UCSF-Chimera/C2/Writing-Commands/Hindi
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Revision as of 19:45, 16 January 2018 by Shruti arya (Talk | contribs)
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00:01 | Chimera में Writing Commands ट्यूटोरियल पर आपका स्वागत है। |
00:06 | इस ट्यूटोरियल में हम कमांड्स टाइप करेंगे display को परमाणुओं में बदलने के लिए |
00:12 | ribbons को दर्शाने और छिपाने के लिए |
00:14 | amino acid residues का रंग बदलने के लिए |
00:18 | एक एक residues को लेबल करने के लिए। |
00:21 | solvent अणुओं को हटाने के लिए और इमेज को भिन्न-भिन्न फॉर्मेट में सेव करने के लिए। |
00:28 | इस ट्यूटोरियल के अनुसरण के लिए आपको स्नातक स्तर की Biochemistry का ज्ञान होना चाहिए। |
00:34 | Structural Biology और Chimera interface से अवश्य परिचित होने चाहियें। |
00:40 | संबधित ट्यूटोरियल्स के लिए कृपया हमारी वेबसाइट पर जाएँ। |
00:44 | इस ट्यूटोरियल को रिकॉर्ड करने के लिए मैं Ubuntu Linux ओ एस वर्जन 14.04 और chimera वर्जन 1.10.2 का उपयोग कर रही हूँ। |
00:53 | Mozilla firefox ब्राउज़र 42.0 और एक कार्यकारी इन्टरनेट कनेक्शन। |
01:00 | Chimera विंडो को खोलने के लिए Chimera आइकॉन पर डबल क्लिक करें। |
01:06 | graphics window को खोलने के लिए lightning bolt icon पर क्लिक करें। |
01:10 | इस ट्यूटोरियल में हम दर्शाएंगे कि संरचना में बदलाव लाने के लिए commands को कैसे प्रयोग करना है। |
01:16 | Favorites मेनू का प्रयोग करके Command Line खोलें। |
01:20 | Chimera विंडो के तल में एक command text box दिखाई देता है। |
01:25 | menus से होने वाली टास्कस को commands द्वारा किया जा सकता है। |
01:31 | Chimera Commands के बारे में |
01:34 | Chimera commands, Command line पर प्रविष्ट किये जाते हैं। |
01:38 | semicolon सेपरेटर से विभिन्न commands एक लाइन में संयुक्त किये जा सकते हैं। |
01:43 | command को निष्पादित करने के लिए Enter key दबाएँ। |
01:47 | पहले वाले commands पर command History से जाया जा सकता है। |
01:51 | commands के बारे में ज्यादा जानकारी दिए हुए लिंक पर दर्शायी गयी है। |
01:56 | Chimera विंडो पर वापस जाएँ। आइये एक command टाइप करके leucine zipper का एक मॉडल खोलते हैं। |
02:03 | command एक command वर्ड से शुरू होता है। |
02:06 | command line टेक्स्ट बॉक्स पर, open space 1zik टाइप करें। |
02:13 | आपको एक एक कार्यकारी इन्टरनेट कनेक्शन की जरुरत होती है। |
02:17 | command को निष्पादित करने के लिए Enter दबाएँ। |
02:20 | संरचना स्क्रीन पर दिखाई देती है। |
02:23 | ribbons डिस्प्ले को atoms में बदलने के लिए command line text box में टाइप करें: The command word display और एंटर दबाएँ। |
02:34 | अब हमारे पास atoms display में protein की संरचना है। |
02:38 | ये संरचना आंशिक रूप से ribbons की तरह प्रदर्शित होती है। |
02:42 | ribbons छुपाने के लिए – टाइप करें wave symbol जो tilda की तरह भी जाना जाता है। उसके बाद command वर्ड ribbon टाइप करें। |
02:51 | tilda के साथ कमांड रिवर्स फंक्शन को दिखाता है। |
02:55 | यहाँ, संकेत tilda इसके बाद ribbon keyword ribbons को छुपा देता है।
एंटर दबाएँ। |
03:03 | हम atoms, bonds, surfaces को रंगीन बनाने के लिए color command का उपयोग कर सकते हैं। |
03:10 | उदहारण के लिए सारे leucines का रंग बदलने के लिए टाइप करें: Color space yellow space colon और इसके बाद amino acid के लिए तीन अक्षर का लघु रूप। |
03:24 | leucine के लिए, मैं टाइप करुँगी leu. |
03:28 | यहाँ color yellow argument के साथ command word है और संरचना के सारे leucines टारगेट है। |
03:37 | यदि आप टारगेट का विशेष विवरण नहीं देते हैं तो पूरी संरचना पीले रंग में रंगी होगी।
एंटर दबाएँ। |
03:45 | panel का निरिक्षण करें, सारे leucines अब पीले रंग में हैं। |
03:51 | हम एक विशेष स्थान के amino acid को एक खास रंग से रंग सकते हैं। |
03:56 | उदहारण के लिए histidine का रंग बदलने के लिए, जो की chain B पर स्थान 18 पर उपस्थित है, टाइप करें:
color space red space colon18.B और एंटर दबाएँ। |
04:13 | पेनल का निरिक्षण करें, histidine अब लाल हो गया है। |
04:19 | पूरी संरचना के डिस्प्ले को CPK spacefill में बदलने के लिए, rep टाइप करें। |
04:26 | rep कीवर्ड represent का संक्षिप्त रूप है, rep space sphere; एंटर दबाएँ। |
04:37 | पेनल का निरिक्षण करें। |
04:39 | संरचना को stick डिस्प्ले पर वापस लाने के लिए, पुन्हा टाइप करें rep space stick और एंटर दबाएँ। |
04:50 | solvent अणुओं को संरचना से छुपाने के लिए, टाइप करें- del (मिटाने के लिए) space solvent.
एंटर दबाएँ। |
05:02 | चुनाव के लिए residues को सक्रिय करने के लिए, वर्ड select command का उपयोग करें।
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05:08 | command line टेक्स्ट बॉक्स पर टाइप करें, select space colon उसके बाद रेज़िडियु की संख्या एवं chain |
05:18 | उदहारण के लिए chain B पर स्थान 28 पर उपस्थित lysine को सक्रिय करने के लिए, टाइप करें, select space colon उसके बाद 28 dot B. एंटर दबाएँ। |
05:34 | अब चुने हुए residue का label दिखाने के लिए, टाइप करें rlabel space sel
एंटर दबाएँ। |
05:44 | पेनल का निरिक्षण करें, चुने हुए residue का residue label प्रदर्शित होता है। |
05:51 | पहले चुने हुए residue को अचयनित करने के लिए, select command पाने के लिए अप एरो की को दबाएँ। |
05:59 | command की शुरुआत में tilda symbol टाइप करें। एंटर दबाएँ। |
06:05 | Help menu में keywords और command index की सूची उपलब्ध है। |
06:09 | Help menu पर क्लिक करें, मेनू में नीचे जाएँ और Commands index पर क्लिक करें। |
06:16 | commands लिखने के लिए keywords की सूची के साथ एक web-page खुलता है। |
06:22 | Chimera विंडो पर वापस जाएँ। |
06:25 | यदि आप पृष्ठदृश्य यानि बैकग्राउंड के रंग को काले से नीला करना चाहते हैं, टाइप करें: background space solid space blue
एंटर दबाएँ। |
06:38 | अब पेनल का रंग नीला है। |
06:41 | Command का पुनरावृत्त करने के लिए, Command line के दाहिनी तरफ उपस्थित काले त्रिकोण पर क्लिक करें। |
06:48 | Command history पहले उपयोग किये हुए commands को सूचीबद्ध करती है। |
06:53 | Commands, Command पर क्लिक करके फिर से निष्पादित किये जा सकते हैं। |
06:57 | Command line छुपाने के लिए, ड्राप-डाउन मेनू में Hide command line विकल्प पर क्लिक करें। |
07:03 | आपकी बनायी हुई संरचना को save करने के अनेक विकल्प होते हैं, File menu को खोलें। |
07:09 | आप ये कर सकते हैं: Restore a Session, Save a Session |
07:14 | इमेज को JPEG या PNG फॉर्मेट में सेव करें। |
07:19 | इमेज को PDB या Mol2 फाइल्स में सेव करें, दृश्य इत्यादि को Export करें। |
07:27 | दर्शाने के लिए, मैं इमेज को JPEG फॉर्मेट में सेव करती हूँ। |
07:33 | Save image विकल्प पर क्लिक करें एक Save image' डायलॉग बॉक्स खुलता है। |
07:40 | फाइल लोकेशन के लिए डेस्कटॉप को चुनें। |
07:44 | File name को 1zik की तरह टाइप करें File type को JPEG की तरह चुनें। |
07:52 | इमेज के आकार को अपनी जरुरत के हिसाब से निश्चित करें। |
07:56 | दर्शाने के लिए, मैं चौड़ाई को 800 और ऊंचाई को 600 टाइप करुँगी। |
08:05 | Save बटन पर क्लिक करें इमेज डेस्कटॉप पर 1zik.jpg में सेव होती है। |
08:15 | सारांशित करते हैं कि हमने क्या सीखा है |
08:17 | इस ट्यूटोरियल में हमने कमांड्स टाइप किये, display को atoms में बदलने के लिए |
08:22 | ribbons को दर्शाने और छुपाने के लिए |
08:25 | amino acid residues का रंग बदलने के लिए |
08:28 | अलग-अलग residues को लेबल करने के लिए |
08:31 | solvent molecules को हटाने के लिए, इमेज को भिन्न-भिन्न फॉर्मेट में सेव करने के लिए। |
08:38 | अब Assignment के लिए
Human oxy-hemoglobin (PDB code: 2dn1) की संरचना लोड करने के लिए कमांड्स टाइप करें। |
08:48 | डिस्प्ले को atoms में बदलें और ribbons को छुपायें। |
08:52 | सारे histidine residues को हरे रंग में रंगें |
08:56 | solvent molecules को हटायें और इमेज को JPEG फॉर्मेट में सेव करें। |
09:03 | आपका पूरा किया असाइनमेंट निम्न प्रकार दिखना चाहिए। |
09:12 | निम्न लिंक का वीडीयो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है।
कृपया इसको डाउनलोड करें और देखें। |
09:19 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टीम कार्यशालाएं चलाती है और उनको सर्टिफिकेट देती है जो ऑनलाइन टेस्ट पास करते हैं।
ज्यादा जानकारी के लिए हमें लिखें। |
09:29 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट की वित्तीय सहायता NMEICT, MHRD, भारत सरकार द्वारा दी गयी है। |
09:35 | इस मिशन पर अधिक जानकारी दिए हुए लिंक पर उपलब्ध है। |
09:40 | आई आई टी बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य अब आपसे विदा लेती हूँ। हमें जुड़ने के लिए धन्यवाद। |