Jmol-Application/C3/Proteins-and-Macromolecules/Hindi

Time	Narration
00:01	'Proteins और Macromolecules' के इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है।
00:06	इस ट्यूटोरियल में हम निम्न सीखेंगे
00:09	* 'प्रोटीन डेटा बैंक (PDB)' से प्रोटीन्स के स्ट्रक्चर्स लोड करना।
00:13	* 'PDB' डेटाबेस से '.pdb' फाइल्स डाउनलोड करना।
00:18	* प्रोटीन्स के सेकन्डेरी स्ट्रक्चर्स भिन्न फॉर्मेट्स में दिखाना।
00:24	* 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' और 'डाईसल्फाइड बॉन्ड्स' हाईलाइट करना।
00:29	इस ट्यूटोरियल के अनुसरण के लिए आपको 'Jmol एप्लीकेशन विंडो' से बेसिक ऑपरेशंस के साथ परिचित होना चाहिए।
00:37	यदि नहीं, तो सम्बंधित ट्यूटोरियल्स के लिए हमारी वेबसाइट पर जाएँ।
00:42	इस ट्यूटोरियल को रिकॉर्ड करने के लिए मैं उपयोग कर रही हूँ,
00:46	* 'उबन्टु' OS वर्जन 12.04
00:50	* 'Jmol' वर्जन 12.2.2
00:54	* 'Java' वर्जन 7
00:57	* 'Mozilla Firefox' ब्राउज़र 22.0
01:02	बड़े 'बायोमॉलिक्यूल्स' के स्ट्रक्चर का विश्लेषण जैसे
01:06	* 'प्रोटीन्स' और 'मैक्रोमॉलिक्यूल्स'
01:10	* 'न्यूक्लिक एसिड्स', 'DNA' और 'RNA'
01:13	* 'क्रिस्टल स्ट्रक्चर्स और पॉलीमर्स' 'Jmol एप्लीकेशन' प्रयोग करके किये जा सकते हैं।
01:19	यहाँ मैंने एक नयी 'Jmol' विंडो खोली है।
01:24	'बायोमॉलिक्यूल्स' के 3D स्ट्रक्चर्स को डेटाबेस से सीधे डाउनलोड करके देखा जा सकता है।
01:29	ऐसा करने के लिए, 'फाइल' मेन्यू पर क्लिक करें, नीचे 'Get PDB' पर जाएँ।
01:36	एक इनपुट डायलॉग बॉक्स स्क्रीन पर दिखता है।
01:40	निश्चित 'प्रोटीन' के लिए हमें इनपुट बॉक्स में चार लेटर का 'PDB code' टाइप करना है।
01:48	यह कोड 'प्रोटीन डेटा बैंक (PDB)' 'वेबसाइट' से प्राप्त किया जा सकता है।
01:53	यह 'प्रोटीन डेटा बैंक' का वेब पेज है।
01:57	यह बायोमॉलिक्यूल्स के बारे में जानकारी रखता है जैसे 'प्रोटीन्स' और 'न्यूक्लिक एसिड्स'।
02:04	उदाहरण: अब 'PDB' वेबसाइट से 'पैन्क्रीऐटिक एन्ज़ाइम इन्सुलिन' के लिए 'PDB कोड' प्राप्त करने की कोशिश करते हैं।
02:13	सर्च बॉक्स में प्रोटीन का नाम 'Human' 'इन्सुलिन' टाइप करें। कीबोर्ड पर एंटर की दबाएं।
02:24	अब, प्रदर्शित वेबपेज पर, नीचे जाएँ।
02:28	'PDB कोड्स' के साथ 'ह्यूमन(Human) इन्सुलिन' के ज्ञात स्ट्रक्चर्स की सूची स्क्रीन पर प्रदर्शित होती है।
02:36	उदाहरण, अब कोड '4EX1' के साथ 'ह्यूमन(Human) इन्सुलिन' सलेक्ट करते हैं।
02:44	प्रोटीन के नाम पर क्लिक करें।
02:47	स्ट्रक्चर्स के विवरण के साथ एक विंडो खुलती है।
02:52	जानकारी जैसे
02:54	* 'प्राइमरी साइटेशन (Primary Citation)'
02:56	* 'मॉलिक्यूलर डिस्क्रिप्शन (Molecular Description)' और
02:58	* 'स्ट्रक्चर वैलिडेशन (Structure Validation)' इस वेबपेज पर उपलब्ध हैं।
03:02	हम प्रोटीन्स के स्ट्रक्चर्स को '.pdb' फाइल्स में सेव कर सकते हैं, और उनको 'Jmol' में 3D मोड में देख सकते हैं।
03:12	पेज के ऊपरी दायें कोने पर स्थित, 'Download Files' लिंक पर क्लिक करें।
03:20	ड्राप डाउन मेन्यू से, 'PDB file (gz)' विकल्प सलेक्ट करें।
03:28	स्क्रीन पर डायलॉग बॉक्स दिखता है।
03:32	'Save file' विकल्प सलेक्ट करें।
03:35	'OK' बटन पर क्लिक करें।
03:39	प्रोटीन का स्ट्रक्चर '4EX1.pdb.gz' में 'Downloads' फोल्डर में सेव किया जायेगा।
03:51	उसी प्रकार, आप भिन्न प्रोटीन्स की अपेक्षित '.pdb' फाइल्स डाउनलोड कर सकते हैं, और उनको अलग फाइल्स में सेव कर सकते हैं।
04:02	अब, 'इन्सुलिन' के 3D स्ट्रक्चर को देखने के लिए 'Jmol' विंडो पर जाते हैं।
04:09	यदि आप इंटरनेट से जुड़े हुए हैं, तो आप Jmol पैनल पर प्रोटीन स्ट्रक्चर को सीधे डाउनलोड कर सकते हैं।
04:15	टेक्स्ट बॉक्स में चार लेटर का 'PDB कोड “4EX1” ' टाइप करें और 'OK' बटन पर क्लिक करें।
04:25	यदि आप इंटरनेट से जुड़े हुए नहीं हैं, तो टूल बार पर 'Open a File' आइकन पर क्लिक करें।
04:34	पैनल पर डायलॉग बॉक्स खुलता है।
04:38	'4EX1.pdb.gz' की लोकेशन यानि 'Downloads' फोल्डर पर जाएँ।
04:47	'Downloads' फोल्डर सलेक्ट करें और 'open' बटन पर क्लिक करें।
04:52	'4EX1.pdb.gz' फाइल सलेक्ट करें और 'open' बटन पर क्लिक करें।
05:00	इन्सुलिन का 3D स्ट्रक्चर स्क्रीन पर खुलता है।
05:05	पैनल पर 'प्रोटीन' का डिफ़ॉल्ट डिस्प्ले 'ball and stick' है।
05:12	पैनल पर प्रोटीन का मॉडल हाइड्रोजन परमाणुओं से रहित दिखाया गया है।
05:17	हाइड्रोजन परमाणुओं सहित मॉडल दिखाने के लिए, 'modelkit' मेन्यू खोलें।
05:23	'add hydrogens' विकल्प तक नीचे जाएँ और इस पर क्लिक करें।
05:28	अब पैनल पर मॉडल हाइड्रोजन परमाणुओं सहित दिखाया गया है।
05:33	'प्रोटीन' स्ट्रक्चर को जल अणुओं सहित भी दिखाया गया है।
05:38	जल अणुओं को छिपाने के लिए, दर्शायी स्टेप्स का अनुसरण करें।
05:43	पहले पॉप-अप मेन्यू खोलें और 'Select' पर जाएँ।
05:48	सब-मेन्यू से, 'Hetero' चुनें और 'All Water' विकल्प पर क्लिक करें।
05:55	पॉप-अप मेन्यू फिर से खोलें, 'Style', 'Scheme' पर जाएँ और 'CPK spacefill' विकल्प पर क्लिक करें।
06:05	यह सभी जल अणुओं को 'CPK spacefill' डिस्प्ले में बदल देगा।
06:11	पॉप-अप मेन्यू फिर से खोलें 'Style' पर जाएँ, नीचे 'Atoms' पर जाएँ और 'Off' विकल्प पर क्लिक करें।
06:22	अब हमारे पास पैनल पर जल अणुओं रहित 'इन्सुलिन' स्ट्रक्चर है।
06:27	आगे, हम 'प्रोटीन' के सेकेंडरी स्ट्रक्चर को भिन्न फॉर्मेट्स में दिखाना सीखते हैं।
06:35	पॉप-अप मेन्यू खोलें।
06:37	'Select' विकल्प पर क्लिक करें।
06:39	नीचे 'Protein' पर जाएँ और 'All' विकल्प पर क्लिक करें।
06:44	पॉप-अप मेन्यू दोबारा खोलें और नीचे 'Style' पर जाएँ फिर 'Scheme' पर।
06:50	'CPK Spacefill', 'Ball and Stick', 'Sticks', 'Wireframe', 'cartoon', 'trace' आदि जैसे विकल्पों के साथ एक सब-मेन्यू खुलता है।
07:02	सब-मेन्यू से 'Cartoon' विकल्प पर क्लिक करें।
07:07	यह डिस्प्ले प्रोटीन्स के सेकेंडरी स्ट्रक्चर जैसे 'helices, random coils, strands, sheets' आदि दर्शाता है।
07:17	अधिक डिस्प्ले विकल्पों के लिए,
07:19	पॉप-अप मेन्यू खोलें और नीचे 'Style' पर जाएँ, फिर 'Structures' पर।
07:25	यहाँ हम प्रोटीन के सेकेंडरी स्ट्रक्चर को दर्शाने के, और अधिक विकल्प देखते हैं।
07:31	उदाहरण के लिए, 'Strands' विकल्प पर क्लिक करें।
07:35	अब पैनल पर प्रोटीन 'Strands' की तरह दिखाया गया है।
07:40	डिस्प्ले का रंग बदलने के लिए, पॉप-अप मेन्यू खोलें। नीचे 'Color' पर जाएँ, 'Atoms' सलेक्ट करें और 'Blue' विकल्प पर क्लिक करें।
07:52	पैनल पर रंग में बदलाव देखें।
07:56	स्ट्रक्चर को वापस 'Ball-and-stick' डिस्प्ले में बदलने के लिए,
07:59	पॉप-अप मेन्यू खोलें, 'Style' सलेक्ट करें, फिर 'Scheme' और 'Ball and stick' विकल्प पर क्लिक करें।
08:08	हम प्रोटीन मॉडल में 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' और 'डाई-सल्फाइड बॉन्ड्स' को भी हाईलाइट कर सकते हैं।
08:14	'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' दिखाने के लिए: पॉप-अप मेन्यू खोलें और नीचे 'Style' पर जाएँ और फिर 'Hydrogen Bonds' विकल्प पर जाएँ।
08:25	पॉप-अप मेन्यू में 'Hydrogen Bonds' विकल्प, विशेषताएँ रखता है जैसे:
08:30	'Calculate', 'Set Hydrogen Bonds Side Chain'
08:35	'Set Hydrogen Bonds in the Backbone' और बांड्स की मोटाई बदलने के लिए भी विकल्प रखता है।
08:42	'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' को मॉडल में बदलने के लिए 'Calculate' विकल्प पर क्लिक करें।
08:47	'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' सफ़ेद और लाल लम्बे डैशेज़ की तरह दिखाए गए हैं।
08:53	'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' की मोटाई बदलने के लिए, पॉप-अप मेन्यू से '0.10 A' विकल्प पर क्लिक करें।
09:02	अब पैनल पर हम मोटे 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' देख सकते हैं।
09:06	हम हाइड्रोजन बॉन्ड्स का रंग भी बदल सकते हैं।
09:11	पॉप-अप मेन्यू में नीचे 'Color' पर जाएँ, फिर 'Hydrogen Bonds' पर, फिर 'orange' विकल्प पर क्लिक करें।
09:20	पैनल पर, हमारे पास सारे 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' नारंगी रंग में हैं।
09:25	'डाईसल्फाइड' बॉन्ड्स, और सल्फर परमाणु मॉडल में पीले रंग में दिखते हैं।
09:31	डाईसल्फाइड बॉन्ड्स को रूपांतरित करने के लिए, पॉप-अप मेन्यू में डाईसल्फाइड बॉन्ड्स विकल्प खोलें।
09:38	उन विशेषताओं पर क्लिक करें जिन्हे आप बदलना चाहते हैं, जैसे साइज़ और रंग आदि।
09:44	उसी प्रकार भिन्न 'enzymes' की '.pdb' फाइल्स को खोलने की कोशिश करें और उनके 3D स्ट्रक्चर्स देखें।
09:51	अब सारांशित करते हैं, इस ट्यूटोरियल में हमने निम्न सीखा:
09:57	* प्रोटीन डेटा बैंक (PDB) से प्रोटीन के स्ट्रक्चर्स लोड करना।
10:00	* डेटाबेस से '.pdb' फाइल्स डाउनलोड करना।
10:05	* 'PDB कोड' प्रयोग करके इन्सुलिन का 3D स्ट्रक्चर देखना।
10:10	* जल अणुओं रहित 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर देखना।
10:14	* भिन्न फॉर्मेट्स में सेकेंडरी स्ट्रक्चर दिखाना।
10:17	* 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' और 'डाईसल्फाइड बॉन्ड्स' को हाईलाइट करना।
10:22	यहाँ आपके लिए एक नियत कार्य है।
10:24	* 'PDB' डेटाबेस से 'ह्यूमन हीमोग्लोबिन' की '.pdb' फाइल डाउनलोड करें।
10:31	* 'कार्टून(cartoon)' डिस्प्ले में सेकेंडरी स्ट्रक्चर दिखाएँ।
10:35	* 'प्रोटीन' के 'पोरफीरिंन (Porphyrin)' यूनिट्स को हाईलाइट करें।
10:39	* 'PDB कोड' के लिए निम्न लिंक पर जाएँ।
10:42	इस URL पर उपलब्ध वीडियो देखें। http://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial
10:46	यह स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है।
10:50	अच्छी बैंडविड्थ न मिलने पर, आप इसे डाउनलोड करके देख सकते हैं।
10:55	स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टीम:
10:57	स्पोकन ट्यूटोरियल्स का उपयोग करके कार्यशालाएं चलाती है।
11:01	ऑनलाइन टेस्ट पास करने वालों को प्रमाणपत्र देते हैं।
11:06	अधिक जानकारी के लिए, कृपया contact@spoken-tutorial.org को लिखें।
11:13	स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टॉक-टू-अ टीचर प्रोजेक्ट का हिस्सा है।
11:18	यह भारत सरकार के एम एच आर दी के आई सी टी के माध्यम से राष्ट्रीय साक्षरता मिशन द्वारा समर्थित है।
11:25	इस मिशन पर अधिक जानकारी इस लिंक पर उपलब्ध है http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro]
11:31	आई आई टी बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य अब आपसे विदा लेती हूँ। इस ट्यूटोरियल को देखने के लिए धन्यवाद।

Contributors and Content Editors

Devraj, Shruti arya