CellDesigner/C2/Getting-Started-with-CellDesigner/Malayalam

Time	Narration
00:01	Getting started with CellDesigner.എന്നതിലെ സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം'
00:05	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ നമ്മൾ പഠിക്കും: CellDesigner നെ കുറിച്ച്, Menu Tool ബാറുകൾ
00:13	സെൽ ഡിസൈൻ വർക്ക്സ്പെയ്സിൽ വ്യത്യസ്ത areas
00:17	Species Reactions എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്ന സെൽ ഡിസൈനിംഗിലെ Components
00:23	എങ്ങനെയാണ് ഒരു ലളിതമായ നെറ്റ്വർക്ക് സൃഷ്ടിക്കുന്നതെന്ന് നമ്മൾ പഠിക്കും
00:27	ഒരു നെറ്റ്വർക്ക് സംരക്ഷിക്കുക
00:29	ഒരു ഇമേജ് എക്സ്പോർട് ചെയ്യുക
00:30	ഒരു നെറ്റ്വർക്ക് എങ്ങനെ സൂം ചെയ്യണം
00:33	ജീൻ-റെഗുലേറ്ററി ആൻഡ് ബയോകെമിക്കൽ നെറ്റ്വർക്കുകൾ വരയ്ക്കുന്നതിനുള്ള പ്രക്രിയ ഡയഗ്രം എഡിറ്ററാണ് CellDesigner'
00:40	'കിറ്റാനോ ബയോളജി മാർക്കപ്പ് ലാംഗ്വേജ്' ('SBML') ഉപയോഗിച്ച് ഈ ഡയഗ്രമുകൾ സംഭരിക്കപ്പെടുന്നു.
00:50	ഞാൻ Windows XP ഉം സെൽ ഡെസിഗ്നറും ഉപയോഗിക്കുന്നു 4.2 ലിനക്സ്, മാക് ഒഎസ് എക്സ് എന്നിവയിൽ സെൽ ഡെസിഗ്നറും പ്രവർത്തിക്കുന്നു.
01:00	CellDesigner തുറക്കാൻ, ഡസ്ക്ടോപ്പിൽ കുറുക്കുവഴി CellDesigner ഐക്കണിൽ ഡബിൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
01:07	ഇത് സെൽഡിസൈൻ തുറക്കും, ഇപ്പോൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യാം.
01:12	'menu' ബാനിലെ File, Edit,Component ,View, Database തുടങ്ങിയവ. നു
01:24	Main Menu കീഴിൽ' വിവിധ Toolbars. കാണും.
01:30	എഡിറ്റിംഗ്, സ്പീഷീസ്, പ്രതികരണങ്ങൾ, കംപാർട്ട്മെന്റുകൾ തുടങ്ങിയവയ്ക്കായി Toolbars. ഉണ്ട്.
01:38	നമ്മൾ പോകുമ്പോൾ അവയിൽ ചിലതു നമുക്ക് പഠിക്കും.
01:42	നമുക്ക് സെൽ ഡിസൈൻ വർക്ക്സ്പെയ്സിന്റെ വിവിധ ഭാഗങ്ങളെക്കുറിച്ച് പഠിക്കാം.
01:48	നിങ്ങൾക്ക് കാണാനാകുന്നതുപോലെ, 5 എറിയാസ് ഉണ്ട്.
01:52	വലത് വശത്ത് 'Draw' ഏറീയ
01:55	ഇതാണ് നമ്മൾ നെറ്റ്വർക്കുകൾ വരയ്ക്കുന്നത്.
01:58	'Draw' 'മേഖലയിൽ കാണുന്ന ഏതൊരു രൂപവും ഉദാഹരണം - ദീർഘചതുരം, ഒരു ഓവൽ അല്ലെങ്കിൽ ഒരു ലൈൻ സെഗ്മെന്റ്' Component.
02:08	species, reactions compartment.എന്നതിന്റെ പൊതുവായ പദം ആണ് കം പോണേന്റ്
02:14	ഈ സിമ്പോൾ പട്ടികയും സെൽഡെസൈൻ വെബ്സൈറ്റിലെ www.celldesigner.org ' അവരുടെ അർത്ഥവും നമുക്ക് കാണാം. അത്
02:29	ഞാൻ Documents
02:33	ഇനി നമുക്ക് Startup guide ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. അത് മറ്റൊരു ടാബിലും ഉണ്ട്.
02:40	ഞാൻ 82 നമ്പരിലേക്ക് നേരിട്ട് പോകും.
02:45	വിവിധ ചിഹ്നങ്ങളും അവയുടെ അർത്ഥങ്ങളും ഇവിടെ കാണാം.
02:51	നമുക്ക് സെൽ ഡിസൈൻ വിൻഡോയിലേക്ക് തിരികെ പോകാം.
02: 55	'Draw' ഏ റിയ ക്കു താഴെ Listഏ റിയ
02:59	ഇവിടെ ഒരു മോഡലിന്റെ കമ്പോണന്റ്സ് പ്രവർത്തനങ്ങളും പ്രദർശിപ്പിക്കാൻ കഴിയും.
03:06	Notes പ്രദേശം ഘടകത്തിന്റെ കുറിപ്പുകൾ പ്രദർശിപ്പിച്ച് എഡിറ്റുചെയ്യുന്നതിന് ഉപയോഗിക്കുന്നു.
03:12	ഒരു വൃക്ഷഘടനയിൽ ഘടകങ്ങൾ കാണിക്കുന്ന ഒരുTree ഏ റിയ ഇടതു വശത്തുണ്ട്.
03:21	താഴെയുള്ള ഓരോ ലേയറുകളും പ്രദർശിപ്പിക്കുന്ന Layer ഏരിയയാണ്.
03:27	ബോർഡർലൈനുകൾ ഡ്രാഗ് ചെയ്യുന്നതിലൂടെ പ്ഏരിയ യുടെ വലിപ്പം മാറാവുന്നതാണ്.
03:33	ഞാൻ കഴ്സർ ബോർഡർ ലൈനിൽ സ്ഥാപിക്കും. നിങ്ങൾക്ക് ഒരു ഇരട്ട തലയുമുള്ള അമ്പടയാളം കാണാം. പ്രദേശം വലുതാക്കുന്നതിനോ കുറയ്ക്കുന്നതിനോ ഇത് വലിച്ചിടുക.
03:45	List & Notes ഏരിയ പ്രദേശത്തിന്റെ സ്ഥാനം മാറ്റാൻ
03:50	View ഓപ്ഷൻ ൽ പോകുക Listൽ ക്ലിക്കുചെയ്ത്Right.തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
03:56	ഇത് വലതുവശത്തുള്ള പട്ടികയെ മാറ്റുന്നു. ഡീഫോൾട് ആയി ഒരെണ്ണം താഴെ .
04:00	നമുക്ക് സ്ലൈഡിലേക്ക് തിരിച്ചുപോകാം.
04:05	ഞങ്ങൾ സൃഷ്ടിക്കുന്ന ലളിതമായ നെറ്റ്വർക്ക് ആണ് ഇത്.
04:10	ഈ നെറ്റ്‌വർക്ക് ൽ പ്രോടീൻ A' പ്രോടീൻ B ആയി ട്രാന്സിഷമാണ് ചെയുന്നു .പ്രോടീൻ കാറ്റേ ലൈസിസ്
04:21	പ്രോട്ടീൻ 'B' 'ഉൾക്കൊണ്ടാണ് പ്രോട്ടീൻ' D ആയി മാറുന്നത്.
04:27	ഈ ട്രാൻസിഷൻ പ്രോട്ടീൻ 'E' 'ആണ്.
04:32	നമുക്ക് ഈ നെറ്റ്വർക്ക് സൃഷ്ടിക്കാം.
04:34	ഞാൻ സെൽ ഡിസൈൻ വിൻഡോയിലേക്ക് തിരികെ പോകും.
04:39	ഫയൽ ഇപ്പോൾ പുതിയത് ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:43	‘New Document’ എന്ന പേരിൽ ഒരു ചെറിയ ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കും.
04:48	ഇത് name ഫീൽഡ് ആണ്.
04:50	ഞാൻ “simple network” ടൈപ്പുചെയ്യും
04:53	ആവശ്യമുള്ളത്ര ഉയരവും വീതിയും ഇവിടെ മാറ്റാം. എന്നിരുന്നാലും, ഞാൻ ഡിഫാൾട്ട് ഉയരവും വീതിയും നിലനിർത്തും.
05:03	OK.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. 'Draw' 'ഏരിയ യുടെ മുകളിൽ ഇടതുഭാഗത്തായി കാണപ്പെടുന്ന പേര് നിങ്ങൾക്ക് കാണാം.
05:12	ഇപ്പോള് എഡിറ്റു ചെയ്തതിനുശേഷംGrid snap Grid visible. 'എന്നിവ പ്രാപ്തമാക്കുക.
05:21	'Draw' 'ഏരിയ യിൽ ഒരു ഗ്രിഡ് ദൃശ്യമാകും.
05:25	Grid snap ഗ്രിഡുമായി യോജിപ്പിച്ച് ഘടകങ്ങൾ ശരിയായി ക്രമീകരിക്കും.
05:29	Grid visible ഡീകോം ചെയ്യാൻ കഴിയും.
05:34	ഞങ്ങൾ ഘടകങ്ങൾ ചേർക്കാൻ തുടങ്ങുന്നതിനു മുമ്പ്, സ്പീഷീസുകളും പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങളും നിങ്ങൾക്ക് ചില ഉദാഹരണങ്ങൾ കാണിച്ചു തരാം.
05:42	നമുക്ക് ആദ്യം ഈ സ്പീഷീസ് . കാണാൻ കഴിയും.
05:45	generic protein, receptor, ion channel, truncated protein, gene, RNA . 'എന്നിവയ്ക്കായുള്ള ചിഹ്നങ്ങൾ ഇവിടെയുണ്ട്.
05:58	ഇപ്പോൾ റിയാക്ഷന്സ് ഇതാദ്യമായാണ്State transition, Heterodimer association, Dissociation, Catalysis, Inhibition etc.
06:11	നമ്മൾ Species ടൂൾബാറിലെ ആദ്യ ഐക്കൺ അതിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് തിരഞ്ഞെടുക്കും. ഈ ഐക്കൺ പ്രോട്ടീനുകൾക്കുള്ളതാണ്.
06:22	Draw Area യിൽ എവിടെയും ക്ലിക്കുചെയ്യുക, അവിടെ നിങ്ങൾ ഈ സ്പീഷീസ് സ്ഥാപിക്കാൻ ആഗ്രഹിക്കുന്നു.
06:28	Draw Area യിൽ ഇടതുവശത്ത് ഞാൻ അതിനെ സ്ഥാപിക്കും.
06:33	ഒരു ചെറിയ ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറന്നു പറയും, ഈ സ്പീഷീസ് ന്റെ പേര്.
06:39	പുതിയസ്പീഷീസ് 'A' ആയി പ്രഖ്യാപിച്ച് OK ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:46	ലിസ്റ്റ് ഏരിയ മാറ്റവും കാണുക.
06:50	നിങ്ങൾക്കൊരു പുതിയ സ്പീഷിസ് കൂട്ടിച്ചേർക്കാൻ കഴിയുമെന്ന് കാണാൻ കഴിയും, 'Draw Area' . അതുപോലെ ഞാൻ 'B' 'ചേർക്കും.
06:58	നിങ്ങൾ എഡിറ്റുചെയ്യുന്നതിനോ നീക്കുന്നതിനോ മുമ്പായി നിങ്ങൾ ഒരു ഘടകം തിരഞ്ഞെടുക്കേണ്ടതുണ്ട്.
07:03	അവ തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിന് componentക്ലിക്കുചെയ്യുക. നിങ്ങൾ അത് തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിനു മുമ്പ് തിരഞ്ഞെടുത്ത ഐക്കൺ ഉണ്ടെന്ന് ഉറപ്പുവരുത്തുക.
07:12	A ക്കു അടുത്ത് B കൂടാതെ 'എ' എനിക്കും ആവശ്യമുണ്ട്. അങ്ങനെ 'B' ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
07:17	'A' എന്നതിന് അടുത്തായി അത് ഡ്രാഗ് ചെയുക
07:21	ഒരു ഘടകം എങ്ങനെ മാറ്റം വരുത്താം എന്ന് ഇപ്പോൾ നമുക്ക് കാണാം.
07:24	ഞാൻA എന്നതിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും. അതിൽ ചെറിയ ചതുരം കാണുന്നു.
07:29	വലിപ്പം മാറ്റാനുള്ള ഹാൻഡിലുകളാണ് ഇവ.
07:32	ഞാൻ ഈ കഴ്സറിൽ കഴ്സർ സൂക്ഷിച്ച് വലിച്ചിടുക.
07:36	A യുടെ വലിപ്പം മാറിയിരിക്കുന്നു.
07:39	ഞങ്ങൾ പിന്നീട് ട്യൂട്ടോറിയലിൽ പഠിക്കുന്ന ഘടകത്തിന്റെ വലുപ്പം മാറ്റുന്നതിനുള്ള മറ്റൊരു മാർഗമുണ്ട്.
07:46	നിങ്ങൾക്ക് 'Ctrl-Z' ഉപയോഗിച്ച് മുമ്പത്തെ ക്രിയകൾ “undo" ചെയുക
07:52	“re-do”,ചെയ്യാൻ ആഗ്രഹിക്കുന്നെങ്കിൽ, 'Ctrl-Y' അമർത്തുക.
07:54	പൂർവാവസ്ഥയിലാക്കാൻ, വീണ്ടും ചെയ്തതിന് ഐക്കണുകളിൽ ക്ലിക്കുചെയ്ത് ഇത് നേരിട്ട് ചെയ്യാൻ കഴിയും
08:03	ഇപ്പോൾ റിയാക്ഷന്സ് ചേർക്കാം.
08:06	രണ്ട് വസ്തുക്കൾ തമ്മിലുള്ള ഇന്റെറാക്ഷൻ ആണ് ഒരു പ്രതികരണം.
08:09	ഇത് ഒരു സ്റ്റേറ്റ് ട്രാന്സിഷൻ റിയാക്ഷൻ .
08:12	അപ്പോൾ Reaction ടൂൾബാറിൽ State transition എന്ന ഐക്കണിൽ ഞാൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും.
08:18	A ന്റെ ഏതെങ്കിലും വശവും ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:23	അപ്പോൾ, A B. എന്നതിൽ റിയാക്ഷൻ ആരോ നിങ്ങൾ കാണും.
08:30	ആദ്യം തിരഞ്ഞെടുക്കുന്ന കംപോണന്റ് റിയാക്റ്റന്റ് ആയി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു.
08:35	അതിനാൽ എല്ലായ്പ്പോഴും ആദ്യം റിയാക്ടൻറുകൾ തിരഞ്ഞെടുക്കാൻ ഓർമ്മിക്കുക.
08:39	ഡിഫാൾട് റിയാക്ഷൻ ഐഡി 're1' ആയി വരുന്നു.
08:43	ഇപ്പോള് C യില് ചേര്ക്കുകയും നേരത്തെയുള്ള സ്ലൈഡില് ഉചിതമായ സ്ഥാനത്ത് തുടരുകയും ചെയ്യും.
08:54	ഈ ഐക്കൺ ഞാൻ Reactionടൂൾബാറിൽ നിന്നും തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു. ഇത് 'കാറ്ററലിസിനു വേണ്ടിയുള്ളതാണ്' '.
09:00	'c' , യുടെ എഡിജി ചെക് ചെയ്യാം State transition റിയക്ഷന്റെ ന്റെ സ്ക്വയർ ചിഹ്നം ഞാൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും.
09:08	ഇപ്പോൾ ഞാൻ സ്പീഷിസ് D ചേർക്കുകയും അത് ബി കൂടാതെ ഇത് സ്ഥാപിക്കുകയും ചെയ്യും.
09:15	B 'യിൽ നിന്നും D' യുടെ 'State Transition' റിയാക്ഷൻ ചേർക്കാം. ഡിഫാൾട് റിയാക്ഷൻ ഐഡി re2 ആണ്.
09:26	ഞാൻ സ്പീഷീസ് ചേർക്കുകയും മുമ്പത്തെ സ്ലൈഡിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ ഉചിതമായ സ്ഥാനത്ത് തുടരുകയും ചെയ്യും.
09:35	ഇപ്പോൾ Reaction ടൂൾബാർ മുതൽ Inhibition reaction പ്രതിനിധീകരിച്ച് ഞാൻ ഈ ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കും.
09:44	'E' 'എന്നതിന്റെ വശവും' State transition റിയക്ഷന്റെ സ്ക്വയർ ചിഹ്നത്തിലും ഞാൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും. ഇത് രണ്ട് പോയിന്റുകളിലായി ചേരും.
09:54	ഇപ്പോൾ നമുക്ക് ലളിതമായ നെറ്റ്വർക്ക് കാണാം.
09:57	നമുക്ക് നമ്മുടെ പ്രവൃത്തി സംരക്ഷിക്കാം.
10:00	'ഫയല്' എന്നതിലേക്ക് പോകുക Save as. ആയി ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
10:04	ഞാൻ അതിനെ“Simple Network” . എന്ന പേരിൽ പറയും.
10:06	ഇത് ഞങ്ങളുടെ പ്രവർത്തനം '.xml' ഫോർമാറ്റിൽ സംരക്ഷിക്കും. Save.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക
10:12	ഇപ്പോൾ ഒരു ഇമേജ് എങ്ങനെയാണ് എക്സ്പോർട്ട് ചെയ്യാൻ പഠിക്കുക. ഇത് ചെയ്യുന്നതിന്, File ലെ Export Image. എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
10:22	pdf, png, jpeg തുടങ്ങിയവ പോലുള്ള വിവിധ ഫോർമാറ്റുകളിൽ ഇമേജ് സംരക്ഷിക്കാൻ കഴിയും.
10:29	ഞാൻ അതിനെ 'jpeg' ഇമേജായി സംരക്ഷിക്കും. Save.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
10:35	നമുക്ക് എങ്ങനെ നെറ്റ്വർക്ക് സൂം ചെയ്യണമെന്നു നോക്കാം.
10:38	നമുക്ക് സൂമിനുള്ള 4 ഓപ്ഷനുകൾ ഉണ്ട് - Zoom In, Zoom Out, Zoom Fit. Zoom Reset .
10:47	ഞാൻ Zoom In ഐക്കൺ രണ്ടുതവണ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും. നമുക്ക് വലുപ്പമുള്ള ചിത്രം കാണാം.
10:54	ഇപ്പോൾ Zoom Reset. എന്നതിൽ ഞാൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യും. നെറ്റ്വർക്കിന്റെ യഥാർത്ഥ വലുപ്പത്തിലേക്ക് മടങ്ങുന്നു.
11:02	ഇത് നമ്മളെ കുറിച്ചുള്ള സ്പോക്കണ് ട്യൂട്ടോറിയലിന്റെ അവസാന ഭാഗത്തെത്തിക്കുന്നു. CellDesigner ഉപയോഗിച്ച് ആരംഭിക്കുക.
11:08	ചുരുക്കത്തിൽ, ഞങ്ങൾ സെൽ ഡിസൈൻ മെനുവിലും ടൂൾ ബാറിനേയും കുറിച്ച് പഠിച്ചു.
11:14	CellDesigner ലെ വിവിധ മേഖലകൾ. സ്പീഷീസുകളും റിയാക്ഷന്സ് പോലുള്ള കമ്പോണന്റ്സ്
11:20	സ്പീഷീസുകളും റിയാക്ഷന്സ് കമ്പോണന്റ്സ് ഉപയോഗിച്ച് ലളിതമായ ഒരു നെറ്റ്വർക്ക് ഞങ്ങൾ സൃഷ്ടിച്ചു.
11:26	എങ്ങനെയാണ് സൂം ചെയ്യേണ്ടതെന്നും നെറ്റ്വർക്കിനെ സംരക്ഷിച്ച് ഒരു ചിത്രം കയറ്റുമതി ചെയ്യുന്നതെന്നും ഞങ്ങൾ മനസ്സിലാക്കി.
11:32	ഒരു അസൈൻമെന്റ് എന്ന നിലയിൽ സെൽ ഡിസൈനർ 4.2 സഹായത്തോടെ ഒരു നെറ്റ്വർക്ക് നിർമ്മിക്കുക
11:39	ഈനെറ്റ്‌വർക്ക് ൽ എ, ബി പ്രോട്ടീൻ അസോസിയേറ്റ്സ് ഒരു സങ്കീർണ്ണ ഘടന (കോംപ്ലക്സ് 1) ഉണ്ടാക്കുന്നു.
11:51	ഡിറ്ററസ്ട്രി പ്രോട്ടീൻ ഡി ആകുമ്പോൾ ഈ കോംപ്ലക്സ് തരംതാഴ്ത്തപ്പെടുന്നു.
11:58	നിങ്ങൾക്ക് ഇതുപോലുള്ള ഒരു നെറ്റ്വർക്ക് ലഭിക്കേണ്ടതുണ്ട്.
12:01	താഴെയുള്ള ലിങ്കിൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക ഇത് സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു, നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, നിങ്ങൾക്ക് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്.
12:13	സ്പോക്കണ് ട്യൂട്ടോറിയല് പ്രോജക്ട് ടീം സ്പോക്കണ് ട്യൂട്ടോറിയലുകള് ഉപയോഗിച്ച് വര്ക്ക്ഷോപ്പ് നടത്തുന്നു. ഒരു ഓണ്ലൈന് ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവര്ക്ക് ജിവിതത്തിന്റെ സര്ട്ടിഫിക്കറ്റുകള് കൂടുതല് വിവരങ്ങള്ക്ക്, contact@hotmail.com എന്ന വിലാസത്തില് ബന്ധപ്പെടാന് എഴുതുക.
12:28	സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്റ്റ് ടാക്ക് ടു എ ടീച്ചർ പ്രോജക്റ്റിന്റെ ഭാഗമാണ്, ഇതിനെ പിന്തുണക്കുന്നത് നാഷണൽ മിഷൻ ഓൺ എഡ്യൂക്കേഷൻ ത്രൂ ഐസിടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ
12:41	ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ സ്പോക്കൺ ഹൈഫൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ ഡോട്ട് ഓർഗ് സ്ലേഷ് NMEICT ഹൈഫൻ ആമുഖത്തിൽ ലഭ്യമാണ്
12:53	ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബയിൽ നിന്ന് വിജി നായർ ആണ്. ചേരുന്നതിന് നന്ദി. വിട.

Contributors and Content Editors

Prena