UCSF-Chimera/C4/Axes-and-Planes/Gujarati - Revision history

Jyotisolanki at 09:29, 17 April 2018

2018-04-17T09:29:40Z

Shivanigada at 08:17, 11 February 2018

2018-02-11T08:17:46Z

Shivanigada: Created page with "{| border = 1 ! Time ! Narration |- | 00:01 | '''Chimera'''ના આ '''Axes and Planes'''ના ટ્યૂટોરિઅલમાં..."

2018-02-11T08:16:26Z

Created page with "{| border = 1 ! <center>Time</center> ! <center>Narration</center> |- | 00:01 | '''Chimera'''ના આ '''Axes and Planes'''ના ટ્યૂટોરિઅલમાં..."

New page

{| border = 1
! <center>Time</center>
! <center>Narration</center>

|-
| 00:01
| '''Chimera'''ના આ '''Axes and Planes'''ના ટ્યૂટોરિઅલમાં તમારું સ્વાગત છે.

|-
| 00:06
| આ ટ્યૂટોરિઅલમાં આપણે '''Axes''', '''Planes''' અને '''Centroids'''ને કેવી રીતે બતાવવા તે ,

|-
| 00:12
| '''2D Labels''' અને '''Per-Model clipping''' વિશે શીખીશું.

|-
| 00:17
| આ ટ્યૂટોરિઅલને અનુસરવા તમે '''Chimera''' ઇન્ટરફેઝના જાણકાર હોવા જરૂરી છો.

|-
| 00:23
| જો તમે નથી તો તેને સંબંધિત ટ્યૂટોરિયલો માટે અમારી વેબસાઈટની મુલાકાત લો.

|-
| 00:28
| આ ટ્યૂટોરિઅલને રેકોર્ડ કરવા હું વાપરી રહી છું : '''Ubuntu''' OS આવૃત્તિ 14.04

|-
| 00:34
| '''Chimera''' આવૃત્તિ 1.10.1

|-
| 00:38
| '''Mozilla firefox''' બ્રાઉઝર 42.0 અને એક કાર્યરત ઈન્ટરનેટ કનેકશન.

|-
| 00:45
| અહીં મેં '''Chimera''' વિન્ડો ખોલી છે.

|-
| 00:48
| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો , '''open 1EMA '''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 00:55
| પેનલ ઉપર '''green fluorescent protein '''નું એક સ્ટ્રક્ચર ખુલે છે.

|-
| 01:00
| ''' Tools''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:02
| '''Structure Analysis''' વિકલ્પ સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરો.સબ-મેનુમાંથી '''Axes, Planes, Centroids''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:11
| '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 01:15
| અહીં આપણી પાસે '''Define axes, Define plane, Define centroid tabs''' આવી ગયા છે.

|-
| 01:24
| '''Define axes''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.આ '''Define axes''' ડાયલોગ બોક્સ ખોલે છે.

|-
| 01:31
| અહીં આપણે એટમ સેટ્સને અને બીજા અન્ય પેરામીટર્સને સ્પષ્ટ કરી શકીએ છીએ.

|-
| 01:37
| પેનલ ઉપર, સ્ટ્રકચરના મધ્યમાંથી તમારા પસંદના થોડાક રેસિડ્યુઝને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 01:43
| રેસિડયુઝને સિલેક્ટ કરવા; '''CTRL''' અને '''shift''' કીઝ વારાફરથી દબાવી રાખી હોય તે દરમ્યાન રેસિડ્યુઝ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 01:55
| '''Define Axes '''ડાયલોગ બોક્સ ઉપર , રેડિયો બટન “'''Selected atoms'''” ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:02
| એક્સિસના નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''axis1.'''

|-
|02:06
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

'''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 02:14
| એક્સિસની જાડાઈને બદલવા ;'''angstroms''' રેડિયો બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:19
| ટેક્સ્ટ બોક્સમાં આંક બદલી 0.25 કરો અને '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:27
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ. સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સ માટે '''Axis''' દોરેલા દેખાય છે.

|-
| 02:33
| '''select''' મેનુ દ્વારા પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 02:37
| '''Structure Measurement''' ડાયલોગ બોક્સમાં આ એક્સિસ માટેના એક ઓબ્જેક્ટનું નિર્માણ થાય છે.

|-
| 02:43
| આ એકસીસને ડીલીટ કરવા , આ હાર ઉપર ક્લિક કરો. Click on ડાયલોગ બોક્સના નીચેના ભાગમાં રહેલ '''Delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:51
| હવે સ્ટ્રક્ચરમાં એક '''plane''' ઉમેરવા , '''Define plane''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 02:57
| આ '''Define Plane''' ડાયલોગ બોક્સમાં , પ્લેનનું નામ બદલી '''plane1''' કરો.

|-
| 03:03
| અહીં માત્ર સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સ માટે જ એક '''plane''' બને છે.

|-
| 03:08
| પેનલ ઉપર, સ્ટ્રકચરના મધ્યમાંથી તમારી પસંદગીના થોડાક રેસિડ્યુઝ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 03:14
| રેસિડયુઝને સિલેક્ટ કરવા; '''CTRL''' અને '''shift''' કીઝ વારાફરથી દબાવી રાખી હોય તે દરમ્યાન રેસિડ્યુઝ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:23
| '''Define Plane''' ડાયલોગ બોક્સ ઉપર ; '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:28
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
| 03:34
| '''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 03:39
| સિલેક્ટ કરેલા એટમ્સને આધારે એક '''plane''' બને છે.

|-
| 03:44
| '''Select''' મેનુ દ્વારા પસંદગીને નાબૂદ કરો.

|-
| 03:48
| '''plane'''ને ડીલીટ કરો , '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સમાં '''plane ID''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:55
| '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 03:58
| To show '''centroid'''ને દેખાડવા કરવા , '''Define centroid''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:03
| '''Define centroid''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 04:07
| સેન્ટરોઇડ બનાવવા સ્ટ્રક્ચર પરના રેસિડ્યુઝ 64 અને 68ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:14
| '''Define Centroid''' ડાયલોગ બોક્સમાં; સેન્ટરોઈડના નામ તરીકે ટાઈપ કરો '''centroid1'''.

|-
| 04:21
| અગાઉ જોયું તે મુજબ , '''color well'''માંથી એક રંગ સિલેક્ટ કરો.

|-
| 04:26
| '''color-editor'''ને બંધ કરો.'''OK''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 04:31
| પસંદ કરેલા એટમ્સ માટેના '''Centroid''' પેનલ ઉપર દેખાય છે.

|-
| 04:36
| પસંદગીને નાબૂદ કરો અને '''centroid'''ને ડીલીટ કરો.

|-
| 04:42
| '''Structure Measurements''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
| 04:45
| સ્ટ્રક્ચરમાં '''2D-Labels''' જેમકે '''text''' અને '''arrows''' પણ ઉમેરી શકાય છે.

|-
| 04:52
| ટૂલ્સ મેનુમાંથી '''Utilities''' વિકલ્પ દ્વારા '''2D labels''' ટૂલ શરુ કરો.

|-
| 04:59
| '''2D-Labels ''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે જેમાં આ ટેબ્સ રહેલ છે : '''Labels''', '''Arrows''' અને '''color key'''.

|-
| 05:07
| લેબલ (શીર્ષક) ઉમેરવા '''Labels''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 05:11
| મૂળભૂત રીતે ડાયલોગ બોક્સ પાસે નીચે રહેલ '''use mouse for label placement''' વિકલ્પ સિલેક્ટ થયેલ હોય છે.

|-
| 05:20
| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો , લેબલ માટે એક રંગ સિલેક્ટ કરો. '''color editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 05:28
| પેનલ ઉપર જ્યાં તમે લેબલને મુકવા માંગતા હોવ ત્યાં ક્લિક કરો.

|-
| 05:32
| ડાયલોગ બોક્સ ઉપર X અને Y કોઓર્ડીનેટસ સાથેનું '''Label id''' દૃશ્યમાન થાય છે.

|-
| 05:38
| હવે '''Text''' ક્ષેત્રમાં લેબલને ટાઈપ કરો.

|-
| 05:42
| ટાઈપ કરો : '''Green Fluorescent Protein'''.એન્ટર દબાવો.

|-
| 05:49
| ડાબા માઉસ બટનને ડ્રેગ કરી લેબલને પુનઃસ્થાપિત કરી શકાય છે.

|-
| 05:56
| લેબલને ડીલીટ કરવા , ડાયલોગ બોક્સ ઉપર '''label id'''ને સિલેક્ટ કરો. '''delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:05
| ઍરોઝને ઉમેરવા ડાયલોગ બોક્સમાંના '''Arrows tab''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 06:10
| ડાયલોગ બોક્સમાં નીચે '''Arrow weight''' ક્ષેત્રમાં,

|-
| 06:15
| ઍરોઝની જાડાઈ બદલવા આ આંકને બદલો.

|-
| 06:19
| હું એક પાતળા એરોને બનાવવા ટાઈપ કરીશ 0.5.

|-
| 06:24
| '''Arrow head''' સ્ટાઇલ બટન ઉપર ક્લિક કરો. ડ્રોપ-ડાઉન મેનુમાંથી એક વિકલ્પને પસંદ કરો.

|-
| 06:30
| હું પસંદ કરીશ : '''Pointy'''.

|-
| 06:33
| પેનલ ઉપર કર્સરને મુકો , માઉસ બટનને ક્લિક કરી પકડી રાખો.

|-
| 06:39
| એરોને વિસ્તારવા ડ્રેગ કરો. હવે માઉસ બતાને છોડીદો.

|-
| 06:46
| એરોને પુનઃદિશામાન કરવા અથવા તેની લંબાઈ બદલવા છેડાને ડ્રેગ કરો.

|-
| 06:54
| એરોને મધ્યમાંથી ડ્રેગ કરી તેને ખસેડો.

|-
| 06:58
| '''arrow id''' બાદ આવેલા '''color well''' ઉપર ક્લિક કરી એરોનો રંગ બદલો.

|-
| 07:04
| એક રંગ પસંદ કરો. હવે '''color-editor'''ને બંધ કરો.

|-
| 07:08
| '''2D-Labels ''' ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો. આ સેશનને '''File''' મેનુ દ્વારા બંધ કરો.

|-
| 07:15
| હવે નવું સેશન ખોલો.

|-
| 07:18
| '''per-model clipping'''ને સમજાવવા; હું ઉદાહરણ તરીકે '''myoglobin'''ના સ્ટ્રક્ચરનો ઉપયોગ કરીશ.

|-
| 07:25
| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો '''open 1mbo'''. એન્ટર દબાવો.

|-
| 07:32
| '''Tools''' મેનુમાં નીચે સ્ક્રોલ કરો , '''Depiction'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 07:37
| સબ-મેનુમાંથી , '''Per-Model clipping''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 07:42
| '''Per-Model clipping''' ડાયલોગ બોક્સ ખુલે છે.

|-
| 07:46
| '''Per-Model Clipping''' જુદી-જુદી રીતે જુદા-જુદા મોડેલ્સને સાથે જોડવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| 07:52
| તે એક માત્ર પ્લેન હોય છે જે મોડેલના દેખાતા અને અદ્રશ્ય ભાગોને અલગ પાડે છે.

|-
| 07:59
| દરેક મોડેલ માત્ર એક જ '''Per-Model Clipping''' પ્લેન ધરાવી શકે છે.
|-
| 08:04
| મોડેલ અને તેની સપાટી બંને અલગ-અલગ મોડેલ્સ તરીકે વર્તે છે.

|-
| 08:09
| પેનલ ઉપર પાછા આવીએ. in the '''Per-Model Clipping''' ડાયલોગ બોક્સમાંનું '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ વર્તમાનનું મોડેલ બતાવે છે.

|-
| 08:18
| '''Enable clipping'''ને સિલેક્ટ કરો , તે ક્લિપિંગ પ્લેન્સને સક્રિય કરે છે.

|-
| 08:25
| મોડેલનો દેખાતો ભાગ પ્લેનની પાછળ હોય છે. '''Enable clipping'''ને અનચેક કરો.

|-
| 08:33
| મોડેલની સપાટી બનાવીએ.'''Actions''' મેનુ ઉપર ક્લિક કરો , '''Surface''' સુધી નીચે સ્ક્રોલ કરીએ.
'''Show''' ઉપર ક્લિક કરીએ.

|-
| 08:43
| હવે સ્ટ્રક્ચર એક પોકેટ દેખાડે છે જ્યાં '''Heme''' સમૂહ મજબૂત રીતે બંધાયેલું હોય છે.

|-
| 08:50
| ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ , બે મોડેલ્સ દેખાડે છે.

મોડલ(1mbo) અને સપાટી સાથેનું મોડેલ.

|-
| 09:00
| સપાટી સાથેનું મોડેલ સિલેક્ટ કરો. '''Enable clipping'''ને ક્લિક કરો.

|-
| 09:06
| પેનલ ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 09:10
| મોડેલની માત્ર સપાટી જ જોડાયેલી દેખાય છે.

|-
| 09:14
| '''Use slab mode with thickness''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:18
| તે તમને '''slab thickness''' પ્રમાણે જ મોડેલનો ભાગ જોવાની પરવાનગી આપે છે.

|-
| 09:24
| '''slab thickness'''ને બદલી 0.5 કરો.

|-
| 09:28
| ટેક્સ્ટ બોક્સમાં ટાઈપ કરો 0.5 અને એન્ટર દબાવો. પેનલને ધ્યાનથી જુઓ.

|-
| 09:37
| ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Adjust clipping with mouse''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:43
| '''Translation''' માટે બટન 2 અને '''rotation''' માટે બટન 3ની નિમણુંક કરો.

|-
| 09:51
| '''Surface capping''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 09:55
| '''Surface capping''' ડાયલોગ બોક્સમાં, '''Cap surfaces at clip planes'''ને સિલેક્ટ કરો.

|-
| 10:02
| '''Use cap color''' ઉપર ક્લિક કરો.

|-
| 10:05
| '''color well'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.

|-
| 10:09
| '''color editor'''ને બંધ કરો.'''cap style''' તરીકે '''solid'''ને સિલેક્ટ કરો. ડાયલોગ બોક્સને બંધ કરો.

|-
|10:18
| '''Chimera''' વિન્ડો ઉપર, '''Actions''' મેનુ દ્વારા સપાટીની પારદર્શકતાને 20% સુધીની કરો.

|-
| 10:26
| હવે પેનલ ધ્યાનથી જુઓ . The '''slab''' હવે રંગીત અને પારદર્શક થઇ ગયેલો દેખાય છે.

|-
| 10:33
| માઉસના વચ્ચેના બટનને દબાવીને પકડી રાખો. '''clipping plane'''ને એક દિશામાં ખસેડવા તેને ડ્રેગ કરો.

|-
| 10:42
| '''clipping plane'''ની જગ્યા બદલવા, જમણા માઉસ બટનને પકડી રાખી માઉસને ડ્રેગ કરો.

|-
| 10:50
| પેનલને ધ્યાનથી જુઓ , '''heme''' સમૂહ ધરાવતું પોકેટ હવે ખુબ સ્પષ્ટ રીતે દેખાય રહ્યું છે.

|-
| 10:57
| ચાલો સારાંશ જોઈએ, આપણે આ ટ્યૂટોરિઅલમાં શીખ્યા કે , કેવી રીતે '''Axes''', '''Planes''' અને '''Centroids'''ને બતાવવા,

|-
| 11:05
| '''2D Labels''' બતાવવા અને '''Arrows''' દોરવા.

|-
|11:09
| મોડેલને '''Per-Model clipping''' ટૂલ દ્વારા જોડવું.

|-
| 11:13
| અભ્યાસ માટે , '''Chymotrypsin'''નું મોડેલ ખોલો.

|-
| 11:18
| '''planes''' દોરો. સ્ટ્રકચરને ''' Per-Model Clipping''' ટૂલ દ્વારા જોડો.

|-
| 11:24
| આ નીચેની લિંક ઉપરનો વિડીયો સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટનો સારાંશ આપે છે જો તમારું બેન્ડવિથ સારું ન હોય તો તમે તેને ડાઉલોડ કરી નિહાળી શકો છો.

|-
| 11:32
| અમે સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ્સ દ્વારા વર્કશોપ્સનું સંચાલન કરીએ છીએ અને સર્ટિફિકેટ્સ પણ આપીએ છીએ. વધુ માહિતી માટે અમને સંપર્ક કરો.

|-
| 11:39
| સ્પોકન ટ્યૂટોરિઅલ પ્રોજેક્ટને NMEICT, MHRD, ભારત સરકાર તરફથી ભંડોળ પૂરું પાડવામાં આવે છે.

|-
| 11:45
| ભાષાંતર કરનાર હું શિવાની ગડા વિદાય લઉં છું. અમારી સાથે જોડાવા આભાર.

|}

@@ Line 113: / Line 113: @@
 |-
 | 02:43
-| આ એકસીસને ડીલીટ કરવા , આ હાર ઉપર ક્લિક કરો. Click on ડાયલોગ બોક્સના નીચેના ભાગમાં રહેલ '''Delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
+| આ એકસીસને ડીલીટ કરવા , આ હાર ઉપર ક્લિક કરો.  ડાયલોગ બોક્સના નીચેના ભાગમાં રહેલ '''Delete''' બટન ઉપર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 141: / Line 141: @@
 |-
 | 03:28
-|  '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.
+| '''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો. '''color-editor'''ને બંધ કરો.
 |-
@@ Line 165: / Line 165: @@
 |-
 | 03:58
-| To show '''centroid'''ને દેખાડવા કરવા , '''Define centroid''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.
+|  '''centroid'''ને દેખાડવા  '''Define centroid''' ટેબ ઉપર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 309: / Line 309: @@
 |-
 | 07:25
-| કમાન્ડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો '''open 1mbo'''. એન્ટર દબાવો.
+| કમાંડ ટેક્સ્ટ બોક્સ ઉપર ટાઈપ કરો '''open 1mbo'''. એન્ટર દબાવો.
 |-
@@ Line 334: / Line 334: @@
 | 07:59
 | દરેક મોડેલ માત્ર એક જ '''Per-Model Clipping''' પ્લેન ધરાવી શકે છે.
 |-
 | 08:04
@@ Line 340: / Line 341: @@
 |-
 | 08:09
-| પેનલ ઉપર પાછા આવીએ.  in the '''Per-Model Clipping''' ડાયલોગ બોક્સમાંનું '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ વર્તમાનનું મોડેલ બતાવે છે.
+| પેનલ ઉપર પાછા આવીએ.   '''Per-Model Clipping''' ડાયલોગ બોક્સમાંનું '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ વર્તમાનનું મોડેલ બતાવે છે.
 |-
@@ Line 413: / Line 414: @@
 |-
 | 10:05
-| '''color well'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.
+| '''color well''' માંથી એક રંગ પસંદ કરો.
 |-
@@ Line 425: / Line 426: @@
 |-
 | 10:26
-| હવે પેનલ ધ્યાનથી જુઓ . The '''slab''' હવે રંગીત અને પારદર્શક થઇ ગયેલો દેખાય છે.
+| હવે પેનલ ધ્યાનથી જુઓ .  '''slab''' હવે રંગીત અને પારદર્શક થઇ ગયેલો દેખાય છે.
 |-

@@ Line 82: / Line 82: @@
 | 01:55
 | '''Define Axes '''ડાયલોગ બોક્સ ઉપર , રેડિયો બટન “'''Selected atoms'''” ઉપર ક્લિક કરો.
 |-
@@ Line 91: / Line 89: @@
 |-
 |02:06
-| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.
+| '''color well''' ઉપર ક્લિક કરો.'''color editor'''માંથી એક રંગ પસંદ કરો.'''color editor'''ને બંધ કરો.
-−
 '''color editor'''ને બંધ કરો.
 |-
@@ Line 365: / Line 361: @@
 |-
 | 08:50
-|  ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ , બે મોડેલ્સ દેખાડે છે.
+|  ડાયલોગ બોક્સમાં , '''Model''' ડ્રોપ-ડાઉન મેનુ , બે મોડેલ્સ દેખાડે છે.મોડલ(1mbo) અને સપાટી સાથેનું મોડેલ.
-−
 મોડલ(1mbo) અને સપાટી સાથેનું મોડેલ.
 |-