Difference between revisions of "CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Malayalam"
From Script | Spoken-Tutorial
(Created page with " {| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | ഹലോ എല്ലാവരും.''' ‘Build''' '''and Modify Process Diagram''' in''' CellDesigner’'''....") |
PoojaMoolya (Talk | contribs) |
||
| Line 157: | Line 157: | ||
|- | |- | ||
| − | | 03: | + | | 03:56 |
| അടുത്തതായി, catalyst '' 'S2 എന്ന പേരു മാറ്റുകഅതിൽ വലത്-ക്ലിക്കുചെയ്ത് '''Edit Protein.''' തിരഞ്ഞെടുക്കുക | | അടുത്തതായി, catalyst '' 'S2 എന്ന പേരു മാറ്റുകഅതിൽ വലത്-ക്ലിക്കുചെയ്ത് '''Edit Protein.''' തിരഞ്ഞെടുക്കുക | ||
Latest revision as of 15:11, 1 March 2018
| Time | Narration |
| 00:01 | ഹലോ എല്ലാവരും. ‘Build and Modify Process Diagram in CellDesigner’.
ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം. |
| 00:08 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ നമ്മൾ പഠിക്കും:Macros ഉപയോഗിക്കുക, സമനില പ്രദേശങ്ങളിൽ നീക്കുക, |
| 00:18 | ഒരു പ്രതികരണ വരി വിന്യസിക്കുകയും വിപുലീകരിക്കുകയും ചെയ്യുക, ഒരു Product Reactant. എന്നിവ ചേർക്കുക. |
| 00:23 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിനായി ഞാൻ Ubuntu Linux OS 14.04' CellDesigner version 4.3 Java version 1.7 |
| 00:35 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, പഠിതാക്കൾക്ക് പരിചയമുണ്ടായിരിക്കണം: അണ്ടർഗ്രഡ്യൂട്ട് Biochemistry. CellDesigner interface. |
| 00:43 | ഇല്ലെങ്കിൽ, CellDesigner tutorials, ദയവായി 'സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക. |
| 00:51 | നമുക്ക് തുടങ്ങാം |
| 00:53 | 'അലനൈൻ ബയോസിന്തസിസിനുവേണ്ടിയുള്ള പരമ്പരാഗത ഡയഗ്രമാണ് നിങ്ങൾ ഇവിടെ കാണുന്നത്.' |
| 00:58 | ഇപ്പോൾ ഈ പ്രക്രിയ ഡയഗ്രം സൃഷ്ടിക്കാൻ CellDesigner ഉപയോഗിക്കും. |
| 01:02 | 'Ctrl + Alt + T' കീകളിലൊന്ന് അമർത്തി ടെർമിനൽ തുറക്കുക. |
| 01:09 | ഇപ്പോൾ ടൈപ് ചെയ്യുക './runCellDesigner4.3' അമർത്തുക 'Enter' അമർത്തുക. |
| 01:20 | നിങ്ങളുടെ ടെർമിനലിൽ സെൽ ഡിസൈൻ വിൻഡോ ഇപ്പോൾ തുറന്നിരിക്കുന്നു |
| 01:24 | 'CTRL + N' 'അമർത്തി ഒരു പുതിയ ഫയൽ തുറന്ന്' Build and Modify Process Diagram. പേര് കൊടുക്കുക |
| 01:34 | സ്ഥിര വീതിയും ഉയരവും സൂക്ഷിച്ച് 'ok' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 01:39 | ‘Macros’.എന്തൊക്കെയാണെന്നു പഠിക്കാം. |
| 01:42 | '‘Macros’.പതിവായി ഉപയോഗിക്കുന്നത് Components സെറ്റുകളിൽ എളുപ്പത്തിൽ ഡയഗ്രമുകൾ വരയ്ക്കാൻ സഹായിക്കുന്നു. |
| 01:47 | ടൂൾബാറിൽ, 'Catalysis' എന്നതിനായുള്ള '‘Macros’.ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക, സമനില പ്രദേശത്തിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 01:57 | നമുക്കിപ്പോൾ ദ്രുതഗതിയിൽ ഒരു Macros-Catalysis reaction ഉണ്ട്. |
| 02:02 | ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയുടെ മറ്റൊരു വശത്തേക്ക് എല്ലാ ഘടകങ്ങളെയും നീക്കാൻ പഠിക്കാം. |
| 02:08 | അതിൽ edit 'മെനുവിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക തുടർന്ന്Select All'. ക്ലിക് ചെയുക |
| 02:16 | ഇതരമാർഗ്ഗമായി നിങ്ങൾക്ക് 'Ctrl + A' കീ അമർത്താം. |
| 02:21 | എല്ലാ Components ഇപ്പോൾ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിരിയ്ക്കുന്നു. |
| 02:24 | ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്ത ഘടകങ്ങളിൽ എവിടെയെങ്കിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക, തുടർന്ന് അവ ആവശ്യമായ ലൊക്കേഷനിലേക്ക് വലിച്ചിടുക. |
| 02:30 | നമുക്ക് മുന്നോട്ടുപോകാം. |
| 02:32 | ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്ത ഘടകങ്ങൾ അൺചെക്കുചെയ്യുന്നതിന് ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ എവിടെയെങ്കിലും ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 02:37 | വീണ്ടും Draw Area ൽ, 'Generic Protein S1 ൽ റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.' |
| 02:43 | തുടർന്ന്'Change Identity'. ഓപ്ഷൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 02:47 | 'class' ബോക്സിൽ Protein Simple Molecule. ആക്കുക |
| 02:53 | Name എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: '2-keto-isovalerate' . |
| 02:58 | തുടർന്ന് ‘Apply’ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 03:02 | ഡയലോഗ് ബോക്സിൽ‘The Same Species Exists’ൽ, ‘No’. ക്ലിക് ചെയുക |
| 03:10 | എന്നിരുന്നാലും, ഈ വർഗ്ഗത്തിലെ എല്ലാ ഘടകങ്ങളുമുള്ള മാറ്റത്തെ പ്രതിഫലിപ്പിക്കാൻ നിങ്ങൾ ആഗ്രഹിക്കുന്നുവെങ്കിൽ, yes ക്ലിക്കുചെയ്യുക.ഇവിടെ ഞാൻ ‘No’ കൊടുക്കും |
| 03:20 | Generic Protein S1, ഇപ്പോൾ simple molecule 2- 2-keto-isovalerate. ആണ്. |
| 03:30 | പേര് ചേർക്കാൻ ഞാൻ മോളിക്യൂൾ ഡ്രാഗ് ചെയുക |
| 03:34 | 'എൻഡ്-പോയിന്റ്e end-point, Generic protein-'S1' എന്ന സെന്ററിൽ റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. ഇത്product. ആണ്. |
| 03:42 | ഐഡന്റിറ്റി മാറ്റുക o Simple Molecule നു Valine. നെയിം കൊടുത്തു |
| 03:50 | Apply ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 03:52 | ചിത്രത്തിൽ നിങ്ങൾ Valine ഉണ്ട്. |
| 03:56 | അടുത്തതായി, catalyst 'S2 എന്ന പേരു മാറ്റുകഅതിൽ വലത്-ക്ലിക്കുചെയ്ത് Edit Protein. തിരഞ്ഞെടുക്കുക |
| 04:06 | Name ഫീൽഡിൽ, Aminotransferase. ടൈപ്പുചെയ്യുക. |
| 04:11 | 'Update' ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് ഡയലോഗ് ബോക്സ് ക്ലോസ് ചെയ്യുക. |
| 04:16 | പേര് ചേർക്കുന്നതിനു മോളിക്യൂൾ ന്റെ കോർണർ ഡ്രാഗ് ചെയുക,. |
| 04:21 | അടുത്തതായി, ലിങ്കുചെയ്ത റിയക്ഷന്റെ സ്ഥാനം മാറ്റാം. |
| 04:25 | species ' ന്റെ 'end point ' അതായത്' 'valine' 'എന്നതിന്റെ മധ്യഭാഗത്ത് ക്ലിക്കുചെയ്യുക,' ആവശ്യമുള്ള സ്ഥലത്ത് ഡ്രാഗ് ചെയുക |
| 04:33 | Aminotransferaseമായി ഇത് വീണ്ടും ആവർത്തിക്കുക. |
| 04:37 | end-point’ Species ചലിക്കുമ്പോൾ എവിടെയാണെങ്കിലും ബന്ധം പ്രതിപ്രവർത്തിക്കുന്നത് പിന്തുടരുക. |
| 04:44 | species നു ചുറ്റുമുള്ള reaction lineഎങ്ങനെ ബന്ധിപ്പിക്കാം എന്ന് നമ്മൾ ഇപ്പോൾ പഠിക്കും. |
| 04:49 | ഒരുSpecies.നു ചുറ്റുമുള്ള Reaction line 16 കണക്ഷന്റെ ഏതെങ്കിലും പോയിന്റുകളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കാവുന്നതാണ്. |
| 04:56 | ഇത് എങ്ങനെ ചെയ്യാമെന്ന് ഞാൻ നിങ്ങൾക്ക് കാണിച്ചു തരാം. |
| 04:59 | 'CTRL + N' അമർത്തി പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കുക. |
| 05:04 | ഈ ഫയൽ Connection points. |
| 05:08 | സ്ഥിര വീതിയും ഉയരവും സൂക്ഷിച്ച് 'ok' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 05:14 | സമനിലയിൽ, രണ്ട്generic proteins വരച്ച് അവയ്ക്ക്'Protein 1 and Protein 2. നെയിം കൊടുക്കുക |
| 05:23 | പ്രധാന മെനുവിൽ State Transition.എന്ന ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 05:28 | പിന്നെ, ഡ്രോ ഏറിയ യിൽ ‘start-point' Species, Protein 1. എന്നിവയിൽ മൗസ് ഹോവർ ചെയ്യുക. |
| 05:36 | എല്ലാ 16 കണക്ഷനുകളും ചാര നിറത്തിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിട്ടുണ്ടെന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക. |
| 05:42 | ഈ കണക്ഷൻ പോയിന്റുകളിൽ ഒന്നിലേക്കു് കർസർ അടയാളപ്പെടുത്തുമ്പോൾ, അതു് നീലനിറം മാറുന്നു. |
| 05:49 | കണക്ഷൻ പോയിന്റുകളിൽ ഒരെണ്ണം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 05:53 | സമാനമായി,‘end-point' Species അതായത് . Protein 2. ൽ മൗസ് ചലിപ്പിക്കുക. |
| 06:00 | വീണ്ടും വിശദീകരിച്ചതുപോലെ വീണ്ടും കണക്ഷൻ പോയിന്റിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 06:05 | തെരഞ്ഞെടുത്ത കണക്ഷൻ പോയിന്റുകൾ തമ്മിലുള്ള ഒരു 'സ്റ്റേറ്റ് ട്രാൻസിഷൻ' പ്രതികരണ ലൈൻ രൂപപ്പെടുന്നു. |
| 06:12 | അടുത്തതായി, Reaction line. ഞങ്ങൾ അലൈൻ ചെയ്യും |
| 06:16 | Protein 1 Protein 2എന്നിവക്ക് ഇടക്ക് State transition reaction line ൽ ക്ലിക് ചെയുക |
| 06:21 | reaction line ലെ 2 process nodesഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക. |
| 06:27 | 2 process nodes,ലെ മൗസ് ഹോവർ ചെയ്താൽ, ഒരു ‘plus’ ചിഹ്നം കാണാം. |
| 06:34 | process nodes. കളിൽ ഒന്ന് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.' |
| 06:37 | ഇപ്പോൾ ഇഷ്ടമുള്ള കണക്ഷൻ പോയിന്റിൽ പോയിന്ററിനെ വലിച്ചിടുക. |
| 06:43 | ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്ത ഘടകങ്ങൾ അൺചെക്കുചെയ്യുന്നതിന് ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ എവിടെയെങ്കിലും ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 06:49 | reaction line, വിപുലീകരിക്കാനോ വിപുലീകരിക്കാനോ, അതിൽ ആദ്യം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 06:54 | ഇപ്പോൾ സ് start-pointൽ അല്ലെങ്കിൽ'end-point Species. ഉള്ള process nodes ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 07:01 | ഇഷ്ടാനുസൃത കണക്ഷൻ പോയിന്റ് വരെ reaction line നീക്കാൻ മൗസ് വലിച്ചിടുക. |
| 07:07 | ഇവിടെ നിന്ന്, നമ്മൾ പ്രോസസ് ഡയഗ്രം തുടരും. |
| 07:12 | നമുക്ക് Build and Modify Process Diagram വിൻഡോയിൽ മാറ്റം വരുത്താം. |
| 07:16 | നിലവിലുള്ള പ്രതികരണത്തിലേക്ക് ഒരു Reactant Product,എന്നിവ ചേർക്കൂ. |
| 07:21 | ടൂൾബാറിൽ നിന്ന്, ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ 2simple moleculesക്ലിക്കുചെയ്ത് സ്ഥാപിക്കുക. |
| 07:27 | 'ഗ്ലാട്ടമറ്റ് 2-Oxoglutarate.എന്നീ നാമങ്ങള്ക്ക് പേര് കൊടുക്കുക. |
| 07:36 | Simple molecules: 2-keto-isovalerate Valine. എന്നിവ ചേർത്ത് അവയെ വലിച്ചിടുക. |
| 07:44 | നേരത്തേ വിശദീകരിച്ചതുപോലെ, നമ്മൾ ഡ്രോ ഏരിയയിലെ ഘടകങ്ങളെ വിന്യസിച്ചിരിക്കാം. |
| 07:49 | നേരത്തെ വിശദീകരിച്ചതിൽനിന്ന്, ഘടകങ്ങളെ അണിനിരത്തി ഞാൻ ഇപ്പോൾ പൂർത്തിയാക്കിയിട്ടുണ്ട്. |
| 07:55 | ടൂൾബാറിൽ ‘Add Product’.എന്നതിന്റെ ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 08:00 | '2-keto-isovalerate' , എന്നതിന് ഇടക്കുള്ള State Transition ൽ മൌസ് വെക്കുക |
| 08:07 | highlighted process node.ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 08:10 | അടുത്തതായി 2-Oxoglutarate.ൽ മൗസ് ഹോവർ ചെയ്യുക.' |
| 08:17 | 16 ഹൈലൈറ്റുചെയ്തprocess nodes.കളി ൽ ഏതെങ്കിലും ഒരെണ്ണം തിരഞ്ഞെടുക്കുക.' |
| 08:21 | ശ്രദ്ധിക്കുക, State Transition 2-Oxoglutarate.എന്നീ വിഭാഗങ്ങൾക്ക് ഇടയിൽ ഒരു reaction line കാണപ്പെടുന്നു. |
| 08:29 | അതുപോലെ തന്നെ ‘Add Reactant’ ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 08:34 | ' Glutamateഎന്നതിലെ മൌസ് ഹോവർ ചെയ്ത് 16 ഹൈലൈറ്റുചെയ്ത process nodes. കളിലൊന്നിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 08:40 | അടുത്തതായി, State Transition ൽ പ്രതിപ്രവർത്തനം കാണിക്കുകയുംprocess node.ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.' |
| 08:49 | ശ്രദ്ധിക്കുക, State Transition Glutamate'.എന്നീ വിഭാഗങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള ഒരു reaction line കാണിക്കുന്നു. |
| 08:55 | ഇപ്പോൾ നമ്മൾ Reactant Product എന്നിവയോട് കൂടിയ Catalysis റിയാക്ഷൻ പൂർത്തിയാക്കും |
| 09:01 | പ്രോസസ്സ് ഡയഗ്രമിലെ മറ്റ് ഘടകങ്ങളെ ഉൾക്കൊള്ളാൻ 'Reaction ' 'എന്നതിനൊപ്പം ഞാൻ അലൈൻ ചെയ്യും . |
| 09:09 | ടൂൾ ബാർ ൽ നിന്ന് ഈ ഐകൺസ് തിരഞ്ഞെടുക്കുക State Transition , Simple Molecule, Generic Protein and Catalysis |
| 09:18 | ഇത് പൂർത്തിയാക്കിയ പ്രോസസ് ഡയഗ്രമാണ്. |
| 09:22 | ഇത് ശരിയായി കാണുന്നതിന്, പ്രധാന മെനു ബാറിലെ 'view എന്നതിലേക്ക് പോയി Zoom Fit ക്ലിക് ചെയുക |
| 09:32 | പൂർത്തിയായത് Process Diagram ഏതു പോലെ ഇരിക്കും |
| 09:36 | സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് Macros. ഉപയോഗിക്കാന് പഠിച്ചു. |
| 09:42 | സമനില പ്രദേശങ്ങളിൽ ഘടകങ്ങൾ നീക്കുക, ഒരു സ്പീഷിസിനു ചുറ്റും ഒരു പ്രതികരണ ലൈൻ ബന്ധിപ്പിക്കുക. |
| 09:48 | Product Reactantഎന്നിവ ചേർക്കുക |
| 09:54 | അസൈൻമെന്റിനായി: 'മെത്തിയോയ്ൻ ബയോസിന്തേശിസിനായി' 'ഒരു സെൽ ഡിസൈൻ നിർമ്മിക്കുക' CellDesigner
'GTP / GD' എന്നതിനായുള്ള Macros പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക,ഒരു 'കർവ്' റിയാക്ഷൻ ലൈൻ സൃഷ്ടിക്കുന്നതെങ്ങനെയെന്ന് കണ്ടെത്തുക |
| 10:11 | സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ്- |
| 10:14 | താഴെയുള്ള ലിങ്കിൽ വീഡിയോ കാണുക ഇത് സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു. |
| 10:19 | നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ അത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക. |
| 10:24 | 'സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട്' ടീം സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. |
| 10:29 | ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു. |
| 10:34 | കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി [emailto: contact@spoken-tutorial.org, contact@spoken-tutorial.org] ലേക്ക് എഴുതുക. |
| 10:40 | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്റ്റ് ടോക്ക് ടു എ ടീച്ചർ പ്രൊജക്ടിന്റെ 'ഭാഗമാണ്.' 'ഇത് എൻഎംഇഐടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർണ്മെൻറ് ഓഫ് ഇന്ത്യ' 'എന്നിവയിലൂടെ ധനസഹായം നൽകുന്നു. |
| 10:54 | ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബെ ൽ നിന്ന് വിജി നായർ
പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി. |
