Difference between revisions of "Jmol-Application/C3/Structures-from-Database/Malayalam"
From Script | Spoken-Tutorial
(Created page with " {|border=1 |'''Time''' |'''Narration''' |- |00:01 |''Structures from Database''' in '''Jmol''' എന്ന ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക്...") |
PoojaMoolya (Talk | contribs) |
||
| Line 1: | Line 1: | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
{|border=1 | {|border=1 | ||
|'''Time''' | |'''Time''' | ||
| Line 114: | Line 111: | ||
|- | |- | ||
|02:45 | |02:45 | ||
| − | |''Display'''മെനുവിൽക്ലിക്ക്ചെയ്ത്''Label''തിരഞ്ഞെടുക്കുക.''Number''' | + | |''Display'''മെനുവിൽക്ലിക്ക്ചെയ്ത്''Label''തിരഞ്ഞെടുക്കുക.''Number''' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| − | + | ||
|- | |- | ||
|02:52 | |02:52 | ||
| Line 193: | Line 189: | ||
|- | |- | ||
|04:59 | |04:59 | ||
| − | |പാനലിൽ,ഇoമ്പോർട്ടന്റ് ഫീച്ചേഴ്സ് ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിട്ടുള്ള | + | |പാനലിൽ,ഇoമ്പോർട്ടന്റ് ഫീച്ചേഴ്സ് ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിട്ടുള്ള ''Cholesterol '''എന്ന ഒരു മോഡൽ ഉണ്ട്. |
|- | |- | ||
|05:06 | |05:06 | ||
| Line 217: | Line 213: | ||
|- | |- | ||
|05:36 | |05:36 | ||
| − | |''2D structure''' എന്ന മൊഡ്യൂൾ '''GChemPaint.''' എന്ന സോഫ്റ്റ്വെയർ | + | |''2D structure''' എന്ന മൊഡ്യൂൾ '''GChemPaint.''' എന്ന സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിച്ചാണ് തയ്യാറാക്കപ്പെട്ടത്. |
| − | + | ||
|- | |- | ||
|05:42 | |05:42 | ||
| Line 320: | Line 315: | ||
|- | |- | ||
|08:12 | |08:12 | ||
| − | |ഈ URL ൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക: http: | + | |ഈ URL ൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക: http: //spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial |
| − | + | ||
|- | |- | ||
|08:16 | |08:16 | ||
Latest revision as of 15:46, 15 March 2018
| Time | Narration |
| 00:01 | Structures from Database' in Jmol എന്ന ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം. |
| 00:07 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും: |
| 00:10 | PubChem' ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് Load കെമിക്കൽ സ്‌ട്രെചേഴ്സ്. |
| 00:14 | GChemPaint'ലെ 2D structure'Jmol ലെ 3D model ആയി കന്വേര്റ്റ് ചെയുക |
| 00:21 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, 'Jmol Application' നിങ്ങൾ ഫമിലിയർ ആയിരിക്കണം |
| 00:27 | ഇല്ലെങ്കിൽ, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റിൽ ലഭ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ കാണുക. |
| 00:33 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ റെക്കോർഡ് ചെയ്യാൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു: |
| 00:35 | Ubuntu OS വേർഷൻ 12.04 |
| 00:40 | Jmol വേർഷൻ 12.2.2 |
| 00:44 | Java വേർഷൻ 7 |
| 00:46 | GChemPaint വേർഷൻ 0.12.10 |
| 00:51 | Mozilla Firefox browser 22.0. |
| 00:56 | ഞാൻ ഒരു പുതിയ 'Jmol Application' വിൻഡോ ഓപ്പൺ ചെയ്‌തു . |
| 01:00 | Jmol ഡാറ്റാബേസിൽ ലിസ്റ്റുചെയ്തിരിക്കുന്ന structures നെ load ചെയ്യാനുള്ള ഫീച്ചർ "Jmol ന് ഉണ്ട്. |
| 01:07 | മെനു Fileലെ മെനുവിലെ ഒരു ഓപ്ഷൻ Get MOL. |
| 01:12 | ഇത് കെമിക്കൽ സ്ട്രക്ചർ ഡേറ്റാബേസിന്റെ PubChem.ൽ നിന്ന് മോളികൂളുകൾ നൽകുന്നു. |
| 01:17 | Protein Data Bank'ൽ protein ലോഡ് ചെയ്യാൻ Get PDB എന്ന മറ്റൊരു ഓപ്ഷൻ ഉണ്ട്. |
| 01:26 | ഈ ഫീച്ചർ മറ്റൊരു ട്യൂട്ടോറിയലിൽ വിശദീകരിക്കും. |
| 01:31 | Molക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 01:36 | screen'ൽ ഒരു Input ഡയലോഗ് ബോക്സ് ഓപ്പൺ ചെയ്യുന്നു. |
| 01:40 | ബോക്സിൽ ടൈപ്പ് ചെയ്തുകൊണ്ട് ലോഡ് ചെയ്യാൻ കഴിയും. |
| 01:48 | കോമൺ നെയിം അല്ലെങ്കിൽ IUPAC നെയിം. |
| 01:51 | CAS നമ്പർ |
| 01:54 | CID നമ്പർ |
| 01:56 | InChi identifier or |
| 01:58 | SMILES identifier. |
| 02:01 | ഒരു പ്രത്യേക കെമിക്കൽ തിരിച്ചറിയൽ നമ്പറുകളെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾക്ക് Pubchem ഡാറ്റാബേസ് വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക. |
| 02:09 | നമുക്ക് സ്ക്രീനിൽ phenol ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യാം. |
| 02:13 | Input ടെക്സ്റ്റ്-ബോക്സിൽ "phenol" എന്ന് ടൈപ്പുചെയ്യുക. |
| 02:16 | OK ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 02:20 | പാനലിൽ ഒരു ഫീനോൾ മോഡൽ കാണാം. |
| 02:24 | വ്യത്യസ്തമായ റെൻഡറിംഗ് ഓപ്ഷനുകൾ ഉപയോഗിച്ച് phenol എന്ന ഡിസ്‌പ്ലൈ നമുക്ക് മാറ്റാവുന്നതാണ്. |
| 02:30 | ഈ ഓപ്ഷനുകൾ Menu bar and Pop-up മെനുവിൽ ലിസ്റ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. |
| 02:36 | ഫിനോൾസിന്റെ benzene ring ൽ നമുക്ക് പ്രതിബിംബങ്ങൾ ചേർക്കാൻ കഴിയും. |
| 02:41 | ആദ്യം, നമുക്ക് 'model ലെ ആറ്റങ്ങൾ ലേബൽ ചെയ്യാം. |
| 02:45 | Displayമെനുവിൽക്ലിക്ക്ചെയ്ത്Labelതിരഞ്ഞെടുക്കുക.Number ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 02:52 | amino group' ലെ carbon atom -number 4,ൽ അറ്റാച്ച് ചെയ്ത hydrogen- നമ്പർ 10, |
| 03:00 | modelkit' മെനു തുറക്കുക, ഓപ്ഷനുകളിൽ നിന്ന് nitrogen തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
| 03:06 | hydrogen'- നമ്പർ 10 ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 03:09 | panel ലിലെ Para-Amino Phenol ന്റെ ഒരു മോളികൂൾ ആണ് ഇത്. |
| 03:14 | ഡിസ്പ്ലേ Sticks display' ആയി ചേഞ്ച് ചെയ്യാo. |
| 03:18 | modelkit' മെനുവിൽ നിന്ന് എക്സിറ്റ് ചെയ്യുക. |
| 03:21 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, Style ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക,' Scheme തിരഞ്ഞെടുത്ത് Sticks ഓപ്ഷനുകളിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 03:30 | പാനലിൽ, sticks ഡിസ്‌പ്ലൈയിൽ 'Para-Amino-phenol മോഡൽ ഉണ്ട്. |
| 03:36 | ക്രിയേറ്റ് ചെയ്യാൻ ബുദ്ധിമുട്ടുള്ള കോംപ്ലക്സ് സ്ട്രക്ചർ, പാനലിൽ എളുപ്പത്തിൽ ലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്. |
| 03:42 | ഫോർ എക്സാമ്പിൾ : cholesterol. |
| 03:45 | File' മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 03:47 | എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. |
| 03:54 | ok ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 03:57 | പാനലില് Cholesterol കാണിക്കുന്ന ഒരു മോളിക്യൂള് കാണാം. |
| 04:02 | നമുക്ക് മോളിക്യൂളിൽ double-bond and side-chain എന്നീ ഫീച്ചേഴ്സ് ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യാം. |
| 04:08 | ഡബിൾ ബോണ്ട്ന്റെ ആറ്റങ്ങളുടെ നിറം മാറ്റാം. |
| 04:15 | ടൂൾ ബാറിലെ Select atoms ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക. |
| 04:19 | ചെയ്യുക. |
| 04:24 | ആറ്റങ്ങളുടെ ചുറ്റും ഒരു മഞ്ഞ നിറം പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു. |
| 04:28 | പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു ഓപ്പൺ ചെയ്യുക. |
| 04:30 | Color'ലേക്ക് സ്ക്രോൾചെയ്യൂ,Atoms തിരഞ്ഞെടുത്ത് Orange ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 04:37 | ഇപ്പോൾ ടൂൾ ബാറിൽ “Rotate molecule ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. |
| 04:42 | cholesterol മോഡലിൽ double-bond ഇപ്പോൾ ഓറഞ്ച് നിറത്തിലാണ്. |
| 04:49 | അതുപോലെ തന്നെ, 'carbons സൈഡ് ചെയിനിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുന്നു. |
| 04:54 | Pop-up മെനു ഉപയോഗിച്ചു, കളർ വയലറ്റ്ലേക്ക് മാറ്റുക. |
| 04:59 | പാനലിൽ,ഇoമ്പോർട്ടന്റ് ഫീച്ചേഴ്സ് ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിട്ടുള്ള Cholesterol 'എന്ന ഒരു മോഡൽ ഉണ്ട്. |
| 05:06 | ഒരു അസ്സൈൻമെന്റ്- |
| 05:08 | Pubchem' ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് സ്ട്രക്ചർ ഓഫ് caffeine Load ചെയ്യുക . |
| 05:11 | മോളികൂൾലെ ഇoമ്പോർട്ടന്റ് ഫീച്ചേഴ്സ് ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക. |
| 05:15 | ഡിസ്‌പ്ലൈ 'wireframe' യിലേക്ക് മാറ്റുക. |
| 05:19 | ഇപ്പോൾ Jmol എന്ന മറ്റൊരു പ്രധാന ഫീച്ചർ ഞാൻ ചർച്ചചെയ്യും. |
| 05:24 | നമുക്ക് 2D structure's മോളിക്യൂളുകൾ 3D models എന്നാക്കി മാറ്റാൻ കഴിയും. |
| 05:31 | ഇവിടെ എനിക്കിന്ന് amino acid Alanine എന്ന പാനൽ ഉണ്ട്. |
| 05:36 | 2D structure' എന്ന മൊഡ്യൂൾ GChemPaint. എന്ന സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിച്ചാണ് തയ്യാറാക്കപ്പെട്ടത്. |
| 05:42 | ഒരു "mol" ഫയൽ ആയി സേവ് ചെയ്‌തു . |
| 05:46 | 2D കെമിക്കൽ സ്ട്രക്ചർ വരക്കാനുള്ള Open source software ആണ് "GchemPaint |
| 05:51 | GChemPaint' എന്നതിലെ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ താഴെ പറയുന്ന ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്. |
| 05:56 | സ്ട്രച്ചേഴ്സ് വരയ്ക്കാനും "mol" ഫോർമാറ്റിൽ "save ചെയ്യാനും,Analysis of Compounds ട്യൂട്ടോറിയൽ കാണുക. |
| 06:05 | ഈ Gchempaint ഡിസ്‌പ്ലൈയിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നത് 2 ഡി ഡ്രോയിംഗ്- ആണ് |
| 06:10 | Amino acid -Alanine |
| 06:12 | Nuclioside -Adenosine and |
| 06:14 | Saccharide -Alpha-D glucopyranose. |
| 06:19 | ഞാൻ 'mol' ഫോർമാറ്റിൽ എന്റെ Desktopപ്പിൽ അവ സേവ് ചെയ്‌തു. |
| 06:24 | Alanine ന്റെ 3D മാതൃകയായി Jmol Application ലെ 2 ഡി സ്ട്രക്ചർ ആദ്യം നോക്കാം. |
| 06:32 | അതിനാൽ, ഞാൻ ഒരു പുതിയ 'Jmol' വിൻഡോ തുറക്കും. |
| 06:36 | ടൂൾ ബാറിൽ Open a file ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 06:40 | Desktop ഫോൾഡർ തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'Open ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. 'Alanine.mol' എന്ന ഫയൽ തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'Open ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 06:51 | 3D മോഡൽ Alanine സ്ക്രീനിൽ ഓപ്പൺ ആവുന്നു. |
| 06:55 | Modelkit' മെനു ഓപ്പൺ ചെയ്‌തു fix hydrogens and minimize ഓപ്ഷൻ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. |
| 07:03 | 'ഹൈഡ്രജൻസ്' സ്ട്രക്ചർലേക്ക് ആഡ് ചെയ്യുകയും എനർജി മിനിമൈസ് ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു |
| 07:08 | ഏതെങ്കിലും "mol" ഫയൽ പോലെ, നമുക്ക് മെനു ബാറും "Pop-up " മെനുവും ഉപയോഗിച്ച് കാണാം. |
| 07:15 | Jmol ലെ Adenosine.mol 'യുടെ 3D മോഡൽ ഇവിടെയുണ്ട്. |
| 07:19 | Alpha-D-glucopyranose.mol Jmol ന്റെ ഒരു 3 ഡി മോഡൽ ആണ്. |
| 07:25 | സമ്മറൈസ് ചെയ്യാം |
| 07:27 | ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്: |
| 07:32 | Pubchem ഡേറ്റാ ബേസിൽ നിന്ന് കെമിക്കൽ സ്ട്രച്ചേഴ്സ് Load ചെയ്യാൻ . |
| 07:34 | "Phenol , Cholesterol 'എന്നിവയുടെ ഡിസ്‌പ്ലൈ മോഡിഫിയ്‌ ചെയ്യാൻ . |
| 07:38 | Convert 2D structures drawn in GChemPaint to 3D models in Jmol.
'ജിസിഎൽ' ജെമോൽ 'ൽ 3 ഡി മോഡലുകളിലേക്ക് 2 ഡി ഘടനകൾ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക. "Jmol" ലെ |
| 07:44 | Alanine, Adenosine, Alpha-D-glucopyranose" എന്നിവയുടെ 2D സ്ട്രച്ചേഴ്സ് 3D കൺവെർട് ചെയ്യാൻ. |
| 07:53 | ഇതാ നിങ്ങൾക്ക് മറ്റൊരു അസൈൻമെന്റ് |
| 07:56 | "Amino acids" കളുടെ GChemPaint 2d സ്ട്രച്ചേഴ്സ് വരയ്ക്കുക - |
| 08:01 | Cysteine |
| 08:03 | Histidine Phenylalanine |
| 08:06 | 'mol' ഫയലായി സേവ് ചെയ്യുക. |
| 08:09 | Jmol' ലെ ഫയലുകള് തുറന്ന് ഡിസ്പ്ലേയില് മാറ്റം വരുത്തുക. |
| 08:12 | ഈ URL ൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക: http: //spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial |
| 08:16 | Spoken Tutorial" പ്രൊജക്റ്റ് സമ്മറൈസ് ചെയ്യുന്നു. |
| 08:19 | നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്. |
| 08:23 | സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം: |
| 08:26 | സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു. |
| 08:29 | ഓൺ-ലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫികറ്റുകൾ നല്കുന്നു. |
| 08:33 | കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് ദയവായി ഈ വിലാസത്തിൽ എഴുതുക: 'contact@spoken-tutorial.org' |
| 08:40 | Spoken Tutorial" പ്രോജക്റ്റ് Talk to a Teacher പദ്ധതിയുടെ ഭാഗമാണ്. |
| 08:45 | ഇത് സപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നതു നാഷണൽ മിഷൻ ഓൺ എഡ്യൂക്കേഷൻ ത്രൂ ഐസിടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ ആണ് . |
| 08:52 | ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ ഈ ലിങ്കിലുണ്ട്: http: //spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro |
| 08:57 | ഇത് IIT Bombay യിൽ നിന്ന് വൈശാഖ് ആണ്.പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി. |
