CellDesigner/C3/Build-and-Modify-Process-Diagram/Malayalam

Time	Narration
00:01	ഹലോ എല്ലാവരും. ‘Build and Modify Process Diagram in CellDesigner’. ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം.
00:08	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ നമ്മൾ പഠിക്കും:Macros ഉപയോഗിക്കുക, സമനില പ്രദേശങ്ങളിൽ നീക്കുക,
00:18	ഒരു പ്രതികരണ വരി വിന്യസിക്കുകയും വിപുലീകരിക്കുകയും ചെയ്യുക, ഒരു Product Reactant. എന്നിവ ചേർക്കുക.
00:23	ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിനായി ഞാൻ Ubuntu Linux OS 14.04' CellDesigner version 4.3 Java version 1.7
00:35	ഈ ട്യൂട്ടോറിയൽ പിന്തുടരുന്നതിന്, പഠിതാക്കൾക്ക് പരിചയമുണ്ടായിരിക്കണം: അണ്ടർഗ്രഡ്യൂട്ട് Biochemistry. CellDesigner interface.
00:43	ഇല്ലെങ്കിൽ, CellDesigner tutorials, ദയവായി 'സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക.
00:51	നമുക്ക് തുടങ്ങാം
00:53	'അലനൈൻ ബയോസിന്തസിസിനുവേണ്ടിയുള്ള പരമ്പരാഗത ഡയഗ്രമാണ് നിങ്ങൾ ഇവിടെ കാണുന്നത്.'
00:58	ഇപ്പോൾ ഈ പ്രക്രിയ ഡയഗ്രം സൃഷ്ടിക്കാൻ CellDesigner ഉപയോഗിക്കും.
01:02	'Ctrl + Alt + T' കീകളിലൊന്ന് അമർത്തി ടെർമിനൽ തുറക്കുക.
01:09	ഇപ്പോൾ ടൈപ് ചെയ്യുക './runCellDesigner4.3' അമർത്തുക 'Enter' അമർത്തുക.
01:20	നിങ്ങളുടെ ടെർമിനലിൽ സെൽ ഡിസൈൻ വിൻഡോ ഇപ്പോൾ തുറന്നിരിക്കുന്നു
01:24	'CTRL + N' 'അമർത്തി ഒരു പുതിയ ഫയൽ തുറന്ന്' Build and Modify Process Diagram. പേര് കൊടുക്കുക
01:34	സ്ഥിര വീതിയും ഉയരവും സൂക്ഷിച്ച് 'ok' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
01:39	‘Macros’.എന്തൊക്കെയാണെന്നു പഠിക്കാം.
01:42	'‘Macros’.പതിവായി ഉപയോഗിക്കുന്നത് Components സെറ്റുകളിൽ എളുപ്പത്തിൽ ഡയഗ്രമുകൾ വരയ്ക്കാൻ സഹായിക്കുന്നു.
01:47	ടൂൾബാറിൽ, 'Catalysis' എന്നതിനായുള്ള '‘Macros’.ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക, സമനില പ്രദേശത്തിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
01:57	നമുക്കിപ്പോൾ ദ്രുതഗതിയിൽ ഒരു Macros-Catalysis reaction ഉണ്ട്.
02:02	ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയുടെ മറ്റൊരു വശത്തേക്ക് എല്ലാ ഘടകങ്ങളെയും നീക്കാൻ പഠിക്കാം.
02:08	അതിൽ edit 'മെനുവിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക തുടർന്ന്Select All'. ക്ലിക് ചെയുക
02:16	ഇതരമാർഗ്ഗമായി നിങ്ങൾക്ക് 'Ctrl + A' കീ അമർത്താം.
02:21	എല്ലാ Components ഇപ്പോൾ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിരിയ്ക്കുന്നു.
02:24	ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്ത ഘടകങ്ങളിൽ എവിടെയെങ്കിലും ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക, തുടർന്ന് അവ ആവശ്യമായ ലൊക്കേഷനിലേക്ക് വലിച്ചിടുക.
02:30	നമുക്ക് മുന്നോട്ടുപോകാം.
02:32	ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്ത ഘടകങ്ങൾ അൺചെക്കുചെയ്യുന്നതിന് ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ എവിടെയെങ്കിലും ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
02:37	വീണ്ടും Draw Area ൽ, 'Generic Protein S1 ൽ റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.'
02:43	തുടർന്ന്'Change Identity'. ഓപ്ഷൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
02:47	'class' ബോക്സിൽ Protein Simple Molecule. ആക്കുക
02:53	Name എന്ന് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക: '2-keto-isovalerate' .
02:58	തുടർന്ന് ‘Apply’ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
03:02	ഡയലോഗ് ബോക്സിൽ‘The Same Species Exists’ൽ, ‘No’. ക്ലിക് ചെയുക
03:10	എന്നിരുന്നാലും, ഈ വർഗ്ഗത്തിലെ എല്ലാ ഘടകങ്ങളുമുള്ള മാറ്റത്തെ പ്രതിഫലിപ്പിക്കാൻ നിങ്ങൾ ആഗ്രഹിക്കുന്നുവെങ്കിൽ, yes ക്ലിക്കുചെയ്യുക.ഇവിടെ ഞാൻ ‘No’ കൊടുക്കും
03:20	Generic Protein S1, ഇപ്പോൾ simple molecule 2- 2-keto-isovalerate. ആണ്.
03:30	പേര് ചേർക്കാൻ ഞാൻ മോളിക്യൂൾ ഡ്രാഗ് ചെയുക
03:34	'എൻഡ്-പോയിന്റ്e end-point, Generic protein-'S1' എന്ന സെന്ററിൽ റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക. ഇത്product. ആണ്.
03:42	ഐഡന്റിറ്റി മാറ്റുക o Simple Molecule നു Valine. നെയിം കൊടുത്തു
03:50	Apply ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:52	ചിത്രത്തിൽ നിങ്ങൾ Valine ഉണ്ട്.
03:36	അടുത്തതായി, catalyst 'S2 എന്ന പേരു മാറ്റുകഅതിൽ വലത്-ക്ലിക്കുചെയ്ത് Edit Protein. തിരഞ്ഞെടുക്കുക
04:06	Name ഫീൽഡിൽ, Aminotransferase. ടൈപ്പുചെയ്യുക.
04:11	'Update' ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് ഡയലോഗ് ബോക്സ് ക്ലോസ് ചെയ്യുക.
04:16	പേര് ചേർക്കുന്നതിനു മോളിക്യൂൾ ന്റെ കോർണർ ഡ്രാഗ് ചെയുക,.
04:21	അടുത്തതായി, ലിങ്കുചെയ്ത റിയക്ഷന്റെ സ്ഥാനം മാറ്റാം.
04:25	species ' ന്റെ 'end point ' അതായത്' 'valine' 'എന്നതിന്റെ മധ്യഭാഗത്ത് ക്ലിക്കുചെയ്യുക,' ആവശ്യമുള്ള സ്ഥലത്ത് ഡ്രാഗ് ചെയുക
04:33	Aminotransferaseമായി ഇത് വീണ്ടും ആവർത്തിക്കുക.
04:37	end-point’ Species ചലിക്കുമ്പോൾ എവിടെയാണെങ്കിലും ബന്ധം പ്രതിപ്രവർത്തിക്കുന്നത് പിന്തുടരുക.
04:44	species നു ചുറ്റുമുള്ള reaction lineഎങ്ങനെ ബന്ധിപ്പിക്കാം എന്ന് നമ്മൾ ഇപ്പോൾ പഠിക്കും.
04:49	ഒരുSpecies.നു ചുറ്റുമുള്ള Reaction line 16 കണക്ഷന്റെ ഏതെങ്കിലും പോയിന്റുകളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കാവുന്നതാണ്.
04:56	ഇത് എങ്ങനെ ചെയ്യാമെന്ന് ഞാൻ നിങ്ങൾക്ക് കാണിച്ചു തരാം.
04:59	'CTRL + N' അമർത്തി പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കുക.
05:04	ഈ ഫയൽ Connection points.
05:08	സ്ഥിര വീതിയും ഉയരവും സൂക്ഷിച്ച് 'ok' ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:14	സമനിലയിൽ, രണ്ട്generic proteins വരച്ച് അവയ്ക്ക്'Protein 1 and Protein 2. നെയിം കൊടുക്കുക
05:23	പ്രധാന മെനുവിൽ State Transition.എന്ന ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:28	പിന്നെ, ഡ്രോ ഏറിയ യിൽ ‘start-point' Species, Protein 1. എന്നിവയിൽ മൗസ് ഹോവർ ചെയ്യുക.
05:36	എല്ലാ 16 കണക്ഷനുകളും ചാര നിറത്തിൽ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തിട്ടുണ്ടെന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
05:42	ഈ കണക്ഷൻ പോയിന്റുകളിൽ ഒന്നിലേക്കു് കർസർ അടയാളപ്പെടുത്തുമ്പോൾ, അതു് നീലനിറം മാറുന്നു.
05:49	കണക്ഷൻ പോയിന്റുകളിൽ ഒരെണ്ണം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
05:53	സമാനമായി,‘end-point' Species അതായത് . Protein 2. ൽ മൗസ് ചലിപ്പിക്കുക.
06:00	വീണ്ടും വിശദീകരിച്ചതുപോലെ വീണ്ടും കണക്ഷൻ പോയിന്റിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:05	തെരഞ്ഞെടുത്ത കണക്ഷൻ പോയിന്റുകൾ തമ്മിലുള്ള ഒരു 'സ്റ്റേറ്റ് ട്രാൻസിഷൻ' പ്രതികരണ ലൈൻ രൂപപ്പെടുന്നു.
06:12	അടുത്തതായി, Reaction line. ഞങ്ങൾ അലൈൻ ചെയ്യും
06:16	Protein 1 Protein 2എന്നിവക്ക് ഇടക്ക് State transition reaction line ൽ ക്ലിക് ചെയുക
06:21	reaction line ലെ 2 process nodesഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുക.
06:27	2 process nodes,ലെ മൗസ് ഹോവർ ചെയ്താൽ, ഒരു ‘plus’ ചിഹ്നം കാണാം.
06:34	process nodes. കളിൽ ഒന്ന് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.'
06:37	ഇപ്പോൾ ഇഷ്ടമുള്ള കണക്ഷൻ പോയിന്റിൽ പോയിന്ററിനെ വലിച്ചിടുക.
06:43	ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്ത ഘടകങ്ങൾ അൺചെക്കുചെയ്യുന്നതിന് ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ എവിടെയെങ്കിലും ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:49	reaction line, വിപുലീകരിക്കാനോ വിപുലീകരിക്കാനോ, അതിൽ ആദ്യം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
06:54	ഇപ്പോൾ സ് start-pointൽ അല്ലെങ്കിൽ'end-point Species. ഉള്ള process nodes ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
07:01	ഇഷ്ടാനുസൃത കണക്ഷൻ പോയിന്റ് വരെ reaction line നീക്കാൻ മൗസ് വലിച്ചിടുക.
07:07	ഇവിടെ നിന്ന്, നമ്മൾ പ്രോസസ് ഡയഗ്രം തുടരും.
07:12	നമുക്ക് Build and Modify Process Diagram വിൻഡോയിൽ മാറ്റം വരുത്താം.
07:16	നിലവിലുള്ള പ്രതികരണത്തിലേക്ക് ഒരു Reactant Product,എന്നിവ ചേർക്കൂ.
07:21	ടൂൾബാറിൽ നിന്ന്, ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ 2simple moleculesക്ലിക്കുചെയ്ത് സ്ഥാപിക്കുക.
07:27	'ഗ്ലാട്ടമറ്റ് 2-Oxoglutarate.എന്നീ നാമങ്ങള്ക്ക് പേര് കൊടുക്കുക.
07:36	Simple molecules: 2-keto-isovalerate Valine. എന്നിവ ചേർത്ത് അവയെ വലിച്ചിടുക.
07:44	നേരത്തേ വിശദീകരിച്ചതുപോലെ, നമ്മൾ ഡ്രോ ഏരിയയിലെ ഘടകങ്ങളെ വിന്യസിച്ചിരിക്കാം.
07:49	നേരത്തെ വിശദീകരിച്ചതിൽനിന്ന്, ഘടകങ്ങളെ അണിനിരത്തി ഞാൻ ഇപ്പോൾ പൂർത്തിയാക്കിയിട്ടുണ്ട്.
07:55	ടൂൾബാറിൽ ‘Add Product’.എന്നതിന്റെ ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:00	'2-keto-isovalerate' , എന്നതിന് ഇടക്കുള്ള State Transition ൽ മൌസ് വെക്കുക
08:07	highlighted process node.ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:10	അടുത്തതായി 2-Oxoglutarate.ൽ മൗസ് ഹോവർ ചെയ്യുക.'
08:17	16 ഹൈലൈറ്റുചെയ്തprocess nodes.കളി ൽ ഏതെങ്കിലും ഒരെണ്ണം തിരഞ്ഞെടുക്കുക.'
08:21	ശ്രദ്ധിക്കുക, State Transition 2-Oxoglutarate.എന്നീ വിഭാഗങ്ങൾക്ക് ഇടയിൽ ഒരു reaction line കാണപ്പെടുന്നു.
08:29	അതുപോലെ തന്നെ ‘Add Reactant’ ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:34	' Glutamateഎന്നതിലെ മൌസ് ഹോവർ ചെയ്ത് 16 ഹൈലൈറ്റുചെയ്ത process nodes. കളിലൊന്നിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
08:40	അടുത്തതായി, State Transition ൽ പ്രതിപ്രവർത്തനം കാണിക്കുകയുംprocess node.ൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.'
08:49	ശ്രദ്ധിക്കുക, State Transition Glutamate'.എന്നീ വിഭാഗങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള ഒരു reaction line കാണിക്കുന്നു.
08:55	ഇപ്പോൾ നമ്മൾ Reactant Product എന്നിവയോട് കൂടിയ Catalysis റിയാക്ഷൻ പൂർത്തിയാക്കും
09:01	പ്രോസസ്സ് ഡയഗ്രമിലെ മറ്റ് ഘടകങ്ങളെ ഉൾക്കൊള്ളാൻ 'Reaction ' 'എന്നതിനൊപ്പം ഞാൻ അലൈൻ ചെയ്യും .
09:09	ടൂൾ ബാർ ൽ നിന്ന് ഈ ഐകൺസ് തിരഞ്ഞെടുക്കുക State Transition , Simple Molecule, Generic Protein and Catalysis
09:18	ഇത് പൂർത്തിയാക്കിയ പ്രോസസ് ഡയഗ്രമാണ്.
09:22	ഇത് ശരിയായി കാണുന്നതിന്, പ്രധാന മെനു ബാറിലെ 'view എന്നതിലേക്ക് പോയി Zoom Fit ക്ലിക് ചെയുക
09:32	പൂർത്തിയായത് Process Diagram ഏതു പോലെ ഇരിക്കും
09:36	സംഗ്രഹിക്കാം. ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് Macros. ഉപയോഗിക്കാന് പഠിച്ചു.
09:42	സമനില പ്രദേശങ്ങളിൽ ഘടകങ്ങൾ നീക്കുക, ഒരു സ്പീഷിസിനു ചുറ്റും ഒരു പ്രതികരണ ലൈൻ ബന്ധിപ്പിക്കുക.
09:48	Product Reactantഎന്നിവ ചേർക്കുക
09:54	അസൈൻമെന്റിനായി: 'മെത്തിയോയ്ൻ ബയോസിന്തേശിസിനായി' 'ഒരു സെൽ ഡിസൈൻ നിർമ്മിക്കുക' CellDesigner 'GTP / GD' എന്നതിനായുള്ള Macros പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക,ഒരു 'കർവ്' റിയാക്ഷൻ ലൈൻ സൃഷ്ടിക്കുന്നതെങ്ങനെയെന്ന് കണ്ടെത്തുക
10:11	സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ്-
10:14	താഴെയുള്ള ലിങ്കിൽ വീഡിയോ കാണുക ഇത് സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു.
10:19	നിങ്ങൾക്ക് നല്ല ബാൻഡ് വിഡ്ത്ത് ഇല്ലെങ്കിൽ അത് ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക.
10:24	'സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട്' ടീം സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു.
10:29	ഓൺലൈൻ ടെസ്റ്റ് പാസാകുന്നവർക്ക് സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു.
10:34	കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ദയവായി [emailto: contact@spoken-tutorial.org, contact@spoken-tutorial.org] ലേക്ക് എഴുതുക.
10:40	സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്റ്റ് ടോക്ക് ടു എ ടീച്ചർ പ്രൊജക്ടിന്റെ 'ഭാഗമാണ്.' 'ഇത് എൻഎംഇഐടി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർണ്മെൻറ് ഓഫ് ഇന്ത്യ' 'എന്നിവയിലൂടെ ധനസഹായം നൽകുന്നു.
10:54	ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബെ ൽ നിന്ന് വിജി നായർ പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

Contributors and Content Editors

PoojaMoolya, Prena