Priyacst at 10:59, 12 January 2018

2018-01-12T10:59:43Z

Venuspriya at 06:34, 9 January 2018

2018-01-09T06:34:38Z

Jayashree: Created page with "{| border=1 | Time | Narration |- |00:01 | '''Attribute'''கள் குறித்த இந்த டுடோரியலுக்க..."

2017-12-17T12:35:29Z

Created page with "{| border=1 | <center>Time</center> | <center>Narration</center> |- |00:01 | '''Attribute'''கள் குறித்த இந்த டுடோரியலுக்க..."

New page

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
|00:01
| '''Attribute'''கள் குறித்த இந்த டுடோரியலுக்கு நல்வரவு.

|-
| 00:06
| இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்கப்போவது: atomகள், residueக்கள், மற்றும் modelகளின், '''attribute'''களை மாற்றுவது.

|-
|00:13
| '''B-factor''' மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, ஒரு proteinல் உள்ள atomகளுக்கு வண்ணம் பூசுவது.

|-
|00:18
| '''kdhydrophobicity''' மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, residueக்களுக்கு வண்ணம் பூசுவது.

|-
|00:24
| இந்த டுடோரியலை பின்பற்ற, உங்களுக்கு, '''Chimera''' interface பரீட்சயமாக இருக்க வேண்டும். இல்லையெனில், அதற்கான டுடோரியல்களுக்கு, எங்கள் வலைத்தளத்தை பார்க்கவும்.

|-
|00:33
| இந்த டுடோரியலை பதிவு செய்வதற்கு நான்: '''Ubuntu''' OS பதிப்பு14.04 ,'''Chimera''' பதிப்பு 1.10.2 ,'''Mozilla firefox''' browser 42.0, மற்றும், ஒரு இணைய இணைப்பை பயன்படுத்துகிறேன்.

|-
|00:50
| இங்கு, ஒரு '''Chimera''' windowஐ நான் திறந்துள்ளேன்.

|-
|00:52
| Command lineஐ பயன்படுத்தி, '''Leucine zipper. '''ன் structureஐ திறக்கவும்.

|-
|00:54
| command text boxல், டைப் செய்க: '''open 1zik'''. '''Enter'''ஐ அழுத்தவும்.

|-
|01:05
| Panelலில் இருக்கின்ற, model, '''ribbon'''களாக காட்டப்படுகிறது.

|-
|01:10
| '''Presets''' menuஐ பயன்படுத்தி, displayஐ , '''Interactive 2''' '''. '''க்கு மாற்றவும்.

|-
|01:14
| நீரின் moleculeகளை மறைக்க, '''Command line'''ல், டைப் செய்க: '''delete solvent'''. '''Enter'''ஐ அழுத்தவும்.

|-
|01:22
| Displayஐ , sticksக்கு மாற்ற, டைப் செய்க: '''rep stick'''. '''Enter'''ஐ அழுத்தவும்.

|-
|01:30
| Structureக்கு hydrogenகளை சேர்க்கவும். டைப் செய்க: '''addh '''.

|-
|01:36
| இப்போது, இந்த structureக்கான, '''atoms and residues'''ன், '''attribute'''களை, எப்படி மாற்றுவது என்று கற்போம்.

|-
|01:43
| '''Attribute'''கள், பெயர்கள், மற்றும் மதிப்புகளுடன் கூடிய, propertyகளாகும்.

|-
|01:47
| '''Chimera'''வில், '''atoms, bonds, residues''' மற்றும்'''molecule models''' போன்ற itemகள், '''Attribute'''களை கொண்டிருக்கின்றன.

|-
|01:54
| '''Attribute'''களை மாற்ற, வெவ்வேறு வழிகள் உள்ளன.

|-
|01:57
| '''Favorites''' menuஐ பயன்படுத்தி, '''Model Panel'''ஐ , திறக்கவும்.

|-
|02:01
| '''Model Panel''' dialog box, திரையில் தோன்றுகிறது.

|-
|02:05
| Panelன், வலது பக்கத்தில் இருக்கின்ற, '''attributes''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|02:10
| '''1zik'''க்கான, '''Attributes''' dialog box, திரையில் தோன்றுகிறது.

|-
|02:15
| Dialog box, '''attribute''' பட்டியலை கொண்டிருக்கிறது.

|-
|02:18
| பின்வருவனவற்றை, பட்டியல் கொண்டிருக்கிறது. '''Molecule Attribute'''கள், மற்றும் அதன் கள், '''Atom, bond ''' மற்றும்''' residue attribute'''க்கள்.

|-
|02:28
| ''' Molecule Attributes.'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|02:31
| கிடைக்கின்ற '''attribute'''கள், windowவில் பட்டியலிடப்பட்டுள்ளன.

|-
|02:35
| உதாரணத்திற்கு- aromatic ringகளின் displayஐ மாற்ற, '''aromatic display'''க்கு அடுத்து இருக்கின்ற பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|02:42
| Drop-downல் இருந்து, '''True'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|02:45
| '''Aromatic ring style'''ஐ , '''disk''' என தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|02:49
| Aromatic colorக்கு அடுத்து இருக்கின்ற '''color well''' ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|02:53
| '''Color editor'''ல் இருந்து, நிறத்தை தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|02:56
| Dialog boxஐ மூடவும்.

|-
|02:59
| Panelஐ கவனிக்கவும். எல்லா '''aromatic ring'''களும், நடுவில் diskகளுடன் காட்டப்படுகின்றன.

|-
|03:06
| Structureன் ஐ, '''ball and stick'''க்கு மாற்றவும்.

|-
|03:10
| Command lineல், டைப் செய்க: '''rep bs'''.

|-
|03:16
| Attributes dialog boxல், atomகளின், Van der Walls radii ஐ மாற்றவும்.

|-
|03:22
| '''ball scale'''ன் மதிப்பை, 0.5 க்கு மாற்றவும். '''Enter'''ஐ அழுத்தவும்.

|-
|03:27
| Panelஐ கவனிக்கவும். Atomகள், பெரிய atomic radii யுடன் காட்டப்படுகின்றன.

|-
|03:33
| மீண்டும், '''Molecular Attributes '''check boxஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|03:38
| பட்டியலில் இருந்து, '''Component Atom Attributes'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|03:43
| அதற்கான windowவில், '''atom style button'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|03:48
| Drop-down menu, பல optionகளை கொண்டிருக்கிறது.

|-
|03:51
| Displayஐ , '''cpk'''க்கு மாற்ற, ''' sphere'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|03:55
| Panelஐ கவனிக்கவும்.

|-
|03:57
| '''Sticks''' displayஐ திரும்பிக் கொண்டு வர, '''dot'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|04:02
| இப்போது, '''Component Bond Attributes.'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|04:10
| இங்கு, bond styleஐ , '''stick''' அல்லது '''wire'''க்கு மாற்ற, optionகள் இருக்கின்றன.

|-
|04:13
| '''Component Residue Attributes.'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|04:17
| இங்கு, ribbonனின் attributeகளை மாற்ற, நமக்கு, optionகள் இருக்கின்றன.

|-
|04:22
| '''Presets''' menuஐ பயன்படுத்தி, panelலில் இருக்கின்ற, structureன் displayஐ , '''ribbons'''க்கு மாற்றவும்.

|-
|04:28
| இப்போது, '''Attribute''' dialog-boxஐ க்ளிக் செய்கிறேன்.

|-
|04:32
| இப்போது, '''Attribute''' dialog-boxல், '''ribbon color'''க்கு அடுத்து இருக்கின்ற, '''color well '''ஐ க்ளிக் செய்யவும். ஒரு ribbon நிறத்தை தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|04:41
| பின், '''color editor'''ஐ மூட, '''close''' optionஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|04:46
| '''ribbon'''னின், cross-section மற்றும் '''scaling'''ஐ மாற்ற, optionகள் இருக்கின்றன.

|-
|04:52
| Dialog-boxஐ மூடவும்.

|-
|04:55
| மீண்டும், '''Presets''' menuஐ பயன்படுத்தி, displayஐ , '''atoms '''க்கு மாற்றவும்.

|-
|05:00
| '''Tools''' menuஐ பயன்படுத்தியும், '''attribute'''களை மாற்றலாம்.

|-
|05:03
| '''Tools''' menuஐ க்ளிக் செய்யவும். '''Structure Analysis'''க்கு scroll செய்யவும்.

|-
|05:09
| Sub-menuவில் இருந்து, '''Render by Attribute '''optionஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|05:14
| '''Render by attribute''' dialog box திறக்கிறது.

|-
|05:17
| இங்கு, '''atomகள், residueகள், moleculeகள், segmentation region'''களின், '''attribute'''களை மாற்றுவதற்கு, optionகள் இருக்கின்றன.

|-
|05:27
| '''Atoms'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும். ''' Render.'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|05:32
| இருக்கின்ற optionகளை சரிபார்க்க, '''Attribute''' பட்டியலை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|05:37
| பட்டியல், இரண்டு optionகளை காட்டுகிறது: '''bfactor''' மற்றும்'''occupancy'''.

|-
|05:43
| இந்த இரண்டு '''attribute'''களை, input '''PDB''' file லில் இருந்து படிக்கலாம்.

|-
|05:48
| '''bfactor.'''ஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|05:50
| வண்ணம் பூசப்பட்ட, செங்குத்தான barகளுடன், மதிப்புகளின் ஒரு histogram, தோன்றும்.

|-
|05:55
| '''B-factor''' மதிப்புகள், '''macromolecule'''லில் இருக்கின்ற இயங்குதிறனின் ஒரு அளவீடாகும்.

|-
|06:01
| குறைந்த, '''B-factor''' மதிப்புகளைக் கொண்ட '''atom'''கள், நன்றாக ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட structureன் ஒரு பகுதியை சேர்ந்தவையாகும்.

|-
|06:08
| பெரிய '''B-factor''' மதிப்புகளைக் கொண்ட atomகள், மிகவும் இணக்கமான, structureன் பகுதியை சேர்ந்தவையாகும்.

|-
|06:15
| ஒரு '''protein''' structureக்கான, PDB file, B-factor தகவலைக் கொண்டிருக்கிறது.

|-
|06:21
| Panelக்கு திரும்பவும்.

|-
|06:23
| செங்குத்தான barகளை, mouseஐ வைத்து, '''histogram''' நெடுகிலும் இழுக்கலாம்.

|-
|06:29
| B-factorன் மதிப்பு, ''' Value ''' text boxல் காட்டப்படுகிறது.
|-
|06:34
| நீல செங்குத்தான barஐ , பூஜ்யத்திற்கும், சிவப்பை, 100க்கு இழுக்கவும்.

|-
|06:41
| பின், வெள்ளை barஐ , மதிப்பு 50ல், பொருத்தவும்.

|-
|06:45
| '''Colors''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|06:48
| '''color atoms''', '''keep opaque''' மற்றும்'''color surfaces.'''க்கான, optionகளை check செய்யவும்.

|-
|06:55
| முன்னிருப்பான color '''palette''', நீலம் மற்றும் சிவப்பு ஆகும்.

|-
|06:59
| Drop-down menuஐ பயன்படுத்தி, நீங்கள் color '''palette'''ஐ மாற்றலாம்.

|-
|07:04
| '''Apply''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|07:07
| Panelஐ கவனிக்கவும். அதிக '''B-factor''' மதிப்புகளைக் கொண்ட '''atom'''கள், சிவப்பிலும், குறைந்தவை நீலத்திலும் காட்டப்படுகின்றன.

|-
|07:16
| எதிர்பார்த்தது போல், அதிக '''B-factor''' மதிப்புகளைக் கொண்ட '''atom'''கள், structureன் வெளியில் இருக்கின்றன.

|-
|07:22
| இப்போது, '''residue'''க்களின், '''attribute'''களை மாற்றுவோம்.

|-
|07:26
| '''Select by Attribute''' dialog boxல், '''Attributes ''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|07:32
| Drop-downல் இருந்து, '''residues'''ஐ தேர்ந்தெடுக்கவும்.

|-
|07:36
| '''Render.'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|07:38
| '''Residue'''களுக்கான, '''attribute'''கள், '''kdHydrophobicity scale'''ஐ கொண்டிருக்கிறது.

|-
|07:44
| Drop-down menuவில் இருந்து, '''kdHydrophobicity'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|07:48
| மதிப்புகள், histogramல் காட்டப்படுகின்றன.

|-
|07:52
| '''kdHydrophobicity scales''' என்பன, '''amino acid residue'''க்களின், relative '''hydrophobicity'''ஐ வரையறுக்கின்ற மதிப்புகளாகும்.

|-
|08:00
| '''KdHydrophobicity''' மதிப்புகள், '''hydrophobic residue'''களுக்கு, positiveஆகவும், '''polar residue'''களுக்கு, negativeஆகவும், இருக்கின்றன.

|-
|08:09
| '''Residue'''க்களின் '''Hydrophobicity'''ஐ , நிறங்கள் அல்லது wormகளை வைத்து காட்டலாம்.

|-
|08:15
| '''Colors'''ஐ தேர்வு செய்யவும். முன்னிருப்பாக, சில parameterகள் தேர்ந்தெடுக்கப்படுகின்றன.

|-
|08:21
| '''Apply''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும். Panelஐ கவனிக்கவும்.

|-
|08:26
| '''hydrophobic residue'''க்கள் சிவப்பிலும், '''polar residue'''க்கள் நீலத்திலும் வண்ணம் பூசப்படுகின்றன.

|-
|08:33
| '''Worms''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும். '''Apply'''ஐ க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|08:38
| Panelஐ கவனிக்கவும்.

|-
|08:41
| '''Worm'''கள் என்பன, radiusல் மாறுபடுகின்ற, மாற்றியமைக்கப்பட்ட ribbonகளாகும்.

|-
| 08:47
| பெரும்பாலான, '''hydrophobic residue'''க்கள், structureன் உட்புறத்தை பார்க்கின்றன.

|-
|08:52
| முன்னிருப்பாக, அதிக '''hydrophobic residue'''க்கள், பெரிய radiusஉடன் காட்டப்படும்.

|-
|09:00
| Structureஐ , இயல்பான ribbonக்கு திருப்ப:

|-
|09:03
| Worm-style பட்டனை க்ளிக் செய்து, '''non-worm''' optionஐ தேர்வு செய்யவும்.

|-
|09:09
| '''OK ''' பட்டனை க்ளிக் செய்யவும்.

|-
|09:12
| '''File''' menuஐ பயன்படுத்தி, '''Chimera''' sessionஐ மூடவும்.

|-
|09:16
| சுருங்கச் சொல்ல, இந்த டுடோரியலில் நாம் கற்றது, '''atomகள், residueக்கள், மற்றும் model'''களின், '''attribute'''களை மாற்றுவது.

|-
|09:25
| '''B-factor''' மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, ஒரு '''protein'''ல் உள்ள '''atom'''களுக்கு வண்ணம் பூசுவது.

|-
|09:30
| '''kdhydrophobicity''' மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, '''residue'''க்களுக்கு வண்ணம் பூசுவது.

|-
|09:35
| பயிற்சியாக, panelலில், '''hemoglobin (PDB code: 2HCO)'''ன் ஒரு modelஐ திறக்கவும். '''B-factor''' மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, atomகளுக்கு வண்ணம் பூசவும்.

|-
|09:44
| '''kdhydrophobicity''' மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, residueக்களுக்கு வண்ணம் பூசவும்.

|-
|09:49
| இந்த வீடியோ, ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்தை சுருங்க சொல்கிறது. உங்கள் இணைய இணைப்பு வேகமாக இல்லையெனில், அதை தரவிறக்கிக் காணவும்.

|-
|09:56
| நாங்கள், ஸ்போகன் டுடோரியல்களை பயன்படுத்தி, செய்முறை வகுப்புகள் நடத்தி, சான்றிதழ்கள் தருகிறோம். எங்களுக்கு மின்னஞ்சல் செய்யவும்.

|-
|10:04
| ஸ்போகன் டுடோரியல் திட்டத்திற்கு ஆதரவு, இந்திய அரசாங்கத்தின், '''NMEICT, MHRD''' மூலம் கிடைக்கிறது.

|-
|10:10
| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது ஜெயஸ்ரீ.
|-
|}

@@ Line 97: / Line 97: @@
 |-
 |02:18
-| பின்வருவனவற்றை, பட்டியல் கொண்டிருக்கிறது.  '''Molecule Attribute'''கள், மற்றும் அதன் கள், '''Atom, bond ''' மற்றும்''' residue attribute'''க்கள்.
+| பின்வருவனவற்றை, பட்டியல் கொண்டிருக்கிறது.  '''Molecule Attribute'''கள், மற்றும் அதன் componentகள், '''Atom, bond ''' மற்றும்''' residue attribute'''க்கள்.
 |-
@@ Line 436: / Line 436: @@
 |-
 |09:35
-| பயிற்சியாக, panelலில்,  '''hemoglobin (PDB code: 2HCO)'''ன் ஒரு modelஐ திறக்கவும்.  '''B-factor'''  மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, atomகளுக்கு வண்ணம் பூசவும்.
+| பயிற்சியாக, panelலில்,  '''hemoglobin '''ன் ஒரு modelஐ திறக்கவும்.  '''B-factor'''  மதிப்புகளுக்கு ஏற்ப, atomகளுக்கு வண்ணம் பூசவும்.
 |-

@@ Line 456: / Line 456: @@
 |-
 |10:10
-| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது ஜெயஸ்ரீ.
+| இந்த டுடோரியலை தமிழாக்கம் செய்தது ஜெயஸ்ரீ.குரல்கொடுத்தது IIT Bombayஇல் இருந்து சண்முகப் பிரியா , நன்றி .
 |-
 |}

UCSF-Chimera/C4/Attributes/Tamil - Revision history

Priyacst at 10:59, 12 January 2018

Venuspriya at 06:34, 9 January 2018

Jayashree: Created page with "{| border=1 | Time | Narration |- |00:01 | '''Attribute'''கள் குறித்த இந்த டுடோரியலுக்க..."