Jmol-Application/C4/Animation-using-Script-Commands/Gujarati
From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 11:21, 13 January 2016 by Jyotisolanki (Talk | contribs)
|
|
---|---|
00:01 | Animation using Script Commands. પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છે. |
00:06 | આ ટ્યુટોરીયલમાં આપણે જેમોલ script commands. નો ઉપયોગ કરીને એનીમેશન દેખવાનું શીખીશું. |
00:12 | પ્રદશનના માટે ઉદાહરણ આપણે ethane અને hemoglobin ના મોડેલસ નો ઉપયોગ કરીશું. |
00:19 | એનીમેશનના માટે આપેલ કીવર્ડસ ના સાથે જેમોલ સ્ક્રીપ્ટ કમાંડનો ઉપયોગ કરવામાં આવશે. |
00:24 | Move, delay, slab, loop અને capture. |
00:30 | આ ટ્યુટોરીયલના સંદર્ભમાટે તમને હાઇ સ્કૂલ કેમિસ્ટ્રીનું જ્ઞાન હોવું જોઈએ અને જેમોલ વિન્ડો ઓપરેશન સાથે પરિચિત હોવા જોઈએ. |
00:39 | જો નથી તો વેબ સાઈટ પર ઉપલબ્ધ સંબંધિત ટ્યુટોરિયલ જુઓ. |
00:44 | આ ટ્યુટોરીયલ રિકોર્ડ કરવા માટે હું ઉપયોગ કરી રહી છું Ubuntu OS version. 14.10 |
00:51 | Jmol version 14.1.11 અને Java version 7 |
00:58 | આ સ્લાઈડ વિસ્તારમાં પ્રત્યેક એનીમેશન કમાંડના ફંક્શન દેખાડે છે. |
01:03 | move કમાંડ તમે એક વિશિષ્ટ સમય અંતરાલમાં મોડેલ ના રોતેત, ઝૂમ અને ટ્રાન્સલેટ કરવાનું પરવાનગી આપે છે. |
01:11 | delay કમાંડ અમુક વિશિષ્ટ સેકેંડના માટે એક સ્ક્રીપ્ટ ને પોઝ કરવા માટે ઉપયોગીત છે. |
01:17 | 'Slab કમાંડ પેનલ પર દેખાવા વાળા અણુ ના પરસેંનટેજ ને નિયત્રિત કરવામાં ઉપયોગ થાય છે. |
01:23 | વૈકલ્પિક સમય અંતરાલ કે સાથ શરૂઆતમાં સ્ક્રીપ્ટને રીસ્ટાર્ટ કરવાનું કારણ loop કમાંડ છે. |
01:30 | capture કમાંડ એનિમેશનને animated GIF files ની જેમ કેપ્ચર કરે છે. |
01:36 | જેમોલ સ્ક્રીપ્ટ કમાંડ પર વધુ જાણકારી માટે Jmol interactive script documentation ના વેબ પેજ પર જાવ. |
01:44 | ચાલો Jmol' વિન્ડો ખોલો અને move કમાંડનો ઉપયોગ કરીને એક એનિમેશન દેખાડીએ. |
01:50 | હું ethane ને ઉદાહરની જેમ ઉપયોગ કરીને એક સરળ move કમાંડના સાથે શરુ કરીશ. |
01:55 | modelkit મેનુ નો ઉયપોગ કરીને ethane મોડેલ બનાવો. |
01:59 | modelkit આઇકન પર ક્લિક કરો સ્ક્રીન પર methaneનું મોડલ દેખાય છે. |
02:06 | hydrogen પર ક્લિક કરો . હવે આપની પાસે સ્ક્રીન પર ethaneનું મોડેલ છે. |
02:13 | ફાઈલ મેનુ નો ઉપયોગ કરીને કંસોલને ખોલો. |
02:17 | પ્રોમ્પ્ટ પર આપેલ કમાંડ ટાઈપ કરો. |
02:21 | કમાંડ લાઈન શબ્દ move. સાથે શરુ થાય છે. |
02:24 | તેના પછી નંબરો જે એનિમેશન પેરામીટરસ ને પરીમાંણીત કરે છે. |
02:29 | move કમાંડ વિષે વધુ જાણકારી . move કમાંડ માં નવ પેરામીટર છે. |
02:36 | X, Y અને Z axes. પ્રથમ ત્રણ કમાંડ X, Y અને Z axes ના ફરતે રોટેશન છે.
ચોથું zoom modifier છે. જે પોઝીટીવ અથવા નેગેટીવ નંબરસ માં વ્યક્ત થાય છે. . |
02:48 | ઝૂમ ઇન ના માટે પોઝીટીવ અને ઝૂમ આઉટ માટે નેગેટીવ. |
02:52 | આગળના ત્રણ પેરામીટરસ ત્રણ એક્સીસ ના ફરતે ટ્રાન્સલેશન કરે છે. |
02:57 | આઠમું slab પેરા મીટરસ છે . Slab અણુને કાપે છે. |
03:03 | આ પરમાણુઓ ને એક વિશેષ ઊંડાઈ શુધી હટાવે છે જેથી કે અંદરણી વિશેષતા સહેલાયથી જોઈ શકાય. |
03:10 | પેરામીટર 9 , સેકેંડસ માં સમય છે જે move કમાંડસ ને ક્રિયાન્વિત કરવા માં લેવાય છે. |
03:17 | Jmol પેનલ પર પાછા જાવ. |
03:20 | enter દબાવો અને panel. નું અવલોકન કરો. |
03:25 | આપણે વર્તમાન માં વધુ કમાંડસ ઉમેરી અને વધુ રસપ્રદ એનિમેશન બનાવી શકીએ છીએ. |
03:31 | પાછલા કમાંડ મેળવવા માટે કીબોર્ડ પર ઉપ એરો કીને દાબો. |
03:36 | સેમીકોલ પછી ટાઈપ કરો delay space 2 |
03:41 | આગળના કમાંડને એક્ઝીક્યુટ કરવા પહેલા અહી delay કમાંડ સ્ક્રીપ્ટ ને 2 seconds માટે પોઝ કરે છે. |
03:48 | પછી આ delay command ના પછી હજી એક move કમાંડ ટાઈપ કરો. |
03:52 | પ્રત્યેક કીવર્ડ કમાંડ ના અંત માં semicolon લગાવવાનું ભૂલવું નહિ, એન્ટર દબાવો. પેનલ ને જુઓ. |
04:06 | આપણે આ એનિમેશન દરમ્યાન પરમાણુનો રંગ પણ બદલી શકીએ છીએ. |
04:10 | Again press up arrow key to get the previous command. |
04:15 | Edit the command as I have shown here on the console. |
04:19 | Use select key words to change the color of the hydrogens and carbons.
press enter |
04:27 | Again observe the panel. |
04:34 | Add a slab command to make certain parts of the molecule to disappear and appear. |
04:41 | Press up arrow key again and edit the previous command as shown on the console. |
04:47 | Type slab on after the select command. |
04:51 | Type slab off at the end of the command. |
04:55 | Press enter and observe the panel. |
05:01 | You can see parts of the molecule disappear and appear again. |
05:06 | You can save this animation as a GIF file using capture key word. |
05:11 | Press up arrow key to get the previous command. |
05:15 | Type the capture command and specify the file name and path at the beginning of the command. |
05:21 | You can type the name of your home folder to save the GIF file. |
05:26 | I am saving this animation as file “sneha” on the desktop. Press enter. |
05:36 | Now the animation will be saved as GIF file on my desktop. |
05:41 | Navigate to location of the GIF file. |
05:44 | Open the saved GIF file with image viewer software. |
05:50 | Back to the Jmol panel. |
05:54 | Similarly open a pdb file of any macromolecule; for example oxygenated hemoglobin with a pdb code 2DN1. |
06:06 | Download the structure directly from pdb database using file menu. |
06:11 | Type the pdb code in the text box, 2DN1. Press ok. |
06:19 | A model of hemoglobin is displayed on the panel. |
06:23 | Type the following command in the Console . |
06:26 | We have used select keyword command to change the color of different units of the protein. |
06:32 | We have also used move command. |
06:35 | This command will display protein in red cartoons. |
06:40 | The Haem part in yellow spacefill display and cut away 50% of the molecule. |
06:48 | Rotate 360º on X axis in 4 seconds and restore all atoms. |
06:56 | Press enter and observe the panel. |
07:07 | Let us now use the loop command to repeat all the above steps. |
07:13 | Press up arrow key to get the same command. Type loop 2 at the end of the command. |
07:20 | "loop 2" indicates the previous script commands will be repeated after a 2 second delay.
press enter |
07:34 | You can be creative and type many more such commands to animate. |
07:39 | Now, Lets summarize, In this tutorial we have learnt to, |
07:44 | Create animation of ethane and haemoglobin using script commands such as move, delay. |
07:54 | We have also made use of loop and slab commands. |
07:58 | Saved the animations as a GIF file using capture command. |
08:03 | For the assignment,
|
08:11 | Change display, color and size of the bonds to create animation. |
08:17 | The video at the following link summarizes the Spoken Tutorial project.
Please download and watch it. |
08:25 | The Spoken Tutorial Project Team conducts workshops and gives certificates for those who pass an online test. |
08:32 | For more details, please write to us. |
08:36 | Spoken Tutorial Project is funded by NMEICT, MHRD, Government of India. |
08:43 | More information on this Mission is available at the link shown. |
08:48 | This is Snehalatha from IIT Bombay signing off. Thank you for joining. |