View source for Jmol-Application/C3/Proteins-and-Macromolecules/Tamil

{| border=1
|'''Time'''
| '''Narration'''

|-
| 00:01
| '''புரதங்கள் மற்றும் பெருமூலக்கூறுகள் (Macromolecules)''' குறித்த ஸ்போகன் டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
| 00:06
| இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கபோவது

|-
|00:09
|*  '''Protein Data Bank (PDB)''' லிருந்து புரதங்களின் அமைப்புகளை ஏற்றுதல்

|-
|00:13
|* '''PDB''' தரவுத்தளத்தில் இருந்து '''.pdb '''fileகளை தரவிறக்குதல்

|-
|00:18
|* புரதங்களின் இரண்டாம் அமைப்பை பல்வேறு  formatகளில் காட்டுதல்

|-
|00:24
|*  '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள் ''' மற்றும் '''டைசல்பைடு பிணைப்புகளை''' முன்னிலைப்படுத்துதல். 

|-
|00:29
| இந்த டுடோரியலை தொடர  '''Jmol அப்ளிகேஷன் விண்டோவில்''' அடிப்படை செயல்பாடுகள் பற்றி தெரிந்திருக்க வேண்டும்.

|-
|00:37
|இல்லையெனில் அதற்கான டுடோரியல்களுக்கு எங்கள் வலைத்தளத்தைக் காணவும்.

|-
| 00:42
| இந்த டுடோரியலை பதிவு செய்ய நான் பயன்படுத்துவது

|-
| 00:46
| *  '''உபுண்டு''' இயங்குதளம் பதிப்பு. 12.04

|-
|00:50
|* '''Jmol''' பதிப்பு 12.2.2

|-
|00:54
|* '''Java''' பதிப்பு 7 

|-
|00:57
| * '''மொசில்லா ஃபயர்பாக்ஸ் ''' ப்ரெளசர் 22.0.

|-
| 01:02
|பின்வருவனபோன்ற பெரிய  '''உயிர்மூலக்கூறுகளின் (biomolecules)''' அமைப்பு பகுப்பாய்வை '''Jmol அப்ளிகேஷனை''' பயன்படுத்தி செய்ய முடியும்

|-
|01:06
|* '''புரதங்கள் ''' மற்றும் '''பெருமூலக்கூறுகள்'''

|-
|01:10
|* '''நியூக்ளிக் அமிலங்கள், DNA''' மற்றும் '''RNA'''

|-
|01:13
|* '''படிக அமைப்புகள் (Crystal structures) மற்றும் பல்லுறுப்பிகள் (polymers)''' . 

|-
| 01:19
|ஒரு புதிய '''Jmol''' விண்டோவை திறந்துவைத்துள்ளேன்.

|-
| 01:24
|தரவுத்தளத்திலிருந்து நேரடி தரவிறக்கம் மூலம்  '''உயிர்மூலக்கூறுகளின்''' முப்பரிமாண அமைப்புகளை காணமுடியும். 

|-
| 01:29
| அதைசெய்ய,  '''File '''menu மீது க்ளிக் செய்து, ''' Get PDB''' க்கு வரவும்

|-
|  01:36
|திரையில் ஒரு  input dialog box தோன்றுகிறது. 

|-
| 01:40
|குறிப்பிட்ட புரதத்தின் நான்கு இலக்க '''PDB code''' ஐ  input box ல் டைப் செய்ய வேண்டும். 

|-
| 01:48
|இந்த code ஐ  '''Protein Data Bank (PDB) '''இணையத்தளத்தில்'''''' இருந்து பெற முடியும்

|-
|  01:53
|இது '''Protein Data Bank''' ன் இணையதளம் ஆகும்

|-
|  01:57
| '''புரதங்கள்''' மற்றும் '''நியூக்ளிக் அமிலங்கள்''' போன்ற உயிர்மூலக்கூறுகளின் தகவல்களை கொண்டுள்ளது

|-
| 02:04
|உதாரணமாக: '''PDB ''' தளத்திலிருந்து '''கணைய என்சைம் இன்சுலின் (Pancreatic Enzyme Insulin) ''' க்கான '''PDB code ''' ஐ பெற முயற்சிப்போம்.

|-
|02:13
|  search box ல் புரதத்தின் பெயரை '''Human''' '''Insulin''' என டைப் செய்து விசைப்பலகையில்  Enter விசையை அழுத்துக.

|-
| 02:24
| இப்போது தோன்றும் இணையப்பக்கத்தில் கீழே வரவும்.

|-
| 02:28
|  அறியப்பட்ட '''Human Insulin''' அமைப்புகளின் பட்டியல்  '''PDB code ''' களுடன் திரையில் தோன்றுகிறது.

|-
| 02:36
| உதாரணமாக, code '''4EX1''' உடன் உள்ள ''' Human Insulin''' ஐ தேர்ந்தெடுப்போம்

|-
|  02:44
|புரதத்தின் பெயர் மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 02:47
| அந்த அமைப்பின் அனைத்து தகவல்களுடன் ஒரு விண்டோ திறக்கிறது.

|-
| 02:52
| அந்த தகவல்களாவன

|-
| 02:54
|* '''Primary Citation'''

|-
| 02:56
|* '''Molecular Description ''' மற்றும்

|-
|02:58
|* '''Structure Validation''' ஆகியவை இந்த பக்கத்தில் உள்ளன.

|-
| 03:02
| புரதங்களின் அமைப்புகளை '''.pdb '''fileகளாக சேமித்து அவற்றை  '''Jmol''' ல்  முப்பரிமாண அமைப்பில் காண முடியும்

|-
|  03:12
|  பக்கத்தின் மேல் வலது மூலையில் உள்ள '''Download Files''' இணைப்பு மீது க்ளிக் செய்க. 

|-
| 03:20
| கீழிறங்கு பட்டியலில்,  '''PDB file (gz) ''' தேர்வை ''' ''' தேர்ந்தெடுக்கவும்

|-
| 03:28
|திரையில் ஒரு  dialog box திறக்கிறது. 

|-
|  03:32
| '''Save file''' தேர்வை தேர்ந்தெடுக்கவும். 

|-
|03:35
|'''OK''' பட்டன் மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 03:39
| புரத அமைப்பு '''Downloads '''folder ல் '''4EX1.pdb.gz''' ஆக சேமிக்கப்படும்.

|-
|  03:51
| அதேபோல, பல்வேறு புரதங்களின் தேவையான  '''.pdb '''fileகளை தரவிறக்கி அவற்றை தனித்தனி fileகளில் சேமிக்கலாம். 

|-
| 04:02
| இப்போது '''இன்சுலின்''' முப்பரிமாண அமைப்பை காண  '''Jmol''' விண்டோவுக்கு வருவோம்.

|-
|04:09 
| உங்களிடம் இணைய இணைப்பு இருந்தால் புரத அமைப்பை Jmol panel ல் நேரடியாக தரவிறக்க முடியும்.

|-
|  04:15
| நான்கு இலக்க '''PDB code “4EX1” '''  ஐ உரைப்பெட்டியில் டைப் செய்து '''OK''' பட்டன் மீது க்ளிக் செய்க. 

|-
| 04:25
|உங்களிடம் இணைய இணைப்பு இல்லையெனில்,  tool bar ல் உள்ள '''Open a File''' ஐகான் மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 04:34
| panel ல் dialog box திறக்கிறது.

|-
|  04:38
| '''4EX1.pdb.gz''' file உள்ள இடம் அதாவது '''Downloads '''folder க்கு செல்க.

|-
|  04:47
| '''Downloads''' folder ஐ தேர்ந்தெடுத்து '''open ''' பட்டன் மீது க்ளிக் செய்க. 

|-
|  04:52
| '''4EX1.pdb.gz''' file ஐ தேர்ந்தெடுத்து '''open''' பட்டன் மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 05:00
| திரையில் இன்சுலின் முப்பரிமாண அமைப்பு திறக்கிறது.

|-
| 05:05
| panel ல் புரதத்தின் முன்னிருப்பு  display,  '''ball and stick''' ஆகும்

|-
| 05:12
|panel ல்  புரத்தின் மாதிரி  ஹைட்ரஜன் அணுக்கள் இல்லாமல் காட்டப்படுகிறது.

|-
| 05:17
| ஹைட்ரஜன் அணுக்களுடன் மாதிரியைக் காட்ட '''modelkit''' menu ஐ திறக்கவும்.

|-
|  05:23
| '''add hydrogens''' தேர்வுக்கு வந்து அதன் மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 05:28
| இப்போது ஹைட்ரஜன் அணுக்களுடன் இந்த  மாதிரி panel ல் காட்டப்படுகிறது.

|-
| 05:33
| நீர் மூலக்கூறுகளுடன் புரத அமைப்பும் காட்டப்படுகிறது.

|-
| 05:38
| நீர் மூலக்கூறுகளை மறைக்க , காட்டப்படும் படிகளை பின்பற்றவும்.

|-
| 05:43
| முதலில் pop-up menu ஐ திறந்து பின் '''Select''' க்கு செல்க

|-
| 05:48
| துணை-menu ல், '''Hetero''' ஐ தேர்ந்தெடுத்து  '''“All Water''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 05:55
| மீண்டும் pop-up menu ஐ திறந்து '''Style''' க்கு சென்று, '''Scheme ''' ல்  '''CPK spacefill ''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 06:05
|இது அனைத்து நீர் மூலக்கூறுகளையும் '''CPK Spacefill '''display ஆக மாற்றும்.

|-
| 06:11 
| மீண்டும் pop-up menu ஐ திறந்து '''Style''' க்கு சென்று '''Atoms ''' ல் '''Off ''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 06:22
| இப்போது panel ல் நீர் மூலக்கூறுகள் ஏதும் இல்லாமல் '''இன்சுலின்''' அமைப்பை கொண்டுள்ளோம்.

|-
| 06:27
| இப்போது, பல்வேறு  formatகளில் புரதத்தின் இரண்டாம் அமைப்பை  காட்ட கற்போம்.

|-
|  06:35
|pop-up menu ஐ திறக்கவும். 

|-
| 06:37
|'''Select ''' தேர்வுக்கு சென்று. 

|-
| 06:39
|  '''Protein ''' ல் ''' All ''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 06:44
|pop-up menu ஐ மீண்டும் திறந்து  '''Style ''' ல் '' Scheme ''' க்கு வரவும்

|-
|  06:50
|பின்வரும் தேர்வுகளுடன் ஒரு துணை-menu திறக்கிறது '''CPK Spacefill''', '''Ball and Stick, Sticks, Wireframe, cartoon, trace, மேலும் பல '''

|-
|07:02  
|துணை-menu ல் ''' Cartoon ''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
|07:07
| புரதங்களின் இரண்டாம் அமைப்புகளை  '''திருகுகள், சீரற்ற சுருள்கள், இழைகள், தாள்கள் ''' போன்றவைகளாக இந்த  display காட்டுகிறது.

|-
| 07:17
| மேலும் display தேர்வுகளுக்கு,

|-
| 07:19
| pop-up menu ஐ திறந்து  '''Style''' க்கு சென்று பின்  ''' Structures''' செல்க.

|-
| 07:25
| இங்கே புரதத்தின் இரண்டாம் அமைப்பை  காட்ட பல தேர்வுகள் உள்ளன.

|-
| 07:31
| உதாரணமாக '''Strands''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 07:35
| புரதம் இப்போது  '''இழைகளாக''' panel ல் காட்டப்படுகிறது.

|-
| 07:40
| display ன் நிறத்தை மாற்ற,  Pop-up-menu ஐ திறக்கவும்.  '''Color''' க்கு வந்து  '''Atoms''' ஐ தேர்ந்தெடுத்து  '''Blue''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 07:52
| panel ல் நிற மாற்றத்தை கவனிக்கவும்.

|-
| 07:56
| '''Ball-and-stick''' display க்கு அமைப்பை மீண்டும் மாற்ற,

|-
| 07:59
|  pop-up menu ஐ திறந்து,  '''Style''' ஐ தேர்ந்தெடுத்து பின், '''Scheme''' ல் '''Ball and stick ''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 08:08
| இந்த புரத மாதிரியில்  '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள் ''' மற்றும் '''டை-சல்பைடு( di-sulpfide) பிணைப்புகளை''' முன்னிலைப்படுத்தவும் முடியும்.

|-
| 08:14
| '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளை''' காட்ட:  pop-up menu ஐ திறந்து '''Style''' க்கு சென்று பின்  '''Hydrogen Bonds''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
|08:25 
| Pop-up menu ல் '''Hydrogen Bonds''' தேர்வு பின்வரும் அம்சங்களை கொண்டுள்ளது:

|-
|08:30
|'''Calculate''', '''Set Hydrogen Bonds Side Chain.'''

|-
|08:35
|'''Set Hydrogen Bonds  Backbone.'''
மேலும் பிணைப்புகளின் தடிமனை மாற்ற தேர்வுகளும் உள்ளன.

|-
| 08:42
| மாதிரியில்  '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளை''' காட்ட  '''Calculate''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
|  08:47
| '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள்''' வெள்ளை சிவப்பு கோடுகளாக காட்டப்படுகின்றன.

|-
| 08:53
|  '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளின்''' தடிமனை மாற்ற, ''' pop-up-menu''' ல் ''' 0.10 Angstrom ''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
|  09:02
|இப்போது  panel ல் தடிமனான ''' ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளைக் ''' காணலாம். 

|-
|09:06
| ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளின் நிறத்தை மாற்றவும் முடியும். 

|-
| 09:11
|  Pop-up-menu ல்  '''Color''' க்கு வந்து பின் '''Hydrogen Bonds'''  ல் '''orange''' தேர்வு மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 09:20
| panel ல், அனைத்து  '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளையும்''' ஆரஞ்ச் நிறத்தில் கொண்டுள்ளோம்.

|-
| 09:25
| மாதிரியில்  '''டைசல்பைடு''' பிணைப்புகள், மற்றும் சல்பர் (sulphur) அணுக்கள்  மஞ்சள் நிறத்தில் காட்டப்படுகின்றன.

|-
|09:31
| டைசல்பைடு பிணைப்புகளை மாற்ற  pop menu ல் disulfide bonds தேர்வை திறக்கவும்

|-
| 09:38
| நீங்கள் மாற்ற விரும்பும் அம்சங்களான அளவு, நிறம் போன்றவற்றின் மீது க்ளிக் செய்க.

|-
| 09:44
| அதேபோல வெவ்வேறு '''என்சைம் (enzyme)''' களின் '''.pdb '''fileகளை திறந்து அவற்றின் முப்பரிமாண அமைப்புகளை காண முயற்சிக்கவும்.

|-
|09:51
| சுருங்கசொல்ல. இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது

|-
|09:57
|* Protein Data Bank (PDB) லிருந்து புரத அமைப்புகளை ஏற்றுதல்

|-
|10:00
|* தரவுத்தளத்திலிருந்து  '''.pdb''' fileகளை தரவிறக்குதல்

|-
|10:05
|*  '''PDB code'''  ஐ பயன்படுத்தி இன்சுலினின் முப்பரிமாண அமைப்பை காணுதல்

|-
|10:10
|* நீர் மூலக்கூறுகள் இல்லாமல்  '''புரத''' அமைப்பை காணுதல்

|-
|10:14
|* வெவ்வேறு formatகளில் இரண்டாம் அமைப்பை காட்டுதல்

|-
|10:17
|*  '''ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள்''' மற்றும் '''டைசல்பைடு பிணைப்புகளை''' முன்னிலைப்படுத்துதல்.

|-
|10:22
| இங்கே உங்களுக்கான பயிற்சி.

|-
|10:24
|* '''PDB ''' தரவுத்தளத்திலிருந்து  '''Human Hemoglobin'''  ன் '''.pdb''' file ஐ தரவிறக்குக 

|-
|10:31
|*  '''cartoon '''display ல் இரண்டாம் அமைப்பை காட்டுக

|-
|10:35
|* புரதத்தின் “'''porphyrin'''” unitகளை முன்னிலைப்படுத்தவும்

|-
|10:39
|* '''PDB code''' க்கு பின்வரும் இணைப்பைக் காணவும்

|-
| 10:42
||இந்த இணைப்பில் உள்ள காணொளியைக் காணவும்
 http://spoken-tutorial.org/What_is_a_Spoken_Tutorial

|-
|10:46
||இது ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டம் பற்றி சுருங்க சொல்கிறது

|-
|10:50
||உங்கள் இணைய இணைப்பு வேகமாக இல்லையெனில் அதை தரவிறக்கிக் காணவும்

|-
| 10:55
||ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டக்குழு ஸ்போகன் டுடோரியல்களைப் பயன்படுத்தி செய்முறை வகுப்புகள் நடத்துகிறது

|-
|11:01
||இணையத்தில் பரீட்சை எழுதி தேர்வோருக்கு சான்றிதழ்களும் அளிக்கிறது.

|-
|11:06
||மேலும் தகவல்களுக்கு contact@spoken-tutorial.org க்கு மின்னஞ்சல் எழுதவும். 

|-
| 11:13
||ஸ்போகன் டுடோரியல் பாடங்கள் டாக் டு எ டீச்சர் திட்டத்தின் முனைப்பாகும்.

|-
|11:18
||இதற்கு ஆதரவு இந்திய அரசு துவக்கிய MHRD இன் ஐசிடி மூலம் தேசிய கல்வித்திட்டத்தின் வழியே கிடைக்கிறது. 

|-
|11:25
|இந்த திட்டம் பற்றிய மேலதிக தகவல்கள் கீழுள்ள இணைப்பில் கிடைக்கும்  http://spoken-tutorial.org/NMEICT-Intro

|-
|11:31
|இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்து குரல் கொடுத்தது ஐஐடி பாம்பேவில் இருந்து பிரியா. நன்றி.       

|}