Jmol-Application/C3/Structures-from-Database/Gujarati

Time	Narration
00:01	જેમોલ એપ્લીકેશનમાં Structures from Databases પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છે.
00:07	આ ટ્યુટોરીયલમાં, આપણે આપેલ શીખીશું,
00:10	PubChem ડેટાબેસ થી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરવા અને
00:14	GChemPaint માં બનાવેલ 2D સ્ટ્રક્ચર ને Jmol માં 3D માં બદલતા.
00:21	આ ટ્યુટોરીયલનાં અનુસરણ માટે તમને Jmol Applicationનું જ્ઞાન હોવું અનિવાર્ય છે.
00:27	જો નથી, તો નીચે આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ સંદર્ભિત ટ્યુટોરીયલો નિહાળો.
00:33	આ ટ્યુટોરીયલ રેકોર્ડ કરવા માટે, હું વાપરી રહ્યી છું .
00:35	ઉબુન્ટુ લીનક્સ OS આવૃત્તિ. 12.04
00:40	Jmol આવૃત્તિ 12.2.2
00:44	Java આવૃત્તિ 7
00:46	GChemPaint આવૃત્તિ 0.12.10
00:51	Mozilla Firefox browser 22.0
00:56	મેં એક નવી જેમોલ એપ્લીકેશ વિન્ડો ખોલ્યું છે.
01:00	Jmol ડેટાબેસ યાદીબધ્ધ કંપાઉન્ડથી સ્ટ્રક્ચરને લોડ કરવાનું ફીચર ધરાવે છે.
01:07	મેનુ બાર પર ફાઈલ મેનુ 'Get MOL'. વિકલ્પ ધરાવે છે.
01:12	આ રાસાયણિક સ્ટ્રક્ચર ડેટાબેસ 'PubChem'. થી અણુ ને લોડ કરે છે.
01:17	આ Protein Data Bank થી સ્ટ્રક્ચરને લોડ કરવા માટે એક અન્ય વિકલ્પ 'Get PDB' રાખે છે.
01:26	આ વિષે વધુ જાણકારી બીજા અન્ય ટ્યુટોરીયલમાં સમજાવ્યું છે.
01:31	પેનલ પર રાસાયણિક સ્ટ્રક્ચર લોડ કરવા માટે 'Get Mol' પર ક્લિક કરો.
01:36	સ્ક્રીન પર 'Input' ડાઈલોગ બોક્સ ખુલે છે.
01:40	ડેટાબેસમાં યાદી બધ્ધ કોઈ પણ અણુ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં આપેલ ટાઈપ કરીને લોડ કરી શકાય છે :
01:48	કોમન નેમ અથવા IUPAC નેમ
01:51	CAS નંબર
01:54	CID નંબર
01:56	InChi identifier અથવા
01:58	SMILES identifier
02:01	એક ચોક્કસ કેમિકલ ના આઇડેન્ટિફિકેશન નંબરની જાણકારી માટે Pubchem ડેટાબેસની વેબસાઈટ પર જાઓ.
02:09	હવે સ્ક્રીન પર phenol દેખાય છે.
02:13	Input text box. તો ઈનપુટ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 'phenol' .
02:16	OK બટન પર ક્લિક કરો.
02:20	phenol નું મોડલ પેનલ પર દેખાય છે.
02:24	આપણે વિવિધ રેન્ડરીંગ નો ઉપયોગ કરીને phenol ના દેખાવને બદલી શકીએ છીએ.
02:30	આ વિકલ્પ Menu bar અને Pop-up menu માં યાદી બધ્ધ કરેલ છે.
02:36	આપણે phenol' ના બેન્ઝીન રીંગમાં સ્બ્સીટ્યુઅન્ટસ ઉમેરી શકીએ છીએ.
02:41	પ્રથમ મોડલમાં પરમાણુને લેબલ કરે છે.
02:45	display મેનુ પર ક્લિક કરો, અને label પસંદ કરો. number વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
02:52	હવે કાર્બન પરમાણુ નંબર 4 થી જોડાયેલા હાઇડ્રોજન નંબર 10 ને અમીનો ગ્રુપ થી બદલો.
03:00	modelkit મેનુને ખોલો, વિકલ્પ માંથી nitrogen પસંદ કરો.
03:06	hydrogen number 10 પર ક્લિક કરો.
03:09	પેનલ પર આ Para-Amino Phenol નો અણુ છે.
03:14	આપણે ડિસ્પ્લેને Sticks display થી બદલશું.
03:18	modelkit મેનુ થી બહાર જાઓ.
03:21	પોપ અપ મેનુ ખોલો, સ્ક્રોલ કરી Style પર જાઓ, Scheme પસંદ કરો Sticks વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
03:30	પેનલ પર આપણી પાસે સ્ટીક ડિસ્પ્લેમેં Para-Amino-phenol નું મોડેલ છે.
03:36	કોમ્પ્લેક્સ સ્ટ્રક્ચર જેને બનાવવું મુશ્કિલ છે,પેનલ પર સરળતાથી લોડ કરી શકાય છે.
03:42	ઉદાહરણ તરીકે cholesterol.
03:45	File મેનુ પર ક્લિક કરો.
03:47	Get Mol વિકલ્પ પર ક્લિક કરો , ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો Cholesterol .
03:54	OK બટન પર ક્લિક કરો.
03:57	પેનલ પર Cholesterol નો અણુ દેખાય છે.
04:02	આપણે અણુ માં ફીચરો જેમકે double-bond અને side-chain ને હાઈલાઈટ કરી શકાય છે.
04:08	ડબલ -બોન્ડને હાઈલાઈટ કરવા માટે પ્રથમ ડબલ -બોન્ડના કાર્બન પરમાણુના રંગ ને બદલો.
04:15	ટૂલબાર માં 'Select atoms' આઇકન પર ક્લિક કરો.
04:19	પછી ડબલ-બોન્ડમાં સામેલ થયેલ carbon પરમાણુ પર ક્લિક કરો.
04:24	પરમાણુના ચારો તરફે પીળો હેલો દેખાય છે.
04:28	Pop-up-મેનુ ને ખોલો.
04:30	Color પર સ્કોલ કરો, Atoms પસંદ કરો અને Orange વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
04:37	હવે ટૂલબાર પર “Rotate molecule” વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
04:42	cholesterol મોડલમાં ડબલ-બોન્ડ હવે નારંગી રંગ માં છે.
04:49	તેજ રીતે આપણે સાઈડ ચેનમાં કાર્બનસ ને હાઈલાઈટ કરી શકીએ છીએ.
04:54	Pop-up-મેનુનો ઉપયોગ કરીને જાંબુડી માં બદલીએ.
04:59	પેનલ પર આપણી પાસે હાઈલાઈટ કરેલ મહત્વપૂર્ણ ફીચરો સાથે Cholesterol નો મોડલ છે.
05:06	અસાઇનમેન્ટ તરીકે,
05:08	ડેટાબેસ થી caffeine નું સ્ટ્રક્ચર લોડ કરો.
05:11	અણુમાં મહ્ત્વપૂર્ણ ફીચરોને હાઈલાઈટ કરો .
05:15	ડિસ્પ્લેને wireframe માં રૂપાંતરિત કરો.
05:19	હવે હું Jmol. ના અન્ય મ્હ્ત્વપૂર્ણ ફીચર વિષે બતાવીશ.
05:24	આપણે અણુઓ ના 2D સ્ટ્રક્ચરને અન્ય સોફ્ટવેરમાં 3D મોડલમાં બદલી શકીએ છીએ.
05:31	અહી પેનલ પર મારી પાસે aminoacid Alanine મોડેલ છે.
05:36	આ અણુ નો 2D સ્ટ્રક્ચર GChemPaint. નમક સોફ્ટવેરમાં બનાવ્યો છે.
05:42	સ્ટ્રક્ચરને .mol ફાઈલ તરીકે સેવ કરેલ છે.
05:46	GchemPaint એ 2D કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર બનાવવા માટે ઓપન સોર્સ સોફ્ટવેર છે .
05:51	GChemPaint પર ટ્યુટોરિયલ્સ આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ છે.
05:56	સ્ટ્રક્ચરને બનાવવા અને .મોલ ફોરમેટમાં સેવ કરવા માટે Analysis of Compounds ટ્યુટોરિયલ જુઓ.
06:05	આ Gchempaint પર ડિસ્પ્લે એરિયા 2D ડ્રોઈંગ બતાડ્યા પ્રમાણે છે.
06:10	Amino acid -Alanine
06:12	Nuclioside -Adenosine
06:14	Saccharide -Alpha-D glucopyranose
06:19	મેં આને .mol ફોરમેટમાં ડેસ્કટોપ પર સેવ કર્યું છે.
06:24	પ્રથમ Alanine ના 2D સ્ટ્રક્ચરને Jmol Application માં 3D મોડલમાં જોઈએ છીએ,
06:32	તો હું નવો Jmol વિન્ડો ખોલીશ.
06:36	ટૂલબારમાં Open a file' આઇકન પર ક્લિક કરો.
06:40	હું ડેસ્કટોપDesktop ફોલ્ડર પસંદ કરીશ અને open પર ક્લિક કરીશ.Alanine.mol ફાઈલ પસંદ કરો અને open પર ક્લિક કરો.
06:51	સ્ક્રીન પર 'Alanine' નું મોડલ દેખાય છે.
06:55	modelkit મેનુ ખોલો અને 'fix hydrogens and minimize' વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
07:03	સ્ટ્રક્ચર પર Hydrogens ઉમેર્યા છે અને એનર્જી મીનીમાઇઝ કરી છે.
07:08	.mol ફાઈલની જેમ,આપણે મેનુબાર અને પોપ-અપ મેનુનો પણ ઉપયોગ કરીને ડિસ્પ્લે બદલી શકીએ છીએ.
07:15	અહી Jmol. માં Adenosine.mol નું 3D મોડલ છે.
07:19	અને આ Jmol. માં Alpha-D-glucopyranose.mol નું 3D મોડલ છે.
07:25	ચાલો સારાંશ લઈએ.
07:27	આ ટ્યુટોરીયલ માં આપણે શીખ્યા
07:32	Pubchem ડેટા બેસથી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.
07:34	Phenol અને Cholesterol ના ડિસ્પ્લે રૂપાંતરણ કરતા.
07:38	GChemPaint માં બનેલ 2D સ્ટ્રક્ચરને જેમોલમાં 3D મોડલ્સમાં બદલતા.
07:44	Alanine, Adenosine અને Alpha-D-glucopyranose ના 2D સ્ટ્રક્ચરને 3D મોડેલ્સમાં બદલતા.
07:53	અહી હજુ એક અસાઇનમેન્ટ છે.
07:56	GChemPaint. માં આપેલ Amino acids ના 2D સ્ટ્રક્ચર બનાવો.
08:01	Cysteine
08:03	Histidine , Phenylalanine
08:06	.mol ફાઈલ તરીકે સેવ કરો.
08:09	Jmol ફાઈલ ખોલો અને અને ડીસ્લ્પેને રૂપાંતરિત કરતા.
08:12	આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો નિહાળો. ttp://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_ Tutorial
08:16	તે સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.
08:19	જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિડ્થ ન હોય તો, તમે વિડીયો ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.
08:23	સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટ ટીમ:
08:26	સ્પોકન ટ્યુટોરીયલોનાં ઉપયોગથી વર્કશોપોનું આયોજન કરે છે.
08:29	જેઓ ઓનલાઈન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને પ્રમાણપત્રો આપે છે.
08:33	વધુ વિગતો માટે, કૃપા કરી, contact@spoken-tutorial.org પર લખો.
08:40	સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે.
08:45	જેને આઈસીટી, એમએચઆરડી, ભારત સરકાર મારફતે શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધાર અપાયેલ છે.
08:52	આ મિશન પર વધુ માહિતી આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ છે. http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro ]
08:57	IIT Bombay તરફથી હું, જ્યોતી સોલંકી વિદાય લઉં છું. જોડાવાબદ્દલ આભાર.

Contributors and Content Editors

Jyotisolanki, PoojaMoolya