Avogadro/C2/Build-molecules/Hindi

Time	Narration
00:01	‘Build Molecules’ के इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है।
00:07	इस ट्यूटोरियल में हम सीखेगे: डेटाबेस से अणुओं को इम्पोर्ट करना
00:11	रोटेट, ज़ूम इन और ज़ूम आउट करना
00:15	पैनल पर अणुओं को बनाना
00:17	फ़ोर्स फ़ील्ड सेट अप करना और ज्योमेट्री को उपयुक्त बनाना
00:21	बांड की लम्बाई, बांड कोण, डीहाइड्रल कोण नापना
00:25	फ्रेगमेंट लायब्रेरी दिखाना
00:27	DNA अणु और 'Peptides'बनाना।
00:31	यहाँ मैं उपयोग कर रही हूँ Ubuntu Linux OS वर्जन 14.04 'Avogadro'वर्जन 1.1.1 और एक कार्यकारी इंटरनेट कनेक्शन।
00:44	इस ट्यूटोरियल का अनुसरण करने के लिए आपको केमिस्ट्री यानि रसायन शास्त्र का बुनियादी ज्ञान होना चाहिए। 'Avogadro'डाउनलोड करने के लिए कृपया प्रदर्शित लिंक का उपयोग करें 'sourceforge.net/projects/avogadro'
00:53	मैंने पहले से ही 'Avogadro'डाउनलोड कर लिया है।
00:56	Avogadro खोलने लिए 'Dash home'पर क्लिक करें।
01:00	सर्च बार में टाइप करे 'Avogadro'
01:02	एप्लीकेशन को खोलने के लिए 'Avogadro' आइकन पर क्लिक करें।
01:08	'chemical structure database'से 'xylene'अणुको इम्पोर्ट करके शुरू करते हैं।
01:15	अणु के इम्पोर्ट के लिए हमे कार्यकारी इंटरनेट कनेक्शन की आवश्यकता होगी।
01:19	'File ' मेन्यू पर क्लिक करें। 'Import'पर जाएँ।
01:23	एक sub-menu खुलेगा।
01:25	'Fetch by chemical name'चुनें।
01:28	'Chemical name'डायलॉग बॉक्स खुलता है।
01:30	प्रदर्शन के लिए मैं सर्च बॉक्स में 'xylene' टाइप करुँगी।
01:36	'OK'बटन पर क्लिक करें।
01:38	अब हमारे पास 'पैनल'पर xylene अणु है।
01:42	अब 'पैनल'पर अणु को रोटेट हैं।
01:45	टूल बार में 'Navigation tool'पर क्लिक करें।
01:49	अणु पर कर्सर रखें।
01:52	माऊस के बाएं बटन को दबाएंऔर खींचें।
01:56	ध्यान दें डायरेक्शन एरोज़ ड्रैग को इंगित कर रहे हैं।
02:00	अणु को ट्रांसलेट करने के लिए माऊस के दाहिने बटन का उपयोग करें और खीचे खींचें।
02:06	संरचना को zoom in और zoom out करने के लिए माऊस के पहिये को स्क्रॉल करें।
02:10	अब सीखते हैं कि अणु को कैसे बनाते हैं।
02:14	अणु को बनाने के लिए ,टूल बार में 'Draw Tool'आइकन पर क्लिक करें।
02:19	Draw Settings मेन्यू में हम निम्न देख सकते हैं 'Element'ड्राप डाउन बटन 'Bond Order'ड्राप डाउन बटन 'Adjust Hydrogens'चेक बॉक्स
02:30	यदि आप संरचना में हाइड्रोजन्स नहीं चाहते है तो 'Adjust Hydrogens'चेक बॉक्स को अन-चेक करें।
02:37	'Element'ड्राप डाउन सूची तत्वों की सूची दिखाती है।
02:42	एक अलग विंडो में पूरी 'Periodic table'दिखाने के लिए 'Other'पर क्लिक करें।
02:48	विंडो को बंद करने के लिए 'Close' (X) पर क्लिक करें।
02:51	अब पैनल पर Aniline की संरचना बनाएं।
02:55	'Element'ड्राप डाउन सूची से 'Carbon'का चयन करें।
02:59	Select Single Bond Order ड्राप डाउन से Single का चयन करें।
03:03	Click on the Panel . 'पैनल'पर क्लिक करें।
03:05	6 कार्बन परमाणुओं की एक बंद श्रृंखला बनाने के लिए खींचें और छोड़े।
03:10	To show double bonds, select Double from Bond Order drop dowडबल बॉन्ड्स दिखाने के लिए Bond Order ड्राप डाउन से Double का चयन करें।
03:16	Click on alternate bonds to obtain Benzene structure. Benzene संरचना प्राप्त करने के लिए वैकल्पिक बाँड्स पर क्लिक करें।
03:21	अब Aniline की संरचना पूरी होती है।
03:24	'Element'ड्राप डाउन सूची से 'Nitrogen'का चयन करें।
03:29	'Bond Order' ड्राप डाउन से 'Single' चयन करें।
03:33	संरचना के किसी भी एक कार्बन परमाणु पर क्लिक करें और खींचें।
03:39	'Build' मेन्यू पर जाए और Add Hydrogens का चयन करें।
03:45	अब हमारे पास पैनल पर Anilineकी संरचना है।
03:49	एक स्थिर रचना प्राप्त करने के लिए पैनल पर Aniline संरचना को उपयुक्त बनाने की ज़रूरत है।
03:56	उपयुक्त बनाने के लिए टूल बार में 'Auto Optimization Tool'पर क्लिक करें।
04:02	बायीं तरफ AutoOptimization Settings मेन्यू दिखता है।
04:06	'Force Field'ड्राप डाउन सूची पर क्लिक करें , MMFF94का चयन करें।
04:13	छोटे कार्बनिक अणुओं को उपयुक्त बनाने के लिए सामान्यतः'MMFF94'का उपयोग किया जाता है।
04:20	'Start' बटन पर क्लिक करें।
04:23	उपयुक्त बनाने के लिए ये कुछ सेकंड्स लेगा।
04:28	' Optimization Settings' 'को बंद करने के लिए 'Stop' पर क्लिक करें।
04:33	अब Aniline की बॉन्ड की लम्बाई कोण और डीहाइड्राल कोण को नापते हैं।
04:40	टूल बार में Click to Measure आइकन का चयन करें।
04:44	दूरी नापने के लिए किसी भी दो क्रमागत कार्बन परमाणुओं पर क्लिक करें।
04:49	कोण नापने के लिए किन्हीं तीन क्रमागत परमाणुओं पर क्लिक करें।
04:55	डीहाइड्राल कोण नापने के लिए किन्हीं चार क्रमागत परमाणुओं पर क्लिक करें।
05:02	नापी हुई वैल्यूज़ पैनल पर नीचे दिखती हैं।
05:07	फाइल सेव करने के लिए Fileऔर Save Asपर क्लिक करें।
05:13	Save Molecule Asडायलॉग बॉक्स खुलता है।
05:17	फाइल का नाम Aniline.cmlलिखें।
05:21	स्थान 'Desktop' चुनें और 'Save'बटन पर क्लिक करें।
05:28	नई विंडो खोलने के लिए 'New' आइकन पर क्लिक करें।
05:32	' Avogadro सॉफ्टवेर में 'fragment' लाइब्रेरी का उपयोग करके जटिल अणुओं को बनाने की सुविधा है।
05:38	'Build' मेन्यू पर जाएँ।
05:40	'Insert' पर जाएँ और Fragment'विकल्प का चयन करें।
05:45	Insert Fragment डायलॉग बॉक्स खुलता है।
05:49	हम विभिन रासायनिक संरचनाओ की 'cml'फाइल वाले फोल्डर की सूची देख सकते हैं।
05:55	उदाहरण के लिए , alkenes फोल्डर खोलें।
06:00	फोल्डर की विषय-वस्तु देखने के लिए फोल्डर पर डबल क्लिक करें।
06:04	2-methyl-buta-1,3-diene.cml का चयन करें।
06:10	. 'Insert' बटन पर क्लिक करें।
06:13	डायलोग बॉक्स बंद करेने के लिए 'Close'पर क्लिक करें।
06:17	पैनल पर 2-methyl-1,3-butadiene की संरचना दिखती है।
06:22	इसे सामान्यतः 'Isoprene.कहते हैं।
06:26	हम Isoprene का उपयोग करके बहुत से प्राकृतिक उत्पाद बना सकते है।
06:30	अणु अब चयन मोड में है।
06:33	अचयनित करने के लिए CTRL, SHIFT और A'कीज़ को एक साथ दबाएं।
06:39	उदाहरण के लिए मैं 'Vitamin A'और 'natural rubber'दिखाऊँगी जो Isoprene उपयोग करके बनाये गए थे।
06:47	'Vitamin A'और 'natural rubber'
06:51	मैं 'Isoprene'को एक कोने में ट्रांसलेट करुँगी।
06:56	' Build मेन्यू पर क्लिक करें, 'Insert'पर जाएँ और Fragment का चयन करें।
07:02	macrocycles फोल्डर में नीचे जाए; खोलने के लिए डबल क्लिक करें।
07:08	porphin फ्रेगमेंट का चयन और Insertपर क्लिक करें।
07:14	डायेलॉग बॉक्स बंद करें।
07:16	'porphyrin'फ्रेगमेंट उपयोग करके हम जटिल रासायनिक संरचनायें बना सकते है, जैसे 'Chlorophyll'और 'Vitamin B12'
07:25	Chlorophyll
07:27	Vitamin B12.
07:30	Avogadro उपयोग करके जटिल अणु जैसे DNA और peptides आसानी से बनाये जा सकते हैं।
07:37	New आइकन उपयोग करके एक नई विंडो खोलें।
07:41	एक DNA अणु को इन्सर्ट करने के लिए 'Build' मेन्यु पर जाकर 'Insert' पर जाएँ और सब मेन्यू से 'DNA/RNA'पर क्लिक करें।
07:51	Insert Nucleic Acids डायलॉग बॉक्स खुलता है।
07:55	DNA/RNA Builder ड्राप डाउन से 'DNA'का चयन करें।
08:00	चार 'nucleic acid bases'बटन की तरह दिखते हैं।
08:05	nucleic acid अनुक्रम चुनने के लिए बटन्स पर क्लिक करें।
08:10	आप 'acids' का अपना खुद का अनुक्रम चुन सकते हैं।
08:14	प्रदर्शन के लिए मैं A T G C A T G C.का चयन करुँगी।
08:26	nucleic acids के चयन का अनुक्रम 'Sequence' टेक्स्ट बॉक्स में दिखता है।
08:32	'Bases Per Turn'ड्राप डाउन में A चुनें, "5"चुनें: जो कि ‘बेस पेयर्स पर Helix'की संख्या है।
08:41	'Strands' में ‘Single’ चुने और 'Insert'बटन पर क्लिक करें।
08:47	डायलॉग बॉक्स बंद करने के लिए ' Close'पर क्लिक करें।
08:51	अब हमारे पास पैनल पर एकल स्ट्रैन्डेड 'DNA'अणु है।
08:56	संरचना को ज़ूम आउट करें और पैनल के बीच तक खींचें।
09:01	पैनल पर DNA अणु को अचयनित करने के लिए 'CTRL, SHIFT'और 'A' कीज़ को एक साथ दबाएं।
09:09	हम 'Insert' मेन्यू में Peptide विकल्प उपयोग करके एक Peptide अनुक्रम भी बना सकते है।
09:16	नई विंडो खोलने के लिए फिर से 'New'आइकॉन पर क्लिक करें।
09:21	'Build' मेन्यू पर जाकर 'Insert'और 'Peptide'तक नीचे जाएँ।
09:26	Insert Peptide डायलॉग बॉक्स दिखता है।
09:29	amino acids बटन पर क्लिक करके Peptide अनुक्रम के लिए amino acids का चयन करें।
09:36	प्रदर्शन के लिए मैं निम्न क्रम में चयन करुगी 'Glycine(Gly) -Valine(Val) -Proline(Pro) और Cystine(Cys)’
09:45	Sequence टेक्स्ट बॉक्स में चयन का क्रम दिखता है।
09:50	. Insert Peptide बटन पर क्लिक करें।
09:53	Insert Peptide डायलॉग बॉक्स को बंद करें।
09:57	पैनल पर Peptide श्रृंखला दिखती है।
10:00	पैनल पर Peptide को अचयनित करने के लिए CTRL, SHIFT और A कीज़ को एक साथ दबाएं।
10:07	आप अपनी पसंद के amino acids का चुनाव कर सकते हैं और Peptide अनुक्रम बना सकते हैं।
10:13	अब सारांशित करते हैं ।
10:15	x इस ट्यूटोरियल में हमने सीखा
10:18	डेटाबेस से अणुओ को इम्पोर्ट करना
10:21	रोटेट, ज़ूम इन और ज़ूम आउट करना
10:24	पैनल पर अणु बनाना
10:26	फ़ोर्स फ़ील्ड सेट अप करना और ज्योमेट्री को उपयुक्त बनाना
10:30	बॉन्ड की लम्बाई ,बॉन्ड कोण डीहाइड्राल कोण नापना
10:35	फ्रेगमेंट लाइब्रेरी दिखाना
10:37	DNA अणु और Peptides बनाना।
10:41	एक असाइंमेंट के रूप (नियत कार्य) में निम्नलिखित अमीनो एसिड रेसिड्यूज़ का उपयोग करके प्रोटीन अनुक्रम बनाएं।
10:49	UFFफ़ोर्स फ़ील्ड उपयोग करके ज्योमेट्री को उपयुक्त बनाएं।
10:53	इमेज को .cml फाइल की तरह सेव करें।
10:58	‘Nucleic acids: AUGC'उपयोग करके ‘RNA’ का अनुक्रम बनाएं।
11:04	'MMFF94'फ़ोर्स फ़ील्ड उपयोग करके ज्योमेट्री को उपयुक्त बनाएं।
11:10	इमेज को .cml फाइल की तरह सेव करें।
11:14	यह विडियो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है।
11:18	अच्छी बैंडविथ न मिलने पर भी आप इसे डाउनलोड करके देख सकते हैं।
11:23	हम स्पोकन ट्यूटोरियल्स का उपयोग करके कार्यशालाएं आयोजित करते हैं और प्रमाण पत्र देते है, कृपया हमसे संपर्क करें।
11:30	स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट NMEICT, MHRD भारत सरकार द्वारा वित्त पोषित है।
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Contributors and Content Editors

Jayarastogi, Shruti arya