Difference between revisions of "Biopython/C2/Manipulating-Sequences/Hindi"
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Latest revision as of 20:35, 7 February 2017
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| 00:01 | 'Manipulating Sequences' पर इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है। |
| 00:06 | इस ट्यूटोरियल में हम 'Biopython' टूल्स उपयोग करेंगे: * एक यादृच्छिक DNA सीक्वेंस बनाने के लिए |
| 00:13 | निर्दिष्ट स्थानों पर एक DNA सीक्वेंस को स्लाइस यानि टुकड़े करने में |
| 00:17 | एक नयी सीक्वेंस बनाने के लिए दो सीक्वेंसेस को एकसाथ जोड़ने में यानि कि श्रेणीबद्ध करने में |
| 00:22 | सीक्वेंस की लम्बाई ज्ञात करने में |
| 00:26 | अलग-अलग 'बेसेस' या 'स्ट्रिंग' के भाग की संख्या को गिनने में |
| 00:31 | एक विशेष बेस या स्ट्रिंग के भाग को ज्ञात करने में |
| 00:35 | एक 'सीक्वेंस-ऑब्जेक्ट' को एक परिवर्तनीय सीक्वेंस ऑब्जेक्ट में बदलने में |
| 00:40 | इस ट्यूटोरियल के अनुसरण के लिए आपको स्नातक स्तर की बायोकेमिस्ट्री या बायोइन्फॉर्मेटिक्स |
| 00:47 | और बुनियादी Python प्रोग्रामिंग से परिचित होना चाहिए। |
| 00:51 | यदि नहीं तो दिए गए लिंक पर 'Python' ट्यूटोरियल्स को देखें। |
| 00:56 | इस ट्यूटोरियल को रेकॉर्ड करने के लिए मैं उपयोग कर रही हूँ 'Ubuntu OS' वर्जन 14.10 |
| 01:03 | 'Python' वर्जन 2.7.8 |
| 01:07 | 'Ipython interpreter' वर्जन 2.3.0 |
| 01:12 | 'Biopython' वर्जन 1.64. |
| 01:16 | अब मैं 'टर्मिनल' खोलती हूँ और 'ipython इंटरप्रेटर' शुरू करती हूँ। |
| 01:21 | 'Ctrl, Alt' और 'T' कीज़ एकसाथ दबाएं। |
| 01:26 | प्रॉम्प्ट पर टाइप करें: 'ipython' और एंटर दबाएं। |
| 01:31 | 'Ipython' प्रॉम्प्ट स्क्रीन पर दिखता है। |
| 01:35 | Biopython उपयोग करके हम किसी भी निर्दिष्ट लम्बाई की एक यादृच्छिक DNA सीक्वेंस के लिए एक 'सीक्वेंस ऑब्जेक्ट' बना सकते हैं। |
| 01:44 | अब 20 बेसेस के एक DNA सीक्वेंस के लिए एक सीक्वेंस ऑब्जेक्ट उत्पन्न करते हैं। |
| 01:50 | प्रॉम्प्ट पर टाइप करें: 'import random' एंटर दबाएं। |
| 01:56 | आगे 'Bio पैकेज से 'Seq' मॉड्यूल इम्पोर्ट करते हैं। |
| 02:01 | प्रायः 'Seq' को 'seek' की तरह उच्चारित किया जाता है। |
| 02:06 | प्रॉम्प्ट पर टाइप करें: 'From Bio dot Seq import Seq' एंटर दबाएं। |
| 02:15 | हम DNA सीक्वेंस में ऐल्फबेट्स यानि अक्षरों को निर्दिष्ट करने के लिए 'Bio.Alphabet' मॉड्यूल उपयोग करेंगे। |
| 02:22 | टाइप करें: 'from Bio dot Alphabet import generic underscore dna' एंटर दबाएं। |
| 02:32 | उस यादृच्छिक DNA सीक्वेंस की एक सीक्वेंस ऑब्जेक्ट बनाने के लिए निम्न कमांड टाइप करें। |
| 02:38 | उस कमांड को वेरिएबल 'dna1' में संचित करें। |
| 02:42 | कृपया ध्यान दें: इस कमांड में एक डबल क्वोट के बजाय दो सिंगल क्वोट्स उपयोग करें। एंटर दबाएं। |
| 02:50 | आउटपुट के लिए टाइप करें 'dna1', एंटर दबाएं। |
| 02:55 | आउटपुट उस यादृच्छिक DNA सीक्वेंस के लिए 'सीक्वेंस ऑब्जेक्ट दिखाता है। |
| 03:00 | यदि आप एक नयी सीक्वेंस चाहते हैं तो उपरोक्त की तरह उसी कमांड के लिए अप-एरो की दबाएं। एंटर दबाएं। |
| 03:11 | आउटपुट के लिए वेरिएबल नाम 'dna1' टाइप करें। एंटर दबाएं। |
| 03:17 | आउटपुट एक नयी DNA सीक्वेंस दिखाता है जो पहले वाली से अलग है। |
| 03:23 | 'Sequence Objects' के बारे में: |
| 03:25 | ‘सीक्वेंस ऑब्जेक्ट्स' आमतौर पर सामान्य 'Python स्ट्रिंग्स' की तरह कार्य करते हैं। |
| 03:30 | अतः सामान्य नियमों का अनुसरण करें जैसे कि आप Python स्ट्रिंग्स के लिए करते हैं। |
| 03:35 | Python में हम 1 के बजाय 0 से शुरू करके स्ट्रिंग में कैरेक्टर्स को गिनते हैं। |
| 03:41 | सीक्वेंस में पहला कैरेक्टर 0 स्थिति है। |
| 03:45 | टर्मिनल पर वापस आएं। |
| 03:47 | प्रायः आपको सीक्वेंस के केवल एक भाग के लिए भी कार्य करने की ज़रुरत हो सकती है। |
| 03:52 | अब देखते हैं कि स्ट्रिंग के भागों को कैसे एक्सट्रैक्ट करते हैं और उन्हें सीक्वेंस ऑब्जेक्ट्स की तरह कैसे संचित करते हैं। |
| 03:58 | उदाहरण के लिए हम DNA सीक्वेंस को दो स्थितियों पर 'स्लाइस' करेंगे। |
| 04:04 | पहले 6 और 7 बेसेस के बीच। |
| 04:08 | यह सीक्वेंस की शुरुआत से छठे बेस तक एक फ्रैग्मेंट एक्सट्रैक्ट करेगा। |
| 04:15 | दूसरा स्लाइस 11 और 12 बेसेस के बीच होगा। |
| 04:20 | दूसरा फ्रैग्मेंट सीक्वेंस के बारहवें बेस से अंत तक तक होगा। |
| 04:26 | पहला फ्रैग्मेंट एक्सट्रैक्ट करने के लिए प्रॉम्प्ट पर निम्न कमांड टाइप करें। |
| 04:31 | 'String1 equal to dna1 within brackets 0 semicolon 6'. |
| 04:39 | 'string1' पहला फ्रैग्मेंट संचित करने के लिए वेरिएबल है। |
| 04:43 | कमांड का अनुसरण करें जैसे सामान्य Python में करते हैं। |
| 04:47 | इन ब्रैकेट्स में बंद कोलन से अलग की गयी आरंभ और रोकी हुई स्थितियां हैं। |
| 04:53 | यह स्थितियाँ शुरुआत को शामिल करती हैं किन्तु स्टॉप को शामिल नहीं करती हैं। एंटर दबाएं। |
| 05:01 | आउटपुट देखने के लिए टाइप करें: 'string1' एंटर दबाएं। |
| 05:04 | आउटपुट सीक्वेंस ऑब्जेक्ट की तरह पहला फ्रैग्मेंट दिखाता है। |
| 05:10 | सीक्वेंस से दूसरी स्ट्रिंग को एक्सट्रैक्ट करने के लिए अप-एरो की दबाएं और निम्न की तरह कमांड एडिट करें: |
| 05:17 | वेरिएबल का नाम बदलकर 'string2' और स्थितियाँ बदलकर '11' और '20' करें। |
| 05:24 | आउटपुट के लिए टाइप करें: 'string2' एंटर दबाएं। |
| 05:30 | अब हमारे पास दूसरा फ्रैग्मेंट भी सीक्वेंस ऑब्जेक्ट की तरह ही है। |
| 05:34 | अब श्रेणीबद्ध करते हैं यानि कि दो 'स्ट्रिंग' को एकसाथ जोड़कर एक नया फ्रैग्मेंट बनाते हैं। |
| 05:42 | वेरिएबल 'dna2' में नया सीक्वेंस संचित करें। |
| 05:46 | टाइप करें: 'dna2 equal to string1 plus string2'. एंटर दबाएं। |
| 05:53 | कृपया ध्यान दें: हम असंगत ऐल्फाबेट्स की सीक्वेंसेस को नहीं जोड़ सकते। |
| 05:59 | यानि कि हम एक नयी सीक्वेंस बनाने के लिए DNA सीक्वेंस एक प्रोटीन सीक्वेंस को श्रेणीबद्ध नहीं कर सकते हैं। |
| 06:07 | दो सीक्वेंसेस का ऐल्फाबेट एटट्रिब्यूट समान होना चाहिए। |
| 06:12 | आउटपुट देखने के लिए टाइप करें: 'dna2' एंटर दबाएं। |
| 06:17 | आउटपुट एक नयी सीक्वेंस दिखाता है जो 'string1' और 'string2' का संयोजन है। |
| 06:23 | नयी सीक्वेंस की लम्बाई ज्ञात करने के लिए हम 'len' फंक्शन उपयोग करेंगे। |
| 06:29 | टाइप करें: 'len' ब्रैकेट्स में 'dna2'. एंटर दबाएं। |
| 06:34 | आउटपुट 15 बेसेस लम्बा सीक्वेंस दिखाता है। |
| 06:39 | हम सीक्वेंस में उपस्थित अलग अलग बेसेस की संख्या को भी गिन सकते हैं। |
| 06:44 | ऐसा करने के लिए हम 'count()' फंक्शन उपयोग करेंगे। |
| 06:47 | उदाहरण के लिए सीक्वेंस में उपस्थित alanines की संख्या को गिनने के लिए, निम्न कमांड टाइप करें 'dna2 dot count' ब्रैकेट्स में डबल क्वोट्स में अक्षर A. |
| 07:02 | एंटर दबाएं। |
| 07:04 | आउटपुट सीक्वेंस 'dna2' में उपस्थित alanines की संख्या को दिखाता है। |
| 07:10 | एक विशिष्ट बेस या स्ट्रिंग का भाग ज्ञात करने के लिए हम 'find()' फंक्शन उपयोग करेंगे। |
| 07:16 | टाइप करें: 'dna2 dot find' ब्रैकेट्स में डबल क्वोट्स में 'GC'. एंटर दबाएं। |
| 07:26 | आउटपुट स्ट्रिंग में 'GC' की उपस्थिति के प्रथम इंस्टैंस की स्थिति दिखाता है। |
| 07:32 | सामान्यतः एक सीक्वेंस ऑब्जेक्ट को एडिट नहीं किया जा सकता है। |
| 07:35 | एक सीक्वेंस को एडिट करने के लिए हमें इसे परिवर्तनीय सीक्वेंस ऑब्जेक्ट में बदलना है। |
| 07:41 | ऐसा करने के लिए टाइप करें: 'dna3 equal to dna2 dot to mutable' ब्रैकेट खोलें और बंद करें। एंटर दबाएं। |
| 07:52 | आउटपुट के लिए टाइप करें: 'dna3' एंटर दबाएं। |
| 07:55 | अब सीक्वेंस ऑब्जेक्ट एडिट किया जा सकता है। |
| 07:59 | अब बेस को सीक्वेंस से बदलते हैं। |
| 08:01 | उदाहरण के लिए- पाँचवे स्थान पर उपस्थित बेस को alanine (एलानीन) से बदलने के लिए, टाइप करें: 'dna3 ब्रैकेट्स में 5 इक्वल्स टू डबल क्वोट में अक्षर A. एंटर दबाएं। |
| 08:19 | आउटपुट के लिए टाइप करें: 'dna3' एंटर दबाएं। |
| 08:24 | आउटपुट देखें। पाँचवें स्थान पर 'cytosine' 'alanine' से बदल गया है। |
| 08:31 | 'स्ट्रिंग' के एक भाग को बदलने के लिए निम्न कमांड टाइप करें। |
| 08:35 | 'Dna3 ब्रैकेट्स में 6 सेमीकोलन 10 इक्वल टू डबल क्वोट्स में 'ATGC'. एंटर दबाएं। |
| 08:45 | आउटपुट के लिए टाइप करें: 'dna3' एंटर दबाएं। |
| 08:52 | आउटपुट दिखाता है कि 6 से 9 तक की स्तिथियों पर 4 बेसेस नए बेसेस 'ATGC' से बदले गए हैं। |
| 09:01 | एक बार जब आपने अपना सीक्वेंस ऑब्जेक्ट एडिट कर लिया है तो इसे वापस 'read only' फॉर्म में बदलें। |
| 09:07 | निम्न टाइप करें: 'dna4 equal to dna3 dot to seq ब्रैकेट खोलें और बंद करें' एंटर दबाएं। |
| 09:19 | आउटपुट के लिये टाइप करें: 'dna4' एंटर दबाएं। |
| 09:25 | इसे सारांशित करते हैं। |
| 09:27 | इस ट्यूटोरियल में हमने निम्न करना सीखा: * एक यादृच्छिक DNA सीक्वेंस बनाना |
| 09:32 | निर्दिष्ट स्थानों पर एक DNA सीक्वेंस स्लाइस करना |
| 09:36 | एक नयी सीक्वेंस बनाने के लिए दो सीक्वेंसेस को एकसाथ जोड़ना यानि कि श्रेणीबद्ध करना। |
| 09:43 | हमने यह भी सीखा: कि 'len, count' और 'find' फंक्शन्स को कैसे उपयोग करते हैं |
| 09:49 | एक सीक्वेंस ऑब्जेक्ट को परिवर्तनीय सीक्वेंस ऑब्जेक्ट में कैसे बदलते हैं और स्ट्रिंग के भाग या बेस का स्थान कैसे बदलते हैं। |
| 09:57 | नियत कार्य में 30 बेसेस का एक यादृच्छिक 'DNA सीक्वेंस' बनाएं। |
| 10:02 | Biopython टूल्स उपयोग करके GC परसेंटेज और सीक्वेंस के मोलिक्यूलर वेट यानि आणविक भार की गणना करें। |
| 10:09 | आपका पूर्ण नियत कार्य निम्न प्रकार दिखेगा। |
| 10:13 | आउटपुट परसेंटेज की तरह 'GC' कंटेंट दिखाता है। |
| 10:18 | आउटपुट DNA सीक्वेंस का मोलिक्यूलर वेट यानि आणविक भार दिखाता है। |
| 10:23 | यह वीडियो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रॉजेक्ट को सारांशित करता है। |
| 10:26 | अच्छी बैंडविड्थ न मिलने पर आप इसे डाउनलोड करके देख सकते हैं। |
| 10:30 | हम कार्यशालाएं आयोजित करते हैं और प्रमाणपत्र देते हैं। |
| 10:32 | कृपया हमसे संपर्क करें। |
| 10:35 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रॉजेक्ट भारत सरकार के MHRD के NMEICT द्वारा समर्थित है। |
| 10:43 | आई आई टी बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य आपसे विदा लेती हूँ। हमसे जुड़ने के लिए धन्यवाद। |
