Difference between revisions of "Jmol-Application/C4/Proteins-and-Macromolecules/Malayalam"
From Script | Spoken-Tutorial
(Created page with " {| border=1 || '''Time''' || '''Narration''' |- | 00:01 | ഹലോ എല്ലാവരും. '''Installation of CellDesigner on Linux OS'''എന്നതിലെ ഈ...") |
|||
Line 1: | Line 1: | ||
+ | |||
+ | One | ||
+ | |||
{| border=1 | {| border=1 | ||
− | + | |'''Time''' | |
− | + | | '''Narration''' | |
|- | |- | ||
− | | 00:01 | + | |00:01 |
− | | | + | |''Proteins and Macromolecules.''' എന്ന ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 00: | + | |00:06 |
− | | ഈ | + | |ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കുന്നതു: |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 00: | + | |00:09 |
− | |''' | + | |''Protein Data Bank (PDB)''' ൽനിന്നുള്ള ''protein'' ന്റെ ''Load'' സ്ട്രക്ചഴ്സ്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 00: | + | |00:13 |
− | | ''' | + | |'pdb' ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് 'PDB' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 00: | + | |00:18 |
− | | | + | |വിവിധ ഫോർമാറ്റിൽ പ്രോട്ടീനുകളുടെ സെകണ്ടറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 00: | + | |00:24 |
− | | | + | |''hydrogen bonds '''and '''disulfide bonds''' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 00: | + | |00:29 |
− | | ''' | + | |ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ ഫോളോ ചെയ്യാൻ, '''Jmol Application window ''' ലെ ബേസിക് ഓപ്പറേഷൻസ് ഫെമിലിയർ ആയിരിക്കണം.' '' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |00:37 |
− | | | + | |ഇല്ലെങ്കിൽ, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റിൽ ലഭ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ കാണുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |00:42 |
− | | | + | |ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ റെക്കോർഡ് ചെയ്യാൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നതു: |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |00:46 |
− | | | + | |'''Ubuntu '''OS version '''12.04''' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |00:50 |
− | | | + | |'''Jmol''' version '''12.2.2''' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |00:54 |
− | | | + | |'''Java''' version '''7''' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |00:57 |
− | | | + | |'''Mozilla Firefox Browser''' '''22.0'''. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 01: | + | |01:02 |
− | | '''' | + | |വലിയ ജീവജാലങ്ങളുടെ ''Structure Analysis''. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 01: | + | |01:06 |
− | | '''' | + | |'''Proteins''' and '''Macromolecules''' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 01: | + | |01:10 |
− | | | + | |'''Nucleic acids, DNA''' and '''RNA''' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:13 |
− | | | + | |'''Jmol Application.''' ഉപയോഗിച്ച് '''Crystal structures''' and '''polymers''' ചെയ്യാം |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:19 |
− | | | + | |ഇവിടെ, ഒരു പുതിയ '' Jmol window" തുറന്നിരിക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:24 |
− | | | + | |''3D structure" ബയോമോല്യൂളുകൾ ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് നേരിട്ട് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:29 |
− | | | + | |അങ്ങനെ ചെയ്യാൻ, ''File'' മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക, '''Get PDB'' ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ഡൗൺ ചെയ്യുക |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:36 |
− | | | + | |''screen" നിൽ ഒരു '' Input'' 'ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:40 |
− | | | + | |നാം '''Input''' ബോക്സിലെ '' protein'' നുള്ള നാലു ലെറ്റർ PDb കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യണം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:48 |
− | | | + | |''Protein Data Bank (PDB) '' വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് ഈ കോഡ് ലഭിക്കും. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |01:53 |
− | | | + | |ഇത് ''Protein Data Bank'' ന്റെ വെബ് പേജാണ്. |
|- | |- | ||
− | | | + | |01:57 |
− | | | + | |''proteins''' and '''nucleic acids '' 'തുടങ്ങിയ ബയോമോല്യൂളുകൾ സംബന്ധിച്ച വിവരങ്ങൾ ഇതിന് ഉണ്ട്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 02: | + | |02:04 |
− | | | + | |ഉദാഹരണമായി, '''PDB ''' എന്ന വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്നും '''Pancreatic Enzyme Insulin '' വേണ്ടി ''PDB code" കണ്ടുപിടിക്കാൻ ശ്രമിക്കാം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 02: | + | |02:13 |
− | | | + | |''search box'''ക്സിൽ "human insulin" എന്ന പ്രോട്ടീൻ പേര് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. കീ ബോർഡിൽ Enter '' 'കീ അമർത്തുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | 02: | + | |02:24 |
− | | | + | |ഇപ്പോൾ ഡിസ്പ്ലൈ ആയിരിക്കുന്ന വെബ് പേജിൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:28 |
− | | | + | |''Human Insulin'' ഉം ''PDB codes '' എന്ന പേരിലറിയപ്പെടുന്ന സ്ട്രക്ചഴ്സ് സ്ക്രീനിൽ ഡിസ്പ്ലൈ ആവുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:36 |
− | | | + | |ഉദാഹരണമായി, '''4EX1.''' എന്ന ഒരു കോഡുള്ള ''Human Insulin'' തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:44 |
− | | | + | |പ്രോട്ടീൻ പേര് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:47 |
− | | '' ' | + | |സ്ട്രക്ചർന്റെ എല്ലാ വിവരങ്ങളും ഉള്ള ഒരു '''window''' തുറക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:52 |
− | | | + | |വിവരങ്ങൾ- |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:54 |
− | | | + | |'''Primary Citation''' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:56 |
− | | ''' | + | |'''Molecular Description '''and |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |02:58 |
− | | '' ' | + | |'''Structure Validation'' എന്നിവ ഈ പേജിൽ ലഭ്യമാണ്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:02 |
− | | | + | |നമുക്ക് പ്രോട്ടീനുകളുടെ സ്ട്രക്ചഴ്സ് "pdb' ഫയലായും വ്യൂ '''3D mode''' in '''Jmol''' ആയിരിക്കും |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:12 |
− | | | + | |''page'''ന്റെ മുകളില് വലതുകോണിലുള്ള '''Download Files''' ലിങ്ക് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:20 |
− | | ''' | + | |ഡ്രോപ്പ്-ഡൌൺ മെനുവിൽ നിന്നും '' '''PDB file (gz) '' 'ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:28 |
− | | | + | |സ്ക്രീനില് ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:32 |
− | | '' | + | |''Save file''' ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:35 |
− | | | + | |'''OK''' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:39 |
− | | | + | |'' protein '' സ്ട്രക്ചർ '''4EX1.pdb.gz'' '''Downloads" ഫോൾഡറിൽ സേവ് ചെയ്യും. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |03:51 |
− | | | + | |അതുപോലെ, നിങ്ങൾക്ക് വിവിധ പ്രോട്ടീനുകളുടെ '.pdb' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്, അവ '' പ്രത്യേക ഫയലുകൾ '' 'save" ചെയ്യുക. |
|- | |- | ||
− | | | + | |04:02 |
− | | | + | |ഇപ്പോൾ '''Insulin''' എന്നതിന്റെ '' '3D' '' സ്ട്രക്ചർ കാണാനായി '''Jmol''' വിൻഡോയിലേക്ക മാറാം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:09 |
− | | | + | |നിങ്ങൾ ഇന്റർനെറ്റിൽ കണക്റ്റുചെയ്തിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, നിങ്ങൾക്ക് '' Jmol panel' നിന്ന് നേരിട്ട് പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചർ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:15 |
− | | | + | |ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സിൽ 4 ലെറ്റർ '''PDB code “4EX1” ടൈപ്പ് ചെയ്തിട്ട് ''OK' '' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:25 |
− | | '' ' | + | |നിങ്ങൾ ഇന്റർനെറ്റിൽ കണക്റ്റുചെയ്തിട്ടില്ലെങ്കിൽ, ടൂൾ ബാറിൽ ''Open a File'' ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:34 |
− | | | + | |പാനലിൽ ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കുന്നു |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:38 |
− | | '' ' | + | |''Downloads'' ഫോൾഡറിലേക്ക് പോയി '''4EX1.pdb.gz''' ഫയലിന്റെ ലൊക്കേഷൻ നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:47 |
− | | | + | |''Downloads''' ഫോൾഡർ തിരഞ്ഞെടുത്ത് '''Open ''' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |04:52 |
− | | | + | |''4EX1.pdb.gz' '' ഫയൽ തുറന്ന് "Open" ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:00 |
− | | '' | + | |'3D' Structure of Insulin opens on screen. |
|- | |- | ||
− | | | + | |05:05 |
− | | | + | |പാനലിലെ ഡിഫാൾട്ട് ഡിസ്പ്ലേ പ്രോട്ടീൻ എന്നത് "ball and stick" ആണ് |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:12 |
− | | | + | |പാനലിലെ പ്രോട്ടീൻ മാതൃക ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളില്ലാതെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:17 |
− | | '' ' | + | |ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളുമായി മോഡൽ കാണിക്കാൻ '' 'modelkit" മെനു തുറക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:23 |
− | | ''' | + | |''add hydrogens' ഓപ്ഷനിൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് അതിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:28 |
− | | | + | |പാനലിലെ മോഡൽ ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളുമായി ഡിസ്പ്ലൈ ചയ്തരിക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:33 |
− | | '''' | + | |''protein''' സ്ട്രക്ചർ ജല മോളിക്യൂൾസ് ലൂടെ കാണിക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:38 |
− | | | + | |വാട്ടർ മോളിക്യൂൾസ് ഹൈഡ് ചെയ്യാൻ, കാണിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ |സ്റെപ്സ് ഫോളോ ചെയ്യുക |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:43 |
− | | | + | |ആദ്യം, പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് ''Select'' ചെയ്യുക |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:48 |
− | | | + | |സബ്-മെനുവിൽ നിന്നും '' 'Hetero' '' തിരഞ്ഞെടുത്ത് '' All Water'' ഓപ്ഷനിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |05:55 |
− | | | + | |പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, '' 'Style '' >> '' 'Scheme' '' എന്നതിലേക്ക് പോയി '' 'CPK spacefill'' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:05 |
− | | | + | |ഇത് എല്ലാ വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളും '' 'CPK Spacefill ' '' ഡിസ്പ്ലമായി കൺവെർട് ചെയ്യും. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:11 |
− | | ''' | + | |വീണ്ടും പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് '' 'Style' '', '' Atoms '' എന്നത് ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് ''Off'' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:22 |
− | | | + | |ഇപ്പോൾ പാനലിൽ, നമുക്ക് '''Insulin''' വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്ത സ്ട്രക്ചറുണ്ട്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:27 |
− | | | + | |അടുത്തതായി, നമുക്ക് '''protein''' ൻറെ വിവിധ രൂപങ്ങളിൽ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുന്ന രീതി പഠിക്കാം. |
|- | |- | ||
− | | | + | |06:35 |
− | | | + | |'''pop-up menu''' ഓപ്പൺ ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:37 |
− | | | + | |'''Select '''ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:39 |
− | | | + | |''Protein '''ന് താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് ''All'' ഓപ്ഷനിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:44 |
− | | | + | |പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു വീണ്ടും തുറന്ന് '' 'Style", എന്നിട്ട് "Scheme.''' എന്നിവയിലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |06:50 |
− | | | + | |''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace''' etc മുതലായ ഓപ്ഷനുകളോടെയാണ് സബ്-മെനു തുറക്കുന്നത് |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:02 |
− | | | + | |സബ്-മെനുവിൽ നിന്നും '' 'Cartoon' '' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:07 |
− | | | + | |ഈ ഡിസ്പ്ലേ പ്രോട്ടീൻ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ കാണിക്കുന്നു ''helices, random coils, strands, sheets '''etc. തുടങ്ങിയവ. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:17 |
− | | | + | |കൂടുതൽ ഡിസ്പ്ലൈ ഓപ്ഷനുകൾക്ക്- |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:19 |
− | | | + | |പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് '''Style''' ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക, തുടർന്ന്' '' Structures''. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:25 |
− | | | + | |ഇവിടെ പ്രോട്ടീനിലെ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുന്നതിന് നമുക്ക് കൂടുതൽ ഓപ്ഷനുകൾ കാണാം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:31 |
− | | '' ' | + | |ഉദാഹരണത്തിന്, '' 'Strands' '' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:35 |
− | | | + | |ഈ പ്രോട്ടീൻ ഇപ്പോൾ പാനലിലെ '' 'Strands' 'എന്ന പേരിൽ കാണിക്കുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:40 |
− | | | + | |ഡിസ്പ്ലൈയൂഡേ കളർ മാറ്റുന്നതിന്: പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക. '' 'Color' '' താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. '' 'Atoms' '' തിരഞ്ഞെടുത്ത് '' 'Blue' '' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:52 |
− | | | + | |പാനലിൽ നിറങ്ങളുടെ മാറ്റം ശ്രദ്ധിക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:56 |
− | | | + | |സ്ട്രക്ചർ വീണ്ടും '' 'Ball-and-stick' 'ഡിസ്പ്ലേയിലേക്ക് മാറ്റാൻ: |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |07:59 |
− | | '' ' | + | |പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, '' 'Style '', പിന്നെ '' 'Scheme '' തിരഞ്ഞെടുത്ത് '' 'Ball and stick" ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:08 |
− | | | + | |"protein model'' ലിൽ' '''hydrogen bonds'', '' 'di-sulpfide bonds" കളും ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:14 |
− | | | + | |''hydrogen bonds" ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യാൻ: പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന്'' Style" ലേക്കും പിന്നീട്' '' Hydrogen Bonds'' 'ഓപ്ഷൻ ലേക്കും സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:25 |
− | | | + | |പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിലെ "The Hydrogen Bonds" ഓപ്ഷന് ചില ഫീഛേഴ്സ് ഉണ്ട് |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:30 |
− | | | + | |'' Calculate '', '''Set Hydrogen Bonds Side Chain''', |
|- | |- | ||
− | | | + | |08:35 |
− | | | + | |''Set Hydrogen Bonds in the Backbone" ബോണ്ടുകളുടെ തിക്നെസ്സ് മാറ്റാനും ഓപ്ഷനുകൾ ഉണ്ട്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:42 |
− | | | + | |''hydrogen bonds'' മോഡലിൽ കാണിക്കാൻ '' 'Calculate'' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:47 |
− | | | + | |'' 'hydrogen bonds' '' വെളുപ്പും ചുവപ്പും നീളമുള്ള അലങ്കാരങ്ങളായി ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യപ്പെടുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |08:53 |
− | | ''' | + | |''hydrogen bonds" കളുടെ തിക്നെസ്സ് മാറ്റുന്നതിന്,' '' pop-up-menu"വിലെ |"0.10 A" ഓപ്ഷനില് ക്ലിക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:02 |
− | | | + | |ഇപ്പോൾ, പാനലിൽ, നമുക്ക് തിക്കർ "hydrogen bonds" കാണാം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:06 |
− | | | + | |നമുക്ക് ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകളുടെ കളർ മാറ്റാം. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:11 |
− | | | + | |പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിൽ നിന്ന് '' 'Color' '', പിന്നെ '' 'Hydrogen Bonds '' എന്നിവിടങ്ങളിലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക, തുടർന്ന് '' 'orange'' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:20 |
− | | '''' | + | |പാനലിൽ, ഓറഞ്ച് കളറിൽ എല്ലാ '' 'hydrogen bonds' 'ഉണ്ട്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:25 |
− | | | + | |Disulfide bonds''' and '''sulphur''' ആറ്റങ്ങൾ എന്നിവയാണ് മഞ്ഞ നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നത്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:31 |
− | | | + | |ഡിഫൈൽഫൈഡ് ബോൻഡുകൾ മോഡിഫയ് ചെയ്യാൻ , പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിലെ''disulfide bonds''' ഓപ്ഷൻ തുറക്കുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:38 |
− | | | + | |'''size''', '''color''' തുടങ്ങിയവ പോലെ നിങ്ങൾ മാറ്റാൻ ആഗ്രഹിക്കുന്ന സവിശേഷതകളിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:44 |
− | | | + | |അതുപോലെതന്നെ, വ്യത്യസ്ത ''enzymes ''' .pdb' 'ഫയലുകൾ തുറന്ന് അവരുടെ' '' 3D '' 'സ്ട്രക്ചഴ്സ് കാണുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:51 |
− | | | + | |നമുക്ക് സമ്മറൈസ് ചെയ്യാo. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്: |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |09:57 |
− | | | + | |പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചഴ്സ് '''Protein Data Bank''' (PDB). ൽനിന്ന് '' 'Load' '' ചെയ്യാൻ |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:00 |
− | | | + | |ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് 'pdb' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:05 |
− | | | + | |'' 'PDB code" ഉപയോഗിച്ചുള്ള ഇൻസുലിൻന്റെ ' '3D structure' '' |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:10 |
− | | | + | |'''Protein''' വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്ത ഘടന. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:14 |
− | | | + | |വിവിധ ഫോർമാറ്റുകളിലെ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുക |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:17 |
− | | '' ' | + | |''hydrogen bonds '''and '''disulfide bonds''' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:22 |
− | | | + | |നിങ്ങൾക്ക് ഒരു അസൈൻമെന്റ്- |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:24 |
− | | | + | |''PDB' 'ഡാറ്റാബേസിലെ' 'Human Hemoglobin' 'ന്റെ' .pdb '' ഫയൽ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:31 |
− | | | + | |'''cartoon''' ഡിസ്പ്ലേയിൽ സെക്കണ്ടറി സ്ട്രക്ചർ കാണിക്കുക. |
|- | |- | ||
− | | | + | |10:35 |
− | | | + | |പ്രോട്ടീൻ യൂണിറ്റുകൾ "porphyrin" ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:39 |
− | | '' ' | + | |''PDB code.''' എന്നതിനായി ഇനിപ്പറയുന്ന ലിങ്ക് കാണുക. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:42 |
− | | | + | |ഈ URL ൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക. http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:46 |
− | | '' | + | |''Spoken Tutorial" പ്രൊജക്റ്റ് സമ്മറൈസ് ചെയ്യുന്നു. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:50 |
− | | | + | |നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്. |
− | + | ||
|- | |- | ||
− | | | + | |10:55 |
− | | | + | |സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം: |
− | + | |- | |
+ | |10:57 | ||
+ | |സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. | ||
+ | |- | ||
+ | |11:01 | ||
+ | |ഓൺ-ലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫികറ്റുകൾ നല്കുന്നു. | ||
+ | |- | ||
+ | |11:06 | ||
+ | |കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് ദയവായി ഇതിലേക്ക് എഴുതുക: '''contact@spoken-tutorial.org''' | ||
+ | |- | ||
+ | |11:13 | ||
+ | |''Spoken Tutorial'' പ്രോജക്റ്റ് ''Talk to a Teacher'' പദ്ധതിയുടെ ഭാഗമാണ്. | ||
+ | |- | ||
+ | |11:18 | ||
+ | |ഇത് സപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നതു നാഷണൽ മിഷൻ ഓൺ എഡ്യൂക്കേഷൻ ത്രൂ ഐസിടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ. | ||
+ | |- | ||
+ | |11:25 | ||
+ | |ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ ഈ ലിങ്കിലുണ്ട്: ''http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro'''. | ||
+ | |- | ||
+ | |11:31 | ||
+ | |ഇത് '''IIT Bombay''' യിൽ നിന്ന് വൈശാഖ് ആണ്.പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി. | ||
|} | |} |
Revision as of 11:40, 2 February 2018
One
Time | Narration |
00:01 | Proteins and Macromolecules.' എന്ന ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം. |
00:06 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കുന്നതു: |
00:09 | Protein Data Bank (PDB)' ൽനിന്നുള്ള protein ന്റെ Load സ്ട്രക്ചഴ്സ്. |
00:13 | 'pdb' ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് 'PDB' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക |
00:18 | വിവിധ ഫോർമാറ്റിൽ പ്രോട്ടീനുകളുടെ സെകണ്ടറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുക. |
00:24 | hydrogen bonds and disulfide bonds' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക |
00:29 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ ഫോളോ ചെയ്യാൻ, Jmol Application window ലെ ബേസിക് ഓപ്പറേഷൻസ് ഫെമിലിയർ ആയിരിക്കണം.' |
00:37 | ഇല്ലെങ്കിൽ, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റിൽ ലഭ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ കാണുക. |
00:42 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ റെക്കോർഡ് ചെയ്യാൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നതു: |
00:46 | Ubuntu OS version 12.04 |
00:50 | Jmol version 12.2.2 |
00:54 | Java version 7 |
00:57 | Mozilla Firefox Browser 22.0. |
01:02 | വലിയ ജീവജാലങ്ങളുടെ Structure Analysis. |
01:06 | Proteins and Macromolecules |
01:10 | Nucleic acids, DNA and RNA |
01:13 | Jmol Application. ഉപയോഗിച്ച് Crystal structures and polymers ചെയ്യാം |
01:19 | ഇവിടെ, ഒരു പുതിയ Jmol window" തുറന്നിരിക്കുന്നു. |
01:24 | 3D structure" ബയോമോല്യൂളുകൾ ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് നേരിട്ട് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്. |
01:29 | അങ്ങനെ ചെയ്യാൻ, File മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക, 'Get PDB ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ഡൗൺ ചെയ്യുക |
01:36 | screen" നിൽ ഒരു Input 'ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു. |
01:40 | നാം Input ബോക്സിലെ protein നുള്ള നാലു ലെറ്റർ PDb കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യണം. |
01:48 | Protein Data Bank (PDB) വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് ഈ കോഡ് ലഭിക്കും. |
01:53 | ഇത് Protein Data Bank ന്റെ വെബ് പേജാണ്. |
01:57 | proteins and nucleic acids 'തുടങ്ങിയ ബയോമോല്യൂളുകൾ സംബന്ധിച്ച വിവരങ്ങൾ ഇതിന് ഉണ്ട്. |
02:04 | ഉദാഹരണമായി, PDB എന്ന വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്നും Pancreatic Enzyme Insulin വേണ്ടി PDB code" കണ്ടുപിടിക്കാൻ ശ്രമിക്കാം. |
02:13 | search boxക്സിൽ "human insulin" എന്ന പ്രോട്ടീൻ പേര് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. കീ ബോർഡിൽ Enter 'കീ അമർത്തുക. |
02:24 | ഇപ്പോൾ ഡിസ്പ്ലൈ ആയിരിക്കുന്ന വെബ് പേജിൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. |
02:28 | Human Insulin ഉം PDB codes എന്ന പേരിലറിയപ്പെടുന്ന സ്ട്രക്ചഴ്സ് സ്ക്രീനിൽ ഡിസ്പ്ലൈ ആവുന്നു. |
02:36 | ഉദാഹരണമായി, 4EX1. എന്ന ഒരു കോഡുള്ള Human Insulin തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
02:44 | പ്രോട്ടീൻ പേര് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
02:47 | സ്ട്രക്ചർന്റെ എല്ലാ വിവരങ്ങളും ഉള്ള ഒരു window തുറക്കുന്നു. |
02:52 | വിവരങ്ങൾ- |
02:54 | Primary Citation |
02:56 | Molecular Description and |
02:58 | 'Structure Validation എന്നിവ ഈ പേജിൽ ലഭ്യമാണ്. |
03:02 | നമുക്ക് പ്രോട്ടീനുകളുടെ സ്ട്രക്ചഴ്സ് "pdb' ഫയലായും വ്യൂ 3D mode in Jmol ആയിരിക്കും |
03:12 | page'ന്റെ മുകളില് വലതുകോണിലുള്ള Download Files ലിങ്ക് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
03:20 | ഡ്രോപ്പ്-ഡൌൺ മെനുവിൽ നിന്നും PDB file (gz) 'ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
03:28 | സ്ക്രീനില് ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കുന്നു. |
03:32 | Save file' ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
03:35 | OK ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
03:39 | protein സ്ട്രക്ചർ 4EX1.pdb.gz Downloads" ഫോൾഡറിൽ സേവ് ചെയ്യും. |
03:51 | അതുപോലെ, നിങ്ങൾക്ക് വിവിധ പ്രോട്ടീനുകളുടെ '.pdb' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്, അവ പ്രത്യേക ഫയലുകൾ 'save" ചെയ്യുക. |
04:02 | ഇപ്പോൾ Insulin എന്നതിന്റെ '3D' സ്ട്രക്ചർ കാണാനായി Jmol വിൻഡോയിലേക്ക മാറാം. |
04:09 | നിങ്ങൾ ഇന്റർനെറ്റിൽ കണക്റ്റുചെയ്തിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, നിങ്ങൾക്ക് Jmol panel' നിന്ന് നേരിട്ട് പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചർ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാം. |
04:15 | ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സിൽ 4 ലെറ്റർ PDB code “4EX1” ടൈപ്പ് ചെയ്തിട്ട് OK' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
04:25 | നിങ്ങൾ ഇന്റർനെറ്റിൽ കണക്റ്റുചെയ്തിട്ടില്ലെങ്കിൽ, ടൂൾ ബാറിൽ Open a File ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
04:34 | പാനലിൽ ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കുന്നു |
04:38 | Downloads ഫോൾഡറിലേക്ക് പോയി 4EX1.pdb.gz ഫയലിന്റെ ലൊക്കേഷൻ നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക. |
04:47 | Downloads' ഫോൾഡർ തിരഞ്ഞെടുത്ത് Open ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
04:52 | 4EX1.pdb.gz' ഫയൽ തുറന്ന് "Open" ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
05:00 | '3D' Structure of Insulin opens on screen. |
05:05 | പാനലിലെ ഡിഫാൾട്ട് ഡിസ്പ്ലേ പ്രോട്ടീൻ എന്നത് "ball and stick" ആണ് |
05:12 | പാനലിലെ പ്രോട്ടീൻ മാതൃക ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളില്ലാതെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. |
05:17 | ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളുമായി മോഡൽ കാണിക്കാൻ 'modelkit" മെനു തുറക്കുക. |
05:23 | add hydrogens' ഓപ്ഷനിൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് അതിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
05:28 | പാനലിലെ മോഡൽ ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളുമായി ഡിസ്പ്ലൈ ചയ്തരിക്കുന്നു. |
05:33 | protein' സ്ട്രക്ചർ ജല മോളിക്യൂൾസ് ലൂടെ കാണിക്കുന്നു. |
05:38 | സ്റെപ്സ് ഫോളോ ചെയ്യുക |
05:43 | ആദ്യം, പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് Select ചെയ്യുക |
05:48 | സബ്-മെനുവിൽ നിന്നും 'Hetero' തിരഞ്ഞെടുത്ത് All Water ഓപ്ഷനിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
05:55 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, 'Style >> 'Scheme' എന്നതിലേക്ക് പോയി 'CPK spacefill ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
06:05 | ഇത് എല്ലാ വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളും 'CPK Spacefill ' ഡിസ്പ്ലമായി കൺവെർട് ചെയ്യും. |
06:11 | വീണ്ടും പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് 'Style' , Atoms എന്നത് ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Off ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
06:22 | ഇപ്പോൾ പാനലിൽ, നമുക്ക് Insulin വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്ത സ്ട്രക്ചറുണ്ട്. |
06:27 | അടുത്തതായി, നമുക്ക് protein ൻറെ വിവിധ രൂപങ്ങളിൽ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുന്ന രീതി പഠിക്കാം. |
06:35 | pop-up menu ഓപ്പൺ ചെയ്യുക. |
06:37 | Select ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
06:39 | Protein 'ന് താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് All ഓപ്ഷനിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
06:44 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു വീണ്ടും തുറന്ന് 'Style", എന്നിട്ട് "Scheme.' എന്നിവയിലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. |
06:50 | CPK Spacefill', Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace etc മുതലായ ഓപ്ഷനുകളോടെയാണ് സബ്-മെനു തുറക്കുന്നത് |
07:02 | സബ്-മെനുവിൽ നിന്നും 'Cartoon' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
07:07 | ഈ ഡിസ്പ്ലേ പ്രോട്ടീൻ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ കാണിക്കുന്നു helices, random coils, strands, sheets 'etc. തുടങ്ങിയവ. |
07:17 | കൂടുതൽ ഡിസ്പ്ലൈ ഓപ്ഷനുകൾക്ക്- |
07:19 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് Style ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക, തുടർന്ന്' Structures. |
07:25 | ഇവിടെ പ്രോട്ടീനിലെ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുന്നതിന് നമുക്ക് കൂടുതൽ ഓപ്ഷനുകൾ കാണാം. |
07:31 | ഉദാഹരണത്തിന്, 'Strands' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
07:35 | ഈ പ്രോട്ടീൻ ഇപ്പോൾ പാനലിലെ 'Strands' 'എന്ന പേരിൽ കാണിക്കുന്നു. |
07:40 | ഡിസ്പ്ലൈയൂഡേ കളർ മാറ്റുന്നതിന്: പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക. 'Color' താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. 'Atoms' തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'Blue' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
07:52 | പാനലിൽ നിറങ്ങളുടെ മാറ്റം ശ്രദ്ധിക്കുക. |
07:56 | സ്ട്രക്ചർ വീണ്ടും 'Ball-and-stick' 'ഡിസ്പ്ലേയിലേക്ക് മാറ്റാൻ: |
07:59 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, 'Style , പിന്നെ 'Scheme തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'Ball and stick" ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
08:08 | "protein model ലിൽ' 'hydrogen bonds, 'di-sulpfide bonds" കളും ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്. |
08:14 | hydrogen bonds" ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യാൻ: പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് Style" ലേക്കും പിന്നീട്' Hydrogen Bonds 'ഓപ്ഷൻ ലേക്കും സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. |
08:25 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിലെ "The Hydrogen Bonds" ഓപ്ഷന് ചില ഫീഛേഴ്സ് ഉണ്ട് |
08:30 | Calculate , Set Hydrogen Bonds Side Chain, |
08:35 | Set Hydrogen Bonds in the Backbone" ബോണ്ടുകളുടെ തിക്നെസ്സ് മാറ്റാനും ഓപ്ഷനുകൾ ഉണ്ട്. |
08:42 | hydrogen bonds മോഡലിൽ കാണിക്കാൻ 'Calculate ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
08:47 | 'hydrogen bonds' വെളുപ്പും ചുവപ്പും നീളമുള്ള അലങ്കാരങ്ങളായി ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യപ്പെടുന്നു. |
08:53 | "0.10 A" ഓപ്ഷനില് ക്ലിക് ചെയ്യുക. |
09:02 | ഇപ്പോൾ, പാനലിൽ, നമുക്ക് തിക്കർ "hydrogen bonds" കാണാം. |
09:06 | നമുക്ക് ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകളുടെ കളർ മാറ്റാം. |
09:11 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിൽ നിന്ന് 'Color' , പിന്നെ 'Hydrogen Bonds എന്നിവിടങ്ങളിലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക, തുടർന്ന് 'orange ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
09:20 | പാനലിൽ, ഓറഞ്ച് കളറിൽ എല്ലാ 'hydrogen bonds' 'ഉണ്ട്. |
09:25 | Disulfide bonds and sulphur ആറ്റങ്ങൾ എന്നിവയാണ് മഞ്ഞ നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നത്. |
09:31 | ഡിഫൈൽഫൈഡ് ബോൻഡുകൾ മോഡിഫയ് ചെയ്യാൻ , പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിലെdisulfide bonds' ഓപ്ഷൻ തുറക്കുക. |
09:38 | size, color തുടങ്ങിയവ പോലെ നിങ്ങൾ മാറ്റാൻ ആഗ്രഹിക്കുന്ന സവിശേഷതകളിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
09:44 | അതുപോലെതന്നെ, വ്യത്യസ്ത enzymes ' .pdb' 'ഫയലുകൾ തുറന്ന് അവരുടെ' 3D 'സ്ട്രക്ചഴ്സ് കാണുക. |
09:51 | നമുക്ക് സമ്മറൈസ് ചെയ്യാo. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്: |
09:57 | പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചഴ്സ് Protein Data Bank (PDB). ൽനിന്ന് 'Load' ചെയ്യാൻ |
10:00 | ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് 'pdb' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. |
10:05 | 'PDB code" ഉപയോഗിച്ചുള്ള ഇൻസുലിൻന്റെ ' '3D structure' |
10:10 | Protein വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്ത ഘടന. |
10:14 | വിവിധ ഫോർമാറ്റുകളിലെ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്പ്ലൈ ചെയ്യുക |
10:17 | hydrogen bonds and disulfide bonds' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക. |
10:22 | നിങ്ങൾക്ക് ഒരു അസൈൻമെന്റ്- |
10:24 | PDB' 'ഡാറ്റാബേസിലെ' 'Human Hemoglobin' 'ന്റെ' .pdb ഫയൽ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക. |
10:31 | cartoon ഡിസ്പ്ലേയിൽ സെക്കണ്ടറി സ്ട്രക്ചർ കാണിക്കുക. |
10:35 | പ്രോട്ടീൻ യൂണിറ്റുകൾ "porphyrin" ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക. |
10:39 | PDB code.' എന്നതിനായി ഇനിപ്പറയുന്ന ലിങ്ക് കാണുക. |
10:42 | ഈ URL ൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക. http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial |
10:46 | Spoken Tutorial" പ്രൊജക്റ്റ് സമ്മറൈസ് ചെയ്യുന്നു. |
10:50 | നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്. |
10:55 | സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം: |
10:57 | സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. |
11:01 | ഓൺ-ലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫികറ്റുകൾ നല്കുന്നു. |
11:06 | കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് ദയവായി ഇതിലേക്ക് എഴുതുക: contact@spoken-tutorial.org |
11:13 | Spoken Tutorial പ്രോജക്റ്റ് Talk to a Teacher പദ്ധതിയുടെ ഭാഗമാണ്. |
11:18 | ഇത് സപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നതു നാഷണൽ മിഷൻ ഓൺ എഡ്യൂക്കേഷൻ ത്രൂ ഐസിടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ. |
11:25 | ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ ഈ ലിങ്കിലുണ്ട്: http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro'. |
11:31 | ഇത് IIT Bombay യിൽ നിന്ന് വൈശാഖ് ആണ്.പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി. |