Avogadro/C2/Hydrogen-Bonding/Malayalam

Time	Narration
00:01	ഹൃദ്യമായ ആശംസകൾ Hydrogen bonding in moleculesഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം.
00:07	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, നമ്മൾ പഠിക്കുന്നത്:Avogadro കോൺഫിഗർ ചെയ്യുക,
00:11	ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിംഗ് മോളികൂൽസിൽ കാണിക്കുന്നു,
00:14	ഹൈഡ്രജന്റെ ബോണ്ട്ന്റെ നീളം കാണുക
00:16	Force display ടൈപ്പ് കാണിക്കുകയും മോളിക്യൂൾ ലെ ഡിപോൾ നിമിഷങ്ങൾ കാണിക്കുകയും ചെയ്യുക.
00:22	ഞാൻ ഇവിടെ ഉപയോഗിക്കുന്നത്:ഉബുണ്ടു ലിനക്സ് ഒഎസ് വേർഷൻ 14.04,
00:27	അവഗാഡ്രോ വേർഷൻ 1.1.1. ഇന്റർനെറ്റ് കണക്ഷൻ പ്രവർത്തിക്കുന്നു.
00:34	ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, നിങ്ങൾAvogadro ഇന്റർഫേസ് പരിചയത്തിലായിരിക്കണം.
00:40	ഇല്ലെങ്കിൽ, പ്രസക്തമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾക്കായി, ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക.
00:45	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ ഉപയോഗിച്ചിരിക്കുന്ന ഘടകങ്ങൾ നിങ്ങളുടെ റഫറൻസിനായി കോഡ് ഫയലുകളായി നൽകിയിരിക്കുന്നു.
00:52	ഞാൻ ഒരു പുതിയAvogadro വിൻഡോ തുറന്നു.
00:56	'Draw Tool' ഐക്കൺ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത്panel. ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
01:01	panel ൽ methane വരച്ചുകഴിഞ്ഞു.
01:04	ഇപ്പോൾ Avogadroക്രമീകരിക്കാൻ പഠിക്കാം.
01:08	'Settings' മെനുവിലേക്ക് പോയി 'Avogadro Configure' ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
01:13	Settings ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു.
01:16	ഡയലോഗ് ബോക്സിന് മൂന്ന് മെനു ഇനങ്ങൾ ഉള്ള ഒരു സൈഡ് മെനു ഉണ്ട്- ജനറൽ പ്ലഗിനുകൾ പ്രോജക്ട് ട്രീ
01:24	സ്വതവേ,General' മെനു തിരഞ്ഞെടുത്തിരിക്കുന്നു.
01:28	Generalമെനുവിന് രണ്ട് സ്ലൈഡർ ഉണ്ട് Quality Fog.
01:34	സ്ലൈഡർ നിങ്ങൾLowമുതൽ High. യിലേയ്ക്ക് വലിച്ചിടുന്നതിനാൽ റെൻഡറിംഗിന്റെ ക്വാളിറ്റി വർദ്ധിക്കുന്നു.
01:41	Quality സ്ലൈഡര് Low എന്നതില് വലിച്ചുകൊണ്ട് Applyബട്ടണ് അമര്ത്തുക.
01:47	സ്ട്രക്ച്ചർ ശരിയായി റെൻഡർ ചെയ്തിട്ടില്ലെന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
01:51	Quality സ്ലൈഡര്' High, ആക്കി വലിക്കുക Apply ബട്ടണ് അമര്ത്തുക.
01:56	ഉയർന്ന നിലവാരമുള്ള റെൻഡറിംഗിൽ മോളിക്യുൽ ദൃശ്യമാകുമെന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
02:02	അച്ചടി, ഇമേജുകൾ പ്രസിദ്ധീകരിക്കുന്നതിന് ഉയർന്ന നിലവാരമായ റെൻഡറിംഗ് സജ്ജീകരിച്ചിരിക്കുന്നു.
02:07	ഇത് കൂടുതൽ സിപിയു പവർ ഉപയോഗിക്കുന്നു.
02:11	Qualityസ്ലൈഡര് Medium എന്നതില് വലിച്ചുകൊണ്ട് Apply. അമര്ത്തുക.
02:16	ജനറൽ വ്യൂയിങ് പർപ്പസ് നു ക്വാളിറ്റി സെറ്റിംഗ്സ് നന്നായി പ്രവർത്തിക്കുന്നു.
02:21	ഇപ്പോൾ Fog സ്ലൈഡർ.
02:24	Fog സ്ലൈഡർ Lots ലേക്ക് ഡ്രാഗ് ചെയുക .Lots ലെ Apply ബട്ടൺ അമർത്തുക.
02:28	സ്ട്രക്ച്ചർ ഫോഗഡ് ആണ് എന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
02:32	Fog സ്ലൈഡര്Some ലേക്ക് ഡ്രാഗ് ചെയുക ഇട്ട് Applyക്ലിക് ചെയുക . സ്ട്രക്ച്ചർ വ്യക്തമായി കാണാം.
02:40	അടുത്തത്, Plugins മെനുവിൽ.
02:43	Display Typesഡ്രോപ് ഡൌൺസ് ദൃശ്യമാകും.
02:46	ശ്രദ്ധിക്കുക:Display Types ചെക്ക് ബോക്സുകൾ പ്രാപ്തമാക്കിയിട്ടുണ്ടെന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
02:51	Axes.ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. Axes Display Typeൻറെ വിശദാംശങ്ങൾ Details ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സിൽ പ്രദർശിപ്പിക്കും.
02:59	അതുപോലെ തന്നെ, നിങ്ങൾക്ക് Display Types.ന്റെ വിശദാംശങ്ങൾ കാണാം.
03:04	ഞാൻ എല്ലാ ചെക്ക് ബോക്സുകളും അൺ-ചെക്ക് ചെയ്ത് 'Apply' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:11	Ball and Stick ചെക്ക് ബോക്സ് മാത്രം Display Types മെനുവിൽ കാണാം.
03:16	Ball and Stick Display Type ചെക്ക്ബോക്സ്. അൺചെക്ക് ചെയുക
03:20	Ball and Stick പ്രവർത്തനരഹിതമാകുകയാണെങ്കിൽ,Panelൽ മോളിയ്ക്കുള് അപ്രത്യക്ഷമാകുന്നു.
03:26	പ്രദർശനത്തിനായി പ്രാപ്തമാക്കാൻBall and Stickചെക്ക് ബോക്സിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
03:30	എല്ലാ Display TypesകളുംPlugins.എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
03:33	Display Types ഡ്രോപ്പ് ഡൗണിൽ എല്ലാ ചെക്ക് ബോക്സുകളിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:39	Apply ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:41	എല്ലാDisplay TypesകളുംDisplay Types ഡ്രോപ്പ് ഡൌണിൽ ദൃശ്യമാകും.
03:46	Settings ഡയലോഗ് ബോക്സ് ക്ലോസ് ചെയ്യുന്നതിന് 'OK' ബട്ടണിൽ അമർത്തുക.
03:50	Display Typesമെനുവിൽ Display Typesസജീവമല്ലെങ്കിൽAddബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
03:58	Add Display Type ഡയലോഗ് ബോക്സ് കാണുന്നു.
04:02	Types ഡ്രോപ് ഡൗണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള Display Type തിരഞ്ഞെടുക്കുക
04:07	ഞാൻHydrogen Bond തിരഞ്ഞെടുത്ത്' OK 'ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:11	"Hydrogen Bond" Display Type ഡിസ്പ്ലേ ടൈപ്പുകളുടെ മെനുവിൽ ദൃശ്യമാകുന്നു.
04:16	ഇപ്പോൾ, polar methanolമോളിക്കുലുകളിൽ ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിങ് പ്രകടമാക്കും.
04:22	നമുക്ക് ഇതിനകം തന്നെ പാനല്'ൽ methane മോളിക്കുല് ഉണ്ട്.
04:26	പ്രകടനത്തിന്, എനിക്കൊരു methane മോളികൂൾസ് ആവശ്യമുണ്ട്.
04:31	methane മോളിക്യൂളുകൾ വരയ്ക്കുന്നതിന് എളുപ്പമുള്ള മാർഗംDraw tool.ആണ്.
04:36	ഡിഫാൾട് ആയി Draw Settings മെനുവിൽ 'എലമെന്റ്' Carbon and Bond Order Single ആണ്
04:43	Panel.ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:46	Element ഡ്രോപ്പ് ഡൗൺ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. Oxygen. തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
04:50	പിന്നെ methaneതന്മാത്രകളുടെ ഹൈഡ്രജനിൽ ഏതെങ്കിലും ഒരു ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:56	നമുക്ക് ഇപ്പോൾ 'പാനൽ' ൽ Methanol എന്ന ഒരു ഗ്രൂപ്പ് ഉണ്ട്.
05:00	Display Types.ലെ ' Hydrogen Bondചെക്ക് ബോക്സിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:04	ശരിയായ ഓറിയന്റേഷൻ വേണ്ടി തന്മാത്രകൾ നമുക്ക് ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യാം.
05:08	ടൂൾ ബാറിൽAuto Optimization Toolക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:12	Auto Optimization Settings മെനു ഇടത് വശത്ത് പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു.
05:17	Force Field ഡ്രോപ്പ് ഡൌണിൽ,MMFF94. തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
05:22	ഒപ്റ്റിമൈസുചെയ്യാൻ Start ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:26	മഞ്ഞ "ഡാഷ്ഡ് ലൈനുകളായിhydrogenബോണ്ട് രൂപീകരണം കാണാവുന്നതാണ്.
05:31	ഒരു തന്മാത്രയിലെ ഹൈഡ്രജനും മറ്റ് തന്മാത്രകളുടെ ഓക്സിജനും തമ്മിലുള്ള ഈ വരികൾ രൂപപ്പെട്ടുവരുന്നു.
05:38	Auto optimization. നിർത്താൻ Stop എന്നത് അമർത്തുക.
05:42	ഇപ്പോൾ ഞാൻ ഇൻട്രാമോമ്യൂളർhydrogen ബോണ്ടിംഗ്ortho-nitrophenol. കാണിക്കും.
05:48	ഇതിനു വേണ്ടിChemical structure database. ൽ നിന്നും ഞാൻ മോളികുൽ കൊണ്ടു വരും.
05:54	മുമ്പ് തുറന്ന വിൻഡോകൾ അടച്ച് ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കുക .
05:59	File' മെനുവില് അമര്ത്തുക, Importഎന്നതിലേക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക. Fetch by Chemical name.'ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:06	Chemical Name ടെക്സ്റ്റ് ബോക്സ് കാണുന്നു.
06:09	ടൈപ് 'ortho-nitrophenol' താഴെയുള്ള കേസിൽ "OK" "ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:15	ortho-nitrophenolമോണോകല് Panel. കാണിക്കുന്നു.
06:19	hydrogenബോണ്ടിംഗ് കാണിക്കുന്നതിനായി,Panel. ൽ Ortho-nitrophenolമോളിക്യുലസ് ന്കളുടെ ഒരു കൂട്ടം ആവശ്യമാണ്.
06:26	പാനലിലെ മോളിക്യുലസ്കോപ്പി പേസ്റ്റ് ചെയ്തു
06:30	സെലക്ഷൻ ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച് മോളിക്യുലസ്തെരഞ്ഞെടുക്കുക.
06:34	കോപ്പി ചെയ്യാൻ CTRL + C അമർത്തുക. പേസ്റ്റ് ചെയ്യാൻ CTRL + V 'അമർത്തുക
06:39	Hydrogen Bondചെക്ക് ബോക്സില് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:42	ആവശ്യമെങ്കിൽ ശരിയായ ഓറിയന്റേഷൻ വേണ്ടി തന്മാത്രകൾ ഒപ്റ്റിമൈസുചെയ്യുക.
06:46	ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ പ്രക്രിയയ്ക്കിടയിൽ Intra molecular Hydrogen bondരൂപീകരിച്ച് മോളിക്യുലസ്കളിലാണ് രൂപപ്പെടുന്നത്.
06:54	ഹൈഡ്രജന് ബോണ്ട് രൂപീകരിയ്ക്കുന്നു nitro ഗ്രൂപ്പ്' ', ഹൈഡ്രോക്സി Hydroxy ഗ്രൂപ്പ്' 'ഗ്രൂപ്പിലെ ഓക്സിജന് തന്മാത്രയില്.
07:02	നമുക്ക് ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിന്റെ അളവ് കണക്കാക്കാം.
07:06	ടൂൾ ബാറിൽ ' Click to Measure ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
07:10	ഹൈഡ്രജൻ ആറ്റം, ഓക്സിജൻ ആറ്റം എന്നിവയിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:14	Hydrogen bond ദൈർഘ്യം പാനലിന്റെ അടിയിൽ കാണാം.
07:19	ഈ സ്ലൈഡ് ഹൈഡ്രജൻബോണ്ട് ന്റെ പ്രാധാന്യം കാണിക്കുന്നു.
07:23	ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകൾ:ജലത്തിന്റെ യൂണിക് സോൾവാന്റ കപ്പാസിറ്റി കണ്ടെത്തുകയും ഐസ് ക്രിസ്റ്റൽ സ്ട്രക്ച്ചർ സ്ഥിരപ്പെടുത്തുകയും ചെയ്യുക.
07:32	ഡിഎൻഎയുടെ കോംപ്ലിമെന്ററി സ്‌ട്രെൻഡ്‌സ് പിടിക്കുക
07:36	പ്രോട്ടീനുകളുടെയും ന്യൂക്ലിക് ആസിഡുകളുടെയും സ്ട്രക്ചേർസ് നിർണ്ണയിക്കുകയും നിലനിർത്തുകയും ചെയ്യുക,
07:41	എൻസൈം catalysis എന്ന സംവിധാനത്തിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു
07:46	ഒരു അസൈൻമെന്റ് എന്ന നിലയിൽ, ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിങ് കാണിക്കുക, 1. Para-hydroxybenzoic acid. 2. Nucleobases- adenine and uracil.
07:56	നിങ്ങളുടെ അസൈൻമെന്റ് താഴെപ്പറയുന്നതായി കാണണം.
08:00	Para-hydroxybenzoic acidമോളികുലുകളിൽ ഇന്റർ മോളികുലാർ ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിംഗ് നിരീക്ഷിക്കുക. 'adenine' ഒപ്പം 'uracil' മോളിക്യുലസ്
08:10	Display Types ഒരു ഓപ്ഷൻ ഉണ്ട്, അത്മോളിക്യുലസ് കൾക്ക് ഫോഴ്സ് കാണിക്കുന്നു.
08:15	കുറച്ച് വാട്ടർ മോളിക്യുലസ് ളോടെ ഞാൻ ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കും.
08:19	Display Types,ൽ, Forceചെക്ക് ബോക്സിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:23	Hydrogen Bond ചെക്ക് ബോക്സില് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:26	ടൂൾ ബാറിൽ Auto Optimization Tool ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:30	MMFF94 Force Field തിരഞ്ഞെടുക്കുക. Start ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:36	ഒപ്റ്റിമൈസേഷൻ പ്രക്രിയയ്ക്കിടയിൽ, Forceഡിസ്പ്ലേ ടൈപ്പ് കാണിക്കുന്നത് ഹരിത അമ്പടങ്ങിയ ഓരോ ആറ്റിലും പ്രവർത്തിക്കുന്നു.
08:45	ആരോസ് ദിശകളും ഫോഴ്സ് അളവുതരുന്നു.
08:49	ഒരു മോളികുൽ അതിന്റെ ഒപ്റ്റിമൈസേഷനോട് ചേർന്നാൽ അമ്പ് അപ്രത്യക്ഷമാവും.
08:55	ഇപ്പോൾ, dipole moment ഒരു തന്മാത്രയിൽ.
08:59	dipole moment polar മോളിക്യുലസ് കളിലാണ് ചാർജ് വേർപെടുത്തിയിരിക്കുന്നത്.
09:04	Dipole moment(μ) = charge(Q) times distance of separation(r)
09:09	Debye ടെ യൂണിറ്റുകളിൽ ഡൈപോൾ മൊമന്റ് പ്രകടിപ്പിക്കുന്നു.
09:13	ഇപ്പോൾ ഹൈഡ്രജൻ സയനൈഡിലും വാട്ടർ മോളിക്യുലസ് കളിലും ഞാൻ ഡൈപോൾ കാണിക്കും
09:20	ഒരു പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കുക. 'Draw' 'ടൂൾ ഉപയോഗിച്ച്, പാനലിലെ ഹൈഡ്രജൻ സയനൈഡ് (HCN) തന്മാത്രകൾ വരയ്ക്കുക.
09:27	ഹൈഡ്രജനെ തെരഞ്ഞെടുത്ത് കാർബണിലേക്ക് ഒരു ബോണ്ട് വരയ്ക്കുക.
09:31	'Nitrogen തിരഞ്ഞടുക്കുക Bond Order'triple 'എന്നതുപോലെ തിരഞ്ഞെടുക്കുക, ഒരു ബോൻഡ് വരയ്ക്കുക.
09:38	MMFF94 Force Field.ഉപയോഗിച്ച് ഘടന ഒപ്റ്റിമൈസുചെയ്യുക.
09:44	dipole moment, കാണിക്കുന്നതിന് Display Types.ലെ Dipole ചെക്ക് ബോക്സിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
09:50	ചുവപ്പ് കളർ ആരോ ഉപയോഗിച്ച് 'Dipoleകാണിക്കുന്നു.
09:54	എസ്റിമേറ്റ് ഡൈപോൾ മൊമന്റ് കാണുന്നതിന്, Viewമെനുവിലേക്ക് പോകുക.
09:57	Properties എന്നതിലേക്ക് നാവിഗേറ്റുചെയ്യുക Molecule Properties.തിരഞ്ഞെടുക്കുക. Molecule Properties.വിൻഡോ തുറക്കുന്നു.
10:05	ഹൈഡ്രജന് സയനൈഡ് ന്റെ 0.396D.ആയി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു.
10:13	അതുപോലെ, 0.245D.എന്നതിന്റെ ഡൈലോൾ നിമിഷം.
10:21	നമുക്ക് ചുരുക്കാം.
10:23	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, ഞങ്ങൾ പഠിച്ചത്- Avogadro കോൺഫിഗർ ചെയ്യുക,
10:27	മീതേനോളിൽ ഇൻറർമൈല്യൂക്ചർ ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിങ് കാണിക്കുന്നു,
10:31	ഓർത്രോ നിക്റ്റോഫെനോനോൾ ഇൻട്രോമോളിക്കലിൽ ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടിംഗ്, കാണിക്കുക
10:35	ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകൾ, ലെങ്ത് കാണുക
10:38	വാട്ടർ മോളിക്സിൽ ഫോഴ്സ് ഡിസ്പ്ലേ ടൈപ്പ് കാണിക്കുന്നു,
10:42	എച്ച്സിഎൻ, വാട്ടർ മോളിക്യൂളുകളിൽ ഡൈപ്പോൾ നിമിഷങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുക.
10:48	ഒരു അസൈൻമെന്റായി, 1. കാർബൺ ഡൈ ഓക്സൈഡ്, മീഥിൽ ക്ലോറൈഡ് മോളിക്യൂസിനുള്ള ഇരുചക്രവാഹനങ്ങൾ. 2. അമോണിയ തന്മാത്രകൾക്ക് Force Display Type കാണിക്കുക.
10:59	ഈ വീഡിയോ 'സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ' സംഗ്രഹം സംഗ്രഹിക്കുന്നു. നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ, ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണാവുന്നതാണ്.
11:06	സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഞങ്ങൾ വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുകയും സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുകയും ചെയ്യുന്നു. ഞങ്ങളെ ബന്ധപ്പെടുക.
11:12	സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ്, NMEICT MHRD ഗോവെർമെൻറ് ഓഫ് ഇന്ത്യ എന്നിവയുടെ പിന്തുണ യോടെ നടപ്പാക്കുന്നു
11:18	ഇത് വിജി നായർ സെയ്നി ങ് ഓഫ് . പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

Contributors and Content Editors

Vijinair