CellDesigner/C3/Customizing-Diagram-Layout/Hindi

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Time Narration
00:01 नमस्कार। ‘Customizing Diagram Layout’ के इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है।
00:08 इस ट्यूटोरियल में, हम सीखेंगे: Reaction line के रंग, आकार एवं चौड़ाई को बदलना
00:19 Anchor points' को Reaction line से जोड़ना Components को संरेखित करना Reaction ids दिखाना/छिपाना
00:30 हम यह भी सीखेंगे : Components में नोट्स जोड़ना Protein को एडिट करना जानकारी एडिट करना।
00:39 और डायग्राम का एक बर्ड आई व्यू प्राप्त करना।
00:44 इस ट्यूटोरियल को रिकार्ड करने के लिये, मैं Ubuntu Linux OS 14.04 CellDesigner version 4.3 Java version 1.7 का प्रयोग कर रहा हूँ
01:01 इस ट्यूटोरियल पर आगे बढ़ने के लिए, शिक्षार्थियों को Undergraduate Biochemistry एवं CellDesigner इंटरफ़ेस से परिचित होना चाहिए।


01:12 यदि ऐसा नहीं है, तो प्रासंगिक CellDesigner tutorials के लिए कृपया Spoken Tutorial वेबसाइट पर आएं।
01:20 शुरू करते हैं।
01:22 पिछले ट्यूटोरियल में से एक का असाइनमेंट था - Methionine Biosynthesis के लिए process diagram बनाना।
01:32 मैं इस ट्यूटोरियल के उदाहरण के रूप में उसी डायग्राम का प्रयोग करने जा रहा हूँ। और मैं दिखाऊँगा कि इसे कैसे कस्टमाइज करते हैं।
01:43 CellDesigner इंटरफ़ेस पर स्विच करते हैं।
01:47 आपको यहाँ Methionine Biosynthesis के लिए process diagram दिखाई दे रहा है।
01:53 ट्यूटोरियल को यहाँ रोकें और Methionine Biosynthesis process diagram खोलें, जो अपने बनाया है।
02:01 यदि आपके पास कोई सेव की गयी फाइल नहीं है, तो आप दी गई कोड फाइल से खोल सकते हैं।
02:08 अब diagram को कस्टमाइज करना शुरू करें।
02:12 Cell designer इंटरफ़ेस पर वापस जाते हैं।
02:16 शुरु करने के लिये, मैं Reaction line की चौड़ाई और रंग बदलूँगा।
02:22 ऐसा करने के लिये, मैं Homoserine and Succinylhomoserine' के बीच State Transition का चयन कर रहा हूँ ।
02:30 अब मुख्य मेनू बार में “Component” में जाएँ।
02:35 और “Change color & shape” विकल्प पर क्लिक करें।
02:39 वैकल्पिक रूप से, आप Reaction line पर राइट क्लिक करके “Change color & shape” विकल्प चुन सकते हैं।
02:47 Change color & shape” नामक एक डायलॉग बॉक्स स्क्रीन पर दिखाई देता है।
02:53 एक मोटी Reaction line के लिये, Line Width को 1.0 से उच्च मान में बदलें।
03:02 मैं इसे बदलकर 3.0 करूँगा
03:06 Reaction line का रंग बदलने के लिये, Color panel में जाएँ।
03:12 Color panel में हम एक हैंडल जैसे पॉइंटर युक्त कलर व्हील देख सकते हैं।
03:19 पॉइंटर पर क्लिक करें तथा दबाए रखें और पसंदीदा रंग चुनने के लिए घुमाएँ।
03:25 मैं नीले रंग का शेड चुनूंगा।
03:28 इसके बाद, रंग त्रिभुज में कहीं भी क्लिक करें।
03:34 अब, पॉइंटर पर छोटे वृत्तों को क्लिक करें और छोड़ें।
03:40 सभी संशोधन करने के बाद, Apply और फिर Ok पर क्लिक करें।
03:48 ध्यान दें कि Reaction line अब मोटी और नीले रंग की हो गई है।
03:55 इसके बाद हम सीखेंगे कि Reaction line पर Anchor points को कैसे जोड़ेंगे।
04:01 और Anchor points - Reaction lines के चारों ओर घुमाने में क्यों उपयोगी है
04:09 इन्हें सही आकार दें और उन्हें draw area में सही स्थिति में रखें।
04:16 CellDesigner interface पर वापस आते हैं।
04:20 कोई भी Reaction line चुनें।
04:23 हम Homoserine और SuccinylHomoserine के बीच उसी State Transition reaction line का चयन करेंगें।
04:31 इस लाइन पर, कर्सर का प्रयोग करके, वह सटीक स्थिति चुनें, जहाँ Anchor point रखा जाना चाहिए।
04:39 एक बार सटीक पॉइंट चुनने के बाद, राइट क्लिक करें और Add Anchor Point चुनें।
04:47 आप Reaction line पर चुनी गई सटीक स्थिति पर नए जोड़े गए Anchor point देंखेगें।
04:55 मैं आपको बताता हूँ कि Anchor Points एक रिएक्शन लाइन को बदलने में कैसे मदद कर सकते हैं।
05:03 एक नई विंडो खोलें और इसे Anchor नाम दें। OK पर क्लिक करें।
05:11 अब GTP/GDP के आइकॉन पर क्लिक करें।


05:18 और ड्रा एरिया पर कहीं भी क्लिक करें।


05:22 Reaction line पर राइट क्लिक करें और Add Anchor point पर क्लिक करें।


05:29 Reaction line को खींचे और ड्रा एरिया पर कहीं भी छोड़ें।


05:37 इसके बाद हम देखेंगे कि draw area के कम्पोनेंट्स को कैसे align करें।
05:44 Methionine biosynthesis प्रोसेस डायग्राम विंडो पर वापस आते हैं।
05:50 हाइलाइटेड Reaction line को अनचेक करने के लिए ड्रा एरिया पर कहीं भी क्लिक करें।
05:56 अब 'Shift' कुंजी को दबाकर रखें और draw area पर कई Species पर क्लिक करें।
06:04 Edit मेनू पर जाएँ, नीचे स्क्रॉल करें Alignment चुनें और Alignment type पर क्लिक करें।
06:15 वैकल्पिक रूप से, टूलबार पर Alignment आइकॉन पर क्लिक करें।
06:21 अपने आप टूलबार पर अन्य Alignment विकल्प खोजें।
06:27 एलाइनमेंट को अनडू करें और आगे बढ़ें।
06:31 Reaction पर कार्य करते समय, हम process diagram पर Reaction ids को कैसे दिखा/ छिपा सकते हैं?
06:39 आइए यह सीखते हैं।
06:41 'View' पर जाएँ, नीचे स्क्रॉल करें और 'Show Reaction Id' को अनचेक करें।
06:48 draw area पर संबंधित रिएक्शंस पर Reaction ids अब दिखाई नहीं देंगी।
06:55 यदि आप Reaction Id do the following दिखाना चाहते हैं।
07:01 'View' पर जाएँ, नीचे स्क्रॉल करें और 'Show Reaction Id' पर क्लिक करें।
07:08 Reaction ids, draw area पर संबंधित reactions पर दिखाई देंगी।
07:15 हम draw area पर सभी Components (Compartment, Species या Reaction) में नोट्स जोड़ सकते हैं।
07:21 आइए इसे करना सीखते हैं।
07:24 draw area पर एक Species पर राइट क्लिक करें।
07:28 मैं CoA पर क्लिक करूंगा।
07:32 नीचे स्क्रॉल करें और ‘Species Notes’ पर क्लिक करें।
07:35 एक पॉप अप मेनू दिखाई देता है।
07:38 'Species Notes' नामक डायलॉग बॉक्स खुलता है। Species से संबंधित टेक्स्ट टाइप करें
07:46 मैं निम्नलिखित टाइप करूँगा।


07:49 'OK' पर क्लिक करें।
07:51 ध्यान दें कि नोट्स संबंधी जानकारी को Notes Area में दिखाया गया है।
07:58 वैकल्पिक रूप से, Species में नोट्स जोड़ने के लिये, draw area में एक Species पर क्लिक करें।
08:06 मैं Succinate पर क्लिक करूँगा।
08:09 इसके बाद, CellDesigner विंडो के निचले दाएं कोने पर स्थित Edit Notes टैब पर क्लिक करें।
08:18 एक पॉप अप विंडो खुलेगी।
08:21 Species से संबंधित टेक्स्ट टाइप करें।
08:25 मैं टाइप करूँगा एवं 'OK' पर क्लिक करूँगा।
08:30 इसी तरह, हम एक Protein को एडिट कर सकते हैं।
08:35 ऐसा करने के लिए, draw area पर एक कम्पोनेंट पर राइट क्लिक करें।
08:40 मैं Homoserinesuccinyltransferase पर क्लिक करूँगा।
08:46 नीचे स्क्रॉल करें और Edit Protein पर क्लिक करें।
08:51 स्क्रीन पर Protein नामक एक डायलॉग बॉक्स दिखाई देता है।
08:55 नाम बॉक्स में Protein का नाम दर्ज करें।
09:00 मैं नाम बॉक्स में O-succinyltransferase टाइप करूंगा।
09:06 ‘Update’ पर क्लिक करें और डायलॉग बॉक्स बंद करें।
09:11 हम एक Protein में क्षेत्र भी जोड़ सकते हैं।
09:15 draw area पर एक Protein पर राइट क्लिक करें।


09:19 मैं O-succinyltransferase पर राइट क्लिक करूँगा।
09:24 नीचे स्क्रॉल करें और Edit Protein पर क्लिक करें।
09:29 स्क्रीन पर Protein नामक एक डायलॉग बॉक्स दिखाई देता है।
09:33 residues/regions’ टैब के अंतर्गत, 'Add' बटन पर क्लिक करें।
09:40 डायलॉग बॉक्स - ModificationResidue/Bindingregion में :
09:46 ड्रॉप डाउन मेनू से ‘Binding region का ‘Type’ चुनें।
09:52 कर्सर को आवश्यक मान पर मूव करके आकार एवं कोण बदलें।
09:59 इस डेमो के लिये, मैं Size 15 और Angle 38 चुनूँगा।


10:09 फिर ‘Close’ पर क्लिक करें।
10:12 Update पर क्लिक करें।
10:14 और बॉक्स बंद करें।
10:17 चूँकि हमें Methionine Biosynthesis में क्षेत्र जोड़ने की आवश्यकता नहीं है, मैं इन परिवर्तनों को अनडू कर दूंगा।
10:25 फिर, हम जानकारी को एडिट करना सीखते हैं।
10:30 draw area पर component पर राइट क्लिक करें।
10:33 मैं Homoserine पर क्लिक करूँगा।
10:37 नीचे स्क्रॉल करें और ‘Edit Information’ पर क्लिक करें।
10:41 स्क्रीन पर ‘Edit Information’ नामक डायलॉग बॉक्स दिखाई देता है।
10:46 डायलॉग बॉक्स में, निम्नलिखित करें - ‘state’ टैब के अंतर्गत Open चुनें।
10:54 prefix’ टैब के अंतर्गत के तहत mt चुनें।
10:59 ‘Label’ टैब के अंतर्गत dna चुनें।
11:04 ‘Ok’ पर क्लिक करें।
11:07 आप ड्रा एरिया पर दिखाई देने वाली जानकारी mt:dna देख सकते हैं
11:15 मैं Edit Information को अनडू कर दूँगा, क्योंकि हमें Methionine Biosynthesis में इसकी आवश्यकता नहीं है।
11:23 कुछ मामलों में, process diagram जटिल हो सकता है।



11:28 ऐसे मामलों में, Bird's eye view मदद कर सकता है, क्योंकि एक बड़े मॉडल के अन्दर नेविगेट करना आसान है।
11:37 Bird's eye view आइकॉन पर क्लिक करें।
11:41 Bird’s Eye View में रेड स्क्वायर खींचे।
11:46 ध्यान दें कि draw area पर view उसके अनुसार चलता है।
11:52 यह ट्यूटोरियल यहीं समाप्त होता है।
11:56 आइए सारांशित करते हैं। इस ट्यूटोरियल में, हमने सीखा : Reaction line का रंग, आकार एवं चौड़ाई बदलना।


12:07 Anchor points' को Reaction line से जोड़ना Components को संरेखित करना Reaction ids दिखाना/छिपाना
12:18 हमने यह भी सीखा है- Components में नोट्स जोड़ना
12:23 Protein/Gene एडिट करना, जानकारी एडिट करना।
12:27 और डायग्राम का Bird’s Eye View प्राप्त करना।
12:32 असाइनमेंट के लिए, सेलडिज़ाइनर में टूल्स का उपयोग करके एक ग्लाइकोलिसिस प्रोसेस डायग्राम बनाएँ।
12:41 Reaction line की विभिन्न आकृतियाँ खोजें।
12:47 दिए गए लिंक पर जाकर वीडियो देखें, यह वीडियो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है।


12:52 अच्छी बैंडविड्थ न मिलने पर आप इसे डाउनलोड करके भी देख सकते हैं।


12:57 स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टीम - कार्यशालाएं आयोजित करती है तथा ऑनलाइन टेस्ट पास करने वालों को प्रमाण पत्र प्रदान करती है।
13:06 अधिक जानकारी के लिए, कृपया contact@spoken-tutorial.org पर संपर्क करें।
13:13 स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टॉक टू अ टीचर प्रोजेक्ट का एक भाग है। यह NMEICT, MHRD भारत सरकार द्वारा वित्तपोषित है। इस “मिशन” से संबंधित अधिक जानकारी दिए गए लिंक पर उपलब्ध है।
13:29 यह ट्यूटोरियल इं. अमित कुमार द्वारा अनूदित है। आईआईटी बॉम्बे से मैं _____ आपसे विदा लेता हूँ।

हमसे जुड़ने के लिए धन्यवाद।

Contributors and Content Editors

Indiantranslators2012, Shruti arya