Difference between revisions of "Jmol-Application/C4/Proteins-and-Macromolecules/Malayalam"

From Script | Spoken-Tutorial
Jump to: navigation, search
 
Line 24: Line 24:
 
|-
 
|-
 
|00:24
 
|00:24
−
|''hydrogen bonds '''and '''disulfide bonds''' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക  
+
|''hydrogen bonds ''' '''disulfide bonds''' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക  
 
|-
 
|-
 
|00:29
 
|00:29
−
|ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ ഫോളോ ചെയ്യാൻ, '''Jmol Application window ''' ലെ ബേസിക് ഓപ്പറേഷൻസ് ഫെമിലിയർ ആയിരിക്കണം.' ''
+
|ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ ഫോളോ ചെയ്യാൻ, '''Jmol Application window ''' ലെ ബേസിക് ഓപ്പറേഷൻസ് ഫെമിലിയർ ആയിരിക്കണം.
 
|-
 
|-
 
|00:37
 
|00:37
Line 36: Line 36:
 
|-
 
|-
 
|00:46
 
|00:46
−
|'''Ubuntu '''OS version '''12.04'''
+
|'''Ubuntu '''OS വേർഷൻ  '''12.04'''
 
|-
 
|-
 
|00:50
 
|00:50
−
|'''Jmol''' version '''12.2.2'''
+
|'''Jmol''' വേർഷൻ  '''12.2.2'''
 
|-
 
|-
 
|00:54
 
|00:54
−
|'''Java''' version '''7'''  
+
|'''Java''' വേർഷൻ  '''7'''  
 
|-
 
|-
 
|00:57
 
|00:57
Line 48: Line 48:
 
|-
 
|-
 
|01:02
 
|01:02
−
|വലിയ ജീവജാലങ്ങളുടെ ''Structure Analysis''.  
+
|വലിയ ബയോ മോളിക്യൂൾസ്  ന്റെ  ''Structure Analysis''.  
 
|-
 
|-
 
|01:06
 
|01:06
−
|'''Proteins''' and '''Macromolecules'''
+
|'''Proteins''' '''Macromolecules'''
 
|-
 
|-
 
|01:10
 
|01:10
Line 57: Line 57:
 
|-
 
|-
 
|01:13
 
|01:13
−
|'''Jmol Application.''' ഉപയോഗിച്ച് '''Crystal structures''' and '''polymers'''  ചെയ്യാം
+
|'''Jmol Application.''' ഉപയോഗിച്ച് '''Crystal structures''' '''polymers'''  ചെയ്യാം
 
|-
 
|-
 
|01:19
 
|01:19
Line 84: Line 84:
 
|-
 
|-
 
|02:04
 
|02:04
−
|ഉദാഹരണമായി, '''PDB ''' എന്ന വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്നും '''Pancreatic Enzyme Insulin '' വേണ്ടി ''PDB code" കണ്ടുപിടിക്കാൻ ശ്രമിക്കാം.
+
|ഉദാഹരണമായി, '''PDB ''' എന്ന വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്നും '''Pancreatic Enzyme Insulin '' എന്നതിന്  ''PDB code" കണ്ടുപിടിക്കാൻ ശ്രമിക്കാം.
 
|-
 
|-
 
|02:13
 
|02:13
Line 93: Line 93:
 
|-
 
|-
 
|02:28
 
|02:28
−
|''Human Insulin'' ഉം ''PDB codes '' എന്ന പേരിലറിയപ്പെടുന്ന സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ സ്ക്രീനിൽ ഡിസ്‌പ്ലൈ ആവുന്നു.
+
|''Human Insulin''   ''PDB codes '' എന്ന പേരിലറിയപ്പെടുന്ന സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ സ്ക്രീനിൽ ഡിസ്‌പ്ലൈ ആവുന്നു.
 
|-
 
|-
 
|02:36
 
|02:36
Line 105: Line 105:
 
|-
 
|-
 
|02:52
 
|02:52
−
|വിവരങ്ങൾ-
+
|ഇന്ഫോര്മേഷന്സ്
 
|-
 
|-
 
|02:54
 
|02:54
Line 111: Line 111:
 
|-
 
|-
 
|02:56
 
|02:56
−
|'''Molecular Description '''and
+
|'''Molecular Description '''
 
|-
 
|-
 
|02:58
 
|02:58
Line 117: Line 117:
 
|-
 
|-
 
|03:02
 
|03:02
−
|നമുക്ക് പ്രോട്ടീനുകളുടെ സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ "pdb' ഫയലായും വ്യൂ '''3D mode''' in '''Jmol''' ആയിരിക്കും
+
|നമുക്ക് പ്രോട്ടീനുകളുടെ സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ ". pdb' ഫയലായും നമുക്ക് ഉ  '''3D mode''' ൽ  '''Jmol''' ആയിരിക്കും
 
|-
 
|-
 
|03:12
 
|03:12
Line 147: Line 147:
 
|-
 
|-
 
|04:15
 
|04:15
−
|ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സിൽ 4 ലെറ്റർ  '''PDB code “4EX1” ടൈപ്പ് ചെയ്തിട്ട് ''OK' '' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
+
|ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സിൽ 4 ലെറ്റർ ഉള്ള '''PDB code “4EX1” ടൈപ്പ് ചെയ്തിട്ട് ''OK' '' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
 
|-
 
|-
 
|04:25
 
|04:25
Line 184: Line 184:
 
|-
 
|-
 
|05:33
 
|05:33
−
|''protein'''  സ്ട്രക്ചർ ജല മോളിക്യൂൾസ് ലൂടെ കാണിക്കുന്നു.
+
|''protein'''  സ്ട്രക്ചർ വാട്ടർ  മോളിക്യൂൾസ് ലൂടെ കാണിക്കുന്നു.
 
|-
 
|-
 
|05:38
 
|05:38
−
|വാട്ടർ  മോളിക്യൂൾസ് ഹൈഡ് ചെയ്യാൻ, കാണിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ |സ്റെപ്സ് ഫോളോ  ചെയ്യുക  
+
|വാട്ടർ  മോളിക്യൂൾസ് ഹൈഡ് ചെയ്യാൻ, കാണിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ സ്റെപ്സ് ഫോളോ  ചെയ്യുക  
 
|-
 
|-
 
|05:43
 
|05:43
Line 196: Line 196:
 
|-
 
|-
 
|05:55
 
|05:55
−
|പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, '' 'Style '' >> '' 'Scheme' '' എന്നതിലേക്ക് പോയി '' 'CPK spacefill'' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
+
|പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, '' 'Style '' >> ലെ '' 'Scheme' '' എന്നതിലേക്ക് പോയി '' 'CPK spacefill'' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
 
|-
 
|-
 
|06:05
 
|06:05
Line 277: Line 277:
 
|-
 
|-
 
|08:47
 
|08:47
−
|'' 'hydrogen bonds' '' വെളുപ്പും ചുവപ്പും നീളമുള്ള അലങ്കാരങ്ങളായി ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യപ്പെടുന്നു.
+
|'' 'hydrogen bonds' '' വെളുപ്പും ചുവപ്പും ഡാഷുകൾ ആയി  ചെയ്യപ്പെടുന്നു.
 
|-
 
|-
 
|08:53
 
|08:53
−
|''hydrogen bonds" കളുടെ തിക്‌നെസ്സ് മാറ്റുന്നതിന്,' '' pop-up-menu"വിലെ |"0.10 A" ഓപ്ഷനില് ക്ലിക് ചെയ്യുക.
+
|''hydrogen bonds" കളുടെ തിക്‌നെസ്സ് മാറ്റുന്നതിന്,' '' pop-up-menu"വിലെ "0.10 A" ഓപ്ഷനില് ക്ലിക് ചെയ്യുക.
 
|-
 
|-
 
|09:02
 
|09:02
Line 295: Line 295:
 
|-
 
|-
 
|09:25
 
|09:25
−
|Disulfide bonds''' and '''sulphur'''  ആറ്റങ്ങൾ എന്നിവയാണ് മഞ്ഞ നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നത്.
+
|Disulfide bonds''' '''sulphur'''  ആറ്റങ്ങൾ എന്നിവയാണ് മഞ്ഞ നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നത്.
 
|-
 
|-
 
|09:31
 
|09:31
Line 307: Line 307:
 
|-
 
|-
 
|09:51
 
|09:51
−
|നമുക്ക് സമ്മറൈസ് ചെയ്യാo. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്:
+
|നമുക്ക് ചുരുക്കം . ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്:
 
|-
 
|-
 
|09:57
 
|09:57
−
|പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ '''Protein Data Bank''' (PDB). ൽനിന്ന് '' 'Load' '' ചെയ്യാൻ   
+
|സ്‌ '''Protein Data Bank''' (PDB). ൽനിന്ന്പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചഴ് '' 'Load' '' ചെയ്യാൻ   
 
|-
 
|-
 
|10:00
 
|10:00
Line 319: Line 319:
 
|-
 
|-
 
|10:10
 
|10:10
−
|'''Protein'''  വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്ത ഘടന.
+
|'''Protein'''  വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്തസ്ട്രുക്ചാർ
 
|-
 
|-
 
|10:14
 
|10:14
Line 325: Line 325:
 
|-
 
|-
 
|10:17
 
|10:17
−
|''hydrogen bonds '''and '''disulfide bonds''' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക.
+
|''hydrogen bonds ''' '''disulfide bonds''' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക.
 
|-
 
|-
 
|10:22
 
|10:22

Latest revision as of 12:09, 27 February 2018

One


Time Narration
00:01 Proteins and Macromolecules.' എന്ന ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം.
00:06 ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കുന്നതു:
00:09 Protein Data Bank (PDB)' ൽനിന്നുള്ള protein ന്റെ Load സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌.
00:13 'pdb' ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് 'PDB' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക
00:18 വിവിധ ഫോർമാറ്റിൽ പ്രോട്ടീനുകളുടെ സെകണ്ടറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യുക.
00:24 hydrogen bonds disulfide bonds' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക
00:29 ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ ഫോളോ ചെയ്യാൻ, Jmol Application window ലെ ബേസിക് ഓപ്പറേഷൻസ് ഫെമിലിയർ ആയിരിക്കണം.
00:37 ഇല്ലെങ്കിൽ, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റിൽ ലഭ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ കാണുക.
00:42 ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ റെക്കോർഡ് ചെയ്യാൻ ഞാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നതു:
00:46 Ubuntu OS വേർഷൻ 12.04
00:50 Jmol വേർഷൻ 12.2.2
00:54 Java വേർഷൻ 7
00:57 Mozilla Firefox Browser 22.0.
01:02 വലിയ ബയോ മോളിക്യൂൾസ് ന്റെ Structure Analysis.
01:06 Proteins Macromolecules
01:10 Nucleic acids, DNA and RNA
01:13 Jmol Application. ഉപയോഗിച്ച് Crystal structures polymers ചെയ്യാം
01:19 ഇവിടെ, ഒരു പുതിയ Jmol window" തുറന്നിരിക്കുന്നു.
01:24 3D structure" ബയോമോല്യൂളുകൾ ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് നേരിട്ട് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്.
01:29 അങ്ങനെ ചെയ്യാൻ, File മെനുവിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക, 'Get PDB ലേക്ക്‌ സ്ക്രോൾ ഡൗൺ ചെയ്യുക
01:36 screen" നിൽ ഒരു Input 'ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു.
01:40 നാം Input ബോക്സിലെ protein നുള്ള നാലു ലെറ്റർ PDb കോഡ് ടൈപ്പ് ചെയ്യണം.
01:48 Protein Data Bank (PDB) വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് ഈ കോഡ് ലഭിക്കും.
01:53 ഇത് Protein Data Bank ന്റെ വെബ് പേജാണ്.
01:57 proteins and nucleic acids 'തുടങ്ങിയ ബയോമോല്യൂളുകൾ സംബന്ധിച്ച വിവരങ്ങൾ ഇതിന് ഉണ്ട്.
02:04 ഉദാഹരണമായി, PDB എന്ന വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്നും Pancreatic Enzyme Insulin എന്നതിന് PDB code" കണ്ടുപിടിക്കാൻ ശ്രമിക്കാം.
02:13 search boxക്സിൽ "human insulin" എന്ന പ്രോട്ടീൻ പേര് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക. കീ ബോർഡിൽ Enter 'കീ അമർത്തുക.
02:24 ഇപ്പോൾ ഡിസ്‌പ്ലൈ ആയിരിക്കുന്ന വെബ് പേജിൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക.
02:28 Human Insulin PDB codes എന്ന പേരിലറിയപ്പെടുന്ന സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ സ്ക്രീനിൽ ഡിസ്‌പ്ലൈ ആവുന്നു.
02:36 ഉദാഹരണമായി, 4EX1. എന്ന ഒരു കോഡുള്ള Human Insulin തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
02:44 പ്രോട്ടീൻ പേര് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
02:47 സ്ട്രക്ചർന്റെ എല്ലാ വിവരങ്ങളും ഉള്ള ഒരു window തുറക്കുന്നു.
02:52 ഇന്ഫോര്മേഷന്സ്
02:54 Primary Citation
02:56 Molecular Description
02:58 'Structure Validation എന്നിവ ഈ പേജിൽ ലഭ്യമാണ്.
03:02 നമുക്ക് പ്രോട്ടീനുകളുടെ സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ ". pdb' ഫയലായും നമുക്ക് ഉ 3D mode ൽ Jmol ആയിരിക്കും
03:12 page'ന്റെ മുകളില് വലതുകോണിലുള്ള Download Files ലിങ്ക് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:20 ഡ്രോപ്പ്-ഡൌൺ മെനുവിൽ നിന്നും PDB file (gz) 'ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
03:28 സ്ക്രീനില് ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കുന്നു.
03:32 Save file' ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
03:35 OK ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:39 protein സ്ട്രക്ചർ 4EX1.pdb.gz Downloads" ഫോൾഡറിൽ സേവ് ചെയ്യും.
03:51 അതുപോലെ, നിങ്ങൾക്ക് വിവിധ പ്രോട്ടീനുകളുടെ '.pdb' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്, അവ പ്രത്യേക ഫയലുകൾ 'save" ചെയ്യുക.
04:02 ഇപ്പോൾ Insulin എന്നതിന്റെ '3D' സ്ട്രക്ചർ കാണാനായി Jmol വിൻഡോയിലേക്ക മാറാം.
04:09 നിങ്ങൾ ഇന്റർനെറ്റിൽ കണക്റ്റുചെയ്തിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, നിങ്ങൾക്ക് Jmol panel' നിന്ന്‌ നേരിട്ട് പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചർ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യാം.
04:15 ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സിൽ 4 ലെറ്റർ ഉള്ള PDB code “4EX1” ടൈപ്പ് ചെയ്തിട്ട് OK' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:25 നിങ്ങൾ ഇന്റർനെറ്റിൽ കണക്റ്റുചെയ്തിട്ടില്ലെങ്കിൽ, ടൂൾ ബാറിൽ Open a File ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:34 പാനലിൽ ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് തുറക്കുന്നു
04:38 Downloads ഫോൾഡറിലേക്ക് പോയി 4EX1.pdb.gz ഫയലിന്റെ ലൊക്കേഷൻ നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക.
04:47 Downloads' ഫോൾഡർ തിരഞ്ഞെടുത്ത് Open ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:52 4EX1.pdb.gz' ഫയൽ തുറന്ന് "Open" ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
05:00 '3D' Structure of Insulin opens on screen.
05:05 പാനലിലെ ഡിഫാൾട്ട് ഡിസ്പ്ലേ പ്രോട്ടീൻ എന്നത് "ball and stick" ആണ്
05:12 പാനലിലെ പ്രോട്ടീൻ മാതൃക ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളില്ലാതെ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു.
05:17 ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളുമായി മോഡൽ കാണിക്കാൻ 'modelkit" മെനു തുറക്കുക.
05:23 add hydrogens' ഓപ്ഷനിൽ സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് അതിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
05:28 പാനലിലെ മോഡൽ ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റങ്ങളുമായി ഡിസ്‌പ്ലൈ ചയ്തരിക്കുന്നു.
05:33 protein' സ്ട്രക്ചർ വാട്ടർ മോളിക്യൂൾസ് ലൂടെ കാണിക്കുന്നു.
05:38 വാട്ടർ മോളിക്യൂൾസ് ഹൈഡ് ചെയ്യാൻ, കാണിച്ചിരിക്കുന്നതുപോലെ സ്റെപ്സ് ഫോളോ ചെയ്യുക
05:43 ആദ്യം, പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് Select ചെയ്യുക
05:48 സബ്-മെനുവിൽ നിന്നും 'Hetero' തിരഞ്ഞെടുത്ത് All Water ഓപ്ഷനിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
05:55 പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, 'Style >> ലെ 'Scheme' എന്നതിലേക്ക് പോയി 'CPK spacefill ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:05 ഇത് എല്ലാ വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളും 'CPK Spacefill ' ഡിസ്പ്ലമായി കൺവെർട് ചെയ്യും.
06:11 വീണ്ടും പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് 'Style' , Atoms എന്നത് ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Off ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:22 ഇപ്പോൾ പാനലിൽ, നമുക്ക് Insulin വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്ത സ്ട്രക്ചറുണ്ട്.
06:27 അടുത്തതായി, നമുക്ക് protein ൻറെ വിവിധ രൂപങ്ങളിൽ ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യുന്ന രീതി പഠിക്കാം.
06:35 pop-up menu ഓപ്പൺ ചെയ്യുക.
06:37 Select ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
06:39 Protein 'ന് താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് All ഓപ്ഷനിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:44 പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു വീണ്ടും തുറന്ന് 'Style", എന്നിട്ട് "Scheme.' എന്നിവയിലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക.
06:50 CPK Spacefill', Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace etc മുതലായ ഓപ്ഷനുകളോടെയാണ് സബ്-മെനു തുറക്കുന്നത്
07:02 സബ്-മെനുവിൽ നിന്നും 'Cartoon' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:07 ഈ ഡിസ്പ്ലേ പ്രോട്ടീൻ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ കാണിക്കുന്നു helices, random coils, strands, sheets 'etc. തുടങ്ങിയവ.
07:17 കൂടുതൽ ഡിസ്‌പ്ലൈ ഓപ്ഷനുകൾക്ക്-
07:19 പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് Style ലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക, തുടർന്ന്' Structures.
07:25 ഇവിടെ പ്രോട്ടീനിലെ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യുന്നതിന് നമുക്ക് കൂടുതൽ ഓപ്ഷനുകൾ കാണാം.
07:31 ഉദാഹരണത്തിന്, 'Strands' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:35 ഈ പ്രോട്ടീൻ ഇപ്പോൾ പാനലിലെ 'Strands' 'എന്ന പേരിൽ കാണിക്കുന്നു.
07:40 ഡിസ്‌പ്ലൈയൂഡേ കളർ മാറ്റുന്നതിന്: പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക. 'Color' താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക. 'Atoms' തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'Blue' ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:52 പാനലിൽ നിറങ്ങളുടെ മാറ്റം ശ്രദ്ധിക്കുക.
07:56 സ്ട്രക്ചർ വീണ്ടും 'Ball-and-stick' 'ഡിസ്പ്ലേയിലേക്ക് മാറ്റാൻ:
07:59 പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറക്കുക, 'Style , പിന്നെ 'Scheme തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'Ball and stick" ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:08 "protein model ലിൽ' 'hydrogen bonds, 'di-sulpfide bonds" കളും ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്.
08:14 hydrogen bonds" ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യാൻ: പോപ്പ്-അപ്പ് മെനു തുറന്ന് Style" ലേക്കും പിന്നീട്' Hydrogen Bonds 'ഓപ്ഷൻ ലേക്കും സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക.
08:25 പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിലെ "The Hydrogen Bonds" ഓപ്ഷന് ചില ഫീഛേഴ്സ് ഉണ്ട്
08:30 Calculate , Set Hydrogen Bonds Side Chain,
08:35 Set Hydrogen Bonds in the Backbone" ബോണ്ടുകളുടെ തിക്‌നെസ്സ് മാറ്റാനും ഓപ്ഷനുകൾ ഉണ്ട്.
08:42 hydrogen bonds മോഡലിൽ കാണിക്കാൻ 'Calculate ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:47 'hydrogen bonds' വെളുപ്പും ചുവപ്പും ഡാഷുകൾ ആയി ചെയ്യപ്പെടുന്നു.
08:53 hydrogen bonds" കളുടെ തിക്‌നെസ്സ് മാറ്റുന്നതിന്,' pop-up-menu"വിലെ "0.10 A" ഓപ്ഷനില് ക്ലിക് ചെയ്യുക.
09:02 ഇപ്പോൾ, പാനലിൽ, നമുക്ക് തിക്കർ "hydrogen bonds" കാണാം.
09:06 നമുക്ക് ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകളുടെ കളർ മാറ്റാം.
09:11 പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിൽ നിന്ന് 'Color' , പിന്നെ 'Hydrogen Bonds എന്നിവിടങ്ങളിലേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്യുക, തുടർന്ന് 'orange ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
09:20 പാനലിൽ, ഓറഞ്ച് കളറിൽ എല്ലാ 'hydrogen bonds' 'ഉണ്ട്.
09:25 Disulfide bonds sulphur ആറ്റങ്ങൾ എന്നിവയാണ് മഞ്ഞ നിറത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നത്.
09:31 ഡിഫൈൽഫൈഡ് ബോൻഡുകൾ മോഡിഫയ് ചെയ്യാൻ , പോപ്പ്-അപ്പ് മെനുവിലെdisulfide bonds' ഓപ്ഷൻ തുറക്കുക.
09:38 size, color തുടങ്ങിയവ പോലെ നിങ്ങൾ മാറ്റാൻ ആഗ്രഹിക്കുന്ന സവിശേഷതകളിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
09:44 അതുപോലെതന്നെ, വ്യത്യസ്ത enzymes ' .pdb' 'ഫയലുകൾ തുറന്ന് അവരുടെ' 3D 'സ്ട്രക്ചഴ്സ്‌ കാണുക.
09:51 നമുക്ക് ചുരുക്കം . ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിച്ചത്:
09:57 സ്‌ Protein Data Bank (PDB). ൽനിന്ന്പ്രോട്ടീൻ സ്ട്രക്ചഴ് 'Load' ചെയ്യാൻ
10:00 ഡേറ്റാബേസിൽ നിന്ന് 'pdb' ഫയലുകൾ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക.
10:05 'PDB code" ഉപയോഗിച്ചുള്ള ഇൻസുലിൻന്റെ ' '3D structure'
10:10 Protein വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളില്ലാത്തസ്ട്രുക്ചാർ
10:14 വിവിധ ഫോർമാറ്റുകളിലെ സെക്കൻഡറി സ്ട്രക്ചർ ഡിസ്‌പ്ലൈ ചെയ്യുക
10:17 hydrogen bonds disulfide bonds' ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക.
10:22 നിങ്ങൾക്ക് ഒരു അസൈൻമെന്റ്-
10:24 PDB' 'ഡാറ്റാബേസിലെ' 'Human Hemoglobin' 'ന്റെ' .pdb ഫയൽ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക.
10:31 cartoon ഡിസ്പ്ലേയിൽ സെക്കണ്ടറി സ്ട്രക്ചർ കാണിക്കുക.
10:35 പ്രോട്ടീൻ യൂണിറ്റുകൾ "porphyrin" ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക.
10:39 PDB code.' എന്നതിനായി ഇനിപ്പറയുന്ന ലിങ്ക് കാണുക.
10:42 ഈ URL ൽ ലഭ്യമായ വീഡിയോ കാണുക. http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial
10:46 Spoken Tutorial" പ്രൊജക്റ്റ് സമ്മറൈസ് ചെയ്യുന്നു.
10:50 നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്.
10:55 സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് ടീം:
10:57 സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു.
11:01 ഓൺ-ലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫികറ്റുകൾ നല്കുന്നു.
11:06 കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് ദയവായി ഇതിലേക്ക് എഴുതുക: contact@spoken-tutorial.org
11:13 Spoken Tutorial പ്രോജക്റ്റ് Talk to a Teacher പദ്ധതിയുടെ ഭാഗമാണ്.
11:18 ഇത് സപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നതു നാഷണൽ മിഷൻ ഓൺ എഡ്യൂക്കേഷൻ ത്രൂ ഐസിടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ.
11:25 ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ ഈ ലിങ്കിലുണ്ട്: http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro'.
11:31 ഇത് IIT Bombay യിൽ നിന്ന് വൈശാഖ് ആണ്.പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

Contributors and Content Editors

Prena, Vijinair

Retrieved from "https://script.spoken-tutorial.org/index.php?title=Jmol-Application/C4/Proteins-and-Macromolecules/Malayalam&oldid=42579"