|
|
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {| Border=1
| |
| − | ! <center>Time</center>
| |
| − | ! <center>Narration</center>
| |
| | | | |
| − | |-
| |
| − | | 00:01
| |
| − | | ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. Parsing Data ಕುರಿತ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ಗೆ ಸುಸ್ವಾಗತ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:06
| |
| − | | ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ ನಾವು NCBI ಡೇಟಾಬೇಸ್ ವೆಬ್ಸೈಟ್ನಿಂದ FASTA ಮತ್ತುGenBank ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಕಲಿಯುವೆವು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:14
| |
| − | | ಮತ್ತು, ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್ ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ function ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ, ಡೇಟಾ ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು Parse ಮಾಡುವುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:19
| |
| − | | ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ಅರ್ಥ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು, ನೀವು ಪದವಿಪೂರ್ವ ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರ ಅಥವಾ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್,
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:26
| |
| − | |ಮತ್ತು ಬೇಸಿಕ್ Python programming ಅನ್ನು ಅರಿತಿರಬೇಕು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:30
| |
| − | |ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಕೊಟ್ಟಿರುವ ಪೈಥಾನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗಳನ್ನು ನೋಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:34
| |
| − | |ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಮಾಡಲು, ನಾನು Ubuntu OS ನ 14.10 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
| |
| − |
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:40
| |
| − | | ಪೈಥಾನ್ ನ 2.7. 8 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
| |
| − |
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:44
| |
| − | | Ipython interpreter ನ 2.3.0 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
| |
| − |
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:48
| |
| − | | ಬಯೋಪೈಥಾನ್ ನ 1.64 ಆವೃತ್ತಿ, ಮತ್ತು Mozilla Firefox browser ನ 35.0 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ, ಇವುಗಳನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸಿದ್ದೇನೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 00:56
| |
| − | |biology ಯಲ್ಲಿನ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಡಾಟಾವನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ FASTA, GenBank, EMBL, Swiss-Prot ಮುಂತಾದ ಟೆಕ್ಸ್ಟ್ ಫೈಲ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
| |
| − |
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:07
| |
| − | | ಡೇಟಾ ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಡೇಟಾಬೇಸ್ ವೆಬ್ಸೈಟ್ಗಳಿಂದ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:12
| |
| − | | ಯಾವುದೇ ವೆಬ್ ಬ್ರೌಸರ್ನಲ್ಲಿ ಕೆಳಗೆ ನೀಡಿದ ವೆಬ್ಸೈಟ್ ಲಿಂಕ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯಿರಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:17
| |
| − | |ಒಂದು ವೆಬ್ ಪೇಜ್ ಓಪನ್ ಆಗುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:19
| |
| − | | ನಾವು ಮಾನವನ ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಜೀನ್ ಗೆ, FASTA ಮತ್ತು GenBank ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡೋಣ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:25
| |
| − | |ಸರ್ಚ್ ಬಾಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ, human insulin ಎಂದು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ, Search ಬಟನ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:31
| |
| − | | ವೆಬ್ ಪೇಜ್, ಮಾನವನ ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಜೀನ್ ಗೆ, ಅನೇಕ ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:35
| |
| − | | ಪ್ರದರ್ಶನಕ್ಕಾಗಿ, ನಾನು Homo sapiens Insulin mRNA ಹೆಸರಿರುವ 4 ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡುತ್ತೇನೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:43
| |
| − | | ನಾನು 500 ಬೇಸ್ ಪೇರ್ ಗಳಿಗಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಇರುವ ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡುತ್ತೇನೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:48
| |
| − | | ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲು, ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಚೆಕ್-ಬಾಕ್ಸ್ ಮೇಲೆ ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 01:56
| |
| − | | ಪುಟದ, ಮೇಲಿನ ಬಲ ಮೂಲೆಯಲ್ಲಿರುವ Send to ಆಪ್ಶನ್ ಗೆ ಕರ್ಸರ್ ಅನ್ನು ತನ್ನಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:02
| |
| − | | Send to ಬಟನ್ ನ ನಂತರ, ಡೌನ್ ಆರೋ ಇರುವ ಸಣ್ಣ ಸೆಲೆಕ್ಷನ್ ಬಟನ್ ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:09
| |
| − | | Choose destination ಹೆಡಿಂಗ್ ನ ಕೆಳಗಿರುವ File ಆಪ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:13
| |
| − | | format ಡ್ರಾಪ್ ಡೌನ್ ಲಿಸ್ಟ್ ಬಾಕ್ಸ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಯಾವುದೇ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು save ಮಾಡಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:21
| |
| − | | ಅಲ್ಲಿರುವ ಆಯ್ಕೆಗಳಲ್ಲಿ FASTA ಎಂಬುದನ್ನು ಆರಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:25
| |
| − | | Create file ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:29
| |
| − | |ಸ್ಕ್ರೀನ್ ನ ಮೇಲೆ ಒಂದು ಡೈಲಾಗ್ ಬಾಕ್ಸ್ ಕಾಣುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | |02:32
| |
| − | | Open with ಅನ್ನು ಆಯ್ಕ್ರ್ ಮಾಡಿ, OK ಬಟನ್ ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:36
| |
| − | | text editor ನಲ್ಲಿ ಫೈಲ್ ಒಪನ್ ಆಗುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:39
| |
| − | |ನಾವು ನಾಲ್ಕು ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಡೌನ್ ಲೋಡ್ ಮಾಡಿದ್ದರಿಂದ, ಈ ಫೈಲ್, 4 ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ,
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:46
| |
| − | |ಎಲ್ಲ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳ ಮೊದಲ ಲೈನ್, ಐಡೆಂಟಿಫೈರ್ ಲೈನ್ ಆಗಿರುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:50
| |
| − | |ಅದು greater than (>) ಸಿಂಬಲ್ ಇಂದ ಆರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:53
| |
| − | | ಇದರ ನಂತರ sequence ಇರುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 02:56
| |
| − | |ಫೈಲ್ ಅನ್ನು home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ sequence.fasta ಎಂದು Save ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:01
| |
| − | |ಟೆಕ್ಸ್ಟ್ ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲೋಸ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:03
| |
| − | |ಮೊದಲು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದ ಫೈಲ್ ಗಳ, GenBank ಫಾರ್ಮಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಡೌನ್ ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಮೇಲಿನ ಹಂತಗಳನ್ನೇ ಅನುಸರಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:12
| |
| − | | file format ಅನ್ನು GenBank ಎಂದು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:16
| |
| − | |ಒಂದು ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಕ್ರಿಯೇಟ್ ಮಾಡಿ, ಟೆಕ್ಸ್ಟ್ ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ಓಪನ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:21
| |
| − | | GenBank ಫಾರ್ಮಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್, FASTA ಫೈಲ್ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಗಮನಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:27
| |
| − | | ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ sequence.gb ಎಂದು Save ಮಾಡಿ. ಟೆಕ್ಸ್ಟ್ ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲೋಸ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:34
| |
| − | |ಡೆಮಾನ್ಸ್ಟ್ರೇಶನ್ ಗಾಗಿ, ನಮಗೆ ಒಂದು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಇರುವ FASTA ಫೈಲ್ ನ ಅವಶ್ಯಕತೆ ಇದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:39
| |
| − | |ಇದಕ್ಕಾಗಿ, ಮೊದಲ ಸೆಲೆಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಪುನಃ ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ ಚೆಕ್ ಬಾಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲಿಯರ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:48
| |
| − | |ಈಗ, Human insulin gene complete cds ಎಂಬ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:54
| |
| − | |ಚೆಕ್ ಬಾಕ್ಸ್ ಮೇಲೆ ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ,
| |
| − | |-
| |
| − | | 03:57
| |
| − | |ಮತ್ತು ಫೈಲ್ ಅನ್ನು home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ save ಮಾಡಲು, ಮೊದಲು ತೋರಿಸಿದ ಹಂತಗಳನ್ನು ಅನುಸರಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:01
| |
| − | |ಫೈಲ್ ಅನ್ನು insulin.fasta ಎಂದು save ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:08
| |
| − | | ಈ ಫೈಲ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿರುವ ಬಯಲಾಜಿಕಲ್ ಡೇಟಾವನ್ನು Biopython ಲೈಬ್ರರಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಹೊರತೆಗೆಯಬಹುದು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಪಡಿಸಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:16
| |
| − | |ಟೆಕ್ಸ್ಟ್ ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲೋಸ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:19
| |
| − | | ಡೇಟಾ ಫೈಲ್ಗಳಿಂದ ಡೇಟಾವನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯುವುದನ್ನು Parsing ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:23
| |
| − | |SeqIO ಮಾಡ್ಯೂಲ್ನಲ್ಲಿ ಇರುವ function ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಹೆಚ್ಚಿನ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ಗಳನ್ನು ಪಾರ್ಸ್ ಮಾಡಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:30
| |
| − | | SeqIO ಮಾಡ್ಯೂಲ್ನ ಸಾಮಾನ್ಯ ಬಳಕೆಯ ಕಾರ್ಯಗಳು ಹೀಗಿವೆ: parse, read, write ಮತ್ತು convert.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:38
| |
| − | |Ctrl, Alt ಮತ್ತು t ಕೀಗಳನ್ನು ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಒತ್ತುವ ಮೂಲಕ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯಿರಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:44
| |
| − | | ಪ್ರಾಂಪ್ಟಿನಲ್ಲಿ ipython ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿ ipython. Enter ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:51
| |
| − | |ನಂತರ,Bio ಪ್ಯಾಕೇಜ್ನಿಂದ SeqIO ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ಅನ್ನು import ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 04:56
| |
| − | |ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, from Bio import SeqIO ಎಂದು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ. Enter ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:04
| |
| − | |ನಾವು ಮೊದಲು ಬಹು ಮುಖ್ಯವಾದ parse ಫಂಕ್ಷನ್ ಇಂದ ಪ್ರಾರಂಭಿಸೋಣ.
| |
| − | |-
| |
| − | |05:07
| |
| − | | ಡೆಮಾಸ್ಟ್ರೇಷನ್ ಗಾಗಿ, ನಾವು ಡೇಟಾಬೇಸ್ನಿಂದ ಮೊದಲೇ ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಿದ ಹಲವಾರು record ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:17
| |
| − | | ಸರಳ FASTA ಪಾರ್ಸಿಂಗ್ ಗಾಗಿ, ಕೆಳಗಿನವುಗಳನ್ನು ಪ್ರಾಂಪ್ಟಿನಲ್ಲಿ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:22
| |
| − | |ಇಲ್ಲಿ, ನಾವು sequence.fasta ಫೈಲ್ ನ ವಿಷಯಗಳನ್ನು ರೀಡ್ ಮಾಡಲು parse ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದೇವೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:30
| |
| − | | ಔಟ್ಪುಟ್ ಗಾಗಿ, record id ಅನ್ನು, ರೆಕಾರ್ಡ್ನಲ್ಲಿ ಇರುವ sequence ಮತ್ತು sequence ನ ಉದ್ದವನ್ನು print ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:41
| |
| − | |ಮತ್ತು, ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಡೆಟಾ ವನ್ನು Sequence record objects ಆಗಿ ರೀಡ್ ಮಾಡಲು parse ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸುತ್ತಿದ್ದೇವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಗಮನಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:48
| |
| − | |ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಇದು for ಲೂಪ್ ನೊಂದಿಗೆ ಉಪಯೋಗಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:52
| |
| − | |ಇದು 2 argument ಗಳನ್ನು ಅಕ್ಸೆಪ್ಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಮೊದಲನೆಯದು ಡೇಟಾವನ್ನು ರೀಡ್ ಮಾಡಲು ಬೇಕಾದ ಫೈಲ್ ನೇಮ್.
| |
| − | |-
| |
| − | | 05:59
| |
| − | |ಎರಡನೇಯದು ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮಾಟ್ ಅನ್ನು ಹೇಳುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:02
| |
| − | |ಔಟ್ ಪುಟ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯಲು Enter ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:07
| |
| − | | identifier line, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಮತ್ತು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಎಲ್ಲ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ನ ಉದ್ದ, ಇವುಗಳನ್ನು ಔಟ್ ಪುಟ್ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:21
| |
| − | | FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್, ಅಲ್ಫಾಬೆಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ಪೆಸಿಫೈ ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ ಎಂಬುದನ್ನು ಗಮನಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:26
| |
| − | |ಹಾಗಾಗಿ, ಇದನ್ನು DNA sequence ಎಂದು ಔಟ್ ಪುಟ್ ಸ್ಪೆಸಿಫೈ ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:31
| |
| − | | GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಪಾರ್ಸ್ ಮಾಡಲು ಅದೇ ಹಂತಗಳನ್ನು ಪುನರಾವರ್ತಿಸಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:36
| |
| − | |ಡೆಮಾನ್ಸ್ಟ್ರೇಶನ್ ಗಾಗಿ, ನಾವು ಈ ಮೂದಲು ಡೌನ್ ಲೋಡ್ ಮಾಡಿದ GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸುತ್ತೇವೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:43
| |
| − | | ನಾವು ಮೊದಲು ಬಳಸಿದ ಕೋಡ್ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲು up-arrow ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿರಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:49
| |
| − | |ಫೈಲ್ ಹೆಸರನ್ನು sequence.gb ಗೆ ಬದಲಾಯಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:53
| |
| − | |ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಅನ್ನು genbank ಗೆ ಬದಲಾಯಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:56
| |
| − | |ಉಳಿದ ಕೋಡ್ ಮೊದಲಿನಂತೆಯೇ ಇರುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 06:58
| |
| − | |ಔಟ್ ಪುಟ್ ಪಡೆಯಲು Enter ಕೀಯನ್ನು ಎರಡು ಬಾರಿ ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:03
| |
| − | | ಇಲ್ಲಿಯೂ, ಔಟ್ಪುಟ್, record id, sequence ಮತ್ತು ಫೈಲ್ ನ ಎಲ್ಲ ರೆಕಾರ್ಡ್ಗಳ sequence ನ ಉದ್ದವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:12
| |
| − | |GenBank ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್, sequence ಅನ್ನು, DNA sequence ಆಗಿ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಗಮನಿಸಿ.
| |
| − |
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:19
| |
| − | | ಅಂತೆಯೇ, Swiss-prot ಮತ್ತು EMBL ಫೈಲ್ಗಳನ್ನು ಮೇಲಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಪಾರ್ಸ್ ಮಾಡಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:27
| |
| − | | ನಿಮ್ಮ ಫೈಲ್, ಒಂದೇ record ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೆ, parsing ಗಾಗಿ ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:34
| |
| − | | ಇಲ್ಲಿ, ನಾವು ಹಿಂದೆ save ಮಾಡಿದ, ಒಂದು record ಇರುವ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತೇವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ insulin.fasta.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:43
| |
| − | | parse ಫಂಕ್ಷನ್ ನ ಬದಲಿಗೆ ನಾವು read ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿದ್ದೇವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಗಮನಿಸಿ. Enter ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:50
| |
| − | | ಔಟ್ಪುಟ್, insulin.fasta ಫೈಲ್ ನ ಕಂಟೆಂಟ್ ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:55
| |
| − | |ಇದು ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು sequence record object ಆಗಿ,
| |
| − | |-
| |
| − | | 07:59
| |
| − | |ಮತ್ತು ಇತರ ಆಟ್ರಿಬ್ಯೂಟ್ ಗಳಾದ GI, accession number, description ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:06
| |
| − | | ಈ ರೆಕಾರ್ಡ್ ನ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ನಾವು ಕೆಳಗಿನಂತೆ ನೋಡಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:11
| |
| − | |ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ ಹೀಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ : record dot seq. Enter ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:18
| |
| − | |ಔಟ್ ಪುಟ್, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:22
| |
| − | |ಈ ರೆಕಾರ್ಡ್ ನ ಐಡೆಂಟಿಫೈರ್ ಗಳನ್ನು ನೋಡಲು, ಹೀಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ : record dot id . Enter ಕೀಯನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:29
| |
| − | |ಔಟ್ ಪುಟ್, GI ನಂಬರ್ ಮತ್ತು ಅಕ್ಸೆಶನ್ ನಂಬರ್ ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:34
| |
| − | |ಮೇಲೆ ವಿವರಿಸಿದ ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು, ನಿಮ್ಮ ಆಯ್ಕೆಯ ಡಾಟಾ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಪಾರ್ಸ್ ಮಾಡಲು ಬಳಸಬಹುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:40
| |
| − | |ಇಲ್ಲಿಗೆ ನಾವು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತಗೊಳಿಸೋಣ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:42
| |
| − | |ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ ನಾವು ಕಲಿತ ಅಂಶಗಳು : FASTA ಮತ್ತು GenBank ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು NCBI ಡಾಟಾಬೇಸ್ ವೆಬ್ ಸೈಟ್ ನಿಂದ ಡೌನ್ ಲೋಡ್ ಮಾಡುವುದು ಮತ್ತು SeqIO ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ parse , read ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸುವುದು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 08:55
| |
| − | | FASTA ಮತ್ತು GenBank ಫೈಲ್ ಗಳಿಂದ, record id, ವಿವರಣೆ, ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಮುಂತಾದ ಡಾಟಾಗಳನ್ನು ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್ ಮಾಡಲು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:03
| |
| − | | ಈಗ ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ ಗಾಗಿ -
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:06
| |
| − | | NCBI ಡಾಟಾಬೇಸ್ ನಿಂದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಾಗಿ ನಿಮ್ಮ ಆಯ್ಕೆಯ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಡೌನ್ ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:13
| |
| − | |ಈ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳ ಫೈ ಅನ್ನು ಅದರ ರಿವರ್ಸ್ ಕಾಂಪ್ಲಿಮೆಂಟ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:17
| |
| − | |ನಿಮ್ಮ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ , ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರಬೇಕು.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:22
| |
| − | |FASTA ಫೈಲ್ ನಿಂದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು load ಮಾಡಲು parse ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:28
| |
| − | |ನಂತರ, ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನ reverse complement ಎಂಬ ಬ್ಯುಲ್ಟ್ ಇನ್ ಮೆಥಡ್ ಅನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸಿ, ರಿವರ್ಸ್ ಕಾಂಪ್ಲಿಮೆಂಟ್ ಅನ್ನು ಪ್ರಿಂಟ್ ಮಾಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:37
| |
| − | | ಈ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿರುವ ವೀಡಿಯೋ ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:42
| |
| − | | ದಯವಿಟ್ಟು ಇದನ್ನು ಡೌನ್ ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ ನೋಡಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:44
| |
| − | |ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್ ಟೀಮ್, ಕಾರ್ಯಾಗಾರಗಳನ್ನು ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆನ್ಲೈನ್ ಟೆಸ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ ತೇರ್ಗಡೆಯಾದವರಿಗೆ ಸರ್ಟಿಫಿಕೇಟ್ ಕೊಡುತ್ತದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:51
| |
| − | |ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, ದಯವಿಟ್ಟು ನಮ್ಮನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸಿ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 09:55
| |
| − | |ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್, ರಾಷ್ಟ್ರಿಯ ಸಾಕ್ಷರತಾ ಮಿಷನ್ ICT, MHRD ಮೂಲಕ ಭಾರತ ಸರ್ಕಾರದಿಂದ ಬೆಂಬಲಿತವಾಗಿದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 10:01
| |
| − | |ಈ ಮಿಶನ್ ನ ಬಗೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯು ಇಲ್ಲಿ ಇರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
| |
| − | |-
| |
| − | | 10:06
| |
| − | |ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಅನುವಾದಕರು ಚೇತನಾ. ಧನ್ಯವಾದಗಳು.
| |
| − | |}
| |
