CellDesigner/C2/Create-and-Edit-Components/Malayalam

From Script | Spoken-Tutorial
Revision as of 23:52, 1 February 2018 by Prena (Talk | contribs)

(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Time Narration


00:01 ഹലോ എല്ലാവരും. Create and Edit Components' in CellDesigner.ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിലേക്ക് സ്വാഗതം.
00:08 ഈ ട്യൂട്ടോറിയലില് നമ്മള് പഠിക്കും: ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയില് ഉള്ള .xml ഫയല് തുറക്കുക.
00:15 ബോർഡർ ന്റെ ആകൃതി, വലുപ്പം, നിറം, കനം എന്നിവ കണ്ട്: 'കമ്പാർട്ട്മെന്റ്' ൽ മാറ്റുക.
00:22 'സെൽഡ്രോസൈനിനിൽ ഒന്നിലധികം ഫയലുകൾ ഉണ്ടാക്കുക,Species ന്റെ ഐഡൻറിറ്റി മാറ്റുക
00:28 Species സ്പീഷിസ് ന്റെ സ്റ്റാർട്ട് പോയിന്റ്, എൻഡ് പോയിന്റ് എന്നിവ എങ്ങനെ കോപ്പി പേസ്റ്റ് ചെയ്യുമെന്ന് , നമ്മൾ പഠിക്കും.
00:37 'സ്പീഷീസ്' ന്റെ വർണ്ണം സജീവമാക്കാനും മാറ്റം വരുത്താനും, 'reactions' പ്രോപർട്ടിസ് മാറ്റുന്നത് ള ഫയൽ എങ്ങിനെ ക്ലോസെ ചെയ്യാംവ്
00:47 ഇവിടെ Ubuntu Linux OS version 14.04 CellDesigner version 4.3 Java version 1.7 ഉപയോഗിക്കുന്നു
00:57 'ബയോകെമിസ്ട്രി' CellDesigner 'ഇൻറർഫേസ് എന്നിവ പരിചയത്തിലായിരിക്കണം.
01:05 ഇല്ലെങ്കിൽ, 'സെൽഡെസൈൻ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾക്കായി' ദയവായി ഞങ്ങളുടെ വെബ്സൈറ്റ് സന്ദർശിക്കുക 'www.spoken-tutorial.org'
01:16 പഠിതാക്കൾ ശ്രദ്ധിക്കുക: ഈ പരമ്പരയിലെ ചില ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ ചില വിൻഡോസ് ഓസിൽ 'ൽ സൃഷ്ടിക്കപ്പെട്ടു.
01:24 എന്നിരുന്നാലും, ഉബുണ്ടു ലിനക്സ് ഒഎസ് എന്ന പേരിൽ പരമ്പര പൂർത്തിയാകും.
01: 30 'CellDesigner' ലെ കമ്പോണന്റ്സ് സൃഷ്ടിക്കുന്നതിനും എഡിറ്റ് ചെയ്യുന്നതിനും തുടരട്ടെ.
01:35 'Ctrl + Alt + T' കീകളിലൊന്ന് അമർത്തി 'ടെർമിനൽ തുറക്കുക .
01:41 ഇപ്പോൾ ടൈപ് ചെയ്യുക './runCellDesigner4.3' അമർത്തുക 'Enter' അമർത്തുക.
01:52 'സെൽ ഡിസൈൻറ്റർ' വിൻഡോ ഇപ്പോൾ നിങ്ങളുടെ സ്ക്രീനിൽ തുറക്കുന്നു.
01:56 നമുക്ക് നേരത്തെ സൃഷ്ടിച്ചിരിക്കുന്ന Create and Edit എന്ന ഫയൽ തുറക്കാം.
02:02 അതിനാല്, 'file' പിന്നെOpen.എന്നിടത്ത് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
02:07 Open.എന്ന പേരിൽ ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് സ്ക്രീനില് കാണാം.
02:11 ഇവിടെ, ഫോൾഡറുകൾ ലേബലിനു കീഴിൽ ഫോൾഡർ സെലക്ട് ചെയ്യുക.
02:15 പ്രമാണം ലേബലിന് കീഴിലുള്ള 'Create_and_Edit.xml' 'ഫയലിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക എന്നിട്ട്' ok എന്നതിൽ ഡബിൾ -ക്ലിക്കുചെയ്യുക. '
02:27 ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ 'Create_and_Edit.xml' ഇപ്പോൾ ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ തുറന്നിരിക്കുന്നു.
02:35 കമ്പാർട്ട്മെന്റ് തിരഞ്ഞെടുക്കുക. main menu ബാർ ' Component പോകുക.
02:43 താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് Change to OVAL.തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
02:48 ഡ്രോയിലെ പ്രദേശത്ത്, ഞങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ഒരു ഓവൽ കമ്പാർട്ട്മെന്റാണ്.
02:54 നിറം അല്ലെങ്കിൽ കനം മാറ്റുന്നതിന്, പ്രധാന മെനു ബാറിലെ “Component”പോകുക.
03:00 Change color & shape” ഓപ്ഷൻ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
03:05 മറ്റൊരു രീതിയിൽ കംപർട്ട് ബെൻഡറിൽ വലതുക്ലിക്കുചെയ്ത് “Change color & shape”ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
03:14 Change color & shape”എന്ന പേരിൽ ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് സ്ക്രീനിൽ കാണുന്നു.
03:20 ഒരു മെലിഞ്ഞ അതിർത്തി രേഖയിൽ, Membrane Thickness 12 മുതൽ 8 വരെ അല്ലെങ്കിൽ അതിൽ താഴെയായി മാറ്റുക.
03:29 നിറം മാറ്റുന്നതിന് Color panel.പോവുക.
03:34 Color panel.ഒരു കളർ വീൽ ആണ്.
03:39 ഇഷ്ടമുള്ള നിറം തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിന് പോയിന്റർ ക്ലിക്കുചെയ്ത് തിരിക്കുക.
03:46 എല്ലാ മാറ്റങ്ങളും പൂർത്തിയാക്കിയ ശേഷം, Apply.ക്ലിക്കുചെയ്യുക. തുടർന്ന് ok .
03:53 പ്രതികരണ ഉപകരണ ബാറിലെ വിവിധ 'Compartments' വരയ്ക്കുന്നതിന് നിങ്ങളുടെ സ്വന്തമായി മറ്റ് ഓപ്ഷനുകൾ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക.
04:00 Speciesന്റെ . change the identity എന്ന് നമുക്ക് ഇപ്പോൾ മനസിലാക്കാം.
04:05 അതുകൊണ്ട്, ആദ്യം CTRL + N അമർത്തി പുതിയ വിൻഡോ തുറക്കും.
04:11 നമുക്ക് ഈ ഫയലിൽ ഒരു പേരു നൽകാം, Change Species.
04:16 ഞങ്ങൾ സ്ഥിരമായ വീതിയും ഉയരവും നിലനിർത്തും. എന്നിട്ട് 'Ok' 'ബട്ടണിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:22 ഇപ്പോൾ ടൂൾബാറിൽ നിന്നും'Generic protein' എന്ന ഐക്കണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:30 ഡയലോഗ് ബോക്സിൽ 'പെക്ടീൻ' എന്ന് ടൈപ് ചെയ്ത് 'Ok' 'ബട്ടണിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:37 ഇപ്പോൾ Generic protein Pectin.റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:41 Change Identity. എന്ന ഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
04:46 'Change identity of the species' സ്ക്രീനിൽ കാണുന്നു.
04:53 'class' 'ബോക്സിൽ താഴേയ്ക്കുള്ള അമ്പടയാളത്തിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
04:58 ഏതെങ്കിലും ഓപ്ഷൻ തെരഞ്ഞെടുക്കുക, ഉദാഹരണത്തിന് simple molecule ഡ്രോപ്പ്-ഡൌൺ മെനുവിൽ നിന്നും പറയുക.
05:05 ഇപ്പോൾ, ഈ പേര് simple molecule name ബോക്സിൽ നൽകുക.
05:10 നമുക്കിത് Fructose.' പറയാം . Apply ബട്ടൺ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
05:17 നമ്മുടെ Protein Pectinഇപ്പോൾ Fructose. എന്ന simple molecule ളാക്കി പരിവർത്തനം ചെയ്യപ്പെടുന്നു.
05:25 ഇനി നമുക്ക് 'കട്ട്, കോപ്പി' പേസ്റ്റ് പഠിക്കാം.
05:29 ഞാൻ ഇപ്പോൾ ഡ്രാഫ്റ്റ് ഏരിയയിൽ നിലവിലുള്ള Fructose ഉപയോഗിക്കും.
05:34 Species,മുറിച്ചുമാറ്റാൻe Species Fructoseആദ്യം ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
05:40 'edit' മെനുവിലേക്ക് പോകുക, സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് 'cut' ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
05:47 'cut എന്നതിനായുള്ള കുറുക്കുവഴി കീ 'Ctrl + X' എന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
05:53 Species Fructose വെട്ടിക്കളഞ്ഞിരിക്കുന്നു.
05:56 ഇനങ്ങൾ ഒട്ടിക്കുന്നതിന്, 'edit' മെനുവിലേക്ക് തിരിച്ചുപോവുക, താഴേക്ക് സ്ക്രോൾ ചെയ്ത് 'paste' ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:03 'paste' എന്നതിന്റെ കുറുക്കുവഴി കീയാണ് 'Ctrl + V' എന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
06:08 Species Fructose സമനിലയിൽ വീണ്ടും പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു.
06:12 'സ്പീഷീസുകളുടെ ഒരു പകർപ്പുണ്ടാക്കാൻ, മെയിൻ മെനു ബാറിലെ Edit ൽ പോകുക.
06:18 Copy. ക്ലിക് ചെയുക
06:21 കോപ്പി ക്കു കുറുക്കുവഴി കീ 'Ctrl + C' എന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക. ' copy' എന്നതിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക. ഡ്രോപ്പ് ഏരിയയിൽ ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
06:31 ഈ സമയം, നമുക്ക് പേസ്റ്റ് ചെയ്യാനായി 'Ctrl + V' അമർത്താം.
06:36 നമുക്ക് ഇപ്പോൾFructose'ന്റെ ഒരു കോപ്പി ഉണ്ട്.
06:40 'Ctrl + Z' 'അമർത്തി ഏതെങ്കിലും' Ctrl + Y ആവർത്തിക്കുക.
06:51 എന്നിരുന്നാലും അവ അവ ഉപയോഗത്തിലാണ് ഉപയോഗിക്കുന്നത്.
06:55 നമുക്ക് ഡ്രാഫ്റ്റ് ഏരിയയിൽ Fructose molecules വലിച്ചിട്ടുകൊണ്ട് മുന്നോട്ട് പോകാം.
07:00 അങ്ങനെ ചെയ്യാൻ, Fructose ക്ലിക്കുചെയ്ത് അതിനെ ആവശ്യമുള്ള സ്ഥലത്തേക്ക് വലിച്ചിടുക.
07:07 speciesഎങ്ങനെയാണ് ആക്ടിവേറ്റ് ചെയുന്നത് ' സ്റ്റാർട്ട് പോയിന്റ് 'എൻഡ് പോയിന്റ്' 'സ്പീഷീസ്' '?
07:13 അതിനായി, ഞാൻ ഇതിനകം 2 generic proteins. നു ഇടയിൽ സംസ്ഥാന state transition reaction വരച്ചത്.
07:21 ഞാൻ അവയെ പ്രോട്ടീൻ 1 ', പ്രോട്ടീൻ 2 എന്നീ പേരുകളിൽ വിളിച്ചിട്ടുണ്ട്.
07:25 'മുൻപ് എങ്ങനെ reaction എന്ന് ഞങ്ങൾ നേരത്തെ മനസിലാക്കി.
07:29 നിങ്ങൾക്ക് അറിയില്ലെങ്കിൽ, ഈ ശ്രേണിയിലെ മുൻ ട്യൂട്ടോറിയലുകൾ റഫർ ചെയ്യുക. മുന്നോട്ടുപോകാം.
07:35 ഈ പ്രതികരണത്തിൽ reaction പ്രോട്ടീൻ 1' ‘end point’ പ്രോട്ടീൻ 2 '
07:43 species ആക്ടിവേട് ചെയ്യാൻ species ക്ലിക് ചെയുക അത് Reaction ന്റെ 'end point'
07:50 നമ്മുടെ കാര്യത്തിൽ, അത് Protein 2. ആണ്.
07:53 'അമർത്തുക.
07:59 'Ctrl + Z' കീകൾ അമർത്തി കൊണ്ട് ഈ മാറ്റം പഴയപടിയാക്കാൻ അനുവദിക്കുക.
08:05 പകരം, Protein 2. ക്ലിക് ചെയുക
08:09 അടുത്തതായി, പ്രധാന മെനു ബാറിൽ, Component. ൽ പോകുക.
08:13 സ്ക്രോൾ ഡൌൺ ചെയ്ത് Set Active. ക്ലിക് ചെയുക
08:18 activated species ഒരു ഡ്രോഫ് ലൈൻ കൊണ്ട് പൊതിഞ്ഞു കാണിക്കുന്നു.
08:24 ഇനി നമുക്ക് species, Protein 2. ന്റെ നിറം മാറ്റാം,
08:29 അതിനായി റൈറ്റ് ക്ലിക് ചെയ്യുകയും പിന്നീട് 'Change color and shape'. ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:35 ഞങ്ങൾ നേരത്തെ കണ്ടപോലെ, 'color' പാനൽ നിറം വീൽ ആണ്.
08:40 ഇഷ്ടമുള്ള നിറം തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നതിന് പോയിന്റർ ക്ലിക്കുചെയ്ത് തിരിക്കുക.
08:44 പിന്നെApply Ok. എന്നിവയിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
08:49 species , ലെ വർണ്ണ മാറ്റങ്ങൾ ശ്രദ്ധിക്കുക,
08:53 Reaction.ന്റെ സ്വഭാവം മാറ്റുന്നതെങ്ങനെയെന്ന് ഇപ്പോൾ നമ്മൾ പഠിക്കും.
08:57 നമുക്ക് state transition reaction വരയ്ക്കാം.
09:03 species. കൾ തമ്മിലുള്ള reaction arrowറൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
09:08 Change Identity ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
09:13 ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് 'Change Properties of the Reaction കാണാം
09:18 'Name' 'ബോക്സിൽ പ്രതികരണത്തിന്റെ പേര് ടൈപ്പ് ചെയ്യുക, Reaction1.
09:26 'Type' 'ബോക്സിൽ ഡ്രോപ്പ്-ഡൌൺ മെനുവിൽ നിന്നും ആവശ്യമുള്ള പ്രതികരണം തെരഞ്ഞെടുക്കുക,' Transcription.എന്ന് പറയുക. ok' 'ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
09:38 reaction സമനിലയിൽ മാറിയെന്ന് ശ്രദ്ധിക്കുക.
09:42 സമനിലപ്രദേശത്തുള്ള റിയാക്ഷൻ ആരോ ഞങ്ങൾ നൽകിയ പേര് ഞങ്ങൾ കാണുന്നില്ല.
09:47 വിഷമിക്കേണ്ട, വരാനിരിക്കുന്ന ട്യൂട്ടോറിയലുകളിൽ നമ്മൾ അത് മനസ്സിലാക്കും.
09:53 നമുക്ക് വീണ്ടുംreaction arrow ൽ വീണ്ടും റൈറ്റ് ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് Change Identityഓപ്ഷനിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
10:00 ഒരുReversible റിയാക്ഷൻ ആണെങ്കിൽ, 'TRUE' എന്ന ഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുത്ത് 'ok ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
10:09 പ്രതികരണം ഇപ്പോൾ തിരിച്ചെത്തിയതായി നിങ്ങൾക്ക് കാണാം.
10:14 CellDesigner, ൽ പുറത്തുകടക്കാൻ, File ക്ലിക്കുചെയ്ത് Exitഓപ്ഷൻ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
10:20 കൂടാതെ, നിങ്ങൾക്ക് 'Ctrl Q' അമർത്താം.
10:25 മാറ്റങ്ങൾ സൂക്ഷിക്കണമോ എന്ന് ചോദിക്കുന്ന ഒരു ഡയലോഗ് ബോക്സ് Confirmation പ്രത്യക്ഷപ്പെടുന്നു.
10:32 'yes' ക്ലിക്കുചെയ്ത് 'ok' ബട്ടണിൽ ഇരട്ട-ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
10:38 ഫയൽ പരിഷ്കരിച്ചതായി പറയുന്നു.
10:41 Save the changes? Yes.ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
10:46 ചുരുക്കത്തിൽ പറയാം: ഈ ട്യൂട്ടോറിയലിൽ, എങ്ങനെ പഠിക്കണം:
10:50 ചിത്രത്തിൽ ഇതിനകം സംരക്ഷിച്ച .xml ഫയൽ തുറക്കുക.
10:55 Compartment. ന്റെ ബോർഡിന്റെ ആകൃതി, വലിപ്പം, നിറം, കനം എന്നിവ മാറ്റുക.
11:01 'CellDesigner' ൽ ഒന്നിലധികം ഫയലുകൾ ഉണ്ടാക്കുക, തുടർന്ന് ഐഡന്റിറ്റി മാറ്റുക.
11:07 ഒരു Species. കോപ്പി പേസ്റ്റ് ചെയ്ത
11:10 നാം മനസ്സിലാക്കിയത്: ഒരുSpecies.ന്റെ സ്റ്റാർട്ടിങ് പോയിന്റ്, എൻഡ് പോയിന്റ് എന്നിവയെക്കുറിച്ച്.
11:15 complex ഉണ്ടാക്കുക .' Complex നുള്ളിൽ Species വെക്കുക
11:25 നിങ്ങളുടെ അസൈൻമെന്റിനായി: ഒരു Complex സൃഷ്ടിച്ച്, Complex നു ഉള്ളിൽ ഒരു '
11:32 അസൈൻമെന്റ് 2: ടൂൾബാർ പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുക, എങ്ങനെ reactant നു ഒരു product ഒരു റിയാക്ഷൻ എങ്ങിനെ ചേർക്കാം എന്നറിയാൻ.
11:41 നിങ്ങളുടെ പൂർത്തിയാക്കിയ നിയമനം ഇതുപോലെ ആയിരിക്കണം.
11:45 നിങ്ങളുടെ ആദ്യ അസൈൻമെന്റ് ഇതുപോലെയിരിക്കും: Complex. 'ഉള്ളിൽ ഒരു Species
11:55 അസൈൻമെന്റ് 2 ഇതുപോലെ ആയിരിയ്ക്കും reactant ഉം productരു state-transition reaction
12:00 സ്പോക്കൺ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ്.
12:05 ഈ ലിങ്കിലെ വീഡിയോ സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റിനെ സംഗ്രഹിക്കുന്നു. ഡൌൺലോഡ് ചെയ്ത് കാണുക.
12:13 സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രോജക്ട് വർക്ക്ഷോപ്പുകൾ നടത്തുന്നു, ഓൺലൈനിൽ ടെസ്റ്റ് പാസ്സാകുന്നതിനുള്ള സർട്ടിഫിക്കറ്റുകൾ നൽകുന്നു. കൂടുതൽ വിശദാംശങ്ങൾക്ക്, ദയവായി ഞങ്ങൾക്ക് എഴുതുക.
12:23 സ്പോകെൻ ട്യൂട്ടോറിയൽ പ്രൊജക്റ്റ് ഫണ്ട്, എൻ എം ഇ ഐ സി, എംഎച്ച്ആർഡി, ഗവർമെന്റ് ഓഫ് ഇന്ത്യ. ഈ മിഷനെ കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾ ഈ ലിങ്കിൽ ലഭ്യമാണ്.
12:35 ഇത് ഐ.ഐ.ടി ബോംബേയിൽ നിന്നാണ് വിജി നായർ . പങ്കുചേർന്നതിന് നന്ദി.

Contributors and Content Editors

Prena