Difference between revisions of "Avogadro/C2/Edit-molecules/Malayalam"
From Script | Spoken-Tutorial
Line 97: | Line 97: | ||
|| 02:02 | || 02:02 | ||
|| ശരിയായ അലൈൻമെന്റ് ലഭിക്കാൻ '''Navigation ''' ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച്സ്ട്രക്ച്ചർ റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക | || ശരിയായ അലൈൻമെന്റ് ലഭിക്കാൻ '''Navigation ''' ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച്സ്ട്രക്ച്ചർ റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക | ||
+ | |- | ||
|| 02:09 | || 02:09 | ||
|| നമ്മൾ ഇപ്പോൾ ആട്ടാനകളെ ചേർത്ത് തന്മാത്രകളെ എങ്ങനെ പഠിക്കാമെന്ന് പഠിക്കും. | || നമ്മൾ ഇപ്പോൾ ആട്ടാനകളെ ചേർത്ത് തന്മാത്രകളെ എങ്ങനെ പഠിക്കാമെന്ന് പഠിക്കും. |
Latest revision as of 12:58, 24 July 2018
Time | Narration |
00:01 | എല്ലാവർക്കും . Edit molecules. എന്ന ഈട്യൂട്ടോറിയലിലേയ്ക്ക് സ്വാഗതം |
00:08 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും - ആറ്റങ്ങള് ചേര്ക്കുക, ഡിലീറ്റ് ചെയുക |
00:14 | 'ബോണ്ട്' 'കൂട്ടിച്ചേർക്കുക, ഡിലീറ്റ് ചെയുക |
00:16 | ബോണ്ടുകൾ,റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക |
00:18 | ബോൻഡിലെ ലെങ്ത് മാറ്റുന്നു, |
00:20 | ഹൈഡ്രജനെ മിഥില് ഗ്രൂപ്പിലേക്ക് മാറ്റുക, |
00:23 | സ്ട്രക്ചേർസ് 'കോപ്പി, പേസ്റ്റ്' ,ജോയിൻ എന്നിവ ചെയുക |
00:27 | ഇവിടെ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു:
'ഉബുണ്ടു ലിനക്സ്' 'OS പതിപ്പ്. 14.04, 'അവോഗാഡ്രോ' പതിപ്പ് 1.1.1. |
00:37 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, നിങ്ങൾ പരിചയത്തിലായിരിക്കണം: Avogadro ഇൻറർഫേസ്. |
00:43 | ഇല്ലെങ്കിൽ, അനുയോജ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾക്കായി, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക. |
00:49 | Avogadro ., ടെർമിനൽ 'ഉപയോഗിച്ചു് ഇവിടെ എങ്ങനെ തുറക്കാം എന്നു കാണിക്കും. |
00:55 | ടെർമിനൽ തുറക്കുന്നതിനായി 'CTRL, ALT' , 'T' കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക. |
01:03 | 'പ്രോംപ്റ്റില്' avogadro ടൈപ്പ് ചെയ്യുകയുംEnter.അമര്ത്തുകയും ചെയ്യുക. |
01:08 | Avogadro application window തുറക്കുന്നു. |
01:12 | പ്രകടനത്തിനായി,Fragment libraryൽ നിന്നുംn-butane ന്റെ ഒരു മോളിക്യുൽ ഞാൻ പ്രദർശിപ്പിക്കും. |
01:19 | Build മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. Insert->Fragment എന്നതിലേക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക |
01:25 | Insert fragmentഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണിക്കുന്നു |
01:29 | 'fragments,ന്റെ ലിസ്റ്റിൽ നിന്നും alkanes ഫോൾഡർ തുറക്കുന്നതിനു ഡബിൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
01:35 | ഡ്രോപ്പ് ഡ്രോപ്പിൽ നിന്നുംbutane.cml തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
01:41 | Insertബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.Insert Fragment ഡയലോഗ് ബോക്സ് അടയ്ക്കുന്നതിന് X ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
01:49 | 'butane മോളിക്യുലസ് നീല നിറത്തിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്ന തന്മാത്രപത്രം Panel.കാണുന്നു. |
01:54 | ഹൈലൈറ്റുചെയ്തത് ഒഴിവാക്കുന്നതിന്, 'Ctrl, Shift' , A കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക. |
02:02 | ശരിയായ അലൈൻമെന്റ് ലഭിക്കാൻ Navigation ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച്സ്ട്രക്ച്ചർ റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക |
02:09 | നമ്മൾ ഇപ്പോൾ ആട്ടാനകളെ ചേർത്ത് തന്മാത്രകളെ എങ്ങനെ പഠിക്കാമെന്ന് പഠിക്കും. |
02:14 | tool bar.എന്നതിലെ Draw tool ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
02:18 | പാനലിൽ അവസാനം 'കാർബൺ' 'ആറ്റം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
02:23 | ആവശ്യമുള്ള ഹൈഡ്രജനുമായി കാർബൺ ആറ്റം ചേർക്കുന്നു. |
02:27 | നമ്മൾ 'പാനൽ' Pentane' 'ഒരു മോളിക്യുൽ ഉണ്ട് |
02:32 | അതുപോലെ, 'ആൽക്കെയ്ണുകളുടെ ഒരു പരമ്പര ഉണ്ടാക്കാൻ' 'Draw tool'ഉപയോഗിച്ച് നിങ്ങൾക്ക് ആറ്റോമുകൾ ചേർക്കാൻ കഴിയും. |
02:39 | ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കുക. 'Draw tool ഉപയോഗിച് propaneവരയ്ക്കുക. |
02:45 | 'Ethan' മോളിക്യൂൾ ലഭിക്കാൻ ഹൈഡ്രജൻ ഉപയോഗിച്ച് കാർബൺ ആറ്റം ഡിലീറ്റ് ചെയുക |
02:52 | അണുക്കളെ ഇല്ലാതാക്കാൻ, ടൂൾ ബാറിലെ Selection toolഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
02:57 | തിരഞ്ഞെടുക്കുവാൻ അവസാന ത്തെ കാർബൺ ആറ്റം ക്ലിക്കുചെയ്ത് വലിച്ചിടുക. |
03:02 | തിരഞ്ഞെടുക്കപ്പെട്ട ആറ്റങ്ങൾ നീല നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നു. |
03:06 | ഡിലീറ്റ് ചെയ്യാൻ Backspace അമർത്തുക. പകരം, Edit മെനുവിൽ വ്യക്തമായ ഓപ്ഷൻ ഉപയോഗിക്കാം. |
03:14 | redo, ചെയ്യുവാൻ അമർത്തുക, 'Ctrl' , 'Z' 'കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക. |
03:20 | ഒരു മോളിക്യുൽ ൽ 'ബോണ്ട്' 'എങ്ങനെയാണ് ചേർക്കാനും നീക്കം ചെയ്യാനും കാണിക്കാം |
03:26 | ബോണ്ടുകൾ ചേർക്കാൻ, നീക്കം ചെയ്യാൻ ടൂൾ ബാറിലെ Draw tool ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
03:31 | Draw Settings മെനു ഇടത് വശത്ത് തുറക്കുന്നു. |
03:35 | ഡിഫാൾട് ആയി , Element ഡ്രോപ്പ് ഡൌൺ ലിസ്റ്റിൽCarbon തിരഞ്ഞെടുക്കപ്പെടുന്നു. |
03:40 | ഒരു ഡബിൾ ബോണ്ട് പരിചയപ്പെടുത്താൻ,Bond Order ഡ്രോപ്പ് ഡൗണിൽ നിന്ന് Doubleതിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
03:46 | C-1, C-2 എന്നിവ തമ്മിലുള്ള ബോണ്ട് ഒരു ഡബിൾ ബോണ്ടിലേക്ക് മാറ്റുക. |
03:52 | ഡബിൾ ബോൻഡ് ട്രിപ്പിൾ ബോണ്ടായി മാറ്റുക, Bond Order.എന്നതിൽ നിന്ന് Triple തിരഞ്ഞെടുക്കുക.' ബോണ്ടിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
03:59 | ബോണ്ടുകൾ നീക്കം ചെയ്യുന്നതിനായി, വലത്mouse buttonബോണ്ടുകൾ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
04:04 | ഇത് രണ്ട് വ്യത്യസ്ത മോളിക്യുലസ് ആണ് |
04:08 | നമുക്ക് മോളിക്യൂളുകളിൽ വീണ്ടും ചേർക്കാം. |
04:11 | ഒരു മോളിക്യൂളുകളി കാർബനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് ഡ്രാഗ് ചെയ്ത് മറ്റ് തന്മാത്രകളുടെ കാർബൺ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
04:18 | ബോണ്ട് സെന്ററി മാനിപുലേഷൻ ഉപയോഗിച്ച് നമുക്ക് ബോണ്ടുകൾ റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക , ബോണ്ട് ലെങ്ത് മാറ്റാം. |
04:24 | ടൂൾ ബാറിൽ Bond Centric Manipulation ടൂൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
04:29 | Bond Centric Manipulate മെനു ഇടത് വശത്ത് സെറ്റിങ്സ് മെനു തുറക്കുന്നു. |
04:34 | ഡിഫാൾട് ആയി , Show Angles Snap-to Bonds എന്നിവ ചെക് ചെയ്തിരിക്കുന്നു |
04:39 | Snap-to Threshold '(10 degree).സെറ്റ് ചെയുക |
04:43 | യൂസേഴ്സ് നു ആവശ്യാനുസരണം സെറ്റിംഗ്സ് തിരഞ്ഞെടുക്കാം. |
04:49 | ആംഗിള്സ് കാണിക്കാനായി രണ്ട് ആറ്റങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള ബോണ്ടിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
04:55 | നാം ബോണ്ടുകളുടെ പ്ലെയിൻ ഓഫ് റൊട്ടേഷൻ നമുക്ക് ഫിക്സ് ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട് |
04:59 | നിങ്ങൾക്കാവശ്യമുള്ളത്രയും പ്ലെയിൻ ശരിയാക്കാൻ, ബോണ്ടിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് മുകളിലേക്കോ താഴേക്കോ നീക്കുക. |
05:05 | ആറ്റം തമ്മിലുള്ള പ്ലെയിൻ നീല അല്ലെങ്കിൽ മഞ്ഞനിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നു. |
05:11 | റൊട്ടേറ്റ് ചെയുക , ആറ്റങ്ങളിൽ ഒരെണ്ണം ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് നീക്കുക. |
05:16 | നിശ്ചിത പ്ലെയിനിൽ ആറ്റങ്ങളും സഹിതം ഘടിപ്പിച്ചിട്ടുള്ള ബോണ്ട് ഭ്രമണം ചെയ്യുന്നു. |
05:21 | ബോണ്ടിന്റെ ലെങ്ത് മാറ്റുന്നതിന്, വലതു വശത്ത് mouse button അമർത്തി പിടിച്ച ഡ്രാഗ് ചെയുക |
05:27 | ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജനെ methyl ഗ്രൂപ്പുകളാക്കി മാറ്റുന്നത് എങ്ങനെയെന്ന് കാണിക്കാം. |
05:32 | Build മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്ത്'Change H To Methyl. ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
05:38 | എല്ലാ ഹൈഡ്രജനുകളും ഇപ്പോൾ Methylഗ്രൂപ്പുകളാൽ മാറ്റുന്നു. |
05:43 | ചെഞ്ചസ് undo ചെയ്യാൻ 'CTRL' Zകീകള് ഒരേ സമയം അമർത്തുക |
05:49 | നമുക്ക് ഒരു പ്രത്യേക ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റവും തിരഞ്ഞെടുത്ത് ഒരുmethyl ഗ്രൂപ്പിലേക്ക് മാറ്റാം. |
05:55 | ടൂൾ ബാറിൽSelection tool ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക |
05:59 | അവസാനത്തെ കാർബൺ ആറ്റം അറ്റാച്ച് ചെയ്ത ഹൈഡ്രജനിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
06:04 | Build മെനുവിലേക്ക് പോയി'Change H to Methyl.എന്നിടത്ത് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
06:10 | തിരഞ്ഞെടുത്ത 'ഹൈഡ്രജനെ' METHYL 'ഗ്രൂപ്പ് മാറ്റിസ്ഥാപിക്കും. |
06:15 | ഡീസെലെൿറ് മാറ്റാൻ, 'Ctrl, Shift' , 'A' 'കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക. |
06:22 | നമുക്ക് എങ്ങനെ സ്ട്രക്ച്ചർ copy, paste JOIN എന്നിവ ചെയുന്നത് നോക്കാം. |
06:28 | File-> New എന്ന പേരിൽ ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കാൻ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
06:33 | നമുക്ക് ഒരു 'Maltose' മോളിക്യുൽ ഉണ്ടാക്കാൻ പഠിക്കാം. |
06:37 | ' 'Maltose' ' glucose മോളിക്യുലസ് കൊണ്ടാണ് നിർമിച്ചത് . |
06:41 | glucose മോളിക്യൂൾ ചേർക്കുന്നതിന്, Buildമെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
06:46 | Insert -> Fragmentസ്ക്രോൾ ഡൌൺ ചെയുക |
06:51 | Insert -> Fragment ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു. |
06:55 | ലിസ്റ്റ് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Cyclic sugarഫോൾഡറുകൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
07:01 | ഒരു സബ് മെനു കാണുന്നു. |
07:04 | താഴേയ്ക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക, 'beta-d-glucopyranose.cml.തിരഞ്ഞെടുക്കുക.' |
07:10 | Insert ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. ഡയലോഗ് ബോക്സ് ക്ലോസ് ചെയ്യുക. |
07:16 | beta-D-glucopyranose.cmlദൃശ്യമാകുമ്പോൾ 'പാനൽ' ൽ നീല നിറത്തിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. |
07:24 | 'ഹാൻഡ് ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച് മധ്യഭാഗത്ത് Translate ചെയ്യുക. |
07:28 | മറ്റൊരു' 'Glucose' മോളിക്യൂലെ copy paste ചെയ്യാം |
07:33 | മെനു ബാറിലെ Edit മെനുവിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
07:36 | എന്നിട്ട് Copy. എന്നിടത്ത് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. വീണ്ടും എഡിറ്റ് മെനു താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Paste.ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
07:44 | ദയവായി ശ്രദ്ധിക്കുക: കോപ്പി, പേസ്റ്റ് പ്രക്രിയ സമയത്ത്, ഒരു നിമിഷം വിൻഡോ മങ്ങുകയും തുടർന്ന് അത് റിക്കവർ ചെയ്യുകയും ചെയ്യും |
07:51 | ഒരു പുതിയ മോളിക്യൂൾ നിലവിലുള്ള പാനിൽ കോപ്പി പേസ്റ്റ് ചെയ്തിട്ടുണ്ട്. |
07:58 | ഒരു ഹാൻഡ് ടൂൾ ൽ കഴ്സർ മാറുന്നു. |
08:01 | ഒറിജിനൽ മോളിക്യുൽ ൽ നിന്നും കോപ്പി ചെയ്ത മോളിക്യുൽ നീക്കുന്നു |
08:06 | ഇപ്പോൾ നമുക്ക് പാനലിലെ രണ്ട് വ്യത്യസ്ത തന്മാത്രകൾ ഉണ്ട്. |
08:10 | ഡി-സെലക്റ്റ് ചെയ്യുന്നതിന് 'Ctrl, Shift' ,A കീകൾ ഒരേസമയം അമർത്തുക. |
08:17 | നമുക്ക് മോളിക്യുലസ് ലേബലിൽ കൊണ്ടുവരിക. ലേബലിംഗ് എല്ലാ ആറ്റങ്ങളുടെയും സ്ഥാനങ്ങൾ തിരിച്ചറിയാൻ സഹായിക്കുന്നു. |
08:25 | ലേബൽ ചെയ്യുന്നതിന് Display Types ഡ്രോപ്പ് ഡൗണിൽ നിന്ന് Label ചെക്ക് ബോക്സിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
08:32 | 'Maltose' 'ലഭിക്കാൻ നമുക്ക് ഒരു വാട്ടർ മോളിക്യൂൾ നീക്കം ചെയ്യണം. |
08:37 | രണ്ടാമത്തെ മോളിക്യുൽ C 9 എന്നതിൽ ഹൈദരാജിയനിൽ ആദ്യത്തെ മോളിക്യുൽ C 9 എന്നതിന് OH ഗ്രൂപ്പ് ഇല്ലാതാക്കുക. |
08:46 | Draw tool settings. ലെ Carbon തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
08:50 | Bond Order Single എന്നായി തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
08:54 | Adjust Hydrogensചെക്ക് ബോക്സ്. അൺചെക്ക് ചെയുക |
08:58 | oxygen ആറ്റോം രണ്ടാമത്തെ മോളിക്യുൽ ലെ സി -1 ൽ രണ്ടാമത്തെ മോളിക്യുൽ ലെ സി -9-ൽ ചേരാനായി ക്ലിക്കുചെയ്ത് വലിച്ചിടുക. |
09:07 | നമ്മൾ ജിയോമെറ്ററി ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട്. |
09:11 | Auto Optimization tool.തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
09:15 | Auto Optimization settings ഇടത് വശത്ത് മെനു പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു. |
09:20 | 'MMFF94' ഫോഴ്സ് ഫീൽഡ് തിരഞ്ഞെടുത്ത് Start. ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
09:27 | ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ പൂർത്തിയാക്കാൻ അൽപ്പ സമയം എടുത്തേക്കാം. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ലേബലുകൾ നീക്കംചെയ്യാം. |
09:35 | നമ്മൾ ഇപ്പോൾ പാനലിലെ 'Maltose' 'യുടെ ഒരു മികച്ച രീതിയിലാണ് നിർമ്മിച്ചിരിക്കുന്നത്. |
09:40 | സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്: ആറ്റങ്ങള് ചേര്ക്കുകയും നീക്കം ഡിലീറ്റ് ചെയ്യുക, |
09:47 | ബോണ്ടുകൾ ചേർക്കുക, ഡിലീറ്റ് ചെയ്യുക |
09:50 | റൊട്ടേറ്റ് ബോണ്ടുകൾ, |
09:52 | ബോൻഡ് ലെൻഹ്ത് മാറ്റുക, |
09:54 | ഹൈഡ്രജനെ മിഥില് ഗ്രൂപ്പിലേക്ക് മാറ്റുക, |
09:56 | സ്റ്റ്ക്ച്ചേഴ്സ് .കോപ്പി , പേസ്റ്റ് ജോയിൻ എന്നിവ ചെയുക |
10:00 | ഒരു അസൈൻമെന്റായി, ഡ്രോപ്പ് ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച് ബൂട്ടെൻ മോളിക്കുൽ ഉണ്ടാക്കുക. |
10:06 | ഇത് '2,3 ഡൈ ബൂട്ടെൻ ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യുക. |
10:10 | ബോണ്ടുകൾ തിരിക്കുക, ബോണ്ട് ലെങ്ത് മാറ്റുക. |
10:14 | cellulose എന്ന ഒരു മോളിക്യുൽ നിർമ്മിക്കുക (സൂചന: ഡി-ഗ്ലൂക്കോസ് മോണോമർ ഇൻസേർട്ട് ഫ്രഗ്മെന്റ് റ് ലൈബ്രറിയിൽ ലഭ്യമാണ്) |
10:22 | UFF force field. ഉപയോഗിച്ച് ജിയോമെട്രി ഒപ്റ്റിമൈസുചെയ്യുക. |
10:27 | ഈ വീഡിയോ സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പദ്ധതിയെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു. നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്. |
10:36 | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഞങ്ങൾ വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുകയും സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു. ഞങ്ങളെ ബന്ധപ്പെടുക. |
10:44 | സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്റ്റ് NMEICT MHRD ഗവണ്മെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ എന്നിവരുടെ പിന്തുണയോടു കൂടി നടപ്പാക്കുന്നു |
10:52 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽവിജി നായർ സംഭാവന ചെയ്യുന്നു.
പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി. |