Difference between revisions of "Avogadro/C2/Build-molecules/Bengali"
From Script | Spoken-Tutorial
| Line 597: | Line 597: | ||
|07:41 | |07:41 | ||
| − | |'' DNA''' অণুর সন্নিবেশ করার জন্য,''' Build ''' মেনুতে যান ''' '''Insert''' '' এ যান এবং | + | |'' DNA''' অণুর সন্নিবেশ করার জন্য, ''' Build ''' মেনুতে যান ''' '''Insert''' '' এ যান এবং |
উপ-মেনু থেকে '' DNA/RNA ''' ক্লিক করুন । | উপ-মেনু থেকে '' DNA/RNA ''' ক্লিক করুন । | ||
| Line 611: | Line 611: | ||
|07:55 | |07:55 | ||
| − | |''' DNA/RNA Builder'' | + | |''' DNA/RNA Builder''' ড্রপ ডাউন থেকে ''' DNA ''' নির্বাচন করুন। |
|- | |- | ||
| Line 629: | Line 629: | ||
|08:10 | |08:10 | ||
| − | |আপনি''' অ্যাসিড '''এর নিজস্ব ক্রম চয়ন করতে পারেন। | + | |আপনি ''' অ্যাসিড '''এর নিজস্ব ক্রম চয়ন করতে পারেন। |
|- | |- | ||
| Line 635: | Line 635: | ||
|08:14 | |08:14 | ||
| − | |আমি প্রদর্শন-এর জন্য, | + | |আমি প্রদর্শন-এর জন্য, ''' A T G C A T G C.''' নির্বাচন করবো |
|- | |- | ||
| Line 677: | Line 677: | ||
|09:01 | |09:01 | ||
| − | |'''Panel-এ DNA''' অণুটি অনির্বাচিত করতে '''CTRL, Shift''' এবং ''' A ''' কী-তিনটি একসাথে | + | |'''Panel-এ DNA''' অণুটি অনির্বাচিত করতে '''CTRL, Shift''' এবং ''' A ''' কী-তিনটি একসাথে টিপুন । |
|- | |- | ||
| Line 695: | Line 695: | ||
|09:21 | |09:21 | ||
| − | |'''Build''' মেনুতে যান এবং '''পেপটাইড '''এ স্ক্রোল করুন। | + | |'''Build''' মেনুতে যান এবং '''পেপটাইড''' এ স্ক্রোল করুন। |
|- | |- | ||
Latest revision as of 15:58, 20 November 2017
| Time | Narration |
| 00:01 | সবাইকে শুভেচ্ছা! Build Molecules এই টিউটোরিয়ালটিতে স্বাগত। |
| 00:07 | এই টিউটোরিয়ালে, আমরা শিখব: ডাটাবেস থেকে অণু আমদানি |
| 00:11 | ঘোরানো, জুম ইন এবং জুম আউট |
| 00:15 | Panel অণু তৈরি করা |
| 00:17 | ফোর্স ফিল্ড সেট করা এবং জ্যামিতি অপটিমাইজ করা |
| 00:21 | বন্ড দৈর্ঘ্য, বন্ড কোণ, ডায়াড্রাল কোণ পরিমাপ |
| 00:25 | ফ্র্যাগমেন্ট লাইব্রেরি দেখা |
| 00:27 | DNA অণু এবং পেপটাইডস তৈরি করা। |
| 00:31 | এখানে আমি উবুন্টু লিনাক্স অপারেটিং সিস্টেমের সংস্করণ 14.04 ব্যবহার করছি।
Avogadro সংস্করণ 1.1.1 কার্যক্ষম ইন্টারনেট সংযোগ |
| 00:44 | এই টিউটোরিয়াল অনুসরণ করতে, আপনার মৌলিক রসায়ন সম্বন্ধে জ্ঞান থাকা উচিত।
Avogadro ডাউনলোড করতে দয়া করে দেখানো sourceforge.net/projects/avogadro লিঙ্কটি ব্যবহার করুন। |
| 00:53 | আমি ইতিমধ্যে Avogadro ডাউনলোড করেছি |
| 00:56 | Avogadro খুলতে, Dash home এ ক্লিক করুন। |
| 01:00 | সার্চ বারে, Avogadro টাইপ করুন। |
| 01:02 | অ্যাপ্লিকেশনটি খুলতে Avogadro আইকনে ক্লিক করুন। |
| 01:08 | চলুন, chemical structure database থেকে xylene অণু আমদানি করে শুরু করা যাক । |
| 01:15 | একটি অণু আমদানি করতে, আমাদের একটি কার্যকরী ইন্টারনেট সংযোগের প্রয়োজন। |
| 01:19 | File মেনুতে ক্লিক করুন, Import -এ নেভিগেট করুন |
| 01:23 | একটি সাব-মেনু খোলে। |
| 01:25 | Fetch by chemical name নির্বাচন করুন। |
| 01:28 | Chemical name ডায়লগ বাক্স প্রদর্শিত হচ্ছে। |
| 01:30 | প্রদর্শন-এর জন্য আমি সার্চ বাক্সে xylene টাইপ করবো। |
| 01:36 | ওকে বাটনে ক্লিক করুন। |
| 01:38 | এখন আমাদের Panel-এ xyleneঅণু আছে। |
| 01:42 | চলুন Panel-এ অনু-টিকে ঘোরানো যাক। |
| 01:45 | টুলবারে ন্যাভিগেশন টুল এ ক্লিক করুন। |
| 01:49 | অণুতে কার্সার রাখুন। |
| 01:52 | বাম মাউস বাটন ধরে রাখুন এবং টানুন। |
| 01:56 | লক্ষ্য করুন direction তীরগুলি টেনে আনা নির্দেশ করে। |
| 02:00 | অণু translate করতে, ডান মাউস বাটন ব্যবহার করুন এবং টেনে আনুন। |
| 02:06 | মাউস-এর চাকা স্ক্রল করে কাঠামোটিতে জুম বাড়ান বা কমান |
| 02:10 | চলুন দেখা যাক কিভাবে একটি অণু তৈরি করতে হয়। |
| 02:14 | একটি অণু তৈরি করতে, টুল বারে ড্র টুল আইকনে ক্লিক করুন। |
| 02:19 | ড্র সেটিংস মেনুতে, আমরা দেখতে পাচ্ছি
এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন বোতাম বন্ড অর্ডারড্রপ ডাউন বোতাম Adjust Hydrogens চেক বাক্স। |
| 02:30 | যদি আপনি হাইড্রোজেনগুলিকে কাঠামোর মধ্যে না চান, তাহলে Adjust Hydrogens চেক বাক্সটি অনির্বাচন করুন। |
| 02:37 | এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন, অণুগুলির তালিকা দেখায়। |
| 02:42 | সম্পূর্ণ Periodic table , একটি পৃথক উইন্ডোতে দেখতে, Other ক্লিক করুন। |
| 02:48 | উইন্ডো বন্ধ করতে Close (X) ক্লিক করুন। |
| 02:51 | Panel এ Aniline এর গঠন আঁকা যাক । |
| 02:55 | এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন তালিকা থেকে কার্বন নির্বাচন করুন। |
| 02:59 | বন্ড অর্ডার ড্রপ ডাউন থেকে Single নির্বাচন করুন। |
| 03:03 | Panel ' এ ক্লিক করুন। |
| 03:05 | ছয় কার্বন পরমাণুর একটি বন্ধ শৃঙ্খল করতে টানুন এবং বসান। |
| 03:10 | ডাবল বন্ড দেখাতে, বন্ড অর্ডার ড্রপ ডাউন থেকে ডাবল নির্বাচন করুন। |
| 03:16 | বেঞ্জেন' কাঠামো পাওয়ার জন্য বিকল্প বন্ডগুলিতে ক্লিক করুন। |
| 03:21 | চলুন Aniline কাঠামো সম্পূর্ণ করা যাক । |
| 03:24 | এলিমেন্ট ড্রপ ডাউন তালিকা থেকে নাইট্রোজেন নির্বাচন করুন। |
| 03:29 | বন্ড অর্ডার ড্রপ ডাউন থেকে Single নির্বাচন করুন। |
| 03:33 | কাঠামোর উপর কার্বন পরমাণুগুলির যেকোনো একটিতে ক্লিক করুন এবং টেনে আনুন। |
| 03:39 | Build ' মেনুতে যান এবং Add Hydrogens নির্বাচন করুন। |
| 03:45 | Panel -এ আমাদের Aniline গঠন রয়েছে । |
| 03:49 | একটি স্থিতিশীল রূপান্তর পেতে, Panel -এর Aniline গঠন অপ্টিমাইজ করা প্রয়োজন। |
| 03:56 | অপটিমাইজ করতে, টুলবারের Auto Optimization Tool এ ক্লিক করুন। |
| 04:02 | অটো অষ্টিমাইজেশন সেটিংস মেনু বাম দিকে প্রদর্শিত হবে |
| 04:06 | Force Field ড্রপ ডাউন তালিকাতে ক্লিক করুন, MMFF94 নির্বাচন করুন। |
| 04:13 | MMFF94 সাধারণত ছোট জৈব অণুকে অপটিমাইজ করতে ব্যবহৃত হয়। |
| 04:20 | স্টার্ট বোতামে ক্লিক করুন। |
| 04:23 | এই অপ্টিমাইজেশান সম্পূর্ণ করতে কয়েক সেকেন্ড লাগবে। |
| 04:28 | 'অপ্টিমাইজেশান সেটিংস বন্ধ করতে Stop এ ক্লিক করুন। |
| 04:33 | চলুন Aniline-এর বন্ড দৈর্ঘ্য, বন্ডের কোণ এবং ডাইডিড্রাল অ্যাঙ্গেলস পরিমাপ করা যাক। |
| 04:40 | টুল বারে Click to Measure আইকন নির্বাচন করুন। |
| 04:44 | দূরত্ব পরিমাপ করতে, দুইটি পরপর কার্বন পরমাণুতে ক্লিক করুন। |
| 04:49 | কোণ পরিমাপ করতে, 3 টি পরপর পরমাণুতে ক্লিক করুন। |
| 04:55 | ডায়াড্রাল অ্যাঙ্গেলস' পরিমাপ করতে, 4 টি পরপর পরমাণুতে ক্লিক করুন। |
| 05:02 | পরিমাপ করা মানগুলি Panel এর নীচে প্রদর্শিত হয়। |
| 05:07 | ফাইলটি সংরক্ষণ করতে, File এবং Save As এ ক্লিক করুন। |
| 05:13 | Save Molecule As ডায়ালগ বক্সটি প্রদর্শিত হচ্ছে। |
| 05:17 | ফাইলের নাম হিসাবে Aniline.cml টাইপ করুন। |
| 05:21 | অবস্থান হিসাবে ডেস্কটপ চয়ন করুন এবং Save বোতামটি ক্লিক করুন। |
| 05:28 | নতুন উইন্ডো খুলতে New আইকনে ক্লিক করুন। |
| 05:32 | Avogadro সফটওয়্যারটিতে fragment লাইব্রেরি ব্যবহার করে জটিল অণু নির্মাণের একটি বৈশিষ্ট্য রয়েছে। |
| 05:38 | Build মেনুতে যান। |
| 05:40 | Insert এ নেভিগেট করুন এবং ফ্র্যাগমেন্ট বিকল্পটি নির্বাচন করুন। |
| 05:45 | Insert Fragment ডায়ালগ বক্স খুলে গেছে । |
| 05:49 | আমরা বিভিন্ন রাসায়নিক কাঠামোর cml ফাইলগুলির ফোল্ডারগুলির তালিকা দেখতে পাচ্ছি। |
| 05:55 | উদাহরণস্বরূপ চলুন alkenes ফোল্ডারটি খুলুন। |
| 06:00 | ফোল্ডারটির বিষয়বস্তু দেখতে ফোল্ডারে ডাবল ক্লিক করুন। |
| 06:04 | 2-methyl-buta-1,3-diene.cml নির্বাচন করুন । |
| 06:10 | Insert বোতামে ক্লিক করুন |
| 06:13 | ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করতে Close ক্লিক করুন। |
| 06:17 | 2-methyl-buta-1,3-diene কাঠামো Panel এ প্রদর্শিত হচ্ছে। |
| 06:22 | এটি সাধারণভাবে Isoprene নামে পরিচিত। |
| 06:26 | আমরা Isoprene ব্যবহার করে অনেক প্রাকৃতিক পণ্য তৈরি করতে পারি |
| 06:30 | অণুটি নির্বাচন মোডে রয়েছে। |
| 06:33 | অ-নির্বাচন করতে, একসাথে CTRL, SHIFT' এবং A কী টিপুন। |
| 06:39 | একটি উদাহরণ হিসাবে: আমি Isoprene ব্যবহার করে তৈরি করা Vitamin A and natural rubber দেখানো । |
| 06:47 | Vitamin A, natural rubber |
| 06:51 | আমি একটি কোণে Isoprene অনুবাদ করবে। |
| 06:56 | Build মেনুতে ক্লিক করুন, Insert এ নেভিগেট করুন এবং Fragment নির্বাচন করুন। |
| 07:02 | macrocycles ফোল্ডার অবধি স্ক্রোল করুন; খুলতে ডাবল ক্লিক করুন |
| 07:08 | porphin অংশ নির্বাচন করুন এবং Insert' ক্লিক করুন। |
| 07:14 | ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করুন। |
| 07:16 | porphyrin' অংশ ব্যবহার করে, আমরা জটিল রাসায়নিক কাঠামো তৈরি করতে পারি: যেমন ক্লোরোফিল এবং ভিটামিন বি 12। |
| 07:25 | ক্লোরোফিল |
| 07:27 | ভিটামিন বি 12 |
| 07:30 | DNA' এবং পেপটাইডস মতো জটিল অণু, Avogadro ব্যবহার করে সহজেই তৈরি করা যায়। |
| 07:37 | New আইকন ব্যবহার করে একটি নতুন উইন্ডো খুলুন। |
| 07:41 | DNA অণুর সন্নিবেশ করার জন্য, Build মেনুতে যান Insert এ যান এবং
উপ-মেনু থেকে DNA/RNA ' ক্লিক করুন । |
| 07:51 | Insert Nucleic Acids ডায়ালগ বক্স প্রদর্শিত হবে। |
| 07:55 | DNA/RNA Builder ড্রপ ডাউন থেকে DNA নির্বাচন করুন। |
| 08:00 | চারটি nucleic acid bases বোতাম হিসেবে দেখা যাচ্ছে । |
| 08:05 | nucleic acid ক্রম নির্বাচন করতে বোতামে ক্লিক করুন। |
| 08:10 | আপনি অ্যাসিড এর নিজস্ব ক্রম চয়ন করতে পারেন। |
| 08:14 | আমি প্রদর্শন-এর জন্য, A T G C A T G C. নির্বাচন করবো |
| 08:26 | নিউক্লিক এসিড-গুলির নির্বাচনের ক্রম Sequence টেক্সট বক্সে প্রদর্শিত হচ্ছে। |
| 08:32 | Bases Per Turn ড্রপ ডাউন এ, A নির্বাচন করুন, "5" নির্বাচন করুন: যা প্রতি হেলিক্স-এ base জোড়ার সংখ্যা । |
| 08:41 | স্ট্র্যান্ডস Single হিসাবে নির্বাচন করুন এবং Insert' বোতামে ক্লিক করুন। |
| 08:47 | ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করতে Close এ ক্লিক করুন। |
| 08:51 | এখন আমাদের Panel এ একটি একতন্ত্রী DNA' অণু আছে । |
| 08:56 | গঠনটি জুম আউট করুন এবং Panel এর কেন্দ্রে টানুন। |
| 09:01 | Panel-এ DNA অণুটি অনির্বাচিত করতে CTRL, Shift এবং A কী-তিনটি একসাথে টিপুন । |
| 09:09 | আমরা পেপটাইড ক্রম তৈরি করতে Insert মেনুর পেপটাইড বিকল্পও ব্যবহার করতে পারি। |
| 09:16 | আবার নতুন উইন্ডো খুলতে New আইকনে ক্লিক করুন। |
| 09:21 | Build মেনুতে যান এবং পেপটাইড এ স্ক্রোল করুন। |
| 09:26 | Insert Peptide ডায়ালগ বক্স প্রদর্শিত হচ্ছে । |
| 09:29 | অ্যামিনো অ্যাসিড বোতামগুলি ক্লিক করে পেপটাইড ক্রমের জন্য অ্যামিনো অ্যাসিড নির্বাচন করুন। |
| 09:36 | প্রদর্শন-এর জন্য আমি Glycine(Gly) -Valine(Val) -Proline(Pro) and Cystine(Cys) অনুসারে ক্রমটি নির্বাচন করবো। |
| 09:45 | Sequence টেক্সট বক্সে নির্বাচন করার ক্রমটি প্রদর্শিত হয়। |
| 09:50 | Insert Peptide বোতামে ক্লিক করুন |
| 09:53 | Insert Peptide ডায়ালগ বাক্সটি বন্ধ করুন। |
| 09:57 | পেপটাইড চেইনটি Panel-এ প্রদর্শিত হচ্ছে । |
| 10:00 | Panel-এর পেপটাইড''-টি অনির্বাচন করতে, CTRL, Shift এবং A একসাথে টিপুন। |
| 10:07 | আপনি আপনার পছন্দমত অ্যামিনো অ্যাসিড নির্বাচন করতে পারেন এবং পেপটাইড ক্রম তৈরি করতে পারেন। |
| 10:13 | এর সংক্ষিপ্ত বিবরণ |
| 10:15 | এই টিউটোরিয়ালে আমরা শিখেছি: |
| 10:18 | ডাটাবেস থেকে আমদানি অণু |
| 10:21 | ঘোরানো, জুম ইন এবং জুম আউট |
| 10:24 | Panel-এ অণু তৈরি করা |
| 10:26 | ফোর্স ফিল্ড সেট করা এবং জ্যামিতি অপটিমাইজ করা |
| 10:30 | বন্ড ধৈর্ঘ্য, বন্ড কোণ, ডায়াড্রাল কোণ পরিমাপ করা |
| 10:35 | ফ্র্যাগমেন্ট লাইব্রেরি দেখানো |
| 10:37 | DNA অণু এবং পেপটাইড তৈরী করা । |
| 10:41 | একটি অনুশীলনী হিসাবে - নিম্নলিখিত অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ ব্যবহার করে একটি প্রোটিন ক্রম তৈরি করুন: |
| 10:49 | UFFফোর্স ফিল্ড ব্যবহার করে জ্যামিতি অপটিমাইজ করা |
| 10:53 | ছবি .cml হিসাবে সংরক্ষণ করা । |
| 10:58 | Nucleic acids: AUGC ব্যবহার করে RNA ক্রম তৈরি করা |
| 11:04 | MMFF94 ফোর্স ফিল্ড' ব্যবহার করে জ্যামিতি অপটিমাইজ করা |
| 11:10 | ছবিটি .cml ফাইল হিসাবে সংরক্ষণ করা । |
| 11:14 | এই ভিডিওটি স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্পকে সারসংক্ষেপে দেখায় |
| 11:18 | যদি আপনার ভাল ব্যান্ডউইডথ না থাকে, তাহলে আপনি এটি ডাউনলোড করে দেখতে পারেন। |
| 11:23 | আমরা স্পোকেন টিউটোরিয়ালগুলি ব্যবহার করে কর্মশালা পরিচালনা করি এবং সার্টিফিকেটগুলি দিযে থাকি । আমাদের সাথে যোগাযোগ করুন । |
| 11:30 | স্পোকেন টিউটোরিয়াল প্রকল্পটি ভারত সরকারের NMEICT, MHRD দ্বারা পরিচালিত হয়। |
| 11:36 | অন্তরা এই টিউটোরিয়ালটি অনুবাদ এবং রেকর্ড করেছেন ।
যোগদান করার জন্য ধন্যবাদ। |
