CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Tamil

Time	Narration
00:01	வணக்கம். ‘ Diagram Layoutஐ Customize செய்வது’ குறித்த tutorial க்கு நல்வரவு.
00:08	இந்த டுட்டோரியலில் நாம் கற்கப்போவது:Reaction line ன் color, shape மற்றும் width ஐ எப்படி மாற்றுவது.
00:19	Anchor points ஐ Reaction line ஓடு சேர்ப்பது , Components ஐ சீரமப்பது , Reaction ids ஐ காட்டுவது அல்லது மறைப்பது.
00:30	மேலும் கற்கபோவது Component களுக்கு குறிப்புகளை சேர்ப்பது, Protein ஐ edit செய்வது, information களை edit செய்வது
00:39	மற்றும் diagram ன் bird’s eye view ஐ பெறுவது.
00:44	இந்த tutorial ஐ பதிவு செய்ய நான் பயன்படுத்துவது Ubuntu Linux OS 14.04 CellDesigner version 4.3 Java version 1.7
01:01	இந்த டுடோரியலை பின்பற்ற கற்பவருக்கு Undergraduate Biochemistry மற்றும் CellDesigner interface பரீட்சயமாக இருக்க வேண்டும்.
01:12	இல்லையெனில், தொடர்புடைய CellDesigner டுட்டோரியல்களுக்கு Spoken Tutorial website ஐ அணுகவும்.
01:20	இப்போது ஆரம்பிக்கலாம்.
01:22	Methionine Biosynthesis க்கு process diagram ஐ build செய்வது என்பது முந்தைய tutorial களில் ஒன்றின் பயிற்சியாகும்
01:32	இந்த tutorial க்கு அதே diagram ஐ நான் பயன்படுத்த போகிறேன் .பிறகு அதை எப்படி customize செய்வது என்பதை நான் விளக்குகிறேன்.
01:43	நான் CellDesigner interface க்கு செல்கிறேன்.
01:47	இங்கே நீங்கள் காண்பது Methionine Biosynthesis க்கான process diagram.
01:53	Tutorial ஐ இங்கே இடைநிறுத்தி நீங்கள் உருவாக்கிய Methionine Biosynthesis process diagram ஐ திறக்கவும்.
02:01	சேமித்த file உங்களிடம் இல்லையெனில், கொடுக்கப்பட்டுள்ள code file ல் இருந்து திறக்கலாம்.
02:08	இப்போது நான் diagram ஐ customize செய்ய தொடங்குகிறேன்.
02:12	Cell designer interface க்கு திரும்பலாம்.
02:16	தொடங்க, Reaction line ன் width மற்றும் நிறத்தை நான் மாற்றுகிறேன்.
02:22	அதை செய்ய Homoserine மற்றும் Succinyl homoserine க்கு நடுவில் உள்ள State Transition ஐ நான் தேர்வு செய்கிறேன்.
02:30	Main menu bar ல் “Component” க்கு செல்லவும்.
02:35	“Change color & shape” option ஐ click செய்யவும்.
02:39	மாற்றாக , Reaction line ன் மேல் right-click செய்து “Change color & shape” option ஐ தேர்வு செய்யவும்.
02:47	“Change color & shape” என்று பெயருடைய dialog box திரையில் தோன்றும்.
02:53	தடிமனான Reaction line க்காக , Line Width ஐ 1.0 ல் இருந்து அதிக மதிப்பிற்கு மாற்றவும்
03:02	நான் 3.0 க்கு மாற்றுகிறேன்.
03:06	Reaction line ன் நிறத்தை மாற்ற Color panel க்கு செல்லவும்.
03:12	Color panel ல் pointer போன்ற handle ஐ உடைய color wheel ஐ காணலாம்.
03:19	விரும்பிய நிறத்தை தேர்வு செய்ய pointer ஐ hold செய்து சுழற்ற வேண்டும்.
03:25	நான் நீலநிறத்தை தேர்வு செய்கிறேன்.
03:28	அடுத்து, color triangle ன் ஏதேனும் ஒரு இடத்தில click செய்யவும்.
03:34	இப்போது , சிறிய circle ஐ click செய்து pointer ல் விடவும்.
03:40	அனைத்து மாற்றங்களும் முடிந்த பிறகு, Apply ஐ click செய்து பிறகு Ok ஐ click செய்யவும்.
03:48	Reaction line தடிமனாக நீல நிறத்தில் இருப்பதை கவனிக்கவும்.
03:55	அடுத்து Reaction line ன் மேல் Anchor points ஐ எப்படி சேர்ப்பது என்பதை கற்கலாம்.
04:01	Anchor points ஏன் , Reaction lines ஐ சுற்றி வரவும் ,
04:09	அவற்றிற்கு சரியான வடிவம் தந்து draw area ல் சரியான இடத்தில் வைக்கவும், பயன்படுகிறது என்பதையும் கற்கலாம்.
04:16	CellDesigner interface க்கு திரும்பலாம்.
04:20	ஏதேனும் ஒரு Reaction line ஐ தேர்வு செய்யவும்.
04:23	Homoserine மற்றும் Succinyl Homoserineக்கு நடுவில் உள்ள அதே State Transition reaction line ஐயே நான் தேர்வு செய்கிறேன்.
04:31	இந்த line ன் மேல் cursor ஐ பயன்படுத்தி Anchor point ஐ வைக்கவேண்டிய சரியான இடத்தை தேர்வு செய்யவும்.
04:39	சரியான point ஐ தேர்ந்தெடுக்கும்போது, right-click செய்து Add Anchor Point ஐ தேர்வு செய்யவும்.
04:47	Reaction line ல் நீங்கள் தேர்ந்தெடுத்த சரியான இடத்தில் புதிதாக சேர்க்கப்பட்ட Anchor point ஐ காணலாம்.
04:55	Reaction line ஐ சரிசெய்ய Anchor Points எவ்வாறு உதவுகிறது என்பதை காட்டுகிறேன்.
05:03	புதிய window ஐ திறந்து Anchor என்று பெயரிடுகிறேன். OK ஐ click செய்யவும்.
05:11	இப்போது GTP/GDPக்கான icon ஐ click செய்யவும்.
05:18	பிறகு draw area ன் ஓரிடத்தில் click செய்யவும்.
05:22	Reaction line ன் மீது right-click செய்து Add Anchor point ஐ click செய்யவும்.
05:29	Reaction line ஐ இழுத்து draw area வில் எங்கேனும் விடவும்.
05:37	அடுத்து draw area வில் உள்ள components ஐ எப்படி சீரமைப்பது என்பதை காணலாம்.
05:44	Methionine biosynthesis process diagram window க்கு திரும்பலாம்.
05:50	முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட Reaction line ஐ uncheck செய்ய draw area வில் எங்காவது click செய்யவும்.
05:56	'Shift' key ஐ hold செய்து draw area வில் ஒன்றிற்கும் மேற்பட்ட Species ஐ click செய்யவும்.
06:04	Edit menu க்கு சென்று scroll down செய்து Alignment ஐ தேர்வு செய்து Alignment type ஐ click செய்யவும்.
06:15	மாற்றாக, toolbar ல் Alignment க்கான icon ஐ click செய்யவும்.
06:21	Toolbar ல் உள்ள மற்ற Alignment option களை சுயமாக ஆராயவும் .
06:27	Alignment ஐ undo செய்துவிட்டு தொடரலாம்.
06:31	Reaction ல் வேலை செய்துகொண்டிருக்கும்போது process diagram ல் உள்ள Reaction ids ஐ எப்படி காட்டுவது அல்லது மறைப்பது ?
06:39	நாம் அதை கற்கலாம்.
06:41	'View' க்கு சென்று , scroll down செய்து 'Show Reaction Id' ஐ uncheck செய்க.
06:48	draw area வில் உள்ள reaction களுக்கு தகுந்த Reaction ids ஐ இனி காண முடியாது.
06:55	ஒருவேளை , Reaction Id ஐ காட்ட விரும்பினால் கீழே கூறியவற்றை செய்யவும்.
07:01	'View' க்கு சென்று, scroll down செய்து 'Show Reaction Id' ஐ click செய்யவும்.
07:08	draw area வில் உள்ள reactions க்கு தகுந்த Reaction ids தோன்றும்.
07:15	draw area வில் உள்ள அனைத்து Component களுக்கும் நாம் குறிப்புகளை சேர்க்கலாம்.
07:21	அதை எப்படி செய்வது என்பதை கற்கலாம்.
07:24	draw area வில் உள்ள Species மீது right-click செய்யவும்.
07:28	நான் CoA ஐ click செய்கிறேன்.
07:32	Scroll down செய்து ‘Species Notes’ ஐ click செய்யவும்.
07:35	pop up menu காட்டப்படும்.
07:38	'Species Notes' dialog box தோன்றும். Species உடன் தொடர்புடைய text ஐ type செய்யவும்.
07:46	நான் பின்வருமாறு type செய்கிறேன்.
07:49	'OK' ஐ click செய்யவும்.
07:51	குறிப்புகள் பற்றிய தகவல் Notes Area உள் காட்டப்படுவதை கவனிக்கவும்.
07:58	மாற்றாக , Species க்கு குறிப்புகளை சேர்க்க , draw area வில் Species ஐ click செய்க.
08:06	நான் Succinate ஐ click செய்கிறேன்.
08:09	பிறகு, CellDesigner window ன் கீழ் வலது மூலையில் உள்ள Edit Notes tab ஐ click செய்க.
08:18	pop up window தோன்றும்.
08:21	Species க்கு தொடர்புடைய text ஐ type செய்யவும்.
08:25	நான் 'OK' ஐ click செய்கிறேன்.
08:30	அதேபோல் நாம் Protein ஐ edit செய்யலாம்.
08:35	அதை செய்ய , draw area வில் component ன் மேல் right-click செய்க.
08:40	நான் Homoserine succinyl transferase ஐ click செய்கிறேன்.
08:46	Scroll down செய்து Edit Protein ஐ click செய்கிறேன்.
08:51	Protein என்று பெயருடைய dialog box திரையில் தோன்றும்.
08:55	Name box ல் Protein ன் பெயரை enter செய்க.
09:00	Name box ல் நான் O-succinyltransferase என்று type செய்கிறேன்.
09:06	‘Update’ ஐ click செய்து dialog box ஐ close செய்க.
09:11	Protein உடன் regions ஐ நாம் சேர்க்கலாம்.
09:15	draw area ல் Protein ன் மீது right-click செய்க.
09:19	நான் O-succinyltransferase ன் மீது right click செய்கிறேன்.
09:24	Scroll down செய்து Edit Proteinஐ click செய்க.
09:29	Protein dialog box திரையில் தோன்றும்.
09:33	‘residues/regions’ tab ன் கீழ் 'Add' button ஐ click செய்க.
09:40	ModificationResidue/Bindingregion dialog box ல் :
09:46	‘Type’ drop down menu வில் ‘Binding region ஐ தேர்வு செய்யவும்.
09:52	Cursor ஐ தேவையான value க்கு நகர்த்துவதன் மூலம் size மற்றும் angle ஐ மாற்றலாம்.
09:59	செயல்விளக்கத்திற்கு நான் Size ஐ 15 எனவும் Angle ஐ 38 எனவும் தேர்வு செய்கிறேன்.
10:09	பிறகு ‘Close’ ஐ click செய்க.
10:12	Update ஐ click செய்க.
10:14	Box ஐ close செய்க.
10:17	Methionine Biosynthesis ல் region ஐ சேர்க்க தேவைஇல்லை என்பதால் மாற்றங்களை undo செய்யலாம்.
10:25	அடுத்து, நாம் தகவல்களை edit செய்ய கற்கலாம்.
10:30	draw area ல் component ஐ right -click செய்க.
10:33	நான் Homoserine ஐ click செய்கிறேன்.
0:37	Scroll down செய்து ‘Edit Information’ ஐ click செய்க.
10:41	‘Edit Information’ dialog box திரையில் தோன்றும்.
10:46	Dialog box ல் பின்வருவனவற்றை செய்யவும் - ‘state’ tab ன் கீழ் Open ஐ தேர்வு செய்யவும்.
10:54	‘prefix’ tab ன் கீழ் mt ஐ தேர்வு செய்க.
10:59	‘label’ ன் கீழ் dna ஐ தேர்வு செய்க.
11:04	‘Ok’ ஐ click செய்யவும்.
11:07	Draw area ல் 'mt:dna பற்றிய தகவல் தோன்றுவதை காணலாம்.
11:15	Methionine Biosynthesis ல் அது தேவையில்லை என்பதால் நான் Edit Information ஐ undo செய்கிறேன்.
11:23	சில இடங்களில் , process diagram சிக்கலான ஒன்றாக இருக்கலாம்.
11:28	அச்சமயங்களில், பெரிய model களினுள் செல்ல Bird's eye view வசதியாக இருக்கும் .
11:37	Bird's eye view icon ஐ click செய்க.
11:41	Bird’s Eye View ல் சிகப்பு நிற square ஐ இழுக்கவும்.
11:46	அதன்படி draw area ல் view நகர்வதை கவனிக்கவும்.
11:52	இந்த tutorial ன் முடிவிற்கு நாம் வந்துவிட்டோம்.
11:56	கற்றதை நாம் நினைவுகூருவோம். இந்த tutorial ல் நாம் கற்றது : Reaction line ன் color, shape மற்றும்width ஐ மாற்றுவது.
12:07	Reaction line க்கு Anchor points ஐ சேர்ப்பது , Component களை சீரமைப்பது Reaction id’s ஐ காட்டுவது அல்லது மறைப்பது.
12:18	மேலும் நாம் கற்றது Component களுக்கு குறிப்புகளை சேர்த்தல்
12:23	Protein ஐ edit செய்தல் தகவலை edit செய்தல்.
12:27	Diagram ன் Bird’s Eye View ஐ பெறுதல்.
12:32	பயிற்சியாக CellDesignerல் உள்ள tool களை பயன்படுத்தி Glycolysis Process Diagram ஐ உருவாக்கவும்.
12:41	Reaction line ன் பல வடிவங்களை ஆராயவும்.
12:47	கொடுக்கப்பட்டுள்ள இணைப்பில் உள்ள video, Spoken Tutorial project ஐ சுருங்க சொல்கிறது.
12:52	உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லையெனில் அதை தரவிறக்கி காணவும்.
12:57	ஸ்போகன் டுடொரியல் திட்டக்குழு: ஸ்போகன் டுடொரியல்களை பயன்படுத்தி செய்முறை வகுப்புகள் நடத்துகிறது. இணையத்தில் பரிட்சை எழுதி தேர்வோருக்கு சான்றிதழ்கள் தருகிறது.
13:06	மேலும் விவரங்களுக்கு contact@spoken-tutorial.org க்கு மின்னஞ்சல் செய்யவும்.
13:13	Spoken Tutorial திட்டம் Talk to a Teacher project ன் ஒரு பகுதியாகும். இதற்கு ஆதரவு NMEICT, MHRD,இந்திய அரசாங்கத்தின் மூலம் கிடைக்கிறது. மேலும் விவரங்களுக்கு, கீழ்கண்ட இணைப்பை பார்க்கவும்.
13:29	இந்த டுடோரிலை தமிழாக்கம் செய்து குரல்கொடுத்தது IIT Bombayஇல் இருந்து சண்முகப் பிரியா , நன்றி .

Contributors and Content Editors

Venuspriya