CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Tamil

Time	Narration
00:01	CellDesigner ல் , Build மற்றும் Modify Process Diagram குறித்த spoken tutorial க்கு நல்வரவு.
00:08	இந்த டுட்டோரியலில் நாம் கற்கப்போவது Macros ஐ பயன்படுத்துவது ,Draw area வில் Components ஐ நகர்த்துவது , species ஐ சுற்றி reaction line ஐ இணைப்பது.
00:18	Reaction line ஐ Align மற்றும் extend செய்வது, Product மற்றும் Reactant ஐ சேர்ப்பது .
00:23	இந்த டுட்டோரியலுக்கு நான் பயன்படுத்துவது , Ubuntu Linux OS 14.04' ,CellDesigner version 4.3, Java version 1.7
00:35	இந்த டுடோரியலை பின்பற்ற கற்பவருக்கு Undergraduate Biochemistry. மற்றும் CellDesigner interface பரீட்சயமாக இருக்க வேண்டும்.
00:43	இல்லையெனில், தொடர்புடைய CellDesigner டுட்டோரியல்களுக்கு Spoken Tutorial website ஐ அணுகவும்.
00:51	இப்போது ஆரம்பிக்கலாம்.
00:53	இங்கே நீங்கள் காண்பது Alanine Biosynthesis க்கான conventional diagram.
00:58	இந்த process diagram ஐ உருவாக்க CellDesigner ஐ பயன்படுத்தலாம்.
01:02	Ctrl+Alt+T key களை ஒன்றாக அழுத்தி terminal ஐ திறக்கலாம்.
01:09	இப்போது type செய்க ./runCellDesigner4.3 பிறகு Enter ஐ அழுத்தவும் .
01:20	இப்போது terminal ல் CellDesigner window திறந்துள்ளது.
01:24	CTRL+N ஐ அழுத்தி புதிய file ஐ திறந்து Build and Modify Process Diagram என பெயரிடவும்.
01:34	முன்னிருப்பான width மற்றும் height ஐ வைத்துக்கொண்டு Ok button ஐ click செய்யவும்.
01:39	‘Macros’ என்றால் என்ன என கற்கலாம்.
01:42	Macros என்பது diagram களை எளிமையாக வரைய அடிக்கடி பயன்படுத்தப்படும் Component set களாகும்.
01:47	Catalysis க்காக toolbar ன் மீது Macros icon ஐ click செய்யவும் பிறகு draw area ன் மீது click செய்யவும்.
01:57	இப்பொது draw area வில் Macros-Catalysis reaction ஐ நாம் கொண்டுள்ளோம் .
02:02	நாம் அனைத்து component களையும் draw area ன் மற்றொரு பக்கத்திற்கு மாற்ற கற்போம் .
02:08	அதற்க்கு 'Edit' menu ஐ click செய்து 'Select All' ஐ click செய்யவும் .
02:16	மாற்றாக நீங்கள் Ctrl + A key களை அழுத்தலாம் .
02:21	அனைத்து Component களும் இப்பொது முன்னிலைப்படுத்தப்பட்டுள்ளது .
02:24	இப்பொது முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட component களில் எங்காவது click செய்து விரும்பிய இடத்திற்கு இழுக்கவும்.
02:30	மேலும் தொடரலாம்.
02:32	முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட component களை uncheck செய்ய draw area வில் எங்காவது click செய்யவும்.
02:37	மீண்டும் draw area வில் ,Generic Protein S1 ன் மீது right click செய்யவும்.
02:43	பிறகு 'Change Identity' option மீது click செய்யவும்.
02:47	'class' box ல் ,Protein ஐ Simple Molecule க்கு மாற்றவும்.
02:53	Name ஐ 2-keto-isovalerate என type செய்யவும்.
02:58	பிறகு ‘Apply’ button ஐ click செய்யவும்.
03:02	‘The Same Species Exists’ dialog box ல் ‘No’ ஐ click செய்யவும்.
03:10	எனினும் நீங்கள் species ன் அனைத்து component களிலும் மாற்றத்தை பிரதிபலிக்க விரும்பினால் ‘Yes’ ஐ click செய்யவும். இங்கு நான் ' No' ஐ click செய்கிறேன்.
03:20	Generic Protein S1 என்பது தற்போது 2-keto-isovalerate என பெயரிடப்பட்ட simple molecule ஆக இருப்பதை கவனிக்கவும்.
03:30	பெயரின் இட வசதிக்காக நான் molecule ஐ இழுக்கிறேன்.
03:34	Product ஆன Generic protein-S1 என்ற End-pointன் மத்தியில் right click செய்யவும்.
03:42	Identity ஐ Simple Molecule க்கு மாற்றி Valine என்று பெயரிடவும்.
03:50	Apply button ஐ click செய்யவும்.
03:52	Draw area வில் நீங்கள் Valine ஐ கொண்டுள்ளீர்கள்.
03:56	அடுத்து, catalyst S2 ஐ மறுபெயரிடவும் .அதன் மீது right-click செய்து Edit Protein ஐ தேர்வு செய்யவும்.
04:06	‘name’ field ல் ,Aminotransferase என type செய்யவும்.
04:11	Update ஐ click செய்து dialog box ஐ மூடவும்.
04:16	பெயரின் இடவசதிக்காக molecule ன் மூலையில் இழுக்கவும்.
04:21	அடுத்து, linked reaction னின் நிலையை மாற்றலாம்.
04:25	'end-point' species அதாவது Valine ன் மத்தியில் click செய்து விரும்பிய இடத்தில் drag மற்றும் drop செய்ய வேண்டும்.
04:33	அதே போல், Aminotransferase இலும் முயற்சிக்கவும்.
04:37	end-point’ Species எங்கே நகர்கிறதோ அங்கே linked reaction தொடர்வதை கவனிக்கவும்.
04:44	இப்போது species சுற்றி reaction line ஐ எப்படி இணைப்பது என்பதை கற்கலாம்.
04:49	Reaction line , Species ஐ சுற்றியுள்ள 16 connection point களில் எவற்றிலும் இணைக்கப்படலாம்.
04:56	அதை எப்படி செய்வது என காட்டுகிறேன்
04:59	CTRL+N ஐ அழுத்தி புதிய window ஐ திறக்கவும் .
05:04	இந்த file ஐ Connection points என்று பெயரிடவும்.
05:08	முன்னிருப்பான width மற்றும் height ஐ வைத்துக்கொண்டு Ok button ஐ click செய்யவும்.
05:14	Draw area ன் மேல் இரண்டு generic protein களை வரைந்து Protein 1 மற்றும் Protein 2 என்று பெயரிடவும்.
05:23	Main menu வில் ,State Transition க்கான icon ஐ click செய்யவும்.
05:28	பிறகு , draw area ன் மீது , mouse ஐ ‘start-point' Species, Protein 1 ன் மீது வைக்கவும்.
05:36	எல்லா 16 connection point களும் சாம்பல் நிறத்தில் முன்னிலைப்படுத்தப்பட்டிருப்பதை கவனிக்கவும்.
05:42	இந்த connection point களில் ஏதேனும் ஒன்றை cursor சுட்டிக்காட்டினால் ,அது நீல நிறத்திற்கு மாறும்.
05:49	connection point களில் ஒன்றை நாம் click செய்யலாம்.
05:53	இதேபோல் mouse ஐ ‘end-point' Species அதாவது Protein 2 ன் மீது வைக்கவும் .
06:00	மீண்டும் , மேலே விளக்கப்பட்டதுபோல் , தேவையான connection point ல் click செய்யவும்.
06:05	தேர்வு செய்யப்பட்ட connection point களின் நடுவில் State Transition reaction line உருவாக்கப்பட்டிருக்கும்.
06:12	அடுத்து, நாம் Reaction line ஐ சீரமைக்கலாம்.
06:16	Protein 1 மற்றும் Protein 2 வின் நடுவில் State transition reaction line மீது click செய்யவும்.
06:21	reaction line ல் 2 process node கள் முன்னிலைப்படுத்தப்பட்டிருப்பதை கவனிக்கவும்.
06:27	ஒருவேளை mouse ஐ 2 process node களில் ஒன்றில் வைத்தால் ‘plus’ குறி தோன்றும்.
06:34	process node களில் ஒன்றை click செய்யவும்.
06:37	இப்போது pointer ஐ இழுத்து விருப்பமான connection point ன் மேல் வைக்கவும்.
06:43	முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட component களை uncheck செய்ய draw area ன் ஏதேனும் ஒரு இடத்தில் click செய்யவும்.
06:49	reaction line ஐ நீட்டிக்க , முதலில் அதை click செய்யவும்.
06:54	இப்போது start-point அல்லது end-point Species ன் மீது உள்ள process node களில் ஒன்றை click செய்யவும்.
07:01	விரும்பிய connection point வரை reaction line ஐ நீட்டிக்க mouse ஐ இழுக்கவும்.
07:07	இங்கிருந்து Process diagram ஐ நாம் தொடங்கலாம்.
07:12	நாம் Buildand Modify Process Diagram window க்கு திரும்புவோம்.
07:16	இப்போது, இருக்கும் reaction க்கு Reactant மற்றும் Product ஐ சேர்ப்போம்.
07:21	Toolbar ல் இருந்து, 2 simple molecule களை click செய்து draw area ன் மேல் வைக்கவும்.
07:27	அவற்றிற்க்கு Glutamate மற்றும் 2-Oxoglutarate என்று பெயரிடவும்.
07:36	அவற்றை இழுத்து Simple molecule கள்: 2-keto-isovalerate மற்றும் Valine க்கு அடுத்து வைக்க வேண்டும்.
07:44	முன்பே விளக்கப்பட்டது போல், draw area ன் மேல் உள்ள component களை வரிசைப்படுத்தவும்.
07:49	முன்பு விளக்கப்பட்டது போல், நான் இப்போது component களை வரிசைப்படுத்திவிட்டேன்.
07:55	Toolbar ன் மேல், ‘Add Product’ க்கான icon ஐ click செய்யவும்.
08:00	State Transition reaction ஆன 2-keto-isovalerate மற்றும் Valine க்கு நடுவில் cursor ஐ வைக்கவும் .
08:07	முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட process node ன் மீது click செய்யவும்.
08:10	அடுத்து, 2-Oxoglutarate ன் மீது cursor ஐ வைக்கவும்.
08:17	முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட 16 process node களில் ஒன்றை click செய்யவும்.
08:21	State Transition மற்றும் 2-Oxoglutarate க்கு நடுவில் reaction line உள்ளதை கவனிக்கவும்.
08:29	அதேபோல், ‘Add Reactant’ icon ஐ click செய்யவும்.
08:34	mouse ஐ Glutamate ன் மேல் வைத்து முன்னிலைப்படுத்தப்பட்ட 16 process node களில் ஒன்றை click செய்யவும்.
08:40	அடுத்து, mouse ஐ State Transition reaction மீது வைத்து process node ஐ click செய்யவும்.
08:49	State Transition மற்றும் Glutamate க்கு நடுவில் reaction line உள்ளதை கவனிக்கவும்.
08:55	இப்போது நாம், Reactant மற்றும் Product உடன் கூடிய முழுமையான Catalysis reaction ஐ கொண்டுள்ளோம்.
09:01	process diagram ன் மற்ற component களின் இடவசதிக்காக , நான் reaction ஐ வரிசைப்படுத்துகிறேன்.
09:09	Toolbar ல் இருந்து State Transition , Simple Molecule, Generic Protein மற்றும் Catalysis icon களை பயன்படுத்தலாம்.
09:18	இதுவே முழுமையான process diagram ஆகும்.
09:22	அதை சரியாக பார்க்க, main menu bar ல் View க்கு சென்று Zoom Fit ஐ click செய்யவும்.
09:32	இப்போது நீங்கள் முழுமையான Process Diagram ஐ பார்க்கலாம்.
09:36	நாம் கற்றதை நினைவுகூருவோம். இந்த டுட்டோரியலில், நாம் கற்றது Macros ஐ எப்படி பயன்படுத்துவது.
09:42	Component களை draw area க்கு நகர்த்துவது, species ஐ சுற்றியுள்ள reaction line ஐ இணைப்பது.
09:48	reaction line ஐ align மற்றும் extend செய்து, Product மற்றும் Reactant ஐ சேர்ப்பது.
09:54	பயிற்சியாக உங்களுக்கான வேலை : CellDesigner ல் உள்ள tool களை பயன்படுத்தி Methionine Biosynthesis க்கு process diagram ஐ build செய்யவும். GTP/GD க்கான Macros ஐ ஆராயவும், ’Curve’ reaction line ஐ எப்படி உருவாக்குவது என்று கண்டுபிடிக்கவும்.
10:11	Spoken Tutorial project ஐ பற்றி காணலாம்-
10:14	கொடுக்கப்பட்டுள்ள இணைப்பில் உள்ள video, Spoken Tutorial project ஐ சுருங்க சொல்கிறது.
10:19	உங்களிடம் நல்ல bandwidth இல்லையெனில் இதை download செய்து பார்க்கலாம்.
10:24	ஸ்போகன் டுடொரியல் திட்டக்குழு, ஸ்போகன் டுடொரியல்களை பயன்படுத்தி செய்முறை வகுப்புகள் நடத்துகிறது.
10:29	இணையத்தில் பரிட்சை எழுதி தேர்வோருக்கு சான்றிதழ்கள் தருகிறது.
10:34	மேலும் விவரங்களுக்கு contact@spoken-tutorial.org க்கு மின்னஞ்சல் எழுதவும்.
10:40	Spoken Tutorial Project ஆனது Talk to a Teacher project இன் ஒரு பகுதி ஆகும். இந்த project க்கு ஆதரவு NMEICT, MHRD, Government of India . இந்த Mission பற்றிய மேலதிக விவரங்களுக்கு கொடுக்கப்பட்டுள்ள இணைப்பை பார்க்கவும்.
10:54	இந்த டுட்டோரியலை தமிழாக்கம் செய்து குரல் கொடுத்தது சண்முகப் பிரியா. நன்றி

|-

Contributors and Content Editors

Venuspriya