Difference between revisions of "Jmol-Application/C3/Structures-from-Database/Gujarati"

From Script | Spoken-Tutorial
Jump to: navigation, search
 
(One intermediate revision by one other user not shown)
Line 13: Line 13:
 
|-
 
|-
 
| 00:10
 
| 00:10
−
| * '''PubChem''' ડેટાબેસ થી રાસાયણિક સ્ટ્રક્ચર લોડ કરવા અને  
+
|  '''PubChem''' ડેટાબેસ થી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરવા અને  
  
 
|-
 
|-
 
| 00:14
 
| 00:14
−
| *  '''GChemPaint''' માં બનાવેલ '''2D''' સ્ટ્રક્ચર ને Jmol''' માં '''3D''' માં બદલતા.
+
| '''GChemPaint''' માં બનાવેલ '''2D''' સ્ટ્રક્ચર ને Jmol''' માં '''3D''' માં બદલતા.
  
 
|-
 
|-
Line 33: Line 33:
 
|-
 
|-
 
| 00:35
 
| 00:35
−
| * ''' ઉબુન્ટુ લીનક્સ  '''OS ''' આવૃત્તિ. 12.04
+
| ''' ઉબુન્ટુ લીનક્સ  '''OS ''' આવૃત્તિ. 12.04
  
 
|-
 
|-
 
| 00:40
 
| 00:40
−
| * '''Jmol''' આવૃત્તિ 12.2.2
+
| '''Jmol''' આવૃત્તિ 12.2.2
  
 
|-
 
|-
 
|00:44  
 
|00:44  
−
| * '''Java''' આવૃત્તિ 7
+
| '''Java''' આવૃત્તિ 7
  
 
|-
 
|-
 
| 00:46
 
| 00:46
−
| * '''GChemPaint''' આવૃત્તિ 0.12.10
+
| '''GChemPaint''' આવૃત્તિ 0.12.10
  
 
|-
 
|-
 
| 00:51
 
| 00:51
−
| * '''Mozilla Firefox''' browser 22.0
+
| '''Mozilla Firefox''' browser 22.0
  
 
|-
 
|-
Line 81: Line 81:
 
|-
 
|-
 
| 01:36
 
| 01:36
−
| Andialog box opens on the screen. સ્ક્રીન પર  ''''Input''''  ડાઈલોગ બોક્સ ખુલે છે.
+
| સ્ક્રીન પર  ''''Input''''  ડાઈલોગ બોક્સ ખુલે છે.
  
 
|-
 
|-
Line 237: Line 237:
 
|-
 
|-
 
| 04:42
 
| 04:42
−
| The double-bond in the '''cholesterol ''' મોડલમાં  ડબલ-બોન્ડ હવે નારંગી રંગ માં છે.
+
| '''cholesterol ''' મોડલમાં  ડબલ-બોન્ડ હવે નારંગી રંગ માં છે.
  
 
|-
 
|-
Line 257: Line 257:
 
|-
 
|-
 
| 05:08
 
| 05:08
−
| * ડેટાબેસ થી '''caffeine''' નું સ્ટ્રક્ચર લોડ કરો.
+
| ડેટાબેસ થી '''caffeine''' નું સ્ટ્રક્ચર લોડ કરો.
  
 
|-
 
|-
 
| 05:11
 
| 05:11
−
| * અણુમાં મહ્ત્વપૂર્ણ ફીચરોને હાઈલાઈટ  કરો .
+
| અણુમાં મહ્ત્વપૂર્ણ ફીચરોને હાઈલાઈટ  કરો .
  
 
|-
 
|-
 
| 05:15
 
| 05:15
−
| * ડિસ્પ્લેને '''wireframe''' માં રૂપાંતરિત કરો.  
+
|  ડિસ્પ્લેને '''wireframe''' માં રૂપાંતરિત કરો.  
  
 
|-
 
|-
Line 301: Line 301:
 
|-
 
|-
 
| 06:05
 
| 06:05
−
| Shown on this આ '''Gchempaint''' પર ડિસ્પ્લે એરિયા '''2D''' ડ્રોઈંગ બતાડ્યા પ્રમાણે છે.  
+
| આ '''Gchempaint''' પર ડિસ્પ્લે એરિયા '''2D''' ડ્રોઈંગ બતાડ્યા પ્રમાણે છે.  
  
 
|-
 
|-
 
| 06:10
 
| 06:10
−
| * '''Amino acid -Alanine'''
+
| '''Amino acid -Alanine'''
  
 
|-
 
|-
 
| 06:12
 
| 06:12
−
| * '''Nuclioside -Adenosine'''
+
| '''Nuclioside -Adenosine'''
  
 
|-
 
|-
 
| 06:14
 
| 06:14
−
| * '''Saccharide -Alpha-D glucopyranose'''
+
| '''Saccharide -Alpha-D glucopyranose'''
  
 
|-
 
|-
 
| 06:19
 
| 06:19
−
| મેં આને '''.mol ''' ફોરમેટમાં ડેસ્કટોપ પર સેવ કર્યું છે.
+
| મેં આને '''.mol ''' ફોરમેટમાં ડેસ્કટોપ પર સેવ કર્યું છે.
  
 
|-
 
|-
 
| 06:24
 
| 06:24
−
|   પ્રથમ  '''Alanine ''' ના '''2D''' સ્ટ્રક્ચરને '''Jmol Application''' માં '''3D'''  મોડલમાં જોઈએ છીએ,
+
| પ્રથમ  '''Alanine ''' ના '''2D''' સ્ટ્રક્ચરને '''Jmol Application''' માં '''3D'''  મોડલમાં જોઈએ છીએ,
  
 
|-
 
|-
Line 361: Line 361:
 
|-
 
|-
 
| 07:25
 
| 07:25
−
| Let's summarize  ચાલો સારાંશ લઈએ.
+
| ચાલો સારાંશ લઈએ.
  
 
|-
 
|-
Line 369: Line 369:
 
|-
 
|-
 
| 07:32
 
| 07:32
−
| *  '''Pubchem''' ડેટા બેસથી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.  
+
| '''Pubchem''' ડેટા બેસથી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.  
  
 
|-
 
|-
 
| 07:34
 
| 07:34
−
| * '''Phenol''' અને  '''Cholesterol''' ના ડિસ્પ્લે રૂપાંતરણ કરતા.  
+
| '''Phenol''' અને  '''Cholesterol''' ના ડિસ્પ્લે રૂપાંતરણ કરતા.  
  
 
|-
 
|-
 
| 07:38
 
| 07:38
−
| * '''GChemPaint''' માં બનેલ '''2D''' સ્ટ્રક્ચરને જેમોલમાં  '''3D'''  મોડલ્સમાં બદલતા.
+
| '''GChemPaint''' માં બનેલ '''2D''' સ્ટ્રક્ચરને જેમોલમાં  '''3D'''  મોડલ્સમાં બદલતા.
  
 
|-
 
|-
 
| 07:44
 
| 07:44
−
| *  '''Alanine, Adenosine''' અને  '''Alpha-D-glucopyranose ''' ના '''2D''' સ્ટ્રક્ચરને  '''3D''' મોડેલ્સમાં બદલતા.
+
| '''Alanine, Adenosine''' અને  '''Alpha-D-glucopyranose ''' ના '''2D''' સ્ટ્રક્ચરને  '''3D''' મોડેલ્સમાં બદલતા.
  
 
|-
 
|-
Line 389: Line 389:
 
|-
 
|-
 
| 07:56
 
| 07:56
−
| # Draw structures of the following  in '''GChemPaint.''' માં આપેલ '''Amino acids''' ના '''2D''' સ્ટ્રક્ચર  બનાવો.
+
|'''GChemPaint.''' માં આપેલ '''Amino acids''' ના '''2D''' સ્ટ્રક્ચર  બનાવો.
  
 
|-
 
|-
 
| 08:01
 
| 08:01
−
| * '''Cysteine '''
+
| '''Cysteine '''
  
 
|-
 
|-
 
| 08:03
 
| 08:03
−
| * '''Histidine '''
+
| '''Histidine ''',  '''Phenylalanine'''
−
 
+
−
|-
+
−
| 08:04
+
−
| * '''Phenylalanine'''
+
  
 
|-
 
|-
 
| 08:06
 
| 08:06
−
| #  '''.mol ''' ફાઈલ તરીકે સેવ કરો.
+
| '''.mol ''' ફાઈલ તરીકે સેવ કરો.
  
 
|-
 
|-
 
| 08:09
 
| 08:09
−
| # '''Jmol''' ફાઈલ ખોલો અને અને ડીસ્લ્પેને રૂપાંતરિત કરતા.  
+
| '''Jmol''' ફાઈલ ખોલો અને અને ડીસ્લ્પેને રૂપાંતરિત કરતા.  
  
 
|-
 
|-
 
| 08:12
 
| 08:12
−
| આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો નિહાળો.
+
| આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો નિહાળો. [http://spoken-tutorial.org/What ttp://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial
−
[http://spoken-tutorial.org/What ttp://spoken-tutorial.org/What]_is_a_Spoken_ Tutorial
+
  
 
|-
 
|-

Latest revision as of 13:21, 28 February 2017

Time Narration
00:01 જેમોલ એપ્લીકેશનમાં Structures from Databases પરનાં આ ટ્યુટોરીયલમાં સ્વાગત છે.
00:07 આ ટ્યુટોરીયલમાં, આપણે આપેલ શીખીશું,
00:10 PubChem ડેટાબેસ થી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરવા અને
00:14 GChemPaint માં બનાવેલ 2D સ્ટ્રક્ચર ને Jmol માં 3D માં બદલતા.
00:21 આ ટ્યુટોરીયલનાં અનુસરણ માટે તમને Jmol Applicationનું જ્ઞાન હોવું અનિવાર્ય છે.
00:27 જો નથી, તો નીચે આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ સંદર્ભિત ટ્યુટોરીયલો નિહાળો.
00:33 આ ટ્યુટોરીયલ રેકોર્ડ કરવા માટે, હું વાપરી રહ્યી છું .
00:35 ઉબુન્ટુ લીનક્સ OS આવૃત્તિ. 12.04
00:40 Jmol આવૃત્તિ 12.2.2
00:44 Java આવૃત્તિ 7
00:46 GChemPaint આવૃત્તિ 0.12.10
00:51 Mozilla Firefox browser 22.0
00:56 મેં એક નવી જેમોલ એપ્લીકેશ વિન્ડો ખોલ્યું છે.
01:00 Jmol ડેટાબેસ યાદીબધ્ધ કંપાઉન્ડથી સ્ટ્રક્ચરને લોડ કરવાનું ફીચર ધરાવે છે.
01:07 મેનુ બાર પર ફાઈલ મેનુ 'Get MOL'. વિકલ્પ ધરાવે છે.
01:12 આ રાસાયણિક સ્ટ્રક્ચર ડેટાબેસ 'PubChem'. થી અણુ ને લોડ કરે છે.
01:17 આ Protein Data Bank થી સ્ટ્રક્ચરને લોડ કરવા માટે એક અન્ય વિકલ્પ 'Get PDB' રાખે છે.
01:26 આ વિષે વધુ જાણકારી બીજા અન્ય ટ્યુટોરીયલમાં સમજાવ્યું છે.
01:31 પેનલ પર રાસાયણિક સ્ટ્રક્ચર લોડ કરવા માટે 'Get Mol' પર ક્લિક કરો.
01:36 સ્ક્રીન પર 'Input' ડાઈલોગ બોક્સ ખુલે છે.
01:40 ડેટાબેસમાં યાદી બધ્ધ કોઈ પણ અણુ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં આપેલ ટાઈપ કરીને લોડ કરી શકાય છે :
01:48 કોમન નેમ અથવા IUPAC નેમ
01:51 CAS નંબર
01:54 CID નંબર
01:56 InChi identifier અથવા
01:58 SMILES identifier
02:01 એક ચોક્કસ કેમિકલ ના આઇડેન્ટિફિકેશન નંબરની જાણકારી માટે Pubchem ડેટાબેસની વેબસાઈટ પર જાઓ.
02:09 હવે સ્ક્રીન પર phenol દેખાય છે.
02:13 Input text box. તો ઈનપુટ ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 'phenol' .
02:16 OK બટન પર ક્લિક કરો.
02:20 phenol નું મોડલ પેનલ પર દેખાય છે.
02:24 આપણે વિવિધ રેન્ડરીંગ નો ઉપયોગ કરીને phenol ના દેખાવને બદલી શકીએ છીએ.
02:30 આ વિકલ્પ Menu bar અને Pop-up menu માં યાદી બધ્ધ કરેલ છે.
02:36 આપણે phenol' ના બેન્ઝીન રીંગમાં સ્બ્સીટ્યુઅન્ટસ ઉમેરી શકીએ છીએ.
02:41 પ્રથમ મોડલમાં પરમાણુને લેબલ કરે છે.
02:45 display મેનુ પર ક્લિક કરો, અને label પસંદ કરો. number વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
02:52 હવે કાર્બન પરમાણુ નંબર 4 થી જોડાયેલા હાઇડ્રોજન નંબર 10 ને અમીનો ગ્રુપ થી બદલો.
03:00 modelkit મેનુને ખોલો, વિકલ્પ માંથી nitrogen પસંદ કરો.
03:06 hydrogen number 10 પર ક્લિક કરો.
03:09 પેનલ પર આ Para-Amino Phenol નો અણુ છે.
03:14 આપણે ડિસ્પ્લેને Sticks display થી બદલશું.
03:18 modelkit મેનુ થી બહાર જાઓ.
03:21 પોપ અપ મેનુ ખોલો, સ્ક્રોલ કરી Style પર જાઓ, Scheme પસંદ કરો Sticks વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
03:30 પેનલ પર આપણી પાસે સ્ટીક ડિસ્પ્લેમેં Para-Amino-phenol નું મોડેલ છે.
03:36 કોમ્પ્લેક્સ સ્ટ્રક્ચર જેને બનાવવું મુશ્કિલ છે,પેનલ પર સરળતાથી લોડ કરી શકાય છે.
03:42 ઉદાહરણ તરીકે cholesterol.
03:45 File મેનુ પર ક્લિક કરો.
03:47 Get Mol વિકલ્પ પર ક્લિક કરો , ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો Cholesterol .
03:54 OK બટન પર ક્લિક કરો.
03:57 પેનલ પર Cholesterol નો અણુ દેખાય છે.
04:02 આપણે અણુ માં ફીચરો જેમકે double-bond અને side-chain ને હાઈલાઈટ કરી શકાય છે.
04:08 ડબલ -બોન્ડને હાઈલાઈટ કરવા માટે પ્રથમ ડબલ -બોન્ડના કાર્બન પરમાણુના રંગ ને બદલો.
04:15 ટૂલબાર માં 'Select atoms' આઇકન પર ક્લિક કરો.
04:19 પછી ડબલ-બોન્ડમાં સામેલ થયેલ carbon પરમાણુ પર ક્લિક કરો.
04:24 પરમાણુના ચારો તરફે પીળો હેલો દેખાય છે.
04:28 Pop-up-મેનુ ને ખોલો.
04:30 Color પર સ્કોલ કરો, Atoms પસંદ કરો અને Orange વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
04:37 હવે ટૂલબાર પર “Rotate molecule” વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
04:42 cholesterol મોડલમાં ડબલ-બોન્ડ હવે નારંગી રંગ માં છે.
04:49 તેજ રીતે આપણે સાઈડ ચેનમાં કાર્બનસ ને હાઈલાઈટ કરી શકીએ છીએ.
04:54 Pop-up-મેનુનો ઉપયોગ કરીને જાંબુડી માં બદલીએ.
04:59 પેનલ પર આપણી પાસે હાઈલાઈટ કરેલ મહત્વપૂર્ણ ફીચરો સાથે Cholesterol નો મોડલ છે.
05:06 અસાઇનમેન્ટ તરીકે,
05:08 ડેટાબેસ થી caffeine નું સ્ટ્રક્ચર લોડ કરો.
05:11 અણુમાં મહ્ત્વપૂર્ણ ફીચરોને હાઈલાઈટ કરો .
05:15 ડિસ્પ્લેને wireframe માં રૂપાંતરિત કરો.
05:19 હવે હું Jmol. ના અન્ય મ્હ્ત્વપૂર્ણ ફીચર વિષે બતાવીશ.
05:24 આપણે અણુઓ ના 2D સ્ટ્રક્ચરને અન્ય સોફ્ટવેરમાં 3D મોડલમાં બદલી શકીએ છીએ.
05:31 અહી પેનલ પર મારી પાસે aminoacid Alanine મોડેલ છે.
05:36 આ અણુ નો 2D સ્ટ્રક્ચર GChemPaint. નમક સોફ્ટવેરમાં બનાવ્યો છે.
05:42 સ્ટ્રક્ચરને .mol ફાઈલ તરીકે સેવ કરેલ છે.
05:46 GchemPaint એ 2D કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર બનાવવા માટે ઓપન સોર્સ સોફ્ટવેર છે .
05:51 GChemPaint પર ટ્યુટોરિયલ્સ આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ છે.
05:56 સ્ટ્રક્ચરને બનાવવા અને .મોલ ફોરમેટમાં સેવ કરવા માટે Analysis of Compounds ટ્યુટોરિયલ જુઓ.
06:05 આ Gchempaint પર ડિસ્પ્લે એરિયા 2D ડ્રોઈંગ બતાડ્યા પ્રમાણે છે.
06:10 Amino acid -Alanine
06:12 Nuclioside -Adenosine
06:14 Saccharide -Alpha-D glucopyranose
06:19 મેં આને .mol ફોરમેટમાં ડેસ્કટોપ પર સેવ કર્યું છે.
06:24 પ્રથમ Alanine ના 2D સ્ટ્રક્ચરને Jmol Application માં 3D મોડલમાં જોઈએ છીએ,
06:32 તો હું નવો Jmol વિન્ડો ખોલીશ.
06:36 ટૂલબારમાં Open a file' આઇકન પર ક્લિક કરો.
06:40 હું ડેસ્કટોપDesktop ફોલ્ડર પસંદ કરીશ અને open પર ક્લિક કરીશ.Alanine.mol ફાઈલ પસંદ કરો અને open પર ક્લિક કરો.
06:51 સ્ક્રીન પર 'Alanine' નું મોડલ દેખાય છે.
06:55 modelkit મેનુ ખોલો અને 'fix hydrogens and minimize' વિકલ્પ પર ક્લિક કરો.
07:03 સ્ટ્રક્ચર પર Hydrogens ઉમેર્યા છે અને એનર્જી મીનીમાઇઝ કરી છે.
07:08 .mol ફાઈલની જેમ,આપણે મેનુબાર અને પોપ-અપ મેનુનો પણ ઉપયોગ કરીને ડિસ્પ્લે બદલી શકીએ છીએ.
07:15 અહી Jmol. માં Adenosine.mol નું 3D મોડલ છે.
07:19 અને આ Jmol. માં Alpha-D-glucopyranose.mol નું 3D મોડલ છે.
07:25 ચાલો સારાંશ લઈએ.
07:27 આ ટ્યુટોરીયલ માં આપણે શીખ્યા
07:32 Pubchem ડેટા બેસથી કેમિકલ સ્ટ્રક્ચર લોડ કરતા.
07:34 Phenol અને Cholesterol ના ડિસ્પ્લે રૂપાંતરણ કરતા.
07:38 GChemPaint માં બનેલ 2D સ્ટ્રક્ચરને જેમોલમાં 3D મોડલ્સમાં બદલતા.
07:44 Alanine, Adenosine અને Alpha-D-glucopyranose ના 2D સ્ટ્રક્ચરને 3D મોડેલ્સમાં બદલતા.
07:53 અહી હજુ એક અસાઇનમેન્ટ છે.
07:56 GChemPaint. માં આપેલ Amino acids ના 2D સ્ટ્રક્ચર બનાવો.
08:01 Cysteine
08:03 Histidine , Phenylalanine
08:06 .mol ફાઈલ તરીકે સેવ કરો.
08:09 Jmol ફાઈલ ખોલો અને અને ડીસ્લ્પેને રૂપાંતરિત કરતા.
08:12 આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ વિડીયો નિહાળો. ttp://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_ Tutorial
08:16 તે સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે.
08:19 જો તમારી પાસે સારી બેન્ડવિડ્થ ન હોય તો, તમે વિડીયો ડાઉનલોડ કરીને જોઈ શકો છો.
08:23 સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટ ટીમ:
08:26 સ્પોકન ટ્યુટોરીયલોનાં ઉપયોગથી વર્કશોપોનું આયોજન કરે છે.
08:29 જેઓ ઓનલાઈન પરીક્ષા પાસ કરે છે તેઓને પ્રમાણપત્રો આપે છે.
08:33 વધુ વિગતો માટે, કૃપા કરી, contact@spoken-tutorial.org પર લખો.
08:40 સ્પોકન ટ્યુટોરીયલ પ્રોજેક્ટ ટોક ટુ અ ટીચર પ્રોજેક્ટનો એક ભાગ છે.
08:45 જેને આઈસીટી, એમએચઆરડી, ભારત સરકાર મારફતે શિક્ષણ પર નેશનલ મિશન દ્વારા આધાર અપાયેલ છે.
08:52 આ મિશન પર વધુ માહિતી આપેલ લીંક પર ઉપલબ્ધ છે. http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro ]
08:57 IIT Bombay તરફથી હું, જ્યોતી સોલંકી વિદાય લઉં છું. જોડાવાબદ્દલ આભાર.

Contributors and Content Editors

Jyotisolanki, PoojaMoolya

Retrieved from "https://script.spoken-tutorial.org/index.php?title=Jmol-Application/C3/Structures-from-Database/Gujarati&oldid=31842"