View source for Biopython/C2/Parsing-Data/Assamese

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
{| Border=1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
|Parsing Data এৰ টিউটোৰিয়েলত আপোনাক স্বাগতম।

|-
| 00:06
| ইয়াতে শিকিম NCBI ডাটাবেস ওয়েবসাইটৰ পৰা FASTA আৰু GenBank ফাইল ডাউনলোড কৰা আৰু

|-
| 00:14
| Sequence Input/Output মডিউলত ফাংশনৰ দ্বাৰা ডেটা ফাইল Parse কৰা।

|-
| 00:19
| টিউটোৰিয়েলটো অনুসৰণ কৰিবলৈ অস্নাতকৰ বায়োকেমিস্ট্ৰ বা বায়োইনফৰমেটিক্স

|-
| 00:26
| আৰু মৌলিক Python প্ৰোগ্ৰামিং সম্পর্কে জানোব লাগিব। 

|-
| 00:30
| প্ৰদত্ত লিঙ্কত Python টিউটোৰিয়েল চাওক।

|-
| 00:34
| টিউটোৰিয়েলটো ৰেকর্ড কৰিবলৈ ব্যবহাৰ কৰিছো: উবুন্টু OS সংস্কৰণ 14.10

|-
| 00:40
| Python সংস্কৰণ 2.7.8

|-
| 00:44
| Ipython interpretor সংস্কৰণ 2.3.0

|-
| 00:48
|Biopython সংস্কৰণ 1.64 আৰু Mozilla Firefox ব্ৰাউজাৰ 35.0.

|-
| 00:56
| বায়োলজিত বৈজ্ঞানিক তথ্য সাধাৰণতে টেক্সট ফাইল যেনে FASTA, GenBank, Swiss-Prot, EMBL ইত্যাদিত সংৰক্ষিত হয়।

|-
| 01:07
|ডেটা ফাইল ডাটাবেস ওয়েবসাইটৰ পৰা ডাউনলোড কৰা যাব পাৰে।

|-
| 01:12
|যি কোনো ওয়েব ব্ৰাউজাৰত, তলত দিয়া ওয়েবসাইটৰ লিঙ্কটো খুলক।

|-
| 01:17
| এটা ওয়েব পৃষ্ঠা খোলে।
|-
| 01:19
|এতিয়া মানুহৰ insulin gene এৰ বাবে FASTA আৰু GenBank ফাইল ডাউনলোড কৰো।

|-
| 01:25
|সার্চ বাক্সত লিখক: human insulin, Search বোতামত ক্লিক কৰক।

|-
| 01:31
| ওয়েব পৃষ্ঠা মানুহৰ insulin gene এৰ অনেক ফাইল দেখায়।

|-
| 01:35
| প্ৰদর্শন কৰিবলৈ মই Homo sapiens Insulin mRNA নামৰ 4টা ফাইল চয়ন কৰিম।

|-
| 01:43
|মই 500 এৰ কম বেস পেয়ার্স ৰাখা ফাইলবোৰ চয়ন কৰিম।

|-
| 01:48
|ডাউনলোডৰ বাবে ফাইল চয়ন কৰিবলৈ চেক-বাক্সত ক্লিক কৰক।

|-
| 01:56
| কার্সাৰ Send to বিকল্পত লৈ যাওক যি পৃষ্ঠাৰ উপৰৰ সোফালে আছে।

|-
| 02:02
|ডাউন এৰোৰ সৈতে সৰু চয়নিত বোতামত ক্লিক কৰক যি Send To বোতামৰ উচৰত আছে।

|-
| 02:09
| Choose destinationত, File বিকল্পত ক্লিক কৰক।
|-
| 02:13
|আপোনি এই ফাইলক যি কোনো ফাইল ফৰম্যাটত সংৰক্ষণ কৰিব পাৰে, যি format ড্ৰপ-ডাউন তালিকা বাক্সত সূচীবদ্ধ।

|-
| 02:21
|প্ৰদত্ত বিকল্প পৰা FASTA চয়ন কৰক।

|-
| 02:25
|তাৰপিছত Create File বিকল্পত ক্লিক কৰক।

|-
| 02:29
| স্ক্ৰীনত এটা ডায়ালগ বাক্স দেখায়।

|-
|02:32 
|Open with চয়ন কৰক, OK ত লিক কৰক।

|-
| 02:36
| টেক্সট এডিটৰত এটা ফাইল খোলে।

|-
| 02:39
|ফাইলটোৱে 4টা ৰেকর্ড দেখায়, কাৰণ ডাউনলোড কৰিবলৈ মই চাৰিটা ফাইল চয়ন কৰিছো।

|-
| 02:46
|প্ৰত্যেক ৰেকর্ডৰ প্ৰথম লাইন হল identifier লাইন।

|-
| 02:50
|এইটোৱে (>) চিহ্ন দি আৰম্ভ কৰে।

|-
| 02:53
|ইয়াৰ পিছত sequence আছে।

|-
| 02:56
|ফাইলটো হোম ফোল্ডাৰত sequence.fasta হিসাবে সংৰক্ষণ কৰক।

|-
| 03:01
| টেক্সট এডিটৰ বন্ধ কৰক।

|-
| 03:03
| পূর্বে চয়নিত একেই ফাইলসৰ বাবে GenBank ফৰম্যাটত ফাইল ডাউনলোড কৰিবলৈ উপৰৰ মতে ধাপবোৰ অনুসৰণ কৰক।

|-
| 03:12
|file format ত GenBank চয়ন কৰক।

|-
| 03:16
|এটা ফাইল বনাওক। টেক্সট এডিটৰৰ সৈতে খুলক। 

|-
| 03:21
| লক্ষ্য কৰক GenBank ফৰম্যাটত থকা সিকোয়েন্স ফাইলটোত FASTA ফাইলৰ তুলনাত অধিক বৈশিষ্ট্য আছে। 

|-
| 03:27
|ফাইলটোক home ফোল্ডাৰত sequence.gb হিসাবে সংৰক্ষণ কৰক। টেক্সট এডিটৰক বন্ধ কৰক।

|-
| 03:34
| প্ৰদর্শন কৰিবলৈ একক ৰেকর্ড সহ এটা FASTA ফাইলৰ প্ৰয়োজন।

|-
| 03:39
| ইয়াৰ বাবে চেক বাক্সত আকৌ এবাৰ ক্লিক কৰি আগৰ চয়নটো মুছি পেলাওক।
|-
| 03:48
|এতিয়া Human insulin gene complete cds ফাইলটো চয়ন কৰক।

|-
| 03:54
|চেক-বক্সে ক্লিক কৰক।

|-
| 03:57
| home ফোল্ডাৰত ফাইল সংৰক্ষণ কৰিলবৈ আগেই দেখোৱা একেই ধাপ অনুসৰণ কৰক।

|-
| 04:01
|ফাইলটো insulin.fasta হিসাবে সংৰক্ষণ কৰক।

|-
| 04:08
| এই ফাইলত সংৰক্ষিত বায়োলজিকাল ডেটা Biopython লাইব্ৰৰীৰ মাধ্যমেৰে এক্সট্র্যাক্ট আৰু সংশোধন কৰা যাব পাৰে।

|-
| 04:16
|টেক্সট এডিটৰ বন্ধ কৰক।

|-
| 04:19
| ডেটা ফাইলৰ পৰা ডেটা এক্সট্র্যাক্ট কৰাক Parsing বোলে।

|-
| 04:23
|অধিকতৰ ফাইল ফৰম্যাট SeqIO মডিউলত উপলব্ধ ফাংশন দ্বাৰা পার্স কৰা যায়।

|-
| 04:30
|SeqIO মডিউলৰ অধিকতৰ ব্যবহৃত ফাংশন হল: parse, read, write আৰু convert

|-
| 04:38
| Ctrl, Alt আৰু T কী একেসৈতে টিপি টার্মিনেল খুলক।

|-
| 04:44
| প্ৰম্পটত ipython লিখি Ipython আৰম্ভ কৰক। এন্টাৰ টিপক।

|-
| 04:51
| ইয়াৰ পিছত, Bio প্যাকেজৰ পৰা SeqIO মডিউল ইম্পোর্ট কৰক।

|-
| 04:56
| প্ৰম্পটত লিখক: from Bio import SeqIO, এন্টাৰ টিপক।

|-
| 05:04
| মই সবতচে গুৰুত্বপূর্ণ ফাংশন parse দিয়ে আৰম্ভ কৰিম।

|-
|05:07
|প্ৰদর্শন কৰিবলৈ মই সেই FASTA ফাইল ব্যবহাৰ কৰিম যত অনেক ৰেকর্ড আছে যাক ডেটাবেসৰ পৰা আগেই ডাউনলোড কৰিছো।

|-
| 05:17
| সহজ FASTA পার্সিংয়ৰ বাবে প্ৰম্পটত নিম্ন লিখক।

|-
| 05:22
|ইয়াতে sequence.fasta ফাইলৰ বিষয় বস্তু পড়িবলৈ parse ফাংশন ব্যবহাৰ কৰিছো।

|-
| 05:30
|আউটপুটৰ বাবে record id, ৰেকর্ডত উপস্থিত সিকোয়েন্স আৰু সিকোয়েন্সৰ দৈর্ঘ্য প্ৰিন্ট কৰে।
|-
| 05:41
|আৰু লক্ষ্য কৰক যে, সিকোয়েন্স ডেটাক Sequence record objects হিসাবে পড়িবলৈ parse ফাংশন ব্যবহৃত হয়।

|-
| 05:48
|এইটো সাধাৰণতে for লুপৰ বাবে ব্যবহৃত হয়।

|-
| 05:52
|এইটোৱে দুটা আর্গুমেন্ট গ্ৰহণ কৰিব পাৰে, প্ৰথমটো হল ডেটা পড়িবলৈ ফাইলৰ নাম।

|-
| 05:59
|দ্বিতীয়টোৱে ফাইল ফৰম্যাট নির্দিষ্ট কৰে।

|-
| 06:02
|আউটপুট পাবলৈ এন্টাৰ কী দুইবাৰ টিপক।

|-
| 06:07
|আউটপুটে identifier line এৰ পিছত ফাইলত অন্তর্ভুক্ত সিকোয়েন্স আৰু ফাইলত সকলো ৰেকর্ডৰ বাবে সিকোয়েন্স দৈর্ঘ্যও দেখায়।

|-
| 06:21
|লক্ষ্য কৰক যে FASTA ফৰম্যাটে অাখৰ নির্দিষ্ট নকৰে। 

|-
| 06:26
|সেয়ে আউটপুটে এইটোক DNA সিকোয়েন্স হিসাবে নির্দিষ্ট নকৰে।

|-
| 06:31
| একেই ধাপবোৰ GenBank ফাইল পার্সিং কৰিবলৈ পুনৰাবৃত্তি কৰা যায়।

|-
| 06:36
|প্ৰদর্শন কৰিবলৈ GenBank ফাইল ব্যবহাৰ কৰিম যাক আগেই ডাটাবেসৰ পৰা ডাউনলোড কৰিছো।

|-
| 06:43
|কোডৰ লাইন যাক আগেই ব্যবহাৰ কৰিছিলো তাক পাবলৈ আপ এৰো কী টিপক।

|-
| 06:49
|ফাইলৰ নাম সলায় sequence.gb কৰক।
|-
| 06:53
|ফাইল ফৰম্যাটক genbank কৰক।

|-
| 06:56
|বাকি কোডক একেই ৰাখক। 

|-
| 06:58
| আউটপুট পাবলৈ এন্টাৰ কী দুইবাৰ টিপক।

|-
| 07:03
|ইয়াতেও আউটপুটত, ফাইলত থকা সকলো ৰেকর্ডৰ বাবে record id, sequence আৰু সিকোয়েন্স এৰ দৈর্ঘ্য দেখায়।

|-
| 07:12
| লক্ষ্য কৰক যে GenBank ফৰম্যাটে সিকোয়েন্সক DNA সিকোয়েন্সৰ মতে নির্দিষ্ট কৰে।

|-
| 07:19
| একেইভাবে, Swiss-prot আৰু EMBL ফাইলক উপৰৰ নিচিনা একেই কোড ব্যবহাৰ কৰি পার্স কৰা যায়।

|-
| 07:27
| আপোনাৰ ফাইলত একক ৰেকর্ড থাকিলে parsing এৰ বাবে নিম্নোক্ত কোড লিখক।

|-
| 07:34
| ইয়াতে, মই একক ৰেকর্ড সহ পূর্বে সংৰক্ষিত FASTA ফাইল ব্যবহাৰ কৰিম, উদাহৰণস্বৰুপে insulin.fasta.

|-
| 07:43
| লক্ষ্য কৰক মই parse ফাংশনৰ সলনি read ফাংশন ব্যবহাৰ কৰিছো। এন্টাৰ টিপক।

|-
| 07:50
| আউটপুটে insulin.fasta ফাইলৰ বাবে কন্টেন্ট দেখায়।

|-
| 07:55
|এইটোৱে sequence record object এৰ মতে সিকোয়েন্স দেখায়

|-
| 07:59
|আৰু অন্যান্য এট্ৰিবিউট যেনে GI, accession number আৰু description দেখায়।

|-
| 08:06
| মই নিম্নৰ মতে এই ৰেকর্ডৰ স্বতন্ত্র এট্ৰিবিউট দেখিব পাৰো।

|-
| 08:11
|প্ৰম্পটত লিখক: record dot seq এন্টাৰ টিপক।

|-
| 08:18
| আউটপুটে ফাইলত উপস্থিত সিকোয়েন্স দেখায়।

|-
| 08:22
| এই ৰেকর্ডৰ বাবে আইডেন্টিফায়ার্স চাবলৈ লিখক: record dot id এন্টাৰ টিপক।

|-
| 08:29
|আউটপুটে GI নম্বৰ আৰু এক্সেশন নম্বৰ ইত্যাদি দেখায়।

|-
| 08:34
|আপোনি পছন্দৰ ডেটা ফাইল parse কৰিবলৈ উপৰত বর্ণিত ফাংশন ব্যবহাৰ কৰিব পাৰে।

|-
| 08:40
| এতিয়া, সংক্ষিপ্তকৰণ কৰো।

|-
| 08:42
|ইয়াতে NCBI ডেটাবেস ওয়েবসাইটৰ পৰা FASTA আৰু GenBank ফাইল ডাউনলোড কৰা আৰু SeqIO মডিউলৰ পৰা parse আৰু read ফাংশন ব্যবহাৰ কৰা শিকিছো।

|-
| 08:55
| FASTA আৰু GenBank ফাইলৰ পৰা ডেটা যেনে record ids, ডিস্ক্রিপশন আৰু সিকোয়েন্স এক্সট্র্যাক্ট কৰা।
|-
| 09:03
| অনুশীলনী হিসাবে-

|-
| 09:06
|NCBI ডেটাবেসৰ পৰা পছন্দৰ নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সৰ বাবে FASTA ফাইল ডাউনলোড কৰক।

|-
| 09:13
|সিকোয়েন্সৰ ফাইলক তাৰ reverse complements ত সলাওক।

|-
| 09:17
| আপোনাৰ সম্পন্ন কামটোৰ কোডত নিম্নোক্ত লাইন থাকিব লাগে।

|-
| 09:22
| FASTA ফাইলৰ পৰা নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স লোড কৰিবলৈ parse ফাংশন ব্যবহাৰ কৰক।

|-
| 09:28
|ইয়াৰ পিছত, reverse complement মেথডত নির্মিত সিকোয়েন্স অবজেক্টৰ দ্বাৰা ৰিভার্স কমপ্লিমেন্ট প্ৰিন্ট  কৰক।

|-
| 09:37
| এই লিঙ্কত উপলব্ধ ভিডিওটোৱে প্ৰকল্পক সাৰসংক্ষেপে বোঝায়।

|-
| 09:42
|এইটোক ডাউনলোড কৰি চাওক। 

|-
| 09:44
| স্পোকেন টিউটোৰিয়েল প্ৰকল্প দলে কর্মশালাৰ আয়োজন কৰে আৰু অনলাইন পৰীক্ষা পাস কৰিলে প্ৰশংসাপত্ৰ দিয়ে।

|-
| 09:51
|অধিক জানিবলৈ আমালৈ যোগাযোগ কৰক।

|-
| 09:55
| স্পোকেন টিউটোৰিয়েল প্ৰকল্প ভাৰত সৰকাৰৰ NMEICT, MHRD দ্বাৰা সমর্থিত।

|-
| 10:01
| এই বিষয়ত বিস্তাৰিত তথ্য এই লিঙ্কত প্ৰাপ্তিসাধ্য।

|-
| 10:06
|আইআইটি বোম্বেৰ পৰা মই বিদায় লৈছো। অংশগ্ৰহণৰ বাবে ধন্যবাদ। 

|}