Avogadro/C2/Build-molecules/Bengali

Time	Narration
00:01	সবাইকে শুভেচ্ছা! Build Molecules এই টিউটোরিয়ালটিতে স্বাগত।
00:07	এই টিউটোরিয়ালে, আমরা শিখব: ডাটাবেস থেকে অণু আমদানি
00:11	ঘোরানো, জুম ইন এবং জুম আউট
00:15	Panel অণু তৈরি করা
00:17	ফোর্স ফিল্ড সেট করা এবং জ্যামিতি অপটিমাইজ করা
00:21	বন্ড দৈর্ঘ্য, বন্ড কোণ, ডায়াড্রাল কোণ পরিমাপ
00:25	ফ্র্যাগমেন্ট লাইব্রেরি দেখা
00:27	DNA অণু এবং পেপটাইডস তৈরি করা।
00:31	এখানে আমি উবুন্টু লিনাক্স অপারেটিং সিস্টেমের সংস্করণ 14.04 ব্যবহার করছি। Avogadro সংস্করণ 1.1.1 কার্যক্ষম ইন্টারনেট সংযোগ
00:44	এই টিউটোরিয়াল অনুসরণ করতে, আপনার মৌলিক রসায়ন সম্বন্ধে জ্ঞান থাকা উচিত। Avogadro ডাউনলোড করতে দয়া করে দেখানো sourceforge.net/projects/avogadro লিঙ্কটি ব্যবহার করুন।
00:53	আমি ইতিমধ্যে Avogadro ডাউনলোড করেছি
00:56	Avogadro খুলতে, Dash home এ ক্লিক করুন।
01:00	সার্চ বারে, Avogadro টাইপ করুন।
01:02	অ্যাপ্লিকেশনটি খুলতে Avogadro আইকনে ক্লিক করুন।
01:08	চলুন, chemical structure database থেকে xylene অণু আমদানি করে শুরু করা যাক ।
01:15	একটি অণু আমদানি করতে, আমাদের একটি কার্যকরী ইন্টারনেট সংযোগের প্রয়োজন।
01:19	File মেনুতে ক্লিক করুন, Import -এ নেভিগেট করুন
01:23	একটি সাব-মেনু খোলে।
01:25	Fetch by chemical name নির্বাচন করুন।
01:28	Chemical name ডায়লগ বাক্স প্রদর্শিত হচ্ছে।
01:30	প্রদর্শন-এর জন্য আমি সার্চ বাক্সে xylene টাইপ করবো।
01:36	ওকে বাটনে ক্লিক করুন।
01:38	এখন আমাদের Panel-এ xyleneঅণু আছে।
01:42	চলুন Panel-এ অনু-টিকে ঘোরানো যাক।
01:45	টুলবারে ন্যাভিগেশন টুল এ ক্লিক করুন।
01:49	অণুতে কার্সার রাখুন।
01:52	বাম মাউস বাটন ধরে রাখুন এবং টানুন।
01:56	লক্ষ্য করুন direction তীরগুলি টেনে আনা নির্দেশ করে।
02:00	অণু translate করতে, ডান মাউস বাটন ব্যবহার করুন এবং টেনে আনুন।
02:06	মাউস-এর চাকা স্ক্রল করে কাঠামোটিতে জুম বাড়ান বা কমান
02:10	চলুন দেখা যাক কিভাবে একটি অণু তৈরি করতে হয়।
02:14	একটি অণু তৈরি করতে, টুল বারে ড্র টুল আইকনে ক্লিক করুন।
02:19	ড্র সেটিংস মেনুতে, আমরা দেখতে পাচ্ছি এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন বোতাম বন্ড অর্ডারড্রপ ডাউন বোতাম Adjust Hydrogens চেক বাক্স।
02:30	যদি আপনি হাইড্রোজেনগুলিকে কাঠামোর মধ্যে না চান, তাহলে Adjust Hydrogens চেক বাক্সটি অনির্বাচন করুন।
02:37	এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন, অণুগুলির তালিকা দেখায়।
02:42	সম্পূর্ণ Periodic table , একটি পৃথক উইন্ডোতে দেখতে, Other ক্লিক করুন।
02:48	উইন্ডো বন্ধ করতে Close (X) ক্লিক করুন।
02:51	Panel এ Aniline এর গঠন আঁকা যাক ।
02:55	এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন তালিকা থেকে কার্বন নির্বাচন করুন।
02:59	বন্ড অর্ডার ড্রপ ডাউন থেকে Single নির্বাচন করুন।
03:03	Panel ' এ ক্লিক করুন।
03:05	ছয় কার্বন পরমাণুর একটি বন্ধ শৃঙ্খল করতে টানুন এবং বসান।
03:10	ডাবল বন্ড দেখাতে, বন্ড অর্ডার ড্রপ ডাউন থেকে ডাবল নির্বাচন করুন।
03:16	বেঞ্জেন' কাঠামো পাওয়ার জন্য বিকল্প বন্ডগুলিতে ক্লিক করুন।
03:21	চলুন Aniline কাঠামো সম্পূর্ণ করা যাক ।
03:24	এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন তালিকা থেকে নাইট্রোজেন নির্বাচন করুন।
03:29	বন্ড অর্ডার ড্রপ ডাউন থেকে Single নির্বাচন করুন।
03:33	কাঠামোর উপর কার্বন পরমাণুগুলির যেকোনো একটিতে ক্লিক করুন এবং টেনে আনুন।
03:39	Build ' মেনুতে যান এবং Add Hydrogens নির্বাচন করুন।
03:45	Panel -এ আমাদের Aniline গঠন রয়েছে ।
03:49	একটি স্থিতিশীল রূপান্তর পেতে, Panel -এর Aniline গঠন অপ্টিমাইজ করা প্রয়োজন।
03:56	অপটিমাইজ করতে, টুলবারের Auto Optimization Tool এ ক্লিক করুন।
04:02	অটো অষ্টিমাইজেশন সেটিংস মেনু বাম দিকে প্রদর্শিত হবে
04:06	Force Field ড্রপ ডাউন তালিকাতে ক্লিক করুন, MMFF94 নির্বাচন করুন।
04:13	MMFF94 সাধারণত ছোট জৈব অণুকে অপটিমাইজ করতে ব্যবহৃত হয়।
04:20	স্টার্ট বোতামে ক্লিক করুন।
04:23	এই অপ্টিমাইজেশান সম্পূর্ণ করতে কয়েক সেকেন্ড লাগবে।
04:28	'অপ্টিমাইজেশান সেটিংস বন্ধ করতে Stop এ ক্লিক করুন।
04:33	চলুন Aniline-এর বন্ড দৈর্ঘ্য, বন্ডের কোণ এবং ডাইডিড্রাল অ্যাঙ্গেলস পরিমাপ করা যাক।
04:40	টুল বারে Click to Measure আইকন নির্বাচন করুন।
04:44	দূরত্ব পরিমাপ করতে, দুইটি পরপর কার্বন পরমাণুতে ক্লিক করুন।
04:49	কোণ পরিমাপ করতে, 3 টি পরপর পরমাণুতে ক্লিক করুন।
04:55	ডায়াড্রাল অ্যাঙ্গেলস' পরিমাপ করতে, 4 টি পরপর পরমাণুতে ক্লিক করুন।
05:02	পরিমাপ করা মানগুলি Panel এর নীচে প্রদর্শিত হয়।
05:07	ফাইলটি সংরক্ষণ করতে, File এবং Save As এ ক্লিক করুন।
05:13	Save Molecule As ডায়ালগ বক্সটি প্রদর্শিত হচ্ছে।
05:17	ফাইলের নাম হিসাবে Aniline.cml টাইপ করুন।
05:21	অবস্থান হিসাবে ডেস্কটপ চয়ন করুন এবং Save বোতামটি ক্লিক করুন।
05:28	নতুন উইন্ডো খুলতে New আইকনে ক্লিক করুন।
05:32	Avogadro সফটওয়্যারটিতে fragment লাইব্রেরি ব্যবহার করে জটিল অণু নির্মাণের একটি বৈশিষ্ট্য রয়েছে।
05:38	Build মেনুতে যান।
05:40	Insert এ নেভিগেট করুন এবং ফ্র্যাগমেন্ট বিকল্পটি নির্বাচন করুন।
05:45	Insert Fragment ডায়ালগ বক্স খুলে গেছে ।
05:49	আমরা বিভিন্ন রাসায়নিক কাঠামোর cml ফাইলগুলির ফোল্ডারগুলির তালিকা দেখতে পাচ্ছি।
05:55	উদাহরণস্বরূপ চলুন alkenes ফোল্ডারটি খুলুন।
06:00	ফোল্ডারটির বিষয়বস্তু দেখতে ফোল্ডারে ডাবল ক্লিক করুন।
06:04	2-methyl-buta-1,3-diene.cml নির্বাচন করুন ।
06:10	Insert বোতামে ক্লিক করুন
06:13	ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করতে Close ক্লিক করুন।
06:17	2-methyl-buta-1,3-diene কাঠামো Panel এ প্রদর্শিত হচ্ছে।
06:22	এটি সাধারণভাবে Isoprene নামে পরিচিত।
06:26	আমরা Isoprene ব্যবহার করে অনেক প্রাকৃতিক পণ্য তৈরি করতে পারি
06:30	অণুটি নির্বাচন মোডে রয়েছে।
06:33	অ-নির্বাচন করতে, একসাথে CTRL, SHIFT' এবং A কী টিপুন।
06:39	একটি উদাহরণ হিসাবে: আমি Isoprene ব্যবহার করে তৈরি করা Vitamin A and natural rubber দেখানো ।
06:47	Vitamin A, natural rubber
06:51	আমি একটি কোণে Isoprene অনুবাদ করবে।
06:56	Build মেনুতে ক্লিক করুন, Insert এ নেভিগেট করুন এবং Fragment নির্বাচন করুন।
07:02	macrocycles ফোল্ডার অবধি স্ক্রোল করুন; খুলতে ডাবল ক্লিক করুন
07:08	porphin অংশ নির্বাচন করুন এবং Insert' ক্লিক করুন।
07:14	ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করুন।
07:16	porphyrin' অংশ ব্যবহার করে, আমরা জটিল রাসায়নিক কাঠামো তৈরি করতে পারি: যেমন ক্লোরোফিল এবং ভিটামিন বি 12।
07:25	ক্লোরোফিল
07:27	ভিটামিন বি 12
07:30	DNA' এবং পেপটাইডস মতো জটিল অণু, Avogadro ব্যবহার করে সহজেই তৈরি করা যায়।
07:37	New আইকন ব্যবহার করে একটি নতুন উইন্ডো খুলুন।
07:41	DNA অণুর সন্নিবেশ করার জন্য, Build মেনুতে যান Insert এ যান এবং উপ-মেনু থেকে DNA/RNA ' ক্লিক করুন ।
07:51	Insert Nucleic Acids ডায়ালগ বক্স প্রদর্শিত হবে।
07:55	DNA/RNA Builder ড্রপ ডাউন থেকে DNA নির্বাচন করুন।
08:00	চারটি nucleic acid bases বোতাম হিসেবে দেখা যাচ্ছে ।
08:05	nucleic acid ক্রম নির্বাচন করতে বোতামে ক্লিক করুন।
08:10	আপনি অ্যাসিড এর নিজস্ব ক্রম চয়ন করতে পারেন।
08:14	আমি প্রদর্শন-এর জন্য, A T G C A T G C. নির্বাচন করবো
08:26	নিউক্লিক এসিড-গুলির নির্বাচনের ক্রম Sequence টেক্সট বক্সে প্রদর্শিত হচ্ছে।
08:32	Bases Per Turn ড্রপ ডাউন এ, A নির্বাচন করুন, "5" নির্বাচন করুন: যা প্রতি হেলিক্স-এ base জোড়ার সংখ্যা ।
08:41	স্ট্র্যান্ডস Single হিসাবে নির্বাচন করুন এবং Insert' বোতামে ক্লিক করুন।
08:47	ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করতে Close এ ক্লিক করুন।
08:51	এখন আমাদের Panel এ একটি একতন্ত্রী DNA' অণু আছে ।
08:56	গঠনটি জুম আউট করুন এবং Panel এর কেন্দ্রে টানুন।
09:01	Panel-এ DNA অণুটি অনির্বাচিত করতে CTRL, Shift এবং A কী-তিনটি একসাথে টিপুন ।
09:09	আমরা পেপটাইড ক্রম তৈরি করতে Insert মেনুর পেপটাইড বিকল্পও ব্যবহার করতে পারি।
09:16	আবার নতুন উইন্ডো খুলতে New আইকনে ক্লিক করুন।
09:21	Build মেনুতে যান এবং পেপটাইড এ স্ক্রোল করুন।
09:26	Insert Peptide ডায়ালগ বক্স প্রদর্শিত হচ্ছে ।
09:29	অ্যামিনো অ্যাসিড বোতামগুলি ক্লিক করে পেপটাইড ক্রমের জন্য অ্যামিনো অ্যাসিড নির্বাচন করুন।
09:36	প্রদর্শন-এর জন্য আমি Glycine(Gly) -Valine(Val) -Proline(Pro) and Cystine(Cys) অনুসারে ক্রমটি নির্বাচন করবো।
09:45	Sequence টেক্সট বক্সে নির্বাচন করার ক্রমটি প্রদর্শিত হয়।
09:50	Insert Peptide বোতামে ক্লিক করুন
09:53	Insert Peptide ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করুন।
09:57	পেপটাইড চেইনটি Panel-এ প্রদর্শিত হচ্ছে ।
10:00	Panel-এর পেপটাইড''-টি অনির্বাচন করতে, CTRL, Shift এবং A একসাথে টিপুন।
10:07	আপনি আপনার পছন্দমত অ্যামিনো অ্যাসিড নির্বাচন করতে পারেন এবং পেপটাইড ক্রম তৈরি করতে পারেন।
10:13	এর সংক্ষিপ্ত বিবরণ
10:15	এই টিউটোরিয়ালে আমরা শিখেছি:
10:18	ডাটাবেস থেকে আমদানি অণু
10:21	ঘোরানো, জুম ইন এবং জুম আউট
10:24	Panel-এ অণু তৈরি করা
10:26	ফোর্স ফিল্ড সেট করা এবং জ্যামিতি অপটিমাইজ করা
10:30	বন্ড ধৈর্ঘ্য, বন্ড কোণ, ডায়াড্রাল কোণ পরিমাপ করা
10:35	ফ্র্যাগমেন্ট লাইব্রেরি দেখানো
10:37	DNA অণু এবং পেপটাইড তৈরী করা ।
10:41	একটি অনুশীলনী হিসাবে - নিম্নলিখিত অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ ব্যবহার করে একটি প্রোটিন ক্রম তৈরি করুন:
10:49	UFFফোর্স ফিল্ড ব্যবহার করে জ্যামিতি অপটিমাইজ করা
10:53	ছবি .cml হিসাবে সংরক্ষণ করা ।
10:58	Nucleic acids: AUGC ব্যবহার করে RNA ক্রম তৈরি করা
11:04	MMFF94 ফোর্স ফিল্ড' ব্যবহার করে জ্যামিতি অপটিমাইজ করা
11:10	ছবিটি .cml ফাইল হিসাবে সংরক্ষণ করা ।
11:14	এই ভিডিওটি স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায়
11:18	যদি আপনার ভাল ব্যান্ডউইডথ না থাকে, তাহলে আপনি এটি ডাউনলোড করে দেখতে পারেন।
11:23	আমরা স্পোকেন টিউটোরিয়ালগুলি ব্যবহার করে কর্মশালা পরিচালনা করি এবং সার্টিফিকেটগুলি দিযে থাকি । আমাদের সাথে যোগাযোগ করুন ।
11:30	স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্পটি ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা পরিচালিত হয়।
11:36	অন্তরা এই টিউটোরিয়ালটি অনুবাদ এবং রেকর্ড করেছেন । যোগদান করার জন্য ধন্যবাদ।

Contributors and Content Editors

Antarade, Kaushik Datta