Avogadro/C2/Build-molecules/Gujarati

Time	Narration
00:01	સૌને નમસ્તે !! Build Molecules ના આટ્યુટોરીયલમાં આપનું સ્વાગત છે.
00:07	આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે ડેટાબેઝમાંથી અણુંઓ આયાત કરવાનું શીખીશું.
00:11	રોટેટ કરવું,ઝૂમ ઈન કરવું અને ઝૂમ આઉટ કરવું.
00:15	પેનલ પર અણુંઓ બનાવવું.
00:17	ફોર્સ ફિલ્ડ સેટ કરવું.અને જોમેટ્રી ઓપ્ટિમાઇઝ કરવું.
00:21	બોન્ડ લેન્થસ , બોન્ડ એન્ગલસ અને ડાઇહાઇડ્રલ એન્ગલ્સ માપવું.
00:25	ફ્રેગમેન્ટ લાઇબ્રેરી બતાવવું.
00:27	DNA molecules અને Peptides બનાવવું.
00:31	અહીંયા હું ઉપયોગ કરી રહ્યો છું Ubuntu Linux OS version 14.04 Avogadro version 1.1.1 કાર્યરત Internet connection .
00:44	આ ટ્યૂટોરિઅલ અનુસરવા માટે તમને basic school Chemistry નું જ્ઞાન હોવું જોઇએ. '  Avogadro ડાઉનલોડ કરવા માટે કૃપા કરીને દર્શાવેલી લિંક ઉપયોગ કરો.   sourceforge.net/projects/avogadro.
00:53	મેં Avogadro પહેલેથી જ ડાઉનલોડ કરેલ છે.
00:56	Avogadro ખોલવા માટે   Dash home   પર ક્લિક કરો.
01:00	સર્ચ બારમાં avogadro ટાઈપ કરો.
01:02	એપ્લિકેશન ખોલવા માટે Avogadro આઇકોન પર ક્લિક કરો.
01:08	ચાલો હવે chemical structure database માંથી xylene અણું આયાત કરીને શરુ કરીયે.
01:15	અણું આયાત કરવા માટે આપણને કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કન્નેકશન ની જરૂર હોય છે.
01:19	File મેનુ પર ક્લિક કરો, Import પર જાઓ.
01:23	સબ-મેનુ ખુલે છે.
01:25.	Fetch by chemical name પસંદ કરો.
01:28	Chemical name ડાયલોગ બોક્સ દેખાય છે.
01:31	નિર્દેશન માટે હું સેર્ચ બોક્સ માં xylene ટાઈપ કરીશ.
01:36	OK બટન પર ક્લિક કરો.
01:38	હવે Panel પર અમારી પાસે xylene અણું છે.
01:42	Panel પર અણું રોટેટ કરો.
01:45	ટૂલ બાર પર Navigation tool પર ક્લિક કરો.
01:49	અણું પર કર્સર મૂકો.
01:52	માઉસનું ડાબું બટન દબાવી રાખો અને ડ્રેગ કરો.
01:56	નોંધ લો કે ડાયરેક્શન એરોસ ડ્રેગ ને સૂચવે છે.
02:00	અણુંને ખસેડવા માટે, જમણા માઉસ બટન વાપરો અને ડ્રેગ કરો.
02:06	સ્ટ્રકચને ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ કરવા માટે માઉસ વ્હીલને સ્ક્રોલ કરો.
02:10	ચાલો અણું કેવી રીતે બનાવવું તે શીખીએ
02:14	અણું બનાવવા માટે, ટૂલ બાર પર Draw Tool આઇકોન પર ક્લિક કરો.
02:19	“Draw Settings ' 'મેનુ હેઠળ, આપણે જોઈ શકીએ છીએ Element ડ્રોપ ડાઉન બટન, Bond Order ડ્રોપ ડાઉન બટન, Adjust Hydrogens ચેક બૉક્સ
02:30	જો તમે સ્ટ્રક્ટચર પર હાયડ્રોજન ના ઇચ્છતા હોય તો Adjust Hydrogens ચેક બોક્સ ને અનચેક કરો.
02:37	Element ડ્રોપ ડાઉન લિસ્ટ એલિમેન્ટ્સની સૂચિ બતાવે છે.
02:42	સંપૂર્ણ Periodic table ને અલગ વિંડોમાં જોવા   Other પર ક્લિક કરો.
02:48	વિન્ડો બંધ કરવા માટે   Close  (X) પર ક્લિક કરો.
02:51	ચાલો Panel પર Aniline નું સ્ટ્રક્ટચર દોરીએ.
02:55	Element ડ્રોપ ડાઉન લિસ્ટમાંથી   Carbon પસંદ કરો.
02:59	Bond Order ડ્રોપ ડાઉનમાંથી Single પસંદ કરો.
03:03	Panel પર ક્લિક કરો
03:05	છ કાર્બન અણુંબંધ સાંકળ બનાવવા માટે ડ્રેગ કરો અને ડ્રોપ કરો.
03:10	ડબલ બોન્ડ્સ બતાવવા માટે,   Bond Order   માંથી   Double   પસંદ કરો.
03:16	Benzene સ્ટ્રક્ટચર મેળવવા માટે ‘’ alternate bonds ‘’ પર ક્લિક કરો.
03:21.	ચાલો   Aniline સ્ટ્રક્ટચર પૂર્ણ કરીએ.
03:24	Element   ડ્રોપ ડાઉન લિસ્ટમાંથી   Nitrogen  સિલેક્ટ કરો.
03:29	Bond Order  ડ્રોપ ડાઉનમાંથી Single પસંદ કરો.
03:33	સ્ટ્રક્ટચર પર કોઈપણ એક કાર્બન અણુ પર ક્લિક કરો અને ડ્રેગ કરો.
03:39	Build   મેનૂ પર જાઓ અને   Add Hydrogens પસંદ કરો.
03:45	અમારી પેનલ પર   Aniline  નું સ્ટ્રક્ટચર છે.
03:49	સ્થિર બનાવટ મેળવવા માટે,   Panel   પરના Aniline સ્ટ્રક્ટચરને ઓપ્ટીમાઇઝ્ડ કરવાની જરૂર છે.
03:56	ઑપ્ટિમાઇઝ કરવા માટે, ટૂલ બાર પર   Auto Optimization Tool   પર ક્લિક કરો.
04:02	AutoOptimization Settings   મેનૂ ડાબી બાજુએ દેખાય છે.
04:06	Force Field   ડ્રોપ ડાઉન લિસ્ટ પર ક્લિક કરો,   MMFF94 પસંદ કરો.
04:13	MMFF94  નો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે નાના ઓર્ગેનિક અણુંઓને ઓપ્ટિમાઇઝ કરવા માટે થાય છે.
04:20	Start બટન પર ક્લિક કરો.
04:23	ઓપ્ટિમાઇઝેશનને પૂર્ણ કરવા માટે થોડી સેકન્ડસ લેશે.
04:28	Optimization Settings ને બંધ કરવા માટે   Stop   પર ક્લિક કરો.
04:33	ચાલો Aniline ના bond lengths, bond angles અને dihedral angles માપીએ.
04:40	ટૂલ બાર પર Click to Measure આઇકોન પર ક્લિક કરો.
04:44	ડિસટન્સ માપવા માટે, કોઈપણ બે સળંગ કાર્બન પરમાણુઓ પર ક્લિક કરો.
04:49	એંગલ્સ માપવા માટે, કોઈ પણ 3 સળંગ પરમાણુઓ પર ક્લિક કરો.
04:55	dihedral angles માપવા માટે, 4 સળંગ પરમાણુઓ પર ક્લિક કરો.
05:02	Panel ની નીચે માપવામાં આવેલ વેલ્યુસ દેખાય છે.
05:07	ફાઇલ સેવ કરવા માટે, File અને Save As પર ક્લિક કરો.
05:13	Save Molecule As ડાયલોગ બોક્સ દેખાય છે.
05:17	Aniline.cml તરીકે ફાઇલ નામ લખો.
05:21	સ્થાન Desktop  તરીકે પસંદ કરો અને Save બટન પર ક્લિક કરો.
05:28	નવી વિંડો ખોલવા માટે New  આઇકોન પર ક્લિક કરો.
05:32	Avogadro સોફ્ટવેર પાસે fragment   લાયબ્રેરીનો ઉપયોગ કરી જટિલ અણું બનાવવાની સુવિધા છે.
05:38	Build મેનુ પર જાઓ.
05:40	Insert પર જાઓ. અને   Fragment વિકલ્પ પસંદ કરો.
05:45	Insert Fragment ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.
05:49	આપણે વિવિધ કેમિકેલ સ્ટ્રક્ટચર્સની cml ફાઈલો ધરાવતા ફોલ્ડર્સની સૂચિ જોઈ શકીએ છીએ.
05:55	ઉદાહરણ તરીકે, ચાલો alkenes ફોલ્ડર ખોલીએ.
06:00	ફોલ્ડરના કન્ટેન્ટ જોવા માટે ફોલ્ડર પર ડબલ ક્લિક કરો.
06:04	2-methyl-buta-1,3-diene.cml પસંદ કરો.
06:10	Insert બટન પર ક્લિક કરો.
06:13	ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરવા માટે Close   પર ક્લિક કરો.
06:17	2-methyl-1,3-butadiene સ્ટ્રક્ટચર Panel પર ડિસ્પ્લેય થાય છે.
06:22	તે સામાન્ય રીતે   Isoprene  તરીકે ઓળખાય છે.
06:26	અમે   Isoprene નો ઉપયોગ કરીને ઘણાં નેચરલ પ્રોડક્ટસ બનાવી શકીએ છીએ.
06:30	અણું પસંદ મોડમાં છે.
06:33	ના પસંદ કરવા માટે એકસાથે 'CTRL, SHIFT' અને A કી દબાવો.
06:39	ઉદાહરણ તરીકે: હું   Vitamin A and natural rubber   બતાવીશ જે Isoprene નો ઉપયોગ કરીને બનાવવામાં આવી હતી.
06:47	Vitamin A, natural rubber .
06:51	હું Isoprene એક ખૂણામાં ખસેડીશ.
06:56	Build મેનૂ પર ક્લિક કરો,   Insert માં શોધ કરો અને Fragment પસંદ કરો.
07:02	macrocycles ફોલ્ડરમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો; ખોલવા માટે ડબલ ક્લિક કરો.
07:09	porphin ફ્રેગમેન્ટપસંદ કરો અને Insert પર ક્લિક કરો.
07:14	ડાયલોગ બોક્સ બંધ કરો.
07:16	porphyrin ફ્રેગમેન્ટ ઉપયોગ કરીને, આપણે જટિલ કેમિકેલ સ્ટ્રક્ટચર્સ બનાવી શકીએ છીએ:
07:20	જેમ કે   Chlorophyll   અને   Vitamin B12 .
07:25	Chlorophyll
07:27	Vitamin B12.
07:30	DNA અને peptides જેવા જટિલ અણુંઓ Avogadro નો ઉપયોગ કરીને સરળતાથી બનાવી શકાય છે.
07:37	New આયકનનો ઉપયોગ કરીને નવી વિંડો ખોલો.
07:41	DNA  અણું દાખલ કરવા માટે,   Build  મેનુ પર જાઓ Insert માં શોધ કરો અને સબ-મેનુમાંથી DNA/RNA પર ક્લિક કરો.
07:51	Insert Nucleic Acids ડાયલોગ બોક્સ દેખાય છે.
07:55	DNA/RNA Builder ડ્રોપ ડાઉનમાંથી DNA પસંદ કરો.
08:00	ચાર nucleic acid bases બટનો તરીકે દર્શાવવામાં આવે છે.
08:05	nucleic acid ક્રમ પસંદ કરવા માટે બટનો પર ક્લિક કરો.
08:10	તમે તમારી પોતાનું સિકવેન્સ acids પસંદ કર શકો છો.
08:14	નિદર્શન માટે હું   A T G C A T G C  પસંદ કરીશ.
08:26	nucleic acids ના સિલેકશનનો ક્રમ Sequence ટેક્સ્ટ બૉક્સમાં દેખાશે.
08:32	Bases Per Turn  ડ્રોપ ડાઉનમાં, A પસંદ કરો, "5"સિલેક્ટ કરો : જે પ્રતિ   Helix બેઝ જોડીઓની સંખ્યા છે.
08:41	Strands  ને   Single   તરીકેપસંદ કરો અને 'Insert' બટન પર ક્લિક કરો.
08:47	ડાયલોગ બૉક્સને બંધ કરવા માટે   Close(X) પર ક્લિક કરો.
08:51	હવે Panel પર આપણી પાસે સિંગલ સ્ટેન્ડર્ડ DNA છે
08:56	સ્ટ્રક્ટચર ઝૂમ કરો અને   Panel ના કેન્દ્રમાં ડ્રેગ કરો .
09:01	Panel પર DNA અણુંને નાપસંદ કરવા,
09:04	'CTRL, Shift' અને 'A' કીઝને એકસાથે દબાવો.
09:09	અમે ' Insert મેનુમાં Peptide વિકલ્પનો ઉપયોગ કરીને Peptide ક્રમ પણ બનાવી શકીએ છીએ.
09:16	ફરીથી નવી વિન્ડો ખોલવા માટે New આયકોન પર ક્લિક કરો.
09:21	Build મેનૂ પર જાઓ, Insert સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો અને Peptide
09:26	Insert Peptide ડાયલોગ બોક્સ દેખાય છે.
09:29	amino acids બટનો પર ક્લિક કરીને Peptide ક્રમ માટે amino acids પસંદ કરો.
09:36	નિદર્શન માટે હું   Glycine(Gly) -Valine(Val) -Proline(Pro) and Cystine(Cys) 'તરીકે ક્રમ પસંદ કરીશ.
09:45	સિલેકશનનો ક્રમ   Sequence ટેક્સ્ટ બૉક્સમાં દેખાય છે.
09:50	Insert Peptide બટન પર ક્લિક કરો.
09:53	Insert Peptide ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.
09:57	Peptide ચેન Panel પર દેખાય છે.
10:00	Peptide ને Panel પર નાપસંદ કરવા માટે, 'CTRL, Shift' અને A કીઝ એકસાથે દબાવો.
10:07	તમે તમારી પસંદના   amino acids પસંદ કરી શકો છો અને Peptide ક્રમ નિર્માણ કરી શકો છો.
10:13	ચાલો સારાંશ કરીએ
10:15	આ ટ્યુટોરીયલમાં આપણે શીખ્યા:
10:19	ડેટાબેઝમાંથી અણુંઓ આયાત કરવું
10:21	રોટેટ કરવું,ઝૂમ ઈન અને ઝૂમ આઉટ કરવું
10:24	પેનલ પર અણુંઓ બનાવવું
10:27	ફોર્સ ફિલ્ડ સેટ કરવું અને જોમેટ્રી ઓપ્ટિમાઇઝ કરવું
10:30	બોન્ડ લેન્થસ , બોન્ડ એન્ગલસ અને ડાયહેડ્રલ એન્ગલ્સ માપવું.
10:35	ફ્રેગમેન્ટ લાઇબ્રેરી બતાવવું.
10:37	DNA અણુંઓ અને Peptides બનાવવું.
10:41	અસાઇનમેન્ટ તરીકે - નીચેના એમિનો એસિડ અવશેષોનો ઉપયોગ કરીને પ્રોટીન ક્રમ બનાવો:   Glu, Leu, Asn, Cys, His .
10:49	UFF ફોર્સ ફિલ્ડનો ઉપયોગ કરીને જોમેટ્રી ઑપ્ટિમાઇઝ કરો.
10:53	ઇમેજને '.cml' ફાઇલ તરીકે સેવ કરો .
10:58	Nucleic acids: AUGC નો ઉપયોગ કરીને   RNA   ક્રમ બનાવો.
11:04	MMFF94   ફોર્સ ફિલ્ડનો ઉપયોગ કરીને જોમેટ્રી ઑપ્ટિમાઇઝ કરો.
11:10	ઇમેજને '.cml' ફાઇલ તરીકે સેવ કરો.
11:14	આ વિડીયો સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.
11:18	જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિડ્થ ન હોય તો, તમે તેને ડાઉનલોડ કરી જોઈ શકો છો.
11:23	અમે સ્પોકન ટ્યુટોરિયલોનો ઉપયોગ કરીને વર્કશોપ કરીએ છીએ અને સર્ટફિકેટ્સ આપીએ છીએ. અમારો સંપર્ક કરો.
11:30	સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટને   NMEICT, MHRD Government of India   દ્વારા ભંડોળ આપવામાં આવ્યું છે
11:36	આ ટ્યુટોરીયલ ભાષાંતર કરનાર હું સંદીપ સોલંકી વિદાય લવું છું.જોડાવા બદલ આભાર.

Contributors and Content Editors

Jyotisolanki