Avogadro/C4/File-Extensions/Gujarati

Time	Narration
00:01	File Extensions પરના આ ટ્યુટોરીયલમાં આપનું સ્વાગત છે.
00:05	આ ટ્યુટોરીયલમાં, આપણે computational chemistry પ્રોગ્રામ્સ માટે ઈનપુટ ફાઈલો તૈયાર કરવી શીખીશું,જેમ કે : GAMESS, Gaussian, MOPAC, NWChemવગેરે.
00:18	અને GAMESS અને Gaussian સૉફ્ટવેરમાંથી પેદા થતી આઉટપુટ ફાઇલોનો ઉપયોગ કરીને Molecular orbitals અને calculated IR spectrum જોઈશું.
00:28	અહીં હું ઉપયોગ કરી રહ્યો Ubuntu Linux OS version. 14.04 Avogadro version 1.1.1.
00:38	આ ટ્યુટોરીયલને અનુસરવા માટે, તમે Avogadro ઇન્ટરફેસથી પરિચિત હોવા જોઈએ.
00:43	જો નહિં, તો સંબંધિત ટ્યુટોરીયલો માટે, અમારી વેબસાઇટની મુલાકાત લો.
00:49	આ ટ્યુટોરીયલ માટે જરૂરી ઉદાહરણ ફાઈલો કોડ ફાઇલો તરીકે આપવામાં આવે છે.
00:55	કૃપા કરીને ડાઉનલોડ કરો અને તેને ડેસ્કટૉપ પર ફોલ્ડરમાં સાચવો.
01:00	અહીં મેં Avogadro વિન્ડો ખોલી છે.
01:04	Insert fragment લાઇબ્રેરીનો ઉપયોગ કરીને Build મેનૂમાંથી બેન્ઝીન અણુ લોડ કરો.
01:12	ટૂલ બારમાંથી Auto-optimization tool નો ઉપયોગ કરીને જિયોમેટ્રી ઑપ્ટિમાઇઝ કરો.
01:20	Extensions મેનૂ પર ક્લિક કરો
01:23	Avogadro નો ઉપયોગ કરીને આપણે લોકપ્રિય ક્વોન્ટમ કોડ્સ માટે ઇનપુટ ફાઇલો તૈયાર કરી શકીએ છીએ, જેમ કે: GAMESS Gaussian MOLPRO MOPAC Q-CHEM વગેરે.
01:36	Gaussian વિકલ્પ પર ક્લિક કરો. એક ગ્રાફિકલ ડેટા ઇનપુટ ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
01:43	ચાલો હું Gaussian પ્રોગ્રામ માટે ઈનપુટ ફાઈલ કેવી રીતે બનાવવી તે દર્શાવું.
01:49	આપણને ડાયલોગ બોક્સમાં બતાવેલ આવશ્યક સુવિધાઓ ભરવાનું રહેશે.
01:55	Avogadro પોતે જ molecular orbitals ની ગણતરી કરી શકતા નથી.
01:59	તો ચાલો આપણે benzene અણુના molecular orbitals ને જોવા માટે ઇનપુટ ફાઇલ બનાવીએ.
02:05	Gaussian ઇનપુટ ડાયલોગ બોક્સમાં, Benzene hyphen MO તરીકે શીર્ષક લખો.
02:11	Calculation ડ્રોપ ડાઉનમાંથી Frequencies' પસંદ કરો. Processors તરીકે 1. Theory તરીકે B3LYP. 6-31G(d) તરીકે Basis set. Charge zero. Multiplicity 1. Output તરીકે Standard. Format તરીકે cartesian checkpoint check box. ને તપાસો.
02:40	તમે ડાયલોગ બૉક્સના તળિયે ઇનપુટ ફાઇલનું પૂર્વાવલોકન જોઈ શકો છો.
02:45	તમે વિકલ્પો બદલી રહ્યા છો તે અપડેટ થશે.
02:49	Generate બટન પર ક્લિક કરો.
02:52	Save input Deck ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
02:56	ઉત્ત્પન્ન થયેલ Gaussian input ફાઈલ dot com એક્સ્ટેંશન સાથે સાચવવામાં આવશે.
03:02	ફાઇલ નામ Benzene. તરીકે લખો. સ્થાન તરીકે Desktop પસંદ કરો. Save બટન પર ક્લિક કરો.
03:10	ફાઇલ ડેસ્કટોપ પર Benzene.com તરીકે સંગ્રહિત થશે. 'Gedit' સાથે ફાઇલ ખોલો
03:18	હવે આ ફાઇલ Gaussian સોફ્ટવેર પ્રોગ્રામ માટે ઇનપુટ ફાઇલ તરીકે ઉપયોગ કરી શકાય છે.
03:24	Gaussian સૉફ્ટવેર વિશે.
03:28	Gaussian એ computational chemistry માટે કોમ્પ્યુટર પ્રોગ્રામ છે.
03:32	તે Gaussian Inc. દ્વારા વિકસિત અને લાઇસેન્સ ધરાવતી વ્યવસાયિક સોફ્ટવેર છે. વધુ માહિતી આપેલ લિંક પર ઉપલબ્ધ છે. http://www.gaussian.com/
03:41	Avogadro વિંડો પર પાછા ફરો ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.
03:46	હવે ચાલો જોઈએ કે 'GAMESS' 'પ્રોગ્રામ માટે ઇનપુટ ફાઇલ કેવી રીતે તૈયાર કરવી.
03:51	નવી વિન્ડો ખોલો. Tools મેનૂમાંથી “New પર ક્લિક કરો.
03:56	Draw tool નો ઉપયોગ કરીને પાણીનો અણુ બનાવો. તત્વને Oxygenમાં બદલો.
04:01	પેનલ પર ક્લિક કરો. auto-optimization tool નો ઉપયોગ કરીને જોમેટ્રી ઑપ્ટિમાઇઝ કરો.
04:08	Extensions મેનૂ પર ક્લિક કરો સબમેનૂમાંથી GAMESS, Input generator પસંદ કરો.
04:16	GAMESS ઇનપુટ ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે. ત્યાં બે ટૅબ્સ છે. Basic setup અને Advanced setup.
04:24	આપણે Gaussian ઇનપુટ ફાઇલ સાથે કર્યું છે, તે પ્રમાણે આવશ્યક માહિતી ભરો.
04:29	Basic Setup અંતર્ગત, આપણે Calculate અંતર્ગત, Equilibrium Geometry ને પસંદ કરીશું.
04:36	wave function.ના નિર્ધારણ માટે, RHF, Restricted Hartee Fock એ approximation ની પદ્ધતિ છે.
04:44	પાણી એક નાનો અણુ છે, તેથી આપણે 6-31G(d,p) તરીકે Basis set. પસંદ કરીશું.
04:52	gas સ્વરૂપમાં, singlet , કારણ કે તમામ ઇલેક્ટ્રોન જોડીમાં છે.
04:58	પાણી એક ન્યુટ્રલ અણુ છે, તેથી charge' neutral હશે.
05:02	ઑપ્ટિમાઇઝેશનને નિયંત્રિત કરવા માટે કેટલાક વધુ પરિમાણો ઉમેરવા માટે Advanced Setup પર ક્લિક કરો.
05:08	જો તમે કાર્યોનો સમૂહ બદલવા માંગતા હોવ તો Basis પર ક્લિક કરો.
05:12	Data.પર ક્લિક કરો.
05:14	Title ને water-MO તરીકે ટાઇપ કરો.
05:18	Point Group ને CnV માં બદલો.
05:21	Order of Principal Axis ને 2 માં.
05:24	અત્યારે આપણે મૂળભૂત પરિમાણોને એવાજ રાખીશું.
05:29	Generate પર ક્લિક કરો. Save Input deck ખુલે છે.
05:34	મૂળભૂત રૂપે,ફાઇલ એક્સ્ટેંશન 'dot inp' છે.
05:38	ફાઇલ નામ Water તરીકે ટાઇપ કરો.
05:42	ફાઇલ સ્થાન તરીકે Desktop પસંદ કરો. Save button. પર ક્લિક કરો
05:48	GAMESS ઇનપુટ ફાઇલ Desktop પર Water.inp તરીકે સચવાઈ છે.
05:55	GAMESS વિષે.
05:57	GAMESS એ General Atomic and Molecular Electronic Structure System માટે વપરાય છે. (GAMESS) તે એક સામાન્ય અણુ ક્વોન્ટમ રસાયણશાસ્ત્ર પેકેજ છે.
06:08	તે શૈક્ષણિક અને ઔદ્યોગિક વપરાશકારો બંને માટે વિના મુલ્યે ઉપલબ્ધ છે.
06:14	ઈન્સ્ટોલેશન (સ્થાપન ) અને ડાઉનલોડ વિશેની માહિતી નીચે આપેલી લિંક પર આપવામાં આવી છે. http://www.msg.ameslab.gov/gamess/download.html
06:20	હવે આપણે GAMESS અને Gaussian પ્રોગ્રામ્સ માટે ઇનપુટ ફાઇલો બનાવી છે.
06:26	આ ઇનપુટ ફાઇલો સંબંધિત કાર્યક્રમોમાં લોડ થવા માટે તૈયાર છે.
06:31	દર્શકો મહેરબાની કરીને નોંધ કરો: Gaussian વ્યવસાયિક સૉફ્ટવેર છે. તેથી હું ઇનપુટ ફાઇલને લોડ કરવા માટે ઇન્ટરફેસને બતાવવા માટે સક્ષમ નહીં રહીશ.
06:41	અગાઉ ઉલ્લેખ કર્યો છે તે પ્રમાણે GAMESS મુફ્ત સોફ્ટવેર છે.
06:45	જેને રુચિ હોય તે આપેલ લિંક પરથી GAMESS સૉફ્ટવેર ડાઉનલોડ કરી શકે છે. અને આઉટપુટ ફાઈલ બનાવવા માટે ઇનપુટ ફાઇલ લોડ કરો. http://www.msg.ameslab.gov/gamess/download.htm
06:53	મારી પાસે ડેસ્કટોપ પર કેટલીક Gaussian and GAMESS આઉટપુટ ફાઇલો છે.
06:58	મેં આ ફાઇલોને આ ટ્યુટોરીયલ સાથે કોડ ફાઇલો તરીકે પ્રદાન કરી છે.
07:03	ચાલો આ આઉટપુટ ફાઇલોને avogadro માં જોઈએ.
07:07	એક નવું એવોંગાર્ડો વિન્ડો ખોલો.
07:10	ટૂલ બારમાં open આઇકોન પર ક્લિક કરો.
07:13	ફાઇલ સ્થાનની દિશામાં જાઓ અને Benzene.log પસંદ કરો.
07:18	ફાઇલ ખુલે છે, આપણે પેનલ પર Benzene' નું સ્ટ્રક્ટચર જોઈ શકીએ છીએ.
07:24	Benzene.log Gaussian નો ઉપયોગ કરીને ઉત્ત્પન થયું હતું.
07:28	આમાં molecular orbitals અને C-C અને C-H બોન્ડ સ્ટ્રેચિંગ વિશેની માહિતી છે.
07:36	કેટલીકવાર લોગ ફાઇલ ઓર્બીટલ માહિતી બતાવી શકતી નથી.
07:40	આવા કિસ્સામાં કોડફાઇલમાં આપેલ '.fchk' ફાઇલને કોડફાઇલમાં ખોલો.
07:47	orbitals જોવા માટે, લિસ્ટમાં orbital પર ક્લિક કરો.
07:54	જો તમે orbitals ના પ્રદર્શનને બદલવા માંગતા હોય તો, ડિસ્પ્લે પ્રકારોમાં સપાટી વિકલ્પોની બાજુમાં spanner ચિન્હ પર ક્લિક કરો.
08:02	Surface Setting ડાયલોગ બોક્સમાં, ઓપેસિટીને બદલવા માટે slider ને ડ્રેગ કરો. પેનલનું અવલોકન કરો.
08:10	Renderડ્રોપ ડાઊનમાં ત્રણ વિકલ્પ છે.' fill , lines અને points .
08:17	મૂળભૂત રીતે orbitals એ fillતરીકે રેન્ડર કરવામાં આવે છે.
08:21	અહીંયા લોબસના રંગને બદલવાનો પણ વિકલ્પ છે.
08:25	positive અને negative વિકલ્પની બાજુમાં Color ટેબ્સ પર ક્લિક કરો.
08:30	Select Color ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
08:33	પસંદ કરવા માટે કોઈપણ રંગ પર ક્લિક કરો. OK બટન પર ક્લિક કરો.
08:38	પેનલનું અવલોકન કરો, ઓર્બિટલ્સના રંગો હવે બદલાયા છે. ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.
08:45	સ્ટ્રક્ટચરમાંથી ઓર્બિટેલ્સ દૂર કરવા માટે, Display Types' માં Surfaces વિકલ્પને અન-ચેક કરો.
08:51	vibrational frequencies' જોવા માટ Vibrations ટૅબ પર ક્લિક કરો.
08:56	Vibration વિંડોમાં, સૂચિમાંથી કોઈપણ ફ્રિક્યુએન્સી પર ક્લિક કરો.
09:01	વિન્ડોની તળિયે હાજર Start Animation બટન પર ક્લિક કરો.
09:06	પેનલનું અવલોકન કરો. C-C અને C-H બોન્ડની ખેંચાણ એનિમેટેડ છે.
09:13	આપણે સ્ટ્રક્ટચર માટે આઇઆર સ્પેક્ટ્રમ જોઈ શકીયે છીએ.
09:17	Show Spectra પર ક્લિક કરો.
09:20	Spectra Visualization વિન્ડો ખુલે છે. તે Benzene ની ગણતરી કરેલ IR spectrum દર્શાવે છે.
09:27	એક નવી વિંડો ખોલો. GAMESS પ્રોગ્રામનો ઉપયોગ કરીને પાણીના અણુ માટે બનાવેલ log ફાઈલને ખોલો.
09:35	log ફાઇલ પાણીના સ્ટ્રક્ટચર અને મોલેક્યુલર ઓર્બિટલની માહિતી સાથે ખુલે છે.
09:41	લિસ્ટમાંથી orbital ના નામ પર ક્લિક કરો. ઓર્બિટલ પેનલ પર પ્રદર્શિત થાય છે.
09:47	ચાલો સારાંશ કરીએ.
09:49	આ ટ્યુટોરીયલમાં આપણે શીખ્યા છે, computational chemistry પ્રોગ્રામ્સ માટે ઇનપુટ ફાઈલો તૈયાર કરવી . જેમ કે: GAMESS and Gaussian.
09:58	benzene અને water અણુ માટે Molecular orbitals જુઓ.
10:04	Gaussian માંથી ઉત્પન્ન થયેલ લોગ ફાઇલોનો ઉપયોગ કરીને અણુઓ માટે ગણતરી કરેલ IR spectrum જુઓ.
10:11	અસાઇનમેન્ટ તરીકે, benzene અણુ માટે પ્રદાન કરેલ કોડ ફાઇલોમાંથી લૉગ ફાઇલ ખોલો.
10:18	લિસ્ટમાંથી કોઈ પણ Molecular Orbital દર્શાવો..
10:22	લોબનો પ્રદર્શન અને રંગ બદલો. 'JPEG' ફોર્મેટમાં ઇમેજ સાચવો.
10:29	આ વિડીયો સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે, જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિડ્થ ન હોય તો, તમે તેને ડાઉનલોડ કરી જોઈ શકો છો.
10:35	અમે સ્પોકન ટ્યુટોરિયલોનો ઉપયોગ કરીને વર્કશોપ કરીએ છીએ અને પ્રમાણપત્રો આપીએ છીએ. અમારો સંપર્ક કરો.
10:42	સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD Government of Indiaદ્વારા ફંડ આપવામાં આવે છે.
10:48	હું સંદીપ સોલંકી હવે વિદાય લવું છું. જોડાવા બદલ આભાર.

Contributors and Content Editors

Jyotisolanki, PoojaMoolya