Difference between revisions of "Biopython/C2/Writing-Sequence-Files/Kannada"

From Script | Spoken-Tutorial
Jump to: navigation, search
(Created page with "{|Border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- | 00:01 | ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯ...")
 
 
(One intermediate revision by the same user not shown)
Line 7: Line 7:
 
| ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗೆ ನಿಮಗೆ ಸ್ವಾಗತ.  
 
| ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. ''''Writing Sequence Files''' ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗೆ ನಿಮಗೆ ಸ್ವಾಗತ.  
  
| -
+
|-
 
| 00:07
 
| 00:07
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ ನಾವು: 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ಸ್' ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ರಚಿಸುವುದು,
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ ನಾವು: 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ಸ್' ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ರಚಿಸುವುದು,
  
| -
+
|-
 
| 00:13
 
| 00:13
 
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯುವುದು,
 
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯುವುದು,
| -
+
|-
 
| 00:15
 
| 00:15
 
| 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದು
 
| 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದು
  
| -
+
|-
 
| 00:19
 
| 00:19
 
| ಮತ್ತು, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸುವುದು (sort) ಇವುಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಕಲಿಯುವೆವು.
 
| ಮತ್ತು, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸುವುದು (sort) ಇವುಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಕಲಿಯುವೆವು.
  
| -
+
|-
 
| 00:23
 
| 00:23
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ಅನುಸರಿಸಲು, ನೀವು  
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ಅನುಸರಿಸಲು, ನೀವು  
  
| -
+
|-
 
| 00:27
 
| 00:27
 
| ಪದವಿಪೂರ್ವ ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಅಥವಾ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
 
| ಪದವಿಪೂರ್ವ ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಅಥವಾ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
  
| -
+
|-
 
| 00:31
 
| 00:31
 
| ಮತ್ತು ಬೇಸಿಕ್ Python (ಪೈಥನ್) ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಇವುಗಳನ್ನು ತಿಳಿದಿರಬೇಕು.
 
| ಮತ್ತು ಬೇಸಿಕ್ Python (ಪೈಥನ್) ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಇವುಗಳನ್ನು ತಿಳಿದಿರಬೇಕು.
  
| -
+
|-
 
| 00:34
 
| 00:34
 
| ಕೊಟ್ಟಿರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಪೈಥನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗಳನ್ನು ನೋಡಿ.
 
| ಕೊಟ್ಟಿರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಪೈಥನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗಳನ್ನು ನೋಡಿ.
  
| -
+
|-
 
| 00:38
 
| 00:38
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಮಾಡಲು, ನಾನು '''Ubuntu OS''' ನ 14.10 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಮಾಡಲು, ನಾನು '''Ubuntu OS''' ನ 14.10 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
 
   
 
   
| -
+
|-
 
| 00:45
 
| 00:45
 
| '''Python''' ನ 2.7.8 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
 
| '''Python''' ನ 2.7.8 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
  
| -
+
|-
 
| 00:48
 
| 00:48
 
| '''Ipython interpreter''' ನ (ಐ ಪೈಥನ್ ಇಂಟರ್ಪ್ರಿಟರ್) 2.3.0 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಮತ್ತು '''Biopython''' ನ 1.64  ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಇವುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ.
 
| '''Ipython interpreter''' ನ (ಐ ಪೈಥನ್ ಇಂಟರ್ಪ್ರಿಟರ್) 2.3.0 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಮತ್ತು '''Biopython''' ನ 1.64  ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಇವುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ.
| -
+
|-
 
| 00:55
 
| 00:55
 
| ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವುದನ್ನು ಓದಲಿಕ್ಕಾಗಿ, '''parse''' ಮತ್ತು '''read''' ಎಂಬ ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಈಗಾಗಲೇ ನಾವು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
 
| ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವುದನ್ನು ಓದಲಿಕ್ಕಾಗಿ, '''parse''' ಮತ್ತು '''read''' ಎಂಬ ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಈಗಾಗಲೇ ನಾವು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
  
| -
+
|-
| 01: 03
+
| 01:03
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು '''write''' 'ಫಂಕ್ಷನ್' ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸುವುದು  
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು '''write''' 'ಫಂಕ್ಷನ್' ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸುವುದು  
  
| -
+
|-
 
| 01:09
 
| 01:09
 
| ಮತ್ತು, '''Convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ, ವಿವಿಧ 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಒಂದರಿಂದ ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಲು ನಾವು ಕಲಿಯುತ್ತೇವೆ.
 
| ಮತ್ತು, '''Convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ, ವಿವಿಧ 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಒಂದರಿಂದ ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಲು ನಾವು ಕಲಿಯುತ್ತೇವೆ.
  
| -
+
|-
 
| 01:16
 
| 01:16
 
| '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸಬೇಕು ಎಂಬುದನ್ನು ಈಗ ನಾನು ತೋರಿಸುತ್ತೇನೆ.
 
| '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸಬೇಕು ಎಂಬುದನ್ನು ಈಗ ನಾನು ತೋರಿಸುತ್ತೇನೆ.
  
| -
+
|-
 
| 01:20
 
| 01:20
 
| ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನೊಂದಿಗೆ, ಇಲ್ಲಿ ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ಇದೆ.
 
| ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನೊಂದಿಗೆ, ಇಲ್ಲಿ ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ಇದೆ.
  
| -
+
|-
| 01: 24
+
| 01:24
 
| 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.  
 
| 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.  
  
| -
+
|-
| 01: 28
+
| 01:28
 
| ಫೈಲ್, '''GI''' ಆಕ್ಸೆಶನ್ ನಂಬರ್ (GI accession number) ಮತ್ತು '''description''' ಗಳಂತಹ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ.
 
| ಫೈಲ್, '''GI''' ಆಕ್ಸೆಶನ್ ನಂಬರ್ (GI accession number) ಮತ್ತು '''description''' ಗಳಂತಹ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 01: 36
+
| 01:36
 
| ಈಗ ನಾವು ಈ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಾಗಿ, '''FASTA ''' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತೇವೆ.
 
| ಈಗ ನಾವು ಈ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಾಗಿ, '''FASTA ''' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತೇವೆ.
  
| -
+
|-
| 01: 41
+
| 01:41
 
| ಇಲ್ಲಿ, 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್' ಅನ್ನು ರಚಿಸುವುದು ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ.
 
| ಇಲ್ಲಿ, 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್' ಅನ್ನು ರಚಿಸುವುದು ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
 
| 01:45
 
| 01:45
 
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿ:
 
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿ:
  
| -
+
|-
| 01: 49
+
| 01:49
 
| ಇದು  ' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್' ಗಾಗಿ ಬೇಸಿಕ್ ಡೇಟಾ ಟೈಪ್ ಆಗಿದೆ.
 
| ಇದು  ' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್' ಗಾಗಿ ಬೇಸಿಕ್ ಡೇಟಾ ಟೈಪ್ ಆಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 01: 55
+
| 01:55
 
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, '''identifier''' ಮತ್ತು '''description''' ಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.
 
| ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, '''identifier''' ಮತ್ತು '''description''' ಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.
 
|-
 
|-
| 02: 04
+
| 02:04
 
| '''Ctrl, Alt''' ಮತ್ತು '''t''' ಕೀ ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಒತ್ತುವ ಮೂಲಕ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯಿರಿ.
 
| '''Ctrl, Alt''' ಮತ್ತು '''t''' ಕೀ ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಒತ್ತುವ ಮೂಲಕ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯಿರಿ.
  
| -
+
|-
 
| 02:10
 
| 02:10
 
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಹೀಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ: '''ipython''' ಮತ್ತು '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಹೀಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ: '''ipython''' ಮತ್ತು '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
| 02: 15
+
| 02:15
 
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ:
 
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ:
  
| -
+
|-
| 02: 18
+
| 02:18
 
| from Bio dot Seq ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Seq ಕ್ಲಾಸ್.
 
| from Bio dot Seq ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Seq ಕ್ಲಾಸ್.
  
| -
+
|-
| 02: 24
+
| 02:24
 
| from Bio dot SeqRecord ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Sequence Record ಕ್ಲಾಸ್.  
 
| from Bio dot SeqRecord ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Sequence Record ಕ್ಲಾಸ್.  
  
| -
+
|-
| 02: 31
+
| 02:31
 
| ನಂತರ, from Bio dot Alphabet ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import generic protein ಕ್ಲಾಸ್.
 
| ನಂತರ, from Bio dot Alphabet ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import generic protein ಕ್ಲಾಸ್.
  
| -
+
|-
| 02: 38
+
| 02:38
 
| ಆಮೇಲೆ, ನಾನು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು '''record1''' ಎಂಬ ವೇರಿಯಬಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡುವೆನು.
 
| ಆಮೇಲೆ, ನಾನು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು '''record1''' ಎಂಬ ವೇರಿಯಬಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡುವೆನು.
  
| -
+
|-
| 02: 45
+
| 02:45
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ನಿಂದ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, id (ಐಡಿ) ಮತ್ತು '''description''' ಗಳನ್ನು ಕಾಪಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನುಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಆಯಾ ಸಾಲುಗಳಲ್ಲಿ ಪೇಸ್ಟ್ ಮಾಡಿ.  
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ನಿಂದ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, id (ಐಡಿ) ಮತ್ತು '''description''' ಗಳನ್ನು ಕಾಪಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನುಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಆಯಾ ಸಾಲುಗಳಲ್ಲಿ ಪೇಸ್ಟ್ ಮಾಡಿ.  
  
| -
+
|-
| 02: 56
+
| 02:56
 
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
 
| 02:58
 
| 02:58
 
| ಔಟ್ಪುಟ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, '''record1''' ಎಂದು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
 
| ಔಟ್ಪುಟ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, '''record1''' ಎಂದು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 03: 02
+
| 03:02
 
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
| 03: 04
+
| 03:04
 
| ಔಟ್ಪುಟ್, 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
 
| ಔಟ್ಪುಟ್, 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
  
| -
+
|-
| 03: 10
+
| 03:10
 
| ಇದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು '''id''' ಮತ್ತು '''description''' ಗಳೊಂದಿಗೆ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
 
| ಇದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು '''id''' ಮತ್ತು '''description''' ಗಳೊಂದಿಗೆ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
  
| -
+
|-
 
| 03:13
 
| 03:13
 
| ಮೇಲಿನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು, '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ನಾವು ''' write ''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವೆವು.
 
| ಮೇಲಿನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು, '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ನಾವು ''' write ''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವೆವು.
  
| -
+
|-
| 03: 21
+
| 03:21
 
| '''Bio package''' ನಿಂದ '''SeqIO module''' ಅನ್ನು ಇಂಪೋರ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
 
| '''Bio package''' ನಿಂದ '''SeqIO module''' ಅನ್ನು ಇಂಪೋರ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
| -
+
|-
| 03: 26
+
| 03:26
 
| ನಂತರ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು,  'ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್' ಅನ್ನು '''write'''  ಫಂಕ್ಷನ್ ನೊಂದಿಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
 
| ನಂತರ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು,  'ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್' ಅನ್ನು '''write'''  ಫಂಕ್ಷನ್ ನೊಂದಿಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 03: 40
+
| 03:40
 
| '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್, 3 'ಆರ್ಗ್ಯುಮೆಂಟ್' ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.
 
| '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್, 3 'ಆರ್ಗ್ಯುಮೆಂಟ್' ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.
  
| -
+
|-
| 03: 44
+
| 03:44
 
| ಮೊದಲನೆಯದು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ಟೋರ್ ಮಾಡುವ ವೇರಿಯಬಲ್ ಆಗಿದೆ.
 
| ಮೊದಲನೆಯದು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ಟೋರ್ ಮಾಡುವ ವೇರಿಯಬಲ್ ಆಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 03: 49
+
| 03:49
 
| ಎರಡನೆಯದು, '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಬರೆಯಬೇಕಾದ ಫೈಲ್ ನ ಹೆಸರು ಆಗಿದೆ.
 
| ಎರಡನೆಯದು, '''FASTA''' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಬರೆಯಬೇಕಾದ ಫೈಲ್ ನ ಹೆಸರು ಆಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 03: 54
+
| 03:54
 
| ಮೂರನೆಯದು, ಬರೆಯಲು ಬೇಕಾಗಿರುವ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಆಗಿದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| ಮೂರನೆಯದು, ಬರೆಯಲು ಬೇಕಾಗಿರುವ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಆಗಿದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
 
| 03:58
 
| 03:58
 
| ಔಟ್ಪುಟ್ ಒಂದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂದರೆ, ನಾವು ಒಂದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಿದ್ದೇವೆ.
 
| ಔಟ್ಪುಟ್ ಒಂದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂದರೆ, ನಾವು ಒಂದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಿದ್ದೇವೆ.
 
|-
 
|-
| 04: 07
+
| 04:07
 
| FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ  ಫೈಲ್ ಅನ್ನು '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ "example.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಾಲಾಗಿದೆ.
 
| FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ  ಫೈಲ್ ಅನ್ನು '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ "example.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಾಲಾಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 04: 13
+
| 04:13
 
| ನಾನು ನಿಮ್ಮನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ಎಚ್ಚರಿಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ. ಔಟ್ಪುಟ್, ಇದೇ ಹೆಸರಿನ ಫೈಲ್ ಈಗಾಗಲೇ ಇದ್ದರೆ, ಅದರ ಮೇಲೆಯೇ ಬರೆದುಬಿಡುತ್ತದೆ.
 
| ನಾನು ನಿಮ್ಮನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ಎಚ್ಚರಿಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ. ಔಟ್ಪುಟ್, ಇದೇ ಹೆಸರಿನ ಫೈಲ್ ಈಗಾಗಲೇ ಇದ್ದರೆ, ಅದರ ಮೇಲೆಯೇ ಬರೆದುಬಿಡುತ್ತದೆ.
 
   
 
   
| -
+
|-
 
| 04:18
 
| 04:18
 
| ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಫೈಲ್ ಗೆ ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ.
 
| ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಫೈಲ್ ಗೆ ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 04: 24
+
| 04:24
 
| ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.
 
| ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.
  
| -
+
|-
| 04: 27
+
| 04:27
 
| ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, ಈಗ FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿದೆ.
 
| ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, ಈಗ FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 04: 31
+
| 04:31
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
  
| -
+
|-
 
| 04:33
 
| 04:33
 
| ಅನೇಕ 'ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್' ಟೂಲ್ ಗಳು, ವಿಭಿನ್ನ ಇನ್ಪುಟ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.
 
| ಅನೇಕ 'ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್' ಟೂಲ್ ಗಳು, ವಿಭಿನ್ನ ಇನ್ಪುಟ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.
  
| -
+
|-
| 04: 38
+
| 04:38
 
| ಹೀಗಾಗಿ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳ ನಡುವೆ ಪರಸ್ಪರ ಬದಲಾಯಿಸುವ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ.
 
| ಹೀಗಾಗಿ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳ ನಡುವೆ ಪರಸ್ಪರ ಬದಲಾಯಿಸುವ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ.
  
| -
+
|-
| 04: 44
+
| 04:44
 
| '''SeqIO'''  ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ, '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲ್ ಪರಿವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ನಾವು ಮಾಡಬಹುದು.
 
| '''SeqIO'''  ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ, '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲ್ ಪರಿವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ನಾವು ಮಾಡಬಹುದು.
  
| -
+
|-
 
| 04:50
 
| 04:50
 
| ಪ್ರದರ್ಶನಕ್ಕಾಗಿ, ನಾನು ಒಂದು '''GenBank''' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತೇನೆ.
 
| ಪ್ರದರ್ಶನಕ್ಕಾಗಿ, ನಾನು ಒಂದು '''GenBank''' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತೇನೆ.
  
| -
+
|-
| 04: 55
+
| 04:55
 
| ನನ್ನ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು '''GenBank''' ಫೈಲ್ ಇದೆ.  
 
| ನನ್ನ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು '''GenBank''' ಫೈಲ್ ಇದೆ.  
| -
+
|-
| 04: 59
+
| 04:59
 
| ನಾನು ಇದನ್ನು ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯುತ್ತೇನೆ.
 
| ನಾನು ಇದನ್ನು ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯುತ್ತೇನೆ.
  
| -
+
|-
| 05: 02
+
| 05:02
 
| ಫೈಲ್, '''GenBank''' (ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್) ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, '''HIV genome''' ಅನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್) ಹೊಂದಿದೆ.
 
| ಫೈಲ್, '''GenBank''' (ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್) ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, '''HIV genome''' ಅನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್) ಹೊಂದಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 05: 07
+
| 05:07
 
| ಈ 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್, 'ಜೀನೋಮ್' ನಲ್ಲಿಯ  ಎಲ್ಲಾ ಜೀನ್ ಗಳ ವಿವರಣೆಗಳನ್ನು, ಫೈಲ್ ನ ಮೊದಲ ಭಾಗದಲ್ಲಿ, ಹೊಂದಿದೆ.
 
| ಈ 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್, 'ಜೀನೋಮ್' ನಲ್ಲಿಯ  ಎಲ್ಲಾ ಜೀನ್ ಗಳ ವಿವರಣೆಗಳನ್ನು, ಫೈಲ್ ನ ಮೊದಲ ಭಾಗದಲ್ಲಿ, ಹೊಂದಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 05: 14
+
| 05:14
 
| ನಂತರ, ಇದು ಸಂಪೂರ್ಣವಾದ  'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
 
| ನಂತರ, ಇದು ಸಂಪೂರ್ಣವಾದ  'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 05: 18
+
| 05:18
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ. ಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ. ಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 05: 23
+
| 05:23
 
| ಇಲ್ಲಿ, '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್, 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸಂಪೂರ್ಣ 'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| ಇಲ್ಲಿ, '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್, 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸಂಪೂರ್ಣ 'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
| 05: 33
+
| 05:33
 
|  'FASTA' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ  ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಈಗ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, 'HIV.fasta' ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.
 
|  'FASTA' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ  ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಈಗ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, 'HIV.fasta' ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
 
| 05:39
 
| 05:39
 
| ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ ಈ ಫೈಲ್ ಗೆ ಹೋಗಿ ಮತ್ತು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.
 
| ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ ಈ ಫೈಲ್ ಗೆ ಹೋಗಿ ಮತ್ತು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.
  
| -
+
|-
| 05: 46
+
| 05:46
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
 
| ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
  
| -
+
|-
| 05: 49
+
| 05:49
 
| ನಾವು '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದಾಗಿದೆ. ಆದರೆ ಅದು ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ.
 
| ನಾವು '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದಾಗಿದೆ. ಆದರೆ ಅದು ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 05: 56
+
| 05:56
 
| ಕೆಲವು ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು, ಇನ್ನುಳಿದ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳು ಹೊಂದಿರದ ಮಾಹಿತಿಯು ಅಗತ್ಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
 
| ಕೆಲವು ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು, ಇನ್ನುಳಿದ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳು ಹೊಂದಿರದ ಮಾಹಿತಿಯು ಅಗತ್ಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
 
|-
 
|-
| 06: 02
+
| 06:02
 
| ಉದಾಹರಣೆಗೆ: ನಾವು 'GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು, ಆದರೆ ಇದರ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
 
| ಉದಾಹರಣೆಗೆ: ನಾವು 'GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು, ಆದರೆ ಇದರ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
  
| -
+
|-
| 06: 09
+
| 06:09
 
| ಹಾಗೆಯೇ, ನಾವು ಒಂದು 'FASTQ' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, 'FASTA' ಫೈಲ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು ಆದರೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
 
| ಹಾಗೆಯೇ, ನಾವು ಒಂದು 'FASTQ' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, 'FASTA' ಫೈಲ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು ಆದರೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
  
| -
+
|-
| 06: 15
+
| 06:15
 
| '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, '''help''' ಕಮಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
 
| '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, '''help''' ಕಮಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 06: 21
+
| 06:21
 
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
| 06: 24
+
| 06:24
 
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ಗೆ ಹಿಂತಿರುಗಲು, ಕೀ ಬೋರ್ಡ್ ನಲ್ಲಿಯ 'q' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ಗೆ ಹಿಂತಿರುಗಲು, ಕೀ ಬೋರ್ಡ್ ನಲ್ಲಿಯ 'q' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
| -
+
|-
| 06: 28
+
| 06:28
 
| '''GenBank''' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, 'ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್' ನಿಂದ, ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು ನಾವು ಹೊರತೆಗೆಯಬಹುದು.
 
| '''GenBank''' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, 'ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್' ನಿಂದ, ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು ನಾವು ಹೊರತೆಗೆಯಬಹುದು.
  
| -
+
|-
| 06: 35
+
| 06:35
 
| ಈ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು,  'FASTA'  ಅಥವಾ ಇತರ ಯಾವುದೇ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಬಹುದು.
 
| ಈ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು,  'FASTA'  ಅಥವಾ ಇತರ ಯಾವುದೇ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಬಹುದು.
  
| -
+
|-
| 06: 41
+
| 06:41
 
| ಇದಕ್ಕಾಗಿ ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
 
| ಇದಕ್ಕಾಗಿ ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 06: 47
+
| 06:47
 
| ಈ ಕೋಡ್, ಎಲ್ಲ ಪ್ರತ್ಯೇಕ '''CDS''' (ಸಿಡಿಎಸ್) ಜೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ '''id''' ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು 'ಜೀನ್' ನ ಹೆಸರನ್ನು ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಬರೆಯುತ್ತದೆ.
 
| ಈ ಕೋಡ್, ಎಲ್ಲ ಪ್ರತ್ಯೇಕ '''CDS''' (ಸಿಡಿಎಸ್) ಜೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ '''id''' ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು 'ಜೀನ್' ನ ಹೆಸರನ್ನು ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಬರೆಯುತ್ತದೆ.
  
| -
+
|-
| 06: 56
+
| 06:56
 
| ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ನಿಮ್ಮ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, "HIV_geneseq.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
 
| ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ನಿಮ್ಮ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, "HIV_geneseq.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. '''Enter''' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
  
| -
+
|-
 
| 07:07
 
| 07:07
 
| ನಾವು 'ಬಯೋಪೈಥನ್' ಟೂಲ್ ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು.
 
| ನಾವು 'ಬಯೋಪೈಥನ್' ಟೂಲ್ ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು.
  
| -
+
|-
| 07: 12
+
| 07:12
 
| ಇಲ್ಲಿ, ನಾನು “hemoglobin.fasta” ಎಂಬ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆದಿದ್ದೇನೆ. ಇದು ಆರು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.  
 
| ಇಲ್ಲಿ, ನಾನು “hemoglobin.fasta” ಎಂಬ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆದಿದ್ದೇನೆ. ಇದು ಆರು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.  
  
| -
+
|-
| 07: 19
+
| 07:19
 
| ಪ್ರತಿಯೊಂದು ರೆಕಾರ್ಡ್ ನ ಉದ್ದವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ.
 
| ಪ್ರತಿಯೊಂದು ರೆಕಾರ್ಡ್ ನ ಉದ್ದವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
 
| 07:23
 
| 07:23
 
| ಅತ್ಯಂತ ಉದ್ದ ಇರುವ  ರೆಕಾರ್ಡ್ ಅನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
 
| ಅತ್ಯಂತ ಉದ್ದ ಇರುವ  ರೆಕಾರ್ಡ್ ಅನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 07: 27
+
| 07:27
 
| ವಿಂಗಡಿಸಲಾದ (sorted ) ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು "sorted_hemoglobin.fasta" ಎಂದು, ನಿಮ್ಮ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.
 
| ವಿಂಗಡಿಸಲಾದ (sorted ) ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು "sorted_hemoglobin.fasta" ಎಂದು, ನಿಮ್ಮ '''home''' ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.
  
| -
+
|-
| 07: 38
+
| 07:38
 
| ಚಿಕ್ಕ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, '''records.sort''' ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್ ನಲ್ಲಿ, ಆರ್ಗ್ಯೂಮೆಂಟ್ ಗಳನ್ನು ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಇರಿಸಿ.
 
| ಚಿಕ್ಕ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, '''records.sort''' ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್ ನಲ್ಲಿ, ಆರ್ಗ್ಯೂಮೆಂಟ್ ಗಳನ್ನು ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಇರಿಸಿ.
  
| -
+
|-
 
| 07:45
 
| 07:45
 
| ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ, ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ನಾವು:  ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು,
 
| ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ, ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ನಾವು:  ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು,
  
| -
+
|-
| 07: 51
+
| 07:51
 
| 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್' ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು,
 
| 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್' ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ '''write''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು,
  
| -
+
|-
| 07: 58
+
| 07:58
 
| '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲು,
 
| '''convert''' ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲು,
  
| -
+
|-
| 08: 03
+
| 08:03
 
| ಮತ್ತು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
 
| ಮತ್ತು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
  
| -
+
|-
 
| 08:07
 
| 08:07
 
|  ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ ಗಾಗಿ -
 
|  ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ ಗಾಗಿ -
  
| -
+
|-
| 08: 09
+
| 08:09
 
|HIV ಯ 'ಜೆನೊಮಿಕ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನಿಂದ, 4587 ರಿಂದ 5165 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀನ್ "HIV1gp3" ಯನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ 1 ಜಿಪಿ 3) ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
 
|HIV ಯ 'ಜೆನೊಮಿಕ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನಿಂದ, 4587 ರಿಂದ 5165 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀನ್ "HIV1gp3" ಯನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ 1 ಜಿಪಿ 3) ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
  
| -
+
|-
| 08: 21
+
| 08:21
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಕೋಡ್ ಫೈಲ್ ಗಳಲ್ಲಿ, "HIV.gb" ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ.
 
| ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಕೋಡ್ ಫೈಲ್ ಗಳಲ್ಲಿ, "HIV.gb" ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ.
  
| -
+
|-
| 08: 28
+
| 08:28
 
| ನಿಮ್ಮ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್, ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.
 
| ನಿಮ್ಮ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್, ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.
 
|-
 
|-

Latest revision as of 20:50, 19 July 2018

Time Narration
00:01 ಎಲ್ಲರಿಗೂ ನಮಸ್ಕಾರ. 'Writing Sequence Files ಎಂಬ ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗೆ ನಿಮಗೆ ಸ್ವಾಗತ.
00:07 ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ ನಾವು: 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ಸ್' ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ರಚಿಸುವುದು,
00:13 ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯುವುದು,
00:15 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದು
00:19 ಮತ್ತು, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸುವುದು (sort) ಇವುಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಕಲಿಯುವೆವು.
00:23 ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ಅನುಸರಿಸಲು, ನೀವು
00:27 ಪದವಿಪೂರ್ವ ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ಅಥವಾ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್
00:31 ಮತ್ತು ಬೇಸಿಕ್ Python (ಪೈಥನ್) ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಇವುಗಳನ್ನು ತಿಳಿದಿರಬೇಕು.
00:34 ಕೊಟ್ಟಿರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಪೈಥನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಗಳನ್ನು ನೋಡಿ.
00:38 ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಅನ್ನು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಮಾಡಲು, ನಾನು Ubuntu OS ನ 14.10 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
00:45 Python ನ 2.7.8 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ,
00:48 Ipython interpreter ನ (ಐ ಪೈಥನ್ ಇಂಟರ್ಪ್ರಿಟರ್) 2.3.0 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಮತ್ತು Biopython ನ 1.64 ನೇ ಆವೃತ್ತಿ ಇವುಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ.
00:55 ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವುದನ್ನು ಓದಲಿಕ್ಕಾಗಿ, parse ಮತ್ತು read ಎಂಬ ಫಂಕ್ಷನ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಈಗಾಗಲೇ ನಾವು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
01:03 ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು write 'ಫಂಕ್ಷನ್' ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸುವುದು
01:09 ಮತ್ತು, Convert ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ, ವಿವಿಧ 'ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್' ಗಳನ್ನು ಒಂದರಿಂದ ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಲು ನಾವು ಕಲಿಯುತ್ತೇವೆ.
01:16 write ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸಬೇಕು ಎಂಬುದನ್ನು ಈಗ ನಾನು ತೋರಿಸುತ್ತೇನೆ.
01:20 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನೊಂದಿಗೆ, ಇಲ್ಲಿ ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ಇದೆ.
01:24 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.
01:28 ಫೈಲ್, GI ಆಕ್ಸೆಶನ್ ನಂಬರ್ (GI accession number) ಮತ್ತು description ಗಳಂತಹ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ.
01:36 ಈಗ ನಾವು ಈ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಾಗಿ, FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತೇವೆ.
01:41 ಇಲ್ಲಿ, 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್' ಅನ್ನು ರಚಿಸುವುದು ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ.
01:45 ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿ:
01:49 ಇದು ' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್' ಗಾಗಿ ಬೇಸಿಕ್ ಡೇಟಾ ಟೈಪ್ ಆಗಿದೆ.
01:55 ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, identifier ಮತ್ತು description ಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ.
02:04 Ctrl, Alt ಮತ್ತು t ಕೀ ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಒತ್ತುವ ಮೂಲಕ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯಿರಿ.
02:10 ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಹೀಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ: ipython ಮತ್ತು Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
02:15 ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ:
02:18 from Bio dot Seq ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Seq ಕ್ಲಾಸ್.
02:24 from Bio dot SeqRecord ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import Sequence Record ಕ್ಲಾಸ್.
02:31 ನಂತರ, from Bio dot Alphabet ಮೊಡ್ಯೂಲ್, import generic protein ಕ್ಲಾಸ್.
02:38 ಆಮೇಲೆ, ನಾನು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು record1 ಎಂಬ ವೇರಿಯಬಲ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡುವೆನು.
02:45 ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಫೈಲ್ ನಿಂದ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, id (ಐಡಿ) ಮತ್ತು description ಗಳನ್ನು ಕಾಪಿ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನುಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಆಯಾ ಸಾಲುಗಳಲ್ಲಿ ಪೇಸ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
02:56 Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
02:58 ಔಟ್ಪುಟ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, record1 ಎಂದು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
03:02 Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
03:04 ಔಟ್ಪುಟ್, 'ಇನ್ಸುಲಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
03:10 ಇದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು id ಮತ್ತು description ಗಳೊಂದಿಗೆ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
03:13 ಮೇಲಿನ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು, FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ನಾವು write ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವೆವು.
03:21 Bio package ನಿಂದ SeqIO module ಅನ್ನು ಇಂಪೋರ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
03:26 ನಂತರ, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಲು, 'ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್' ಅನ್ನು write ಫಂಕ್ಷನ್ ನೊಂದಿಗೆ ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
03:40 write ಫಂಕ್ಷನ್, 3 'ಆರ್ಗ್ಯುಮೆಂಟ್' ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.
03:44 ಮೊದಲನೆಯದು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ಟೋರ್ ಮಾಡುವ ವೇರಿಯಬಲ್ ಆಗಿದೆ.
03:49 ಎರಡನೆಯದು, FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಬರೆಯಬೇಕಾದ ಫೈಲ್ ನ ಹೆಸರು ಆಗಿದೆ.
03:54 ಮೂರನೆಯದು, ಬರೆಯಲು ಬೇಕಾಗಿರುವ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಆಗಿದೆ. Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
03:58 ಔಟ್ಪುಟ್ ಒಂದನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂದರೆ, ನಾವು ಒಂದು ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಿದ್ದೇವೆ.
04:07 FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ "example.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಾಲಾಗಿದೆ.
04:13 ನಾನು ನಿಮ್ಮನ್ನು ಇಲ್ಲಿ ಎಚ್ಚರಿಸುತ್ತಿದ್ದೇನೆ. ಔಟ್ಪುಟ್, ಇದೇ ಹೆಸರಿನ ಫೈಲ್ ಈಗಾಗಲೇ ಇದ್ದರೆ, ಅದರ ಮೇಲೆಯೇ ಬರೆದುಬಿಡುತ್ತದೆ.
04:18 ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲು, home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಫೈಲ್ ಗೆ ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ.
04:24 ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.
04:27 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್, ಈಗ FASTA ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿದೆ.
04:31 ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
04:33 ಅನೇಕ 'ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್' ಟೂಲ್ ಗಳು, ವಿಭಿನ್ನ ಇನ್ಪುಟ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.
04:38 ಹೀಗಾಗಿ, ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳ ನಡುವೆ ಪರಸ್ಪರ ಬದಲಾಯಿಸುವ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ.
04:44 SeqIO ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನಲ್ಲಿ, convert ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೈಲ್ ಪರಿವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ನಾವು ಮಾಡಬಹುದು.
04:50 ಪ್ರದರ್ಶನಕ್ಕಾಗಿ, ನಾನು ಒಂದು GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತೇನೆ.
04:55 ನನ್ನ home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, ಒಂದು GenBank ಫೈಲ್ ಇದೆ.
04:59 ನಾನು ಇದನ್ನು ಒಂದು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯುತ್ತೇನೆ.
05:02 ಫೈಲ್, GenBank (ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್) ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, HIV genome ಅನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್) ಹೊಂದಿದೆ.
05:07 ಈ 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್, 'ಜೀನೋಮ್' ನಲ್ಲಿಯ ಎಲ್ಲಾ ಜೀನ್ ಗಳ ವಿವರಣೆಗಳನ್ನು, ಫೈಲ್ ನ ಮೊದಲ ಭಾಗದಲ್ಲಿ, ಹೊಂದಿದೆ.
05:14 ನಂತರ, ಇದು ಸಂಪೂರ್ಣವಾದ 'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
05:18 ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ. ಟರ್ಮಿನಲ್ ನಲ್ಲಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
05:23 ಇಲ್ಲಿ, convert ಫಂಕ್ಷನ್, 'ಜೆನ್ ಬ್ಯಾಂಕ್' ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಸಂಪೂರ್ಣ 'ಜೀನೋಮ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು 'FASTA' ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
05:33 'FASTA' ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿರುವ ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ಈಗ home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, 'HIV.fasta' ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ.
05:39 ನ್ಯಾವಿಗೇಟ್ ಮಾಡಿ ಈ ಫೈಲ್ ಗೆ ಹೋಗಿ ಮತ್ತು ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ನಲ್ಲಿ ತೆರೆಯಿರಿ.
05:46 ಟೆಕ್ಸ್ಟ್-ಎಡಿಟರ್ ಅನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
05:49 ನಾವು convert ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದಾಗಿದೆ. ಆದರೆ ಅದು ಸೀಮಿತವಾಗಿದೆ.
05:56 ಕೆಲವು ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು, ಇನ್ನುಳಿದ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳು ಹೊಂದಿರದ ಮಾಹಿತಿಯು ಅಗತ್ಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
06:02 ಉದಾಹರಣೆಗೆ: ನಾವು 'GenBank ಫೈಲ್ ಅನ್ನು FASTA ಫೈಲ್ ಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು, ಆದರೆ ಇದರ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
06:09 ಹಾಗೆಯೇ, ನಾವು ಒಂದು 'FASTQ' ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, 'FASTA' ಫೈಲ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಬಹುದು ಆದರೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
06:15 convert ಫಂಕ್ಷನ್ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, help ಕಮಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
06:21 Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
06:24 ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ಗೆ ಹಿಂತಿರುಗಲು, ಕೀ ಬೋರ್ಡ್ ನಲ್ಲಿಯ 'q' ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
06:28 GenBank ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ, 'ಎಚ್ಐವಿ ಜೀನೋಮ್' ನಿಂದ, ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು ನಾವು ಹೊರತೆಗೆಯಬಹುದು.
06:35 ಈ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಜೀನ್ ಗಳನ್ನು, 'FASTA' ಅಥವಾ ಇತರ ಯಾವುದೇ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಬಹುದು.
06:41 ಇದಕ್ಕಾಗಿ ಪ್ರಾಂಪ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
06:47 ಈ ಕೋಡ್, ಎಲ್ಲ ಪ್ರತ್ಯೇಕ CDS (ಸಿಡಿಎಸ್) ಜೀನ್ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳ id ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು 'ಜೀನ್' ನ ಹೆಸರನ್ನು ಒಂದು ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ಬರೆಯುತ್ತದೆ.
06:56 ಈ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು, ನಿಮ್ಮ home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ, "HIV_geneseq.fasta" ಎಂದು ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. Enter ಅನ್ನು ಒತ್ತಿ.
07:07 ನಾವು 'ಬಯೋಪೈಥನ್' ಟೂಲ್ ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿಯ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು.
07:12 ಇಲ್ಲಿ, ನಾನು “hemoglobin.fasta” ಎಂಬ FASTA ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆದಿದ್ದೇನೆ. ಇದು ಆರು ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
07:19 ಪ್ರತಿಯೊಂದು ರೆಕಾರ್ಡ್ ನ ಉದ್ದವು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ.
07:23 ಅತ್ಯಂತ ಉದ್ದ ಇರುವ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಅನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, ಕೆಳಗಿನ ಸಾಲುಗಳನ್ನು ಟೈಪ್ ಮಾಡಿ.
07:27 ವಿಂಗಡಿಸಲಾದ (sorted ) ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ ಹೊಸ ಫೈಲ್ ಅನ್ನು "sorted_hemoglobin.fasta" ಎಂದು, ನಿಮ್ಮ home ಫೋಲ್ಡರ್ ನಲ್ಲಿ ಸೇವ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.
07:38 ಚಿಕ್ಕ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಮೊದಲು ಇರಿಸಲು, records.sort ಕಮಾಂಡ್ ಲೈನ್ ನಲ್ಲಿ, ಆರ್ಗ್ಯೂಮೆಂಟ್ ಗಳನ್ನು ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ (ರಿವರ್ಸ್) ಇರಿಸಿ.
07:45 ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ, ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನಲ್ಲಿ, ನಾವು: ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಆಬ್ಜೆಕ್ಟ್ ಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು,
07:51 'ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಇನ್ಪುಟ್ / ಔಟ್ಪುಟ್' ಮಾಡ್ಯೂಲ್ ನ write ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಗಳನ್ನು ಬರೆಯಲು,
07:58 convert ಫಂಕ್ಷನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ಫೈಲ್ ಫಾರ್ಮ್ಯಾಟ್ ಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲು,
08:03 ಮತ್ತು, ಫೈಲ್ ನಲ್ಲಿ ರೆಕಾರ್ಡ್ ಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ಅನುಸಾರವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲು ಕಲಿತಿದ್ದೇವೆ.
08:07 ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್ ಗಾಗಿ -
08:09 HIV ಯ 'ಜೆನೊಮಿಕ್' ಸಿಕ್ವೆನ್ಸ್ ನಿಂದ, 4587 ರಿಂದ 5165 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀನ್ "HIV1gp3" ಯನ್ನು (ಎಚ್ಐವಿ 1 ಜಿಪಿ 3) ಎಕ್ಸ್ಟ್ರಾಕ್ಟ್ ಮಾಡಿ.
08:21 ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಕೋಡ್ ಫೈಲ್ ಗಳಲ್ಲಿ, "HIV.gb" ಫೈಲ್ ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ.
08:28 ನಿಮ್ಮ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ಅಸೈನ್ಮೆಂಟ್, ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.
08:43 ಈ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿರುವ ವೀಡಿಯೋ, ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್ ಅನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.
08:48 ದಯವಿಟ್ಟು ಇದನ್ನು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ ನೋಡಿ. ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್ ಟೀಮ್, ಕಾರ್ಯಶಾಲೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆನ್ಲೈನ್ ಟೆಸ್ಟ್ ನಲ್ಲಿ ತೇರ್ಗಡೆಯಾದವರಿಗೆ ಸರ್ಟಿಫಿಕೇಟ್ ಕೊಡುತ್ತದೆ.
08:57 ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, ದಯವಿಟ್ಟು ನಮ್ಮನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸಿ.
09:00 ಸ್ಪೋಕನ್ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ಪ್ರೊಜೆಕ್ಟ್, ರಾಷ್ಟ್ರಿಯ ಸಾಕ್ಷರತಾ ಮಿಷನ್ ICT, MHRD ಮೂಲಕ ಭಾರತ ಸರ್ಕಾರದ ಆಧಾರವನ್ನು ಪಡೆದಿದೆ.
09:06 ಈ ಮಿಶನ್ ನ ಬಗೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಯು ಇಲ್ಲಿ ಇರುವ ಲಿಂಕ್ ನಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ.
09:10 ಈ ಟ್ಯುಟೋರಿಯಲ್ ನ ಅನುವಾದಕಿ IIT Bombay ಯಿಂದ ಸಂಧ್ಯಾ ಪುಣೇಕರ್ ಮತ್ತು ಧ್ವನಿ ನವೀನ್ ಭಟ್, ಉಪ್ಪಿನಪಟ್ಟಣ. ಧನ್ಯವಾದಗಳು.

Contributors and Content Editors

Sandhya.np14