CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Malayalam

From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 17:21, 6 February 2018 by Prena (Talk | contribs)

(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Time Narration
00:01 ഹലോ എല്ലാവരും. ‘Customizing Diagram Layout’.ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം.
00:08 ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും:Reaction lineന്റെ നിറവും ആകൃതിയും വീതിയും മാറ്റുക
00:19 'Reaction line , ലേക്ക് Anchor points Components , അലൈൻ ചെയുക Reaction ids ഷോ /ഹൈഡ് ചെയുക
00:30 Components , Edit Protein , Edit information ,എന്നിവയിലേക്ക് ആഡ് നോട്സ് ചേർക്കുന്നത്
00: 39 ഡയഗ്രത്തിലെ bird’s eye viewകാണുക.
00:44 ഈ ടൂട്ടോറിയൽ റെക്കോർഡ് ചെയ്യാൻ, ഞാൻ ഉബുണ്ടു ലിനക്സ് ഒഎസ് 14.04 സെൽഡിസൈനർ വേർഷൻ 4.3 'ജാവ പതിപ്പ് 1.7'
01:01 ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, പഠിതാക്കൾക്ക് പരിചയമുണ്ടായിരിക്കണം: 'അണ്ടർ ഗ്രാഡ്വേറ്റ് ബയോകെമിസ്ട്രി' ' 'സെൽ ഡിസൈൻ ഇന്റർഫേസ്.'
01:12 ഇല്ലെങ്കിൽ, 'സെൽഡ്രോസൈൻ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾക്കായി,' സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക.
01:20 നമുക്ക് തുടങ്ങാം.
01:22 മുമ്പത്തെ ട്യൂട്ടോറിയലുകളിലൊന്നിനുള്ള നിയമനം - Methionine Biosynthesis.എന്നതിനായുള്ള ഒരു 'പ്രോസസ് ഡയഗ്രം' ഉണ്ടാക്കുന്നതിന്.
01:32 ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിനുള്ള ഉദാഹരണമായി ഞാൻ അതേ ഡയഗ്രം ഉപയോഗിക്കും.അത് എങ്ങനെ ഇഷ്ടാനുസൃതമാക്കാം എന്ന് ഞാൻ പ്രദർശിപ്പിക്കും.
01:43 'സെൽ ഡിസൈൻ' ഇന്റർഫേസിലേക്ക് മാറാൻ എന്നെ അനുവദിക്കുക.
01:47 നിങ്ങൾ ഇവിടെ കാണുന്നത്Methionine Biosynthesis.എന്നതിനായുള്ള' പ്രോസസ് ഡയഗ്രം '
01:53 ഇവിടെ ട്യൂട്ടോറിയൽ താൽക്കാലികമായി നിർത്തി, നിങ്ങൾ സൃഷ്ടിച്ച Methionine Biosynthesis.പ്രക്രിയ ഡയഗ്രം' തുറന്നു.
02:01 നിങ്ങൾക്ക് ഒരു സംരക്ഷിച്ച ഫയൽ ഇല്ലെങ്കിൽ, നിങ്ങൾക്ക് നൽകിയിരിക്കുന്ന കോഡ് ഫയലിൽ നിന്ന് തുറക്കാൻ കഴിയും.
02:08 ഇപ്പോൾ ഡയഗ്രം യഥേഷ്ടം ആരംഭിക്കാൻ അനുവദിക്കുക.
02:12 നമുക്ക് 'സെൽ ഡിസൈനർ' ഇന്റർഫേസിലേക്ക് തിരികെ പോകാം
02:16 ആരംഭിക്കുന്നതിന്, Reaction line. ന്റെ വീതിയും കളറും ഞാൻ മാറ്റും.
02:22 അങ്ങനെ ചെയ്യുന്നതിന്, Homoserine Succinyl homoserine.എന്നിവയ്ക്കിടയിൽ' State Transition തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു.
02:30 ഇപ്പോൾ, പ്രധാന മെനു ബാറിലെ "Component" "" ൽ പോകുക.
02:35 Change color & shape” ഓപ്ഷൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
02:39 മറ്റൊരു രീതിയിൽ നിങ്ങൾ Reaction line'റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുകയും “Change color & shape” 'ഓപ്ഷൻ തെരഞ്ഞെടുക്കുക.
02:47 Change color & shape” എന്ന് പേരുള്ള ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് സ്ക്രീനിൽ കാണുന്നു.
02:53 കട്ടിയുള്ള Reaction lineഎന്നതിന്, Line Width 1.0 ൽ നിന്ന് ഉയർന്ന വിലയിൽ മാറ്റം വരുത്തുക.
03:02 ഞാൻ ഇത് 3.0 ആയി മാറ്റും
03:06 Reaction line, ന്റെ നിറം മാറ്റുന്നതിന്, Color panel.ൽ പോകുക.
03:12 Color panel.ൽ കളർ വീൽ കാണാം.
03:19 ഇഷ്ടമുള്ള നിറം തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിന് പോയിന്റർ ക്ലിക്കുചെയ്ത് തിരിക്കുക.
03:25 ഞാൻ നീലയുടെ ഒരു ഷെയ്ഡ് തിരഞ്ഞെടുക്കും.
03:28 അടുത്തതായി, കളർ ത്രികോണത്തിനുള്ളിൽ എവിടെയും ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
03:34 ഇപ്പോൾ, പോയിന്ററിൽ ചെറിയ സർക്കിൾ ക്ലിക്കുചെയ്ത് ഡ്രോപ്പ് ചെയ്യുക.
03:40 എല്ലാ മാറ്റങ്ങളും പൂർത്തിയാക്കിയ ശേഷംApply Ok. എന്നിവ ക്ലിക് ചെയുക
03:48 Reaction line ഇപ്പോൾ കട്ടിയുള്ളതും നീലയുടെ നിഴലിലുമാണെന്ന് നിരീക്ഷിക്കുക.
03:55 Reaction line ഇത് Anchor points എങ്ങനെ ചേർക്കാം എന്ന് അടുത്തതായി നമ്മൾ പഠിക്കും.
04:01 Reaction line. ൽ എന്തുകൊണ്ട് Anchor points ഉപയോഗപ്രദമാണ്
04:09 അവ ശരിയായ രൂപത്തിൽ നൽകുകയും draw area.ൽ ശരിയായ സ്ഥാനത്ത് സ്ഥാപിക്കുക.' .
04:16 നമുക്ക് CellDesigner interface.ലേക്ക് തിരികെ വരും' .
04:20 ഏതെങ്കിലും Reaction line. തെരഞ്ഞെടുക്കുക.
04:23 ഞാൻ Homoserine Succinyl Homoserine.എന്നിവക്കിടയിലുള്ള State Transition reaction line തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു
04:31 ഈ വരിയിൽ, കർസർ ഉപയോഗിച്ചു്Anchor point'എവിടെ സ്ഥാപിക്കണം എന്ന സ്ഥാനത്തു് തെരഞ്ഞെടുക്കുക.
04:39 കൃത്യമായ പോയിന്റുകളുടെ തിരഞ്ഞെടുക്കൽ അനുസരിച്ച് റായിറ്റു ക്ലിക്കുചെയ്ത് Anchor point'ചേർക്കുക.
04:47 Reaction line'ലെ കൃത്യമായ തെരഞ്ഞെടുത്ത സ്ഥാനത്ത് പുതുതായി ചേർത്തAnchor pointകാണും.
04:55 എങ്ങനെ Anchor pointഒരു പ്രതികരണ വരിയിൽ മാറ്റം വരുത്താൻ സഹായിക്കും എന്ന് ഞാൻ നിങ്ങളെ അറിയിക്കട്ടെ.
05:03 ഞാൻ ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറന്ന് അതിനെ Anchor. എന്ന് വിളിക്കാം. OK' ക്ലിക് ചെയുക
05:11 ഇപ്പോള് GTP/GDP ഐക്കൺ ൽ ക്ലിക് ചെയുക
05:18 ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ എവിടെയും ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:22 Reaction line ലെ Add Anchor point റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്ത്'
05:29 ഡ്രാഗ് ചെയ്ത എവിടെയെങ്കിലും Reaction line ഡ്രോ ഏരിയ ൽ എവിടെയെങ്കിലും ഇടുക.
05:37 അടുത്തതായി draw area. എങ്ങിനെ align ചെയ്യാം എന്ന് കാണണം എന്ന് നോക്കാം.
05:44 നമുക്ക്e Methionine ബയോ സിന്തെസിസ് പ്രോജക്ട് ഡയഗ്രാം വിൻഡോയിലേക്ക് തിരിച്ചു വരാം
05:50 ഹൈലിലൈറ്റുചെയ്തReaction line.അൺചെക്കുചെയ്യുന്നതിനുള്ള സമനിലയിൽ എവിടെയും ക്ലിക്കുചെയ്യുക.'
05:56 ഇപ്പോൾ'Shift' കീ അമർത്തിപ്പിടിക്കുക, draw area.Speciesക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. '
06:04 Edit മെനുവിലേക്ക് പോവുക, താഴോട്ട് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത Alignment തിരഞ്ഞെടുത്ത Alignment type. ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:15 മറ്റൊരു രീതിയിൽ ടൂൾബാറിൽAlignment ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:21 നിങ്ങളുടെ സ്വന്തം ഉപകരണത്തിലെ മറ്റ് Alignment ഓപ്ഷനുകൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക.
06:27 നമുക്ക് വിന്യാസം മായ്ച്ച് മുന്നോട്ട് പോകാം.
06:31 Reaction, എന്ന പേരിൽ പ്രവർത്തിക്കുമ്പോൾ, process diagram?ത്തിൽ Reaction ids എങ്ങനെ കാണിക്കാനോ മറയ്ക്കാനോ കഴിയുമോ?
06:39 നമുക്ക് പഠിക്കാം.
06:41 'View', എന്നതിലേക്ക് പോകുക, 'Show Reaction Id'.അൺചെക്ക് ചെയ്യുക.
06:48 draw area ലെ ഓരോ റിയക്ഷന്റെയും Reaction ids വീണ്ടും ദൃശ്യമാകില്ല.
06:55 Reaction Id do the following.കാണിക്കാൻ നിങ്ങൾ ആഗ്രഹിക്കുന്നു.'
07:01 draw area. ൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്ത്' അതാതു 'Reaction ids ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
07:08 Reaction ids draw area. ൽ ബന്ധപ്പെട്ട reactions എന്നതിൽ ദൃശ്യമാവുന്നു.'
07:15 'Draw area' ലെ എല്ലാ ഘടകങ്ങളും components '(Compartment, Species or Reaction) നോട് ചേർക്കാം.
07:21 അത് എങ്ങനെ ചെയ്യണമെന്ന് പഠിക്കാം.
07:24 'Draw area' ലെ Species എന്നതിൽ റൈറ്റ്-ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:28 ഞാൻ CoA. ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:32 താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് ‘Species Notes’. ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
07:35 ഒരു പോപ്പ് അപ്പ് മെനു പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നു
07:38 ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ്‘Species Notes’. പോപ്സ്. അപ്പ് Species കളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ടെക്സ്റ്റ് ടൈപ്പുചെയ്യുക
07:46 ഞാൻ താഴെ പറയും.
07:49 'OK'.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:51 നോട്ട്സ് വിവരം Notes Area.ൽ കാണിക്കുന്നു.
07:58 ഒരുപക്ഷേ,Species,ൽ എആഡ് നോട്സ് ചേർക്കുന്നതിന്, draw area. യിൽ Species ക്ലിക് ചെയുക
08:06 ഞാൻ Succinate.എന്നതിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും.
08:09 ശേഷം CellDesigner വിൻഡോ ന്റെ താഴെ വലതു വശത്തായി കാണുന്നEdit Notes ക്ലിക് ചെയ്യുക.
08:18 ഒരു പോപ്പ് അപ്പ് വിൻഡോ പ്രത്യക്ഷപ്പെടും.
08:21 Species- ബന്ധപ്പെട്ട വാചകം ടൈപ്പുചെയ്യുക -
08:25 ഞാൻ ടൈപ്പ് ചെയ്ത് 'OK' 'ക്ലിക്കുചെയ്യും.
08:30 അതേ രീതിയിൽ നമുക്ക് Protein.തിരുത്താവുന്നതാണ്.
08:35 അങ്ങനെ ചെയ്യാൻ, 'draw മേഖലയിലെ ഒരു ഭാഗത്ത് റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:40 ഞാൻ 'Homoserine succinyl transferase ക്ലിക്ക് ചെയ്യും.'
08:46 Edit Protein. താഴേക്കു സ്ക്രോൽ ചെയുക
08:51 Protein 'എന്ന പേരിൽ ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് സ്ക്രീനിൽ കാണുന്നു.
08:55 Protein എന്ന നെയിം ബോക്സിൽ നൽകുക.
09:00 ഞാൻ O-succinyltransferase എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക.
09:06 ‘Update’ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് ഡയലോഗ് ബോക്സ് ക്ലോസ് ചെയ്യുക.
09:11 നമുക്ക് Protein. ൽ പ്രദേശങ്ങൾ ചേർക്കാം.
09:15 'Draw area' ലെ Protein.എന്നതിൽ വലത്-ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
09:19 ഞാൻ O-succinyltransferase.ൽ റായിറ്റു ക്ലിക്ക് ചെയ്യും.'
09:24 Edit Protein. ലീക്ക് സ്ക്രോൽ ചെയുക
09:29 ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ്, Protein,ക്രീനിൽ കാണുന്നു.
09:33 residues/regions’ ടാബ് നു കീഴിൽ 'Add' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
09:40 ഡയലോഗ് ബോക്സിൽ - 'ModificationResidue / Bindingregion' :
09:46 ഡ്രോപ്പ് ഡൗൺ മെനുവിൽ ‘Binding region.എന്നതിനായുള്ള‘Type’ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
09:52 ആവശ്യമായ മൂല്യത്തിൽ കഴ്സർ നീക്കി വലുപ്പവും ആംഗിളും മാറ്റുക.
09:59 ഈ ഡെമോയ്ക്ക് ഞാൻ, Size 15 ഉം Angle 38 ഉം സെലക്ട് ചെയ്യും
10:09 എന്നിട്ട് ‘Close’.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
10:12 Updateക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.


10:14 ബോക്സ് അടയ്ക്കുക.
10:17 Methionine Biosynthesis, ൽ റീജിയൻ ചേർക്കാൻ ഞങ്ങൾ ആവശ്യപ്പെടുന്നില്ല, ഞാൻ ഈ മാറ്റങ്ങൾ പഴയപടിയാക്കും.
10:25 അടുത്തതായി, വിവരങ്ങൾ എഡിറ്റുചെയ്യാൻ പഠിക്കാം.
10:30 'Draw area' ലെ component റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
10:33 ഞാൻ Homoserine ക്ലിക്ക് ചെയ്യും.
10:37 താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Edit Information’. ക്ലിക് ചെയുക
10:41 ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ്‘Edit Information’.സ്ക്രീനില് ദൃശ്യമാകുന്നു
10:46 ഡയലോഗ് ബോക്സിൽ ഇനി പറയുന്നവ ‘state’ ടാബ് നു കീഴിൽ Open. തിരഞ്ഞെടുക്കുക
10:54 prefix’ ടാബ് നു കീഴിൽ mt തിരഞ്ഞെടുക്കുക
10:59 ടാബ് ‘label’ നു കീഴിൽ dna.തിരഞ്ഞെടുക്കുക
11:04 ‘Ok’.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
11:07 നിങ്ങൾക്ക് ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ പ്രദർശിപ്പിച്ചിരിക്കുന്ന വിവരം 'mt: dna' കാണാം
11:15 Edit Information, അൺ ഡൊ ചെയ്യും Methionine Biosynthesis.ൽ ആവശ്യമില്ല'
11:23 ചില സന്ദർഭങ്ങളിൽ, e process diagram ഒരു സങ്കീർണ്ണമായ ഒന്നായിരിക്കും.
11:28 അത്തരം സന്ദർഭങ്ങളിൽ, ഒരു വലിയ മോഡലിന് നാവിഗേറ്റ് ചെയ്യാൻ അനുയോജ്യമാണ്.
11:37 view ഐക്കൺ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
11:41 Bird’s Eye View.ൽ ചുവന്ന ചതുരം വലിച്ചിടുക.
11:46 'Draw area' ലെ വ്യൂ നു അനുസരിച്ച് നീങ്ങുന്നു.
11:52 ഇത് നമ്മെ ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിന്റെ അവസാന ഭാഗത്തെത്തിക്കുന്നു.
11:56 സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് എങ്ങനെയാണു പഠിച്ചത്: Reaction line,ൽ നിറവും രൂപവും വീതിയും മാറുന്നത്
12:07 Reaction line, ൽ Align Components And show/hide Reaction id’s


12:18 ആഡ് നോടസ് ൽ എങ്ങനെ Components, ചേർക്കുക,
12:23 എഡിറ്റ് Protein/Gene എഡിറ്റ് ഇൻഫർമേഷൻ ,
12:27 ഡയഗ്രത്തിലെ Bird’s Eye View കാണുക.
12:32 അസൈൻമെന്റിനായി ഒരു ഗ്ലൈക്കലൈസി പ്രൊസസ്സ് തയ്യാറാക്കുക ഡയൽഗ്രാം CellSsigner ലെ ടൂൾസ് ഉപയോഗിക്കുന്നു.
12:41 Reaction line ലെ വ്യത്യസ്ത ആകൃതികൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക
12:47 താഴെയുള്ള ലിങ്കിൽ വീഡിയോ കാണുക ഇത് സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു.
12:52 നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ അത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക.
12:57 'സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട്' ടീം - പരിശീലന ശിൽപശാലകൾ നടത്തി, ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫികറ്റുകൾ നൽകുന്നു.
13:06 കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് contact@spoken-tutorial.org ൽ എഴുതുക
13:13 'സ്പോട്ട് ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്റ്റ്' 'ടോക്ക് ടു എ ടീച്ചർ പ്രൊജക്ടിന്റെ ഭാഗമാണ്.' 'ഇത് എൻഎച്ച്ഇഐഡി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ ഗവൺമെൻറ് ആണ്. ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ നൽകിയിരിക്കുന്ന ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്.
13:29 ഇത് 'ഐഐടി ബോംബെയ്' ൽ നിന്ന് വിജി നായർ

പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

Contributors and Content Editors

Prena