Difference between revisions of "Jmol-Application/C3/Proteins-and-Macromolecules/Hindi"
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Latest revision as of 15:51, 2 January 2015
| Time | Narration |
| 00:01 | 'Proteins और Macromolecules' के इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है। |
| 00:06 | इस ट्यूटोरियल में हम निम्न सीखेंगे |
| 00:09 | * 'प्रोटीन डेटा बैंक (PDB)' से प्रोटीन्स के स्ट्रक्चर्स लोड करना। |
| 00:13 | * 'PDB' डेटाबेस से '.pdb' फाइल्स डाउनलोड करना। |
| 00:18 | * प्रोटीन्स के सेकन्डेरी स्ट्रक्चर्स भिन्न फॉर्मेट्स में दिखाना। |
| 00:24 | * 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' और 'डाईसल्फाइड बॉन्ड्स' हाईलाइट करना। |
| 00:29 | इस ट्यूटोरियल के अनुसरण के लिए आपको 'Jmol एप्लीकेशन विंडो' से बेसिक ऑपरेशंस के साथ परिचित होना चाहिए। |
| 00:37 | यदि नहीं, तो सम्बंधित ट्यूटोरियल्स के लिए हमारी वेबसाइट पर जाएँ। |
| 00:42 | इस ट्यूटोरियल को रिकॉर्ड करने के लिए मैं उपयोग कर रही हूँ, |
| 00:46 | * 'उबन्टु' OS वर्जन 12.04 |
| 00:50 | * 'Jmol' वर्जन 12.2.2 |
| 00:54 | * 'Java' वर्जन 7 |
| 00:57 | * 'Mozilla Firefox' ब्राउज़र 22.0 |
| 01:02 | बड़े 'बायोमॉलिक्यूल्स' के स्ट्रक्चर का विश्लेषण जैसे |
| 01:06 | * 'प्रोटीन्स' और 'मैक्रोमॉलिक्यूल्स' |
| 01:10 | * 'न्यूक्लिक एसिड्स', 'DNA' और 'RNA' |
| 01:13 | * 'क्रिस्टल स्ट्रक्चर्स और पॉलीमर्स' 'Jmol एप्लीकेशन' प्रयोग करके किये जा सकते हैं। |
| 01:19 | यहाँ मैंने एक नयी 'Jmol' विंडो खोली है। |
| 01:24 | 'बायोमॉलिक्यूल्स' के 3D स्ट्रक्चर्स को डेटाबेस से सीधे डाउनलोड करके देखा जा सकता है। |
| 01:29 | ऐसा करने के लिए, 'फाइल' मेन्यू पर क्लिक करें, नीचे 'Get PDB' पर जाएँ। |
| 01:36 | एक इनपुट डायलॉग बॉक्स स्क्रीन पर दिखता है। |
| 01:40 | निश्चित 'प्रोटीन' के लिए हमें इनपुट बॉक्स में चार लेटर का 'PDB code' टाइप करना है। |
| 01:48 | यह कोड 'प्रोटीन डेटा बैंक (PDB)' 'वेबसाइट' से प्राप्त किया जा सकता है। |
| 01:53 | यह 'प्रोटीन डेटा बैंक' का वेब पेज है। |
| 01:57 | यह बायोमॉलिक्यूल्स के बारे में जानकारी रखता है जैसे 'प्रोटीन्स' और 'न्यूक्लिक एसिड्स'। |
| 02:04 | उदाहरण: अब 'PDB' वेबसाइट से 'पैन्क्रीऐटिक एन्ज़ाइम इन्सुलिन' के लिए 'PDB कोड' प्राप्त करने की कोशिश करते हैं। |
| 02:13 | सर्च बॉक्स में प्रोटीन का नाम 'Human' 'इन्सुलिन' टाइप करें। कीबोर्ड पर एंटर की दबाएं। |
| 02:24 | अब, प्रदर्शित वेबपेज पर, नीचे जाएँ। |
| 02:28 | 'PDB कोड्स' के साथ 'ह्यूमन(Human) इन्सुलिन' के ज्ञात स्ट्रक्चर्स की सूची स्क्रीन पर प्रदर्शित होती है। |
| 02:36 | उदाहरण, अब कोड '4EX1' के साथ 'ह्यूमन(Human) इन्सुलिन' सलेक्ट करते हैं। |
| 02:44 | प्रोटीन के नाम पर क्लिक करें। |
| 02:47 | स्ट्रक्चर्स के विवरण के साथ एक विंडो खुलती है। |
| 02:52 | जानकारी जैसे |
| 02:54 | * 'प्राइमरी साइटेशन (Primary Citation)' |
| 02:56 | * 'मॉलिक्यूलर डिस्क्रिप्शन (Molecular Description)' और |
| 02:58 | * 'स्ट्रक्चर वैलिडेशन (Structure Validation)' इस वेबपेज पर उपलब्ध हैं। |
| 03:02 | हम प्रोटीन्स के स्ट्रक्चर्स को '.pdb' फाइल्स में सेव कर सकते हैं, और उनको 'Jmol' में 3D मोड में देख सकते हैं। |
| 03:12 | पेज के ऊपरी दायें कोने पर स्थित, 'Download Files' लिंक पर क्लिक करें। |
| 03:20 | ड्राप डाउन मेन्यू से, 'PDB file (gz)' विकल्प सलेक्ट करें। |
| 03:28 | स्क्रीन पर डायलॉग बॉक्स दिखता है। |
| 03:32 | 'Save file' विकल्प सलेक्ट करें। |
| 03:35 | 'OK' बटन पर क्लिक करें। |
| 03:39 | प्रोटीन का स्ट्रक्चर '4EX1.pdb.gz' में 'Downloads' फोल्डर में सेव किया जायेगा। |
| 03:51 | उसी प्रकार, आप भिन्न प्रोटीन्स की अपेक्षित '.pdb' फाइल्स डाउनलोड कर सकते हैं, और उनको अलग फाइल्स में सेव कर सकते हैं। |
| 04:02 | अब, 'इन्सुलिन' के 3D स्ट्रक्चर को देखने के लिए 'Jmol' विंडो पर जाते हैं। |
| 04:09 | यदि आप इंटरनेट से जुड़े हुए हैं, तो आप Jmol पैनल पर प्रोटीन स्ट्रक्चर को सीधे डाउनलोड कर सकते हैं। |
| 04:15 | टेक्स्ट बॉक्स में चार लेटर का 'PDB कोड “4EX1” ' टाइप करें और 'OK' बटन पर क्लिक करें। |
| 04:25 | यदि आप इंटरनेट से जुड़े हुए नहीं हैं, तो टूल बार पर 'Open a File' आइकन पर क्लिक करें। |
| 04:34 | पैनल पर डायलॉग बॉक्स खुलता है। |
| 04:38 | '4EX1.pdb.gz' की लोकेशन यानि 'Downloads' फोल्डर पर जाएँ। |
| 04:47 | 'Downloads' फोल्डर सलेक्ट करें और 'open' बटन पर क्लिक करें। |
| 04:52 | '4EX1.pdb.gz' फाइल सलेक्ट करें और 'open' बटन पर क्लिक करें। |
| 05:00 | इन्सुलिन का 3D स्ट्रक्चर स्क्रीन पर खुलता है। |
| 05:05 | पैनल पर 'प्रोटीन' का डिफ़ॉल्ट डिस्प्ले 'ball and stick' है। |
| 05:12 | पैनल पर प्रोटीन का मॉडल हाइड्रोजन परमाणुओं से रहित दिखाया गया है। |
| 05:17 | हाइड्रोजन परमाणुओं सहित मॉडल दिखाने के लिए, 'modelkit' मेन्यू खोलें। |
| 05:23 | 'add hydrogens' विकल्प तक नीचे जाएँ और इस पर क्लिक करें। |
| 05:28 | अब पैनल पर मॉडल हाइड्रोजन परमाणुओं सहित दिखाया गया है। |
| 05:33 | 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर को जल अणुओं सहित भी दिखाया गया है। |
| 05:38 | जल अणुओं को छिपाने के लिए, दर्शायी स्टेप्स का अनुसरण करें। |
| 05:43 | पहले पॉप-अप मेन्यू खोलें और 'Select' पर जाएँ। |
| 05:48 | सब-मेन्यू से, 'Hetero' चुनें और 'All Water' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 05:55 | पॉप-अप मेन्यू फिर से खोलें, 'Style', 'Scheme' पर जाएँ और 'CPK spacefill' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 06:05 | यह सभी जल अणुओं को 'CPK spacefill' डिस्प्ले में बदल देगा। |
| 06:11 | पॉप-अप मेन्यू फिर से खोलें 'Style' पर जाएँ, नीचे 'Atoms' पर जाएँ और 'Off' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 06:22 | अब हमारे पास पैनल पर जल अणुओं रहित 'इन्सुलिन' स्ट्रक्चर है। |
| 06:27 | आगे, हम 'प्रोटीन' के सेकेंडरी स्ट्रक्चर को भिन्न फॉर्मेट्स में दिखाना सीखते हैं। |
| 06:35 | पॉप-अप मेन्यू खोलें। |
| 06:37 | 'Select' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 06:39 | नीचे 'Protein' पर जाएँ और 'All' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 06:44 | पॉप-अप मेन्यू दोबारा खोलें और नीचे 'Style' पर जाएँ फिर 'Scheme' पर। |
| 06:50 | 'CPK Spacefill', 'Ball and Stick', 'Sticks', 'Wireframe', 'cartoon', 'trace' आदि जैसे विकल्पों के साथ एक सब-मेन्यू खुलता है। |
| 07:02 | सब-मेन्यू से 'Cartoon' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 07:07 | यह डिस्प्ले प्रोटीन्स के सेकेंडरी स्ट्रक्चर जैसे 'helices, random coils, strands, sheets' आदि दर्शाता है। |
| 07:17 | अधिक डिस्प्ले विकल्पों के लिए, |
| 07:19 | पॉप-अप मेन्यू खोलें और नीचे 'Style' पर जाएँ, फिर 'Structures' पर। |
| 07:25 | यहाँ हम प्रोटीन के सेकेंडरी स्ट्रक्चर को दर्शाने के, और अधिक विकल्प देखते हैं। |
| 07:31 | उदाहरण के लिए, 'Strands' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 07:35 | अब पैनल पर प्रोटीन 'Strands' की तरह दिखाया गया है। |
| 07:40 | डिस्प्ले का रंग बदलने के लिए, पॉप-अप मेन्यू खोलें। नीचे 'Color' पर जाएँ, 'Atoms' सलेक्ट करें और 'Blue' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 07:52 | पैनल पर रंग में बदलाव देखें। |
| 07:56 | स्ट्रक्चर को वापस 'Ball-and-stick' डिस्प्ले में बदलने के लिए, |
| 07:59 | पॉप-अप मेन्यू खोलें, 'Style' सलेक्ट करें, फिर 'Scheme' और 'Ball and stick' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 08:08 | हम प्रोटीन मॉडल में 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' और 'डाई-सल्फाइड बॉन्ड्स' को भी हाईलाइट कर सकते हैं। |
| 08:14 | 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' दिखाने के लिए: पॉप-अप मेन्यू खोलें और नीचे 'Style' पर जाएँ और फिर 'Hydrogen Bonds' विकल्प पर जाएँ। |
| 08:25 | पॉप-अप मेन्यू में 'Hydrogen Bonds' विकल्प, विशेषताएँ रखता है जैसे: |
| 08:30 | 'Calculate', 'Set Hydrogen Bonds Side Chain' |
| 08:35 | 'Set Hydrogen Bonds in the Backbone'
और बांड्स की मोटाई बदलने के लिए भी विकल्प रखता है। |
| 08:42 | 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' को मॉडल में बदलने के लिए 'Calculate' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 08:47 | 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' सफ़ेद और लाल लम्बे डैशेज़ की तरह दिखाए गए हैं। |
| 08:53 | 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' की मोटाई बदलने के लिए, पॉप-अप मेन्यू से '0.10 A' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 09:02 | अब पैनल पर हम मोटे 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' देख सकते हैं। |
| 09:06 | हम हाइड्रोजन बॉन्ड्स का रंग भी बदल सकते हैं। |
| 09:11 | पॉप-अप मेन्यू में नीचे 'Color' पर जाएँ, फिर 'Hydrogen Bonds' पर, फिर 'orange' विकल्प पर क्लिक करें। |
| 09:20 | पैनल पर, हमारे पास सारे 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' नारंगी रंग में हैं। |
| 09:25 | 'डाईसल्फाइड' बॉन्ड्स, और सल्फर परमाणु मॉडल में पीले रंग में दिखते हैं। |
| 09:31 | डाईसल्फाइड बॉन्ड्स को रूपांतरित करने के लिए, पॉप-अप मेन्यू में डाईसल्फाइड बॉन्ड्स विकल्प खोलें। |
| 09:38 | उन विशेषताओं पर क्लिक करें जिन्हे आप बदलना चाहते हैं, जैसे साइज़ और रंग आदि। |
| 09:44 | उसी प्रकार भिन्न 'enzymes' की '.pdb' फाइल्स को खोलने की कोशिश करें और उनके 3D स्ट्रक्चर्स देखें। |
| 09:51 | अब सारांशित करते हैं, इस ट्यूटोरियल में हमने निम्न सीखा: |
| 09:57 | * प्रोटीन डेटा बैंक (PDB) से प्रोटीन के स्ट्रक्चर्स लोड करना। |
| 10:00 | * डेटाबेस से '.pdb' फाइल्स डाउनलोड करना। |
| 10:05 | * 'PDB कोड' प्रयोग करके इन्सुलिन का 3D स्ट्रक्चर देखना। |
| 10:10 | * जल अणुओं रहित 'प्रोटीन' स्ट्रक्चर देखना। |
| 10:14 | * भिन्न फॉर्मेट्स में सेकेंडरी स्ट्रक्चर दिखाना। |
| 10:17 | * 'हाइड्रोजन बॉन्ड्स' और 'डाईसल्फाइड बॉन्ड्स' को हाईलाइट करना। |
| 10:22 | यहाँ आपके लिए एक नियत कार्य है। |
| 10:24 | * 'PDB' डेटाबेस से 'ह्यूमन हीमोग्लोबिन' की '.pdb' फाइल डाउनलोड करें। |
| 10:31 | * 'कार्टून(cartoon)' डिस्प्ले में सेकेंडरी स्ट्रक्चर दिखाएँ। |
| 10:35 | * 'प्रोटीन' के 'पोरफीरिंन (Porphyrin)' यूनिट्स को हाईलाइट करें। |
| 10:39 | * 'PDB कोड' के लिए निम्न लिंक पर जाएँ। |
| 10:42 | इस URL पर उपलब्ध वीडियो देखें।
http://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial |
| 10:46 | यह स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है। |
| 10:50 | अच्छी बैंडविड्थ न मिलने पर, आप इसे डाउनलोड करके देख सकते हैं। |
| 10:55 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टीम: |
| 10:57 | स्पोकन ट्यूटोरियल्स का उपयोग करके कार्यशालाएं चलाती है। |
| 11:01 | ऑनलाइन टेस्ट पास करने वालों को प्रमाणपत्र देते हैं। |
| 11:06 | अधिक जानकारी के लिए, कृपया contact@spoken-tutorial.org को लिखें। |
| 11:13 | स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टॉक-टू-अ टीचर प्रोजेक्ट का हिस्सा है। |
| 11:18 | यह भारत सरकार के एम एच आर दी के आई सी टी के माध्यम से राष्ट्रीय साक्षरता मिशन द्वारा समर्थित है। |
| 11:25 | इस मिशन पर अधिक जानकारी इस लिंक पर उपलब्ध है http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro] |
| 11:31 | आई आई टी बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य अब आपसे विदा लेती हूँ। इस ट्यूटोरियल को देखने के लिए धन्यवाद। |
