UCSF-Chimera/C2/Writing-Commands/Gujarati

Time	Narration
00:01	Chimera માં Writing Commands પરના આ સ્પોકન ટ્યુટોરીઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.
00:06	આ ટ્યુટોરીઅલમાં, displayને એટમ્સમાં ફેરવવા આપણે કમાન્ડ ટાઈપ કરીશું.
00:12	ribbonsને કેવી રીતે દેખાડવા અને અદૃશ્ય કરવા.
00:14	amino acid residuesના રંગ કેવી રીતે બદલવા
00:18	પ્રત્યેક residuesને કેવી રીતે લેબલ આપવા.
00:21	solvent મોલેક્યુલ્સને કેવી રીતે દૂર કરવા. અને ફાઇલ્સને જુદાજુદા ફોર્મેટમાં કેવી રીતે સેવ કરવી.
00:28	આ ટ્યુટોરીઅલને અનુસરવા તમને Undergraduate Biochemistryનું જ્ઞાન હોવું જોઈએ.
00:34	તમે Structural Biology અને Chimera interfaceના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.
00:40	આને સંબંધિત ટ્યુટોરીઅલ્સ માટે,અમારા વેબસાઈટની મુલાકાત લો.
00:44	આ ટ્યુટોરીઅલને રેકોર્ડ કરવા ,હું Ubuntu OS version 14.04
00:50	Chimera version 1.10.2
00:53	Mozilla firefox browser 42.0 અને એક કાર્યરત Internet connectionનો ઉપયોગ કરી રહી છું.
01:00	Chimera વિન્ડોને ખોલવા Chimera આઇકોન ઉપર બે વખત ક્લિક કરો.
01:06	graphics window ખોલવા lightning bolt icon ઉપર ક્લિક કરો.
01:10	આ ટ્યુટોરીઅલમાં , હું તમને સમજાવીશ કે કેવી રીતે commandsનો ઉપયોગ કરી સ્ટ્રકચરનો કૂશળતાપૂર્વક ઉપયોગ કરવો.
01:16	Favorites મેનુનો ઉપયોગ કરી Command Line ખોલો.
01:20	Chimera વિન્ડોમાં નીચે એક command text box દૃશ્યમાન થાય છે.
01:25	જે પણ કાર્યો menus દ્વારા અમલમાં મુકાય છે તે બધા જ commands દ્વારા પણ કરી શકાય છે.
01:31	Chimera Commands વિષે જોઈએ.
01:34	Chimera commands ને Command line ઉપર દાખલ કરવામાં આવે છે.
01:38	એક સાથે ઘણા commands ને semicolon વિભાજકો દ્વારા એક લાઈનમાં જોડી શકાય છે.
01:43	commandને અમલમાં મુકવા Enter key દબાવો.
01:47	અગાઉના commands, command Historyમાંથી મેળવી શકાય છે.
01:51	commands વિશે વધુ માહિતી આ આપેલ લિંક ઉપરથી મેળવી શકાય છે.
01:56	Chimera window ઉપર પાછા આવો. ચાલો leucine zipperનું મોડેલ command ટાઈપ કરીને ખોલીએ.
02:03	આ command એક command word સાથે શરુ થાય છે.
02:06	command line ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર , ટાઈપ કરો open space 1zik.
02:13	તમને આ પગલાં માટે એક કાર્યરત Internet connectionની જરૂર પડશે.
02:17	commandને અમલમાં મુકવા Enter દબાવો.
02:20	સ્ક્રીન ઉપર એક સ્ટ્રક્ચર દ્રશ્યમાન થાય છે.
02:23	ribbons ડિસ્પ્લેને atomsમાં ફેરવવા , command line text boxમાં ટાઈપ કરો : command word display . અને Enter દબાવો.
02:34	તો હવે આપણે protein સ્ટ્રક્ચર atoms displayમાં મેળવ્યું છે.
02:38	સ્ટ્રક્ચર આંશિક રૂપે ribbons તરીકે રજુ થાય છે.
02:42	ribbonsને અદૃશ્ય કરવા - ribbon command wordની આગળ wave symbolટાઈપ કરો , જે tilda તરીકે પણ ઓળખાય છે.
02:51	tildaસાથેનો કોઈ પણ command વિપરીત કાર્ય સૂચવે છે.
02:55	અહીં tilda ચિન્હ જે રિબન કીવર્ડ સાથે રહેલ છે તે ribbonsને અદૃશ્ય કરે છે. Enter દબાવો.
03:03	આપણે color commandનો ઉપયોગ કરી atoms, bonds, surfaces વગેરેના રંગો સેટ કરી શકીએ.
03:10	દાખલા તરીકે , બધા leucinesના રંગો બદલવા , ટાઈપ કરો :Color space yellow space colon તે પછી amino acid(અમીનો એસિડ) માટેના પ્રથમ ત્રણ અક્ષર એબ્રીવીએશન તરીકે.
03:24	leucine માટે , હું ટાઈપ કરીશ leu.
03:28	અહીં color એક command word છે જે argument તરીકે yellow અને target તરીકે સ્ટ્રકચરના બધા જ leucines સાથે છે.
03:37	જો તમે કોઈ ટાર્ગેટ સ્પષ્ટ ન કરો તો આખું જ સ્ટ્રક્ચર પીળા રંગમાં પરિવર્તીત થઇ જશે. Enter દબાવો.
03:45	panelને ધ્યાનથી જુઓ . બધા જ leucines પીળા રંગમાં દેખાય છે.
03:51	ચોક્કસ સ્થાને રહેલ amino acidને આપણે વિશિષ્ટ રીતે રંગીન કરી શકીએ.
03:56	દાખલા તરીકે histidineનો રંગ બદલવા,જે chain Bના 18માં સ્થાને રહેલ છે, ટાઈપ કરો color space red space colon18.B. Enter દબાવો.
04:13	પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. histidine હવે લાલ રંગમાં દેખાય છે.
04:19	સંપૂર્ણ સ્ટ્રકચરના દેખાવને CPK spacefillમાં બદલવા , ટાઈપ કરો rep
04:26	rep એ represent કીવર્ડ માટેનું કાપીને ટૂંકું કરેલ સ્વરૂપ છે. rep space sphere ; Enter દબાવો.
04:37	પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.
04:39	સ્ટ્રકચરને stick ડિસ્પ્લેમાં પાછું લાવવા માટે, ફરી ટાઈપ કરો rep space stickઅને Enter દબાવો.
04:50	સ્ટ્રક્ચરમાંથી solvent મોલેક્યુલ્સને અદૃશ્ય કરવા, ટાઈપ કરો - del (delete માટે) space solvent અને Enter દબાવો.
05:02	પસંદગી માટે residuesને સક્રિય કરવા, select command wordનો ઉપયોગ કરો .
05:08	command line ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો , select space colon તે પછી નંબર અને રેસિડયુની chain.
05:18	દાખલા તરીકે chain B ઉપર, 28 સ્થાને રહેલ lysineને સક્રિય કરવા ટાઈપ કરો - select space colon તે પછી 28 dot B . Enter દબાવો.
05:34	હવે સિલેક્ટ કરેલ residueના labelને બતાવવા, ટાઈપ કરો - rlabel space sel.Enter દબાવો.
05:44	પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલા residue માટેનું residue label હવે દેખાય છે.
05:51	અગાઉ સિલેક્ટ કરેલા residueને નાપસઁદ કરવા, select commandને મેળવવા અપ એરો કીને દબાવો.
05:59	commandની શરૂઆતમાં tilda symbol ટાઈપ કરો. Enter દબાવો.
06:05	keywords અને command index ની સૂચિ Help menu ઉપર ઉપલબ્ધ છે.
06:09	Help menu ઉપર ક્લિક કરો , નીચે સ્ક્રોલ કરો અને Commands index ઉપર ક્લિક કરો.
06:16	એક web-page ખુલે છે જે commands લખવા માટેના keywordsની સૂચિ બતાવે છે.
06:22	Chimera વિન્ડો ઉપર પાછા આવીએ.
06:25	જો તમે બેકગ્રાઉંગનો રંગ કાળા માંથી ભૂરામાં બદલવા માંગતા હોવ તો ટાઈપ કરો : background space solid space blue.Enter દબાવો.
06:38	પેનલ હવે ભૂરા રંગમાં દેખાય છે.
06:41	Command history જોવા ,Command lineની જમણી બાજુએ આવેલ કાળા રંગના ત્રિકોણ ઉપર ક્લિક કરો.
06:48	Command history અગાઉ ઉપયોગમાં લીધેલ commandsની સૂચિ આપે છે.
06:53	Commandsને તે command ઉપર ક્લિક કરીને ફરી અમલમાં મૂકી શકાય છે.
06:57	To hide the command lineને અદૃશ્ય કરવા , ડ્રોપ ડાઉનમાંના Hide command line વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો.
07:03	તમે બનાવેલ સ્ટ્રકચરને સેવ કરવા ઘણા વિકલ્પો ઉપલબ્ધ છે. File menu ખોલો.
07:09	તમે Restore a Session , Save a Session
07:14	ઇમેજને JPEG અથવા PNG ફોર્મેટ્સમાં સેવ કરી શકો.
07:19	ઇમેજને PDB અથવા Mol2 ફાઇલ્સ તરીકે સેવ કરો , Export sceneવગેરે.
07:27	સમજાવવા , ચાલુ હું આ ઇમેજને JPEG ફોર્મેટમાં સેવ કરું.
07:33	Save image વિકલ્પ ઉપર ક્લિક કરો. એક Save image ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
07:40	ફાઈલ લોકેશન તરીકે Desktop સિલેક્ટ કરો.
07:44	File name તરીકે 1zik ટાઈપ કરો. File type તરીકે JPEG પસંદ કરો.
07:52	ઈમેજનું માપ તમારી જરુરીઆત તરીકે નિશ્ચિત કરો.
07:56	તે સમજાવવા , હું વીડ્થ 800 અને હાઈટ 600 ટાઈપ કરીશ.
08:05	Save બટન ઉપર ક્લિક કરો. ઇમેજ 1zik.jpg તરીકે Desktop ઉપર સેવ થઇ છે.
08:15	ચાલો આપણે શું શીખ્યા તેનો સારાંશ જોઈએ.
08:17	આ ટ્યુટોરીઅલમાં આપણે ડિસ્પ્લેને એટમ્સમાં ફેરવવા commands ટાઈપ કર્યા.
08:22	ribbonsને દેખાડ્યા અને અદૃશ્ય કર્યા.
08:25	amino acid residues.ના રંગ બદલ્યા.
08:28	પ્રત્યેક residuesના Label આપ્યા.
08:31	solvent moleculesને દૂર કર્યા. ઇમેજને જુદા જુદા ફોર્મેટમાં સેવ કરી.
08:38	હવે અભ્યાસ તરીકે Human oxy-hemoglobin (PDB code: 2dn1)ના સ્ટ્રક્ચરને લોડ કરવા commands ટાઈપ કરો.
08:48	ડિસ્પ્લે ને atomsમાં ફેરવો અને ribbonsને અદ્રશ્ય કરો.
08:52	બધા histidine residues ને લીલા રંગમાં બદલો.
08:56	solvent moleculesને દૂર કરો અને ઇમેજને JPEG ફોર્મેટમાં સેવ કરો.
09:03	તમારો પૂર્ણ થયેલ અભ્યાસ આ મુજબ દેખાશે.
09:12	આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડિઓ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે. તેને ડાઉલોડ કરો અને નિહાળો.
09:19	સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલની ટીમ આ સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરે છે અને જેઓ આ ઓનલાઇન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપે છે. વધુ માહિતી માટે, અમને આ લિંક( contact@spoken-tutorial.org) ઉપર લખો.
09:29	સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.
09:35	આ યોજના માટેની વધુ માહિતી આ લિંક ("સ્પોકન હાઈફન ટ્યુટોરીયલ ડોટ ઓઆરજી સ્લેશ NMEICT હાઈફન ઇનટ્રો") ઉપર ઉપલબ્ધ છે.
09:40	ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લાઉ છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

Contributors and Content Editors

Jyotisolanki, Shivanigada