Jayarastogi at 05:35, 4 July 2018

2018-07-04T05:35:11Z

Jayarastogi at 03:52, 2 July 2018

2018-07-02T03:52:52Z

Jayarastogi at 03:38, 2 July 2018

2018-07-02T03:38:02Z

Shruti arya: Created page with "{| border=1 | Time | Narration |- |00:01 | Attributes पर इस ट्यूटोरियल में आपका स्वाग..."

2018-02-19T18:51:54Z

Created page with "{| border=1 | <center>Time</center> | <center>Narration</center> |- |00:01 | Attributes पर इस ट्यूटोरियल में आपका स्वाग..."

New page

{| border=1
| <center>Time</center>
| <center>Narration</center>

|-
|00:01
| Attributes पर इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है।

|-
|00:05
| इस ट्यूटोरियल में हम सीखेंगे परमाणुओं, रेसीड्यूज़ और मॉडल्स के ऐट्रिब्यूट्स बदलना।

|-
|00:13
| B-factor वैल्यूज़ के आधार पर एक प्रोटीन में परमाणुओं को रंग करना।

|-
|00:18
| kdHydrophobicity वैल्यूज़ के आदर पर रेसीड्यूज़ को रंग करना।

|-
|00:24
| इस ट्यूटोरियल के अनुसरण के लिए आपको Chimera इंटरफ़ेस से परिचित होना चाहिए। यदि नहीं हैं तो सम्बंधित ट्यूटोरियल्स के लिए कृपया हमारी वेबसाइट पर जाएँ।

|-
|00:33
| इस ट्यूटोरियल को रेकॉर्ड करने के लिए मैं उपयोग कर रही हूँ Ubuntu OS वर्जन 14.04, Chimera वर्जन 1.10.2, Mozilla Firefox ब्राउज़र 42.0 और एक कारकरी इन्टरनेट कनेक्शन।

|-
|00:50
| यहाँ मैंने एक Chimera विंडो खोली है।

|-
|00:54
|कमांड लाइन उपयोग करके Leucine zipper का स्ट्रक्चर खोलें।

|-
| 00:52
|कमांड टेक्स्ट बॉक्स में टाइप करें open 1zik एंटर दबाएँ।

|-
|01:05
| पैनल पर मॉडल ribbons की तरह दिखता है।

|-
|01:10
|Presets मेन्यू उपयोग करके डिस्प्ले को Interactive 2 में बदलें।

|-
|01:14
| जल अणुओं को छिपाने के लिए कमांड लाइन पर टाइप करें delete solvent, एंटर दबाएँ।

|-
|01:22
| डिस्प्ले को स्टिक्स में बदलने के लिए टाइप करें rep stick, एंटर दबाएँ।

|-
|01:30
| स्ट्रक्चर में हाइड्रोजन जोड़ने के लिए टाइप करें addh .

|-
|01:36
| अब हम सीखते हैं लिंक इस स्ट्रक्चर के लिए atoms और residues के ऐट्रिब्यूट्स को कैसे बदलते हैं।

|-
|01:43
| Attributes नामों और वैल्यूज़ के साथ विशेषताएं होते हैं।

|-
|01:47
|Chimera में आइटम्स जैसे atoms, bonds, residues और molecule models ऐट्रिब्यूट्स रखते हैं।

|-
|01:54
| Attributes को बदलने के लिए भिन्न-भिन्न तरीके हैं।

|-
|01:57
| Favorites मेन्यू उपयोग करके Model Panel खोलें।

|-
|02:01
| स्क्रीन पर Model Panel डायलॉग बॉक्स खुलता है।

|-
|02:05
| पैनल के दायीं तरफ attributes बटन पर क्लिक करें।

|-
|02:10
| स्क्रीन पर 1zik के लिए Attributes डायलॉग बॉक्स खुलता है।

|-
|02:15
| डायलॉग बॉक्स attribute सूची रखता है।

|-
|02:18
| सूची Molecule Attributes और इसके कंपोनेंट्स Atom, bond और residue attributes रखती है।

|-
|02:28
| Molecule Attributes चुनें।

|-
|02:31
| उपलब्ध attributes विंडो पर सूचीबद्ध हैं।

|-
|02:35
| उदाहरण के लिए – एरोमेटिक रिंग्स के डिस्प्ले को बदलने के लिए aromatic display के आगे वाले बटन पर क्लिक करें।

|-
|02:42
| ड्राप-डाउन से True चुनें।

|-
|02:45
| Aromatic ring style में disk चुनें।

|-
|02:49
| aromatic color के आगे वाले color well पर क्लिक करें।

|-
|02:53
| color editor से रंग चुनें।

|-
|02:56
|डायलॉग बॉक्स बंद करें।

|-
|02:59
| पैनल का निरिक्षण करें, सभी aromatic rings केंद्र में डिस्क्स के साथ दिखती हैं।

|-
|03:06
| स्ट्रक्चर के डिस्प्ले को ball and stick में बदलें।

|-
|03:10
|कमांड लाइन पर टाइप करें rep bs.

|-
|03:16
| Attributes डायलॉग बॉक्स पर परमाणुओं की Van der Walls radii बदलें।

|-
|03:22
| ball scale की वैल्यू बदलकर 0.5 करें। एंटर दबाएँ।

|-
|03:27
| पैनल का निरिक्षण करें। परमाणु बहुत बड़े परमाण्विक रेडिआई के साथ दिखते हैं।

|-
|03:33
| Molecular Attributes चेक बॉक्स पर दोबारा क्लिक करें।

|-
|03:38
| सूची से Component Atom Attributes पर क्लिक करें।

|-
|03:43
| तत्स्थानी विंडो में atom style button पर क्लिक करें।

|-
|03:48
| ड्राप डाउन मेन्यू में बहुत से विकल्प हैं।

|-
|03:51
| डिस्प्ले को cpk में बदलने के लिए sphere पर क्लिक करें।

|-
|03:55
|पैनल का निरिक्षण करें।

|-
|03:57
| डिस्प्ले में वापस जाने के लिए dot चुनें।

|-
|04:02
| अब Component Bond Attributes पर क्लिक करें।

|-
|04:10
| यहाँ bond style को stick या wire में बदलने के लिए विकल्प हैं।

|-
|04:13
|Component Residue Attributes पर क्लिक करें।

|-
|04:17
| यहाँ रिबन के ऐट्रिब्यूट्स बदलने के लिए हमारे पास विकल्प हैं।

|-
|04:22
| Presets मेन्यू उपयोग करके पैनल पर स्ट्रक्चर के डिस्प्ले को ribbons में बदलें।
|-
|04:28
|अब Attribute डायलॉग बॉक्स पर क्लिक करें।

|-
|04:32
| Attribute डायलॉग बॉक्स में ribbon color के आगे वाले color well पर क्लिक करें. रिबन कलर को चुनें।

|-
|04:41
| color editor को बंद करने के लिए close पर क्लिक करें।

|-
|04:46
| ribbon और scaling के क्रॉस-सेक्शन (अनुप्रस्थ काट) को बदलने के लिए विकल्प हैं।

|-
|04:52
| डायलॉग बॉक्स बंद करें।

|-
|04:55
| Presets मेन्यू उपयोग करके दोबारा परमाणुओं के डिस्प्ले क बदलें।

|-
|05:00
| Tools मेन्यू उपयोग करके Attributes को बदला जा सकता है।

|-
|05:03
| Tools मेन्यू पर क्लिक करें, Structure Analysis तक नीचे जाएँ

|-
|05:09
|और सब-मेन्यू से Render by Attribute विकल्प चुनें।

|-
|05:14
| Render by attribute डायलॉग बॉक्स खुलता है।

|-
|05:17
| यहाँ atoms, residues, molecules, segmentation regions आदि के ऐट्रिब्यूट्स बदलने के लिए विकल्प हैं।

|-
|05:27
|atoms चुनें। Render पर क्लिक करें।

|-
|05:32
| उपलब्ध विकल्पों की जाँच के लिए Attribute सूची पर क्लिक करें।

|-
|05:37
| सूची दो विकल्प दिखाती है: bfactor और occupancy

|-
|05:43
| ये दो ऐट्रिब्यूट्स इनपुट PDB फाइल से पढ़े जा सकते हैं।

|-
|05:48
| bfactor चुनें।

|-
|05:50
| रंगीन उर्ध्वाधर बार्स के साथ वैल्यूज़ का एक हिस्टोरम दिखेगा।

|-
|05:55
| B-factor वैल्यूज़ मैक्रोमॉलिक्यूल्स में गतिशीलता की माप देती हैं।

|-
|06:01
| कम B-factor वैल्यूज़ के पामाणु, स्ट्रक्चर का भाग जो सुव्यवस्थित है, से सम्बंधित हैं।

|-
|06:08
| बड़े B-factor वैल्यूज़ के पामाणु, स्ट्रक्चर का भाग जो बहुत लचीला है, से सम्बंधित हैं।

|-
|06:15
| प्रोटीन स्ट्रक्चर के लिए PDB फाइल B-factor जानकारी रखती है।

|-
|06:21
| पैनल पर वापस आएं।

|-
|06:23
| उर्ध्वाधर बार्स माउस से हिस्टोग्राम के साथ ड्रैग की जा सकती हैं।

|-
|06:29
| B-factor की वैल्यू Value टेक्स्ट बॉक्स में दिखती है।

|-
|06:34
| नीली उर्ध्वाधर बार को ज़ीरो तक लाल को 100 तक ड्रैग करें।

|-
|06:41
| फिर सफ़ेद बार को 50 पर फिक्स करें।

|-
|06:45
| Colors बटन पर क्लिक करें।

|-
|06:48
| color atoms, keep opaque और color surfaces विकल्पों को चेक करें।

|-
|06:55
| डिफ़ॉल्ट कलर palette blue और red है।

|-
|06:59
| आप कलर palette को ड्राप-डाउन से बदल सकते हैं।

|-
|07:04
| Apply बटन पर क्लिक करें।

|-
|07:07
| पैनल का निरिक्षण करें। बड़े B-factor वाले परमाणु लाल में और कम वाले नीले में दिखते हैं।

|-
|07:16
| अपेक्षित की तरह बड़े B-factors के परमाणु स्ट्रक्चर के बाहर की तरफ हैं।

|-
|07:22
| अब रेसीड्यूज़ के ऐट्रिब्यूट्स को बदलते हैं।

|-
|07:26
| Select by Attribute डायलॉग बॉक्स में, Attributes बटन पर क्लिक करें।

|-
|07:32
|ड्राप डाउन से residues चुनें।

|-
|07:36
| Render पर क्लिक करें।

|-
|07:38
| रेसीड्यूज़ में लिए वो ऐट्रिब्यूट्स kdHydrophobicity scale रखते हैं।

|-
|07:44
| ड्राप डाउन मेन्यू से kdHydrophobicity पर क्लिक करें।

|-
|07:48
| हिस्टोग्राम में वैल्यूज़ दिखती हैं।

|-
|07:52
|kdHydrophobicity scales वो वैल्यूज़ हैं जो एमिनो एसिड रेसीड्यूज़ की रिलेटिव hydrophobicity परिभाषित करती हैं।

|-
|08:00
| KdHydrophobicity वैल्यूज़ hydrophobic residues के लिए पॉज़िटिव और polar residues के लिए नेगेटिव होती हैं।

|-
|08:09
| रेसीड्यूज़ की Hydrophobicity colors या worms में देखी जा सकती है।

|-
|08:15
|Colors चुनें। डिफ़ॉल्ट रूप से कुछ पैरामीटर्स चयनित हैं।

|-
|08:21
|Apply बटन पर क्लिक करें। पैनल का निरिक्षण करें।

|-
|08:26
|hydrophobic residues का रंग लाल और polar residues का रंग नीला होता है।

|-
|08:33
| Worms बटन पर क्लिक करें. Apply पर क्लिक करें।

|-
|08:38
|पैनल का निरिक्षण करें।

|-
|08:41
|Worms संशोधित रिबन्स हैं जो जिनकी रेडियस (त्रिज्या) परिवर्तित होती है।

|-
| 08:47
| अधिकतर hydrophobic residues स्ट्रक्चर के अन्दर की तरफ होते हैं।

|-
|08:52
| डिफ़ॉल्ट रूप से ज़्यादा hydrophobic residues बड़ी रेडियस के दिखेंगे।

|-
|09:00
| स्ट्रक्चर को सामान्य ribbon में वापस जाने के लिए।

|-
|09:03
| worm-style पर क्लिक करें और non-worm विकल्प चुनें।

|-
|09:09
|OK बटन पर क्लिक करें।

|-
|09:12
|File मेन्यू उपयोग करके Chimera सेशन बंद करें।

|-
|09:16
| इसे सारांशित करते हैं। इस ट्यूटोरियल में हमने सीखा परमाणुओं, रेसीड्यूज़ और मॉडल्स के ऐट्रिब्यूट्स को बदलना।

|-
|09:25
| B-factor वैल्यूज़ के आधार पर प्रोटीन में परमाणुओं को कलर करना।

|-
|09:30
| kdHydrophobicity वैल्यूज़ के आधार पर रेसीड्यूज़ को कलर करना।

|-
|09:35
| नियत कार्य में पैनल पर hemoglobin (PDB code: 2HCO) का मॉडल खोलें. B-factor वैल्यूज़ के आधार पर परमाणुओं को कलर करें।

|-
|09:44
| kdHydrophobicity वैल्यूज़ के आधार पर रेसीड्यूज़ को कलर करें।

|-
|09:49
| यह विडियो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है। अच्छी बैंडविड्थ न मिलने पर आप इसे डाउनलोड करके देख सकते हैं।

|-
|09:56
| हम स्पोकन ट्यूटोरियल्स का उपोग करके कार्यशालाएं आयोजित करते हैं और प्रमाणपत्र देते हैं।

|-
|10:04
| स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट NMEICT, MHRD भारत सरकार द्वारा वित्त पोषित है।

|-
|10:10
|आई आई ती बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य आपसे विदा लेती हूँ।
हमसे जुड़ने के लिए धन्यवाद।

|}

@@ Line 352: / Line 352: @@
 |-
 |07:38
-| रेसीड्यूज़ में लिए वो ऐट्रिब्यूट्स kdHydrophobicity scale रखते हैं।
+| रेसीड्यूज़ के लिए वो ऐट्रिब्यूट्स kdHydrophobicity scale रखते हैं।
 |-

@@ Line 456: / Line 456: @@
 |-
 |10:10
-|आई आई ती बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य आपसे विदा लेती हूँ।
+|यह स्क्रिप्ट श्रुति आर्य द्वारा अनुवादित है।मैं जया आपसे विदा लेती हूँ। धन्यवाद।
-हमसे जुड़ने के लिए धन्यवाद।
 |}

@@ Line 32: / Line 32: @@
 |-
-|00:54
+|00:52
 |कमांड लाइन उपयोग करके Leucine zipper का स्ट्रक्चर खोलें।
 |-
-| 00:52
+| 00:57
 |कमांड टेक्स्ट बॉक्स में टाइप करें open 1zik एंटर दबाएँ।
@@ Line 224: / Line 224: @@
 |-
 |04:55
-| Presets मेन्यू उपयोग करके दोबारा परमाणुओं के डिस्प्ले क बदलें।
+| Presets मेन्यू उपयोग करके दोबारा परमाणुओं के डिस्प्ले को बदलें।
 |-
@@ Line 268: / Line 268: @@
 |-
 |05:50
-| रंगीन उर्ध्वाधर बार्स के साथ वैल्यूज़ का एक हिस्टोरम दिखेगा।
+| रंगीन उर्ध्वाधर बार्स के साथ वैल्यूज़ का एक हिस्टोग्राम दिखेगा।
 |-
@@ Line 396: / Line 396: @@
 |-
 |08:41
-|Worms संशोधित रिबन्स हैं जो जिनकी रेडियस (त्रिज्या) परिवर्तित होती है।
+|Worms संशोधित रिबन्स हैं  जिनकी रेडियस (त्रिज्या) परिवर्तित होती है।
 |-

UCSF-Chimera/C4/Attributes/Hindi - Revision history

Jayarastogi at 05:35, 4 July 2018

Jayarastogi at 03:52, 2 July 2018

Jayarastogi at 03:38, 2 July 2018

Shruti arya: Created page with "{| border=1 | Time | Narration |- |00:01 | Attributes पर इस ट्यूटोरियल में आपका स्वाग..."