Avogadro/C2/Edit-molecules/Malayalam

Time	Narration
00:01	എല്ലാവർക്കും അഭിവാദ്യം. Edit molecules. ഈട്യൂട്ടോറിയലിലേയ്ക്ക് സ്വാഗതം
00:08	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും - ആറ്റങ്ങള് ചേര്ക്കുക, ഇല്ലാതാക്കുക,
00:14	'ബോണ്ട്' 'കൂട്ടിച്ചേർക്കുക,
00:16	ബോണ്ടുകൾ,റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക
00:18	ബോൻഡിലെ ലെങ്ത് മാറ്റുന്നു,
00:20	ഹൈഡ്രജനെ മിഥില് ഗ്രൂപ്പിലേക്ക് മാറ്റുക,
00:23	സ്ട്രക്ചേർസ് 'കോപ്പി, പേസ്റ്റ്' ,ജോയിൻ എന്നിവ ചെയുക
00:27	ഇവിടെ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു: 'ഉബുണ്ടു ലിനക്സ്' 'OS പതിപ്പ്. 14.04, 'അവോഗാഡ്രോ' പതിപ്പ് 1.1.1.
00:37	ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, നിങ്ങൾ പരിചയത്തിലായിരിക്കണം: Avogadro ഇൻറർഫേസ്.
00:43	ഇല്ലെങ്കിൽ, അനുയോജ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾക്കായി, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക.
00:49	Avogadro ., ടെർമിനൽ 'ഉപയോഗിച്ചു് ഇവിടെ എങ്ങനെ തുറക്കാം എന്നു കാണിക്കും.
00:55	ടെർമിനൽ തുറക്കുന്നതിനായി 'CTRL, ALT' , 'T' കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക.
01:03	'പ്രോംപ്റ്റില്' avogadro ടൈപ്പ് ചെയ്യുകയുംEnter.അമര്ത്തുകയും ചെയ്യുക.
01:08	Avogadro application window തുറക്കുന്നു.
01:12	പ്രകടനത്തിനായി,Fragment libraryൽ നിന്നുംn-butane ന്റെ ഒരു തന്മാത്ര ഞാൻ പ്രദർശിപ്പിക്കും.
01:19	Build മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. Insert->Fragment എന്നതിലേക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക
01:25	Insert fragmentഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു.
01:29	'fragments,ന്റെ ലിസ്റ്റിൽ നിന്നും alkanes തുറക്കുന്നതിനുപകരം ഡബിൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
01:35	ഡ്രോപ്പ് ഡ്രോപ്പിൽ നിന്നുംbutane.cml തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
01:41	Insertബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.Insert Fragment ഡയലോഗ് ബോക്സ് അടയ്ക്കുന്നതിന് X ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
01:49	Insert Fragment നീല നിറത്തിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്ന തന്മാത്രപത്രം Panel.കാണുന്നു.
01:54	ഹൈലൈറ്റുചെയ്തത് ഒഴിവാക്കുന്നതിന്, 'Ctrl, Shift' , A കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക.
02:02	ശരിയായ അലൈൻമെന്റ് ലഭിക്കാൻ Navigation ഉപയോഗിച്ച്സ്ട്രക്ച്ചർ തിരിക്കുക
02:09	നമ്മൾ ഇപ്പോൾ അണുക്കളെ ചേർത്ത് തന്മാത്രകളെ എങ്ങനെ പഠിക്കാമെന്ന് പഠിക്കും.
02:14	tool bar.എന്നതിലെ Draw tool ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
02:18	പാനലിൽ അവസാനം 'കാർബൺ' 'ആറ്റം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
02:23	ആവശ്യമുള്ള ഹൈഡ്രജനുമായി കാർബൺ ആറ്റം ചേർക്കുന്നു.
02:27	ഇപ്പോൾ നമ്മൾ 'പാനൽ' Pentane' 'ഒരു തന്മാത്രയുണ്ട്.
02:32	അതുപോലെ, 'ആൽക്കെയ്ണുകളുടെ ഒരു പരമ്പര ഉണ്ടാക്കാൻ' 'Draw tool'ഉപയോഗിച്ച് നിങ്ങൾക്ക് ആറ്റോമുകൾ ചേർക്കാൻ കഴിയും.
02:39	ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കുക. 'Draw tool ഉപയോഗിച് propaneവരയ്ക്കുക.
02:45	'Ethan' ന്റെ മോളിക്യൂൾ ലഭിക്കാൻ ഹൈഡ്രജൻ ഉപയോഗിച്ച് കാർബൺ ആറ്റം അവസാനിപ്പിക്കാം.
02:52	അണുക്കളെ ഇല്ലാതാക്കാൻ, ടൂൾ ബാറിലെ Selection toolഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
02:57	തിരഞ്ഞെടുക്കുവാൻ അവസാനം കാർബൺ ആറ്റം ക്ലിക്കുചെയ്ത് വലിച്ചിടുക.
03:02	തിരഞ്ഞെടുക്കപ്പെട്ട ആറ്റങ്ങൾ നീല നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നു.
03:06	ഡിലീറ്റ് ചെയ്യാൻ Backspace അമർത്തുക. പകരം, Edit മെനുവിൽ വ്യക്തമായ ഓപ്ഷൻ ഉപയോഗിക്കാം.
03:14	redo, അമർത്തുക, 'Ctrl' , 'Z' 'കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക.
03:20	ഒരു മോളിക്യുൽ ൽ 'ബോണ്ട്' 'എങ്ങനെയാണ് ചേർക്കാനും നീക്കം ചെയ്യാനും ഉള്ളതെന്ന് ഞങ്ങൾ തെളിയിക്കും.
03:26	ബോണ്ടുകൾ ചേർക്കാൻ, ടൂൾ ബാറിലെ Draw tool ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
03:31	Draw Settings മെനു ഇടത് വശത്ത് തുറക്കുന്നു.
03:35	ഡിഫാൾട് ആയി , Element ഡ്രോപ്പ് ഡൌൺ ലിസ്റ്റിൽCarbon തിരഞ്ഞെടുക്കപ്പെടുന്നു.
03:40	ഒരു ഡബിൾ ബോണ്ട് പരിചയപ്പെടുത്താൻ,Bond Order ഡ്രോപ്പ് ഡൗണിൽ നിന്ന് Doubleതിരഞ്ഞെടുക്കുക.
03:46	C-1, C-2 എന്നിവ തമ്മിലുള്ള ബോണ്ട് ഒരു ഡബിൾ ബോണ്ടിലേക്ക് മാറ്റുക.
03:52	ഡബിൾ ബോൻഡ് ട്രിപ്പിൾ ബോണ്ടായി മാറ്റുക, Bond Order. ൽ നിന്ന് Triple തിരഞ്ഞെടുക്കുക.' ബോണ്ടിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:59	ബോണ്ടുകൾ നീക്കം ചെയ്യുന്നതിനായി, വലത്mouse buttonബോണ്ടുകൾ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:04	ഇത് രണ്ട് വ്യത്യസ്ത മോളിക്യുലസ് ആണ്
04:08	നമുക്ക് മോളിക്യൂളുകളിൽ വീണ്ടും ചേർക്കാം.
04:11	ഒരു തന്മാത്രയുടെ കാർബനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് ഡ്രാഗ് ചെയ്ത് മറ്റ് തന്മാത്രകളുടെ കാർബൺ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:18	ബോണ്ട് സെന്ററി മാനിപുലേഷൻ ഉപയോഗിച്ച് നമുക്ക് ബോണ്ടുകൾ തിരിക്കുക, ബോണ്ട് ദൈർഘ്യം മാറ്റാം.
04:24	ടൂൾ ബാറിൽ Bond Centric Manipulation ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:29	Bond Centric Manipulate s ഇടത് വശത്ത് സെറ്റിങ്സ് മെനു തുറക്കുന്നു.
04:34	സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി, Show Angles Snap-to Bonds എന്നിവ പരിശോധിച്ചിരിക്കുന്നു.
04:39	Snap-to Threshold 100(10 degree).സെറ്റ് ചെയുക
04:43	ഉപയോക്താക്കൾക്ക് ആവശ്യാനുസരണം ക്രമീകരണങ്ങൾ തിരഞ്ഞെടുക്കാം.
04:49	ആംഗിള്സ് കാണിക്കാനായി രണ്ട് ആറ്റങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള ബോണ്ടിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:55	നാം ബോണ്ടുകളുടെ പ്ലെയിൻ ഓഫ് റൊട്ടേഷൻ ഫിക്സ് ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട്
04:59	നിങ്ങൾക്കാവശ്യമുള്ളത്രയും ശരിയാക്കാൻ, ബോണ്ടിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് മുകളിലേക്കോ താഴേക്കോ നീക്കുക.
05:05	ആറ്റം തമ്മിലുള്ള പ്ലെയിൻ നീല അല്ലെങ്കിൽ മഞ്ഞനിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നു.
05:11	റൊട്ടേറ്റ്‌ ചെയുക , ആറ്റങ്ങളിൽ ഒരെണ്ണം ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് നീക്കുക.
05:16	നിശ്ചിത തലത്തിൽ ആറ്റങ്ങളും സഹിതം ഘടിപ്പിച്ചിട്ടുള്ള ബോണ്ട് ഭ്രമണം ചെയ്യുന്നു.
05:21	ബോണ്ടിന്റെ ലെങ്ത് മാറ്റുന്നതിന്, വലതു വശത്ത് mouse button അമർത്തി വലിച്ചിടുക.
05:27	ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജനെ methyl ഗ്രൂപ്പുകളാക്കി മാറ്റുന്നത് എങ്ങനെയെന്ന് കാണിക്കാം.
05:32	Build മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്ത്'Change H To Methyl. ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. '
05:38	എല്ലാ ഹൈഡ്രജനുകളും ഇപ്പോൾ Methylഗ്രൂപ്പുകളാൽ മാറ്റുന്നു.
05:43	ചെഞ്ചസ് undo ചെയ്യാൻ c 'CTRL' Zകീകള് ഒരേ സമയം അമർത്തുക
05:49	നമുക്ക് ഒരു പ്രത്യേക ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റവും തിരഞ്ഞെടുത്ത് ഒരുmethyl ഗ്രൂപ്പിലേക്ക് മാറ്റാം.
05:55	ടൂൾ ബാറിൽSelection tool ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക
05:59	തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിന് കാർബൺ ആറ്റം അറ്റാച്ച് ചെയ്ത ഹൈഡ്രജനിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:04	Build മെനുവിലേക്ക് പോയി'Change H to Methyl.എന്നിടത്ത് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:10	തിരഞ്ഞെടുത്ത 'ഹൈഡ്രജനെ' മെറ്റില് 'ഗ്രൂപ്പ് മാറ്റിസ്ഥാപിക്കും.
06:15	തിരഞ്ഞെടുത്തത് മാറ്റാൻ, 'Ctrl, Shift' , 'A' 'കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക.
06:22	നമുക്ക് എങ്ങനെ സ്ട്രക്ച്ചർ copy, paste JOIN എന്നിവ ചെയുന്നത് നോക്കാം.
06:28	File-> New എന്ന പേരിൽ ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കാൻ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:33	നമുക്ക് ഒരു 'Maltose' മോളിക്യുൽ ഉണ്ടാക്കാൻ പഠിക്കാം.
06:37	glucose തന്മാത്രകളാണ്.
06:41	glucose മോളിക്യൂൾ ചേർക്കുന്നതിന്, Buildമെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:46	Insert -> Fragmentസ്ക്രോൾ ഡൌൺ ചെയുക
06:51	Insert -> Fragment ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു.
06:55	ലിസ്റ്റ് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Cyclic sugarഫോൾഡറുകൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:01	ഒരു ഉപ മെനു കാണുന്നു.
07:04	താഴേയ്ക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക, 'beta-d-glucopyranose.cml.തിരഞ്ഞെടുക്കുക.'
07:10	Insert ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. ഡയലോഗ് ബോക്സ് ക്ലോസ് ചെയ്യുക.
07:16	beta-D-glucopyranose.cmlദൃശ്യമാകുമ്പോൾ 'പാനൽ' ൽ നീല നിറത്തിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു.
07:24	'ഹാൻഡ് ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച് മധ്യഭാഗത്ത് Translate ചെയ്യുക.
07:28	മറ്റൊരു' 'Glucose' മോളിക്യൂലെ copy paste ചെയ്യാം
07:33	മെനു ബാറിലെ Edit മെനുവിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:36	എന്നിട്ട് Copy. എന്നിടത്ത് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. വീണ്ടും എഡിറ്റ് മെനു താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Paste.ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
07:44	ദയവായി ശ്രദ്ധിക്കുക: കോപ്പി, പേസ്റ്റ് പ്രക്രിയ സമയത്ത്, ഒരു നിമിഷം വിൻഡോ മങ്ങുകയും തുടർന്ന് അത് റിക്കവർ ചെയ്യുകയും ചെയ്യും.
07:44	ദയവായി ശ്രദ്ധിക്കുക: കോപ്പി പേസ്റ്റു സമയത്ത്, പേസ്റ്റ് പ്രക്രിയ, ഒരു നിമിഷം വിൻഡോ മങ്ങുകയും തുടർന്ന് അത് വീണ്ടെടുക്കുകയും ചെയ്യും.
07:51	ഒരു പുതിയ മോളിക്യൂൾ നിലവിലുള്ള പാനിൽ കോപ്പി പേസ്റ്റ് ചെയ്തിട്ടുണ്ട്.
07:58	ഒരു ഹാൻഡ് ടൂൾ ൽ കഴ്സർ മാറുന്നു.
08:01	യഥാർത്ഥ പകൃതിയിൽ നിന്ന് പകർത്തിയായ തന്മാത്രകളെ നീക്കുക.
08:06	ഇപ്പോൾ നമുക്ക് പാനലിലെ രണ്ട് വ്യത്യസ്ത തന്മാത്രകൾ ഉണ്ട്.
08:10	ഡി-സെലക്റ്റ് ചെയ്യുന്നതിന് 'Ctrl, Shift' ,A കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക.
08:17	നമുക്ക് തന്മാത്രകളെ ലേബലിൽ കൊണ്ടുവരിക. ലേബലിംഗ് എല്ലാ ആറ്റങ്ങളുടെയും സ്ഥാനങ്ങൾ തിരിച്ചറിയാൻ സഹായിക്കുന്നു.
08:25	ലേബൽ ചെയ്യുന്നതിന് Display Types ഡ്രോപ്പ് ഡൗണിൽ നിന്ന് Label ചെക്ക് ബോക്സിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:32	'Maltose' 'ലഭിക്കാൻ നമുക്ക് ഒരു വാട്ടർ മോളിക്യൂൾ നീക്കം ചെയ്യണം.
08:37	ആദ്യത്തെ മോളിക്യുൽ ലെ OH ഗ്രൂപ്പ് ഇല്ലാതാക്കുക.
08:46	Draw tool settings. ലെ Carbon തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
08:50	Bond Order Single എന്നായി തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
08:54	Adjust Hydrogensചെക്ക് ബോക്സ്. അൺചെക്ക് ചെയുക
08:58	oxygen ആറ്റോം രണ്ടാമത്തെ തന്മാത്രയിലെ സി -1 ൽ രണ്ടാമത്തെ തന്മാത്രയിലെ സി -9-ൽ ചേരാനായി ക്ലിക്കുചെയ്ത് വലിച്ചിടുക.
09:07	നമ്മൾ ജിയോമെറ്ററി ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട്.
09:11	Auto Optimization tool.തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
09:15	Auto Optimization settings ഇടത് വശത്ത് മെനു പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു.
09:20	'MMFF94' ഫോഴ്സ് ഫീൽഡ് തിരഞ്ഞെടുത്ത് Start. ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
09:27	പൂർത്തിയാക്കാൻ ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ അൽപ്പ സമയം എടുത്തേക്കാം. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ലേബലുകൾ നീക്കംചെയ്യാം.
09:35	ഞങ്ങൾ ഇപ്പോൾ പാനലിലെ 'Maltose' 'യുടെ ഒരു മികച്ച രീതിയിലാണ് നിർമ്മിച്ചിരിക്കുന്നത്.
09:40	സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്: ആറ്റങ്ങള് ചേര്ക്കുകയും നീക്കം ചെയ്യുകയും ചെയ്യുക,
09:47	ബോണ്ടുകൾ ചേർക്കുക, ഇല്ലാതാക്കുക,
09:50	റൊട്ടേറ്റ് ബോണ്ടുകൾ,
09:52	ബോൻഡ് ദൈർഘ്യം മാറ്റുക,
09:54	ഹൈഡ്രജനെ മിഥില് ഗ്രൂപ്പിലേക്ക് മാറ്റുക,
09:56	സ്റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് .കോപ്പി , പേസ്റ്റ് ജോയിൻ
10:00	ഒരു അസൈൻമെന്റായി, ഡ്രോപ്പ് ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച് ബൂട്ടെൻ 'മോളിക്കുൽ ഉണ്ടാക്കുക.
10:06	ഇത് '2,3 ഡൈമൈത് ബൂട്ടെൻ ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യുക.
10:10	ബോണ്ടുകൾ തിരിക്കുക, ബോണ്ട് ദൈർഘ്യം മാറ്റുക.
10:14	cellulose എന്ന ഒരു തന്മാത്ര നിർമ്മിക്കുക (സൂചന: ഡി-ഗ്ലൂക്കോസ് മോണോറ്റർ ഇൻസേർട്ട് ഫ്രഗ്മെന്റ് റ് ലൈബ്രറിയിൽ ലഭ്യമാണ്)
10:22	UFF force field. ഉപയോഗിച്ച് ജിയോമെട്രി ഒപ്റ്റിമൈസുചെയ്യുക.
10:27	ഈ വീഡിയോ 'സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പദ്ധതിയെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു. നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്.
10:36	സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഞങ്ങൾ വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുകയും സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു. ഞങ്ങളെ ബന്ധപ്പെടുക.
10:44	സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്റ്റ് 'എൻഎംഇക്ടി, എംഎച്ച്ആർഡി' 'ഗവണ്മെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ' 'ആണ്.
10:52	ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽവിജി നായർ സംഭാവന ചെയ്യുന്നു. പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

Contributors and Content Editors

Vijinair