Jmol-Application/C2/Structures-from-Database/Bengali
From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 00:14, 15 November 2014 by Kaushik Datta (Talk | contribs)
Time | Narration |
00:01 | Jmol এ Structures from Database এর টিউটোরিয়ালে আপনাদের স্বাগত। |
00:07 | এই টিউটোরিয়ালে আমরা শিখব: |
00:10 | PubChem ডাটাবেস থেকে রাসায়নিক কাঠামো আঁকা এবং |
00:14 | GChemPaint এ আঁকা 2D কাঠামো Jmol এ 3D মডেলে রূপান্তর করা। |
00:21 | টিউটোরিয়ালটি অনুসরণ করতে Jmol অ্যাপ্লিকেশন সম্পর্কে জানতে হবে। |
00:27 | না হলে, নিম্নলিখিত লিঙ্ক থেকে প্রাসঙ্গিক টিউটোরিয়াল দেখুন। |
00:33 | টিউটোরিয়ালটি রেকর্ড করতে |
00:35 | উবুন্টু OS সংস্করণ 12.04, |
00:40 | Jmol সংস্করণ 12.2.2 |
00:44 | জাভা সংস্করণ 7 |
00:46 | GChemPaint সংস্করণ 0.12.10 |
00:51 | মোজিলা ফায়ারফক্স ব্রাউজার 22.0 ব্যবহার করছি। |
00:56 | আমি একটি নতুন Jmol এপ্লিকেশন খুলেছি। |
01:00 | Jmol এর ডাটাবেসে তালিকাভুক্ত যৌগের কাঠামো আঁকার বৈশিষ্ট্য রয়েছে। |
01:07 | মেনু বারে 'File' মেনুতে একটি বিকল্প 'Get MOL' রয়েছে। |
01:12 | এটি 'PubChem' ডাটাবেস রাসায়নিক কাঠামো থেকে অণু লোড করে। |
01:17 | এতে আরেকটি বিকল্প 'Get PDB' রয়েছে যা প্রোটিন ডেটা ব্যাংক থেকে প্রোটিন কাঠামো লোড করে। |
01:26 | এই বৈশিষ্ট্য অন্য টিউটোরিয়ালে ব্যাখ্যা করা হবে। |
01:31 | প্যানেলে রাসায়নিক কাঠামো লোড করতে 'Get Mol' এ টিপুন। |
01:36 | পর্দায় 'Input' নামক ডায়লগ বাক্স খোলে। |
01:40 | ডাটাবেসে তালিকাভুক্ত যে কোনো অণু টেক্সট বাক্সে লোড করতে লিখুন: |
01:48 | Common name বা IUPAC name |
01:51 | CAS number |
01:54 | CID number |
01:56 | InChi identifier বা |
01:58 | SMILES identifier |
02:01 | একটি বিশেষ রাসায়নিক যৌগের identification নম্বর জানতে PubChem ডাটাবেস ওয়েবসাইটে যান। |
02:09 | পর্দায় Phenol (ফেনল) প্রদর্শন করি। |
02:13 | এখন ইনপুট টেক্সট বাক্সে 'phenol' লিখুন। |
02:16 | OK বোতামে টিপুন। |
02:20 | প্যানেলে ফেনলের মডেল প্রদর্শিত হয়েছে। |
02:24 | আমরা বিভিন্ন রেন্ডারিং বিকল্প ব্যবহার করে ফেনলের প্রদর্শনী বদলাতে পারি। |
02:30 | এই বিকল্প মেনু বার এবং পপ আপ মেনুতে তালিকাভুক্ত রয়েছে। |
02:36 | আমরা ফেনলের বেঞ্জিন চক্রে প্রতিস্থাপী জুড়তে পারি। |
02:41 | প্রথমে মডেলে পরমাণু লেবেল করি। |
02:45 | Display মেনুতে টিপে Label নির্বাচন করুন। Number বিকল্পে টিপুন। |
02:52 | এখন, সংযুক্ত হাইড্রোজেন (H) সংখ্যা 10 কে কার্বন (C) সংখ্যা 4 এর সাথে একটি অ্যামিনো (amino) গ্রুপ দ্বারা প্রতিস্থাপিত করি। |
03:00 | model kit মেনু খুলে বিকল্প থেকে নাইট্রোজেন (N) নির্বাচন করুন। |
03:06 | হাইড্রোজেন সংখ্যা 10 এ টিপুন। |
03:09 | প্যানেলে এটি হল Para-Amino (প্যারা-অ্যামিনো) ফেনলের অণু। |
03:14 | আমরা ডিসপ্লে Sticks ডিসপ্লে তে বদলাবো। |
03:18 | model kit মেনু থেকে প্রস্থান করুন। |
03:21 | পপ আপ মেনু খুলুন, নীচে Style এ গিয়ে Scheme নির্বাচন করে Sticks বিকল্পে টিপুন। |
03:30 | প্যানেলে ডিসপ্লে তে এটি হল Para-Amino (প্যারা-অ্যামিনো) ফেনলের মডেল। |
03:36 | তৈরি করা কঠিন জটিল কাঠামো, প্যানেলে সহজে লোড করা যাবে। |
03:42 | উদাহরণস্বরূপ Cholesterol (কোলেস্টেরল) |
03:45 | File মেনুতে টিপুন। |
03:47 | Get Mol বিকল্পে টিপুন। টেক্সট বাক্সে লিখুন Cholesterol. |
03:54 | OK বোতামে টিপুন। |
03:57 | কোলেস্টেরলের একটি অণু প্যানেলে প্রদর্শিত হয়েছে। |
04:02 | আমরা অণুতে দ্বি-বন্ধন এবং পার্শ্ব চেনের মত বৈশিষ্ট্য লক্ষ্য করতে পারি। |
04:08 | দ্বি-বন্ধন লক্ষনীয় করতে, প্রথমে কার্বন পরমাণুর দ্বি-বন্ধনের রঙ পরিবর্তন করি। |
04:15 | টুল বারে 'Select atoms' আইকনে টিপুন। |
04:19 | তারপরে দ্বি-বন্ধনে জড়িত কার্বন পরমাণুর উপর টিপুন। |
04:24 | পরমাণুর চারপাশে হলুদ বর্ণবলয় দেখায়। |
04:28 | পপ আপ মেনু খুলুন। |
04:30 | Color এ স্ক্রোল করে Atoms নির্বাচন করে Orange বিকল্পে টিপুন। |
04:37 | টুল বারে “Rotate molecule” বিকল্পে টিপুন। |
04:42 | আপনি দেখবেন যে মডেলে দ্বি-বন্ধন এখন কমলা রঙে রয়েছে। |
04:49 | একইভাবে, আমরা পার্শ্ব চেনে কার্বন লক্ষনীয় করতে পারি। |
04:54 | আবার পপ আপ মেনুতে গিয়ে Violet নির্বাচন করুন। |
04:59 | প্যানেলে, লক্ষনীয় গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য-এর সাথে কোলেস্টেরলের মডেল রয়েছে। |
05:06 | এখন |
05:08 | PubChem ডাটাবেস থেকে caffeine (ক্যাফিন) কাঠামো লোড করুন। |
05:11 | অণুতে গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য লক্ষনীয় করুন। |
05:15 | ডিসপ্লে wireframe এ পরিবর্তন করুন। |
05:19 | এখন Jmol এর আরেকটি গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্য ব্যাখ্যা করব। |
05:24 | আমরা অন্য সফ্টওয়্যারে আঁকা অণুর 2D কাঠামো 3D মডেলে রূপান্তর করতে পারি। |
05:31 | এখানে প্যানেলে অ্যামিনো অ্যাসিড Alanine এর মডেল রয়েছে। |
05:36 | এই অণুর 2D কাঠামো আঁকার সফ্টওয়্যার হল GChemPaint. |
05:42 | কাঠামো .mol ফাইল হিসাবে সংরক্ষিত হয়েছে। |
05:46 | GChemPaint 2D কাঠামো আঁকার একটি ওপেন সোর্স সফটওয়্যার। |
05:51 | এই সম্বন্ধীয় টিউটোরিয়াল নিম্ন লিঙ্কে উপলব্ধ। |
05:56 | কাঠামো এঁকে তা .mol ফরম্যাটে সংরক্ষণ করতে Analysis of Compounds টিউটোরিয়াল দেখুন। |
06:05 | GChempaint ডিসপ্লে এরিয়াতে প্রদর্শিত 2D কাঠামোগুলি হল: |
06:10 | Amino acid -Alanine |
06:12 | Nuclioside -Adenosine |
06:14 | Saccharide -Alpha-D glucopyranose |
06:19 | আমি এগুলি ডেস্কটপে .mol ফরম্যাটে সংরক্ষণ করেছি। |
06:24 | প্রথমে, Jmol অ্যাপ্লিকেশনে Alanine এর 2D কাঠামো 3D মডেল হিসাবে দেখি। |
06:32 | তাই আমি একটি নতুন Jmol উইন্ডো খুলবো। |
06:36 | টুল বারে 'Open a file' আইকনে টিপুন। |
06:40 | আমি Desktop ফোল্ডার নির্বাচন করে Open এ টিপব। Alanine.mol ফাইলে টিপে Open বোতামে টিপুন। |
06:51 | পর্দায় 'Alanine' এর 3D মডেল খোলে। |
06:55 | model kit মেনু খুলুন এবং 'fix hydrogens and minimize' বিকল্পে টিপুন। |
07:03 | কাঠামোতে হাইড্রোজেন যুক্ত এবং শক্তি ও নুন্যতম হয়েছে। |
07:08 | আমরা মেনু বার এবং পপ আপ মেনু ব্যবহার করেও প্রদর্শনী বদলাতে পারি। |
07:15 | এখানে এটি হল Adenosine এর 3D মডেল |
07:19 | এবং এটি হল Alpha-D-glucopyranose এর 3D মডেল। |
07:25 | সংক্ষেপে, |
07:27 | এই টিউটোরিয়ালে শিখেছি: |
07:32 | PubChem ডাটাবেস থেকে রাসায়নিক কাঠামো লোড করা। |
07:34 | ফেনল (Phenol) এবং কোলেস্টেরল (Cholesterol) এর ডিসপ্লে পরিবর্তন করা। |
07:38 | GChemPaint এ আঁকা 2D কাঠামো Jmol এ 3D মডেলে রূপান্তর করা। |
07:44 | Alanine, Adenosine এবং Alpha-D-glucopyranose এর 2D কাঠামো 3D মডেলে রূপান্তর করা। |
07:53 | এখন |
07:56 | GChemPaint এ নিম্নলিখিত অ্যামিনো অ্যাসিডের 2D কাঠামো আঁকুন। |
08:01 | Cysteine (সিস্টিন) |
08:03 | Histidine (হিস্টিডিন) |
08:04 | Phenylalanine (ফিনাইলঅ্যালানিন) |
08:06 | .mol ফাইল হিসাবে এটি সংরক্ষণ করুন। |
08:09 | Jmol এ ফাইলগুলি খুলে ডিসপ্লে পরিবর্তন করুন। |
08:12 | এই লিঙ্কে উপলব্ধ ভিডিওটি দেখুন, http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_ Tutorial |
08:16 | এটি প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে বোঝায়। |
08:19 | ভাল ব্যান্ডউইডথ না থাকলে ভিডিওটি ডাউনলোড করে দেখুন। |
08:23 | স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প দল |
08:26 | কর্মশালার আয়োজন করে। |
08:29 | অনলাইন পরীক্ষা পাস করলে প্রশংসাপত্র দেয়। |
08:33 | বিস্তারিত তথ্যের জন্য contact@spoken-tutorial.org তে ইমেল করুন। |
08:40 | স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্প Talk to a Teacher প্রকল্পের অংশবিশেষ। |
08:45 | এটি ভারত সরকারের ICT, MHRD এর জাতীয় শিক্ষা মিশন দ্বারা সমর্থিত। |
08:52 | এই বিষয়ে বিস্তারিত তথ্য এই লিঙ্কে প্রাপ্তিসাধ্য, http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro |
08:57 | আমি কৌশিক দত্ত এই টিউটোরিয়ালটি অনুবাদ করেছি। ধন্যবাদ। |