟି କରିବା କଷ୍ଟକର ଅଟେ, ପ୍ୟାନେଲରେ ସହଜରେ ଲୋଡ୍ କରାଯାଇପାରିବ |
03:42 | ଉଦାହରଣସ୍ଵରୂପ: cholesterol |
03:45 | File ମେନୁ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
03:47 | ବିକଳ୍ପ Get Mol ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରିବା ସହ ଟେକ୍ସଟ ବକ୍ସରେ ଟାଇପ୍ କରନ୍ତୁ: Cholesterol |
03:54 | OK ବଟନ୍ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
03:57 | ପ୍ୟାନେଲ୍ ଉପରେ Cholesterolର ଗୋଟିଏ ପରମାଣୁ ପ୍ରଦର୍ଶିତ ହୋଇଛି |
04:02 | ପରମାଣୁରେ, double-bond ଓ side-chain ଭଳି ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡିକୁ ହାଇଲାଇଟ୍ କରିପାରିବା |
04:08 | ଡବଲ୍-ବଣ୍ଡକୁ ହାଇଲାଇଟ୍ କରିବା ପାଇଁ, ପ୍ରଥମେ ଡବଲ୍-ବଣ୍ଡରେ ଥିବା carbon ଅଣୁର ରଙ୍ଗକୁ ପରିବର୍ତ୍ତନ କରନ୍ତୁ |
04:15 | ଟୂଲ୍ ବାରରେ ଥିବା Select atoms ଆଇକନ୍ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
04:19 | ତା’ପରେ ଡବଲ୍-ବଣ୍ଡରେ ସମ୍ପୃକ୍ତ ଥିବା carbon ଅଣୁଗୁଡିକ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
04:24 | ଅଣୁଗୁଡିକର ଚାରିପଟେ ଗୋଟିଏ ହଳଦିଆ ରଙ୍ଗର ବଳୟ ଦୃଶ୍ୟମାନ ହେବ |
04:28 | ପପ୍-ଅପ୍ ମେନୁକୁ ଖୋଲନ୍ତୁ |
04:30 | Color ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ସ୍କ୍ରୋଲ୍ କରନ୍ତୁ, Atomsକୁ ଚୟନ କରିବା ସହିତ ବିକଳ୍ପ Orange ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
04:37 | ବର୍ତ୍ତମାନ ଟୂଲ୍ ବାର ଉପରେ ଥିବା ବିକଳ୍ପ Rotate molecule ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
04:42 | cholesterol ଆକାରରେ ଥିବା ଡବଲ୍-ବଣ୍ଡ ବର୍ତ୍ତମାନ ଅରେଞ୍ଜ କଲରରେ ଅଛି |
04:49 | ସେହିପରି, ପାର୍ଶ୍ଵ ଶୃଙ୍ଖଳରେ ଥିବା carbonsକୁ ହାଇଲାଇଟ୍ କରିପାରିବେ |
04:54 | Pop-up ମେନୁକୁ ବ୍ୟବହାର କରି କଲରକୁ ବାଇଗଣୀରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ କରନ୍ତୁ |
04:59 | ପ୍ୟାନେଲ୍ ଉପରେ, ଜରୁରୀ ଫିଚରଗୁଡିକ ହାଇଲାଇଟ୍ ହେବା ସହିତ ଗୋଟିଏ Cholesterolର ଆକାର ଅଛି |
05:06 | ଗୋଟିଏ ଆସାଇନମେଣ୍ଟ ଭାବେ- |
05:08 | Pubchem ଡେଟାବେସରୁ caffeineର ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ Load କରନ୍ତୁ |
05:11 | ପରମାଣୁରେ ଥିବା ଗୁରୁତ୍ଵପୂର୍ଣ୍ଣ ଫିଚରଗୁଡିକୁ ହାଇଲାଇଟ୍ କରନ୍ତୁ |
05:15 | ଡିସ୍ପ୍ଲେକୁ wireframeରେ ରୂପାନ୍ତର କରନ୍ତୁ |
05:19 | ବର୍ତ୍ତମାନ Jmolର ଅନ୍ୟ ଏକ ଗୁରୁତ୍ଵପୂର୍ଣ୍ଣ ଫିଚର୍ ଆଲୋଚିତ ହେବ |
05:24 | ଅନ୍ୟ ସଫ୍ଟୱେରରେ ଅଙ୍କା ଯାଇଥିବା ପରମାଣୁର 2D structureକୁ, 3D modelରେ ରୂପାନ୍ତର କରାଯାଇପାରିବ |
05:31 | ଏଠାରେ, ପ୍ୟାନେଲ୍ ଉପରେ amino acid Alanineର ଗୋଟିଏ ଆକାର ଅଛି |
05:36 | ଏହି ପରମାଣୁର 2D structure, GChemPaint ନାମକ ଗୋଟିଏ ସଫଟୱେରରେ ଅଙ୍କା ଯାଇଥିଲା |
05:42 | ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ ଗୋଟିଏ .mol ଫାଇଲ୍ ଭାବେ ସେଭ୍ କରାଯାଇଥିଲା |
05:46 | 2D କେମିକାଲ୍ ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ ଆଙ୍କିବା ପାଇଁ GchemPaint ଗୋଟିଏ Open source software ଅଟେ |
05:51 | GchemPaint ଉପରେ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲଗୁଡିକ ନିମ୍ନ ଲିଙ୍କରେ ଅଛି |
05:56 | ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ ଆଙ୍କିବା ଏବଂ .mol ଫର୍ମାଟରେ save କରିବା ପାଇଁ Analysis of Compounds ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲର ସାହାଯ୍ୟ ନିଅନ୍ତୁ |
06:05 | ଏହି Gchempaintର ଡିସ୍ପ୍ଲେ ଏରିଆ ଉପରେ ପ୍ରଦର୍ଶିତ ହୋଇଥିବା 2D ଅଙ୍କନଗୁଡିକ ହେଲା- |
06:10 | Amino acid -Alanine |
06:12 | Nuclioside –Adenosine ଓ |
06:14 | Saccharide -Alpha-D glucopyranose |
06:19 | ସେଗୁଡିକୁ ମୁଁ ମୋର Desktop ଉପରେ .mol ଫର୍ମାଟରେ ସେଭ୍ କରିଛି |
06:24 | ପ୍ରଥମେ ଚାଲନ୍ତୁ Jmol Applicationରେ Alanineର 2D ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ 3D model ଭାବେ ଦେଖିବା |
06:32 | ତେଣୁ, ଗୋଟିଏ ନୁତନ Jmol ୱିଣ୍ଡୋକୁ ଖୋଲନ୍ତୁ |
06:36 | ଟୂଲ୍ ବାର୍ ଉପରେ ଥିବା Open a file ଆଇକନ୍ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
06:40 | Desktop ଉପରେ ଥିବା ଫୋଲ୍ଡରକୁ ଚୟନ କରିବା ସହିତ Openରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ. Alanine.mol ଫାଇଲକୁ ଚୟନ କରିବା ସହ Open ବଟନ୍ ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
06:51 | ସ୍କ୍ରୀନ୍ ଉପରେ Alanineର ଗୋଟିଏ 3D model ଖୋଲିଯିବ |
06:55 | modelkit ମେନୁକୁ ଖୋଲନ୍ତୁ ଏବଂ ବିକଳ୍ପ fix hydrogens and minimize ଉପରେ କ୍ଲିକ୍ କରନ୍ତୁ |
07:03 | ଷ୍ଟ୍ରକଚରରେ Hydrogenଗୁଡିକ ସଂଯୁକ୍ତ ହେବା ସହ ଏନର୍ଜୀ ମିନିମାଇଜ୍ ହୋଇଛି |
07:08 | ଯେକୌଣସି .mol ଫାଇଲରେ କରିବା ଭଳି, ମେନୁ ବାର୍ ଓ Pop-up ମେନୁକୁ ମଧ୍ୟ ବ୍ୟବହାର କରି ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ ପରିବର୍ତ୍ତନ କରିପାରିବା |
07:15 | ଏଠାରେ Adenosine.molର 3D ଆକାର ଅଛି |
07:19 | ଏବଂ ଏହା Jmol ଦ୍ଵାରା Alpha-D-glucopyranose.molର ଗୋଟିଏ 3D ଆକାର ଅଟେ |
07:25 | ସଂକ୍ଷିପ୍ତରେ |
07:27 | ଏହି ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲରେ ଆମେ ଶିଖିଲେ- |
07:32 | Pubchem ଡେଟାବେସରୁ କେମିଲାଲ୍ ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ Load କରିବା |
07:34 | Phenol ଓ Cholesterolର ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ ରୂପାନ୍ତର କରିବା |
07:38 | GchemPaintରେ ଅଙ୍କା ଯାଇଥିବା 2D ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ Jmolରେ 3D ଆକାରରେ ରୂପାନ୍ତର କରିବା |
07:44 | Alanine, Adenosine ଓ Alpha-D-glucopyranoseର 2D ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ 3D ଆକାରରେ ରୂପାନ୍ତର କରିବା |
07:53 | ଏଠାରେ ଆପଣଙ୍କ ପାଇଁ ଅନ୍ୟ ଏକ ଆସାଇନମେଣ୍ଟ ଅଛି |
07:56 | GchemPaintରେ ନିମ୍ନ Amino acidଗୁଡିକର 2D ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ ଆଙ୍କନ୍ତୁ- |
08:01 | Cysteine |
08:03 | Histidine ଓ Phenylalanine |
08:06 | .mol ଫାଇଲ୍ ଭାବେ ସେଭ୍ କରନ୍ତୁ |
08:09 | ଫାଇଲଗୁଡିକୁ Jmolରେ ଖୋଲିବା ସହ ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ ରୂପାନ୍ତର କରନ୍ତୁ |
08:12 | ଏହି URLରେ ଉପଲବ୍ଧ ଥିବା ଭିଡିଓକୁ ଦେଖନ୍ତୁ: http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial |
08:16 | ଏହା Spoken Tutorial ପ୍ରୋଜେକ୍ଟକୁ ସାରାଂଶିତ କରେ |
08:19 | ଯଦି ଆପଣଙ୍କର ଭଲ ବ୍ୟାଣ୍ଡୱିଡଥ୍ ନାହିଁ, ଏହାକୁ ଡାଉନଲୋଡ୍ କରିଦେଖିପାରିବେ |
08:23 | ସ୍ପୋକନ୍ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲ୍ ପ୍ରୋଜେକ୍ଟ ଟିମ୍, |
08:26 | ସ୍ପୋକନ୍ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲ୍ସ ବ୍ୟବହାର କରି କର୍ମଶାଳାମାନ ଚଲାନ୍ତି |
08:29 | ଅନଲାଇନ୍ ଟେଷ୍ଟ ପାସ୍ କରୁଥିବା ବ୍ୟକ୍ତିମାନଙ୍କୁ ପ୍ରମାଣପତ୍ର ଦିଅନ୍ତି. |
08:33 | ଅଧିକ ବିବରଣୀ ପାଇଁ ଦୟାକରି contact@spoken-tutorial.orgକୁ ଲେଖନ୍ତୁ |
08:40 | ସ୍ପୋକନ୍ ଟ୍ୟୁଟୋରିଆଲ ପ୍ରୋଜେକ୍ଟ, ଟକ୍ ଟୁ ଏ ଟିଚର୍ ପ୍ରୋଜେକ୍ଟର ଏକ ଅଂଶ |
08:45 | ଏହା ଭାରତ ସରକାରଙ୍କ MHRDର ICT ମାଧ୍ୟମରେ ରାଷ୍ଟ୍ରୀୟ ସାକ୍ଷରତା ମିଶନ୍ ଦ୍ୱାରା ସମର୍ଥିତ |
08:52 | ଏହି ମିଶନ୍ ଉପରେ ଅଧିକ ବିବରଣୀ ଏହି ଲିଙ୍କରେ ଉପଲବ୍ଧ: http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro |
08:57 | ଆଇଆଇଟି ବମ୍ୱେ ତରଫରୁ, ପ୍ରଦୀପ ମହାପାତ୍ରଙ୍କ ସହ ମୁଁ ପ୍ରଭାସ ତ୍ରିପାଠୀ ଆପଣଙ୍କଠାରୁ ବିଦାୟ ନେଉଛି. ଆମ ସହିତ ଜଡ଼ିତ ହୋଇଥିବାରୁ ଧନ୍ୟବାଦ |